单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202604-202604] [清除筛选条件]
当前共找到 943 篇文献,本页显示第 481 - 500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-04-23
Single-cell transcriptome analysis reveals the association between ketone body synthesis and morphogenic profile of intestinal epithelia in neonatal mice
2026-Apr, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了新生小鼠肠道上皮细胞中酮体合成与细胞形态发生特征之间的关联 首次在新生小鼠肠道上皮细胞中发现了酮体合成基因的上调与细胞形态发生基因高表达之间的相关性,而非主要作为能量来源 研究仅关注了10天和21天两个时间点的小鼠,未涵盖更广泛的发育阶段;且仅分析了特定病原体无菌和普通条件下的样本,可能未完全反映真实肠道环境 探究新生儿期肠道上皮细胞的早期生命特征及其成熟过程 新生(10天)和幼年(21天)小鼠的肠道上皮细胞 单细胞转录组学 肠道疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 新生和幼年小鼠的肠道上皮细胞,具体样本数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
482 2026-04-23
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Apr, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病的免疫-基质微环境的关键细胞亚群及其相互作用 开发了使用微型支气管镜的位点特异性矽肺小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯模型,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)亚群的分化轨迹及其与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)的互作网络 研究主要基于全肺灌洗液样本,可能无法完全代表肺组织原位微环境;小鼠模型虽具位点特异性,但与人类疾病进程的完全对应仍需进一步验证 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以识别可干预的免疫-基质轴靶点 矽肺病患者(人类)和矽肺病小鼠模型的肺组织免疫与基质细胞 数字病理学 肺纤维化/矽肺病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞间通讯建模 细胞间通讯网络模型 单细胞转录组数据 人类矽肺病患者全肺灌洗液样本及矽肺病小鼠模型样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
483 2026-04-23
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析年轻与老年小鼠疫苗接种后淋巴结变化,揭示了树突状细胞迁移缺陷是老年免疫衰退的关键机制,并提出口服酵母来源纳米颗粒可改善此缺陷以增强疫苗效果 首次通过单细胞RNA测序鉴定老年小鼠树突状细胞迁移缺陷及相关基因特征,并开发口服纳米颗粒非侵入性策略靶向肠道-免疫互作改善疫苗效果 研究基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证;未详细探讨纳米颗粒长期安全性 探究衰老导致疫苗效果下降的免疫机制并开发干预策略 年轻与老年小鼠的树突状细胞及淋巴结组织 免疫学 老年疾病 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 年轻与老年小鼠群体(具体数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
484 2026-04-23
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Apr, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文介绍了CellVoyager,一个基于大语言模型的AI代理,能够自主生成并执行单细胞RNA测序分析,以加速计算生物学研究 开发了首个能够自主生成并实施scRNA-seq分析的AI代理,在预测已发表研究分析方法方面优于GPT-4o和o3-mini,并能产生专家认可的新发现 仅评估于CellBench基准的76项研究,在更广泛数据集和生物学问题上的普适性有待验证 解决单细胞RNA测序数据分析耗时且需要专业知识的挑战,实现生物学假设空间的自主探索 单细胞RNA测序数据 计算生物学 COVID-19, 衰老相关疾病 单细胞RNA测序 大语言模型 单细胞RNA测序数据 基于76项已发表scRNA-seq研究的基准测试 NA 单细胞RNA-seq NA NA
485 2026-04-23
Chemokine-defined macrophage niches establish spatial organization of tumor immunity
2026-Apr, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示了肺癌中巨噬细胞亚群的空间组织和功能分工,通过单细胞和空间转录组学技术,识别了具有相反功能的趋化因子表达巨噬细胞亚群,并探索了CCR5阻断策略以增强抗肿瘤免疫 首次系统性地揭示了巨噬细胞谱系和空间区室化如何调控肿瘤免疫,识别了特定趋化因子表达的巨噬细胞亚群在抗肿瘤和促肿瘤中的对立功能,并提出了通过CCR5阻断选择性抑制免疫抑制性单核来源树突状细胞迁移的新策略 研究主要聚焦于肺癌模型,结果在其他肿瘤类型中的普适性尚需验证;空间转录组学数据的分辨率可能限制了对巨噬细胞微环境互作的精细解析 探究巨噬细胞谱系和空间组织如何塑造抗肿瘤免疫,并识别调控策略 肺癌中的巨噬细胞亚群,包括组织驻留CD206+和CD206-间质巨噬细胞、Ly6c2+Fn1+Vcan+招募巨噬细胞,以及单核来源树突状细胞 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
486 2026-04-23
Cell type-agnostic transcriptomic signatures enable uniform comparisons of neural maturation
2026-Apr, PLoS biology IF:7.8Q1
研究论文 本研究开发了一种单细胞转录组“时钟”,用于预测神经发育的真实年龄,实现跨研究、物种和模型系统的标准化比较 开发了基于462个基因的细胞类型无关预测模型,能稳健追踪不同细胞类型和数据集的发育动态,误差仅为2.6周,并首次实现跨物种神经发育速度的量化比较(小鼠比人类快10倍) 模型主要基于人类大脑发育数据,在其他组织或物种中的泛化能力需进一步验证,且依赖单细胞转录组数据的质量和覆盖度 建立标准化的跨上下文神经成熟评估框架,用于发育生物学和疾病建模 发育中的人类大脑细胞、神经类器官以及跨物种(如小鼠)的神经细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 机器学习模型 单细胞转录组数据 超过280万个细胞来自发育中的人类大脑 NA 单细胞RNA-seq NA NA
487 2026-04-23
Simultaneous spatial transcriptomics and morphology profiling as tools to explore how microglia change with age
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究结合空间转录组学和形态学分析,探索小胶质细胞随年龄变化时形态与亚细胞mRNA定位的相互作用 首次将多重错误鲁棒荧光原位杂交与免疫组化结合,揭示小胶质细胞亚细胞mRNA空间组织与形态异质性,并挑战了形态与状态关联的传统假设 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且技术方法可能受限于分辨率或通量 探索小胶质细胞形态与亚细胞转录定位如何影响其功能,特别是在衰老过程中的变化 年轻和老年小鼠大脑中的小胶质细胞 空间转录组学 老年疾病 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH)与免疫组化 NA 图像与空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
488 2026-04-23
Immunosuppressive Microenvironment Reprogramming by Synergistic Sonodynamic Therapy of Phthalocyanine-MOF Hybrids for Hepatocellular Carcinoma
2026-Apr, Exploration (Beijing, China)
研究论文 本研究介绍了一种新型酞菁-金属有机框架杂化材料(Pc@Zr-MOF),用于肝细胞癌的声动力治疗和免疫调节 开发了一种新型的酞菁-金属有机框架杂化材料(Pc@Zr-MOF),通过增强超声转换效率和协同作用,实现了直接杀伤肿瘤细胞与重塑免疫微环境的双重机制 NA 解决肝细胞癌治疗中因缺氧诱导的免疫抑制和耐药性导致的疗效有限问题,旨在重塑免疫抑制微环境并建立持久的抗肿瘤免疫 肝细胞癌 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
489 2026-04-22
Organelle symphony: Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 and nuclear factor-kappa B in stroke pathobiology
2026-Apr-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了核因子红细胞2相关因子2和核因子κB在缺血性和出血性中风病理生物学中的作用机制,重点关注它们在氧化应激、炎症和神经保护中的功能 强调了Nrf2和NF-κB在细胞器间相互作用中的潜在串扰,并指出单细胞测序和空间转录组学技术为理解中风发病机制和开发靶向治疗提供了新视角 NA 探讨Nrf2和NF-κB在中风病理生理学中的核心作用及其在氧化应激、炎症和神经保护中的机制 中风(包括缺血性中风和出血性中风)的病理生物学过程 NA 中风 单细胞测序,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
490 2026-04-21
Therapy-induced remodeling of the tumor immune microenvironment: Mechanistic insights and implications for immunotherapy
2026-Apr-20, Chinese medical journal IF:7.5Q1
综述 本文综述了治疗诱导的肿瘤免疫微环境重塑,阐明了其机制及对免疫治疗的影响,并讨论了治疗优化的潜在策略 利用单细胞测序、空间转录组学等新兴高分辨率技术,前所未有地揭示了治疗方式与肿瘤免疫微环境之间的动态相互作用及关键的继发性微环境变化 作为一篇综述文章,主要总结现有研究,不包含原始实验数据,其讨论基于已发表文献 总结治疗诱导的肿瘤免疫微环境重塑,阐明其调节免疫治疗反应的机制,并讨论治疗优化的潜在策略 肿瘤免疫微环境 数字病理学 肿瘤 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
491 2026-04-21
Biomimetic Bamboo-Inspired Bone Repair Scaffold: Reversing Degraded States and Promoting Mesenchymal Stem Cell Differentiation
2026-Apr-20, ACS applied bio materials IF:4.6Q2
研究论文 本研究报道了一种受竹子和骨小梁启发的多功能骨修复支架,旨在通过上调Slc25a33和Crabp1来逆转骨质疏松条件下骨髓间充质干细胞的衰老表型,从而促进骨再生 设计了一种结合聚乳酸纳米取向纤维和I型胶原的仿生多孔支架,其独特的纺锤形孔道结构模拟了骨小梁的管腔陷窝,能够持续提供I型胶原并上调关键线粒体生物合成和视黄酸信号通路基因 研究主要在老年骨质疏松大鼠模型中进行,尚未在更大型动物或人体中进行验证 开发一种能够逆转骨髓间充质干细胞衰老、促进骨质疏松性骨缺损修复的生物材料 衰老的骨髓间充质干细胞和15月龄的骨质疏松大鼠 组织工程与再生医学 骨质疏松症 单细胞测序 NA 基因表达数据、组织形态学数据 老年骨质疏松大鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
492 2026-04-21
Boosting Sensory Nerve-to-Bone Interactions Enhances Hedgehog Mediated Calvarial Bone Repair
2026-Apr-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过药理学激活TrkA受体,增强感觉神经与骨骼的相互作用,从而促进小鼠颅骨缺损的骨修复,并揭示Hedgehog信号通路在其中的关键作用 首次通过药理学增益功能方法(而非传统的功能丧失研究)探究感觉神经信号增强对骨修复的促进作用,并识别出Hedgehog信号通路在神经-骨骼相互作用中的中介角色 研究基于小鼠模型,结果可能无法直接外推至人类;且主要关注颅骨缺损,对其他骨骼类型的适用性未验证 探究增强感觉神经与骨骼相互作用对骨修复的潜在治疗益处及其分子机制 小鼠颅骨缺损模型中的感觉神经元、骨骼细胞(如成骨细胞、成纤维细胞)及免疫细胞 NA 骨骼损伤/骨修复 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 小鼠模型(具体数量未在摘要中明确,但涉及处理组和条件敲除小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
493 2026-04-21
Inhibition of Focal Adhesion Restricts Chemoresistance in Pancreatic Cancer by Targeting SLC7A11 Mediated Ferroptosis
2026-Apr-20, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞和批量测序分析,发现胰腺癌化疗耐药与黏着斑信号激活相关,并揭示FAK抑制剂IN10018通过靶向SLC7A11介导的铁死亡来限制吉西他滨耐药 首次将黏着斑信号激活与胰腺癌化疗耐药及肿瘤微环境重塑联系起来,并证明FAK抑制剂可通过诱导铁死亡克服耐药 研究主要基于临床前模型,需进一步临床验证;耐药机制可能涉及其他信号通路 探索胰腺癌化疗耐药的分子机制并寻找联合治疗靶点 胰腺导管腺癌(PDAC)的化疗耐药细胞及临床前模型 NA 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量测序(bulk-seq) NA 测序数据 化疗处理及吉西他滨耐药(GR)样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
494 2026-04-21
Biomimetic nanodecoys remodel the mechano-immune microenvironment to potentiate checkpoint blockade in colorectal cancer
2026-Apr-19, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本文开发了一种仿生纳米平台(MDPAs),通过重塑结直肠癌的力学-免疫微环境,增强检查点阻断疗法的疗效 创新点在于利用血小板膜包裹的载药介孔二氧化硅纳米颗粒,靶向抑制Integrin-FAK-YAP机械转导轴,从而软化肿瘤微环境并协同PD-L1抗体激活抗肿瘤免疫 NA 研究旨在克服结直肠癌中因致密细胞外基质导致的免疫检查点抑制剂耐药性 研究对象为结直肠癌的肿瘤微环境,包括免疫细胞、上皮细胞和基质细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
495 2026-04-21
Autophagy related 7 dysfunction in senescent melanocytes and hypopigmented skin: reversal by metformin
2026-Apr-17, The British journal of dermatology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了自噬功能障碍是紫外线诱导黑素细胞衰老的早期关键事件,并发现二甲双胍可通过上调ATG7恢复自噬活性,延缓衰老 首次识别出自噬失调(特别是ATG7下调)作为紫外线诱导黑素细胞衰老的最早分子事件,并验证了二甲双胍通过恢复自噬和氧化还原平衡的治疗潜力 研究主要基于体外UVB诱导的衰老模型,体内验证和临床转化需进一步探索 探究黑素细胞衰老的早期分子机制,并评估预防衰老的治疗策略 紫外线诱导的衰老黑素细胞及特发性点状白斑皮肤组织 单细胞组学 皮肤色素减退性疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 免疫组化, 基因敲低/过表达 NA RNA测序数据, 蛋白质表达数据 未明确样本数量,但涉及体外黑素细胞模型和皮肤组织 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
496 2026-04-21
PTEN restrains SHH medulloblastoma growth through cell autonomous and nonautonomous mechanisms
2026-Apr-17, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究探讨PTEN基因在SHH亚型髓母细胞瘤中通过细胞自主和非自主机制抑制肿瘤生长的作用 揭示了PTEN缺失在SHH-MB小鼠模型中加速肿瘤生长的双重机制,包括细胞自主的增殖增强和非自主的免疫微环境改变 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;scRNA-seq分析可能受样本量限制 阐明PTEN基因在SHH亚型髓母细胞瘤进展中的功能机制 SHH亚型髓母细胞瘤小鼠模型及小脑颗粒细胞前体细胞 肿瘤生物学 髓母细胞瘤 单细胞RNA测序 小鼠遗传模型 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,基于小鼠模型研究 NA 单细胞RNA-seq NA NA
497 2026-04-21
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-Apr-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了18-β-甘草次酸通过HMGB1-cGAS-Mul1轴缓解肌腱病中氧化应激的分子机制 揭示了GA通过诱导HMGB1的K43甲基化,促进cGAS降解,从而抑制NLRP3炎症小体激活的新机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化仍需进一步验证 阐明GA缓解肌腱病的分子机制,特别是其在调节HMGB1-cGAS-STING轴和NLRP3炎症小体激活中的作用 临床肌腱病样本、大鼠肌腱病模型、H2O2诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 数字病理学 肌腱病 单细胞RNA测序、蛋白质组学、药理学实验 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组学数据 临床样本、动物组织、细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
498 2026-04-21
Reconstructing cell-cell interaction network in single-cell spatial transcriptomics via directed heterogeneous graph autoencoder
2026-Apr-17, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 提出了一种基于有向异构图自编码器的方法DualCellChat,用于从单细胞空间转录组数据中重建细胞间相互作用网络 利用有向异构图自编码器框架,能够建模细胞间相互作用的方向性,不依赖于已知的配体-受体对 方法在五种单细胞空间数据集上进行了基准测试,但未提及在更大规模或更复杂组织中的应用验证 重建单细胞空间转录组学中的细胞间相互作用网络 单细胞空间转录组数据 生物信息学 NA 空间转录组学 有向异构图自编码器 基因表达数据和空间位置信息 五个单细胞空间数据集(来自四种不同技术) NA 单细胞空间转录组学 NA NA
499 2026-04-21
Time-resolved single-cell transcriptomics maps zebrafish heart development
2026-Apr-17, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过时间分辨的单细胞转录组学技术,绘制了斑马鱼心脏从早期到晚期发育过程的细胞图谱 首次对斑马鱼心脏从25小时到60天受精后十个发育阶段进行全面的单细胞RNA测序分析,揭示了心肌细胞在14天受精后的额外增殖高峰,并发现了新的心肌细胞亚型标记基因 研究仅基于斑马鱼模型,结果向其他脊椎动物的直接推广需谨慎;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有低丰度转录本 全面解析斑马鱼心脏发育过程中的细胞类型动态变化和分子机制 斑马鱼心脏细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 超过34,000个细胞,涵盖10个发育阶段(25小时至60天受精后) NA 单细胞RNA-seq NA NA
500 2026-04-21
Experimental upregulation of Lancl1 promotes axon regeneration after optic nerve injury in vivo
2026-Apr-17, Experimental neurology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过实验性上调Lancl1基因,探究其在体内促进视神经损伤后轴突再生的作用 首次发现Lancl1作为轴突再生促进因子,并通过体内实验验证其神经保护和轴突再生能力,揭示了其治疗中枢神经系统损伤的潜力 未发现Lancl1转基因激活mTOR通路的pS6标记,其下游作用机制尚需进一步研究 探究Lancl1基因在视神经损伤后轴突再生中的作用及其治疗潜力 视网膜神经节细胞(RGCs)和视神经损伤模型 神经科学 中枢神经系统损伤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能获得性实验、转基因技术 NA 基因表达数据、体内实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部