单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202604-202604] [清除筛选条件]
当前共找到 945 篇文献,本页显示第 241 - 260 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
241 2026-06-23
Roles of mitophagy and immune infiltration in Parkinson's disease: new perspectives from bioinformatics analysis and A53T transgenic mice
2026-Apr-17, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.] IF:4.8Q2
研究论文 通过生物信息学分析和A53T转基因小鼠模型,研究线粒体自噬和免疫浸润在帕金森病中的作用 首次结合单细胞RNA测序和A53T转基因小鼠模型,鉴定出五个关键线粒体自噬相关差异表达基因,并发现它们在中枢神经系统和免疫细胞中均有异常表达 未提及具体局限性 阐明线粒体自噬在帕金森病发病和进展中的精确机制 帕金森病患者样本和α-突触核蛋白A53T转基因小鼠 数字病理学 帕金森病 RNA测序,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 两个单细胞RNA测序数据集(GSE178265和PRJNA1145007),以及A53T转基因小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
242 2026-06-23
18-β-glycyrrhetinic acid facilitates nuclear-mitochondrial communications to alleviate oxidative stress through HMGB1-cGAS-Mul1 axis in tendinopathy
2026-Apr-17, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了18-β-甘草次酸通过HMGB1-cGAS-Mul1轴减轻肌腱病中氧化应激的机制 首次揭示了GA通过诱导HMGB1甲基化(由甲基转移酶DOT1L催化)促进cGAS与线粒体E3泛素连接酶Mul1相互作用,从而降解cGAS,调控核-线粒体通讯减轻氧化应激的新机制 未提及具体局限性 阐明18-β-甘草次酸缓解肌腱病的分子机制,重点关注其对氧化应激下HMGB1-cGAS-STING轴和NLRP3炎症小体活化的调控 肌腱病大鼠模型、H₂O₂诱导的肌腱干细胞氧化应激模型 机器学习和数字病理 肌腱病 单细胞RNA测序、蛋白质组学 NA 基因表达数据、蛋白质组数据 临床样本(具体数量未提及)、大鼠组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
243 2026-06-23
Biomimetic KeMA hydrogel encapsulating CAP-EVs-MEF2C for inhibiting inflammation and senescence in intervertebral disc degeneration
2026-Apr-17, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 开发一种封装MEF2C过表达巨噬细胞来源的软骨亲和肽修饰细胞外囊泡的KeMA水凝胶,用于通过调控MEF2C/P21/CDK2轴抑制椎间盘退变中的炎症和衰老 首次利用单细胞RNA测序鉴定MEF2C为关键调控因子,并设计CAP修饰的EVs结合KeMA水凝胶实现靶向递送和缓释,同时调控软骨终板软骨细胞炎症和髓核细胞衰老 未提及具体局限性 开发一种仿生系统以抑制椎间盘退变中的炎症和细胞衰老 软骨终板软骨细胞和髓核细胞 数字病理学 椎间盘退变 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未提及具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
244 2026-06-23
Transcriptional programming of early-forming memory B cells arises independently of cognate CD4+ T-cell interactions
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 通过MHCII敲除小鼠模型,研究早期记忆B细胞在缺乏CD4+ T细胞相互作用下的转录编程机制 首次揭示早期记忆B细胞的转录编程独立于CD4+ T细胞相互作用,证明其在无T细胞辅助下仍可形成多样化群体 未分析T细胞非依赖记忆B细胞在长期免疫记忆维持中的功能差异 探究CD4+ T细胞相互作用对T细胞非依赖记忆B细胞分子编程和多样性的影响 流感病毒感染后形成的记忆B细胞 免疫学 流感感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 转录组分析 NA 基因表达数据 MHCII敲除小鼠与野生型小鼠的B细胞样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台
245 2026-06-23
Mapping the Cell-Cell Interactions in Cardiovascular Diseases: A Single-Cell Atlas Perspective
2026-Apr-14, Korean circulation journal IF:3.0Q2
综述 基于单细胞图谱视角,综述心血管疾病中细胞间相互作用的改变及其发病机制 通过单细胞和空间转录组学技术系统构建人类心脏和血管细胞图谱,推断配体-受体分析介导的细胞间通讯,揭示疾病特异性信号通路改变 未提及具体局限性 总结心血管疾病中细胞间相互作用的主要变化,阐明失调信号网络在心肌病、心肌梗死和心力衰竭中的作用 心血管细胞(心肌细胞、内皮细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞和免疫细胞) 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
246 2026-06-23
A Protocol for Harvesting Single-cell Suspension from Mouse Corneas
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 建立了一种从小鼠角膜中制备高质量单细胞悬液的稳健方案 提出了一种独特的通过胶原酶A和胰蛋白酶顺序消化从小鼠角膜组织制备单细胞悬液的方法,确保了高细胞数量和优良活性 未提及局限性 解决角膜组织因结构致密而难以制备高质量单细胞悬液的问题 小鼠角膜 数字病理学 NA scRNA-seq, 胶原酶A消化, 胰蛋白酶消化 NA 单细胞悬液 多只小鼠角膜 NA 单细胞RNA测序 NA NA
247 2026-06-23
Mapping Infant Immunity with Minimal Input: Integrative Single-cell and Multiomic Profiling
2026-Apr-03, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 针对新生儿血量极少的限制,开发了优化方案,通过整合流式细胞术、蛋白质组学和单细胞RNA测序,从微量血液中获取高维度免疫数据,揭示早期生命免疫的独特轨迹 提出了利用极少量新生儿血液进行高维免疫分析的综合方案,实现了纵向采样和多组学整合,弥补了新生儿免疫研究中的关键空白 研究中提到的极低出生体重和极早早产儿的血液样本量限制仍然是挑战,且方案在更大人群中的验证可能受限于样本可获得性 建立从微量新生儿血液中进行高分辨率免疫分析的方法,揭示早期生命免疫系统的动态变化 新生儿血液中的循环免疫细胞 NA NA 流式细胞术、蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 转录组和蛋白质组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
248 2026-06-23
Fibroblast-Driven Fibroblast Growth Factor and Fibronectin 1 Signaling Orchestrates Extracellular Matrix Remodeling for Ovine Mammary Lactation Decline
2026-Apr, Comprehensive Physiology IF:4.2Q1
研究论文 本研究整合了绵羊泌乳高峰和晚期单细胞RNA测序数据,揭示了成纤维细胞驱动的FGF和FN1信号通路在细胞外基质重塑和泌乳衰退中的作用 首次在绵羊乳腺中通过单细胞转录组学揭示成纤维细胞作为基质调控枢纽,通过FGF和FN1信号通路协调ECM重塑,并发现与人类保守的转录程序 未涉及功能验证实验,跨物种比较仅限于转录水平,缺乏对信号通路的直接干扰验证 阐明绵羊泌乳衰退过程中乳腺细胞外基质重塑的细胞和分子机制 泌乳高峰和晚期绵羊乳腺组织中的多种细胞类型,包括成纤维细胞、免疫细胞和内皮细胞 数字病理学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 未指定具体样本数量,但涉及泌乳高峰和晚期两个阶段的绵羊乳腺样本 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
249 2026-06-23
Limited protection against early-life lung murine cytomegalovirus infection results from deficiency of cytotoxic CD8 T cells
2026-Apr, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 该研究通过小鼠巨细胞病毒呼吸道感染模型和过继性T细胞转移,揭示了早期生命阶段CD8 T细胞毒性缺陷导致抗病毒保护不足的机制 首次通过单细胞RNA测序分析早期生命阶段MCMV特异性CD8 T细胞的分化,发现新生儿期αβ T细胞普遍缺陷导致效应T细胞功能不全 研究基于小鼠模型,结果向人类CMV感染的转化需进一步验证 阐明早期生命阶段抗巨细胞病毒T细胞免疫的差异机制 新生和成年小鼠的呼吸道巨细胞病毒感染模型 数字病理学 巨细胞病毒感染 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 未明确说明样本量 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'试剂盒
250 2026-06-22
Inferring gene-regulatory networks using epigenomic priors
2026-Apr-17, iScience IF:4.6Q1
研究论文 利用表观基因组先验网络提高基因调控网络推断的准确性 通过整合DNA甲基化、染色质可及性和组蛋白修饰等多组学数据构建表观基因组先验网络,显著提升基因调控网络推断精度,且发现DNA甲基化数据在推断先验网络时比染色质可及性数据覆盖更多基因 未说明 开发基于表观基因组先验网络的基因调控网络推断方法并验证其有效性 12项不同研究的数据集,包括人类胚胎发育和乳腺癌风险女性的样本 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、染色质可及性测序、组蛋白修饰测序 基因调控网络推断模型 基因表达数据、表观基因组数据 12项研究的公开数据集 NA 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、染色质可及性测序 NA NA
251 2026-06-22
DJ-1 inhibition reshapes tumor microenvironment and potentiates immune checkpoint inhibitors
2026-Apr-10, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 发现DJ-1作为T细胞负调控因子,抑制DJ-1通过调控巨噬细胞重编程增强抗肿瘤免疫并提高免疫检查点抑制剂疗效 首次揭示DJ-1通过调控巨噬细胞ROS/NF-κB/STAT3信号通路重编程肿瘤微环境,间接激活T细胞,并验证双硫仑作为DJ-1抑制剂可有效增强PD-1阻断抗肿瘤效果 主要为小鼠模型研究,临床转化仍需进一步验证 探索DJ-1作为免疫检查点抑制剂增敏靶点的潜力及机制 DJ-1基因敲除小鼠及荷瘤模型、肿瘤浸润CD45细胞、巨噬细胞 机器学习 癌症 单细胞测序 NA 单细胞基因表达数据 小鼠模型(具体样本量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 用于肿瘤浸润CD45细胞单细胞测序
252 2026-06-20
GPR56 Outperforms CD319 as a Discriminative Marker for CD4 + Cytotoxic T Lymphocytes and Is Elevated in Primary Sjögren's Syndrome
2026-04, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨GPR56和CD319作为CD4+细胞毒性T淋巴细胞表面标志物的潜力,并发现GPR56在原发性干燥综合征中升高 首次识别GPR56作为CD4 CTL的新型表面标志物,并揭示其在原发性干燥综合征中的功能相关性 未提及研究的局限性,可能包括样本量较小或机制探索不足 鉴定CD4 CTL的表面标志物并评估其在自身免疫疾病中的意义 CD4+细胞毒性T淋巴细胞和原发性干燥综合征患者 数字病理学 干燥综合征 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 原发性干燥综合征患者样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
253 2026-06-20
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2026-04, Immunology IF:4.9Q2
研究论文 研究发现MyD88缺陷通过影响树突状细胞和T细胞保护小鼠免受实验性自身免疫性脑脊髓炎 首次通过单细胞RNA测序重新分析多发性硬化症患者数据,揭示了MyD88在树突状细胞和CD4 T细胞中的显著上调,并证明MyD88缺陷通过影响DC成熟、促炎因子产生及Th1/Th17分化来减轻神经炎症 MyD88在EAE不同细胞类型中的具体贡献仍不完全清楚 探究MyD88信号通路在多发性硬化症及其动物模型的发病机制中在不同细胞类型中的具体作用 多发性硬化症患者外周血单核细胞来源的树突状细胞和CD4 T细胞,以及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型中的树突状细胞和T细胞 自然语言处理 多发性硬化症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多发性硬化症患者样本及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
254 2026-06-19
Integrating single-cell RNA and bulk RNA sequencing data to identify prognostic genes associated with pyrimidine metabolism in triple-negative breast cancer by machine learning algorithm combinations
2026-Apr-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合单细胞RNA和批量RNA测序数据,利用机器学习算法组合识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因 采用101种机器学习算法组合构建风险模型,并结合单细胞RNA测序分析探索与预后基因表达相关的细胞类型 数据均来自公共数据库,未提及外部验证队列的多样性或前瞻性验证 识别三阴性乳腺癌中与嘧啶代谢相关的预后基因并构建风险模型 三阴性乳腺癌的基因表达数据和患者预后信息 机器学习 三阴性乳腺癌 RNA测序 机器学习算法组合 基因表达数据 来自公共数据库的三阴性乳腺癌样本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
255 2026-06-19
Integration of 117 machine learning algorithms and single-cell transcriptomics identifies macrophage polarization and ER stress signatures for cancer prognosis and precision therapy
2026-Apr-30, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合117种机器学习算法和单细胞转录组学,识别巨噬细胞极化和内质网应激特征用于癌症预后和精准治疗 首次系统性地在泛癌水平分析巨噬细胞极化和内质网应激相关基因,并利用117种机器学习算法组合开发出稳健的预后特征 未提及具体限制 探究巨噬细胞极化和内质网应激相关基因在癌症进展和治疗抵抗中的作用,并开发预后标志物和精准治疗策略 33种癌症类型的多组学数据,包括TCGA、GTEx、CCLE以及单细胞RNA测序数据集中的86,378个细胞 机器学习 肺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习算法组合(117种) 文本 86,378个单细胞(来自多种癌症类型) NA 单细胞RNA测序 NA NA
256 2026-06-19
Identification and validation of an intratumor heterogeneity-related prognostic signature in triple-negative breast cancer: a study based on integrative machine learning and single-cell sequencing
2026-Apr-25, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 本研究结合机器学习和单细胞测序,构建并验证了三阴性乳腺癌中基于肿瘤内异质性的预后签名,提高了预后预测准确性 创新性地结合十种机器学习算法和单细胞测序技术,构建了包含七个基因的肿瘤内异质性相关预后签名,并验证了其对免疫治疗反应的预测能力 该研究主要基于公共数据库,未说明外部前瞻性验证样本的获取情况 开发并验证基于肿瘤内异质性的三阴性乳腺癌预后签名,以改进风险分层和治疗反应预测 三阴性乳腺癌患者 机器学习 三阴性乳腺癌 单细胞测序,qRT-PCR StepCox[backward] + GBM 转录组数据 METABRIC训练集以及来自GEO数据库的多个验证集,具体样本数未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
257 2026-06-19
Integrating optogenetic fMRI and spatial transcriptomics to reveal circuit-specific gene signatures in fronto- and hippo-thalamic networks
2026-Apr-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合清醒小鼠的光遗传学fMRI和空间转录组学,揭示前额-丘脑和海马-丘脑通路中调控神经血管耦合的回路特异性基因特征 首次在同一小鼠中同时进行清醒光遗传学fMRI与空间转录组学分析,克服了跨模态数据来自不同个体的局限性,实现了神经活动与基因表达的因果关联解析 仅关注前额-丘脑和海马-丘脑两个回路,且传统线性模型主要捕获线性基因-过程关系,未充分探索非线性计算方法 揭示微观分子结构如何塑造宏观脑网络组织,特别是基因表达与神经血管耦合之间的因果联系 清醒状态下的B6小鼠,涉及前额叶皮层、海马下托和丘脑区域 计算机视觉 不适用 光遗传学fMRI, 空间转录组学 广义线性模型, 主成分分析 fMRI影像, 空间基因表达数据 同一批小鼠,具体数量未详述 NA 空间转录组学, 光遗传学fMRI NA 采用定制化光遗传学fMRI和空间转录组学流程,具体平台未指明
258 2026-06-19
Single-cell transcriptomic landscape highlights epithelial-fibroblast interactions and CD44-mediated malignant traits in laryngeal squamous cell carcinoma
2026-Apr-18, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示喉鳞状细胞癌中上皮-成纤维细胞相互作用及CD44介导的恶性特征 首次在喉鳞状细胞癌中绘制单细胞转录组图谱,识别出三种恶性上皮亚型和五种成纤维细胞亚型,并发现CD44在成纤维细胞-上皮细胞互作中驱动转移的关键作用 样本量较小(仅3例患者),未提及功能验证的体内模型细节及临床相关性分析 探究喉鳞状细胞癌中上皮细胞和成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用 喉鳞状细胞癌患者的原发肿瘤、癌旁正常组织和转移淋巴结样本 数字病理学 喉鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 3例患者的9份匹配样本(原发肿瘤、癌旁组织、转移淋巴结各3份) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
259 2026-06-19
Antiviral CD4+ T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2026-Apr-17, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究结合体外和体内免疫检测与人类样本,在血清学和单细胞水平上探究老年人和年轻人对流感疫苗的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞反应差异 首次在单细胞转录组水平揭示老年人在流感疫苗应答中T辅助细胞和髓系细胞干扰素转录程序减弱,且抗体应答虽正常但细胞免疫应答受损 未明确说明局限性 探究老年人对流感疫苗的细胞免疫反应减弱机制,特别是CD4+ T细胞和髓系细胞的转录变化 年轻和老年人外周血样本中的B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞 NA 老年疾病 单细胞转录组测序(single-cell transcriptomics) NA 基因表达数据 年轻人和老年人的血液样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
260 2026-06-19
Integrative single-cell analysis reveals endothelial diversity in the vasa vasorum of human atherosclerosis
2026-Apr-17, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过整合单细胞分析揭示人类动脉粥样硬化血管外膜血管内皮细胞的多样性 首次构建人类动脉粥样硬化单细胞转录组图谱,识别出SULF1 ArtECs和VenECs作为内皮间质转化和白细胞招募的潜在治疗靶点 未提及具体局限性 研究动脉粥样硬化斑块中微血管的内皮细胞异质性及其在疾病进展中的作用 动脉粥样硬化斑块中的血管内皮细胞 计算机视觉 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 来自5项研究的17,367个血管内皮细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部