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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-09-23 |
Dynamic regulation of long non-coding RNAs across asexual and gametocyte development in Plasmodium falciparum
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718799
PMID:42039573
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研究论文 | 该研究整合了长读长牛津纳米孔直接RNA测序、核糖体图谱和单细胞转录组学,对恶性疟原虫在无性和配子体发育阶段的lncRNA进行了全面注释和动态调控分析 | 首次整合长读长ONT直接RNA测序、核糖体图谱和单细胞转录组学,克服了短读长测序、逆转录假象和第二链降解不完全等问题,实现了恶性疟原虫lncRNA的稳健阶段特异性表征 | 未明确提及 | 在全基因组范围内鉴定和表征恶性疟原虫在无性和有性血液阶段表达的lncRNA,并揭示其在配子体生成和传播中的可能作用 | 恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)的无性血液阶段和配子体阶段 | 基因组学,转录组学 | 疟疾 | ONT直接RNA测序,核糖体图谱,单细胞RNA测序 | NA | RNA序列,图像 | NA | Oxford Nanopore Technology, Illumina | 长读长直接RNA测序,核糖体图谱,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-09-23 |
Mapping breast cancer lineage in radiation and immunotherapy using the REMAP mouse
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718689
PMID:42039427
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研究论文 | 本文介绍了一种名为REMAP的谱系追踪小鼠模型,该模型将可诱导CRISPR记录技术与MMTV-PyMT激素受体阳性乳腺癌模型相结合,用于研究肿瘤演化及放疗联合抗PD1免疫治疗的响应 | 开发了REMAP小鼠模型,整合可诱导CRISPR记录与MMTV-PyMT乳腺癌模型,通过MARC1归巢引导RNA的可遗传谱系标记实现克隆关系重建,首次在体内将克隆历史与细胞状态高分辨率耦合 | 仅基于小鼠模型,结果向人类乳腺癌的转化适用性有待验证;REMAP模型局限于MMTV-PyMT激素受体阳性乳腺癌,可能不适用于其他乳腺癌亚型 | 研究乳腺癌肿瘤演化、转移及放疗联合抗PD1免疫治疗响应的克隆谱系机制 | MMTV-PyMT激素受体阳性乳腺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR谱系追踪、可诱导CRISPR记录 | MMTV-PyMT小鼠模型、可诱导Cas9 | 图像、文本、单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞基因表达 |
| 23 | 2026-09-23 |
SEC-seq reveals translation-focused metabolic strategies for high IgG productivity in clonal CHO cells
2026-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718270
PMID:42039631
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研究论文 | 该研究应用分泌编码单细胞测序(SEC-seq)技术,同时测量CHO细胞单细胞的转录组和分泌型IgG,揭示了高产IgG克隆细胞中以翻译为核心的代谢策略 | 首次将SEC-seq应用于CHO细胞,实现单细胞水平同时测量转录组和分泌型IgG,揭示了IgG mRNA与蛋白分泌仅呈中等相关,并发现了三种高产克隆通过不同的代谢和能量/氧化还原程序汇聚于翻译聚焦状态 | 研究仅涉及一个亲本生产细胞系和五个CHO克隆,样本量有限;未验证所发现的代谢靶点是否可直接用于工程化改造以提高产量 | 在单细胞分辨率下解析CHO细胞克隆内和克隆间制造表型的异质性及其代谢和分泌回路,识别高产IgG的亚群和回路特征以指导工程改造或筛选 | CHO细胞(一个亲本生产细胞系和五个克隆,每个克隆的细胞特异性生产力不同) | 单细胞测序、生物制造、代谢工程 | NA | 分泌编码单细胞测序(SEC-seq) | NA | 单细胞转录组数据、分泌型IgG蛋白数据 | 一个亲本生产细胞系和五个CHO克隆的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞分泌蛋白检测 | NA | SEC-seq(分泌编码单细胞测序),同时测量单细胞转录组和分泌型IgG |
| 24 | 2026-09-23 |
Lineage-specific CK2α deletion reshapes the transcriptome of hematopoietic stem cells toward an immune-primed state
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717787
PMID:42039464
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析条件性敲除CK2α的小鼠造血干细胞,发现CK2α缺失导致造血干细胞转录组向免疫激活状态重塑 | 首次在稳态造血条件下揭示CK2α对造血干细胞转录组的调控作用,发现CK2α缺失导致造血干细胞发生免疫相关转录重编程,并鉴定出驱动该过程的转录因子网络和细胞间通讯变化 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;未探讨CK2α缺失对造血干细胞功能的长期影响;未进行功能验证实验 | 探究CK2α在稳态造血过程中对造血干细胞的调控作用及其分子机制 | 转基因小鼠的骨髓和脾脏组织样本中的造血干细胞 | 单细胞组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型对照和CK2α条件性敲除小鼠的骨髓和脾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-09-23 |
Benchmarking scRNA-seq Copy Number Inference: A Comprehensive Evaluation and Practitioner's Guide
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.718050
PMID:42039587
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研究论文 | 对12种从scRNA-seq数据推断拷贝数变异(CNV)的方法在28个真实数据集和多种合成数据集上进行了全面基准测试,并提供了实践指南 | 首次在28个真实数据集(超过10万个细胞)和多种合成数据集上对12种CNV推断方法进行全面基准测试,并建立了一个实用的决策框架 | 未提及具体局限性 | 评估和比较从scRNA-seq数据推断拷贝数变异(CNV)的方法,为研究人员提供实践指南 | 12种CNV推断方法(包括Numbat、Clonalscope、CopyKAT、inferCNV、SCEVAN等)、28个真实数据集(超过10万个细胞)和多种合成数据集 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 文本、图像 | 28个真实数据集(超过100,000个细胞)和多种合成数据集 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 26 | 2026-09-23 |
Serial Spatial Transcriptomics Reveal Divergent Routes to Therapy Resistance in Metastatic Breast Cancer
2026-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9365657/v1
PMID:42040933
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研究论文 | 该研究通过纵向空间转录组学分析四名转移性乳腺癌患者长达3.5年治疗过程中的十次活检样本,揭示了肿瘤治疗耐药的不同空间适应策略 | 首次以患者为中心,结合概率主题建模与空间深度学习,对转移性乳腺癌进行长达3.5年的纵向空间转录组学追踪,揭示了耐药机制在空间层面的异质性及三种普适性耐药原则 | 样本量较小,仅涉及四名转移性乳腺癌患者,研究结果的普适性有待更大规模队列验证 | 解析转移性乳腺癌在个性化治疗过程中治疗耐药的空间架构和细胞上下文,揭示耐药机制的空间异质性 | 四名转移性乳腺癌患者的十次活检样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 概率主题建模,空间深度学习 | 空间转录组数据,图像 | 345207个细胞,来自4名转移性乳腺癌患者的10次活检 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 27 | 2026-09-23 |
sigNATURE maps cohort-specific T-cell states to reproducible programs of ICI response
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718532
PMID:42039669
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研究论文 | 该文章提出了sigNATURE框架,通过将查询细胞映射到大型CD4和CD8 T细胞图谱上,评估已发表的ICI响应标志物,并量化图谱支持度,从而提高单细胞ICI生物标志物的可重复性和跨队列可比性 | 提出了一种参考引导的框架sigNATURE,将查询细胞映射到大型CD4和CD8 T细胞图谱上,在坐标对齐系统中评估已发表的ICI响应标志物,并通过细胞级可识别性评分量化映射细胞的图谱支持度,解决了T细胞状态通常在各队列中从头定义导致标志物基因对队列组成和分析选择敏感的问题 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 提高单细胞ICI生物标志物的可重复性、跨队列可比性和机制可解释性 | 两个独立的ICI scRNA-seq队列,包括36名非小细胞肺癌患者和15名皮肤癌患者(11名基底细胞癌和4名鳞状细胞癌) | 数字病理学 | 肺癌,皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本,图像 | 51名患者(36名非小细胞肺癌患者和15名皮肤癌患者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-09-23 |
Regional and Systemic Metabolic Remodeling Promotes Longevity by Bioengineered Yeast-Derived Lipids
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717033
PMID:42039507
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研究论文 | 本文发现从基因工程长寿命酵母菌株中提取的膳食脂质能显著延长果蝇寿命,并通过D2O探针的受激拉曼散射显微镜成像代谢动态和单核RNA测序(snRNA-seq)揭示其机制 | 首次发现基因工程酵母来源的膳食脂质能通过区域和系统性代谢重塑延长果蝇寿命,揭示了跨物种的代谢长寿调控机制,并开发了FLY-MAP分析流程 | 研究主要基于果蝇模型,尚未在哺乳动物或人类中验证;酵母脂质的具体活性成分和最佳剂量仍需进一步研究 | 探究酵母来源膳食脂质对寿命的影响及其代谢调控机制 | 果蝇(Drosophila) | 代谢组学,衰老研究 | 衰老相关疾病 | 受激拉曼散射显微镜,单核RNA测序(snRNA-seq),拉曼光谱,脂质组学 | NA | 图像,文本(测序数据) | NA | NA | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | NA |
| 29 | 2026-09-23 |
Spatial Transcriptomics and Dual Dye Mapping Identify Wnt-Driven BBB Protection in Endothelial EphA4-Deficiency
2026-Apr-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9261231/v1
PMID:41994141
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研究论文 | 该研究结合双染料标记系统和空间转录组学,揭示了内皮细胞EphA4缺失通过Wnt信号通路保护创伤性脑损伤后血脑屏障的机制 | 开发了双染料标记系统(EBD、NaFl和IgG)来评估CCI损伤后BBB通透性的时空动态变化,并首次将空间转录组学与染料定量相结合,发现EphA4内皮细胞缺失通过上调Wnt信号通路基因(包括FZD4)发挥BBB保护作用,并验证了FZD4激动剂FZM1.8的药理激活可减少病灶体积和BBB破坏 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究创伤性脑损伤后血脑屏障破坏的分子和空间特征,以及EphA4/Wnt信号通路在BBB保护中的作用 | 内皮细胞特异性EphA4敲除小鼠和野生型小鼠的CCI损伤模型 | 空间转录组学 | 创伤性脑损伤 | 空间转录组学,双染料标记(EBD、NaFl、IgG免疫染色) | NA | 图像,文本(基因表达数据) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 30 | 2026-09-23 |
Emergent latent neurotoxic effects of manganese following nominal chronic exposures in human stem cell and Caenorhabditis elegans models
2026-Apr-07, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag040
PMID:42033779
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研究论文 | 该研究利用人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的皮层培养物和秀丽隐杆线虫两种模型,发现慢性锰暴露停止后会出现显著的潜在神经毒性效应,通过单细胞RNA测序揭示了暴露停止后才显现的转录组变化,并在线虫中验证了行为表型的放大效应 | 首次在两种遗传和机制可操作系统中证明了慢性锰暴露停止后出现潜在的神经毒性效应,且该效应的幅度远超慢性暴露本身;利用单细胞RNA测序比较了暴露期间与暴露停止后的转录组变化,发现了仅在暴露停止后才显现的转录组改变 | 研究主要基于hiPSC来源的皮层培养物和秀丽隐杆线虫模型,尚未在人类或其他哺乳动物体内直接验证;单细胞RNA测序的样本量和时间点覆盖范围可能有限;潜在效应的长期持续性和可逆性未充分探讨 | 探究慢性锰暴露停止后是否会出现潜在的神经毒性效应,并阐明其背后的细胞通路和分子机制 | 人诱导多能干细胞(hiPSC)来源的皮层培养物和秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans) | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | hiPSC来源的皮层培养物经历40天慢性锰暴露,秀丽隐杆线虫用于行为学终点评估 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-09-23 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-Apr, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71394
PMID:42029189
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研究论文 | 该研究使用小鼠适应性SARS-CoV-2(MA10)感染老年5xFAD和野生型小鼠,发现感染未改变阿尔茨海默病神经病理学,但引起多种细胞类型的广泛基因表达变化 | 首次在老年5xFAD阿尔茨海默病小鼠模型中系统评估小鼠适应性SARS-CoV-2感染对AD神经病理学的影响,并利用空间转录组学揭示脑内多种细胞类型的基因表达变化 | 小鼠适应性病毒可能无法完全模拟人类SARS-CoV-2感染;脑内未检测到病毒RNA,可能未完全反映人类感染情况;仅使用一种AD小鼠模型 | 探究SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病神经病理学和脑内基因表达的影响 | 老年5xFAD转基因阿尔茨海默病小鼠和野生型小鼠 | 空间转录组学, 神经科学 | 阿尔茨海默病, COVID-19 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 图像 | 老年5xFAD和野生型小鼠(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 32 | 2026-09-21 |
Cell fusion reprograms tumor cells and promotes RUNX1-mediated invasion and dissemination in colorectal cancer
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.12.717781
PMID:42039517
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研究论文 | 本研究探讨了结直肠癌中肿瘤-巨噬细胞杂交细胞的形成机制及其促进转移的作用,发现RUNX1是杂交细胞侵袭和播散的关键调控因子 | 首次揭示了细胞融合通过重编程肿瘤细胞促进RUNX1介导的侵袭和播散,并发现循环杂交细胞可作为结直肠癌转移的非侵入性生物标志物 | 摘要未明确提及研究的具体局限性 | 探究肿瘤-巨噬细胞杂交细胞的异质性及其在结直肠癌转移中的分子机制 | 结直肠癌肿瘤-巨噬细胞杂交细胞、循环杂交细胞及结直肠癌患者样本 | 数字病理学, 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 循环免疫荧光 | NA | 图像, 文本 | 结直肠癌患者原发肿瘤和外周血样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 33 | 2026-09-21 |
Serum albumin-fused interleukin-10 prevents neuroinflammation by promoting immunoregulation in the secondary lymphoid organs and limiting immune cell infiltration in the spinal cord
2026-Apr-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717764
PMID:42039602
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研究论文 | 该研究通过整合人类转录组分析与小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型,探究血清白蛋白融合IL-10(SA-IL-10)通过在次级淋巴器官中促进免疫调节并限制脊髓中免疫细胞浸润来预防神经炎症的机制。 | 工程化设计了血清白蛋白与IL-10的融合蛋白(SA-IL-10),具有延长的半衰期和增强的次级淋巴器官暴露;整合了人类单细胞RNA测序分析与小鼠EAE模型;揭示了SA-IL-10通过促进次级淋巴器官中的免疫调节来抑制神经炎症的新机制。 | 摘要中未明确提及研究局限性。 | 研究持续的IL-10暴露在次级淋巴器官中如何在炎症条件下调节免疫反应,以及SA-IL-10预防神经炎症的疗效和机制。 | 人类多发性硬化症(MS)患者的转录组数据以及小鼠实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型。 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-09-21 |
Vascular STING activation facilitates NK cell anti-tumor immunity in small cell lung cancer
2026-Apr-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.02.008
PMID:41791380
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研究论文 | 该研究通过开发动态单细胞RNA测序技术(DynaMITE-seq)并结合空间转录组学,揭示小细胞肺癌中血管STING信号激活可促进NK细胞抗肿瘤免疫。 | 开发了DynaMITE-seq技术,用于动态单细胞RNA测序微生理免疫肿瘤环境;首次揭示微血管是限制NK细胞外渗/募集的主要检查点;发现激活血管STING信号可恢复NK细胞浸润并增强对神经内分泌小细胞肺癌的杀伤。 | 摘要中未提及该研究的局限性。 | 研究小细胞肺癌中NK细胞抗肿瘤免疫的调控机制,并探索克服免疫排斥屏障的治疗策略。 | 小细胞肺癌患者样本及神经内分泌小细胞肺癌细胞。 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 35 | 2026-09-21 |
FABP4 Couples Lipid Metabolism to PD-L1 Stabilization in Immunosuppressive Macrophages
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.09.717546
PMID:42039386
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研究论文 | 该研究揭示了FABP4-PD-L1轴在高脂饮食条件下通过棕榈酸诱导FABP4表达并促进PD-L1棕榈酰化,从而稳定PD-L1于细胞表面,驱动免疫抑制和肿瘤进展。 | 首次发现FABP4通过棕榈酸介导的PD-L1棕榈酰化稳定PD-L1蛋白,独立于转录调控,并鉴定出一个在肥胖和乳腺癌中保守的CD14+CD16+单核细胞亚群。 | 摘要未明确说明研究局限性,可能包括样本量有限、机制在人体中的验证不足以及缺乏FABP4靶向治疗的临床数据。 | 探究脂质信号如何驱动免疫抑制,特别是FABP4在PD-L1稳定和免疫逃逸中的作用。 | 单核细胞、巨噬细胞、高脂饮食小鼠模型、人类肥胖和侵袭性乳腺癌患者样本。 | 单细胞转录组学、免疫学、肿瘤生物学 | 乳腺癌、肥胖 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据、图像 | 未明确说明具体样本量,涉及高脂饮食小鼠和人类样本。 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 36 | 2026-09-21 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
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研究论文 | 该研究通过分析浸润性小叶癌中MDC1的相互作用组,揭示了其同源重组修复功能障碍的机制,并证明PARP抑制剂talazoparib可有效抑制肿瘤生长 | 首次发现MDC1在浸润性小叶癌中特异性调控ER活性并以DNA修复功能障碍为代价,揭示了浸润性小叶癌中一种不同于经典BRCAness的同源重组功能障碍状态,并证明其对PARP抑制剂敏感 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究MDC1如何调控浸润性小叶癌中的ER活性和DNA修复功能,并评估PARP抑制剂对其的治疗潜力 | 浸润性小叶癌(ILC)细胞及肿瘤组织、ILC异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序、DNA修复活性分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 37 | 2026-09-21 |
Cell-type-specific transposon demethylation and TAD remodeling in aging mouse brain
2026-Apr-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.015
PMID:41819104
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研究论文 | 该研究构建了衰老小鼠大脑的多区域单细胞甲基化组和染色质构象图谱,揭示了细胞类型特异性的转座子去甲基化和TAD重塑 | 首次在多个脑区生成大规模单细胞甲基化组和联合染色质构象-甲基化组图谱,发现转座子甲基化可单独区分年龄组,并开发深度学习模型预测衰老相关基因表达变化 | 研究基于小鼠模型,结果向人类大脑衰老的转化需进一步验证;样本年龄范围有限,仅比较2个月与年老阶段 | 探究大脑衰老的表观遗传机制,特别是转座子甲基化和染色质构象变化 | 衰老小鼠大脑多个脑区 | 表观遗传学, 单细胞组学, 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞甲基化测序, 单细胞染色质构象捕获, 单细胞转录组测序, 单细胞染色质可及性测序, 空间转录组学 | 深度学习模型 | 单细胞甲基化数据, 染色质构象数据, 转录组数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | 132,551个单细胞甲基化组, 72,666个联合染色质构象-甲基化组细胞核, 895,296个细胞的空问转录组数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 单细胞多组学, 空间转录组学, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 38 | 2026-09-21 |
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3776
PMID:41860764
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研究论文 | 本研究通过多队列纵向研究,结合RNA测序和单细胞转录组学,分析了宫颈癌在放化疗期间肿瘤细胞和免疫微环境的重编程变化,并发现MDM2是放化疗耐药的关键靶点 | 首次通过多队列纵向研究整合bulk RNA测序和单细胞转录组学,系统揭示放化疗对宫颈癌肿瘤细胞和免疫微环境的动态重编程;发现MDM2是放疗反应的关键中介因子,并验证了MDM2抑制联合放化疗可增强HPV阳性、TP53野生型宫颈癌的放疗效果并重塑免疫景观 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 定义放化疗期间宫颈肿瘤及肿瘤微环境的细胞和分子程序,揭示细胞相互作用的变化机制,并寻找克服放化疗耐药的治疗靶点 | 人宫颈肿瘤及肿瘤微环境(HPV阳性宫颈癌) | 数字病理学、机器学习 | 宫颈癌 | RNA测序、单细胞转录组学 | NA | 文本(基因表达数据)、图像 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 39 | 2026-09-21 |
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03331-3
PMID:41188622
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术揭示了压后皮层在空间记忆巩固过程中的单细胞分辨率转录组特征 | 首次使用Xenium空间转录组学解析压后皮层在记忆巩固早期的细胞类型和兴奋性神经元层特异性基因表达变化,并结合深度学习工具揭示细胞类型特异性分子激活模式 | 研究主要基于小鼠模型,人类压后皮层的记忆巩固机制仍需进一步验证 | 揭示压后皮层在空间记忆巩固过程中的转录组学特征和神经元亚型变化 | 小鼠压后皮层,包括阿尔茨海默病及相关痴呆模型小鼠 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病及相关痴呆 | 空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | Xenium空间转录组学平台 |
| 40 | 2026-09-21 |
Multiomic, Histologic, and scRNA-seq Profiling of Pleural Mesothelioma Reveals Negative Prognosis Associated With a Novel Uncommitted Molecular Phenotype
2026-04, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.11.019
PMID:41319863
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研究论文 | 该研究通过多组学、组织学和单细胞RNA测序分析胸膜间皮瘤,发现了一种与不良预后相关的新型未分化分子表型 | 识别了一种在双相型胸膜间皮瘤中富集的新型未分化恶性细胞状态,发现TGF-β和GAS6-AXL信号通路为候选驱动因素,并验证了MEST和MSLN两个预后生物标志物 | 需要进一步的实验探索和临床验证来确认这些发现,以揭示新的治疗策略并完善临床决策 | 识别胸膜间皮瘤恶性细胞状态的候选驱动因素和预后生物标志物,以改善患者分层 | 胸膜间皮瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量外显子测序, RNA测序, 光学基因组映射, 空间转录组学, 组织学分析 | NA | 图像, 文本 | 93个样本来自40名患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |