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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-05-27 |
Exploration of the roles of SSR2 in hepatocellular carcinogenesis based on single-cell transcriptomics and spatial transcriptomics
2026-Apr-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05017-w
PMID:41979818
|
研究论文 | 基于单细胞转录组和空间转录组数据,探索SSR2基因在肝细胞癌发生中的作用机制 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组分析,发现SSR2在NK细胞中高表达伴随细胞质翻译通路增强,驱动肿瘤免疫微环境紊乱 | NA | 探索SSR2基因在肝细胞癌发生中的作用,为改善预后提供新的诊断和治疗靶点 | 肝细胞癌患者的肝脏组织 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量转录组测序 | 非负矩阵分解, 加权基因共表达网络分析, 集成机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 442 | 2026-05-29 |
Single-cell profiling reveals that dynamic lung immune responses distinguish protection from susceptibility to tuberculosis
2026-04, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013635
PMID:42044120
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析,揭示肺部免疫反应的动态变化如何区分对结核病的保护性与易感性 | 首次通过单细胞RNA测序,在多时间点、多小鼠品系和多结核分枝杆菌菌株下,系统比较了初次感染与已受控感染小鼠的肺免疫反应动态差异,发现保护性免疫依赖于免疫激活的时序和协调,而非单一反应的强度 | 研究中主要使用小鼠模型,结果向人类和灵长类的推广仍需进一步验证;且未深入探讨相关信号通路的分子机制 | 阐明肺结核保护性免疫的免疫相关因素,特别是时间动态和细胞协调机制 | 小鼠(未感染和已受控结核分枝杆菌感染的品系)及非人灵长类(静脉注射BCG疫苗后的样本) | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达谱(单细胞转录组数据) | 多个时间点、多个小鼠品系和多个结核分枝杆菌菌株的肺免疫细胞样本,以及非人灵长类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 平台 |
| 443 | 2026-05-28 |
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.708620
PMID:41889866
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研究论文 | 本研究探讨了不同高脂饮食对宿主和肠道微生物组的多组学重编程影响,以及这些变化在饮食逆转后的持久性 | 首次系统揭示了高脂饮食来源、基线微生物组结构和饮食历史如何共同塑造宿主-微生物组相互作用,并发现饮食逆转后部分微生物和宿主基因表达的改变持续存在,形成“微生物组记忆”效应 | 研究仅在动物模型中进行,对人类影响的直接推断需谨慎;饮食逆转观察时间窗口有限,未能完全捕捉所有改变的恢复过程 | 定义高脂饮食中不同脂肪来源对宿主和微生物组的长期影响,并评估这些影响在饮食逆转后的可逆性 | 小鼠及肠道微生物组 | 数字病理学 | NA | 多组学技术,包括粪便宏基因组学、粪便代谢组学、血浆代谢组学、脂质组学和肠道单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据(宏基因组、代谢组、脂质组、单细胞转录组) | 小鼠多个队列,包括一年饲养和饮食逆转实验,具体样本量文中未明述 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于肠道单细胞RNA测序 |
| 444 | 2026-05-28 |
The heterogeneity and sexual-dimorphism of human TCRαβ+CD4-CD8- double negative T cells
2026-Apr-18, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.04.008
PMID:42009279
|
研究论文 | 通过单细胞转录组、TCR库和染色质可及性分析,揭示了人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的异质性和性别二态性 | 首次系统描绘了外周血双阴性T细胞的单细胞多组学特征,发现了其亚群在基因表达、转录调控、发育特征和性别异质性方面的差异,并揭示了这些亚群在溃疡性结肠炎和1型糖尿病中的变化 | 仅基于10个健康供体的样本,且未对功能机制进行深入验证 | 探究人类外周血TCRαβ+CD4-CD8-双阴性T细胞的分子和功能特征及其在疾病中的潜在作用 | 10名健康供体的外周血双阴性T细胞 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎, 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 单细胞ATAC测序 | 未明确提及 | 单细胞转录组数据, TCR库数据, 染色质可及性数据 | 10名健康供体的外周血样本,以及公开数据中的溃疡性结肠炎和1型糖尿病患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 和单细胞ATAC测序平台 |
| 445 | 2026-05-28 |
RTCB is essential for early mouse embryogenesis
2026-04-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioag008
PMID:41524728
|
研究论文 | 通过条件性敲除小鼠模型,发现RTCB对早期小鼠胚胎发生至关重要,其缺失导致原肠胚形成失败 | 首次揭示RTCB在小鼠胚胎原肠胚形成中的关键作用,并提出了YY1-RTCB-NUSAP1调控轴 | 研究主要基于小鼠模型,人类胚胎中相关机制的验证仍需进一步实验 | 探索RTCB在哺乳动物生殖和早期胚胎发育中的功能 | 小鼠胚胎组织和NIH 3T3细胞 | 机器学习 | NA | 条件性基因敲除、组织学分析、免疫组化、定量PCR、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠胚胎样本(E3.5至E7.5)及NIH 3T3细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2026-05-28 |
Characterization and regulatory mechanism evaluation of C8orf33 in hepatocellular carcinoma through multiomics profiling
2026-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04951-z
PMID:41965457
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研究论文 | 通过多组学分析表征C8orf33在肝细胞癌中的表达谱及其调控机制 | 首次整合bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq和空间转录组学多组学方法,全面解析C8orf33在肝细胞癌中的表达景观及其与巨噬细胞免疫调节的潜在联系 | 仅使用Huh7细胞系进行功能验证,缺乏其他细胞系及体内模型的深入验证 | 探究C8orf33在肝细胞癌中的生物学功能及调控机制 | C8orf33基因及其在肝细胞癌中的表达与功能 | 计算机视觉 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 多个癌症样本(具体数量未说明)及肝细胞癌细胞系Huh7 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 447 | 2026-04-11 |
Single-cell and spatial transcriptomics analyses reveal tumor microenvironment-driven proliferation of NF2-associated vestibular schwannomas
2026-Apr-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03799-y
PMID:41957607
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 448 | 2026-05-28 |
Integrating single-cell transcriptomics and epigenetics in a multi-omics MR framework identifies PARK7 as a causal gene in streptococcal septicemia
2026-Apr-05, Epigenetics & chromatin
IF:4.2Q1
DOI:10.1186/s13072-026-00673-2
PMID:41937214
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2026-04-06 |
Integration of machine learning-based screening approaches and single-cell sequencing technique to identify cancer stemness genes associated with radiotherapy resistance in lung adenocarcinoma
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04873-w
PMID:41934581
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2026-05-28 |
Helicobacter pylori-linked gene CFAP73 rewires epithelial programs and shapes the gastric cancer microenvironment
2026-Apr-04, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04891-8
PMID:41934579
|
研究论文 | 该研究揭示了HP感染相关基因CFAP73通过重编程上皮程序并塑造胃癌微环境,促进肿瘤抑制和免疫激活的作用 | 首次发现CFAP73作为HP感染过程中进行性下调的肿瘤保护基因,并明确其通过抑制增殖、EMT和激活p53/凋亡通路来维持上皮抑癌状态,同时通过配体-受体分析和空间转录组学揭示其重塑纤维细胞和T细胞状态以维持抗肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于公共数据库和体外/体内实验,尚需更大规模的前瞻性队列验证CFAP73作为生物标志物的临床价值,且CFAP73在HP感染早期下调的具体分子机制有待进一步阐明 | 探究胃上皮细胞在HP感染过程中逐渐紊乱的分子程序,并寻找与恶性转化相关的关键基因 | HP感染相关的胃黏膜上皮细胞和胃癌微环境中的免疫细胞、成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | RNA-seq | 随机森林 | 文本 | 多个公共数据集(GSE60662、GSE60427、TCGA-STAD)及单细胞RNA-seq数据集GSE249874 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 451 | 2026-05-27 |
A single-cell and spatial transcriptomic atlas of human tuberculous constrictive pericardium
2026-Apr, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106233
PMID:41875497
|
研究论文 | 对人类结核性缩窄性心包炎进行了单细胞和空间转录组图谱分析 | 首次构建了结核性缩窄性心包炎的人体心包单细胞和空间转录组图谱,揭示了与肉芽肿形成、血管重塑和纤维化激活相关的异质性转录程序,并识别了MMP9+巨噬细胞、CCL19+成纤维细胞和S100A4+内皮细胞等关键细胞类型及其空间组织 | 样本量有限(6例患者和3例正常对照),可能无法完全代表疾病异质性;仅通过观察性分析提出细胞间相互作用,功能性验证尚需进一步研究 | 阐明结核性缩窄性心包炎中肉芽肿性炎症与心包纤维化之间的细胞结构和细胞间信号回路 | 手术切除的结核性缩窄性心包炎患者和正常对照的心包组织 | 数字病理学 | 结核病、心血管疾病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 6例结核性缩窄性心包炎患者和3例正常对照的81,634个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 452 | 2026-04-12 |
Spatial Transcriptomics of the Cyst Microenvironment in an Autosomal Dominant Polycystic Kidney Disease Model
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001050
PMID:41920711
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 453 | 2026-05-25 |
Cre-dependent gene expression enables thymic development of autoreactive tumor-associated antigen targeting CAR-T cells
2026-Apr-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.12.047
PMID:41445186
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研究论文 | 开发了一种通过基因工程造血干细胞在胸腺中持续生成CAR-T细胞的平台,并利用诱导型基因表达克服胸腺负选择 | 首次利用胸腺微环境持续生成CAR-T细胞,并通过诱导型基因表达系统绕过中枢耐受,实现自体更新的CAR-T细胞疗法 | NA | 解决CAR-T细胞体内持久性有限和肿瘤复发问题,开发可持续生成CAR-T细胞的平台 | 造血干细胞和祖细胞、CAR-T细胞、胸腺微环境 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 454 | 2026-05-23 |
DUSP5 suppresses esophageal squamous cell carcinoma by counteracting macrophage-derived AREG-ERK1/2 signaling and disrupting an oncogenic ERK1/2-ELK1-DUSP5 feedback circuitry
2026-Apr-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08641-0
PMID:41956999
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合体内外模型,揭示了DUSP5通过抑制肿瘤浸润巨噬细胞来源的AREG-ERK1/2信号通路及破坏致癌性ERK1/2-ELK1-DUSP5正反馈回路来抑制食管鳞癌进展的分子机制 | 首次阐明DUSP5在食管鳞癌中充当肿瘤抑制因子,并发现其受ERK1/2下游转录因子ELK1负调控,形成致癌性反馈回路;同时揭示了APOC⁺巨噬细胞通过AREG-EGFR轴促进肿瘤生长的免疫微环境机制 | 未明确提及具体研究限制 | 探究DUSP5在食管鳞癌中的功能及肿瘤免疫微环境中的调控机制 | 食管鳞癌细胞系、小鼠异种移植模型及致癌物诱导的DUSP5敲除小鼠 | 数字病理学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、细胞增殖/凋亡/迁移检测、小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组分析、基因表达谱 | 单细胞转录组数据、临床组织样本数据 | 未明确提及样本量,涉及多个细胞系及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2026-05-23 |
Functional analysis of the human miRNome in non-small cell lung cancer unveils a novel miR-92b-3p/NOTCH3 axis that drives tumor progression
2026-Apr-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08709-x
PMID:41951596
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研究论文 | 通过功能性miRNA筛选发现miR-92b-3p/NOTCH3轴驱动非小细胞肺癌进展 | 首次对肺腺癌中人类miRNome进行系统性功能筛选,并发现驱动肿瘤进展的新miR-92b-3p/NOTCH3轴 | NA | 系统鉴定与肺腺癌进展相关的功能性miRNA及其机制 | 肺腺癌细胞系及患者样本 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | 慢病毒miRNA筛选, RNA-seq, 空间转录组学 | 风险评分模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA-LUAD队列及内部空间转录组样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 456 | 2026-05-23 |
SIRT1 mediates KU70 to maintain genomic stability in spermatogonial stem cells via the NHEJ repair pathway
2026-Apr-07, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08710-4
PMID:41946691
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研究论文 | 该论文揭示了SIRT1通过KU70介导的非同源末端连接修复途径维持精原干细胞基因组稳定性的机制 | 首次在精原干细胞中阐明SIRT1通过去乙酰化KU70调控NHEJ修复通路,并发现SIRT1-KU70轴是保护雄性生育力的潜在靶点 | 主要基于体外实验和小鼠模型,人体样本验证有限,且未深入探讨SIRT1其他下游靶点 | 探究SIRT1在精原干细胞DNA损伤应答中的作用机制及其对雄性生育力的影响 | 非阻塞性无精子症患者的精原干细胞及小鼠精原干细胞模型 | 机器学习 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类睾丸单细胞RNA测序数据集(非阻塞性无精子症患者与对照),以及梗阻性无精子症患者睾丸切片 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'RNA-seq |
| 457 | 2026-05-23 |
Integrated spatial transcriptomics and pan-cancer XGBoost modeling uncover spatial drivers of immune exclusion and predict immunotherapy response
2026-Apr-02, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04374-3
PMID:41925746
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研究论文 | 本研究建立了一个综合计算框架,整合27种癌症类型的多组学数据,利用空间转录组学解码免疫相关非编码RNA调控网络,发现SNHG6-BIRC5轴是肺腺癌“免疫冷”表型的关键驱动因子,并开发了泛癌XGBoost模型用于预测免疫治疗反应 | 首次将空间转录组学与多组学分析结合,系统鉴定免疫排斥的空间驱动因素,并开发了优于PD-L1的泛癌XGBoost预测模型 | 文中未明确提及研究局限性 | 利用空间转录组学和机器学习方法,揭示免疫排斥的空间驱动因素,并开发预测免疫治疗反应的泛癌模型 | 27种癌症类型的肿瘤样本,重点为肺腺癌样本 | 机器学习 | 肺癌 | NGS, 空间转录组学, CRISPR-Cas9筛选 | XGBoost | 图像 | 27种癌症类型的数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 458 | 2026-05-23 |
Hepatic radiofrequency ablation induces widespread cellular activation throughout the liver
2026-Apr-02, European radiology experimental
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s41747-026-00687-1
PMID:41926011
|
研究论文 | 研究了肝脏射频消融术后远处肝组织的细胞、转录和翻译激活情况 | 首次通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析,全面揭示了射频消融术后肝脏远处区域在转录和翻译水平上的广泛细胞激活现象 | 研究仅使用小鼠模型,且样本量较小(两只治疗小鼠和一只对照),可能无法完全代表人类肝脏的生物学反应 | 探究射频消融对整个肝脏的细胞、转录和翻译激活程度 | 健康肝脏的小鼠模型 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 射频消融, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析(SomaLogic) | NA | 单细胞基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 两只8-10周龄雄性C57/Bl6小鼠进行射频消融,一只进行假手术对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophage-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析臭氧暴露小鼠肺泡巨噬细胞的浓度依赖性反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组变化和功能调节 | 信息不足,未提及 | 探究肺泡巨噬细胞在臭氧暴露下的浓度依赖性反应机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | NA | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 460 | 2026-05-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals extensive fibrotic remodeling and pathogenic chondrocyte subpopulations in developmental dysplasia of the hip
2026-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-1-891
PMID:42158655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的纤维化重塑和致病性软骨细胞亚群 | 首次在发育性髋关节发育不良的髋臼软骨中通过单细胞RNA测序识别出四个此前未知的软骨细胞亚群,并揭示其向纤维软骨样表型的显著转变及相关的分子机制 | 样本量较小(3例患者和2例对照),且研究仅聚焦于转录组层面,缺乏功能验证实验 | 探究发育性髋关节发育不良中髋臼软骨的细胞异质性和纤维化重塑机制 | 发育性髋关节发育不良患儿的髋臼软骨细胞 | 数字病理学 | 骨科疾病 | 单细胞RNA测序,PCR,免疫组化,组织学染色 | NA | 基因表达数据 | 3例发育性髋关节发育不良患儿和2例年龄匹配对照的髋臼软骨,共10550个软骨细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |