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当前共找到 951 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-04-30 |
Unlocking single-cell level and continuous whole-slide insights in spatial transcriptomics with PanoSpace
2026-Apr, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00938-y
PMID:41495261
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研究论文 | 提出了PanoSpace计算框架，整合低分辨率空间转录组学、高分辨率组织学与单细胞RNA测序，在全组织切片上重构连续单细胞级基因表达图谱 | 利用计算模型将粗粒度空间斑点数据提升至连续单细胞分辨率，填补斑间未测区域，并实现细胞身份、位置及表达谱的精确重建 | 文中未明确讨论框架对异质性组织或低质量数据的鲁棒性，也未提及计算资源需求 | 开发一种计算框架，克服现有空间转录组平台分辨率低和采样稀疏的局限，实现全切片连续单细胞级空间转录组分析 | 乳腺癌、前列腺癌组织及小鼠脑组织 | 计算生物学 | 乳腺癌，前列腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，组织学图像，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 602 | 2026-04-30 |
Developing a Single-Cell Spatial Transcriptomics Workflow for In Vivo Evaluation of Implanted Biomaterials
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513242
PMID:41691505
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研究论文 | 开发了一种用于评估植入生物材料的单细胞空间转录组学工作流程，揭示了聚己内酯（PCL）支架植入小鼠皮下后的细胞动态和空间组织 | 首次将高分辨率空间转录组学（Xenium平台）应用于生物材料的体内评估，能够识别组织学无法检测的巨噬细胞和成纤维细胞亚群的转录组空间转变 | 该工作流程可能依赖特定的平台（Xenium），且尚未在多种生物材料或更长的时间点进行验证以评估其普适性 | 开发一个生物信息学工作流程，通过空间转录组学评估植入生物材料的体内反应，以便更好地理解细胞机制并实现以生物学信息为基础的设计 | 小鼠皮下植入的静电纺丝聚己内酯（PCL）支架 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 皮下植入PCL支架的小鼠样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台用于原位基因表达分析 |
| 603 | 2026-04-30 |
PICDGI: A framework for predicting cancer driver genes through dynamic gene-gene interaction modeling of single-cell data
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014143
PMID:42044093
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研究论文 | 提出PICDGI框架，通过动态基因-基因相互作用建模基于单细胞数据预测癌症驱动基因 | 不依赖DNA突变，而是通过单细胞RNA测序时间序列表达模式推断功能性驱动基因，采用时变状态空间模型结合变分贝叶斯推断和MCMC采样 | 文中未明确提及局限性 | 开发一种通用且生物学基础的计算框架，识别罕见和情境特异性的癌症进展调控驱动基因 | 肺癌（肺腺癌）和儿童急性髓系白血病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌, 白血病 | 单细胞RNA测序 | 时变状态空间模型, 变分贝叶斯, 马尔可夫链蒙特卡洛抽样 | 基因表达数据 | 肺腺癌单细胞RNA测序数据及独立儿童急性髓系白血病单细胞RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 604 | 2026-04-29 |
Multi-scale spatial testing recovers gene programs missed by existing detection methods
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711372
PMID:41890107
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研究论文 | 提出FlashS方法，在频域中重新定义基于核的空间检验，以检测任意多尺度表达模式，并扩展到数百万细胞 | 通过频域变换将空间检验从固定尺度模型解放出来，实现多尺度空间可变基因检测，同时保持可扩展性 | 未明确说明局限性，但可能依赖于基因表达数据的空间分辨率 | 开发一种能够检测现有方法遗漏的多尺度空间模式的空间可变基因检测方法 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 机器学习和数字病理学 | 心血管疾病（与心脏组织相关） | 空间转录组学 | 核方法（频域变换） | 基因表达数据 | 50个基准数据集覆盖9个平台，包括艾伦脑MERFISH图谱（394万个细胞） | NA | 空间转录组学，MERFISH | MERFISH | 艾伦脑MERFISH图谱 |
| 605 | 2026-04-29 |
Cross-platform transcriptomic data integration identifies an overactive neuro-immune signature in human osteoarthritis synovium
2026-Apr, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2025.08.013
PMID:40889615
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研究论文 | 通过跨平台转录组数据整合，识别出人类骨关节炎滑膜中过度活跃的神经免疫信号特征 | 首次通过跨平台统计整合多个公开数据集，系统性地表征骨关节炎滑膜的转录表型，并聚焦于与疼痛相关的信号通路 | 研究基于公共数据集，样本量有限（153例受试者），且仅关注终末期骨关节炎，未纳入早期或中度病变 | 表征骨关节炎滑膜的转录表型，重点关注与疼痛相关的神经免疫信号 | 人类非骨关节炎和骨关节炎滑膜组织样本 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 153例受试者（质量控后139例） | Illumina | bulk RNA-seq | Illumina NovaSeq | 来自GEO数据库的多个微阵列和RNA测序数据集 |
| 606 | 2026-04-28 |
TriPDCL: A Tri-Pathway Prototype-Driven Contrastive Learning Framework for Cross-Modality Single-Cell Integration
2026-Apr-27, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.6c00436
PMID:41952315
|
研究论文 | 提出TriPDCL框架，一种基于原型的三路径对比学习方法，用于跨模态单细胞数据集成 | 通过迭代原型学习更新机制实现异质性信息的有效传递，并利用可学习的原型中心精确构建可靠的正负样本对 | 未在摘要中明确说明 | 解决多组学分析中跨模态异质性对齐和鲁棒学习两个主要挑战 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 对比学习（原型驱动） | 单细胞多组学数据 | 五个数据集 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 607 | 2026-04-28 |
Single-cell insights into plant growth, adaptation, and evolution
2026-Apr-27, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70272
PMID:42037106
|
综述 | 综述了单细胞多组学技术在理解植物生长、适应性和进化中的应用 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间组学，系统解析作物发育、胁迫响应和进化中的细胞异质性 | 原生质体分离技术困难、多模态数据计算整合挑战以及跨物种可扩展性不足 | 利用单细胞技术揭示植物细胞类型特异性程序，推动功能基因组学和精准育种 | 作物植物及其细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学 | NA | 转录组、表观基因组、空间组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 单细胞表观基因组学， 空间转录组学 | NA | NA |
| 608 | 2026-04-28 |
Molecular Traces of Microbial Cross-Kingdom Migration: From the Gut Ecosystem to the Intervertebral Disc Microenvironment
2026-Apr-24, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2026.04.027
PMID:42035921
|
研究论文 | 该研究通过多组学方法发现肠道微生物Phocaeicola vulgatus可能通过LPS-TLR4-MYD88信号轴激活软骨细胞炎症反应并重塑细胞间通讯网络，从而促进椎间盘退变 | 首次利用多组学联合分析揭示肠道微生物与椎间盘退变之间的跨界迁移分子机制，并发现Phocaeicola vulgatus通过LPS信号通路介导的微生物-宿主互作新机制 | 未提及具体的局限性信息 | 利用多组学方法鉴定肠道微生物中促进椎间盘退变的关键菌群，并阐明其通过调控宿主细胞功能参与椎间盘退变的具体分子机制 | 113例接受手术治疗的症状性腰椎退变患者的退变椎间盘组织和配对粪便样本 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 宏基因组二代测序、单细胞RNA测序、批量RNA测序、AUCell评分、CellChat算法 | NA | 测序数据 | 113例患者的退变椎间盘组织和配对粪便样本 | NA | 宏基因组二代测序、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 609 | 2026-04-28 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals intra-tumoral heterogeneity and immunotherapy strategies in high-grade serous ovarian cancer
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115266
PMID:41907410
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示高级别浆液性卵巢癌的肿瘤内异质性和免疫治疗策略 | 首次系统描绘了HGSOC中七种主要细胞类型的变化，特别是发现高表达MHC Ⅰ类分子的上皮细胞与抗原呈递和肿瘤免疫监视的关联，并验证了其与CD8 T细胞激活的关系，为免疫治疗提供新靶点 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、主要基于转录组分析缺乏功能验证、多重免疫组化验证的队列规模可能较小 | 解析高级别浆液性卵巢癌的肿瘤内异质性和免疫治疗潜在机制 | 高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 610 | 2026-04-28 |
Integrated multi-omics identifies macrophage ARG1-mediated deacetylation with causal and diagnostic implications in ischemic stroke
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115269
PMID:41907424
|
研究论文 | 通过整合多组学数据，发现巨噬细胞ARG1介导的去乙酰化在缺血性卒中中具有因果和诊断意义 | 整合多组学数据识别出ARG1作为缺血性卒中的因果因子，并基于去乙酰化相关基因将患者分为两个免疫分子亚型 | 研究主要基于小鼠模型和队列数据，ARG1在人类缺血性卒中的功能机制仍需进一步验证 | 探究去乙酰化相关基因在缺血性卒中中的因果和诊断作用 | 缺血性卒中患者和MCAO小鼠模型 | 机器学习 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化分析 | NA | 多组学数据（转录组、单细胞转录组等） | 患者队列和小鼠模型的样本数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2026-04-28 |
AK5 suppresses breast cancer progression and modulates anti-PD-L1 efficacy via the miR-182-5p/PD-L1 axis
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115260
PMID:41907408
|
研究论文 | 本文揭示了腺苷酸激酶5（AK5）通过miR-182-5p/PD-L1轴抑制乳腺癌进展并调节抗PD-L1疗效 | 首次发现AK5通过其激酶活性依赖方式抑制miR-182-5p成熟，从而上调PD-L1表达，并在乳腺癌中发挥抑癌作用 | 未提及具体局限性 | 探究AK5在乳腺癌中的作用及其分子机制 | 乳腺癌细胞及小鼠模型 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组 |
| 612 | 2026-04-28 |
SC-MO-GRN-DB: A comprehensive repository for single-cell multiomic gene regulatory networks
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115323
PMID:41907425
|
研究论文 | 开发了一个包含实验验证基因调控网络和单细胞多组学数据集的综合数据库SC-MO-GRN-DB | 首次整合了单细胞多组学数据与实验验证的基因调控网络，涵盖六种分子模式，为GRN推断方法提供标准化基准 | 未具体说明局限性 | 构建用于开发和验证单细胞多组学基因调控网络推断方法的公共资源库 | 人类和小鼠组织的单细胞多组学数据集及实验验证的基因调控网络 | 机器学习 | NA | scRNA-seq、scATAC-seq、scChIP-seq、scDNA-Met、scHi-C、scCRISPR-seq | NA | 序列数据、表观遗传数据、基因扰动筛选数据 | 超过200万个细胞，来自人类和小鼠组织的六种分子模式数据 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、单细胞ChIP-seq、单细胞DNA甲基化、单细胞Hi-C、单细胞CRISPR-seq | NA | NA |
| 613 | 2026-04-28 |
KRT15 identified by scRNA-Seq and machine learning as stemness regulator and prognostic biomarker in ESCC
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115020
PMID:41907411
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习鉴定KRT15作为食管鳞状细胞癌干性调控因子和预后生物标志物 | 首次结合单细胞测序和机器学习算法筛选出干细胞样亚群特异性标志物KRT15，并通过功能实验验证其在食管鳞状细胞癌中的干性和侵袭性调控作用 | 未提及具体局限性，但可能包括需要更多临床样本验证、机制研究不深入或缺乏体内实验验证 | 识别食管鳞状细胞癌中与干性相关的关键分子并评估其预后价值 | 食管鳞状细胞癌细胞中的肿瘤干细胞样亚群 | 机器学习, 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法（具体模型未指定） | 单细胞测序数据 | 未明确说明样本数量 | 未指定 | 单细胞RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 614 | 2026-04-28 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal angiogenic vascular responses to chronic cerebral hypoperfusion
2026-Apr-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115331
PMID:41907427
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示慢性脑低灌注引起的血管新生反应 | 首次在慢性脑低灌注模型中鉴定出尖端内皮细胞亚型，并阐明Apln/Aplnr信号通路在血管新生中的作用 | 仅在小鼠模型中进行验证，缺乏人类样本的数据支持 | 阐明慢性脑低灌注后血管损伤与修复的细胞和分子机制 | 接受不对称颈总动脉狭窄诱导的慢性脑低灌注的小鼠脑组织 | 单细胞转录组学 | 血管性认知障碍与痴呆 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脑组织样本（具体数量未提及） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2026-04-28 |
Universal Nanovial Screening Enables Functional Discovery of Metabolite-Reactive T-Cell Receptors for Cancer Therapy
2026-Apr-16, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c22721
PMID:41990155
|
研究论文 | 开发基于纳米小瓶的功能筛选平台，用于从人类血液中非常规T细胞高通量发现代谢物反应性T细胞受体 | 首次实现基于纳米技术的“功能优先”筛选策略，结合纳米小瓶、MR1或CD1d分子标记、细胞因子捕获抗体和分泌编码单细胞测序，高通量发现非常规T细胞的TCR及其功能关联 | NA | 开发高通量功能筛选平台，发现非常规T细胞的TCR用于癌症治疗 | 人类血液中非常规T细胞（包括黏膜相关恒定T细胞MAIT和恒定自然杀伤T细胞iNKT） | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞测序，纳米小瓶筛选 | NA | 单细胞测序数据 | 人类血液样本中分离的稀有MAIT和iNKT细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 功能筛选 | 纳米小瓶 | 基于纳米小瓶的MR1/CD1d分子和细胞因子捕获抗体标记平台，结合分泌编码单细胞测序 |
| 616 | 2026-04-28 |
Reconstructing biologically coherent cellular profiles from imaging-based spatial transcriptomics
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.08.710395
PMID:41959255
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研究论文 | 提出了TRACER方法，通过基因一致性和空间共定位优化成像空间转录组学中的细胞表示，无需外部注释或参考图谱 | 利用数据直接观察到的基因-基因一致性和转录本空间共定位来精炼细胞表示，无需外部标注或参考图谱 | 未明确提及局限性 | 解决成像空间转录组学中细胞分割导致的混合细胞图谱和未检测细胞核缺失问题 | 成像空间转录组学数据中的细胞图谱 | 数字病理学 | NA | 成像空间转录组学 | NA | 图像、空间转录组数据 | 跨多种平台、组织和分割方法的样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 617 | 2026-04-28 |
Integrative transcriptomics defines CD36 as a key regulator of immunometabolic signaling in acute myeloid leukemia
2026-Apr, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01728-6
PMID:41489721
|
研究论文 | 整合转录组学定义了CD36作为急性髓系白血病免疫代谢信号的关键调节因子 | 通过整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学，首次揭示CD36在急性髓系白血病免疫代谢网络中的中心调控作用，并利用结直肠癌空间转录组学验证了巨噬细胞共定位 | 需要进一步的体外和体内综合验证 | 研究CD36作为免疫代谢介质在急性髓系白血病发病机制中的调控作用 | 急性髓系白血病细胞系及临床样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学（结直肠癌样本） |
| 618 | 2026-04-28 |
Multi-omics analyses of the Alviniconcha holobiont reveal multi-faceted adaptations to deep-sea hydrothermal vents
2026-04, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3148-0
PMID:41692943
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示了深海热液喷口Alviniconcha蜗牛全生物体多方面适应机制 | 首次提供了两种Alviniconcha蜗牛的染色体水平基因组，并整合空间转录组学揭示了鳃丝功能分区 | 未提及 | 研究深海热液喷口中Alviniconcha全生物体的分子和生理适应机制 | Alviniconcha adamantis和Alviniconcha marisindica两种蜗牛及其共生菌 | 基因组学、空间转录组学 | NA | 染色体级别基因组组装、空间转录组学 | NA | 基因组序列、空间转录组数据 | 两种Alviniconcha蜗牛物种 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 619 | 2026-04-28 |
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Communication Networks in Centenarians and Elderly Controls
2026-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70486
PMID:41979395
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析，揭示了百岁老人及其后代与老年对照者之间不同的免疫细胞通讯网络，鉴定出与健康衰老相关的免疫重塑模式 | 首次在单细胞水平上系统比较百岁老人、其后代和老年对照者的免疫细胞间通讯网络，发现健康衰老个体中由IL-15和IL-18等正调控因子介导的配体-受体相互作用增强，与效应免疫细胞毒性和免疫监视能力提高一致 | 仅分析外周血单个核细胞的免疫通讯，未涉及其他组织或器官；跨种族或跨队列的验证有限 | 探究免疫细胞间通讯在健康衰老和极端长寿中的变化及其机制 | 百岁老人、其子女以及老年对照者的外周血单个核细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 表达数据 | 包含百岁老人、其子女和老年对照者共多个样本的PBMC单细胞转录组数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒 |
| 620 | 2026-04-27 |
Integrator subunit IntS11 orchestrates the temporal dynamics of neural lineage progression in Drosophila
2026-Apr-25, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-026-01578-z
PMID:42035222
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研究文章 | 利用果蝇模型揭示Integrator亚基IntS11通过转录调控细胞周期基因和维持长3'UTR异构体来协调神经谱系进展的时间动态 | 首次发现IntS11作为神经谱系进展的阶段特异性调控因子，通过转录控制细胞周期基因维持神经母细胞增殖，并通过维持长3'UTR异构体稳定分化程序 | 未提及具体局限性，可能包括需要进一步在哺乳动物模型中验证 | 探究IntS11在神经谱系进展中的具体调控功能 | 果蝇神经母细胞及其后代细胞 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序，ChIP-qPCR，FUCCI分析，活体成像，MARCM | NA | 基因表达数据 | 果蝇幼虫脑样本，具体数量未在摘要中给出 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |