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当前共找到 951 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-05-05 |
Chemotherapy-Induced Oral Mucosal Injury Is Defined by p53 Activation, Cell Cycle Arrest and Diverse Epithelial Progenitor Dynamics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716752
PMID:41993375
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研究论文 | 通过小鼠模型研究化疗诱导的口腔黏膜损伤的机制，定义p53激活、细胞周期阻滞和不同上皮祖细胞动态变化 | 首次揭示化疗诱导的口腔黏膜损伤主要由细胞周期阻滞而非凋亡驱动，并发现口腔黏膜独特的代谢重编程和p53/AP-1基因特征的化学耐药细胞群 | 研究局限于小鼠模型，可能无法完全代表人类口腔黏膜对化疗的反应 | 阐明化疗诱导的口腔黏膜损伤和修复的分子机制 | 5-氟尿嘧啶诱导的口腔黏膜炎小鼠模型中的口腔黏膜组织 | 自然语言处理 | 口腔黏膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-05-05 |
Genetic interaction between Adgrg6 and Sox9 reveals a feedforward mechanism for postnatal spinal stability
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716681
PMID:41993334
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示Adgrg6与Sox9在脊柱稳定中的遗传互作机制 | 首次提出Adgrg6和Sox9之间的前馈调控环路，为青少年特发性脊柱侧凸的遗传机制提供新见解 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 阐明Adgrg6和Sox9在脊柱稳定中的功能互作及对青少年特发性脊柱侧凸的致病机制 | Adgrg6条件敲除小鼠及Sox9低表达等位基因小鼠的脊柱组织 | 机器学习 | 青少年特发性脊柱侧凸 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠脊柱组织样本，具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 503 | 2026-05-05 |
Transcriptional profiling of extraocular motor neurons reveals sim1a as a candidate strabismus-related gene
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717009
PMID:41993546
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研究论文 | 通过斑马鱼外眼运动神经元的转录组分析，发现 sim1a 是潜在的斜视相关基因 | 利用斑马鱼作为模型进行外眼运动神经元的单细胞和批量测序，揭示了 nIII/nIV 脑神经核中运动神经元亚群的转录组多样性，并建立了研究眼运动疾病病因的筛选管道 | 仅进行了 CRISPR/Cas9 介导的基因敲除功能验证，未在人类样本中直接验证；仅检测了前庭眼反射行为，未评估其他眼动功能 | 鉴定调控外眼运动神经元发育并与斜视相关的候选基因 | 斑马鱼幼虫的外眼运动神经元（颅神经核 nIII/nIV 中的神经元亚群） | 数字病理学 | 斜视 | NGS, 单细胞测序, 批量RNA测序, CRISPR/Cas9 | NA | 转录组数据（RNA-seq） | 斑马鱼幼虫（未具体说明数量） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2026-05-05 |
A transcriptomic axis aligns with in vivo functional dynamics in hippocampal inhibitory circuits
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716935
PMID:41993541
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研究论文 | 通过细胞分辨双光子成像和空间转录组学，将小鼠海马体抑制性回路的分子身份与体内功能动态直接关联 | 建立端到端流程，结合双光子钙成像与空间转录组学，揭示转录组轴与神经元功能动态的对应关系，并证明仅凭生理特征即可恢复转录组分类 | 研究仅限于小鼠海马体CA1区，且虚拟现实导航行为的复杂性可能限制生理反应分类的普适性 | 在单细胞分辨率下桥接神经元分子身份与功能动态的关系 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元 | 数字病理学， 机器学习 | NA | 空间转录组学， 双光子钙成像 | 分类器 | 基因表达数据， 成像数据 | 小鼠海马体CA1区的抑制性中间神经元（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 505 | 2026-05-05 |
Longitudinal Single-Cell RNA-seq Profiling of Lung Cell Phenotypes, Signaling, and Cross-talk During Fibrosis Resolution
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.06.716772
PMID:41993271
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序分析肺纤维化消退过程中的细胞表型、信号通路和细胞间通讯变化 | 首次在自发消退的肺纤维化小鼠模型中进行纵向单细胞RNA测序，系统描绘了纤维化消退过程中免疫、间质和上皮细胞的动态变化，并发现cAMP、HGF/MET和TWEAK等潜在抗纤维化通路 | 研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类肺纤维化消退机制；单细胞测序缺乏空间信息，无法提供细胞在组织中的位置分布 | 阐明肺纤维化自发消退过程中涉及的信号通路、细胞间通讯和表型变化，为治疗肺纤维化发现内源性通路 | 小鼠全肺细胞 | 单细胞基因组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 自发消退纤维化小鼠模型的纵向样本，具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 506 | 2026-05-05 |
STDrug enables spatially informed personalized drug repurposing from spatial transcriptomics
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.715101
PMID:41993522
|
研究论文 | STDrug是一个空间感知的计算框架，整合空间转录组学、图建模和多模态学习，实现患者特异性的药物重定位 | 首次将空间转录组学与药物重定位结合，通过图卷积网络和相干点漂移技术对齐疾病与对照空间域，并融合多模态学习进行药物优先排序 | 需要利用空间转录组数据，可能对数据质量和可用性有较高要求；且仅通过肝细胞癌和前列腺癌数据集验证，泛化性有待进一步测试 | 利用空间转录组学实现患者特异性的药物重定位 | 肝细胞癌和前列腺癌患者的空间转录组数据 | 机器学习 | 肝细胞癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络, 机器学习框架 | 空间转录组数据 | 肝细胞癌和前列腺癌数据集（具体样本数未提供） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 507 | 2026-05-05 |
Gain-of-function mutation in SKAP2 leads to type 1 diabetes and broader autoimmunity through hyperactive integrin signaling in myeloid cells
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716136
PMID:41993266
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研究论文 | 本文发现SKAP2基因的功能获得性突变通过髓系细胞中过度活跃的整合素信号通路导致1型糖尿病和更广泛的自身免疫 | 首次鉴定出SKAP2基因功能获得性突变与1型糖尿病相关，并通过整合素信号过度激活解释机制 | 研究主要基于小鼠模型，突变对人类的直接作用需进一步验证 | 阐明SKAP2基因突变导致1型糖尿病和自身免疫的机制 | 携带SKAP2 p.G153R突变的小鼠（NOD和C57BL/6J遗传背景） | 机器学习 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 携带突变的SKAP2小鼠（雌性和雄性）与对照小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 508 | 2026-05-05 |
Halo: a pretrained model for whole-cell segmentation from nuclei images in spatial transcriptomics
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716237
PMID:41993456
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研究论文 | 介绍Halo，一种基于核形态与RNA转录本空间分布整合的全细胞分割预训练模型，用于空间转录组学中从细胞核图像重建全细胞边界 | 提出Halo模型，直接整合原子核形态与RNA转录本的空间分布，无需特定数据集训练即可应用于新数据集，且在多种组织中优于传统核扩张策略 | NA | 开发一种通用且可规模化的全细胞分割模型，提高图像空间转录组学中细胞边界推断的准确性和可重复性 | 空间转录组学中的细胞核图像和RNA转录本坐标 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | Cellpose-SAM | 图像 | 12种组织类型的Xenium多模态数据 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 509 | 2026-05-05 |
Comparative single cell analysis of wound and cancer identifies the metabolic dialogues between tumor initiating stem cells and macrophages
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716187
PMID:41993506
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研究论文 | 通过比较单细胞分析揭示伤口愈合与癌症中肿瘤起始干细胞与巨噬细胞之间的代谢对话 | 首次通过比较单细胞RNA测序揭示伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的差异，发现失调的脂质代谢是TAMs的独特特征，并识别SOX2肿瘤起始干细胞为调控TAMs脂质代谢和细胞状态的关键协调者 | NA | 探究伤口相关巨噬细胞与肿瘤相关巨噬细胞的分子和功能差异，以及肿瘤起始干细胞如何调节TAMs的代谢对话 | 皮肤伤口愈合和皮肤鳞状细胞癌进展过程中的巨噬细胞和SOX2肿瘤起始干细胞 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 510 | 2026-05-05 |
Single-cell, clonal and spatial atlases of cranial placodes illuminate their specification and evolution
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715621
PMID:41959073
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研究论文 | 整合单细胞、克隆和空间图谱揭示颅窝的发育和进化机制 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和高分辨率克隆追踪整合，构建颅窝发育的综合性图谱，揭示前体细胞连续转录景观及竞争性谱系分离模型 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或跨物种比较的潜在偏差 | 解析颅窝前体细胞的谱系分化动态和进化起源 | 脊椎动物颅窝及其前体细胞 | 生物信息学, 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 克隆追踪 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据, 克隆谱系数据 | 涉及多个脊椎动物样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 511 | 2026-05-05 |
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10169-4
PMID:41741649
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研究论文 | 通过多组学单细胞测序技术，研究了人类海马神经发生在成年期、衰老和阿尔茨海默病中的变化及其分子机制 | 首次利用多组学单细胞测序（单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序）分析大规模海马样本，揭示了神经发生失调与染色质可及性变化的关联，并识别了SuperAgers中的‘韧性特征’ | 研究仅基于死后人体样本，样本量有限，且未直接验证神经发生在认知功能中的因果关系 | 探索人类海马神经发生是否存在，以及其在衰老和阿尔茨海默病中的调控机制和认知影响 | 来自不同队列的人类死后海马样本，包括记忆完整的年轻成人、无认知障碍的老年人、有非凡记忆能力的老年人（SuperAgers）、临床前中间病理成人及阿尔茨海默病患者 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞测序数据 | 355,997个海马样本的单细胞核 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞核RNA测序和单细胞核ATAC测序 |
| 512 | 2026-05-05 |
How to efficiently establish animal models of cholangiocarcinoma: challenges and inspiration
2026-Apr, Medical review (2021)
DOI:10.1515/mr-2025-0081
PMID:42078198
|
综述 | 本文综述了胆管癌动物模型建立的方法、挑战与启示，重点讨论了原发性胆管癌模型在临床前研究中的应用及其局限性 | 强调单细胞测序技术在癌症模型研究中的创新应用和巨大潜力，并系统分析了肝内外胆管发育差异对模型构建的影响 | 原生胆管癌模型存在固有局限性，需要进一步改进和优化 | 为建立更先进、更具临床相关性的胆管癌模型提供建议和推荐 | 胆管癌动物模型（包括原发性胆管癌模型、胆管癌类器官等） | 机器学习 | 胆管癌 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 513 | 2026-05-04 |
Integrative multi-omics analysis identifies stromal-immune crosstalk as a determinant of immunotherapy efficacy and establishes a prognostic signature in gastric cancer
2026-Apr-23, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
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研究论文 | 通过多组学整合分析揭示胃癌中基质-免疫互作对免疫检查点抑制剂疗效的影响，并建立预后特征 | 首次将基质-免疫细胞间通信（MHC-I和胶原/层粘连蛋白信号）与帕博利珠单抗耐药机制直接关联，并开发了包含VWF/VCAN等基因的预后评分系统（LSR） | 文中未明确提及研究的局限性 | 探究转移性胃癌中帕博利珠单抗疗效的分子驱动因素，并建立预后签名 | 转移性胃癌患者（包括帕博利珠单抗治疗组及多个独立队列） | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 多组学分析 | Lasso-Cox回归模型（用于构建预后签名） | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 包含TIGER数据库中帕博利珠单抗治疗的胃癌队列，以及4个独立验证队列（来自GEO和TCGA数据库） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据来自GEO数据库，空间转录组学用于GC组织分析 |
| 514 | 2026-05-04 |
Endothelial Adgrl2 Expression and Alternative Splicing Controls the Cerebrovasculature
2026-04-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0019-26.2026
PMID:41876233
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研究论文 | 研究内皮细胞Adgrl2表达和可变剪接对脑血管系统发育和功能的影响 | 发现Adgrl2基因在神经元和内皮细胞中通过细胞类型特异性可变剪接产生不同异构体，分别调控神经回路组装和脑血管稳态 | 主要基于小鼠模型，人类脑血管中Adgrl2的类似功能尚需验证 | 探究Adgrl2在内皮细胞中的功能及其可变剪接对脑血管完整性及血脑屏障稳态的调控机制 | 小鼠（雌雄兼用）的脑血管内皮细胞和神经元 | 神经生物学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 515 | 2026-05-04 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lung Tissue in a Rat Model of Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-04-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70491
PMID:42044167
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研究论文 | 介绍了一种在脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中进行肺组织单细胞RNA测序的标准化方案，揭示了21种细胞群体和6种巨噬细胞/单核细胞亚群的转录特征 | 建立了可重复的单细胞RNA测序工作流程，包括优化的组织解离、严格质量控制、双细胞去除和批次效应校正，首次在ARDS大鼠模型中识别了六种巨噬细胞/单核细胞亚群的独特转录特征 | 该研究基于动物模型，其发现可能不完全适用于人类ARDS；同时技术变异可能影响结果的稳定性和可重复性 | 开发并标准化用于ARDS肺组织单细胞RNA测序的分析流程，以深入解析细胞异质性和炎症机制 | 脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中的肺组织细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2026-05-04 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
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研究论文 | 利用整体和空间转录组学在大鼠模型中定义了出血性休克、横纹肌溶解及其组合对肾脏的早期反应 | 首次在创伤诱导的急性肾损伤大鼠模型中应用商用小鼠空间转录组探针，实现了成本效益高且区域特异性的基因表达谱分析，并揭示了横纹肌溶解作为转录变化主要驱动因素及协同致死反应的分子机制 | 未提及 | 定义出血性休克和横纹肌溶解单独及组合对大鼠肾脏的早期转录反应机制 | 创伤诱导急性肾损伤的大鼠模型 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、整体转录组学 | NA | 文本、图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、整体RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, MGI DNBSEQ | 商用小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾组织、整体RNA测序 |
| 517 | 2026-05-04 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
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research paper | 开发了一种名为人工土壤（ArtSoil）的合成植物生长培养基，能够模拟土壤条件，支持植物生长并维持土壤微生物组，避免了传统培养基中蔗糖的副作用 | 首次提出一种无需添加糖分的合成培养基，通过添加水性土壤提取物保持土壤微生物组和土壤因素，使植物在类似土壤的条件下生长，更接近自然状态 | 文章未明确说明ArtSoil在不同土壤类型或长期培养中的稳定性，以及其在实际农业应用中的可行性 | 开发一种更接近土壤条件的合成植物生长培养基，以便在实验室中准确研究植物生理和多组学特征 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | machine learning | NA | NA | NA | single-cell transcriptomics data | 拟南芥样本在不同生长条件下进行比较，未提供具体数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 518 | 2026-05-04 |
Molecular Characterization of the Effect of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Semaglutide in the Nephrotoxic Serum Nephritis Mouse Model
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001067
PMID:41945470
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研究论文 | 探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂Semaglutide在肾毒性血清肾炎小鼠模型中的作用机制 | 首次在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中揭示Semaglutide通过抗炎、抗纤维化及改善肾血流动力学独立于代谢效应的肾脏保护作用 | 仅在小鼠模型中进行研究，尚未在人类中验证；未涉及长期治疗效果评估 | 阐明Semaglutide在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中的肾脏保护机制 | 肾毒性血清肾炎小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 空间转录组测序、单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠（具体数量未提及） | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织切片分析；10x Chromium单细胞核RNA测序用于肾细胞亚群分析 |
| 519 | 2026-05-04 |
Cell type annotation for scATAC-seq via DNA large language model and graph domain adaptation
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014226
PMID:42060707
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研究论文 | 提出scLLMDA框架，利用DNA大语言模型和图域自适应实现scATAC-seq细胞类型注释 | 首次结合DNA特异性语言模型和图神经网络进行域自适应，捕获峰值序列上下文嵌入与细胞邻域结构，解决了跨模态注释的模态不匹配和信号失真问题 | 文章未明确提到局限性，但可能依赖参考数据的质量与相似性，且大规模数据集的计算效率有待验证 | 开发更准确和鲁棒的scATAC-seq细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | ATAC-seq | DNA大语言模型、图神经网络 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 520 | 2026-05-03 |
Deep-learning-based de novo discovery and design of therapeutics that reverse disease-associated transcriptional phenotypes
2026-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.016
PMID:41850287
|
研究论文 | 提出基于深度学习的药物发现平台GPS，通过逆转疾病相关的转录表型实现从头药物发现和优化 | 首次将转录组特征直接用于从头药物发现而非仅药物重定位，并开发仅从化学结构预测转录扰动特征的方法 | 未充分讨论模型在复杂疾病中的泛化性及化合物合成可行性 | 开发基于深度学习的药物发现平台，通过逆转疾病相关转录特征实现新药发现 | 肝细胞癌和特发性肺纤维化疾病模型 | 机器学习 | 肝细胞癌, 特发性肺纤维化 | RNA-seq | 深度学习模型（具体架构未明确）、树搜索优化方法 | 转录组数据、化学结构数据 | 多个疾病案例及两项验证（肝细胞癌：两个化合物系列；特发性肺纤维化：一个重定位候选和一种新抗纤维化化合物） | NA | NA | NA | NA |