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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-05-21 |
Infection of 5xFAD mice with a mouse-adapted SARS-CoV-2 does not alter Alzheimer's disease neuropathology yet induces widespread changes in gene expression across diverse cell types
2026-04, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71394
PMID:42029189
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研究论文 | 研究小鼠适应性SARS-CoV-2感染对5xFAD小鼠阿尔茨海默病神经病理学及基因表达的影响 | 首次使用小鼠适应性SARS-CoV-2感染老年5xFAD小鼠模型,结合空间转录组学分析未直接感染脑部病毒情况下对多种细胞类型基因表达的广泛影响 | 未在脑内检测到病毒RNA,感染可能未直接作用于中枢神经系统,且研究仅限于小鼠模型,可能无法完全反映人类SARS-CoV-2感染对阿尔茨海默病的影响 | 探究SARS-CoV-2感染是否加重阿尔茨海默病神经病理学及疾病进展 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 老年5xFAD和野生型小鼠 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 362 | 2026-05-19 |
Dysregulated landscape of RNA-binding proteins in unexplained recurrent spontaneous abortion revealed by bulk and single-cell transcriptome
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45052-9
PMID:41922522
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 363 | 2026-05-20 |
Germ layer specification and organotropism in lymphoma invasion
2026-04-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2026.03.009
PMID:41904054
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研究论文 | 研究弥漫大B细胞淋巴瘤中胚层依赖性外结侵犯的分子特征和发育轨迹 | 首次揭示外结侵犯模式与胚层发育的关联性,通过单细胞RNA测序发现恶性B细胞遵循类似胚层发育的轨迹,并提出依赖性免疫检查点靶向策略 | 未明确说明但可能涉及样本量有限及胚层依赖性机制在临床转化中的验证需求 | 探究淋巴瘤侵犯模式与胚层发育之间的关联,并解析其分子机制和临床意义 | 弥漫大B细胞淋巴瘤患者的外结侵犯样本,分为外胚层、内胚层和中胚层起源亚组 | 机器学习 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 发育轨迹分析模型 | 基因表达数据、临床生存数据 | 未明确说明具体数量,但涉及多组外结侵犯患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2026-05-20 |
Enhancer-directed gene delivery for digit regeneration based on conserved epidermal factors
2026-Apr-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2532804123
PMID:41980086
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研究论文 | 本研究基于保守的表皮因子,设计了增强子导向的基因递送平台,用于小鼠指尖再生,部分挽救了SP基因敲除小鼠的再生缺陷并加速了野生型小鼠的再生过程 | 首次利用从高再生能力物种(斑马鱼、蝾螈)中发现的保守表皮因子SP家族,结合增强子导向的基因递送平台,实现了哺乳动物指尖再生的部分恢复和加速 | 未明确说明局限性,但基于摘要,可能存在基因治疗效率、长期安全性或临床应用转化方面的潜在限制 | 开发一种基于保守表皮因子的增强子导向基因递送平台,以实现哺乳动物的指尖再生 | 斑马鱼尾鳍再生、蝾螈肢体再生、小鼠指尖再生模型 | 计算机视觉 | 老年病 | 单细胞RNA测序、腺相关病毒载体基因递送、增强子导向基因表达 | NA | 基因表达数据 | 涉及斑马鱼、蝾螈和小鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2026-05-20 |
ADAM8 mediates eosinophil and neutrophil infiltration and tissue remodeling in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Apr-22, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2026.04.005
PMID:42031098
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研究论文 | 探究ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉中调控嗜酸性粒细胞和中性粒细胞浸润及组织重塑的作用 | 首次明确ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的关键作用,揭示其通过促进炎症细胞迁移和组织重塑参与疾病进展 | 尚未阐明ADAM8在人类患者中的长期治疗效果及具体分子信号通路细节 | 阐明ADAM8在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的作用及其分子机制 | 人类鼻腔组织、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞、人类鼻上皮细胞系、小鼠CRSwNP模型 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | 人类鼻腔组织样本(数量未明确)、小鼠模型(数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
| 366 | 2026-05-20 |
A sequence knowledge-guided deep learning method for single-cell multi-omics translation
2026-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04070-6
PMID:41975483
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研究论文 | 提出一种序列知识引导的深度学习方法scProTrans,实现单细胞多组学翻译,将转录组数据转换为蛋白质组信息 | 融合序列知识与多组学整合,通过层次注意力机制、双向编码器架构和细胞特异性关联组件实现跨组学翻译,并在三组学场景中验证其可扩展性 | 未明确提及,但依赖CITE-seq训练数据,可能对训练数据外的条件泛化能力有限 | 开发一种可解释的深度学习框架,利用序列知识引导多组学整合,实现单细胞分辨率下的跨组学翻译 | 单细胞RNA测序数据与蛋白质组数据的关系,涉及基因-蛋白质关联和细胞异质性 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、CITE-seq | 深度学习模型(层次注意力机制、双向编码器架构) | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | 17个多组学数据集 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3', CITE-seq训练数据 |
| 367 | 2026-05-20 |
MELK is Required for G2/M Phase Progression in Cortical Progenitors: Insights from Rare ASD-Associated Variants
2026-Apr-13, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01728-4
PMID:41973119
|
研究论文 | 研究MELK基因在皮质前体细胞G2/M期进程中的作用,并探讨与自闭症谱系障碍相关的罕见变异 | 首次发现MELK基因的罕见功能丧失变异与自闭症谱系障碍相关,并揭示其在皮质发育中调控G2/M期进程和神经元形态发生的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类中的直接验证有限 | 阐明MELK在胚胎皮质发育中的细胞周期调控功能及其与神经发育疾病的关联 | 小鼠皮质前体细胞 | 分子生物学 | 自闭症谱系障碍 | 子宫内电穿孔、单细胞转录组学、流式细胞分选、转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、转录组数据 | 小鼠皮质组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 368 | 2026-05-20 |
Experimental and computational methods for allelic imbalance analysis from single-nucleus RNA-seq data
2026-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04062-6
PMID:41965748
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研究论文 | 探讨从单核RNA-seq数据中分析等位基因失衡的实验和计算方法,并开发了一套单细胞等位基因特异性表达计算工具 | 发现从单核RNA-seq的内含子区域可提取更多等位基因特异性表达信息,并证明读长和杂交选择可提高检测效能 | 未提及 | 研究实验和计算选择如何影响基于等位基因特异性表达方法的能力 | 帕金森病队列样本 | 自然语言处理, 机器学习 | 帕金森病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 单核RNA-seq | NA | 序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2026-05-20 |
Urolithin A blocks colorectal cancer progression by AKT1 inhibition-driven immune activation
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45621-y
PMID:41922440
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研究论文 | 本研究通过网络药理学、分子对接和单细胞转录组学,发现天然多酚Urolithin A可通过抑制AKT1信号通路激活免疫反应,从而抑制结直肠癌进展 | 首次揭示Urolithin A通过抑制AKT1/FOXO1轴并增强CD8 T细胞效应功能来重塑肿瘤免疫微环境的机制,提出了饮食-微生物-AKT1-免疫轴模型 | 研究中主要使用体外细胞系和动物模型,缺乏临床样本验证;单细胞转录组学分析的具体数据和结果在摘要中未详细说明 | 探索天然多酚Urolithin A抗结直肠癌的潜在机制及其对免疫微环境的调控作用 | 结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、MC38)以及原位结直肠癌小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 三种结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、MC38)和小鼠原位肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2026-05-20 |
scRNA-seq reveals different cell clusters in the testes of Mongolian cattle and EGR1/FOS/JUN regulation in Sertoli cells
2026-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44429-0
PMID:41922521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 371 | 2026-05-19 |
Myeloid Cell States in Influenza-Associated Pulmonary Aspergillosis Are Shaped by Iron Overload and Metabolic Reprogramming
2026-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.22.720189
PMID:42079193
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研究论文 | 通过整合小鼠模型和单细胞RNA测序,揭示流感相关肺曲霉病中由铁过载和代谢重编程驱动的髓系细胞状态变化 | 首次利用单细胞转录组学结合小鼠模型阐明IAV感染后肺内铁积累如何通过免疫代谢重编程损害髓系细胞抗真菌功能,并验证与人类患者转录缺陷的相似性 | 未提及 | 探究流感A病毒感染后肺部微环境如何导致继发性曲霉感染的机制 | 小鼠肺单核细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺曲霉病,流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据(转录组) | 小鼠模型,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2026-05-19 |
Synovial transcriptional clusters link cartilage degeneration to cell-type-specific gene expression in knee osteoarthritis
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719697
PMID:42079156
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研究论文 | 探究膝骨关节炎滑膜转录簇与软骨退变及细胞类型特异性基因表达的关系 | 首次通过共识聚类分析将人类膝骨关节炎滑膜组织划分为四个转录簇,并揭示其与软骨退变严重程度及细胞类型特异性基因表达的关联 | 未提及 | 识别膝骨关节炎滑膜转录簇,并阐明其与滑膜组织学特征、细胞类型相关基因表达及软骨退变严重程度的关系 | 膝骨关节炎患者的滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 共识聚类 | 转录组数据 | 135例膝骨关节炎患者滑膜组织用于批量RNA-seq,18例用于单细胞RNA-seq | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 373 | 2026-05-19 |
Turep: Detecting cross-cancer tumor-reactive T cells in single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.21.719961
PMID:42079298
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研究论文 | 介绍了一种名为Turep的深度学习方法,用于通过单细胞和空间转录组数据稳健地跨癌种预测肿瘤反应性T细胞 | 通过整合七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,识别出泛癌肿瘤反应性基因特征,并利用生成式数据增强解决数据不平衡问题 | 未明确提及局限性 | 开发一种能够在跨癌种场景下稳健预测肿瘤反应性T细胞的工具 | 肿瘤浸润淋巴细胞中的肿瘤反应性T细胞与非反应性旁观者T细胞 | 机器学习 | 泛癌(七种人类恶性肿瘤) | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序,空间转录组学 | 深度学习模型 | 单细胞基因表达数据,T细胞受体序列数据,空间转录组数据 | 七种人类恶性肿瘤的配对单细胞RNA和T细胞受体测序数据,具体样本量未明确 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 374 | 2026-05-19 |
Dissecting the coordinated progression of cell states in spatial transcriptomics with CoPro
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719309
PMID:42079111
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研究论文 | 提出CoPro计算框架,用于检测空间转录组学中细胞状态的协调进展 | 能够以监督和非监督模式检测细胞类型内部或之间的共变基因程序,并解析多个重叠的空间模式 | 未提及局限性 | 识别在空间中连续变化且在不同细胞类型之间协调的基因表达程序 | 结肠、脑、肝脏和肾脏组织样本 | 空间转录组学 | 与衰老相关的肝脏疾病 | MERFISH, SeqFISH+, Xenium, 组织学推断转录组数据 | NA | 空间转录组数据 | 来自结肠、脑、肝脏和肾脏组织的数据集 | NA | 单细胞水平空间转录组学 | MERFISH, SeqFISH+, Xenium | 用于单细胞水平空间转录组学分析的平台 |
| 375 | 2026-05-19 |
Microporous annealed particle scaffolds avoid foreign body response by down regulating complement-fibroblast-macrophage signaling loop
2026-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.17.719225
PMID:42079188
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研究论文 | 该研究通过比较多孔退火颗粒支架与纳米多孔水凝胶的皮下植入反应,揭示了支架孔隙度如何调节补体-成纤维-巨噬细胞信号环,从而避免异物反应 | 首次阐明MAP支架通过下调C5a信号串扰通路抑制补体-成纤维-巨噬细胞信号环,从而避免异物反应 | NA | 研究植入物孔隙度如何影响异物反应,并揭示MAP支架减少纤维包囊及改善组织整合的机制 | MAP支架和纳米多孔水凝胶植入后的免疫反应及组织整合情况 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、多重细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白组数据 | 小鼠皮下植入模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 376 | 2026-05-19 |
Transcriptomic profile reveals cellular composition contribute to hyaline-vascular variant in unicentric Castleman disease-associated paraneoplastic pemphigus
2026-Apr-20, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag153
PMID:42008118
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研究论文 | 整合转录组学分析揭示单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮中透明血管变异型的细胞组成特征 | 首次通过单细胞RNA测序揭示内皮细胞在血管透明化和基质失调中的核心作用,并阐明内皮-免疫细胞互作机制 | 未提及 | 通过整合转录组和细胞分析,阐明单中心Castleman病相关副肿瘤性天疱疮的细胞和分子发病机制 | 33例UCD-PNP患者的淋巴结样本(包含5例进行单细胞测序) | 计算机视觉 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 33例UCD-PNP患者淋巴结样本(5例进行单细胞测序,共58,811个细胞) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | Illumina NovaSeq 6000测序平台 |
| 377 | 2026-05-19 |
Mechanotransduction unifies healthy nondiabetic wound healing over time by promoting a Cd14+/C1qa+ fibroblast subpopulation
2026-Apr-15, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2026.02.027
PMID:41997300
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析遗传诱导和病理生理性糖尿病小鼠伤口愈合过程中的成纤维细胞异质性,发现机械传导通路在健康伤口愈合中促进Cd14+/C1qa+成纤维细胞亚群,而在糖尿病模型中该通路被选择性消耗 | 首次在伤口愈合所有阶段系统表征糖尿病模型中成纤维细胞异质性,揭示机械传导通路(FAK和MAPK)在生理性愈合中的关键作用,并发现遗传性糖尿病中WNT通路过度激活导致愈合障碍 | 仅在小鼠模型中研究,未在人类样本中验证;未深入探讨机械传导通路与WNT通路之间的交互机制 | 探究糖尿病对伤口愈合过程中成纤维细胞异质性和机械传导通路的影响 | C57BL/6野生型小鼠(非糖尿病)、高脂饮食诱导的病理生理性糖尿病小鼠和瘦素受体缺陷的遗传性糖尿病小鼠的伤口组织 | 单细胞测序 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种小鼠模型(非糖尿病、病理生理性糖尿病、遗传性糖尿病)在术后第0、2、7、30天收集伤口组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 378 | 2026-05-19 |
Altered MDC1 Interactions and Dysfunctional DNA Repair in Lobular Breast Cancer Confers Sensitivity to PARP Inhibition
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1217
PMID:41512199
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研究论文 | 该研究揭示了浸润性小叶乳腺癌中MDC1相互作用改变和DNA修复功能障碍导致PARP抑制剂的敏感性 | 首次发现浸润性小叶乳腺癌细胞的ER与MDC1协同作用导致类似BRCA状态的同源重组修复障碍,以及这种障碍与经典BRCA缺失不同,并且可被PARP抑制剂靶向 | 未在文章和摘要中明确提及 | 探究MDC1如何调控浸润性小叶乳腺癌中ER活性和DNA修复功能,以及其治疗靶向潜力 | 浸润性小叶乳腺癌细胞、肿瘤组织及异种移植模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组分析、DNA修复活性分析、免疫共沉淀、PARP抑制剂治疗 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质互作数据、DNA修复信号数据 | 包括体外和体内多个ILC异种移植模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2026-05-19 |
Transcriptomic Plasticity Is a Hallmark of Metastatic Pancreatic Cancer
2026-Apr-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1117
PMID:41379552
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研究论文 | 对一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和多种转移灶进行单细胞转录组分析,揭示转移性胰腺癌的转录组可塑性 | 通过无监督原型分析和新开发的PICASSO系统发育推断方法,揭示胰腺癌细胞在转移过程中适应局部环境主要依赖环境效应而非克隆基因型 | 研究仅基于一名患者的样本,结论的普适性需要更多样本人群验证 | 研究肿瘤细胞在转移过程中适应不同器官微环境的分子机制 | 一名胰腺导管腺癌患者的原发肿瘤和肝、网膜、腹膜、胃壁、淋巴结、膈肌等转移灶样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、全外显子测序 | PICASSO(基于拷贝数变异的克隆系统发育推断方法) | 单细胞转录组数据、全外显子测序数据 | 1名患者的多个原发和转移组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 380 | 2026-05-19 |
Neoadjuvant Therapy-Induced Remodeling in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Multimodal Spatial Analysis and Prognosis
2026-Apr, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70320
PMID:41531168
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研究论文 | 利用整合空间病理组学和转录组学分析新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的重塑作用及其预后意义 | 首次通过多模态空间分析手段系统揭示新辅助治疗不仅减少肿瘤负荷,更通过成纤维细胞重编程、基质纤维化和免疫空间重组实现肿瘤微环境协同重塑 | 样本量相对较小(13例未治疗+23例治疗后),独立验证仅使用单细胞空间数据集,缺乏多中心大样本验证 | 探究新辅助治疗对胰腺导管腺癌肿瘤微环境的结构重塑作用及其对预后评估的价值 | 胰腺导管腺癌患者(13例未接受新辅助治疗和23例接受新辅助治疗后) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间病理组学、空间转录组学、单细胞空间分析 | NA | 空间转录组数据、病理图像数据 | 36例胰腺导管腺癌患者(13例未治疗,23例治疗后) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达分析平台 |