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当前共找到 943 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-15 |
Generation of biologically responsive colon-like intestinal tissue patches from human induced pluripotent stem cells using a rapid co-differentiation platform
2026-Apr-09, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-05006-4
PMID:41957847
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研究论文 | 利用人诱导多能干细胞快速共分化平台生成具有生物学响应的结肠样肠组织补片 | 开发了一种新颖的早期人诱导多能干细胞共分化平台，能在8天内快速生成多种肠道细胞谱系（上皮、间充质和内皮），并形成结肠样肠组织补片 | 仍处于早期阶段，需要进一步开发才能作为肠道黏膜再生治疗的潜在来源 | 开发可移植的肠道黏膜组织移植物，用于肠道黏膜修复和再生治疗 | 人诱导多能干细胞 | 数字病理学 | 肠道疾病 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA和蛋白质表达数据 | 多种人诱导多能干细胞系，在独立中心复现 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-05-15 |
Benchmarking tools for deciphering cellular crosstalk in spatially-resolved transcriptomics
2026-Apr-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04063-5
PMID:41952215
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研究论文 | 对九种计算工具在空间转录组学中推断细胞间相互作用进行基准测试，评估其在不同平台和分辨率下的表现 | 首次专门针对空间转录组学应用的细胞间相互作用推断工具进行系统基准测试，涵盖多种平台（Visium、Stereo-seq、Xenium）并评估其在不同空间分辨率、组织背景和平台下的性能差异 | 仅评估了九种工具，且测试数据集来自三个独立研究，可能未覆盖所有现有工具和多样化应用场景 | 系统评估和比较空间转录组学中细胞间相互作用推断工具的性能，为工具选择提供实用指导 | 九种计算细胞间相互作用推断工具，以及来自三个独立研究的九个真实空间转录组数据集 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 九个来自Visium、Stereo-seq和Xenium平台的真实数据集 | 10x Genomics, BGI, MGI | 空间转录组学 | 10x Visium, BGI Stereo-seq, 10x Xenium | Visium空间转录组平台，Stereo-seq空间转录组平台，Xenium原位分析平台 |
| 23 | 2026-05-15 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the spatiotemporal trajectory of the small peptide TAP4 in delaying postharvest fruit senescence
2026-Apr-07, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2026.101846
PMID:41947460
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示小肽TAP4延缓采后果实衰老的时空轨迹 | 首次鉴定出胰蛋白酶自溶肽中活性最强的TAP4，并利用单细胞转录组分析揭示其通过调控内果皮细胞分化轨迹和激活特定转录因子（如HuWRKY21-1）来延缓果实衰老的新机制 | 未提及 | 探究胰蛋白酶自溶肽TAP4延缓火龙果采后衰老的分子机制 | 火龙果果实，特别是内果皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，病毒诱导基因沉默（VIGS） | NA | 基因表达数据，序列数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 24 | 2026-05-15 |
Self-regulating hydrogel for diabetic wound healing: From animal models to a pilot clinical study
2026-Apr-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aed4981
PMID:41920988
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研究论文 | 开发了一种自调节水凝胶GPP@ZnBG，用于糖尿病伤口愈合，并在动物模型和初步临床研究中验证其效果 | 提出了一种自pH调控的离子顺序释放策略，水凝胶能响应糖尿病伤口的高糖和氧化应激环境，先释放锌离子抗菌，后释放锌、钙、硅酸盐离子促进血管生成和组织修复 | 初步临床研究规模较小，且未报告长期随访数据，水凝胶的长期安全性和有效性需进一步验证 | 开发一种能自我调节的伤口敷料，通过响应糖尿病伤口微环境来释放治疗性离子，以促进感染控制和组织再生 | 糖尿病小鼠伤口模型和糖尿病患者的慢性伤口 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 糖尿病小鼠（未指定数量）和初步临床研究中的患者（未指定数量） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 25 | 2026-04-04 |
Global scientific growth and thematic development of spatial transcriptomics in oncology research
2026-Apr-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04937-x
PMID:41931230
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 26 | 2026-05-15 |
Targeting TPO/MPL Signaling to Mitigate JAK2V617F-driven Cardiac Microvascular Disease
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.01.715884
PMID:41959476
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研究论文 | 本文探讨靶向TPO/MPL信号通路减轻JAK2V617F驱动的心脏微血管疾病 | 首次发现MPL在内皮细胞中表达并介导JAK2V617F相关心血管并发症，且抗MPL抗体能改善心脏病理 | 研究主要基于小鼠模型，人类体内的验证及长期疗效仍需进一步探索 | 阐明JAK2V617F突变血细胞通过TPO/MPL信号导致心脏微血管功能障碍的机制 | JAK2V617F突变血细胞和野生型内皮的嵌合小鼠模型 | 机器学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、骨髓移植、组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 嵌合小鼠（数量未明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 27 | 2026-05-15 |
PMEPA1 modulates YAP1 nuclear translocation to disrupt EMT subtypes and promote metastasis in Biliary tract cancer
2026-Apr-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08684-3
PMID:41932868
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析，揭示PMEPA1通过调控YAP1核转位驱动胆道癌EMT及转移，并发现拓扑异构酶抑制剂SN-38作为潜在治疗药物 | 首次在胆道癌中通过整合47例样本的单细胞RNA测序数据识别出两个EMT富集上皮亚群及特异性EMT基因集，并发现PMEPA1通过抑制LATS1/2激酶活性绕过Hippo肿瘤抑制通路，促进YAP1核转位启动促EMT基因程序 | 未明确提及具体局限性 | 阐明胆道癌中EMT的关键调控因子及其分子机制，探索潜在治疗靶点 | 胆道癌（BTC）患者样本及细胞系 | 数字病理学 | 胆道癌 | 单细胞RNA测序、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、多组学数据 | 47例胆道癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-05-15 |
Senescence-associated gene pathways are differentially expressed in equine aging-related osteoarthritis
2026-Apr-01, American journal of veterinary research
IF:1.3Q2
DOI:10.2460/ajvr.25.09.0343
PMID:41468690
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研究论文 | 本研究分析了马骨关节炎中关节和白细胞衰老相关基因的差异表达 | 首次利用单细胞RNA测序和mRNA测序数据，系统地比较了马骨关节炎局部（关节）和全身（外周血单核细胞）的衰老基因表达谱 | 未提及具体限制，但样本量较小，且缺乏功能验证实验 | 探究衰老相关基因在马骨关节炎中的表达模式，为开发针对衰老细胞的治疗策略提供依据 | 马关节滑液细胞和外周血单核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 65个样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-05-15 |
Goblet of fire: how Chlamydia ignites region-specific colitis by hijacking goblet cells
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI204928
PMID:41919496
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评论 | 本文通过TNF驱动的小鼠模型和单细胞RNA测序数据，揭示了沙眼衣原体通过劫持杯状细胞并激活IDO1/犬尿氨酸通路，促进结肠近端区域特异性炎症的机制 | 首次证明沙眼衣原体作为必要且充分的驱动因子，通过上调杯状细胞中IDO1表达，促进区域限制性肠道炎症，并发现该机制仅发生于近端结肠而非末端回肠 | 研究仅基于小鼠模型和有限的人类数据，需要进一步验证IDO1/犬尿氨酸通路在其他克罗恩病患者群体中的普适性 | 阐明细菌共生体驱动肠道区域特异性炎症的分子机制 | 克罗恩病患者的升结肠区域和TNF驱动的小鼠小肠克罗恩病模型 | 生物信息学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及克罗恩病患者升结肠的单细胞RNA测序数据集（具体样本量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 30 | 2026-05-15 |
CD8 TRM-like T cells expressing perforin and IFN-γ define a pediatric activated T-cell acute liver failure endotype
2026-Apr-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000926
PMID:41921202
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研究论文 | 该研究通过多参数流式细胞术和单细胞RNA测序，鉴定了儿童急性肝衰竭的两种不同内型，其中一种与表达穿孔素和IFN-γ的CD8 TRM样T细胞相关 | 首次定义了儿童活化T细胞急性肝衰竭的两种不同内型，并揭示了高穿孔素内型中独特的循环CD8+IFNγ+Trm样细胞群与单核细胞增殖和激活的关联 | 该研究未提及具体限制，但可能包括样本量有限、缺乏长期随访数据等潜在局限性 | 表征儿童活化T细胞急性肝衰竭的免疫病理学特征，并评估T细胞导向治疗的效用以改善无移植生存率 | 儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童以及因其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 机器学习，数字病理学 | 儿科疾病，肝病 | 多参数流式细胞术，3'单细胞RNA测序，Olink炎症I 384蛋白检测 | NA | NA | TRIUMPH临床研究中的儿童活化T细胞急性肝衰竭患者、健康儿童及其他原因导致急性肝衰竭的儿童 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 3'单细胞RNA测序使用10x Chromium平台 |
| 31 | 2026-05-12 |
Multi omics and mechanistic investigation reveals CBFB as a prognostic biomarker in gastric cancer
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05131-9
PMID:42056631
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研究论文 | 该研究通过多组学分析发现CBFB是胃癌预后生物标志物，并探究其作用机制 | 首次系统性地利用多组学分析揭示CBFB在胃癌中的预后价值及功能机制，包括单细胞RNA测序和分子对接验证 | 未提及明显的局限性 | 探究CBFB在胃癌中的预后意义和潜在作用机制 | 胃癌患者的转录组数据及细胞样本 | 机器学习 | 胃癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | CNN（机器学习） | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 32 | 2026-05-12 |
CSsingle: a unified tool for robust decomposition of bulk and spatial transcriptomic data across diverse single-cell references
2026-Apr-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkag410
PMID:42080261
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研究论文 | 提出了统一框架CSsingle，鲁棒地从多种单细胞参考中解卷积bulk和空间转录组数据 | 引入细胞大小校正和跨平台数据整合，通过External RNA Controls Consortium (ERCC) spike-ins或计算估计器明确校正细胞类型特异性RNA含量差异 | 未明确讨论 | 准确解卷积bulk和空间转录组数据，以研究组织架构和疾病 | bulk转录组和空间转录组数据 | 自然语言处理 | 肺癌 | NA | 重复加权最小二乘模型 | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 33 | 2026-05-12 |
Systems genetics reveals ITIH5 as a key mediator of adipocyte-Endothelial crosstalk
2026-Apr-21, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102373
PMID:42025695
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研究论文 | 使用系统遗传学方法揭示ITIH5作为脂肪细胞与内皮细胞交互的关键调节因子，影响脂肪组织稳态和全身代谢 | 通过无偏倚系统遗传学分析发现ITIH5在脂肪组织稳态和全身代谢中的中心调控作用，并结合急性重组蛋白处理、时空调控的脂肪细胞特异性过表达模型和空间转录组学揭示其通过调节内皮-免疫相互作用的机制 | 未明确提及具体限制，但可能包括动物模型向人类转化、不同饮食条件下的效应差异及潜在的混杂遗传因素 | 探索脂肪组织稳态的遗传调控机制，特别是ITIH5在脂肪细胞-内皮细胞交互和全身代谢中的作用 | 小鼠和人类脂肪组织、内皮细胞 | 系统遗传学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 空间转录组学数据 | 未明确提供具体样本量，涉及小鼠模型和人类细胞实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 34 | 2026-05-12 |
Mapping breast cancer lineage in radiation and immunotherapy using the REMAP mouse
2026-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.15.718689
PMID:42039427
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研究论文 | 介绍REMAP小鼠模型，用于在放射和免疫治疗中绘制乳腺癌谱系，揭示肿瘤进化、转移及治疗反应由可遗传的谱系程序调控 | 首次将诱导型CRISPR记录与MMTV-PyMT小鼠模型结合，实现体内乳腺肿瘤克隆谱系的高分辨率追踪，并揭示可遗传的EMT程序在转移和治疗反应中的作用 | NA | 研究放射与抗PD1免疫治疗联合作用下激素受体阳性乳腺癌的肿瘤进化、转移及肿瘤微环境重塑机制 | REMAP小鼠模型中的激素受体阳性乳腺癌肿瘤及肿瘤微环境 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | REMAP小鼠模型中的多个肿瘤和转移灶样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达系统 |
| 35 | 2026-05-12 |
Distinct gene signatures of human intermuscular adipose tissue expansion visualized by spatial transcriptomics in mice
2026-Apr-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.16.26351017
PMID:42064925
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研究论文 | 通过空间转录组学揭示小鼠及人类肌间脂肪组织扩张的独特基因特征 | 首次结合人类大块转录组学与小鼠空间转录组学，跨物种比较揭示肌间脂肪组织扩张的局部化、上下文依赖性谱系转变机制，并鉴定到EBF2作为关键成脂转录因子 | 仅在小鼠模型中验证空间转录组数据，人类样本大块转录组缺乏空间分辨率；未完全解析人类与小鼠间物种特异性调控网络的差异 | 阐明肌间脂肪组织扩张的细胞组织及调控机制，以揭示其与心血管代谢疾病的关联 | 人类肌间脂肪组织样本及心血管代谢疾病模型的SAM小鼠肌间脂肪组织 | 空间转录组学 | 心血管代谢疾病 | 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 人类肌间脂肪组织样本（具体数量未提供）、SAM小鼠（具体数量未提供） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 36 | 2026-05-12 |
Serial Spatial Transcriptomics Reveal Divergent Routes to Therapy Resistance in Metastatic Breast Cancer
2026-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-9365657/v1
PMID:42040933
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研究论文 | 通过连续空间转录组学揭示四名转移性乳腺癌患者在长达3.5年的个性化治疗过程中产生的治疗耐药性差异路径 | 将概率主题建模与空间深度学习相结合，首次在患者层面系统解析了转移性乳腺癌中治疗耐药性的三种普遍原则（通路独立性、微环境重塑和代偿性信号）及其背后的具体分子机制 | 样本量较小（仅四名患者），可能限制了结果的普遍适用性；研究主要基于空间转录组学数据，未结合其他组学数据（如蛋白质组学）进行验证 | 探索转移性乳腺癌在治疗过程中如何通过复杂的空间异质性机制产生耐药性 | 四名转移性乳腺癌患者在不同治疗时间点获取的十份活检样本中的345,207个细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 概率主题模型、空间深度学习 | 空间转录组数据 | 四名患者的十份活检样本，共计345,207个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 37 | 2026-05-12 |
sigNATURE maps cohort-specific T-cell states to reproducible programs of ICI response
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718532
PMID:42039669
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研究论文 | 提出sigNATURE框架，通过参考图谱映射方法增强免疫检查点抑制剂单细胞RNA-seq研究中T细胞生物标志物的可重复性 | 提出参考引导框架sigNATURE，将查询细胞映射到大型CD4和CD8 T细胞图谱，并在图谱对齐坐标系中评估已发布的免疫检查点抑制剂响应标志物，通过细胞级可识别性评分量化图谱支持度 | 基于两个独立队列（36例非小细胞肺癌和15例皮肤癌患者）验证，样本量和癌症类型有限 | 提高单细胞RNA-seq研究中免疫检查点抑制剂响应T细胞标志物的可重复性和跨队列可比性 | 免疫检查点抑制剂治疗患者的T细胞状态 | 自然语言处理 | 非小细胞肺癌, 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | 参考图谱映射 | 单细胞RNA-seq数据 | 36例非小细胞肺癌患者和15例皮肤癌患者（11例基底细胞癌和4例鳞状细胞癌） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 38 | 2026-05-12 |
Regional and Systemic Metabolic Remodeling Promotes Longevity by Bioengineered Yeast-Derived Lipids
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717033
PMID:42039507
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研究论文 | 研究发现从基因工程改造的长寿酵母菌株中提取的脂质能延长果蝇寿命，揭示其通过改善肠道完整性、代谢重编程和肠道-脑通讯等机制促进健康衰老 | 首次发现来自基因改造长寿酵母的饮食脂质能跨物种延长果蝇寿命，结合重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序和FLY-MAP代谢分析流程，系统揭示了脂质通过改善肠道上皮结构、重编程代谢及增强肠-脑通讯的多层次长寿机制 | 研究主要基于果蝇模型，酵母脂质在哺乳动物中的功效和安全性有待验证；脂质组成复杂，具体活性成分和作用靶点需进一步阐明 | 探究基因工程改造长寿酵母来源的饮食脂质对果蝇寿命的影响及其分子机制 | 果蝇（Drosophila）以及基因工程改造的长寿酵母菌株 | 机器学习 | 老年病 | 重水探针受激拉曼散射显微镜、单核RNA测序、拉曼光谱、脂质组学 | NA | 图像、文本、序列 | 未明确说明样本量，涉及果蝇肠道和脑组织的单核RNA测序及代谢成像 | 10x Genomics | 单核RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单核RNA测序 |
| 39 | 2026-05-12 |
MitoChontrol: Adaptive mitochondrial filtering for robust single-cell RNA sequencing quality control
2026-Apr-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.04.716517
PMID:41993278
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研究论文 | 提出MitoChontrol，一种基于细胞类型感知的概率框架，用于单细胞RNA测序质量控制中的线粒体过滤 | 采用高斯混合分布建模转录相干簇内的线粒体转录本比例，动态确定过滤阈值，避免固定百分比阈值的局限性 | 未提及具体限制 | 开发更稳健的自适应线粒体过滤方法，以改进单细胞RNA测序质量控制 | 受控扰动实验和胰腺导管腺癌单细胞数据集中的细胞群体 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | 高斯混合模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-10 |
Fibroblast pentose phosphate pathway activation upon decreased circPLCE1 exacerbates intestinal fibrosis in Crohn's disease
2026-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-336415
PMID:41390174
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研究论文 | 该研究揭示了克罗恩病肠道纤维化中成纤维细胞戊糖磷酸途径的激活机制，并发现circPLCE1下调通过XYLB/Xu5P轴加剧纤维化 | 首次多层整合代谢组、单细胞RNA测序和空间转录组分析，发现circPLCE1/XYLB/Xu5P轴调控成纤维细胞戊糖磷酸途径在肠道纤维化中的作用 | 未提及明显局限性，但可能包括动物模型与人类疾病的差异及机制验证的局限性 | 探索克罗恩病肠道纤维化过程中成纤维细胞的代谢重编程及其上游调控因子 | 克罗恩病患者的狭窄与非狭窄肠段组织、原代人肠道肌成纤维细胞、葡聚糖硫酸钠诱导的肠道纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组, circRNA转录组, 代谢流分析, 海马分析, RNA下拉实验 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 来自克罗恩病患者狭窄和非狭窄肠段的配对黏膜和黏膜下组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |