单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 143 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
41	2026-03-20	Transcriptome Comparison Between the Cultured and In Vivo Chick Primordial Germ Cells by SMART-Seq-Based Single-Cell RNA Sequencing 2026-Apr, Development, growth & differentiation DOI:10.1111/dgd.70049 PMID:41775620	研究论文	本研究通过基于SMART-seq的单细胞RNA测序，比较了体内和体外培养的鸡原始生殖细胞的转录组差异	首次揭示了PGC培养导致基因调控网络从MYC依赖转变为MYCN依赖，并发现了一个具有生殖系偏向的未分化细胞新群体	研究主要基于转录组数据，缺乏功能验证实验	在分子水平上理解鸡原始生殖细胞培养效应及其发育过程	鸡的原始生殖细胞	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	SMART-seq
42	2026-03-20	L1TD1 promotes colorectal mucinous adenocarcinoma progression by enhancing ABCC3 mRNA stability 2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-026-03716-w PMID:41776049	研究论文	本研究揭示了L1TD1通过增强ABCC3 mRNA稳定性促进结直肠黏液腺癌进展的机制	首次发现L1TD1作为RNA结合蛋白通过结合ABCC3 mRNA的3'-UTR区域增强其稳定性，从而激活MAPK信号通路促进黏液产生和肿瘤进展	未明确L1TD1-ABCC3轴在其他癌症类型中的普适性，且临床样本量可能有限	探究结直肠黏液腺癌中黏液产生的调控机制及肿瘤进展的分子基础	结直肠黏液腺癌组织、癌细胞	癌症生物学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	未明确具体样本数量	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
43	2026-03-19	Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing 2026-04-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153484 PMID:41734714	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了NOD.H-2h4小鼠甲状腺在桥本甲状腺炎不同阶段的免疫景观	首次在NOD.H-2h4小鼠模型中构建甲状腺单细胞转录组图谱，揭示了甲状腺细胞可塑性和Treg功能障碍作为疾病进展的潜在驱动因素	研究基于小鼠模型，结果可能无法完全反映人类桥本甲状腺炎的复杂性	探究桥本甲状腺炎中甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用	NOD.H-2h4小鼠的甲状腺组织	数字病理学	桥本甲状腺炎	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	38,461个细胞，来自三个疾病阶段（4、8和16周）的小鼠甲状腺组织	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
44	2026-03-19	Identification and experimental confirmation of TBC1D10C as a shared transcriptional link between abdominal aortic aneurysm and major depressive disorder 2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153456 PMID:41702190	研究论文	本研究通过整合多组学数据，识别并实验验证了TBC1D10C作为腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享转录调控因子	首次发现TBC1D10C作为AAA和MDD的共同关键枢纽基因，并通过scRNA-seq和小鼠模型验证其在免疫细胞中的表达与淋巴细胞活化的负相关性	研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，缺乏直接的人类临床干预数据	揭示腹主动脉瘤和重度抑郁症之间的共享分子通路，寻找共同治疗靶点	腹主动脉瘤和重度抑郁症患者及小鼠模型的基因表达数据	生物信息学	心血管疾病	RNA-seq, scRNA-seq	机器学习	基因表达数据	七个基因表达数据集	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
45	2026-03-18	Artificial sweeteners and male infertility: Network toxicology and experimental evidence reveal FGFR1 as the critical target 2026-04, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.) DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109191 PMID:41713522	研究论文	本研究通过整合计算预测、网络分析和湿实验验证，探讨人工甜味剂导致男性不育的机制，并确定FGFR1为关键靶点	首次结合网络毒理学、机器学习特征选择、分子对接与动力学模拟以及单细胞RNA-seq分析，系统揭示人工甜味剂通过FGFR1信号通路影响男性生殖功能的分子机制	研究主要基于体外细胞实验和计算模拟，缺乏体内实验和蛋白质水平验证，且仅针对部分人工甜味剂	探索人工甜味剂导致男性不育的潜在分子机制	七种人工甜味剂（如阿斯巴甜、纽甜、三氯蔗糖）及其与男性生殖系统相关的分子靶点	网络毒理学	男性不育	单细胞RNA-seq、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟、机器学习特征选择	机器学习特征选择	基因表达数据、分子结构数据、单细胞转录组数据	TM3 Leydig细胞系暴露于阿斯巴甜（0.5-2 mM）48小时	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
46	2026-03-18	Integrating histology and spatial transcriptomics via multimodal transformers and contrastive representation learning for accurate gene expression prediction 2026-Apr, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbi.2026.105003 PMID:41763376	研究论文	本文提出了一种统一的多模态学习框架，通过结合组织学图像和空间转录组学数据，利用多模态Transformer和对比表示学习来准确预测基因表达	采用ResNet50卷积主干和MobileViT Transformer编码器提取层次视觉表示，并通过对比学习目标在共享潜在空间中对齐图像和转录组特征，显著提高了预测准确性	NA	从组织学图像预测空间基因表达，以理解组织结构和分子表型	人类肝脏组织	数字病理学	NA	空间转录组学	ResNet50, MobileViT Transformer	图像, 基因表达数据	NA	10x Genomics	空间转录组学	10x Visium	10x Genomics Visium数据集
47	2026-03-18	GITR activation potentiates anti-tumor immunity of tumor-infiltrating lymphocytes expanded from glioblastoma by rescuing exhaustion 2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-026-03705-z PMID:41776051	研究论文	本研究优化了从胶质母细胞瘤病灶体外扩增肿瘤浸润淋巴细胞的方法，并通过单细胞RNA测序揭示了其异质性，发现GITR激活可通过NF-κB/KALRN信号轴增强CD8 TIL的抗肿瘤免疫，为改善胶质母细胞瘤的TIL疗法提供了新策略	发现GITR不仅高表达于免疫抑制性Treg细胞，也高表达于耗竭的CD8 TILs；GITR激动剂具有双重作用：直接增强CD8 TIL活化同时消除Treg介导的免疫抑制；揭示了GITR激活通过NF-κB/KALRN信号轴促进免疫突触形成的作用机制	NA	探索改善胶质母细胞瘤自体肿瘤浸润淋巴细胞疗法疗效的策略	从胶质母细胞瘤病灶扩增的肿瘤浸润淋巴细胞	NA	胶质母细胞瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
48	2026-03-18	KRAS-extrachromosomal DNA drives intratumoral heterogeneity in gastric cancer 2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-026-03713-z PMID:41786878	研究论文	本研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了胃癌中KRAS基因在染色体外DNA（ecDNA）上的扩增及其在肿瘤内异质性中的关键作用	首次在胃癌中鉴定出KRAS-ecDNA，并系统分析了其驱动的转录异质性、功能特征及药物反应预测，为靶向ecDNA驱动的致癌程序提供了新策略	研究仅基于单个胃癌样本，样本量有限，且功能验证和临床相关性需进一步探索	探究KRAS基因通过染色体外DNA（ecDNA）在胃癌中的功能影响及肿瘤内异质性机制	胃癌样本	数字病理学	胃癌	全基因组测序, 单细胞RNA测序	NA	基因组数据, 转录组数据	1个胃癌样本	NA	全基因组测序, 单细胞RNA-seq	NA	NA
49	2026-03-17	The underlying mechanism of cardiac injury in exertional heat stroke rats based on the scRNA-seq analysis 2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.bbrc.2026.153452 PMID:41707381	研究论文	本研究基于单细胞RNA测序分析，探讨了劳力性热射病大鼠心脏损伤的潜在机制	首次在劳力性热射病模型中应用单细胞RNA测序技术，系统性地鉴定了不同细胞类型中的差异表达基因，并验证了Hspa8、Hspe1、Id1、Ndufa4和Cd36等关键基因在心脏损伤机制中的作用	研究基于大鼠模型，其结果向人类临床应用的转化需要进一步验证；单细胞测序分析仅聚焦于基因表达层面，未深入探究蛋白质功能或翻译后修饰的影响	探究劳力性热射病中心脏损伤的细胞信号通路和关键基因，为早期识别心脏损伤生物标志物提供理论依据	劳力性热射病大鼠模型的心脏组织	单细胞组学	心血管疾病	单细胞RNA测序，RT-qPCR，免疫组织化学	NA	单细胞转录组数据，基因表达定量数据，组织切片图像	未明确说明具体样本数量的大鼠心脏组织	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
50	2026-03-17	Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers 2026-Apr, Human immunology IF:3.1Q3 DOI:10.1016/j.humimm.2026.111687 PMID:41690207	研究论文	本研究利用单细胞转录组学技术，探究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620在PHA驱动的T细胞活化模型中，对人类外周血单个核细胞炎症反应的特异性调控作用	首次在单细胞分辨率下揭示了SOCE阻断剂对特定免疫细胞亚群（CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞）转录程序的特异性调控，为靶向免疫调节提供了新见解	研究基于体外PHA驱动的T细胞活化模型，可能无法完全反映体内复杂免疫环境；需要未来与常规免疫抑制剂进行头对头比较研究	探究SOCE阻断在特定活化背景下对免疫细胞功能的细胞类型特异性影响	正常人外周血单个核细胞（PBMCs）	单细胞组学	免疫介导性疾病	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
51	2026-03-17	Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization 2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2 DOI:10.1016/j.exger.2026.113070 PMID:41707912	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态	结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析，识别出CCND1、SCGB1A1和DDIT4作为骨质疏松症的新型生物标志物	样本量可能有限，且研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证其临床适用性	探索骨质疏松症中雌激素相关标志物以改善诊断和治疗	骨质疏松症患者	数字病理学	骨质疏松症	单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blot	机器学习	RNA测序数据, 基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
52	2026-03-16	Machine learning derived proliferating T cell-related signature: a novel biomarker for prognosis and treatment efficacy in clear cell renal cell carcinoma 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116361 PMID:41740344	研究论文	本研究开发了一种基于增殖T细胞相关基因的机器学习评分模型（TRRS），用于预测透明细胞肾细胞癌的预后和治疗效果	首次利用增殖T细胞相关特征构建了ccRCC的预后和治疗反应预测模型，并通过多组学分析鉴定了关键介质CST3	模型基于回顾性数据开发，需要前瞻性研究进一步验证其临床实用性	开发可靠的生物标志物以预测ccRCC患者的临床结局和治疗反应	透明细胞肾细胞癌患者	机器学习	肾癌	转录组学、空间转录组学、单细胞转录组学	机器学习框架	转录组数据	多个独立队列（CheckMate025、IMmotion151、JAVELIN Renal 101、TCGA-KIRC、华西医院队列）	NA	单细胞RNA-seq、空间转录组学	NA	NA
53	2026-03-16	Targeting macrophage-mediated clearance of apoptotic cells overcomes anti-VEGF resistance in choroidal neovascularization 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116410 PMID:41740341	研究论文	本研究利用Stereo-seq空间转录组技术，揭示了脉络膜新生血管（CNV）微环境中巨噬细胞清除凋亡细胞的功能障碍是抗VEGF治疗抵抗的关键机制，并提出联合抗CD47治疗可克服此抵抗	首次在单细胞分辨率下构建了视网膜-脉络膜-巩膜复合体的空间转录组图谱，并发现巨噬细胞介导的凋亡内皮细胞清除障碍是抗VEGF治疗抵抗的新机制	研究基于小鼠激光诱导的CNV模型，其结果在人类nAMD患者中的普适性有待验证	探究脉络膜新生血管（CNV）微环境中导致抗VEGF治疗不完全应答（IRT）的细胞与分子机制	健康对照小鼠及激光诱导CNV模型小鼠的视网膜-脉络膜-巩膜（RCS）复合体	空间转录组学	年龄相关性黄斑变性	空间转录组学	NA	空间转录组数据	健康对照、未治疗CNV及抗VEGF治疗CNV三组小鼠的RCS复合体样本	华大基因（BGI）	空间转录组学	Stereo-seq	Stereo-seq技术（用于构建单细胞分辨率空间转录组图谱）
54	2026-03-16	Inhibition of LRRK2 alleviates LPS-induced hippocampal pericyte loss and depressive-like behaviors through suppressing the RIPK1-mediated necroptosis pathway 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116414 PMID:41740343	研究论文	本研究揭示了LRRK2抑制剂通过抑制RIPK1介导的坏死性凋亡通路，减轻LPS诱导的海马周细胞丢失和抑郁样行为	首次将LRRK2激活与RIPK1介导的坏死性凋亡通路联系起来，并证明LRRK2抑制剂能通过该机制保护周细胞、改善血脑屏障功能和抑郁样行为	研究主要基于LPS诱导的炎症模型，在人类临床样本中的验证尚不充分	探究LPS诱导的抑郁样行为发病机制中周细胞丢失的作用及分子机制	小鼠海马组织、人脑血管周细胞	神经科学	抑郁症	单细胞RNA测序、微阵列分析、免疫共沉淀	NA	基因表达数据、蛋白质相互作用数据	NA	NA	单细胞RNA-seq, 微阵列	NA	NA
55	2026-03-16	CXCL9 as a key feature for deep learning-based immune subtyping and prediction of immune checkpoint blockade response in triple-negative breast cancer 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116439 PMID:41759266	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的免疫亚型分类系统，用于三阴性乳腺癌，并识别CXCL9作为与免疫检查点阻断反应正相关的关键生物标志物	使用深度学习驱动的无监督聚类方法识别TNBC的潜在免疫亚型，并通过单细胞测序验证关键特征在免疫细胞中的表达，揭示了IDO1对CXCL9的调控机制	研究基于公共数据集（GEO、TCGA、GTEx）的整合分析，可能受数据异质性和样本量的限制，且体外实验初步验证了假设机制，但需进一步体内验证	开发一种新的免疫分类系统以预测三阴性乳腺癌患者对免疫检查点阻断疗法的反应，并探索相关生物标志物和调控机制	三阴性乳腺癌患者的多组学数据和单细胞测序数据	机器学习	乳腺癌	多组学数据分析、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting、免疫荧光、ELISA	AE-K-means、NMF、ConsensusClusterPlus、VAE-GMM、随机森林	多组学数据（包括基因表达、生存数据等）、单细胞测序数据	来自GEO、TCGA和GTEx数据集的整合样本，具体数量未在摘要中明确说明	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
56	2026-03-16	Tumor-Educated Extracellular Vesicle-Derived LINC01116 Drives Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Immunosuppression by Sponging miR-3614-5p to Upregulate ARHGAP1 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116347 PMID:41764827	研究论文	本研究探讨了细胞外囊泡来源的长链非编码RNA LINC01116在非小细胞肺癌进展和肿瘤免疫微环境中的作用	揭示了EV来源的LINC01116通过海绵吸附miR-3614-5p上调ARHGAP1，从而促进NSCLC进展和免疫抑制的新机制	NA	研究细胞外囊泡来源的lncRNA在非小细胞肺癌进展和肿瘤免疫微环境中的作用	非小细胞肺癌组织、患者血液中的细胞外囊泡、体外细胞模型和体内小鼠模型	生物信息学	肺癌	生物信息学分析、RNA pull-down、RIP、荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据、单细胞RNA-seq数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
57	2026-03-07	The ZNF737-CXCL10 axis drives immune exclusion and resistance to anti-PD-1 therapy in bladder cancer 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116443 PMID:41785601	研究论文	本研究揭示了转录因子ZNF737通过抑制CXCL10的表达，驱动膀胱癌免疫排斥和对PD-1抑制剂耐药的新机制	首次鉴定出ZNF737是膀胱癌免疫逃逸的关键驱动因子，并阐明其通过转录抑制CXCL10导致CD8+ T细胞募集受损和抗原特异性细胞毒性减弱的机制	研究主要基于体外实验和人源化小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；ZNF737在其他癌症类型中的作用未充分探索	探究膀胱癌免疫检查点抑制剂耐药的肿瘤内在分子机制，寻找预测生物标志物和联合治疗新靶点	膀胱癌肿瘤细胞、CD8+ T细胞、患者组织样本、人源化小鼠模型	癌症免疫学	膀胱癌	单细胞RNA测序、多重免疫荧光、细胞迁移/侵袭实验、T细胞趋化实验、双荧光素酶报告基因实验、MHC-I限制性细胞毒性实验	人源化小鼠模型（huPBMC-NOG）	RNA测序数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像、临床预后数据	多个独立患者队列的组织样本和临床数据	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
58	2026-03-16	Norepinephrine promotes colorectal cancer liver metastasis via mechanisms dependent on Kupffer cells 2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2026.116449 PMID:41785604	研究论文	本研究揭示了去甲肾上腺素通过β2-AR信号通路重编程库普弗细胞，促进结直肠癌肝转移的神经免疫机制	首次整合临床分析、单细胞转录组学和体内外实验，阐明了去甲肾上腺素通过β2-AR/PI3K/Akt通路驱动库普弗细胞M2样极化并分泌CXCL12，从而促进结直肠癌肝转移的具体机制	NA	探究去甲肾上腺素在结直肠癌肝转移过程中对肝脏免疫微环境的影响机制	结直肠癌肝转移患者、小鼠CRLM模型、库普弗细胞、结直肠癌细胞	肿瘤免疫学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	转录组数据、临床数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
59	2026-03-16	Comparative analysis of key phagocytic genes in humans and mice using machine learning integrated with single-cell RNA sequencing 2026-Apr-06, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2026.02.002 PMID:41654103	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序与机器学习，比较了小鼠和人类脑出血后小胶质细胞的吞噬反应，揭示了物种特异性的时间模式并鉴定了与吞噬差异相关的关键基因	首次将机器学习模型（特别是XGBoost）与单细胞RNA测序数据整合，用于跨物种比较脑出血后小胶质细胞的吞噬基因表达差异，并成功鉴定了物种特异性的关键基因（小鼠Tlr2和人类CLEC7A）	研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；人类样本的时间点覆盖可能不如小鼠模型全面；机器学习模型的泛化能力需在独立数据集中进一步验证	比较小鼠与人类在脑出血后小胶质细胞吞噬反应的差异，并鉴定导致物种特异性吞噬模式的关键基因	小鼠和人类在脑出血后的脑组织小胶质细胞	机器学习	脑出血	单细胞RNA测序	XGBoost	单细胞转录组数据	未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠和人类脑出血后的脑组织	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
60	2026-03-16	CCR1hi/CCL5hi macrophage-mediated CCL5hi T cell chemotaxis in salivary gland aggravates Sjögren's syndrome 2026-Apr, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.06.076 PMID:40582566	研究论文	本研究揭示了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞通过CCL5介导的T细胞趋化作用，在唾液腺中加剧干燥综合征的发病机制	首次通过单细胞RNA测序和时间分析，明确了CCR1hi/CCL5hi巨噬细胞在干燥综合征唾液腺中的关键作用及其与T/B细胞的顺序性相互作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证相对有限，且未详细探讨CCR1/CCL5靶向治疗的具体临床转化路径	探究CCR1/CCL5在唾液腺淋巴细胞浸润和干燥综合征进展中的作用	干燥综合征患者及非肥胖糖尿病小鼠的唾液腺组织	单细胞组学	干燥综合征	单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 功能富集分析	NA	RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 图像数据	四个批量RNA-seq数据集, 干燥综合征患者及NOD小鼠唾液腺样本	NA	单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq	NA	NA