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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-05-21 |
Shaping the microvascular network: insights into skeletal muscle angiogenesis
2026-Apr-29, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.250183
PMID:42156063
|
综述 | 本文综述了骨骼肌血管生成的细胞事件和分子机制,包括与细胞外基质的相互作用以及多种驻留和浸润细胞类型的关键作用 | 重点介绍了新兴高分辨率技术(如单细胞RNA测序)在揭示骨骼肌血管生成中细胞类型特异性作用及细胞间相互作用方面的应用潜力 | 骨骼肌血管生成的确切机制仍然只有部分被理解 | 探讨骨骼肌血管生成的调控机制及其在生理和病理条件下的变化 | 骨骼肌血管生成过程中的细胞事件和分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 462 | 2026-05-21 |
Multi-Omics reveals SPP1 + malignant and CXCR4+ TAM crosstalk predicts immunotherapy response in lung adenocarcinoma
2026-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05095-w
PMID:42045760
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研究论文 | 通过多组学分析揭示SPP1+恶性细胞与CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用预测肺腺癌免疫治疗反应 | 首次发现SPP1+恶性细胞和CXCR4+肿瘤相关巨噬细胞之间的相互作用是驱动CD8T细胞耗竭并导致免疫治疗反应不良的新机制,并提供了潜在的生物标志物 | NA | 识别肺腺癌免疫治疗反应的预测性生物标志物 | 肺腺癌的肿瘤微环境中的细胞异质性和动态变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,Illumina NovaSeq测序平台用于空间转录组分析 |
| 463 | 2026-05-21 |
SIV infection disrupts the spatial cellular and communication networks of pulmonary granulomas during SIV/Mtb co-infection
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.24.720743
PMID:42079194
|
研究论文 | 通过空间转录组学比较SIV/Mtb共感染猕猴肺部肉芽肿的细胞和通讯网络,发现SIV感染破坏了肉芽肿的空间免疫功能,且抗逆转录病毒治疗未能完全恢复 | 首次在SIV/Mtb共感染模型中揭示了肉芽肿内空间转录组学特征的变化,并评估了抗逆转录病毒治疗对空间免疫网络的影响 | 未详细说明ART治疗的持续时间对结果的影响,且样本量有限 | 探究HIV/Mtb共感染中肺部肉芽肿的免疫相互作用及ART对空间转录组学的影响 | 与SIV/Mtb共感染的猕猴 | 空间转录组学 | 结核病,艾滋病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 猕猴样本(具体数量未说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 464 | 2026-05-21 |
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030017
PMID:41538704
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学和体外功能分析,揭示ANKRD26相关性血小板减少症中祖细胞扩增和通过JUNB-p21通路诱导多倍体巨核细胞凋亡的机制 | 首次在多个患者中整合单细胞转录组和体外功能分析,发现ANKRD26通过JUNB介导的CDKN1A转录激活独立于经典p53-PIDDosome轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,并定位ANKRD26到中心体参与有丝分裂调控 | 样本量有限(仅4名患者),未提及可能的批次效应或技术复制的详细评估 | 阐明ANKRD26基因5'UTR变异导致的血小板减少症的细胞和分子机制 | 4名THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞和祖细胞以及原代巨核细胞 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞转录组学,共聚焦成像 | NA | 序列数据 | 4名患者,包含47,281个THC2 HSPC细胞与51,907个对照细胞,以及7,309个THC2 pMK细胞与5,077个对照细胞 | 10x Genomics,Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium,Illumina NovaSeq | 10x Chromium 单细胞3'测序,Illumina NovaSeq测序平台 |
| 465 | 2026-05-21 |
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03084-6
PMID:42020848
|
研究论文 | 介绍sc-SPLASH方法用于无参考的条形码单细胞测序数据发现 | 首次提出统计优先、无参考的发现方法,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍 | 文章中未提及具体局限性 | 开发一种无参考的统计优先方法,用于发现条形码单细胞测序和空间转录组学中的转录组变异 | 海绵(Spongilla,缺少参考序列)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学 | NA | 序列数据 | 海绵和海鞘的免疫样细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2026-05-21 |
The transcription factor E4F1 is crucial for spermatogonial differentiation and meiosis progression in mice
2026-Apr-14, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12649-3
PMID:41981464
|
研究论文 | 揭示了转录因子E4F1在小鼠精原细胞分化和减数分裂进程中的关键作用 | 首次发现E4F1通过调控精原细胞分化和减数分裂相关基因表达,影响小鼠精子发生过程 | 需要进一步验证以完全阐明E4F1依赖的转录调控机制 | 探究E4F1在精原细胞分化和减数分裂进程中的功能及分子机制 | 小鼠精原细胞和精母细胞 | 分子生物学 | NA | Cre-loxP基因敲除、单细胞转录组分析、CUT&Tag分析 | NA | 基因表达数据 | E4f1条件性敲除小鼠和HIS-Tag敲入小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2026-05-21 |
High-throughput strategy for targeting MDM2 in uveal melanoma to reverse radiation therapy resistance
2026-Apr-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02970-x
PMID:41965789
|
研究论文 | 结合机器学习和高通量筛选平台发现靶向MDM2的小分子抑制剂,以克服葡萄膜黑色素瘤的放射治疗耐药性 | 首次将机器学习模型与高通量筛选平台整合,识别靶向MDM2的新型小分子抑制剂SAR405838,并验证其通过p53激活增强放射敏感性 | 未提及临床验证和体内实验的长期效果评估 | 开发克服葡萄膜黑色素瘤放射治疗耐药性的新治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤细胞及其放射治疗耐药机制 | 机器学习 | 葡萄膜黑色素瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2026-05-21 |
MDA5-MAVS and interferon-lambda signaling in the intestinal epithelium limit murine astrovirus infection
2026-Apr, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.12.002
PMID:41435889
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示MDA5-MAVS和干扰素-λ信号在肠道上皮细胞中限制小鼠星状病毒感染的作用机制 | 首次在体内通过单细胞RNA测序明确小鼠星状病毒感染的细胞嗜性,并证明肠上皮细胞是干扰素-λ的主要来源,MDA5-MAVS通路调控干扰素-λ诱导,且IFN-λ信号主要在分泌细胞(包括杯状细胞)中发挥抗病毒作用 | 未发现特定肠上皮细胞类型对MAVS在控制病毒感染中的需求差异,提示可能需要多种肠上皮细胞的协同作用 | 阐明小鼠星状病毒感染时干扰素-λ诱导的病毒感知通路及其在病毒控制和细胞嗜性调节中的具体作用 | 小鼠星状病毒感染的小鼠肠道上皮细胞(包括杯状细胞和多种肠上皮细胞类型) | 机器学习和单细胞组学 | 肠道病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本量信息 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 469 | 2026-05-21 |
Application and Challenges of Chimeric Antigen Receptor T Cell Therapy in Systemic Rheumatic Diseases and Autoimmune Disorders
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70658
PMID:41930334
|
综述 | 综述嵌合抗原受体T细胞疗法在系统性风湿病和自身免疫性疾病中的应用与挑战 | 系统总结了CAR-T在自身免疫性疾病中的作用机制,分析了核心临床挑战,并突出了新兴策略(如通用型/体内生成CAR-T细胞、多靶点/逻辑门设计、器官归巢工程以及与耐受增强剂的合理组合),强调多组学整合用于患者分层和复发预测 | 面临制造复杂、组织穿透有限、抗原逃逸、免疫后遗症以及缺乏预测性生物标志物等未满足需求 | 系统阐述CAR-T在自身免疫性疾病中的机制、挑战和精准导向创新策略,推动功能免疫重置 | 系统性风湿病和自身免疫性疾病患者 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2026-05-21 |
Metabolic Alterations in Macrophage Subtypes Propel Immune and Stromal Remodeling in Neurofibroma's Malignant Progression
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70709
PMID:41930352
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示巨噬细胞亚型代谢变化驱动神经纤维瘤恶变过程中的免疫和基质重塑 | 首次鉴定出SPP1KYNU巨噬细胞亚群在MPNST恶变中协调基质重塑和免疫抑制的核心作用,并发现色氨酸代谢作为潜在治疗靶点 | 未提及样本量较小等具体局限性 | 阐明神经纤维瘤恶性转化为MPNST的潜在机制,寻找新的治疗靶点和诊断标志物 | 人类良性丛状神经纤维瘤和恶性外周神经鞘瘤样本中的肿瘤微环境细胞 | 数字病理学 | 神经纤维瘤病1型、恶性外周神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本(基因表达数据) | 9个丛状神经纤维瘤和5个恶性外周神经鞘瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 471 | 2026-05-21 |
High-Purity Functional Corneal Endothelial Cells From Human Induced Pluripotent Stem Cells via a Novel Wash-Out Method
2026-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70650
PMID:41930340
|
研究论文 | 通过新颖的冲洗方法从人诱导多能干细胞中生成高纯度功能性角膜内皮细胞 | 首次开发了一种高效、非细胞毒性的冲洗方法,用于去除未分化的诱导多能干细胞并获得高纯度的角膜内皮样细胞 | 内容未提及该方法在长期移植后的稳定性以及其他动物模型或临床试验的验证 | 建立从诱导多能干细胞高效生成高纯度功能性角膜内皮样细胞的稳健方法,以克服角膜内皮移植治疗中供体短缺的问题 | 角膜内皮细胞和诱导多能干细胞 | 机器学习 | 角膜内皮功能不全 | 诱导多能干细胞分化、冲洗方法、单细胞测序、体内移植 | NA | 单细胞测序数据 | 诱导多能干细胞衍生的角膜内皮样细胞和人类原代角膜内皮细胞,以及角膜内皮功能障碍家兔模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2026-05-19 |
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45052-9
PMID:41922522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2026-05-20 |
Germ layer specification and organotropism in lymphoma invasion
2026-04-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.03.009
PMID:41904054
|
研究论文 | 研究弥漫大B细胞淋巴瘤中胚层依赖性外结侵犯的分子特征和发育轨迹 | 首次揭示外结侵犯模式与胚层发育的关联性,通过单细胞RNA测序发现恶性B细胞遵循类似胚层发育的轨迹,并提出依赖性免疫检查点靶向策略 | 未明确说明但可能涉及样本量有限及胚层依赖性机制在临床转化中的验证需求 | 探究淋巴瘤侵犯模式与胚层发育之间的关联,并解析其分子机制和临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外结侵犯样本,分为外胚层、内胚层和中胚层起源亚组 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 发育轨迹分析模型 | 基因表达数据、临床生存数据 | 未明确说明具体数量,但涉及多组外结侵犯患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2026-05-20 |
A sequence knowledge-guided deep learning method for single-cell multi-omics translation
2026-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04070-6
PMID:41975483
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研究论文 | 提出一种序列知识引导的深度学习方法scProTrans,实现单细胞多组学翻译,将转录组数据转换为蛋白质组信息 | 融合序列知识与多组学整合,通过层次注意力机制、双向编码器架构和细胞特异性关联组件实现跨组学翻译,并在三组学场景中验证其可扩展性 | 未明确提及,但依赖CITE-seq训练数据,可能对训练数据外的条件泛化能力有限 | 开发一种可解释的深度学习框架,利用序列知识引导多组学整合,实现单细胞分辨率下的跨组学翻译 | 单细胞RNA测序数据与蛋白质组数据的关系,涉及基因-蛋白质关联和细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | 深度学习模型(层次注意力机制、双向编码器架构) | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 17个多组学数据集 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', CITE-seq训练数据 |
| 475 | 2026-05-20 |
MELK is Required for G2/M Phase Progression in Cortical Progenitors: Insights from Rare ASD-Associated Variants
2026-Apr-13, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01728-4
PMID:41973119
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研究论文 | 研究MELK基因在皮质前体细胞G2/M期进程中的作用,并探讨与自闭症谱系障碍相关的罕见变异 | 首次发现MELK基因的罕见功能丧失变异与自闭症谱系障碍相关,并揭示其在皮质发育中调控G2/M期进程和神经元形态发生的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类中的直接验证有限 | 阐明MELK在胚胎皮质发育中的细胞周期调控功能及其与神经发育疾病的关联 | 小鼠皮质前体细胞 | 分子生物学 | 自闭症谱系障碍 | 子宫内电穿孔、单细胞转录组学、流式细胞分选、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 476 | 2026-05-20 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
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研究论文 | 探讨从单核RNA-seq数据中分析等位基因失衡的实验和计算方法,并开发了一套单细胞等位基因特异性表达计算工具 | 发现从单核RNA-seq的内含子区域可提取更多等位基因特异性表达信息,并证明读长和杂交选择可提高检测效能 | 未提及 | 研究实验和计算选择如何影响基于等位基因特异性表达方法的能力 | 帕金森病队列样本 | 自然语言处理, 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 单核RNA-seq | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2026-05-20 |
Urolithin A blocks colorectal cancer progression by AKT1 inhibition-driven immune activation
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45621-y
PMID:41922440
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接和单细胞转录组学,发现天然多酚Urolithin A可通过抑制AKT1信号通路激活免疫反应,从而抑制结直肠癌进展 | 首次揭示Urolithin A通过抑制AKT1/FOXO1轴并增强CD8 T细胞效应功能来重塑肿瘤免疫微环境的机制,提出了饮食-微生物-AKT1-免疫轴模型 | 研究中主要使用体外细胞系和动物模型,缺乏临床样本验证;单细胞转录组学分析的具体数据和结果在摘要中未详细说明 | 探索天然多酚Urolithin A抗结直肠癌的潜在机制及其对免疫微环境的调控作用 | 结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、MC38)以及原位结直肠癌小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、MC38)和小鼠原位肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2026-05-20 |
scRNA-seq reveals different cell clusters in the testes of Mongolian cattle and EGR1/FOS/JUN regulation in Sertoli cells
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44429-0
PMID:41922521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2026-05-19 |
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719961
PMID:42079298
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研究论文 | 介绍了一种名为Turep的深度学习方法,用于通过单细胞和空间转录组数据稳健地跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 | 通过整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,识别出泛癌肿瘤反应性基因特征,并利用生成式数据增强解决数据不平衡问题 | 未明确提及局限性 | 开发一种能够在跨癌种场景下稳健预测肿瘤反应性T细胞的工具 | 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者T细胞 | 机器学习 | 泛癌(七种人类恶性肿瘤) | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,空间转录组学 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据,空间转录组数据 | 七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 480 | 2026-05-19 |
Transcriptomic profile reveals cellular composition contribute to hyaline-vascular variant in unicentric Castleman disease-associated paraneoplastic pemphigus
2026-Apr-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag153
PMID:42008118
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研究论文 | 整合转录组学分析揭示单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮中透明血管变异型的细胞组成特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞在血管透明化和基质失调中的核心作用,并阐明内皮-免疫细胞互作机制 | 未提及 | 通过整合转录组和细胞分析,阐明单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮的细胞和分子发病机制 | 33例UCD-PNP患者的淋巴结样本(包含5例进行单细胞测序) | 计算机视觉 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 33例UCD-PNP患者淋巴结样本(5例进行单细胞测序,共58,811个细胞) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq 6000测序平台 |