单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202604-202604] [清除筛选条件]
当前共找到 943 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-04-30
Gonadotrope Remodeling in Sustained Low Estrogen States: Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Gonadotrope Subtypes and Activation of Stem Cell Populations
2026-Apr-29, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序分析低雌激素状态下垂体促性腺激素细胞的亚型及干细胞激活 首次通过单细胞转录组学揭示低雌激素状态下促性腺激素细胞存在两个亚群(GON1和GON2),并发现垂体干细胞激活参与促性腺激素细胞群体扩张 基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类,且未对VCD模型与自然绝经的直接差异进行对比验证 研究低雌激素和绝经状态对雌性垂体功能的影响,特别是促性腺激素细胞的基因表达和细胞状态变化 VCD诱导卵巢衰竭模型小鼠的垂体细胞 单细胞转录组学 NA scRNA-seq, RT-qPCR NA 基因表达数据 VCD处理小鼠与正常发情期小鼠的垂体样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
302 2026-04-30
Network medicine and single-cell mapping identify a collagen-rich, fibrosis-associated hub module in Duchenne muscular dystrophy
2026-Apr-29, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过网络医学和单细胞映射识别杜氏肌营养不良症中胶原丰富、与纤维化相关的枢纽模块 首次通过加权基因共表达网络分析和单细胞RNA测序,将杜氏肌营养不良症的纤维化信号特异性地映射到肌腱成纤维细胞,并鉴定了六个关键枢纽基因,同时筛选出候选药物卤夫酮 尚不清楚,摘要中未明确提及局限性 识别与杜氏肌营养不良症细胞外基质重塑相关的关键转录程序、枢纽基因网络、免疫微环境特征,并预测潜在治疗药物 杜氏肌营养不良症患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据,以及体外炎症诱导的成纤维细胞模型 生物信息学 杜氏肌营养不良症 加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、体外验证 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
303 2026-04-30
Spatial Mapping of Single Cells via Correlation and Importance Between Cells and Spots
2026-Apr-29, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出SM-CI方法,通过细胞与斑点间的相关性和重要性进行单细胞空间定位 针对空间转录组学和单细胞RNA测序数据的缺失事件设计独特的填补策略,并引入斑点(或细胞)重要性评估标准,构建线性规划模型整合相关性与重要性度量,提高空间定位准确性 未提及具体限制条件 提高单细胞空间定位的准确性,以理解生物过程、疾病机制和治疗策略 模拟数据集和真实数据集中的细胞和空间斑点 机器学习 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 线性规划模型 基因表达数据,空间位置数据 模拟数据集和多个真实数据集 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
304 2026-04-30
Evaluation of Tissue from Patients with Prostate Cancer Identifies B7-H3 as an Androgen-Regulated, Broadly-Expressed, Combinatorial Therapeutic Target
2026-Apr-29, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组和蛋白质组学分析,评估B7-H3作为前列腺癌治疗靶点的潜力 首次整合大规模单细胞转录组图谱和PDX模型系统鉴定B7-H3在前列腺癌全病程中的均匀表达,并发现其受雄激素受体负调控,联合雄激素抑制可协同抑制肿瘤生长 未提供具体局限性信息 识别前列腺癌全病程中最具临床意义的表面靶点 前列腺癌组织样本、患者来源异种移植模型、细胞系 数字病理学 前列腺癌 单细胞转录组测序、蛋白质组学验证 NA 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 约100万个细胞及213名患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
305 2026-04-30
Prenatal exposure to polystyrene nanoplastics impairs offspring fertility in mice by disrupting meiotic recombination and chromatin accessibility in oocytes
2026-Apr-28, Archives of toxicology IF:4.8Q1
research paper 通过整合单细胞转录组学、染色质可及性分析和功能细胞实验,揭示产前暴露于聚苯乙烯纳米塑料通过破坏卵母细胞减数分裂重组和染色质可及性,损害后代生育能力 首次揭示环境纳米塑料通过表观遗传机制(组蛋白修饰改变和染色质可及性受限)损害减数分裂完整性,发现染色质重塑是纳米毒性的脆弱靶点,并鉴定出由染色质失调驱动的阻滞联会期卵母细胞凋亡和自噬亚群 研究仅采用小鼠模型和单一剂量(10 mg/kg/day),尚未在人类或其他物种中验证;仅关注卵巢和卵母细胞表型,未评估纳米塑料对雄性后代或其他组织的影响 阐明产前聚苯乙烯纳米塑料暴露对雌性后代生育能力的跨代影响及其分子机制 产前暴露于聚苯乙烯纳米塑料的母鼠及其雌性后代 machine learning NA 单细胞转录组学(scRNA-seq)、单细胞ATAC测序(scATAC-seq)、功能细胞实验 NA 基因表达数据、染色质可及性数据 小鼠模型:每日口服灌胃10 mg/kg/day聚苯乙烯纳米塑料的母鼠及其雌性后代 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
306 2026-04-30
Study on the pro-inflammatory mechanism mediated by the RANK-SPP1 axis in macrophage immunomodulation during atherosclerosis
2026-Apr-28, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本研究探讨RANK-SPP1信号轴在动脉粥样硬化巨噬细胞免疫调节中促进炎症的机制 首次发现RANK定义了一个促炎巨噬细胞亚群,并揭示RANK-SPP1轴作为巨噬细胞自主炎症放大器的全新信号通路 NA 阐明RANK分子在动脉粥样硬化中通过调控SPP1促进疾病进展的免疫调节机制 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 基因敲除动物实验, 组织学分析 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
307 2026-04-30
DiffBulk: Enhancing Spatial Transcriptomic Prediction with Diffusion-Based Training
2026-Apr-28, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1
研究论文 提出DiffBulk,一种基于条件扩散模型的两阶段框架,用于从H&E染色组织病理学图像预测空间转录组基因表达 首次将条件扩散模型用于基因表达预测,采用置换不变的开放嵌入基因编码器实现跨基因面板的统一训练,并融合病理基础模型表示以弥合领域差异 未明确提及局限性,但可能涉及对高质量Xenium数据的依赖以及计算开销 降低空间转录组学成本,通过深度学习从组织图像预测基因表达 H&E染色的组织病理学图像及其对应的空间转录组基因表达数据 计算病理学 癌症 空间转录组学、扩散模型 条件扩散模型 图像 来自HEST数据集和CrunchDAO挑战的Xenium ST数据,构建了平铺级别的伪批量数据集 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium原位分析
308 2026-04-30
Cyclin-dependent kinase-9 and oxidative phosphorylation inhibition overcome ibrutinib resistance in mantle cell lymphoma
2026-Apr-28, Cancer research communications IF:2.0Q3
研究论文 本研究探讨了周期蛋白依赖性激酶9抑制剂AZD4573在克服套细胞淋巴瘤伊布替尼耐药中的作用,并发现联合氧化磷酸化抑制可增强疗效 首次揭示CDK9抑制通过下调MYC和MCL1克服伊布替尼耐药,但会导致氧化磷酸化代偿性上调;联合OxPhos抑制剂可协同增强抗肿瘤活性 动物模型(PDX)中生存期延长有限,且OxPhos上调提示肿瘤代谢重编程仍需进一步优化联合策略 评估CDK9抑制剂AZD4573在伊布替尼耐药套细胞淋巴瘤中的疗效及其与氧化磷酸化抑制的协同作用 套细胞淋巴瘤亲本及伊布替尼耐药细胞系、原代MCL细胞、伊布替尼耐药PDX小鼠模型及临床试验患者外周血单核细胞 机器学习 套细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 1例应答患者和2例难治患者的外周血单核细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
309 2026-04-30
A de novo C-terminal truncation mutation in NUP205 as a key factor in premature ovarian insufficiency
2026-Apr-28, Human reproduction (Oxford, England)
研究论文 本研究通过全外显子测序、大规模队列分析和功能验证,发现NUP205基因的一个新发C端截断突变(p.R1054*)是导致早发性卵巢功能不全的关键因素 首次发现NUP205基因突变作为早发性卵巢功能不全的遗传致病因素,通过体内外模型揭示了NUP205缺陷导致核孔复合体结构异常和卵子发生障碍的机制 虽然在大规模队列中鉴定了额外NUP205变异,但这些特定变异的详细分子机制仍需进一步研究 探究NUP205缺陷是否由新发截断突变引起,并阐明其在早发性卵巢功能不全发病机制中的作用 中国家族性早发性卵巢功能不全患者、COV434人卵巢颗粒细胞系、nup205 (p.R1057*) 截断斑马鱼模型 数字病理学 早发性卵巢功能不全 全外显子测序, siRNA敲低, CRISPR/Cas9基因编辑 COV434细胞系, 斑马鱼动物模型 测序数据, 图像, 蛋白质结构数据 1个核心家系和1030例早发性卵巢功能不全病例的队列 Illumina 全外显子测序, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
310 2026-04-30
Spatial transcriptomics atlas of inflammatory bowel disease to guide implementation in research consortiums and clinical trials
2026-Apr-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用来自非疾病对照和溃疡性结肠炎或克罗恩病患者的超过100个肠道组织切片,构建了一个包含超过三百万个细胞的空间解析图谱,并系统评估了两种基于成像的空间转录组学平台 首次在多中心炎症性肠病研究中对CosMx和Xenium两种空间转录组平台进行系统比较,发现CosMx在检测效率和数据稳定性方面优于Xenium,并识别出疾病亚型中调节性T细胞相关的生物学特征 未提及具体局限性 为炎症性肠病的空间转录组学技术在多中心研究和临床试验中的实施提供技术基准 非疾病对照及溃疡性结肠炎或克罗恩病患者的肠道组织样本 数字病理学 炎症性肠病 空间转录组学 NA 图像 超过100个肠道组织切片,包含三百万个细胞 NanoString, 10x Genomics 空间转录组学 CosMx, Xenium CosMx与Xenium基于成像的空间转录组平台
311 2026-04-30
The role of Pth1r in posterior cranium cartilage regulation and craniosynostosis
2026-Apr-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究Pth1r在颅后软骨调节和颅缝早闭中的作用 首次揭示甲状旁腺激素1受体(Pth1r)在颅骨发育中的软骨调节作用及其缺失通过Ihh信号过度激活导致颅缝早闭的机制 可能未涵盖所有细胞类型或人类疾病模型的验证 阐明瞬时软骨在颅缝早闭形态发生破坏中的作用及其分子调控机制 小鼠颅骨间充质和软骨细胞 数字病理学 颅缝早闭 条件性基因敲除、批量RNA-seq、单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 小鼠样本,具体数量未提供 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
312 2026-04-30
Immunological and prognostic impact of NRF2 in high grade serous ovarian cancer
2026-Apr-28, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本研究分析了NRF2在高浆液性卵巢癌(HGSOC)中的免疫学和预后影响 首次基于NRF2水平对HGSOC进行分类,并发现了新的生物标志物,建议通过IHC标记和基因组评估NRF2及免疫标记物以改善预后 未明确提及,但可能受限于样本量较小(scRNA-seq n=7,bulk RNA-seq n=365,TMA n=240)和仅针对一种癌症类型 研究NRF2对HGSOC肿瘤免疫微环境的影响及其预后相关作用 高浆液性卵巢癌(HGSOC)患者样本 机器学习 卵巢癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、组织微阵列 NA 基因表达数据 scRNA-seq 7例,bulk RNA-seq 365例,TMA 240例 Illumina 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 Illumina NovaSeq NA
313 2026-04-30
Divide-and-conquer analysis reveals hidden immune cell influencers across the placenta in preeclampsia
2026-Apr-28, BioData mining IF:4.0Q1
研究论文 通过分治分析法揭示子痫前期胎盘中的隐藏免疫细胞影响因子 构建了人类胎盘多层图谱,设计基于免疫相互作用频率和免疫耐受影响因子的概念模型,应用机器学习分类器识别子痫前期相关基因特征 未明确提及临床样本量限制或进一步验证的需求 探索子痫前期中免疫失调的潜在机制,绘制胎盘免疫图谱并识别疾病特异性免疫信号通路 正常和重度子痫前期妊娠的胎盘组织及其多层结构(绒毛、蜕膜等) 机器学习 子痫前期 单细胞RNA测序 机器学习分类器 单细胞转录组数据 NA(未明确样本数量) NA(未明确提及测序平台公司) 单细胞RNA测序 NA(未明确平台产品) NA(无具体配置细节)
314 2026-04-30
Integrating single-cell transcriptomics and machine learning to predict breast cancer prognosis and immunotherapy sensitivity: a study based on proliferating T cells
2026-Apr-28, World journal of surgical oncology IF:2.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
315 2026-04-30
Integration of Spatiotemporal Multi-Omics in Peach Fruit Unravels a Metabolic Niche and the Genetic Basis of Trichome-Mediated Stress Adaptation
2026-Apr-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 整合空间转录组学与质谱成像技术构建桃果实早期发育的多维图谱,揭示代谢区室化与毛状体介导的抗逆遗传基础 首次构建蔷薇科水果的空间分辨多组学资源,并鉴定出Prupe.7G196500为整合茉莉酸信号促进毛状体发育与抗旱性的新型候选调控因子 对早期器官发生的系统层面理解仍有限,且研究仅针对单一物种及其变种 研究桃果实早期发育过程中基因表达与代谢的时空协调机制及其遗传基础 桃果实及其光滑变种油桃 数字病理学 NA 空间转录组学, 质谱成像 NA 基因表达数据, 代谢物数据 NA NA 空间转录组学, 质谱成像 NA NA
316 2026-04-30
Endothelial cell-derived plasminogen activator inhibitor-1 potentiates thrombosis in antiphospholipid syndrome
2026-Apr-27, Journal of autoimmunity IF:7.9Q1
研究论文 本研究揭示了内皮细胞来源的纤溶酶原激活物抑制剂-1在抗磷脂综合征中促进血栓形成的作用机制 首次通过单细胞RNA测序明确APS患者内皮细胞中PAI-1表达上调,并发现PAI-1抑制剂可缓解小鼠血栓,提出PAI-1抑制作为APS治疗新靶点 研究主要基于小鼠模型和体外实验,PAI-1抑制剂的临床疗效需进一步验证 探讨内皮细胞来源的PAI-1在APS血栓形成中的角色及治疗潜力 APS患者皮肤活检组织、血浆样本、人微血管内皮细胞及小鼠模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、ELISA、定量PCR NA 基因表达数据、血浆检测数据 167例APS患者、37例抗磷脂抗体阳性携带者、18例非APS血栓患者、48例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
317 2026-04-30
Dissecting the cellular architecture of breast cancer brain metastases reveals prognostically distinct immune landscapes
2026-Apr-27, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过多模态分析揭示乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性,并识别出可预测患者生存的两种免疫景观 首次对大规模乳腺癌脑转移队列(156例)进行多模态免疫微环境分析,发现两种免疫景观(CD8组织驻留记忆T细胞高占比和三级淋巴结构)可预测患者生存,且无法从配对原发肿瘤推导 未提及 解析乳腺癌脑转移的免疫微环境异质性及对免疫治疗的敏感性 156例乳腺癌脑转移患者的组织样本 数字病理学 乳腺癌 组织细胞术,批量RNA测序,单核RNA测序,流式细胞术,空间转录组学 NA 基因表达数据,组织图像 156例乳腺癌脑转移患者 NA 批量RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
318 2026-04-30
An SPP1-SOCS1 pathway constrains interferon responses in tumor-associated macrophages and shapes an immunosuppressive tumor microenvironment
2026-Apr-27, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 揭示SPP1-SOCS1通路在肿瘤相关巨噬细胞中抑制干扰素反应并塑造免疫抑制性肿瘤微环境 首次发现SPP1通过TRIM21与SOCS1相互作用,干扰SOCS1泛素化,稳定SOCS1介导的负反馈,从而抑制IFN-γ-STAT1-ISG信号通路,并证明靶向SPP1可增强免疫检查点阻断治疗疗效 未在临床样本中验证靶向SPP1的疗效,主要依赖小鼠模型和公共scRNA-seq数据 探讨肿瘤相关巨噬细胞如何导致免疫检查点阻断治疗无响应,并寻找改善策略 肿瘤相关巨噬细胞,特别是SPP1阳性亚群 机器学习 多种癌症 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 12种癌症类型的公共scRNA-seq数据集,以及小鼠模型(具体样本量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
319 2026-04-30
Diverse high-fat diets drive multi-omic reprogramming that persists after dietary reversal
2026-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过纵向多组学资源研究多种高脂饮食对宿主和微生物组的重编程作用,以及饮食逆转后的持续影响 首次系统研究不同脂肪来源的高脂饮食对宿主-微生物组互作组的长期影响,并发现饮食逆转后仍存在“微生物组记忆”效应 仅在小鼠模型中开展,未涉及人类研究;逆转后观察窗口有限,部分特征恢复不完全 阐明高脂饮食的脂肪来源如何调节宿主生理和肠道微生物组,并评估这些变化在饮食逆转后的恢复程度 小鼠(C57BL/6)及其肠道微生物组、肠道上皮细胞 数字病理学, 机器学习 代谢性疾病 宏基因组测序, 代谢组学, 脂质组学, 单细胞RNA测序 NA 粪便宏基因组数据, 粪便代谢组数据, 血浆代谢组和脂质组数据, 肠道单细胞RNA测序数据 多组小鼠,包括对照饮食组、七种不同脂肪来源的高脂饮食组及饮食逆转组,样本量具体未明确 Illumina, 10x Genomics 宏基因组测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 脂质组学 Illumina NovaSeq, 10x Chromium 采用Illumina NovaSeq进行宏基因组测序,10x Chromium进行肠道单细胞RNA测序
320 2026-04-30
Transcriptomic Analysis of Bovine Oocytes at GV and MII Stages and Dynamic Changes in Key Gene Expression Patterns
2026-Apr-21, Biology
研究论文 利用单细胞RNA测序分析牛卵母细胞在GV和MII阶段的转录组差异及关键基因表达动态变化 通过单细胞RNA测序揭示牛卵母细胞GV与MII阶段间基因表达的显著差异,并锁定能量代谢和信号通路相关基因的关键作用 NA 探究牛卵母细胞成熟过程中不同阶段的基因表达变化 牛卵母细胞(生发泡期和第二次减数分裂中期) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序, RT-qPCR NA RNA测序数据 牛卵母细胞样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部