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当前共找到 951 篇文献,本页显示第 481 - 500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-05-06
Single-Cell Ligand-Receptor Profiling Identifies Targetable Signaling Axes and Therapeutic Candidates in Lupus Nephritis
2026-Apr-22, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3
研究论文 通过单细胞配体-受体分析鉴定狼疮性肾炎中可靶向的信号轴及治疗候选药物 首次基于高关联配体-受体对进行狼疮性肾炎亚型分类,并结合分子对接和动力学模拟筛选老药新用候选物 仅基于公共单细胞数据,缺乏前瞻性队列验证;体内实验尚未开展 阐明配体-受体信号在狼疮性肾炎免疫微环境中的作用并发现治疗靶点 狼疮性肾炎患者肾脏组织的单细胞转录组数据 计算生物学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 整合多个公开单细胞RNA-seq数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序
482 2026-05-06
Single-cell TCR mapping reveals spatially coordinated T cell states in head and neck cancer
2026-Apr-10, Science immunology IF:17.6Q1
研究论文 提出一种空间TCR图谱分析策略,以单细胞分辨率解析头颈鳞癌中T细胞克隆、转录状态和空间位置的关系 首次实现单细胞层面同时解析T细胞克隆身份、转录状态和空间位置,揭示肿瘤微环境中T细胞状态的空间协调性 标题和摘要未提及明显局限性 开发空间TCR图谱方法,解析头颈癌肿瘤微环境中T细胞的空间组织与功能状态 人原发性头颈部鳞状细胞癌组织样本 数字病理学 头颈癌 空间TCR图谱分析 NA 空间转录组与TCR测序数据 多例头颈鳞癌患者样本(具体数量未提及) NA 空间转录组学 NA NA
483 2026-05-06
CD55-expressing myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) drive cancer immunoevasion
2026-Apr-10, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 发现表达CD55的髓系来源抑制细胞(MDSCs)驱动肿瘤免疫逃逸 首次鉴定CD55作为MDSCs的保守表面标志物,并揭示其通过代谢重编程(促进糖原磷酸化酶PYGL磷酸化驱动糖酵解)维持免疫抑制表型的新机制 主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限;托马替丁等小分子抑制剂的体内应用效果需进一步评估 阐明MDSCs表面分子CD55在肿瘤免疫逃逸中的作用机制及治疗潜力 MDSCs及其表达的CD55分子 数字病理学 多种癌症类型(八种癌症) 单细胞RNA测序、RNA测序、DNA pulldown、染色质免疫共沉淀、荧光素酶报告基因、免疫共沉淀、免疫印迹、免疫沉淀-质谱、分子对接、表面等离子共振成像 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据 八种癌症类型的公共单细胞RNA测序数据集、人类患者样本及小鼠肿瘤模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
484 2026-05-06
QuantumXCT: Learning Interaction-Induced State Transformation in Cell-Cell Communication via Quantum Entanglement and Generative Modeling
2026-Apr-09, ArXiv
PMID:41958473
research paper 提出一个混合量子-经典生成框架QuantumXCT,从单细胞转录组中推断细胞间通讯,通过量子纠缠学习相互作用诱导的状态变换 将细胞间通讯推断从静态配体-受体数据库查询转变为学习数据驱动的状态变换,利用量子电路的可解释性揭示生物通信网络,无需先验生物学假设 未明确说明,但可能受限于量子电路的规模及对合成数据的验证而非大规模真实数据 开发一种无先验知识依赖的细胞间通讯推断方法,通过量子机器学习建模信号导致的细胞状态变化 卵巢癌-成纤维细胞共培养模型中的单细胞转录组数据及合成数据中的已知交互 machine learning, quantum machine learning, computational biology ovarian cancer single-cell RNA-seq, quantum computing hybrid quantum-classical generative model, parameterized quantum circuits gene expression data, synthetic data 未知具体样本数量,涉及卵巢癌-成纤维细胞共培养的scRNA-seq数据 Illumina(假设用于scRNA-seq测序,从上下文推断) single-cell RNA-seq NA(未在标题或摘要中指定具体平台产品) NA
485 2026-05-06
Generation of a prop1 knock-in zebrafish enables single-cell transcriptomics of early pituitary development
2026-Apr-07, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 通过生成prop1敲入斑马鱼,利用单细胞转录组学研究早期垂体发育 首次创建了prop1基因敲入GAL4报告基因斑马鱼品系,实现了对早期垂体发育的单细胞分辨率和活体成像研究,并提供了首个斑马鱼早期垂体发育的单细胞图谱 未明确提及 研究脊椎动物腺垂体原基发育的早期分子机制及内分泌细胞谱系分化 斑马鱼和小鼠的早期垂体组织 单细胞转录组学 垂体发育相关疾病(如侏儒症、性成熟障碍) 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、活体成像 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼和小鼠垂体组织样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
486 2026-05-06
Cardiac Fibrosis: Mechanobiology, Epigenetics, and the Path to Precision Therapy
2026-Apr, Cellular and molecular bioengineering IF:2.3Q3
综述 全面综述心脏纤维化的机械生物学、表观遗传学机制及精准治疗路径 整合单细胞和空间转录组学、生物力学及表观遗传学数据,系统阐述纤维化细胞异质性与分子环路;提出CRISPR基因编辑、FAP靶向CAR-T、纳米RNA递送及患者心脏类器官等新兴可逆疗法;构建结合基因组学、生物标志物、AI和环境风险评估的精准抗纤维化策略 作为综述,未提供原创实验数据;新兴疗法的临床转化尚处于早期阶段,缺乏大规模验证 阐明心脏纤维化的机械生物学与表观遗传学机制,并规划从基础研究到临床精准治疗的转化路线图 心脏纤维化中的成纤维细胞、心肌细胞-细胞外基质串扰、机械传导信号及表观遗传调控网络 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学,空间转录组学,基因编辑,CAR-T免疫疗法,纳米医学,类器官技术 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序,空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学平台
487 2026-05-05
Kidney Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Contribute to Myeloid Development and Pathology in Lupus Nephritis
2026-Apr-28, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 探讨肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎中对髓系发育和病理的贡献 首次证明肾脏中的造血干细胞和祖细胞参与髓外造血,并通过局部髓系细胞扩增促进狼疮性肾炎进展 主要基于小鼠模型,人源样本分析有限,可能需要进一步验证临床相关性 研究髓外造血和肾脏驻留造血干细胞和祖细胞在狼疮性肾炎发病机制中的作用 狼疮性肾炎小鼠模型(MRL/lpr和TLR7激动剂诱导)及患者尿液样本 数字病理学 狼疮性肾炎 单细胞RNA测序、免疫染色、过继转移实验 NA 序列数据、图像数据 两种小鼠模型及狼疮性肾炎患者尿液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序用于肾脏和骨髓祖细胞分析
488 2026-05-05
scSketch: Interactive Sketch-based Trajectory Exploration and Pathway-Aware Analysis of Single-Cell Data
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 scSketch是一个交互式工具,允许用户通过草图轨迹探索单细胞数据中的基因表达梯度并进行通路感知分析 首次允许用户通过绘制轨迹交互式探索单细胞数据,并在迭代探索中保持统计有效性和生物学可解释性,同时自动计算基因-轨迹相关性并应用在线错误发现率控制 NA 开发一个能够交互式探索单细胞数据中轨迹假设并保持统计有效性和生物学可解释性的工具 单细胞RNA测序数据中的基因表达梯度及细胞状态转变过程 机器学习 NA NA NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
489 2026-05-05
Interpreting and Validating a Deep Learning Model Predictive of Spatial Morphologic-Molecular Patterns in Lung Adenocarcinoma, Using Ground Truth Immunohistochemistry Images
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发并验证了深度学习模型XpressO-Lung,该模型利用常规H&E染色的全切片图像预测肺腺癌中空间形态-分子模式,并通过免疫组化在外部临床样本中验证 首次实现通过常规病理切片预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性,无需空间转录组学技术,且模型具有可解释性 训练样本仅来自TCGA的200例肺腺癌病例,可能存在选择偏倚;预测基因数量有限;AUC范围0.64-0.92,部分基因预测性能中等 开发可解释的深度学习模型,通过学习组织形态与批量转录组数据的关联,在常规病理切片上预测肿瘤及其微环境的基因表达空间异质性 肺腺癌肿瘤组织及其微环境中的空间基因表达模式 数字病理学 肺癌 深度学习 可解释深度学习模型 图像 200例TCGA肺腺癌病例用于训练,外部验证集来自Dartmouth Health的临床样本 NA NA NA NA
490 2026-05-05
Single-cell profiling reveals epithelial and immune responses in BK polyomavirus-infected human kidney biopsies
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析BK多瘤病毒感染人肾活检组织中的上皮和免疫反应 首次在单细胞分辨率下揭示BK病毒感染不同阶段(病毒滴度上升期和消退期)中肾小管上皮细胞和免疫细胞的动态分子变化 横断面研究设计无法观察纵向动态变化,且体外细胞培养模型未能完全模拟体内代谢适应和免疫反应 阐明BK多瘤病毒感染导致肾损伤的分子机制,为临床管理提供新见解 肾移植活检组织中的上皮细胞和免疫细胞 机器学, 数字病理学 BK病毒性肾病,肾移植并发症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未感染者对照和BK病毒感染两个阶段(病毒滴度上升期和消退期)的肾移植活检样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
491 2026-05-05
Spatial proteomic mapping of the human and mouse retina using IBEX
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 使用IBEX技术生成人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱 将抗体解离选项与化学漂白相结合,实现同一宿主物种抗体的灵活使用,并将其与超分辨率成像耦合,揭示了视网膜细胞群体和外界膜的超微结构特征 NA 绘制人和小鼠视网膜的空间蛋白质组图谱,并探究外界膜的结构组成 人和小鼠视网膜组织 数字病理学 NA 多重免疫组织化学 IBEX NA 图像 健康人和野生型小鼠视网膜,以及Crb1rd8小鼠模型 NA 空间蛋白质组学 NA IBEX 超分辨率成像
492 2026-05-05
FOSL2 regulates endothelial cell state and chromatin accessibility in systemic sclerosis pulmonary vascular remodeling
2026-Apr-22, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 探究FOSL2在系统性硬化症肺部血管重塑中调控内皮细胞状态和染色质可及性的作用 首次通过多组学数据、转基因小鼠模型和深度学习模型ChromBPNet,揭示FOSL2在系统性硬化症相关肺动脉高压中调控内皮细胞表型的关键机制 未明确说明研究限制 阐明FOSL2在系统性硬化症肺部血管病变中对内皮细胞表型和染色质可及性的调控机制 系统性硬化症合并间质性肺病和肺动脉高压患者肺部组织、Fosl2转基因小鼠、Sugen/缺氧及缺氧处理小鼠、原代血管内皮细胞 数字病理学 血管疾病, 肺病, 自身免疫病 多组学分析、单细胞RNA测序、深度学习模型 ChromBPNet 基因表达数据、染色质可及性数据 系统性硬化症患者肺部样本及多种小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
493 2026-05-05
Ancestry-specific rewiring of BCR-MAPK signaling in sarcoidosis B cells
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示结节病B细胞中BCR-MAPK信号通路的祖先特异性重构 首次在单细胞水平上揭示结节病B细胞中MAPK信号重编程及BCR的祖先特异性扩增,并发现与非裔和欧裔人群疾病差异相关的基因表达模式 未提及 探究B细胞在结节病发病机制中的作用及其在不同祖先人群中的差异 外周血单核细胞(PBMCs)来自非洲裔和欧洲裔个体,包括健康对照、结节病患者和系统性红斑狼疮(SLE)患者 单细胞转录组学 结节病 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 48名健康对照、59名结节病患者、28名SLE患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
494 2026-05-05
Generative AI-assisted Bayesian-frequentist Hybrid Inference in Single-cell RNA Sequencing Analysis for Genes Associated with Alzheimer's Disease
2026-Apr-20, medRxiv : the preprint server for health sciences
research paper 提出了一种生成式AI辅助的贝叶斯-频率学派混合推断框架,用于单细胞RNA测序分析中与阿尔茨海默病相关的基因 首次将基于大语言模型的先验知识获取与混合推断理论相结合,在基因组范围贝叶斯分析中实现了计算高效和统计效能提升 依赖于ChatGPT-4o的标准化提示输出,可能受限于先验校准的准确性;仅在线性模型下推导了闭式混合估计量,尚未扩展到非线性模型 开发一种计算可扩展的贝叶斯-频率学派混合推断方法,用于高维组学数据的全基因组关联分析 ROSMAP队列中阿尔茨海默病患者的单细胞RNA测序数据 machine learning 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 大语言模型(ChatGPT-4o)、线性模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
495 2026-05-05
Plectin promotes an aggressive phenotype and represses cytotoxic T cell activity in pancreatic cancer
2026-Apr-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 揭示网蛋白(plectin)在胰腺癌中促进侵袭性表型并抑制细胞毒性T细胞活性的作用机制 首次发现网蛋白作为调节PDAC中T细胞抑制性肿瘤微环境的新因子,并验证抗CSP单克隆抗体可恢复抗肿瘤免疫 未提及具体局限性,但可能包括样本量限制、小鼠模型与人类疾病的差异等 探究网蛋白在胰腺癌中调节T细胞抑制性肿瘤微环境的分子机制 胰腺腺癌(PDAC)患者的肿瘤样本及两种小鼠PDAC模型 计算机视觉 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq(scRNA-seq) NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 229例PDAC患者(scRNA-seq分析)及TCGA-PAAD数据集(未明确具体样本数) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
496 2026-05-05
PALINCODE: Recording cell lineage with ternary palindromic CRISPR bits
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍PALINCODE系统,利用三元CRISPR位点随机写入细胞谱系信息,实现高密度谱系记录 首次提出使用三元CRISPR位点(cBits)实现更高信息密度的细胞谱系记录,通过截断的Cas9引导序列提高三元编辑效率,理论编码能力达10^25比特 未明确提及局限性,但可能受限于CRISPR编辑的随机性及体内应用时的脱靶效应 开发高密度、高精度的细胞谱系记录平台,克服传统CRISPR谱系追踪方法的局限性 细胞谱系记录系统及体内黑色素瘤模型中的克隆进化 机器学习 黑色素瘤 CRISPR NA 单细胞测序数据 293T细胞及黑色素瘤体内模型 NA 单细胞测序 NA NA
497 2026-05-05
Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual and gametocyte development in Plasmodium falciparum
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用长读长Oxford Nanopore直接RNA测序、核糖体图谱分析和单细胞转录组学,对恶性疟原虫无性期和配子体发育过程中的长链非编码RNA进行动态调控研究 首次整合长读长纳米孔直接RNA测序、核糖体分析和单细胞转录组学,对恶性疟原虫lncRNA进行稳健的阶段特异性表征,揭示了其在配子体发生和传播中的潜在作用 研究中可能受到短读长Illumina测序、逆转录酶伪迹以及链特异性cDNA文库中第二链不完全降解的影响,这些因素阻碍了全基因组lncRNA的鉴定 全面鉴定恶性疟原虫无性期和配子体阶段的lncRNA,并探讨其基因表达调控中的作用 恶性疟原虫的无性期和配子体阶段样本 机器学习 疟疾 纳米孔直接RNA测序、核糖体图谱分析、单细胞RNA测序 NA RNA测序数据、单细胞转录组数据 多个无性期和配子体阶段样本,具体数量未说明 Oxford Nanopore Technologies 直接RNA测序、单细胞RNA测序 Oxford Nanopore直接RNA测序平台 NA
498 2026-05-05
Whole-organism spatial transcriptomics at single-cell resolution in C. elegans
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 展示了一种在秀丽隐杆线虫完整个体中实现单细胞分辨率空间转录组学的工作流程 首次在完整生物体上实现单细胞分辨率的多重空间转录成像,通过最多40个基因的连续成像保留空间背景,并结合标记基因面板实现神经元可重复识别 目前仅适用于线虫紧凑透明的体型,可能难以直接扩展到更大或更复杂的生物体 开发一种可扩展的空间转录组学框架,用于分析完整生物体中的基因表达和细胞身份 秀丽隐杆线虫 数字病理学 NA 单分子荧光原位杂交(smFISH),多重成像 NA 图像 整个秀丽隐杆线虫个体 NA 空间转录组学 NA NA
499 2026-05-05
Dysregulation of Hippo Signaling Pathway as a Convergent Mechanism Underlying Choroid Plexus Defects in Bipolar Disorder
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 发现Hippo信号通路失调是双相情感障碍中脉络丛缺陷的汇聚机制 首次通过人类大脑类器官和脉络丛类器官揭示Hippo通路激活驱动脉络丛过度生长,并整合遗传学证据表明该通路在双相情感障碍病理中的关键作用 未提及具体局限性 探究双相情感障碍中脉络丛异常的分子机制 双相情感障碍患者与健康对照者来源的人类皮层类器官和脉络丛类器官 数字病理学 双相情感障碍 单细胞转录组学,全基因组关联研究,结构磁共振成像 NA 基因表达数据,影像数据 双相情感障碍患者和健康对照者来源的类器官及结构磁共振成像扫描 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序,全基因组测序 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞转录组测序,Illumina NovaSeq平台进行全基因组测序
500 2026-05-05
SCOPE: Localizing fate-decision states and their regulatory drivers in single-cell differentiation
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出SCOPE框架,利用半监督共形预测将单细胞分化中的命运决策状态及表观遗传预启动局部化至离散转录组学窗口 首次通过共形推断形式化命运不确定性,在高维单细胞数据中严格界定细胞命运承诺的边界,并揭示染色质可及性先于基因表达的时序滞后 依赖于共形预测的假设(数据可交换性),在高度噪声或样本量较小的数据中性能可能受限 定位单细胞分化中命运决策的关键转录组学状态及调控因子 模拟数据、谱系追踪的小鼠造血系统、多个人类造血数据集和人类视网膜发生数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多组学测序 半监督共形预测 基因表达数据、染色质可及性数据 涵盖模拟、小鼠造血、人类造血及人类视网膜发生的多个数据集 NA 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、单细胞多组学 NA NA
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