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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-07-15
MYC-induced USP10 stabilizes SOX4 to promote thymocyte proliferation and leukemia onset in mice
2026-Apr-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了MYC诱导的USP10通过稳定SOX4促进胸腺细胞增殖及小鼠白血病发生的分子机制 首次整合去泛素化酶文库筛选与单细胞RNA测序,发现USP10是连接胸腺细胞发育信号、增殖信号与白血病转化的关键协调因子,并验证其作为T细胞急性淋巴细胞白血病(T-ALL)治疗靶点的潜力 研究主要在动物模型中进行,USP10在人类T-ALL患者中的作用机制及其临床应用价值仍需进一步验证 阐明胸腺细胞发育异常与白血病发生的分子机制,特别是去泛素化酶USP10在此过程中的功能 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本 机器学习 白血病(T细胞急性淋巴细胞白血病,T-ALL) 去泛素化酶文库筛选、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 小鼠胸腺细胞、人胸腺细胞及T-ALL患者外周血样本(具体数量未明确) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 公开可用的单细胞RNA测序数据
22 2026-07-15
Single-cell transcriptome profiling reveals herpesviral manipulation of host processes in spleen of gibel carp infected with a Cyvirus cyprinidallo2
2026-Apr, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示疱疹病毒对银鲫脾脏宿主过程的操控 首次通过单细胞RNA测序解析了鲤疱疹病毒2型在体内的允许细胞类型及其对宿主细胞过程的精细操控机制,发现了病毒诱导的广泛宿主过程抑制和M2型巨噬细胞极化 研究仅聚焦于脾脏组织,未涵盖其他可能受影响的组织或器官,且缺乏对病毒潜伏期和再激活机制的探讨 揭示鲤疱疹病毒2型(CaHV)在银鲫体内的感染机制及与宿主的相互作用 感染鲤疱疹病毒2型(CaHV)的银鲫脾脏细胞 单细胞转录组学 疱疹病毒性造血坏死病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞基因表达数据 感染CaHV的银鲫脾脏样本(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA
23 2026-07-15
"Eye-Conic" Spatial Transcriptomics Reveals the Layer-Specific Molecular Alterations in Corneas of Patients With Keratoconus
2026-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 使用空间转录组学揭示圆锥角膜患者角膜的层特异性分子改变 首次应用空间转录组学方法研究圆锥角膜角膜的层特异性分子改变,揭示细胞周期失调、细胞外基质通路上调及内皮层翻译和核糖体通路激活等新发现 信息未提供 识别圆锥角膜锥形成过程中角膜层特异性细胞和分子改变 圆锥角膜和正常对照角膜 数字病理学 圆锥角膜 空间转录组学 NA 空间转录组数据 圆锥角膜和对照角膜样本 NA 空间转录组学 NA NA
24 2026-07-15
Using cell-specific late-phase asthma mRNA biomarkers to repurpose drugs that concurrently reverse disease signatures across multiple immune cell-types
2026-Apr, PLoS computational biology IF:3.8Q1
research paper 本研究利用哮喘晚期反应特异性mRNA生物标志物,通过药物特征匹配重新定位药物,以逆转多个免疫细胞类型中的疾病特征 结合血液生物标志物与单细胞RNA测序数据,识别细胞特异性转录变化,并通过公共单细胞扰动数据集进行药物特征匹配,发现能逆转这些变化的化合物 研究样本量较小,且仅基于轻度过敏性哮喘患者,结果需在更大样本和更严重患者中验证 探索哮喘晚期反应mRNA生物标志物在预测哮喘恶化和严重程度中的作用,并识别潜在的治疗药物 轻度过敏性哮喘患者 machine learning asthma RNA-seq, single-cell RNA sequencing NA gene expression data, single-cell RNA sequencing data 轻度过敏性哮喘患者,具体数量未在摘要中提及 NA NA NA NA
25 2026-07-15
Multi omics analysis reveals senescence associated genes in metabolic dysfunction associated steatohepatitis related liver cancer and their functional validation
2026-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
research paper 通过多组学分析揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的衰老相关基因并进行功能验证 首次系统性地筛选并验证了SOD2、ALDH2、MME和IGFBP1四个衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的关键作用,并发现EPZ5676药物对这些基因具有良好亲和力,为MRLC的靶向治疗提供新思路 未提及明显的局限性,但可能包括样本量有限或动物模型与人类疾病的差异 探究衰老相关基因在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌中的作用及其潜在治疗靶点 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎相关肝癌患者和C57BL/6小鼠模型 机器学习 肝癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 多机器学习方法(包括加权基因共表达网络分析、Mendelian randomization等) 基因表达数据, 单细胞转录组数据 全球疾病负担数据库分析,C57BL/6小鼠模型用于实验验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
26 2026-07-12
Chemoradiation Reprograms Tumor Cells and the Immune Microenvironment in Cervical Cancer
2026-Apr-02, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 对宫颈癌患者在放化疗过程中的肿瘤细胞和肿瘤微环境进行了多队列纵向研究,整合RNA测序和单细胞转录组学,揭示了治疗诱导的细胞和分子变化 首次通过多队列纵向研究结合RNA测序和单细胞转录组学,系统描绘了放化疗如何重塑宫颈癌肿瘤细胞和免疫微环境,并鉴定出MDM2作为关键治疗靶点 研究中提到MDM2抑制的效果仅在HPV阳性、TP53野生型的宫颈癌细胞和临床前模型中验证,可能需要更多临床数据支持 探究放化疗对宫颈癌肿瘤细胞和免疫微环境的重新编程机制,寻找治疗抵抗的靶点 接受放化疗的宫颈癌患者肿瘤样本及其微环境 机器学习 宫颈癌 RNA-seq, 单细胞转录组测序 NA RNA测序数据, 单细胞转录组数据 多队列纵向研究,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
27 2026-07-12
Spatiotemporal profiling of Fat family genes highlights Fat2 as a novel marker of outer enamel epithelium and stratum intermedium
2026-Apr, Journal of oral biosciences IF:2.6Q1
研究论文 本研究揭示了Fat基因家族在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式,并发现Fat2可作为外釉上皮和中间层的新的标志物 首次系统描绘Fat1-Fat4在小鼠牙齿发育中的时空表达谱,并鉴定Fat2为外釉上皮和中间层的特异性标志物,通过功能实验证实其在牙上皮干细胞分化和细胞身份维持中的作用 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚需在人类牙齿发育中验证;Fat2调控下游基因的具体分子机制未完全阐明 探究Fat基因家族(Fat1-Fat4)在小鼠牙齿发育过程中的时空表达模式及其功能 C57BL/6J小鼠胚胎及新生小鼠的牙齿组织;M3H1牙上皮干细胞系 数字病理学 牙齿发育异常 定量聚合酶链反应, 原位杂交, 小干扰RNA敲低, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 组织图像 从胚胎第12.5天到出生的小鼠牙齿样本;M3H1细胞系样本 NA 单细胞RNA-seq NA 使用了公共单细胞RNA-seq数据集
28 2026-07-10
A Muribaculaceae-enriched microbiota exacerbates TLR4-dependent Acinetobacter baumannii-induced hyperinflammatory sepsis
2026-Apr-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了富含Muribaculaceae的肠道菌群通过TLR4依赖性过度炎症加剧鲍曼不动杆菌诱导的高炎症性败血症 首次发现特定肠道菌群配置(富含Muribaculaceae)通过TLR4依赖性方式调节宿主对鲍曼不动杆菌感染的炎症反应阈值,而非病原体清除能力,决定败血症结局 仅使用雌性C57BL/6小鼠模型,未在其他物种或性别中验证;未明确热稳定低分子量代谢物的具体化学身份 探究肠道菌群配置如何影响宿主对鲍曼不动杆菌诱导败血症的易感性及其分子机制 雌性C57BL/6小鼠及其肠道菌群,特别是Sangeribacter muris KT1-3菌株 机器学习 败血症 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 多个雌性C57BL/6小鼠群体 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
29 2026-07-10
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为SpaCNA的计算框架,用于从空间转录组数据中稳健检测拷贝数改变 整合多模态信息(基因表达与空间位置),利用隐藏马尔可夫随机场模型实现空间连续的CNA检测,并支持三维重建 未提及局限性 开发高精度检测空间转录组中拷贝数改变的方法,以分析肿瘤内异质性和空间肿瘤生物学 模拟数据及乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌的真实空间转录组数据集 计算生物学 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 隐藏马尔可夫随机场 基因表达数据 多个模拟数据集及三组真实癌症数据集 NA 空间转录组学 NA NA
30 2026-07-10
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过整合空间分析、单细胞RNA测序和多重免疫组化,发现肿瘤细胞衍生的干扰素通过STAT信号诱导肿瘤相关巨噬细胞表达骨桥蛋白,形成免疫抑制性微环境,导致PARP抑制剂耐药 首次揭示肿瘤细胞来源的干扰素在空间上重编程骨桥蛋白富集的巨噬细胞微环境,建立干扰素-骨桥蛋白空间轴介导的PARP抑制剂耐药新机制,并证明骨桥蛋白可作为预后生物标志物和治疗靶点 未描述具体局限性 探究PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中耐药的空间免疫微环境机制 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验中的初治高级别浆液性卵巢癌标本 数字病理学 卵巢癌 PhenoCycler-Fusion空间分析,单细胞RNA测序,多重免疫组化 NA 空间蛋白质组学数据,单细胞转录组数据,组织切片图像数据 来自前瞻性临床试验的卵巢癌患者标本,具体数量未标出 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 PhenoCycler-Fusion PhenoCycler-Fusion空间分析平台
31 2026-07-10
A colon mimetic screening approach reveals Lactobacillus fermentum as a microbiome-based therapy for COPD
2026-04-14, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 通过结肠模拟个性化药物元分析筛选平台发现发酵乳杆菌作为慢性阻塞性肺疾病的微生物组疗法 首次利用结肠模拟个性化药物元分析筛选平台从重度COPD患者粪便样本中筛选出具有治疗潜力的发酵乳杆菌,并通过单细胞转录组学和粪便微生物组分析揭示其作用机制 研究仅处于临床前阶段,未进行人体临床试验验证 评估发酵乳杆菌对COPD的治疗效果及其作用机制 烟雾暴露小鼠模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 RNA测序, 单细胞转录组学 个性化药物元分析筛选平台 基因表达数据, 微生物组数据 重度COPD患者粪便样本用于筛选,烟雾暴露小鼠用于治疗实验,具体样本数量未说明 NA 单细胞RNA测序, 粪便微生物组分析 NA NA
32 2026-07-10
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态变化 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出DDIT4作为骨质疏松症的风险因子,并构建了预测性能良好的诺模图 研究样本量有限,标记物的临床验证尚需更大规模队列研究支持 揭示骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关基因标志物及其免疫机制,以改善诊断和治疗 骨质疏松症患者组织样本及公开数据库中的表达数据 机器学习 骨质疏松症 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、qRT-PCR、Western blot NA 基因表达数据 未明确样本数量,涉及公开数据库及实验验证样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
33 2026-07-10
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析闭合性轻度脑损伤模型,发现炎症小体接头蛋白ASC在神经炎症和轻度认知障碍中发挥关键作用 首次揭示ASC作为主要炎症小体接头蛋白在轻度闭合性脑损伤后持续神经炎症和认知缺陷中的关键作用 NA 探究闭合性轻度脑损伤后炎症小体相关基因的细胞表达及其功能意义 闭合性轻度脑损伤小鼠模型及其皮质组织 机器学习 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
34 2026-07-10
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本文揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的作用机制 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡加重脓毒症,为脓毒症发病机制研究和临床治疗提供新靶点 未提及具体研究局限性 探究RETN影响脓毒症病理生理的特异性通路 脓毒症患者巨噬细胞及小鼠模型 机器学 脓毒症 单细胞测序,RNA测序 NA 基因表达数据 脓毒症患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
35 2026-07-09
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的免疫景观,揭示桥本甲状腺炎的细胞机制 构建了NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的单细胞转录组图谱,首次揭示甲状腺细胞可塑性和调节性T细胞功能障碍可能是疾病进展的驱动因素 未明确提及局限性 阐明桥本甲状腺炎中每种甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 NOD.H-2h4小鼠甲状腺组织 单细胞转录组学 桥本甲状腺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的甲状腺组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
36 2026-07-09
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-Apr-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序揭示了出生后环氧合酶-2(COX-2)的上调驱动动脉导管解剖闭合的分子机制 首次发现COX-2在出生后动脉导管平滑肌细胞中显著上调,并证实其通过氧化应激和血栓素A2信号促进平滑肌细胞增殖,从而驱动动脉导管解剖闭合,为理解动脉导管闭合机制提供了新视角 研究主要基于小鼠模型,且COX-2抑制剂的干预仅针对出生后早期阶段,未探讨长期抑制的影响,同时涉及的中间分子(如)在摘要中未完全阐明 阐明出生后动脉导管血管重塑的分子机制,特别是COX-2在动脉导管解剖闭合中的作用 小鼠动脉导管平滑肌细胞(DASMCs)及其他细胞类型 NA NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠样本,具体数量未说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
37 2026-07-09
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现衰老过程中树突状细胞迁移缺陷,并通过口服酵母纳米颗粒增强其功能以改善疫苗效力 揭示了衰老中树突状细胞迁移缺陷是免疫衰退的关键机制,并开发了口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来增强树突状细胞功能 未明确提及 探究树突状细胞在衰老相关疫苗效力下降中的作用及改善策略 年轻与老年小鼠的淋巴结、树突状细胞及肠道免疫系统 机器学习 老年病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 年轻与老年小鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
38 2026-07-08
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and limits of marker-based assessment in retinal ganglion cell-enriched organoid cultures
2026-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 通过单细胞分析揭示视网膜神经节细胞富集类器官培养中的细胞异质性和基于标记物评估的局限性 首次利用单细胞RNA测序全面表征视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成,发现基于标记物评估可能高估RGC身份,并揭示了部分特化的RGC状态和非目标细胞群 样本间存在显著变异,且未完全确定功能性RGC亚型的规范程度 评估视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成和发育保真度 人类多能干细胞来源的视网膜类器官衍生的视网膜神经节细胞富集培养物 单细胞基因组学 视网膜神经疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 基因表达数据 4个样本,共73,642个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
39 2026-07-08
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
评论 本文评论了Renedo等人利用单细胞RNA测序对人类缺血性卒中血栓进行表征的研究,揭示了血栓并非惰性栓塞物质,而是具有结构化免疫活性的微环境 强调单细胞转录组学为卒中血栓研究带来细胞和分子层面的新视角,指出血栓保留病因特异性细胞和功能特征 未在摘要中明确提及具体局限性 评论单细胞转录组学在卒中血栓研究中的应用价值 人类缺血性卒中血栓样本 单细胞转录组学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
40 2026-07-08
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA-seq、TCGA WGCNA和空间转录组学,鉴定HSPB1为结直肠癌中调控Treg/CD8+ T细胞比例的关键因子,并证明靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 首次发现HSPB1通过CCL20-CCR6轴调控Treg募集,从而维持肿瘤免疫抑制微环境,并验证其双重抗肿瘤作用 研究主要基于小鼠皮下肿瘤模型和体外实验,缺乏临床样本验证及HSPB1抑制剂的长期安全性数据 探究结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例失衡的分子调控机制 结直肠癌肿瘤细胞、Treg细胞、CD8+ T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑, 多重流式细胞术, bulk RNA-seq NA 基因表达数据, 图像数据 结直肠癌患者肿瘤样本(具体数量未明确)以及MC38和SW480细胞系 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学
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