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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-05-19 |
In-Tumor CRISPR-Cas9 Knockout Screening and Novel Therapy Development for Malignant Transformation of Ovarian Teratoma
2026-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70315
PMID:41531187
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研究论文 | 通过体内CRISPR-Cas9敲除筛选和空间转录组学,发现SOD1是卵巢成熟畸胎瘤恶性转化的治疗靶点,并验证了LCS-1的抑瘤效果 | 首次对卵巢成熟畸胎瘤恶性转化进行全基因组CRISPR-Cas9敲除筛选,结合空间转录组学数据与药理验证,揭示SOD1作为关键脆弱靶点 | 仅基于单一细胞系NOSCC1和有限临床样本,且SOD1抑制剂的临床转化仍需进一步验证 | 识别卵巢成熟畸胎瘤恶性转化的治疗脆弱性,探索新靶向疗法 | 卵巢成熟畸胎瘤恶性转化患者肿瘤及衍生的NOSCC1细胞系 | 基因组学 | 卵巢癌 | CRISPR-Cas9敲除筛选、空间转录组学、siRNA敲低、小分子抑制 | NA | 基因组筛选数据、空间转录组数据 | 3例独立患者肿瘤样本用于空间转录组学;1个患者来源异种移植模型用于体内验证 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 382 | 2026-05-19 |
A Glucose-Responsive Intelligent Antibacterial and Oxygen-Producing Hydrogel Promotes the Healing of Diabetic Wounds by Regulating Cellular Heterogeneity
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517028
PMID:41619261
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研究论文 | 开发了一种葡萄糖响应性智能抗菌产氧水凝胶,通过调控细胞异质性促进糖尿病伤口愈合 | 首次开发结合CaO2纳米颗粒、过氧化氢酶和镓多酚纳米颗粒的葡萄糖响应性水凝胶,并利用单细胞RNA测序分析其调控的细胞异质性 | 未提及 | 开发一种新型水凝胶以实现糖尿病感染伤口的葡萄糖触发按需药物释放,并通过分析细胞异质性探讨其促愈合机制 | CF-CPGaMPN水凝胶及其对糖尿病感染伤口的治疗效果 | 生物材料 | 糖尿病伤口 | 单细胞RNA测序 | 无 | 基因表达数据 | 未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 383 | 2026-05-19 |
Single-Cell and Mendelian Randomization Analyses Identify Macrophage Polarization and Efferocytosis Biomarkers in Osteoarthritis and Reveal Their Regulatory Mechanisms
2026-Apr, Iranian journal of biotechnology
IF:1.6Q4
DOI:10.30498/ijb.2025.524798.4148
PMID:42145976
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研究论文 | 整合转录组学和单细胞RNA测序数据与孟德尔随机化分析,鉴定骨关节炎中巨噬细胞极化和胞葬作用相关生物标志物FMO4和GPR65,并揭示其调控机制 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析结合,从巨噬细胞极化和胞葬作用角度系统鉴定骨关节炎的关键生物标志物,并通过人工神经网络模型提升诊断准确性 | 主要基于公共数据库的二次分析,缺乏独立的临床样本验证和功能实验验证 | 鉴定骨关节炎中与巨噬细胞极化和胞葬作用相关的关键生物标志物及其调控机制 | 骨关节炎患者滑膜组织的转录组和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 骨关节炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | LASSO, SVM-RFE, 人工神经网络 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 三个骨关节炎相关转录组数据集 (GSE89408, GSE55457, GSE152805) 和一个GWAS数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2026-05-18 |
MCT1 governs a metabolic checkpoint at pachytene during spermatogenesis
2026-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.720010
PMID:42079271
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研究论文 | 发现单羧酸转运蛋白1(MCT1)在哺乳动物精子发生过程中控制粗线期代谢检查点,通过调节组蛋白乳酰化修饰影响减数分裂进程 | 首次揭示MCT1依赖的代谢检查点通过H4K12乳酰化表观遗传调控减数分裂,连接了代谢状态与基因表达 | NA | 阐明代谢通量如何直接控制减数分裂进程,特别是MCT1在精子发生中的作用机制 | 哺乳动物精子发生过程中的生精细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,代谢组学,计算扰动建模,多组学分析 | NA | 转录组数据,代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 385 | 2026-05-18 |
Single-cell transcriptomics of acetaminophen-induced responses in human 2D and 3D liver microtissues
2026-04, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04296-6
PMID:41535591
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析对乙酰氨基酚在人类2D和3D肝脏微组织中的细胞反应 | 首次在单细胞水平比较2D单层培养和3D肝脏球体中对乙酰氨基酚暴露的转录响应差异,揭示氧气张力与药物代谢的相互作用 | 未探究高剂量对2D培养的影响,且缺氧信号可能受球体尺寸和结构影响 | 评估肝脏毒性机制及3D模型的生理相关性 | 人类原代肝细胞、库普弗细胞和肝内皮细胞组成的2D单层和3D球体培养物 | 数字病理学 | 药物诱导肝损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两种培养格式(2D和3D),各暴露于低(350 µM)和高(2687 µM)对乙酰氨基酚浓度,2D仅接受低剂量,每个条件多个细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 386 | 2026-05-18 |
Single Cell Analysis Reveals Dynamic Changes of Distinct Cell Populations in Human Nickel Allergy
2026-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70108
PMID:41090989
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类镍过敏中不同细胞群体的动态变化 | 首次在单细胞水平揭示镍过敏反应中内皮细胞、基底上角质形成细胞、成纤维细胞和CCR7+树突状细胞的特异性激活,并发现KLF2+中枢记忆T细胞的浸润是镍过敏和布地奈德过敏的共同特征 | 未提供具体局限性信息 | 阐明人类镍过敏反应中不同细胞类型的作用及其动力学变化 | 镍过敏捐赠者的皮肤样本 | 单细胞转录组学 | 镍过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 镍过敏捐赠者经表皮暴露于稀释液和镍8或72小时的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 387 | 2026-05-17 |
Stromal NNMT overexpression as an independent prognostic biomarker in lung adenocarcinoma and breast carcinoma
2026-Apr-09, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgag020
PMID:41913584
|
研究论文 | 研究了烟酰胺N-甲基转移酶在泛癌基质中的表达谱及其预后意义,并在肺腺癌和乳腺癌中进行了验证 | 首次揭示基质NNMT过表达作为肺腺癌和乳腺癌的独立预后生物标志物,并利用单细胞RNA测序和多个数据库进行多层面验证 | 数据主要来自公共数据库,独立临床队列样本量可能有限,未深入探讨NNMT的分子机制 | 探究基质NNMT在多种癌症中的表达模式及其对肺腺癌和乳腺癌患者的预后价值 | 肺腺癌和乳腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌, 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 定量免疫组织化学 | Cox回归模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织样本图像 | 多个公共数据库和独立临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 388 | 2026-05-17 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
|
研究论文 | 利用人诱导多能干细胞快速共分化平台,生成具有生物学响应性的结肠样肠道组织补片 | 开发了一种新型早期人诱导多能干细胞共分化平台,能在8天内生成多种肠道细胞谱系(上皮、间质和内皮),该方法无血清、动物产品使用大幅减少,且能形成结肠样肠道组织补片 | 仍处于早期阶段 | 开发一种可移植的肠道黏膜组织移植物,用于促进肠道损伤愈合 | 人诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 多个hiPSC细胞系,并在独立中心重复 | NA | 单细胞RNA-seq, 大量RNA-seq | NA | NA |
| 389 | 2026-05-17 |
A zero-inflated hierarchical generalized transformation model to address non-normality in spatially-informed cell-type deconvolution
2026-Apr-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujag055
PMID:41994891
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研究论文 | 提出一种零膨胀分层广义变换模型,用于解决空间转录组学中细胞类型解卷积的非正态性问题,并在口腔鳞状细胞癌数据上验证其优越性能 | 首次将零膨胀分层广义变换模型应用于条件自回归解卷积框架,解决口腔鳞状细胞癌空间转录组数据的高度零膨胀问题,提高细胞类型解卷积的准确性并量化不确定性 | 未提及具体局限性 | 改进空间转录组学中细胞类型解卷积方法,处理数据非正态性和高度零膨胀问题 | 口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中的细胞类型解卷积 | 机器学习 | 口腔癌 | 空间转录组学 | 零膨胀分层广义变换模型、条件自回归模型 | 空间转录组数据 | 口腔鳞状细胞癌样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 390 | 2026-05-17 |
Benchmarking tools for deciphering cellular crosstalk in spatially-resolved transcriptomics
2026-Apr-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04063-5
PMID:41952215
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研究论文 | 该论文对九种计算细胞间相互作用推断方法在空间转录组学数据上进行了系统评估 | 首次针对空间转录组学应用场景对细胞间相互作用推断工具进行全面基准测试,涵盖多个平台和真实数据集 | 工具性能在不同空间分辨率、组织背景和平台间存在显著差异;应用于真实空间转录组学数据时面临关键挑战 | 评估空间转录组学中用于解析细胞间通讯的计算工具的性能和适用性 | 九种计算细胞间相互作用推断方法 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 九组来自三项独立研究的真实空间转录组学数据集 | 10x Genomics, BGI | 空间转录组学 | 10x Visium, MGI Stereo-seq, 10x Xenium | Visium平台、Stereo-seq平台、Xenium平台 |
| 391 | 2026-04-04 |
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04937-x
PMID:41931230
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 392 | 2026-05-17 |
A Tissue Virus Microenvironment with Activated Stress Responses Underlies Durable SIV Persistence
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716177
PMID:41959291
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研究论文 | 通过对比早期与晚期抗逆转录病毒治疗后的SIV感染恒河猴,结合免疫PET/CT引导采样和空间转录组学,定义了组织病毒微环境(VME)在病毒持久性和反弹中的作用 | 首次利用免疫PET/CT引导的空间转录组学揭示病毒微环境(VME)的结构和功能特征,并发现其与肿瘤微环境的相似性,为HIV治愈策略提供新视角 | 未提及具体局限性 | 探究SIV在抗逆转录病毒治疗下的病毒持久性机制及其对病毒反弹的影响 | 早期与晚期启动抗逆转录病毒治疗的SIV感染恒河猴组织样本 | 数字病理学 | 艾滋病 | 空间转录组学、免疫PET/CT | NA | 影像数据, 空间转录组数据 | SIV感染的恒河猴(早期治疗组与晚期治疗组) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 393 | 2026-05-17 |
Depletion of Fibrinogen Suppresses Growth of Primary Tumors and Metastasis of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026-Apr, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.09.024
PMID:41432649
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研究论文 | 消耗纤维蛋白原抑制胰腺导管腺癌原发性肿瘤生长和转移 | 首次使用临床上正在测试的反义寡核苷酸或含小干扰RNA的脂质纳米颗粒来消耗纤维蛋白原,并揭示了纤维蛋白原在胰腺癌早期(而非晚期)转移步骤中的差异作用以及通过空间转录组学鉴定了基质成分的变化 | 纤维蛋白原敲低在脾内注射模型中不影响肝定植,提示该研究主要针对早期转移而非晚期转移步骤,且机制研究依赖于体内模型和蛋白组学、空间转录组学方法 | 探究消耗纤维蛋白原对胰腺导管腺癌肿瘤生长和转移的影响及其潜在机制 | 胰腺导管腺癌患者异种移植模型小鼠 | 机器学习 | 胰腺癌 | 反义寡核苷酸、脂质纳米颗粒、蛋白组学、空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 3个患者来源的异种移植模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 394 | 2026-05-16 |
uPAR-Targeting Cytotoxic Antibody-Drug Conjugates Selectively Deplete Proinflammatory Myeloid Cells for Autoimmune Indications
2026-Apr-29, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090803
PMID:42121904
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别类风湿关节炎滑膜中高表达uPAR的促炎性髓系细胞亚群,并开发靶向uPAR的抗体药物偶联物以清除这些细胞,为自身免疫疾病提供新疗法 | 首次利用单细胞RNA测序发现类风湿关节炎滑膜中uPAR高表达的促炎性髓系细胞亚群,并开发靶向uPAR的抗体药物偶联物选择性清除这些细胞 | 小鼠髓系细胞uPAR表达较低且对BCL-2家族抑制剂敏感性较弱,限制了体内概念验证实验的可靠性 | 开发靶向uPAR的抗体药物偶联物以选择性清除促炎性髓系细胞,用于自身免疫性疾病治疗 | 类风湿关节炎患者滑膜组织中的髓系细胞(单核细胞和巨噬细胞) | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 类风湿关节炎患者滑膜组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2026-05-16 |
Glioblastoma Stem Cells as Targets for Emerging Precision Immunotherapies and Molecular Treatments
2026-Apr-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090783
PMID:42121884
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综述 | 探讨胶质母细胞瘤干细胞作为新兴精准免疫疗法和分子治疗靶点的研究进展 | 整合类器官培养、单细胞与空间转录组学、多组学和高分辨率成像等技术,并结合数据科学,构建神经干细胞及恶性干细胞样状态分子图谱,揭示发育程序、细胞可塑性和微环境信号在胶质瘤发生中的作用 | 综述性质,未提及具体实验验证或临床应用数据,可能缺乏对不同技术整合的量化评估 | 阐述胶质母细胞瘤干细胞在精准免疫治疗和分子治疗中的靶向潜力,提供改进肿瘤建模、早期检测和个性化治疗的概念与技术框架 | 胶质母细胞瘤干细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 396 | 2026-05-16 |
Unique nasal cell states induced by common pediatric respiratory viruses
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.20.719671
PMID:42079074
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研究论文 | 通过单细胞 RNA 测序构建了 132 名五岁以下儿童的鼻粘膜细胞图谱,揭示了 SARS-CoV-2、鼻病毒和呼吸道合胞病毒(RSV)感染诱导的独特鼻细胞状态和粘膜免疫程序 | 首次在单细胞分辨率下系统比较三种常见儿童呼吸道病毒对鼻粘膜的重塑作用,发现了 RSV 感染中一种先前未描述的鳞状样上皮亚型,并整合哮喘全基因组关联数据识别出与儿童哮喘风险相关的 hillock 样鳞状上皮亚群 | 未提及 | 解析儿童常见呼吸道病毒如何以细胞分辨率重塑鼻粘膜,并探究这些变化与疾病严重程度及哮喘风险的关联 | 五岁以下儿童鼻粘膜上皮细胞和免疫细胞,涵盖 SARS-CoV-2、鼻病毒、RSV 感染及未感染对照组 | 数字病理学 | 呼吸道病毒感染、儿童哮喘 | 单细胞 RNA 测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 132 名儿童,335174 个鼻粘膜上皮和免疫细胞 | 10x Genomics | 单细胞 RNA 测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞 3' 测序 |
| 397 | 2026-05-16 |
Spatial Biology Evolution: Past, Present and Future of Mapping Life in Context
2026-Apr-22, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15090743
PMID:42121845
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综述 | 本文回顾了空间生物学从19世纪组织化学起源到现代空间多组学技术的发展历程,并探讨了其在理解组织微环境、细胞通讯及疾病机制中的关键作用 | 系统整合了空间生物学从经典免疫组化到高通量空间多组学的技术演变,提出‘空间法医学’概念,并强调多重免疫荧光、空间转录组学和蛋白质组学之间的功能共生关系 | 未具体讨论不同空间生物学技术在实际应用中的比较优势或数据整合的具体计算挑战 | 探讨空间生物学技术的演进及其在揭示组织微环境结构和功能中的必要性,以推动疾病机制理解和药物开发 | 空间生物学技术、组织微环境、细胞通讯机制 | 计算病理学 | 癌症、常见病、罕见病 | 空间多组学、多重免疫荧光、空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 基因组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 398 | 2026-05-16 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis on Multi-Subtypes of Idiopathic Inflammatory Myopathy Reveals Pathologic Hallmarks Associated With Stromal Stem and Immune Cells in Damaged Skeletal Muscles
2026-Apr-20, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70185
PMID:42007840
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研究论文 | 利用单细胞转录组学分析揭示特发性炎症性肌病亚型中受损骨骼肌的病理特征与基质干细胞和免疫细胞的关系 | 首次在多个特发性炎症性肌病亚型中进行单细胞转录组分析,识别出MEF2C表达减少与肌纤维生成延迟相关,以及CXCL10+成纤维细胞通过CCL19-CCR7/CCRL2轴招募M1样巨噬细胞等新机制 | 每个亚型样本量较小(n=3-5),结果需在更大队列中验证 | 研究特发性炎症性肌病不同亚型的致病特征 | 健康对照者和四种特发性炎症性肌病亚型患者的受累骨骼肌和外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 特发性炎症性肌病 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据, 图像 | 健康对照5例,每种特发性炎症性肌病亚型3-5例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2026-05-16 |
Single-cell transcriptomics and RNAi screening define a hierarchical program of planarian eye regeneration
2026-Apr-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117245
PMID:41964952
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和RNAi筛选定义了涡虫眼再生的层级程序 | 首次结合单细胞转录组学和大规模RNAi筛选,系统揭示了涡虫眼再生的完整层级序列及每个步骤的调控基因 | 信息不足,无法确定 | 阐明涡虫眼再生的分子机制和层级调控程序 | 涡虫眼再生过程中的细胞类型和基因 | 计算机视觉 | 年龄相关退行性眼病 | 单细胞RNA测序,RNA干扰筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | 信息不足,无法确定 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2026-04-04 |
Alignment of spatial transcriptomics slices across diseases, platforms and conditions
2026-Apr-02, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-026-01634-w
PMID:41928322
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |