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当前共找到 951 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-05-10 |
Decoding the tumor immune landscape: emerging TIL subsets as prognostic biomarkers and therapeutic targets
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04913-2
PMID:41579172
|
综述 | 综述了肿瘤浸润淋巴细胞中新兴亚群作为预后生物标志物和治疗靶点的作用 | 系统总结了超越传统CD3和CD8标记的TIL亚群在不同癌症中的功能，并聚焦于它们在免疫治疗中的预测价值 | 未提及具体的数据分析或实验验证，可能缺乏对某些新兴亚群的深入机制探讨 | 研究TIL亚群的异质性及其在癌症免疫中的预后和治疗意义 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的多种亚群，包括CD4+T细胞、Tregs、TRM细胞、γδT细胞等 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 422 | 2026-05-09 |
LILRB2+ monocytes reshape the immune activation landscape in immunotherapy with non-small cell lung cancer: Evidence from real-world cohorts and single-cell analyses
2026-Apr-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.152331
PMID:42069195
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研究论文 | 本研究利用真实世界队列和单细胞分析，揭示LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中重塑免疫激活景观的作用 | 首次在单细胞水平解析LILRB2+单核细胞亚群对PD-1/PD-L1免疫治疗的影响，并建立LILRB2/S100A8单核细胞比值作为新的疗效预测指标 | 未充分探索LILRB2+单核细胞与其他免疫细胞的相互作用机制，且样本量有限，需进一步验证 | 探究LILRB2+单核细胞在非小细胞肺癌免疫治疗中的作用及其预测价值 | 非小细胞肺癌患者的转录组数据和临床数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 来自OAK、POPLAR和ORIENT-11临床试验的NSCLC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-05-09 |
Exogenous pyruvate restores mitochondrial bioenergetics by synergizing with the AMPK-mTOR-SIRT3 pathway to alleviate sepsis-associated acute kidney injury
2026-Apr-22, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2026.112089
PMID:42031090
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研究论文 | 本研究揭示外源性丙酮酸乙酯通过AMPK-mTOR-SIRT3信号通路协同恢复线粒体生物能量学，从而减轻脓毒症相关急性肾损伤 | 首次阐明外源性代谢底物丙酮酸乙酯与AMPK激活剂协同作用，通过AMPK-mTOR-SIRT3通路恢复线粒体功能，为脓毒症相关急性肾损伤的代谢靶向治疗提供新机制 | 实验仅基于小鼠模型和细胞系，缺乏临床验证；SIRT3下游机制有待进一步探索 | 研究外源性丙酮酸乙酯通过调节线粒体生物能量学减轻脓毒症相关急性肾损伤的分子机制 | 盲肠结扎穿刺诱导的SA-AKI小鼠模型和LPS刺激的HK-2细胞 | 数字病理学 | 脓毒症相关急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和HK-2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2026-05-09 |
SpaTRACE: Spatiotemporal recurrent auto-encoder for reconstructing signaling and regulatory networks from spatiotemporal transcriptomics data
2026-Apr-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.20.689569
PMID:42039614
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研究论文 | 提出SpaTRACE框架，从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络 | 利用时空递归自编码器同时重建转录因子-靶基因调控网络、配体-受体-靶基因信号通路及配体-受体结合关系，无需预定义配体-受体数据库 | 依赖伪时间轨迹采样，可能无法完全捕捉真实时间动态；模型复杂度高，需要较大数据集进行训练 | 从空间转录组数据中联合推断细胞间信号传导和基因调控网络，捕捉发育和再生过程中的动态调控机制 | 小鼠中脑发育和蝾螈脑再生过程中的空间转录组数据 | 计算机视觉, 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 自编码器, 注意力机制 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2026-05-09 |
A Mouthful of Genomic Data: Single-Cell Insights into Salivary Gland Biology and Disease
2026-Apr-18, Biology
DOI:10.3390/biology15080641
PMID:42041920
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综述 | 综述单细胞RNA测序在唾液腺生物学与疾病研究中的应用，总结主要发现、局限性及方法学考虑 | 系统整合了唾液腺scRNA-seq研究的最新进展，聚焦于细胞类型发现、分子机制及数据质量问题 | 数据处理不一致和实验方法报告不完整影响可重复性，限制高质量数据集的识别 | 总结scRNA-seq在唾液腺研究中的发现，指导未来研究 | 唾液腺（大唾液腺和小唾液腺） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2026-05-09 |
Histotripsy-Initiated Immune Response Synergizes with Chemotherapy in a Neuroblastoma Murine Model
2026-Apr-15, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081249
PMID:42073574
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研究论文 | 本研究探讨了组织切除术在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导的免疫反应如何与化疗协同作用 | 首次展示了无创聚焦超声组织切除术通过机械性气泡云作用诱导系统性抗肿瘤免疫反应，增强化疗对转移性神经母细胞瘤的疗效 | 未提供具体局限性信息 | 验证组织切除术诱导的肿瘤微环境变化能否改善转移性神经母细胞瘤对化疗的应答 | 雌性A/J小鼠双侧胁部接种Neuro-2a细胞建立神经母细胞瘤模型 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 组织切除术，单细胞RNA测序，流式细胞术，免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只小鼠双侧肿瘤（单侧治疗），每组5-7天后评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提供具体平台配置信息 |
| 427 | 2026-05-09 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
|
研究论文 | 对12种从单细胞RNA测序数据推断拷贝数变异的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试，提供实践指南 | 首次对12种CNV推断方法进行大规模系统基准测试，覆盖超过10万个细胞，建立了基于恶性细胞分类准确性、CNV推断准确性、可扩展性和鲁棒性的综合评估框架，并提供标准化CNV档案公共资源库 | 基准测试主要依赖现有数据集和合成数据，可能未完全涵盖所有实际应用场景；部分方法的性能高度依赖于原始测序数据可用性和等位基因推断质量 | 系统评估单细胞RNA测序数据的拷贝数变异推断方法，为研究人员提供实践决策指南 | 12种CNV推断方法（包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等） | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、等位基因数据 | 28个真实数据集（超过10万个细胞）及多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2026-04-18 |
Sphingosine-1-Phosphate-derived 2-Hexadecenal is a central mediator of ocular neovascularization by inhibiting Sphingosine-1-Phosphate receptor 5
2026-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71792-3
PMID:41980976
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研究论文 | 本文揭示了S1P代谢产物2-HD通过抑制S1PR5破坏铁稳态并诱导铁死亡，从而在视网膜血管异常中发挥关键作用 | 首次发现S1P衍生的2-HD在血管功能中的作用，并揭示其通过直接与S1PR5相互作用诱导铁死亡的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外分析，人类样本验证有限，且未深入探讨其他S1PRs在过程中的潜在作用 | 探究S1P代谢产物2-HD在血管生成和视网膜血管疾病中的功能及机制 | 斑马鱼视网膜血管、人类新生血管视网膜样本 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 多组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-05-09 |
Semi-parametric empirical bayes method for multiplet detection in snATAC-seq with probabilistic multi-omic integration
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013653
PMID:42054434
|
研究论文 | 提出一种半参数经验贝叶斯方法SEBULA，用于snATAC-seq数据中的多细胞检测，并支持多模态证据整合 | 无需合成双细胞，直接从染色质可及性信号建模单细胞背景，实现假发现率控制；并扩展至多模态数据整合 | 标题与摘要未提及具体限制 | 开发高效的snATAC-seq多细胞检测方法 | snATAC-seq数据中的多细胞（双细胞） | 机器学习 | NA | snATAC-seq | 半参数经验贝叶斯模型 | 序列数据 | 多个多模态数据集与模拟数据 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 430 | 2026-05-09 |
Spatial multi-omics identifies a NOTCH3-mediated capillary-mCAF crosstalk driving immune exclusion in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70117
PMID:42099451
|
研究论文 | 通过空间多组学数据分析，发现NOTCH3介导的毛细血管-mCAF相互作用导致肝细胞癌免疫排斥 | 首次利用空间多组学结合泛癌单细胞测序数据，揭示NOTCH3信号通路在肝细胞癌中通过毛细血管与基质产生型癌相关成纤维细胞（mCAF）的相互作用，驱动免疫排斥微环境形成 | NA | 阐明肝细胞癌中纤维化介导的免疫排斥机制，探索NOTCH信号通路在癌相关成纤维细胞极化中的作用 | 肝细胞癌组织样本及小鼠模型 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 空间多组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-05-09 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and phenotypic transitions of smooth muscle cells in aortic dissection
2026-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70124
PMID:42099453
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 432 | 2026-05-08 |
ICON: An isoform-aware hierarchical random forest model for cell type classification
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.28.721306
PMID:42094358
|
研究论文 | 提出一个异构体感知的分层随机森林模型，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型分类 | 联合建模基因和异构体水平表达，捕捉丰度和使用模式，实现超越基因水平分辨率的分类；提供可解释的输出，识别关键基因和异构体驱动细胞类型区分 | 未明确说明，但基于长读长单细胞RNA测序数据集进行基准测试，可能受限于长读长技术的当前采用范围 | 开发异构体感知的细胞类型注释方法，提高单细胞RNA测序数据中细胞亚型和动态状态的分辨率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 长读长RNA测序 | 分层随机森林 | 基因和异构体表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-05-08 |
SpatialQuery: scalable discovery and molecular characterization of multicellular motifs from spatial omics data
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720136
PMID:42094390
|
研究论文 | 提出 SpatialQuery 框架，用于从空间组学数据中规模化发现多细胞基序并对其进行分子表征 | 能够同时识别空间中的多细胞共定位模式（细胞基序）并对其进行分子分析，超越了传统的成对分析，可发现受空间背景调控的基因及其协调表达变化 | NA | 开发一个计算框架，以发现空间组学数据中的多细胞基序并分析其分子特征 | 空间转录组学和蛋白质组学数据（包括肠道管状结构、肾脏、结肠和鼠脑图谱） | 数字病理学 | 肾脏疾病、结肠疾病 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 空间组学数据（基因表达和蛋白质数据） | 多个空间数据集（肠道管状结构、肾脏、结肠、鼠脑图谱等） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 434 | 2026-05-08 |
Unlocking Multi-Sample Differential Expression for Spatial Transcriptomics Data with TESSERA
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.27.720955
PMID:42094441
|
研究论文 | 提出了一种基于空间广义线性模型的方法TESSERA，用于分析多样本空间转录组数据，解决了传统方法在处理不同样本间坐标系统、细胞类型和组织结构差异时的不足 | 首次将空间统计方法扩展到多样本空间转录组数据分析，提供了高效可扩展的模型拟合与统计推断框架，支持跨样本差异表达分析 | 未提及 | 开发一种能够处理多样本空间转录组数据差异表达分析的新方法 | 模拟数据和人肾组织样本的空间转录组数据 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | 空间广义线性模型 | 基因表达计数数据 | 人肾组织样本（具体数量未提及） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 435 | 2026-05-08 |
Multiomic Profiling of 85 iPSC Lines from Familial Dementia Reveals Cellular Diversity and Regulators of Organoid Development
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.29.721747
PMID:42094457
|
研究论文 | 对85株家族性痴呆患者的iPSC系进行多组学分析，揭示细胞多样性与类器官发育调控因子 | 首次对多种MAPT突变iPSC系开展系统性的全基因组测序、单细胞RNA测序和DNA甲基化分析，发现新的亚群标记物与基因组编辑意外事件 | 未深入探讨不同突变类型对iPSC异质性的具体机制影响 | 系统表征家族性痴呆相关iPSC系的分子和遗传特征，提升其在疾病模型与治疗开发中的应用价值 | 85株携带MAPT突变的iPSC系及其同源对照组 | 数字病理学 | 老年性疾病 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序, DNA甲基化分析 | NA | 基因组序列, 转录组数据, 甲基化数据 | 85株iPSC系 | Illumina | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 436 | 2026-05-08 |
Spatially Distinct Macrophage Subsets Drive Myofibroblast Heterogeneity and Maladaptive Fibrosis in Lupus Nephritis
2026-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.27.719870
PMID:42094578
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了狼疮性肾炎中巨噬细胞亚群驱动肌成纤维细胞异质性和适应不良性纤维化的空间特异性机制 | 首次在人类狼疮性肾炎中描绘了巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的空间和功能异质性图谱，识别出两种具有不同空间定位和功能的肌成纤维细胞亚群（间质性促炎亚型Myofib1和肾小球纤维化重塑亚型Myofib2）及其与不同巨噬细胞亚群的互作模式 | 主要基于横断面活检样本，缺乏纵向追踪数据；小鼠体外共培养模型可能无法完全模拟人体内复杂的微环境；样本量相对有限 | 研究狼疮性肾炎中巨噬细胞与成纤维细胞相互作用的细胞图谱，为开发抗纤维化治疗策略提供靶点 | 人类狼疮性肾炎肾活检样本（156例患者和30例健康对照）以及小鼠模型 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、体外共培养 | NA | 基因表达数据、空间转录数据 | 156例人类狼疮性肾炎活检样本、30例健康对照、6例狼疮性肾炎患者的空间转录组样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 437 | 2026-05-08 |
Multi-omics analysis of type II diabetic wound healing reveals CD44-mediated immune cell crosstalk dysfunction in mice and humans
2026-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.26.720829
PMID:42094454
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示CD44介导的II型糖尿病伤口愈合中免疫细胞相互作用异常 | 首次对db/db小鼠伤口愈合模型进行时间序列单细胞多组学分析，并系统比较与人类糖尿病足溃疡的异同，发现CD44作为免疫细胞互作关键枢纽 | 未提及 | 阐明II型糖尿病伤口愈合过程中免疫细胞动态变化及分子机制，寻找潜在治疗靶点 | 糖尿病db/db小鼠与非糖尿病小鼠的皮肤细胞，以及人类糖尿病足溃疡组织 | 计算机视觉 | 糖尿病相关慢性伤口 | 单细胞转录组学、单细胞蛋白质组学、多组学分析 | NA | 单细胞转录组和表面蛋白表达数据 | db/db小鼠和非糖尿病小鼠三个时间点（炎症期、延迟增殖期、恢复期）的皮肤样本；人类慢性伤口研究整合数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2026-05-08 |
High cRel-expressing germinal center B cells favor precursor plasma cell generation
2026-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.26.720943
PMID:42094478
|
研究论文 | 利用cRel荧光报告小鼠和单细胞RNA测序，揭示高表达cRel的生发中心B细胞偏向生成前体浆细胞 | 首次在自然表达变异水平上阐明cRel对生发中心B细胞输出中前体浆细胞生成的调控作用，而非前体记忆B细胞 | 未提供具体局限性信息，但可能包括未直接验证cRel过表达或缺失的功能性影响 | 研究转录因子cRel在生发中心B细胞选择中的生理功能 | cRel荧光报告小鼠的生发中心B细胞（包括明区和暗区细胞） | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 小鼠生发中心B细胞样本（约6-9%明区细胞表达高cRel） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-05-08 |
MatriSpace: Identification and visualization of spatially resolved ECM gene expression patterns in health and disease
2026-Apr-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.26.720198
PMID:42094549
|
研究论文 | 介绍了一个名为MatriSpace的计算框架，用于识别和可视化健康与疾病中空间分辨的细胞外基质基因表达模式 | 开发了一个专门针对ECM基因的空间转录组数据挖掘框架，提供两种操作模式（用户上传数据集或探索公共数据集），并能从单基因到组织微环境和功能ECM单元等多个层面生成空间分辨的基因表达图谱 | 论文未明确说明限制，但可能包括对数据质量或计算资源的依赖 | 利用空间转录组学识别不同细胞群体对ECM生产的空间贡献，并用于治疗目的 | 健康与疾病样本中的细胞外基质基因表达模式 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-05-08 |
Integrative multi-omics analysis identifies key ubiquitination regulators in prostate cancer
2026-Apr-28, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102788
PMID:42055487
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和GWAS数据，识别并验证了前列腺癌中关键泛素化调控基因POLI和TRIM8的因果作用和生物学功能 | 首次通过整合scRNA-seq和GWAS数据的多组学分析方法，系统性地鉴定前列腺癌中与泛素化过程相关的关键因果基因，并通过体内外实验验证TRIM8的抑癌功能 | 泛素化相关基因的筛选局限于已有的基因集合，且主要依赖生物信息学分析，部分结果需要更大样本量的临床队列验证 | 识别前列腺癌中泛素化关键调控基因并验证其多层次的生物学作用 | 前列腺癌患者的组织样本和细胞系 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、全基因组关联分析、孟德尔随机化、免疫组化、Western blot、qPCR、分子对接 | NA | 基因表达数据、GWAS数据 | 30例前列腺癌组织样本（按Gleason分级），细胞系包括22Rv1、LNCaP、PC-3和RWPE-1 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |