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当前共找到 945 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-05-06 |
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.aec3133
PMID:41961948
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研究论文 | 提出一种空间TCR图谱分析策略，以单细胞分辨率解析头颈鳞癌中T细胞克隆、转录状态和空间位置的关系 | 首次实现单细胞层面同时解析T细胞克隆身份、转录状态和空间位置，揭示肿瘤微环境中T细胞状态的空间协调性 | 标题和摘要未提及明显局限性 | 开发空间TCR图谱方法，解析头颈癌肿瘤微环境中T细胞的空间组织与功能状态 | 人原发性头颈部鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 头颈癌 | 空间TCR图谱分析 | NA | 空间转录组与TCR测序数据 | 多例头颈鳞癌患者样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 562 | 2026-05-06 |
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012980
PMID:41963079
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研究论文 | 发现表达CD55的髓系来源抑制细胞（MDSCs）驱动肿瘤免疫逃逸 | 首次鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物，并揭示其通过代谢重编程（促进糖原磷酸化酶PYGL磷酸化驱动糖酵解）维持免疫抑制表型的新机制 | 主要基于小鼠模型和体外实验，临床样本验证规模有限；托马替丁等小分子抑制剂的体内应用效果需进一步评估 | 阐明MDSCs表面分子CD55在肿瘤免疫逃逸中的作用机制及治疗潜力 | MDSCs及其表达的CD55分子 | 数字病理学 | 多种癌症类型（八种癌症） | 单细胞RNA测序、RNA测序、DNA pulldown、染色质免疫共沉淀、荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、免疫印迹、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 八种癌症类型的公共单细胞RNA测序数据集、人类患者样本及小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2026-05-06 |
QuantumXCT: Learning Interaction-Induced State Transformation in Cell-Cell Communication via Quantum Entanglement and Generative Modeling
2026-Apr-09, ArXiv
PMID:41958473
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research paper | 提出一个混合量子-经典生成框架QuantumXCT，从单细胞转录组中推断细胞间通讯，通过量子纠缠学习相互作用诱导的状态变换 | 将细胞间通讯推断从静态配体-受体数据库查询转变为学习数据驱动的状态变换，利用量子电路的可解释性揭示生物通信网络，无需先验生物学假设 | 未明确说明，但可能受限于量子电路的规模及对合成数据的验证而非大规模真实数据 | 开发一种无先验知识依赖的细胞间通讯推断方法，通过量子机器学习建模信号导致的细胞状态变化 | 卵巢癌-成纤维细胞共培养模型中的单细胞转录组数据及合成数据中的已知交互 | machine learning, quantum machine learning, computational biology | ovarian cancer | single-cell RNA-seq, quantum computing | hybrid quantum-classical generative model, parameterized quantum circuits | gene expression data, synthetic data | 未知具体样本数量，涉及卵巢癌-成纤维细胞共培养的scRNA-seq数据 | Illumina（假设用于scRNA-seq测序，从上下文推断） | single-cell RNA-seq | NA（未在标题或摘要中指定具体平台产品） | NA |
| 564 | 2026-05-06 |
Generation of a prop1 knock-in zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-07, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag043
PMID:42035243
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研究论文 | 通过生成prop1敲入斑马鱼，利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 | 首次创建了prop1基因敲入GAL4报告基因斑马鱼品系，实现了对早期垂体发育的单细胞分辨率和活体成像研究，并提供了首个斑马鱼早期垂体发育的单细胞图谱 | 未明确提及 | 研究脊椎动物腺垂体原基发育的早期分子机制及内分泌细胞谱系分化 | 斑马鱼和小鼠的早期垂体组织 | 单细胞转录组学 | 垂体发育相关疾病（如侏儒症、性成熟障碍） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、活体成像 | NA | 单细胞转录组数据 | 斑马鱼和小鼠垂体组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 565 | 2026-05-06 |
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-026-00896-z
PMID:42080143
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综述 | 全面综述心脏纤维化的机械生物学、表观遗传学机制及精准治疗路径 | 整合单细胞和空间转录组学、生物力学及表观遗传学数据，系统阐述纤维化细胞异质性与分子环路；提出CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T、纳米RNA递送及患者心脏类器官等新兴可逆疗法；构建结合基因组学、生物标志物、AI和环境风险评估的精准抗纤维化策略 | 作为综述，未提供原创实验数据；新兴疗法的临床转化尚处于早期阶段，缺乏大规模验证 | 阐明心脏纤维化的机械生物学与表观遗传学机制，并规划从基础研究到临床精准治疗的转化路线图 | 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞-细胞外基质串扰、机械传导信号及表观遗传调控网络 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学，空间转录组学，基因编辑，CAR-T免疫疗法，纳米医学，类器官技术 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium空间转录组学平台 |
| 566 | 2026-05-05 |
Kidney Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Contribute to Myeloid Development and Pathology in Lupus Nephritis
2026-Apr-28, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70201
PMID:42047318
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研究论文 | 探讨肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎中对髓系发育和病理的贡献 | 首次证明肾脏中的造血干细胞和祖细胞参与髓外造血，并通过局部髓系细胞扩增促进狼疮性肾炎进展 | 主要基于小鼠模型，人源样本分析有限，可能需要进一步验证临床相关性 | 研究髓外造血和肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用 | 狼疮性肾炎小鼠模型（MRL/lpr和TLR7激动剂诱导）及患者尿液样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、免疫染色、过继转移实验 | NA | 序列数据、图像数据 | 两种小鼠模型及狼疮性肾炎患者尿液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于肾脏和骨髓祖细胞分析 |
| 567 | 2026-05-05 |
scSketch: Interactive Sketch-based Trajectory Exploration and Pathway-Aware Analysis of Single-Cell Data
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.16.718997
PMID:42079097
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研究论文 | scSketch是一个交互式工具，允许用户通过草图轨迹探索单细胞数据中的基因表达梯度并进行通路感知分析 | 首次允许用户通过绘制轨迹交互式探索单细胞数据，并在迭代探索中保持统计有效性和生物学可解释性，同时自动计算基因-轨迹相关性并应用在线错误发现率控制 | NA | 开发一个能够交互式探索单细胞数据中轨迹假设并保持统计有效性和生物学可解释性的工具 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达梯度及细胞状态转变过程 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-05-05 |
Interpreting and Validating a Deep Learning Model Predictive of Spatial Morphologic-Molecular Patterns in Lung Adenocarcinoma, Using Ground Truth Immunohistochemistry Images
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719723
PMID:42079136
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研究论文 | 开发并验证了深度学习模型XpressO-Lung，该模型利用常规H&E染色的全切片图像预测肺腺癌中空间形态-分子模式，并通过免疫组化在外部临床样本中验证 | 首次实现通过常规病理切片预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性，无需空间转录组学技术，且模型具有可解释性 | 训练样本仅来自TCGA的200例肺腺癌病例，可能存在选择偏倚；预测基因数量有限；AUC范围0.64-0.92，部分基因预测性能中等 | 开发可解释的深度学习模型，通过学习组织形态与批量转录组数据的关联，在常规病理切片上预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性 | 肺腺癌肿瘤组织及其微环境中的空间基因表达模式 | 数字病理学 | 肺癌 | 深度学习 | 可解释深度学习模型 | 图像 | 200例TCGA肺腺癌病例用于训练，外部验证集来自Dartmouth Health的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 569 | 2026-05-05 |
Ancestry-specific rewiring of BCR-MAPK signaling in sarcoidosis B cells
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.718985
PMID:42079256
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示结节病B细胞中BCR-MAPK信号通路的祖先特异性重构 | 首次在单细胞水平上揭示结节病B细胞中MAPK信号重编程及BCR的祖先特异性扩增，并发现与非裔和欧裔人群疾病差异相关的基因表达模式 | 未提及 | 探究B细胞在结节病发病机制中的作用及其在不同祖先人群中的差异 | 外周血单核细胞（PBMCs）来自非洲裔和欧洲裔个体，包括健康对照、结节病患者和系统性红斑狼疮（SLE）患者 | 单细胞转录组学 | 结节病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 48名健康对照、59名结节病患者、28名SLE患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-05-05 |
Generative AI-assisted Bayesian-frequentist Hybrid Inference in Single-cell RNA Sequencing Analysis for Genes Associated with Alzheimer's Disease
2026-Apr-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.17.26351142
PMID:42078386
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research paper | 提出了一种生成式AI辅助的贝叶斯-频率学派混合推断框架，用于单细胞RNA测序分析中与阿尔茨海默病相关的基因 | 首次将基于大语言模型的先验知识获取与混合推断理论相结合，在基因组范围贝叶斯分析中实现了计算高效和统计效能提升 | 依赖于ChatGPT-4o的标准化提示输出，可能受限于先验校准的准确性；仅在线性模型下推导了闭式混合估计量，尚未扩展到非线性模型 | 开发一种计算可扩展的贝叶斯-频率学派混合推断方法，用于高维组学数据的全基因组关联分析 | ROSMAP队列中阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 | machine learning | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型（ChatGPT-4o）、线性模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-05-05 |
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717568
PMID:41993495
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研究论文 | 展示了一种在秀丽隐杆线虫完整个体中实现单细胞分辨率空间转录组学的工作流程 | 首次在完整生物体上实现单细胞分辨率的多重空间转录成像，通过最多40个基因的连续成像保留空间背景，并结合标记基因面板实现神经元可重复识别 | 目前仅适用于线虫紧凑透明的体型，可能难以直接扩展到更大或更复杂的生物体 | 开发一种可扩展的空间转录组学框架，用于分析完整生物体中的基因表达和细胞身份 | 秀丽隐杆线虫 | 数字病理学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH），多重成像 | NA | 图像 | 整个秀丽隐杆线虫个体 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-05-05 |
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717745
PMID:41993308
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研究论文 | 发现Hippo信号通路失调是双相情感障碍中脉络丛缺陷的汇聚机制 | 首次通过人类大脑类器官和脉络丛类器官揭示Hippo通路激活驱动脉络丛过度生长，并整合遗传学证据表明该通路在双相情感障碍病理中的关键作用 | 未提及具体局限性 | 探究双相情感障碍中脉络丛异常的分子机制 | 双相情感障碍患者与健康对照者来源的人类皮层类器官和脉络丛类器官 | 数字病理学 | 双相情感障碍 | 单细胞转录组学，全基因组关联研究，结构磁共振成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 双相情感障碍患者和健康对照者来源的类器官及结构磁共振成像扫描 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序，全基因组测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞转录组测序，Illumina NovaSeq平台进行全基因组测序 |
| 573 | 2026-05-05 |
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717037
PMID:41993275
|
研究论文 | 提出SCOPE框架，利用半监督共形预测将单细胞分化中的命运决策状态及表观遗传预启动局部化至离散转录组学窗口 | 首次通过共形推断形式化命运不确定性，在高维单细胞数据中严格界定细胞命运承诺的边界，并揭示染色质可及性先于基因表达的时序滞后 | 依赖于共形预测的假设（数据可交换性），在高度噪声或样本量较小的数据中性能可能受限 | 定位单细胞分化中命运决策的关键转录组学状态及调控因子 | 模拟数据、谱系追踪的小鼠造血系统、多个人类造血数据集和人类视网膜发生数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多组学测序 | 半监督共形预测 | 基因表达数据、染色质可及性数据 | 涵盖模拟、小鼠造血、人类造血及人类视网膜发生的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 | NA | NA |
| 574 | 2026-05-05 |
Chemotherapy-Induced Oral Mucosal Injury Is Defined by p53 Activation, Cell Cycle Arrest and Diverse Epithelial Progenitor Dynamics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716752
PMID:41993375
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研究论文 | 通过小鼠模型研究化疗诱导的口腔黏膜损伤的机制，定义p53激活、细胞周期阻滞和不同上皮祖细胞动态变化 | 首次揭示化疗诱导的口腔黏膜损伤主要由细胞周期阻滞而非凋亡驱动，并发现口腔黏膜独特的代谢重编程和p53/AP-1基因特征的化学耐药细胞群 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全代表人类口腔黏膜对化疗的反应 | 阐明化疗诱导的口腔黏膜损伤和修复的分子机制 | 5-氟尿嘧啶诱导的口腔黏膜炎小鼠模型中的口腔黏膜组织 | 自然语言处理 | 口腔黏膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-05-05 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716681
PMID:41993334
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示Adgrg6与Sox9在脊柱稳定中的遗传互作机制 | 首次提出Adgrg6和Sox9之间的前馈调控环路，为青少年特发性脊柱侧凸的遗传机制提供新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明Adgrg6和Sox9在脊柱稳定中的功能互作及对青少年特发性脊柱侧凸的致病机制 | Adgrg6条件敲除小鼠及Sox9低表达等位基因小鼠的脊柱组织 | 机器学习 | 青少年特发性脊柱侧凸 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脊柱组织样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 576 | 2026-05-05 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
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研究论文 | 通过斑马鱼外眼运动神经元的转录组分析，发现 sim1a 是潜在的斜视相关基因 | 利用斑马鱼作为模型进行外眼运动神经元的单细胞和批量测序，揭示了 nIII/nIV 脑神经核中运动神经元亚群的转录组多样性，并建立了研究眼运动疾病病因的筛选管道 | 仅进行了 CRISPR/Cas9 介导的基因敲除功能验证，未在人类样本中直接验证；仅检测了前庭眼反射行为，未评估其他眼动功能 | 鉴定调控外眼运动神经元发育并与斜视相关的候选基因 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元（颅神经核 nIII/nIV 中的神经元亚群） | 数字病理学 | 斜视 | NGS, 单细胞测序, 批量RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 转录组数据（RNA-seq） | 斑马鱼幼虫（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 577 | 2026-05-05 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 通过细胞分辨双光子成像和空间转录组学，将小鼠海马体抑制性回路的分子身份与体内功能动态直接关联 | 建立端到端流程，结合双光子钙成像与空间转录组学，揭示转录组轴与神经元功能动态的对应关系，并证明仅凭生理特征即可恢复转录组分类 | 研究仅限于小鼠海马体CA1区，且虚拟现实导航行为的复杂性可能限制生理反应分类的普适性 | 在单细胞分辨率下桥接神经元分子身份与功能动态的关系 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元 | 数字病理学， 机器学习 | NA | 空间转录组学， 双光子钙成像 | 分类器 | 基因表达数据， 成像数据 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 578 | 2026-05-05 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序分析肺纤维化消退过程中的细胞表型、信号通路和细胞间通讯变化 | 首次在自发消退的肺纤维化小鼠模型中进行纵向单细胞RNA测序，系统描绘了纤维化消退过程中免疫、间质和上皮细胞的动态变化，并发现cAMP、HGF/MET和TWEAK等潜在抗纤维化通路 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺纤维化消退机制；单细胞测序缺乏空间信息，无法提供细胞在组织中的位置分布 | 阐明肺纤维化自发消退过程中涉及的信号通路、细胞间通讯和表型变化，为治疗肺纤维化发现内源性通路 | 小鼠全肺细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自发消退纤维化小鼠模型的纵向样本，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 579 | 2026-05-05 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
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研究论文 | STDrug是一个空间感知的计算框架，整合空间转录组学、图建模和多模态学习，实现患者特异性的药物重定位 | 首次将空间转录组学与药物重定位结合，通过图卷积网络和相干点漂移技术对齐疾病与对照空间域，并融合多模态学习进行药物优先排序 | 需要利用空间转录组数据，可能对数据质量和可用性有较高要求；且仅通过肝细胞癌和前列腺癌数据集验证，泛化性有待进一步测试 | 利用空间转录组学实现患者特异性的药物重定位 | 肝细胞癌和前列腺癌患者的空间转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 机器学习框架 | 空间转录组数据 | 肝细胞癌和前列腺癌数据集（具体样本数未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 580 | 2026-05-05 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本文发现SKAP2基因的功能获得性突变通过髓系细胞中过度活跃的整合素信号通路导致1型糖尿病和更广泛的自身免疫 | 首次鉴定出SKAP2基因功能获得性突变与1型糖尿病相关，并通过整合素信号过度激活解释机制 | 研究主要基于小鼠模型，突变对人类的直接作用需进一步验证 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病和自身免疫的机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠（NOD和C57BL/6J遗传背景） | 机器学习 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带突变的SKAP2小鼠（雌性和雄性）与对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |