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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2026-05-02 |
SIRT7-mediated H3K79 desuccinylation modulates functional activities of goat ovarian granulosa cells
2026-Apr-27, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学与分子功能实验结合,探索SIRT7介导的H3K79去琥珀酰化对山羊卵巢颗粒细胞功能活性的调控作用 | 首次发现SIRT7通过调控组蛋白H3K79琥珀酰化水平影响颗粒细胞自噬与凋亡,并鉴定TMEM74为潜在关键下游因子 | 具体分子机制仍需进一步深入研究 | 揭示SIRT7相关组蛋白琥珀酰化在山羊卵巢颗粒细胞功能稳态维持中的表观遗传机制 | 山羊卵巢颗粒细胞 | 机器学学习 | 生殖衰老 | 单细胞RNA测序、转录组分析、位点特异性组蛋白突变体 | NA | 单细胞基因表达数据、转录组数据 | 山羊卵巢颗粒细胞(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 242 | 2026-05-02 |
A macrophage co-expression signature enables robust prognostic prediction in glioblastoma
2026-Apr-25, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102784
PMID:42035563
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研究论文 | 通过整合单细胞巨噬细胞异质性与共表达网络模型,构建了针对胶质母细胞瘤的巨噬细胞共表达衍生风险评分,并揭示SPP1作为关键巨噬细胞效应分子的作用 | 首次结合单细胞转录组数据与共表达网络分析,构建了巨噬细胞共表达衍生风险评分,并系统验证了该评分在多个独立队列中的预后分层能力及免疫治疗相关意义 | 未提及具体局限性,但基于方法学可推测可能包括单细胞数据整合的批次效应、虚拟敲除分析的预测性而非验证性、及功能验证仅限于细胞系层面 | 阐明巨噬细胞状态特异性转录程序与共表达网络如何整合影响胶质母细胞瘤患者预后及免疫治疗相关表型 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的巨噬细胞亚群及其相关调控程序和共表达网络 | 机器学习和生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA-seq | 多算法机器学习框架(具体模型未明确) | 基因表达数据 | 多个独立队列,包括TCGA、CGGA和GEO数据库(具体样本量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 243 | 2026-05-02 |
Comprehensive single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and immune interactions in colorectal cancer
2026-Apr-22, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102761
PMID:42024995
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序对结直肠癌组织进行综合分析,揭示了细胞异质性和免疫相互作用 | 通过单细胞RNA测序识别了六个主要细胞群,并在T_NK细胞中定义了四个不同亚群,使用CytoTRACE和Monocle伪时间分析揭示了分化潜力差异,结合年龄相关基因构建预后模型,并通过免疫算法和肿瘤突变负荷分析揭示了免疫复杂性 | 未说明 | 研究结直肠癌的细胞异质性和免疫相互作用,以支持靶向和个性化治疗 | 结直肠癌组织中的18,741个单个细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 18,741个单个细胞来自结直肠癌组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 244 | 2026-05-02 |
Characterization of a pancreatic cancer GWAS signal suggests PDX1 buffers stress in the exocrine pancreas
2026-Apr-15, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.04.13.26350790
PMID:42064940
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研究论文 | 该研究表征了胰腺癌GWAS信号,发现PDX1在胰腺外分泌部分中缓冲压力的作用 | 首次将chr13q12.2 GWAS风险位点中的rs9581943变异与PDX1表达调控联系起来,阐明PDX1在减轻外分泌胰腺细胞压力及维持上皮细胞稳态中的作用 | 基于细胞系和单细胞转录组分析,缺乏体内或动物模型的功能验证 | 功能表征胰腺导管腺癌GWAS风险位点chr13q12.2的因果变异及其生物学机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)相关的遗传风险位点 | 机器学习 | 胰腺癌 | GWAS, CRISPR/Cas9编辑, 荧光素酶报告基因检测, 电泳迁移率变动分析, 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 新生儿、成年及慢性胰腺炎供体的胰腺外分泌细胞;胰腺肿瘤样本 | 10x Genomics | 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单核RNA测序及单细胞RNA测序 |
| 245 | 2026-05-02 |
TopClust: Topological-based analysis of scRNA-seq data for data-driven identification of clusters and core cluster cells
2026-Apr-14, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.04.010
PMID:41981916
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研究论文 | 提出基于拓扑数据分析的scRNA-seq聚类方法TopClust,实现无偏且可重复的细胞聚类 | 利用拓扑数据分析自动识别峰细胞和峰顶细胞,无需主观参数选择,通过方向向量投影鉴定簇特异性基因 | 未明确提及局限性,可能需在高维大数据集上验证计算效率 | 开发数据驱动的scRNA-seq聚类方法,减少人工偏差并提高细胞类型注释准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类与细胞类型鉴定 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 拓扑数据分析,共享最近邻模型 | 单细胞基因表达数据 | 基准数据集(肺癌细胞系和流式分选免疫细胞) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 246 | 2026-05-02 |
Aged automobile cabin air filters as secondary pollution sources: mechanistic insights into NLRP3 inflammasome activation and discovery of a natural inhibitor
2026-Apr-13, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-026-00674-9
PMID:41975463
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研究论文 | 本研究系统调查了汽车空调滤清器沉积颗粒物的差异毒性,揭示内侧颗粒因富集超细颗粒而毒性更强,并发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)可作为NLRP3炎症小体抑制剂 | 首次揭示汽车空调滤清器内外侧颗粒物的差异化毒性机制,发现超细颗粒物通过非活性氧途径激活NLRP3炎症小体并诱发细胞焦亡,并通过虚拟筛选发现天然环二肽Cyclo-(Tyr-Phe)作为新型NLRP3抑制剂 | 未提及具体局限性 | 探究汽车空调滤清器沉积颗粒物内外侧的差异毒性及其分子机制,并寻找天然抑制剂 | 汽车空调滤清器内外膜沉积颗粒物 | NA | 肺损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 247 | 2026-05-02 |
Disrupted glial-mediated synaptic refinement in Fragile X syndrome
2026-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717772
PMID:41993264
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研究论文 | 该研究揭示了在脆性X综合征中,胶质细胞介导的突触修剪过程被破坏的机制 | 首次通过多组学框架系统阐明FMRP缺失如何通过胶质细胞(小胶质细胞和星形胶质细胞)异常信号导致突触修剪失调,并发现EphA和semaphorin通路及脂质代谢变化在其中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;且仅聚焦于出生后第7天的关键窗口期,未探讨长期发育效应 | 探究FMRP缺失如何影响胶质细胞介导的突触修剪及其在脆性X综合征神经发育中的作用 | Fmr1基因敲除小鼠(FXS模型)的视网膜-膝状体通路 | 机器学习 | 脆性X综合征 | NGS, RNA-seq, 脂质组学 | 神经网络 | 图像, 文本 | 未明确说明样本量,涉及Fmr1敲除小鼠和野生型对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 脂质组学 | NA | NA |
| 248 | 2026-05-02 |
Multimodal profiling reveals Mycobacterium tuberculosis restricts lung mitochondrial immunometabolism to promote pathogenesis
2026-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.717012
PMID:41993288
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研究论文 | 通过多组学分析揭示结核分枝杆菌通过限制肺部线粒体免疫代谢促进致病机制 | 首次发现结核分枝杆菌通过丝氨酸蛋白酶Hip1抑制肺部线粒体氧化磷酸化,诱导持续糖酵解,破坏线粒体功能,从而促进致病性免疫;同时鉴定出与保护性结局相关的新型线粒体免疫代谢肺部特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证范围有限;早期事件的详细分子机制仍有待进一步探索 | 阐明结核分枝杆菌感染后早期肺部免疫环境如何决定保护性还是致病性结局 | 小鼠和人类受试者 | 机器学习 | 结核病 | 高维流式细胞术、单细胞转录组学、非靶向代谢组学 | NA | 多模态数据(流式细胞术数据、单细胞转录组数据、代谢组数据) | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠和人类样本 | NA | 单细胞转录组学、代谢组学 | NA | NA |
| 249 | 2026-05-02 |
Local IFNγ signaling contributes to the regenerative decline of aged alveolar progenitor cells
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.07.716929
PMID:41993319
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研究论文 | 研究发现老年肺泡干细胞再生能力下降与局部IFNγ信号传导有关,通过中和IFNγ或敲除免疫蛋白酶体可部分恢复其再生功能 | 首次揭示老年肺中局部IFNγ信号主动抑制肺泡再生,证明慢性炎性信号是年龄相关肺功能衰退的原因 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证不足,且未完全阐明IFNγ下游具体分子机制 | 探究老年肺泡II型细胞再生能力下降的机制 | 老年小鼠肺泡II型细胞及CD8+ T细胞 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞测序、类器官培养、基因敲除小鼠 | NA | 单细胞转录组数据、类器官图像数据 | 不同年龄小鼠模型(老年组与年轻组)的肺泡组织和细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2026-05-02 |
Serial Thermal Ablation Induces Abscopal Antitumor Immunity and Reveals Targetable CSF1R-Dependent Resistance in Pancreatic Cancer
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.713683
PMID:41993287
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研究论文 | 本研究探讨了连续热消融在胰腺导管腺癌中诱导的远隔抗肿瘤免疫效应及CSF1R依赖性耐药机制 | 首次揭示了连续射频消融能诱导全身性远隔抗肿瘤免疫应答,并识别出CSF1驱动的髓系免疫抵抗程序,提出联合免疫治疗策略可增强消融的系统性疗效 | 研究仅基于双侧肿瘤小鼠模型,尚未在人体中验证;CD8 T细胞耗竭实验虽证实关键作用,但其他免疫机制可能未被完全涵盖 | 探究热消融诱导全身抗肿瘤免疫的能力及限制该反应的机制,并开发有效的联合免疫治疗策略 | 双侧flank肿瘤小鼠模型中的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 射频消融, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 双侧flank肿瘤小鼠模型,具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 251 | 2026-05-02 |
Spatially Anchored Regulatory State Inference in Melanoma
2026-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.05.716552
PMID:41993479
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研究论文 | 提出一种空间锚定的调控状态推断框架,整合空间转录组与单细胞多组学数据,推断黑色素瘤组织中的空间分辨调控程序 | 首次将空间转录组与单细胞多组学数据结合,实现空间锚定的调控状态推断,并通过空间正则化细胞-点映射传播染色质可及性和转录因子基序活性 | 未提及具体局限性 | 开发一种模块化方法,整合空间转录组和单细胞多组学数据,以推断组织空间中的调控程序并评估其稳定性 | 黑色素瘤组织切片 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学、单细胞多组学 | GraphST | 空间转录组数据、单细胞多组学数据(染色质可及性、转录因子基序活性) | 黑色素瘤组织切片样本 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞多组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 252 | 2026-05-02 |
Emergent latent neurotoxic effects of manganese following nominal chronic exposures in human stem cell and Caenorhabditis elegans models
2026-Apr-07, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag040
PMID:42033779
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研究论文 | 本文通过人诱导多能干细胞和秀丽隐杆线虫模型,揭示了慢性锰暴露后出现的潜在神经毒性效应 | 首次在两种遗传和机制可操作的系统中证实,慢性锰暴露停止后会出现此前未检测到的潜在神经毒性效应,且其程度远超慢性锰暴露本身的影响 | 尚未明确潜在效应的具体分子机制,且需要进一步验证其在人体中的相关性 | 研究慢性锰暴露后潜在神经毒性效应的存在及机制 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物和秀丽隐杆线虫 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据和行为数据 | 人诱导多能干细胞衍生的皮层培养物(具体数量未明确)和秀丽隐杆线虫(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 253 | 2026-05-02 |
Human Lymph Node Cellular Senescence Atlas Reveals Age-Dependent Alteration in Germinal Center B Cell Function and Niches
2026-Apr-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.02.716161
PMID:41993351
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research paper | 通过整合单细胞和空间多组学技术,系统描绘了人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老图谱,揭示了衰老过程中生发中心B细胞功能及生态位的年龄依赖性变化 | 首次构建人类淋巴结衰老相关免疫状态的空间多组学图谱,结合单细胞转录组、空间蛋白质组、转录组、表观基因组和代谢成像,揭示了衰老细胞类型的空间异质性和从滤泡外到生发中心的逐步定位转变 | 未提供具体局限性信息 | 系统描述人类淋巴结中与年龄相关的细胞衰老状态及其对免疫微环境的影响 | 人类淋巴结组织,来自18至100岁供体 | digital pathology | geriatric disease | 单细胞转录组学、高多重免疫荧光、空间转录组学、空间表观基因组学、代谢成像 | NA | 单细胞转录组数据、空间蛋白质组数据、空间转录组数据、空间表观基因组数据、代谢成像数据 | 单细胞转录组:来自18-100岁供体;空间蛋白质组:51名供体(18-86岁)的99个淋巴结切片,约2000万个细胞 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 254 | 2026-05-02 |
Thymic stromal lymphopoietin promotes ozone-induced inflammation in the airway
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0281OC
PMID:41025995
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research paper | 本研究探讨了胸腺基质淋巴细胞生成素(TSLP)在臭氧诱导的气道炎症中的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序发现TSLP通过调节cDC1细胞中Fscn1的表达促进臭氧诱导的中性粒细胞性气道炎症 | 未涉及人体样本验证,且具体分子通路细节尚需进一步探索 | 阐明TSLP在臭氧诱导的2型低炎症表型气道高反应性和中性粒细胞炎症中的作用 | BALB/c小鼠、TSLP受体缺陷小鼠、Batf3缺陷小鼠以及骨髓来源的cDC1细胞 | machine learning | 哮喘、气道炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多组小鼠(如BALB/c、TSLP受体缺陷、Batf3缺陷)每组至少6只,具体数量未详细说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 255 | 2026-05-02 |
Temporal modulation of microglial repopulation attenuates retinal degeneration in retinitis pigmentosa
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107295
PMID:41690604
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研究论文 | 探究时间性调控小胶质细胞再增殖在视网膜色素变性中对视网膜变性的缓解作用 | 首次发现小胶质细胞再增殖的时间依赖性表型可塑性,并提出两轮连续清除-再增殖策略以维持小胶质细胞稳态并保护视功能 | 研究主要基于rd10小鼠模型,需进一步验证在人类RP中的适用性;长期再增殖小胶质细胞恢复促炎表型的机制未完全阐明 | 评估时间性调控小胶质细胞清除与再增殖对视网膜色素变性小鼠模型视网膜变性的影响及其治疗潜力 | rd10小鼠视网膜小胶质细胞 | 机器学习 | 视网膜色素变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | rd10小鼠视网膜样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2026-05-02 |
Multi-omics analysis of the lactylation-driven microenvironment and non-invasive clinical translation in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-11016-w
PMID:41699363
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研究论文 | 通过整合多组学策略,研究赖氨酸乳酸化驱动的微环境及非侵入性临床转化在肝细胞癌中的价值 | 首次构建基于赖氨酸乳酸化的风险模型,并整合超声影像组学实现非侵入性预测,揭示乳酸化驱动的免疫抑制微环境与增殖性肿瘤表型 | 未在独立大规模外部队列中验证模型普适性,超声影像组学参数可能受设备差异影响 | 探究乳酸化相关风险模型在肝细胞癌中的临床预后评估及非侵入性预测潜力 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝癌 | 多组学分析, 免疫组化, Western blot, 单细胞测序, 超声影像组学 | 风险模型, 影像组学模型 | 转录组, 蛋白质组, 乳酸化修饰组, 单细胞测序数据, 超声图像 | 本地队列及公开肝癌队列(具体数量未提及) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 257 | 2026-05-02 |
Aberrant medial ganglionic eminence (MGE) GABAergic neurogenesis contributes to Huntington's disease pathogenesis
2026-04, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107297
PMID:41654201
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研究论文 | 利用BACHD小鼠模型揭示内侧神经节隆起(MGE)来源的GABA能神经发生异常是亨廷顿病发病机制的关键发育机制 | 首次通过单细胞转录组分析和谱系特异性遗传挽救实验,证明MGE神经发生早期功能障碍是HD发病机制中的关键发育事件,并发现基础中间祖细胞是突变亨廷顿蛋白的主要易感细胞群 | 论文未提及相关局限性 | 探究MGE来源的GABA能神经元发育异常对亨廷顿病发病机制的影响 | BACHD小鼠模型及E12.5天MGE祖细胞 | 机器学习 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多只BACHD小鼠及其对照,包括E12.5、出生后第13天和第30天样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2026-05-02 |
Direct Cardiac Reprogramming in the Omics Era: Advances, Mechanisms, and Applications
2026-Apr, Cellular reprogramming
IF:1.2Q4
DOI:10.1177/21524971261427184
PMID:41766575
|
综述 | 本文综述组学时代中心脏直接重编程的进展、机制与应用 | 整合多组学(单细胞转录组、表观基因组、蛋白组、代谢组)研究,系统揭示成纤维细胞向诱导心肌样细胞转化的屏障与促进因子 | 未提及具体局限性,但作为综述可能缺乏原始实验验证 | 总结组学方法对直接心脏重编程机制的理解,并讨论其临床应用前景 | 成纤维细胞转化为诱导心肌样细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞转录组学, 表观基因组学, 蛋白组学, 代谢组学 | NA | NA |
| 259 | 2026-05-02 |
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-Apr, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1014150
PMID:42008567
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研究论文 | 探究早期生命阶段细胞毒性CD8 T细胞不足导致对小鼠巨细胞病毒肺部感染保护作用受限的机制 | 首次揭示新生儿期CD8 T细胞启动缺陷是导致早期肺巨细胞病毒疾病高风险的关键因素 | 未明确具体分子机制及人类相关性需进一步验证 | 阐明早期生命阶段抗巨细胞病毒T细胞免疫反应差异的机制 | 新生期和成年期小鼠的巨细胞病毒特异性T细胞反应 | 免疫学 | 巨细胞病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及过继转移实验样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 260 | 2026-05-02 |
Single cell omics identify an anti-inflammatory niche in macrophages of mild to moderate chronic obstructive pulmonary disease
2026-Apr-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0134OC
PMID:41071173
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研究论文 | 通过单细胞组学分析,发现轻中度慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞存在抗炎微环境 | 首次发现并定义了一种名为间质COPD相关巨噬细胞(ICM)的新亚群,并揭示了SCGB3A2-MARCO通路在轻中度COPD中的抗炎保护作用 | 研究仍处于发现阶段,ICM在COPD中的具体功能机制及临床转化潜力尚未完全阐明 | 探究轻中度慢性阻塞性肺疾病中巨噬细胞和分泌细胞的协同抗炎作用 | 轻中度COPD患者和对照组的肺组织样本 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | Microwell-seq, 微流控单细胞RNA测序, snHH-seq, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 轻中度COPD患者和对照组的肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | Microwell-seq平台, 微流控单细胞RNA测序平台, snHH-seq平台 | Microwell-seq用于单细胞转录组分析,微流控单细胞RNA测序用于小鼠验证,snHH-seq用于人重度COPD肺组织总RNA测序 |