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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-05-02 |
Temporal modulation of microglial repopulation attenuates retinal degeneration in retinitis pigmentosa
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107295
PMID:41690604
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研究论文 | 探究时间性调控小胶质细胞再增殖在视网膜色素变性中对视网膜变性的缓解作用 | 首次发现小胶质细胞再增殖的时间依赖性表型可塑性,并提出两轮连续清除-再增殖策略以维持小胶质细胞稳态并保护视功能 | 研究主要基于rd10小鼠模型,需进一步验证在人类RP中的适用性;长期再增殖小胶质细胞恢复促炎表型的机制未完全阐明 | 评估时间性调控小胶质细胞清除与再增殖对视网膜色素变性小鼠模型视网膜变性的影响及其治疗潜力 | rd10小鼠视网膜小胶质细胞 | 机器学习 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | rd10小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 562 | 2026-05-02 |
Multi-omics analysis of the lactylation-driven microenvironment and non-invasive clinical translation in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-11016-w
PMID:41699363
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研究论文 | 通过整合多组学策略,研究赖氨酸乳酸化驱动的微环境及非侵入性临床转化在肝细胞癌中的价值 | 首次构建基于赖氨酸乳酸化的风险模型,并整合超声影像组学实现非侵入性预测,揭示乳酸化驱动的免疫抑制微环境与增殖性肿瘤表型 | 未在独立大规模外部队列中验证模型普适性,超声影像组学参数可能受设备差异影响 | 探究乳酸化相关风险模型在肝细胞癌中的临床预后评估及非侵入性预测潜力 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析, 免疫组化, Western blot, 单细胞测序, 超声影像组学 | 风险模型, 影像组学模型 | 转录组, 蛋白质组, 乳酸化修饰组, 单细胞测序数据, 超声图像 | 本地队列及公开肝癌队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-05-02 |
Macrophage CCL18 promotes lung inflammation in checkpoint inhibitor pneumonitis
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0405OC
PMID:41072117
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞CCL18在检查点抑制剂肺炎(CIP)中促进肺部炎症的作用机制 | 首次发现CCL18在CIP患者肺泡巨噬细胞中高表达,并且在小鼠模型中证实CCL18过表达可诱导类似人类CIP的肺部炎症表型 | 未提及具体局限性 | 探究CIP患者肺泡炎症的潜在机制 | CIP患者和对照组患者的支气管肺泡灌洗液(BALF)样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,ELISA | NA | 文本 | 人类BALF样本及多中心外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 564 | 2026-05-01 |
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72394-9
PMID:42056126
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 | 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 | 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 | 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析 |
| 565 | 2026-05-01 |
Spatial transcriptomic mapping of canine osteosarcoma reveals immune microenvironment features linked to survival
2026-Apr-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10152-9
PMID:42056464
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研究论文 | 利用空间转录组技术绘制犬骨肉瘤的免疫微环境图谱,揭示与生存相关的特征 | 首次使用10x Genomics Visium平台对犬骨肉瘤进行空间转录组分析,结合单细胞数据解卷积,识别与生存相关的免疫细胞空间共定位模式 | 样本量较小(11只犬的14个肿瘤样本),未提及技术重复或批次效应校正 | 探究犬骨肉瘤肿瘤内异质性和肿瘤微环境的空间特征,识别与生存相关的免疫微环境特征 | 11只犬的14个骨肉瘤肿瘤样本(包括原发、转移和复发肿瘤),按生存结果分层 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11只犬的14个肿瘤样本,共18,834个组织斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台用于新鲜冷冻犬骨肉瘤组织切片的空间基因表达分析 |
| 566 | 2026-05-01 |
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02641-4
PMID:42045172
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 | 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 | 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
|
综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 568 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
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评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
|
研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
|
研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用,并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型,并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物,并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 571 | 2026-05-01 |
A self-perpetuating cycle of Type H vessel proliferation and T-2 induced inflammation drives KBD pathogenesis
2026-Apr-16, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2026.04.004
PMID:42000119
|
研究论文 | 本研究探讨了T-2毒素诱导的H型血管增殖与炎症在大骨节病(KBD)发病机制中的作用,并验证了其形成自循环驱动KBD进展 | 首次发现H型血管在大骨节病发病中的关键中介作用,揭示了T-2毒素运输、炎症与软骨损伤之间的恶性循环机制 | 未明确说明 | 探究H型血管在大骨节病(KBD)发病机制中的作用 | 大鼠KBD模型、H型血管 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、qPCR、免疫荧光、组织病理学 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 大鼠分为四组:对照组、低硒+T-2组、低硒+T-2+Roxadustat组、低硒+T-2+Halofuginone组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
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研究论文 | 提出一种名为Locat的框架,通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失,识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集,Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失,并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架,以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-05-01 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
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研究论文 | 通过空间转录组学和双染料标记技术,揭示EphA4缺失内皮细胞中Wnt信号驱动的血脑屏障保护机制 | 首次结合双染料标记系统与空间转录组学,解析创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的时空动态及EphA4/Wnt信号通路的作用 | 未明确说明局限性 | 研究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征,以及EphA4/Wnt信号在保护血脑屏障中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学, 双染料标记, 免疫组化 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 小鼠样本,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 574 | 2026-05-01 |
Defining the RNA Modification Landscape of Multiple Myeloma Reveals METTL3-Dependent m6A Regulation of NEAT1
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716518
PMID:41993494
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研究论文 | 通过整合质谱、Nanopore直接RNA测序和甲基化RNA免疫沉淀测序,定义了多发性骨髓瘤的RNA修饰景观,并揭示了METTL3依赖的m6A修饰对NEAT1的调控作用 | 首次系统描绘多发性骨髓瘤中RNA修饰的全景图谱,发现了超过15000个m6A位点,并鉴定了m6A修饰的长链非编码RNA NEAT1在疾病中的关键调控作用 | 未明确提及研究的局限点 | 解析多发性骨髓瘤中的RNA修饰图谱及m6A修饰的长链非编码RNA在疾病中的作用机制 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 质谱, Nanopore直接RNA测序, 甲基化RNA免疫沉淀测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多发性骨髓瘤细胞和健康细胞样本 | Oxford Nanopore Technologies | Nanopore直接RNA测序, 单细胞RNA测序 | Nanopore测序平台 | Nanopore直接RNA测序用于鉴定RNA修饰类型和m6A位点 |
| 575 | 2026-05-01 |
The AICL-KLRF1 axis supports CD4-CD8 T cell communication and cytokine competence in pre-exhausted CD8+ T cells
2026-Apr, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00732-5
PMID:41851343
|
研究论文 | 该研究揭示了AICL-KLRF1轴在晚期分化CD8 T细胞中支持细胞因子产生,并促进CD4-CD8 T细胞通讯 | 首次发现KLRF1作为CD4-CD8通讯轴的一部分,通过识别其配体AICL来支持晚期分化CD8 T细胞的细胞因子产生能力 | 未详细说明研究的具体局限性 | 探究在慢性感染和癌症中,维持前体耗竭CD8 T细胞细胞因子产生的信号机制 | 人类CD8 T细胞、CD4 T细胞、肺腺癌组织及邻近组织 | 免疫学 | 肺癌 | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传组数据 | 肺腺癌和邻近组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序 |
| 576 | 2026-04-30 |
KDM6A promotes diabetic retinopathy via H3K27me3-dependent ferroptosis in Müller cells
2026-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08816-9
PMID:42049713
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研究论文 | 发现组蛋白去甲基化酶KDM6A通过H3K27me3依赖的铁死亡通路调控Müller细胞促进糖尿病视网膜病变的病理进程 | 首次揭示KDM6A通过表观遗传机制调控Müller细胞铁死亡在糖尿病视网膜病变中的关键作用 | 未提及 | 探索糖尿病视网膜病变中表观遗传调控机制 | 糖尿病视网膜病变患者视网膜组织、糖尿病小鼠模型、Müller细胞 | 机器学习 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类糖尿病视网膜病变视网膜样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台进行单细胞RNA测序 |
| 577 | 2026-04-30 |
Telomerase-Associated Genes as Prognostic Markers in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026-Apr-29, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research
IF:2.2Q3
DOI:10.12659/MSM.951804
PMID:42050900
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研究论文 | 本研究通过单细胞和 bulk RNA-seq 数据分析端粒酶相关基因在高浆液性卵巢癌中的预后价值,并构建了预后风险模型 | 首次结合单细胞 RNA 测序与 bulk RNA 测序数据,系统分析端粒酶相关基因在 HGSOC 中的细胞间通讯及预后作用,并开发了基于这些基因的预后模型 | 数据来源为公共数据库,缺乏独立外部验证组;研究为假设生成性质,需进一步实验验证 | 识别高浆液性卵巢癌(HGSOC)中端粒酶相关基因(TAGs)及其细胞相互作用,以发现新型预后标志物 | 高浆液性卵巢癌患者组织样本及正常组织样本 | 数字病理学和机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞 RNA 测序、Bulk RNA 测序 | Cox 比例风险模型、LASSO 回归 | 基因表达数据(单细胞与 bulk RNA-seq) | 来自公共数据集的多个样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞 RNA 测序、Bulk RNA 测序 | NA | NA |
| 578 | 2026-04-30 |
Uterine natural killer cell-mediated immune imbalance impairs uterine vascular remodeling and contributes to adverse pregnancy outcomes in dengue virus-infected mice
2026-Apr-29, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.03429-25
PMID:42053322
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研究论文 | 该研究探讨了登革病毒感染小鼠模型中子宫自然杀伤细胞介导的免疫失衡如何损害子宫血管重塑并导致不良妊娠结局 | 首次揭示了子宫自然杀伤细胞(uNK)亚群uNK2通过SPP1-CD44信号轴调控单核/巨噬细胞介导的中性粒细胞招募,从而导致子宫血管损伤和不良妊娠结局的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,结果向人类妊娠的转化需要进一步验证 | 阐明登革病毒感染导致子宫损伤的病理机制,为登革相关妊娠疾病的治疗干预提供新靶点 | 登革病毒感染的妊娠小鼠模型 | 机器学 | 登革热相关妊娠并发症 | 转录组分析、单细胞RNA测序、组织病理学分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 登革病毒感染的小鼠模型(具体数量未在摘要中明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2026-04-30 |
Gonadotrope Remodeling in Sustained Low Estrogen States: Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Gonadotrope Subtypes and Activation of Stem Cell Populations
2026-Apr-29, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag091
PMID:42053376
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序分析低雌激素状态下垂体促性腺激素细胞的亚型及干细胞激活 | 首次通过单细胞转录组学揭示低雌激素状态下促性腺激素细胞存在两个亚群(GON1和GON2),并发现垂体干细胞激活参与促性腺激素细胞群体扩张 | 基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未对VCD模型与自然绝经的直接差异进行对比验证 | 研究低雌激素和绝经状态对雌性垂体功能的影响,特别是促性腺激素细胞的基因表达和细胞状态变化 | VCD诱导卵巢衰竭模型小鼠的垂体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq, RT-qPCR | NA | 基因表达数据 | VCD处理小鼠与正常发情期小鼠的垂体样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 580 | 2026-04-30 |
Spatial Mapping of Single Cells via Correlation and Importance Between Cells and Spots
2026-Apr-29, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00837-4
PMID:42053776
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研究论文 | 提出SM-CI方法,通过细胞与斑点间的相关性和重要性进行单细胞空间定位 | 针对空间转录组学和单细胞RNA测序数据的缺失事件设计独特的填补策略,并引入斑点(或细胞)重要性评估标准,构建线性规划模型整合相关性与重要性度量,提高空间定位准确性 | 未提及具体限制条件 | 提高单细胞空间定位的准确性,以理解生物过程、疾病机制和治疗策略 | 模拟数据集和真实数据集中的细胞和空间斑点 | 机器学习 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 线性规划模型 | 基因表达数据,空间位置数据 | 模拟数据集和多个真实数据集 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |