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当前共找到 945 篇文献,本页显示第 341 - 360 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
341 2026-06-13
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-Apr-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 利用单细胞核多组学测序分析小鼠黑质在衰老过程中的转录组和表观遗传组变化,发现与帕金森病相关的保守基因改变 首次通过单细胞核多组学技术(同时捕获转录组和表观遗传组)对小鼠黑质全生命周期进行细胞类型特异性分析,并整合多个公共PD单细胞RNA-seq数据集,揭示衰老与PD之间共有的基因调控网络变化 研究主要基于小鼠模型,人类PD相关发现需进一步验证;仅使用多组学数据,缺乏功能验证实验 探究衰老促进帕金森病发生的分子机制,尤其是细胞类型特异性的基因表达和表观遗传调控变化 小鼠黑质中的各类细胞,包括多巴胺能神经元、少突胶质细胞、小胶质细胞和谷氨酸能神经元等 单细胞基因组学 帕金森病 单细胞核多组学测序(snRNA-seq & snATAC-seq) NA 单细胞转录组和表观遗传组数据 来自小鼠黑质全生命周期的40,125个细胞核 10x Genomics 单细胞核多组学测序 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression 10x Chromium单细胞核多组学测序,同时捕获ATAC-seq和RNA-seq数据
342 2026-06-13
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Apr-07, Genome research IF:6.2Q1
研究论文 提出NeighbourNet方法,构建单细胞特异性共表达网络,用于细粒度调控模式发现 通过主成分分析降维和局部回归构建细胞特异性共表达网络,克服了传统方法依赖预定义聚类和忽视动态调控的局限性 未明确提及,但可能依赖于KNN邻域大小的选择和低维嵌入的优化 开发可扩展的细胞特异性共表达网络构建方法,以捕获单细胞水平上的动态调控变化 单细胞RNA测序数据中的基因表达调控网络 机器学习 癌症(肿瘤微环境案例) scRNA-seq 局部回归模型(结合KNN) 基因表达数据 大规模单细胞数据集(具体数量未说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
343 2026-06-13
L1TD1 promotes colorectal mucinous adenocarcinoma progression by enhancing ABCC3 mRNA stability
2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 L1TD1通过增强ABCC3 mRNA稳定性促进结直肠黏液腺癌进展 首次揭示L1TD1通过结合ABCC3 mRNA的GUGU基序上调其表达,激活MAPK信号通路,促进黏液产生和肿瘤进展,阐明了黏液腺癌中RNA结合蛋白的特异性调控机制 具体调控作用在MAC发展中的机制尚未充分探索 探究结直肠黏液腺癌(MAC)中黏液产生的特异性调控机制 结直肠黏液腺癌组织与相邻非癌组织 机器学习 结直肠黏液腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 结直肠黏液腺癌样本及相邻非癌组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
344 2026-06-13
A pH-responsive hyaluronic acid hydrogel facilitates lesion-localized integrin α5β1 agonism to attenuate osteopontin signaling and fibrosis in intrauterine adhesions
2026-Apr, Acta biomaterialia IF:9.4Q1
研究论文 开发了一种pH响应性透明质酸水凝胶,用于病灶局部整合素α5β1激动,以减轻宫内粘连中的骨桥蛋白信号传导和纤维化 本研究首次将工程化α5β1选择性激动肽与响应性生物材料耦合,通过病灶局部激活巨噬细胞整合素α5β1,重塑免疫-基质通讯,为宫内粘连及相关纤维炎症性疾病提供了一种以巨噬细胞为中心的整合素激动策略 NA(摘要未明确提及局限性) 开发一种病灶局部、pH响应性水凝胶平台,通过持续激活α5β1整合素,调节巨噬细胞功能,抑制骨桥蛋白信号,减轻宫内粘连中的纤维化,恢复子宫内膜容受性 宫内粘连大鼠模型中的巨噬细胞和子宫内膜基质细胞 数字病理学 子宫疾病 单细胞RNA测序 NA(未提及具体模型) 基因表达数据 宫内粘连大鼠模型(具体样本量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
345 2026-06-13
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Apr, Animal models and experimental medicine IF:3.8Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析,揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞变化、表观遗传改变及遗传支持的候选基因 首次采用多组学整合方法(单细胞转录组、DNA甲基化组、孟德尔随机化)系统解析CTEPH的免疫景观和表观遗传机制,并鉴定出具有诊断潜力的候选基因(ETS1和FGR) 未提及具体局限性,可能包括样本量有限、缺乏功能验证实验或未纳入纵向随访数据 探究慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子机制,识别早期诊断和个体化治疗的生物标志物 慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)患者 数字病理学 肺血管疾病 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据、DNA甲基化数据、临床生化数据 未明确提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
346 2026-06-13
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics IF:5.6Q1
研究论文 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,发现PEBP1是缺血性卒中后神经损伤的关键介质,抑制其表达可促进神经功能恢复 首次通过整合单细胞转录组学、大规模遗传学和实验验证,揭示PEBP1作为缺血性卒中治疗靶点的转化潜力,并阐明其通过Akt/p38 MAPK信号通路调控神经元的机制 潜在脱靶效应需进一步验证;动物模型和体外实验的临床转化需更多评估 探究缺血性卒中后神经功能恢复的新治疗靶点 缺血性卒中风险相关基因(PEBP1、BMP4、APOA1、CD86)及内皮细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、定量PCR、免疫荧光 NA 基因表达数据、遗传变异数据 欧洲生物信息学研究所数据集(34,593例病例和624,214例对照)、独立验证集(86,668例病例和1,503,898例对照)以及英国生物银行(26,052例病例和487,214例对照) NA 单细胞RNA测序 NA NA
347 2026-06-11
Tumor-Educated Extracellular Vesicle-Derived LINC01116 Drives Non-Small Cell Lung Cancer Progression and Immunosuppression by Sponging miR-3614-5p to Upregulate ARHGAP1
2026-Apr-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该文章研究了肿瘤教育细胞外囊泡来源的LINC01116通过海绵吸附miR-3614-5p上调ARHGAP1,驱动非小细胞肺癌进展和免疫抑制 首次发现细胞外囊泡来源的LINC01116在非小细胞肺癌中通过ceRNA机制调控ARHGAP1表达,并促进肿瘤进展和免疫抑制 未提及具体局限性 探究细胞外囊泡来源的长链非编码RNA在非小细胞肺癌进展和肿瘤免疫微环境中的作用 非小细胞肺癌患者组织样本、血液样本、细胞系、小鼠模型 机器学习 肺癌 NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 TCGA数据集中的非小细胞肺癌样本 Illumina 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq TCGA数据使用的测序平台
348 2026-06-11
Spatial transcriptomics and single-cell analysis reveal GSTO2-mediated protective networks in oral squamous cell carcinoma tumor microenvironment
2026-Apr, Oral oncology IF:4.0Q2
研究论文 结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示GSTO2在口腔鳞状细胞癌肿瘤微环境中介导的保护性网络 首次通过单细胞和空间转录组学整合分析,发现GSTO2阳性上皮细胞具有增强的代谢重编程和免疫相互作用,并验证GSTO2与MX1的直接结合 研究主要基于公开数据,可能缺乏独立的队列验证;分子机制需进一步功能实验确认 研究口腔鳞状细胞癌中GSTO2介导的代谢和免疫保护网络及其作为生物标志物的潜力 口腔鳞状细胞癌样本中的细胞群和基因表达调控因子 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 分子对接, 免疫共沉淀 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 50,667个细胞,来自口腔鳞状细胞癌样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
349 2026-06-11
Direct Cardiac Reprogramming in the Omics Era: Advances, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Cellular reprogramming IF:1.2Q4
综述 本文综述了组学时代下直接心脏重编程的进展、机制及其在心血管疾病治疗中的应用前景 通过整合多组学分析全面揭示了成纤维细胞向诱导心肌细胞样细胞转化过程中的分子机制和调控网络 未涉及具体实验验证或临床转化数据,主要基于已有文献综述 系统总结组学技术在直接心脏重编程研究中的应用及其对心血管疾病治疗的启示 成纤维细胞直接重编程为诱导心肌细胞样细胞的过程及相关分子机制 组学分析 心血管疾病 单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、代谢组学 NA 组学数据 NA NA 单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、代谢组学 NA NA
350 2026-06-11
Transcriptome Comparison Between the Cultured and In Vivo Chick Primordial Germ Cells by SMART-Seq-Based Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr, Development, growth & differentiation
研究论文 通过SMART-seq单细胞RNA测序比较培养与体内鸡原始生殖细胞的转录组差异 首次使用SMART-seq单细胞RNA测序揭示培养过程使PGC从MYC依赖转向MYCN依赖的基因调控网络,并发现新的种系偏向未分化细胞群体 未说明具体局限性 理解培养与体内鸡原始生殖细胞在分子水平的差异及其对发育过程的影响 鸡原始生殖细胞(PGCs) 数字病理学 不适用 SMART-seq单细胞RNA测序 不适用 转录组数据 单细胞样本(具体数量未提及) 不适用 单细胞RNA测序 SMART-seq SMART-seq单细胞RNA测序
351 2026-06-11
GITR activation potentiates anti-tumor immunity of tumor-infiltrating lymphocytes expanded from glioblastoma by rescuing exhaustion
2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 通过解析多形性胶质母细胞瘤中扩增的肿瘤浸润淋巴细胞的单细胞转录组异质性,发现GITR激动剂通过NF-κB/KALRN信号轴双重增强CD8 TIL功能并解除Treg免疫抑制,从而恢复抗肿瘤免疫效力 首次阐明GITR在耗竭的CD8 TILs上共表达于Treg细胞,并揭示其通过NF-κB/KALRN信号轴促进免疫突触形成的双重作用机制;将GITR靶向与αPD-1联合定位为胶质母细胞瘤TIL疗法增效新策略 研究依赖体外扩增模型及小鼠体内实验,临床前转化中GITR激动剂的系统性毒性及胶质母细胞瘤异质性对疗效的影响需进一步验证 优化胶质母细胞瘤TIL体外扩增方法并探索增强其抗肿瘤免疫的分子机制 多形性胶质母细胞瘤患者来源的肿瘤浸润淋巴细胞 癌症免疫治疗 多形性胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 从胶质母细胞瘤病变组织扩增的TIL NA 单细胞RNA测序 NA NA
352 2026-06-11
Prosta-omics: machine learning-driven TPSA prediction and molecular modeling of ASPM-inhibitors for prostate cancer treatment
2026-Apr, Molecular diversity IF:3.9Q2
研究论文 结合单细胞转录组学、化学信息学和机器学习,开发了一个从组学到治疗的整合流程,以识别前列腺癌中的可靶向生物标志物并筛选药物候选分子 提出了Prosta-Omics这一基于机器学习的工具,可预测分子的拓扑极性表面积(TPSA),并整合单细胞RNA测序数据与分子对接,实现精准肿瘤学中的靶向药物发现 未明确说明,但可能涉及ASPM抑制剂在临床前的验证不足或样本量有限 识别前列腺癌中的可靶向生物标志物并筛选潜在药物候选分子 前列腺癌组织中的恶性与非恶性细胞群体 机器学习 前列腺癌 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 随机森林 基因表达数据,分子SMILES结构数据 未指定样本数量 未指定 单细胞RNA测序 未指定 未指定
353 2026-06-11
Neuronal phenotypic alterations and the therapeutic potential of Anxa2 in traumatic brain injury recovery
2026-Apr, Brain research bulletin IF:3.5Q2
研究论文 利用单细胞和批量RNA测序数据,研究创伤性脑损伤后神经元的表型变化,并探讨Anxa2在恢复中的治疗潜力 首次通过单细胞RNA测序鉴定出创伤性脑损伤后发生显著mRNA表达变化的神经元群体,并发现Anxa2在神经元修复中的关键作用 研究仅使用小鼠模型,需要进一步验证人类样本;分子对接结果需实验验证候选化合物的有效性 探究创伤性脑损伤后神经元表型变化对恢复结果的影响,并寻找潜在治疗靶点 小鼠皮层组织神经元 数字病理学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA 基因表达数据 公开数据集中的小鼠皮层组织样本 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
354 2026-06-11
KRAS-extrachromosomal DNA drives intratumoral heterogeneity in gastric cancer
2026-Apr, Oncogene IF:6.9Q1
研究论文 对胃癌样本进行全基因组测序和单细胞RNA测序,识别了KRAS-染色体外DNA(ecDNA)及其对肿瘤内异质性和免疫逃逸的影响 首次在胃癌中识别出KRAS-ecDNA,并揭示了其驱动转录异质性、增强核糖体生物合成、上调DNA修复通路、减少MHC-II信号及潜在免疫逃逸的机制 基于单一胃癌样本,可能限制结果的普遍性;未提供体内模型或临床验证 研究胃癌中KRAS-ecDNA的功能意义及其对肿瘤异质性和治疗响应的影响 KRAS-ecDNA在胃癌中的作用 数字病理学 胃癌 全基因组测序,单细胞RNA测序 NA 基因组数据,转录组数据 1份胃癌样本 NA NA NA NA
355 2026-06-10
Persistent loss of intrahepatic IFN-γ in HBV is linked to selective impairment of liver-resident CXCR6+NK cells despite long-term NUC therapy
2026-Apr-18, JHEP reports : innovation in hepatology IF:9.5Q1
研究论文 通过多参数免疫荧光和单细胞RNA测序,发现长期核苷酸类似物治疗下,慢性乙肝患者肝脏中CXCR6+NK细胞持续丧失并转录重编程,导致肝内IFN-γ无法恢复 首次在人类肝脏中定义IFN-γ主要来源为肝驻留CXCR6+NK细胞,并揭示NUC治疗后抗原抑制下仍存在选择性NK细胞功能缺陷,提出了非耗竭驱动的免疫改变机制 样本量较小(NUC-HBV肝活检n=9,健康肝n=7),且仅分析了组织学和临床稳定患者,未探讨不同NUC疗程或疾病阶段的影响 明确健康肝脏中IFN-γ的主要细胞来源,并评估在长期NUC治疗对HBV抑制后这一免疫轴的变化 长期NUC治疗的慢性乙肝患者和健康供者的肝活检组织及配对外周血和肝脏细针穿刺样本 数字病理学 慢性乙肝 多参数免疫荧光、单细胞RNA测序 NA 图像、基因表达数据 NUC-HBV患者肝活检9例、健康供者肝活检7例;NUC-HBV患者肝细针穿刺9例、外周血18例;对照数据集肝5例、血9例 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
356 2026-06-10
Spatial and single-cell transcriptomic atlas of human suprachiasmatic nucleus
2026-Apr-15, Neuron IF:14.7Q1
研究论文 通过空间转录组学、单核RNA测序及深度学习组织学分析,构建了人类视交叉上核的综合分子与细胞图谱,揭示了其神经元亚型、保守功能分区及昼夜节律机制 首次在成人人类SCN中整合空间转录组与单核RNA测序数据,结合深度学习分析,揭示了保守的功能分区由LHX1和RORB调控,以及神经肽信号网络的重组,并通过GWAS整合分析鉴定出AVP/NMS神经元亚型与清晨型表型的关联 仅基于成人样本,未涵盖发育或衰老阶段;跨物种比较主要限于小鼠和猕猴,可能不完全反映人类特有的昼夜节律调控机制 阐明人类视交叉上核(SCN)的分子与细胞组成及其昼夜节律调控机制 成人人类视交叉上核(SCN)组织样本 数字病理学, 机器学习 NA 空间转录组学, 单核RNA测序(snRNA-seq) 深度学习模型 空间转录组数据, 单核RNA测序数据, 组织学图像 成人SCN组织样本(具体数量未在摘要中明确) NA 空间转录组学, 单核RNA测序 NA NA
357 2026-06-10
Multiomics Analysis Reveals Distinct Changes in the Cellular Composition of Vulvar Lichen Sclerosus
2026-Apr-01, Journal of lower genital tract disease IF:2.4Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和脂质代谢组学分析,揭示了外阴硬化性苔藓组织中细胞组成和基因通路的变化 首次结合单细胞RNA测序和脂质代谢组学多组学方法,系统解析了VLS组织与正常皮肤在细胞组成和基因/通路水平的差异,特别是T细胞亚群和代谢炎症基因的表达变化 样本量较小(scRNA-seq: 4例; 脂质代谢组学: 15例),可能限制发现的普遍性;自我对照设计可能无法完全排除个体差异 探究外阴硬化性苔藓组织与正常皮肤相比的细胞组成和基因/通路变化 外阴硬化性苔藓患者的VLS组织和自我对照外阴皮肤样本 机器学习和生物信息学 外阴硬化性苔藓 单细胞RNA测序, 脂质代谢组学 NA 单细胞基因表达数据, 脂质代谢组学数据 scRNA-seq: 4个VLS样本及自我对照皮肤; 脂质代谢组学: 15个VLS样本 NA 单细胞RNA测序, 脂质代谢组学 NA NA
358 2026-06-10
Remodeling the gut ecosystem and its mechanism: Natural products in the treatment of ulcerative colitis via regulating gut microbiota and metabolites
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
review 本文综述了六类天然产物(包括生物碱、多糖、多酚、苷类、萜类和动物源化合物)通过调节肠道菌群及其代谢通路(如短链脂肪酸、色氨酸和胆汁酸)来治疗溃疡性结肠炎的作用机制 系统总结了天然产物通过重塑肠道生态系统治疗溃疡性结肠炎的多靶点机制,并整合了单细胞转录组学、空间转录组学和细胞热位移分析等前沿技术用于靶点验证 天然产物治疗溃疡性结肠炎的具体作用机制仍不完全清楚,且缺乏对临床转化可行性的深入探讨 阐明天然产物治疗溃疡性结肠炎的作用机制,并总结前沿技术在靶点识别和验证中的应用 溃疡性结肠炎患者和动物模型中的肠道菌群及代谢物 自然语言处理 溃疡性结肠炎 单细胞转录组学、空间转录组学、细胞热位移分析 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
359 2026-06-10
Artificial sweeteners and male infertility: Network toxicology and experimental evidence reveal FGFR1 as the critical target
2026-Apr, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 通过计算预测、网络分析和实验验证,探究人工甜味剂对男性生育力的影响,揭示FGFR1为关键靶点 整合网络毒理学、机器学习特征选择和单细胞RNA测序,首次明确FGFR1是人工甜味剂致男性不育的核心靶点 仅进行了体外细胞实验,需要体内实验和蛋白质水平的进一步验证 探究人工甜味剂导致男性不育的分子机制 人工甜味剂(阿斯巴甜、纽甜、三氯蔗糖)和TM3莱迪希细胞 机器学习 男性不育 网络毒理学、分子对接、分子动力学模拟、单细胞RNA-seq、RT-qPCR NA 文本、分子结构数据、基因表达数据 7种人工甜味剂筛选,91个候选靶标,1个核心基因(FGFR1) NA 单细胞RNA测序 NA 使用Male Health Atlas数据库的单细胞RNA-seq数据
360 2026-06-10
Integration of TWAS with single-cell and spatial transcriptomics identifies TLR1 as a susceptibility gene and therapeutic target in the breast cancer tumor microenvironment
2026-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过全转录组关联研究(TWAS)结合单细胞和空间转录组学,鉴定TLR1为乳腺癌肿瘤微环境中的易感基因和治疗靶点 首次将TWAS与单细胞RNA测序和空间转录组测序整合,在乳腺癌肿瘤微环境中鉴定出TLR1作为易感基因和潜在药物靶点 未具体说明局限性 利用TWAS筛选乳腺癌易感基因,并通过单细胞和空间转录组学揭示其在肿瘤微环境中的机制和治疗价值 乳腺癌易感基因(ADCY3、CASP8、GRHL1、HELQ和TLR1)及其在肿瘤微环境中的细胞相互作用 数字病理学 乳腺癌 TWAS、空间转录组测序、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 来自GTEx门户的全组织eQTL数据,以及来自BCAC和FinnGen R10数据库的GWAS汇总数据 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
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