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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomic analysis unveils dysregulated macrophage-podocyte crosstalk in membranous nephropathy
2026-Apr-21, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2026.106958
PMID:42025748
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示膜性肾病中巨噬细胞与足细胞通讯失调的机制 | 首次构建膜性肾病单细胞转录组图谱,发现并验证了致病性巨噬细胞-足细胞轴的双重失衡机制 | 基于小鼠模型,结果是否完全适用于人类膜性肾病需要进一步验证 | 解析膜性肾病中驱动肾损伤的细胞网络机制 | 阳离子牛血清白蛋白诱导的膜性肾病小鼠模型肾细胞 | 数字化病理学 | 膜性肾病 | scRNA-seq, 细胞通讯分析(CellChat) | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-04-25 |
Macrophage heterogeneity governs the balance between fibrosis and tissue protection in systemic sclerosis
2026-Apr-20, Clinical and experimental rheumatology
IF:3.4Q2
DOI:10.55563/clinexprheumatol/kfkfod
PMID:42024552
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综述 | 本文综述了巨噬细胞异质性如何超越传统的M1/M2范式,作为连接血管损伤、免疫失调和成纤维细胞介导纤维化的“纤维-免疫轴”的核心调控因子,在系统性硬化症(SSc)及其间质性肺病(SSc-ILD)中发挥作用 | 利用单细胞RNA测序和空间多组学技术,揭示了SSc组织中不同巨噬细胞亚群(如SPP1+、FCGR3A+、TREM2+)的独特角色和功能,并发现“纤维化生态位”中巨噬细胞与成纤维细胞的致病性互作机制,为靶向治疗提供了新视角 | 对时间动态变化和空间信号分辨率的研究仍存在挑战 | 阐明巨噬细胞异质性在系统性硬化症进展中的核心作用,为开发机制导向的治疗策略奠定基础 | 系统性硬化症患者及其间质性肺病中的巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 肺病 | 单细胞RNA测序、空间多组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2026-04-25 |
Protocol for isolating stromal cells from lymphoid tissue for performing scRNA-seq
2026-Apr-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2026.104501
PMID:41989919
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protocol | 提供从淋巴组织中分离基质细胞以进行单细胞RNA测序的协议 | 专门针对低丰度基质细胞(占比小于2%)的分离和纯化步骤优化 | 未提及 | 建立从淋巴组织中纯化成纤维细胞用于单细胞RNA测序分析的标准化流程 | 淋巴组织中的基质细胞(成纤维细胞) | NA | NA | scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-04-25 |
Transcriptomic and single-cell analyses reveal the prognostic value of ETV4 and its role in shaping the immune landscape of colorectal cancer
2026-Apr-15, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102775
PMID:41997046
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研究论文 | 通过转录组和单细胞分析揭示了ETV4在结直肠癌中的预后价值及其通过诱导M2巨噬细胞极化重塑免疫微环境的作用 | 首次综合转录组和单细胞RNA测序数据,明确ETV4通过WNT/β-catenin通路调控,促进M2型巨噬细胞极化,进而塑造结直肠癌免疫抑制微环境 | 未在更大规模独立队列中验证,且ETV4与其他免疫细胞亚群的直接相互作用机制尚需进一步探索 | 研究ETV4在结直肠癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的影响机制 | 结直肠癌肿瘤组织及HCT-116细胞系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 免疫组化, Q-PCR, Western blot | CIBERSORT, GSVA, GSEA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 650例CRC肿瘤组织和51例癌旁正常组织(TCGA队列) | NA | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2026-04-25 |
Advances and limitations in angiogenesis assays: Integrating in vitro, in vivo, and emerging technologies
2026-Apr-13, Vascular pharmacology
IF:3.5Q2
DOI:10.1016/j.vph.2026.107607
PMID:41985854
|
综述 | 该综述综合探讨了血管生成实验方法的进展与局限,包括体外、体内模型及前沿技术整合,并提供了基于应用驱动的决策框架 | 创新点在于引入综合决策矩阵和算法选择指南,平衡生理保真度、实验约束与3R伦理原则,实现个性化实验设计 | 依赖现有技术综述,未涉及实际实验验证;技术整合的长期有效性尚未评估 | 提供血管生成实验方法的选择框架,优化实验设计的可重复性与转化相关性 | 血管生成实验技术,包括体外、体内模型及新兴技术 | 机器视觉 | NA | NA | NA | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 406 | 2026-04-11 |
Integrating machine learning and spatial transcriptomics uncovers shared immunomodulatory deubiquitinases in MAFLD and HCC
2026-Apr-10, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-026-02833-6
PMID:41961303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 407 | 2026-04-25 |
Linking Genetic Risk to Disease-Relevant Cellular States via Metacell-Informed Modeling with ICePop
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715877
PMID:41959181
|
研究论文 | 提出ICePop框架,通过元细胞分辨率进行疾病-细胞类型关联分析,平衡统计功效与异质性检测能力 | 首次实现元细胞分辨率下进行疾病-细胞类型关联分析,在保持细胞类型级别统计功效的同时检测细胞类型内部的异质性疾病信号 | 依赖单细胞转录组数据质量和注释准确性,对罕见细胞状态的检测可能受样本量限制 | 解决GWAS关联信号向特定细胞状态映射的挑战,建立遗传风险与细胞状态的因果关系 | 81种性状和120种细胞类型(Tabula Muris数据集),包括肠道上皮细胞、肺毛细血管内皮细胞、肠神经元等 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎、自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | ICePop(元细胞建模框架) | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris数据集(包含多种组织类型) | 未提及 | 单细胞RNA-seq | 未提及 | NA |
| 408 | 2026-04-25 |
RNA m6A methylation regulates CDH6 to promote epithelial-to-mesenchymal transition in cholangiocytes of biliary atresia
2026-Apr, Journal of pediatric surgery
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.jpedsurg.2025.162492
PMID:40774478
|
research paper | 本研究探讨了RNA m6A甲基化通过调控CDH6促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的机制 | 首次揭示了m6A甲基化通过METTL3/YTHDF2轴调控CDH6表达,进而促进胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于公开单细胞RNA测序数据集和体外实验,缺乏体内动物模型验证及临床样本的大规模验证 | 探究m6A修饰在胆道闭锁胆管细胞上皮-间质转化中的参与作用及其机制 | 胆道闭锁患者的胆管细胞 | machine learning | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, RNA免疫沉淀 | NA | 单细胞RNA测序数据, RNA-seq数据 | 公开单细胞RNA测序数据集HRA003163 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 409 | 2026-04-25 |
Mapping the zygote-to-adult developmental cell phylogeny in Arabidopsis thaliana reveals a three-cell rule of branching
2026-Apr, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-026-02264-1
PMID:41975122
|
研究论文 | 通过开发e-SMALT系统整合单细胞RNA测序,绘制拟南芥从合子到成体的发育细胞系统发育树,揭示三分枝规则 | 首次在高等植物中实现从合子到成体的全发育追踪,发现每个枝条起源于三个创始细胞的三细胞规则,并通过单细胞转录组解析三层胚层起源 | 当前仅分析两个个体,且barcode序列长度与突变率的依赖性可能限制更复杂组织的解析能力 | 阐明多细胞生物从单细胞合子到成体组织的发育细胞谱系及其分支规则 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)的枝条、花和果实组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、细胞谱系追踪 | 系统发育树重建 | 单细胞转录组数据、突变条形码数据 | 两株3月龄拟南芥个体,数千个细胞来自多个枝条分支 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组建库方法 |
| 410 | 2026-04-25 |
A Novel CRYBB2 Splicing Mutation Is Associated With Lens Extracellular Matrix Remodeling and Vascular Alterations in Congenital Cataract
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.4.36
PMID:41989229
|
研究论文 | 该研究在一个先天性白内障家系中发现CRYBB2基因的新剪接突变,并通过体内外实验揭示该突变导致晶状体细胞外基质重塑和血管异常 | 首次发现CRYBB2剪接突变与晶状体血管相互作用异常相关,并通过单细胞转录组分析揭示了晶状体对邻近血管的非细胞自主性影响 | 研究主要基于家系样本和斑马鱼模型,人类样本数量有限,且血管表型的分子机制尚需进一步验证 | 鉴定先天性白内障的遗传病因并阐明CRYBB2剪接突变对晶状体发育及相关眼部表型的影响 | 一个常染色体显性遗传先天性白内障大家系中的患者及斑马鱼模型 | 数字病理学 | 先天性白内障 | 全外显子测序,Sanger测序,RNA测序,定量逆转录PCR,单细胞RNA测序,免疫染色,细胞粘附实验,斑马鱼晶状体结构检测,血管成像 | NA | DNA序列数据,RNA测序数据,图像数据(免疫荧光、血管成像) | 一个先天性白内障家系中的多名成员及斑马鱼胚胎(具体数量未明确) | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序在斑马鱼48小时受精卵阶段进行 |
| 411 | 2026-04-25 |
High ALG1 Expression Is Correlated With Poor Prognosis and the Immune Microenvironment in Glioma
2026-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71142
PMID:42002825
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研究论文 | 本研究探讨ALG1在胶质瘤中的表达及其临床意义,发现ALG1高表达与不良预后和免疫微环境改变相关 | 首次系统揭示ALG1在胶质瘤中的过表达及其通过促进细胞迁移、调控上皮间充质转化和改变免疫抑制微环境促进肿瘤恶性的机制 | 未提及具体局限性 | 探究ALG1在胶质瘤中的表达模式、预后价值及其与免疫微环境的关系 | ALG1基因在胶质瘤中的表达和功能 | 机器学习 | 胶质瘤 | RNA-seq, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化/免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 临床样本数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质瘤样本,以及临床样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | TCGA和CGGA数据库来源的转录组测序数据,具体平台细节未明确 |
| 412 | 2026-04-25 |
M6A demethylase ALKBH5 mediated Igfbp4 mRNA m6A modification drives fibroblast activation and pathological upper airway fibrosis
2026-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70656
PMID:42015658
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研究论文 | 发现M6A去甲基化酶ALKBH5通过介导Igfbp4 mRNA的m6A修饰驱动成纤维细胞活化和上气道病理性纤维化 | 首次阐明ALKBH5-IGFBP4调控轴在喉气管狭窄中驱动成纤维细胞活化和气道纤维化的作用机制 | NA | 探究ALKBH5在喉气管狭窄中对成纤维细胞活化和纤维化的作用及其分子机制 | 喉气管狭窄大鼠模型及成纤维细胞 | 数字病理学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序, RNA测序, MeRIP测序, RNA免疫沉淀定量PCR, 双荧光素酶报告实验 | NA | 基因表达数据 | 喉气管狭窄大鼠模型及体外细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 标准RNA测序, MeRIP测序 | NA | NA |
| 413 | 2026-04-25 |
Cellular stress-induced eccrine gland dysfunction as a potential mechanism in acquired idiopathic generalized anhidrosis
2026-Apr-01, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.03.022
PMID:41933877
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研究论文 | 通过组织学和单细胞RNA测序分析,探究获得性特发性全身性无汗症(AIGA)的发病机制及糖皮质激素脉冲疗法的治疗作用 | 首次发现未折叠蛋白反应相关的细胞应激导致外泌腺功能障碍是AIGA的潜在发病机制,并阐明糖皮质激素脉冲疗法通过减轻细胞应激而非仅靠免疫抑制发挥作用 | 样本量较小,仅对少数病例进行详细分析;缺乏功能性验证实验 | 阐明获得性特发性全身性无汗症的潜在机制及糖皮质激素脉冲疗法的作用原理 | 获得性特发性全身性无汗症(AIGA)患者的皮肤病变组织 | 数字病理学 | 获得性特发性全身性无汗症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织病理图像 | 多例AIGA患者的皮肤样本,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2026-04-25 |
Decoding NK Cell Subset Dysregulation in SARS-CoV-2 Infection: Phenotypic, Functional, and Transcriptomic Insights Into COVID-19 Pathogenesis
2026-Apr, Scandinavian journal of immunology
IF:4.1Q2
DOI:10.1111/sji.70115
PMID:41981866
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综述 | 综述了SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的表型、功能和转录组学失调及其在COVID-19发病机制中的作用 | 整合多组学和表型方法,全面解析NK细胞亚群失调与疾病严重程度的关联,并提出潜在生物标志物和治疗靶点 | 未提供原始实验数据,可能依赖已有研究的局限性,如样本异质性和技术差异 | 阐明SARS-CoV-2感染中NK细胞亚群的失调机制及其在COVID-19免疫病理学中的作用 | 自然杀伤细胞(NK细胞)亚群 | 数字病理学 | 新型冠状病毒肺炎 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 415 | 2026-04-24 |
Causal Associations Between Immune Cell-Specific Gene Expression and Major Depressive Disorder: A Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization Study
2026-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504837R
PMID:42018362
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研究论文 | 通过单细胞转录组范围的孟德尔随机化研究,发现免疫细胞特异性基因表达与重度抑郁症之间的因果关联 | 首次将单细胞cis-eQTL数据与孟德尔随机化方法结合,在免疫细胞亚型层面鉴定与抑郁症因果相关的基因靶点 | NA | 利用遗传证据识别特定免疫细胞类型的分子靶点,为精准免疫治疗提供新方向 | 14种免疫细胞亚型(包括CD4 T细胞、未成熟B细胞和浆细胞) | 机器学习 | 重度抑郁症 | 单细胞转录组测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据和GWAS汇总统计数据 | OneK1K队列中14种免疫细胞亚型的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-04-24 |
Single-cell profiling of ANKRD26 thrombocytopenia reveals progenitor expansion and polyploid apoptosis via JUNB-p21
2026-Apr-23, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030017
PMID:41538704
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示ANKRD26相关血小板减少症中祖细胞扩增和JUNB-p21介导的多倍体凋亡机制 | 首次通过跨患者验证的单细胞转录组和离体功能分析,系统性描绘THC2患者的骨髓细胞图谱,发现ANKRD26高表达通过JUNB-p21轴诱导多倍体巨核细胞凋亡,而非依赖经典p53通路 | 研究患者样本量较少(4例),且未在体内模型中验证治疗靶点 | 阐明ANKRD26基因5'非翻译区变异导致血小板减少症的分子和细胞机制 | 4例THC2患者的骨髓CD34+造血干细胞/祖细胞及原代巨核细胞 | 数字病理学 | 血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4例THC2患者与对照组的47,281个HSPC和7,309个pMK细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 417 | 2026-04-24 |
Histone lactylation maintains bovine early embryo development via regulating embryonic genome activation
2026-Apr-23, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01398-8
PMID:42021385
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研究论文 | 研究组蛋白乳酸化修饰通过调控胚胎基因组激活来维持牛早期胚胎发育 | 首次揭示组蛋白乳酸化修饰在牛早期胚胎发育中的作用及其通过调控胚胎基因组激活影响胚胎发育的机制,并发现β-烟酰胺单核苷酸可逆转抑制效应 | 未提及具体局限性 | 探究组蛋白乳酸化修饰对牛早期胚胎发育的影响及其机制 | 牛体外受精胚胎 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序、5-乙炔尿苷染色 | NA | 基因表达数据 | 牛体外受精胚胎(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-04-24 |
Immune Mediators in Birdshot Chorioretinopathy: A Systematic Review
2026-Apr-23, Ocular immunology and inflammation
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/09273948.2026.2655441
PMID:42023421
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综述 | 系统综述了麻雀脉络膜视网膜病变(BSCR)中的免疫介质及其作为生物标志物或治疗靶点的潜力 | 首次系统整合BSCR中细胞因子、趋化因子和免疫细胞群的证据,并强调Th17、CD8+和NK细胞在发病机制中的作用 | 纳入研究数量有限(14项),且多为小样本研究;缺乏足够的多组学数据整合 | 评估BSCR中免疫介质的表达及其作为生物标志物或治疗靶点的潜在价值 | BSCR患者的外周血、房水和玻璃体液样本 | 数字病理学 | 麻雀脉络膜视网膜病变 | RNA测序 | NA | 文本 | 纳入14项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2026-04-24 |
The MIF-CD74 axis drives colorectal cancer via glycolytic reprogramming and is targeted by a novel small-molecule inhibitor
2026-Apr-22, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01202-9
PMID:42018204
|
研究论文 | 揭示MIF-CD74轴通过糖酵解重编程驱动结直肠癌进展,并鉴定出一种新型小分子抑制剂 | 首次阐明MIF-CD74轴通过上调糖酵解酶促进结直肠癌瓦博格效应的新机制,并发现新型高效抑制剂F3277-0933 | 未在更大规模临床队列中验证抑制剂疗效,且体外实验向临床转化仍需进一步研究 | 研究MIF在结直肠癌代谢重编程中的作用机制及其靶向治疗潜力 | 结直肠癌组织样本、细胞系及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序、虚拟筛选、功能实验 | NA | 单细胞测序数据、临床样本数据、药物筛选数据 | TCGA/GTEx/CPTAC/HPA数据库数据及临床样本验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序分析数据集GSE166555和GSE144735 |
| 420 | 2026-04-24 |
Cell migration inducing protein alleviates adverse remodeling after ischemia and reperfusion injury by controlling fibroblast activation
2026-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag086
PMID:42019016
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研究论文 | 探究细胞迁移诱导蛋白在控制成纤维细胞活化后减轻缺血再灌注损伤后不良重塑的作用 | 首次揭示CEMIP通过调节透明质酸周转和抑制成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,在心肌梗死后愈合中发挥保护作用 | 仅使用全球Cemip敲除小鼠模型,未在特定细胞类型中验证,且机制研究主要基于体外实验 | 研究CEMIP在心肌梗死后心脏重塑中的功能及其潜在治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠心脏样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |