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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2026-07-05 |
Spatial Transcriptomics Reveals Injured Cells, Signature Genes, and Communication Patterns in the Cyst Microenvironment of Polycystic Kidney Disease
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000894
PMID:41071604
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研究论文 | 利用空间转录组学揭示多囊肾病囊肿微环境中的损伤细胞、特征基因和通信模式 | 首次通过空间转录组学分析多囊肾病囊肿微环境的局部基因表达和细胞通信,鉴定出囊肿相关基因特征和关键配体-受体相互作用 | 未提及 | 研究多囊肾病囊肿微环境中的空间基因表达模式和细胞通信 | 野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 使用野生型和Pkd1缺陷小鼠肾脏 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium Spatial Gene Expression |
| 202 | 2026-07-05 |
Hmx2 and Dmrt2 Coordinate the Differentiation of Intercalated Cell Subtypes in Kidney
2026-Apr-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000885
PMID:41051882
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研究论文 | 本研究揭示了Hmx2和Dmrt2转录因子在肾集合管闰细胞亚型分化中的协同调控作用 | 首次发现Hmx2和Dmrt2以互斥方式分别调控B型和A型闰细胞分化,并揭示Hmx3在双缺失条件下的补偿机制 | 基于小鼠模型和单细胞RNA测序分析,但人类肾脏中的验证仍需进一步研究 | 阐明转录因子Dmrt2和Hmx2在肾闰细胞亚型分化中的作用机制 | 小鼠肾脏闰细胞及人肾脏单细胞RNA测序数据集 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 条件性基因敲除与敲入、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因敲除与敲入小鼠模型,以及公开的人和小鼠肾脏单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2026-07-05 |
Generation of spatially patterned human neural tube-like structures using microfluidic gradient devices
2026-04, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01266-1
PMID:41062703
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研究论文 | 本文利用微流控梯度装置生成了具有空间模式的人类神经管样结构 | 首次利用微流控梯度装置实现人类多能干细胞在精确控制化学梯度下的管状或球状菌落形成,产生具有空间组织模式的神经管样结构和前脑样结构 | 协议耗时较长(约8-41天),且需要聚二甲基硅氧烷软光刻和细胞培养经验 | 模拟人类神经管形成和区域模式化 | 人类多能干细胞 | 数字病理学 | NA | 微流控技术 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 204 | 2026-07-04 |
Spatial transcriptomics atlas of inflammatory bowel disease to guide implementation in research consortiums and clinical trials
2026-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72482-w
PMID:42049732
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研究论文 | 构建包含超过三百万个细胞的空间分辨图谱,系统评估两种成像空间转录组学平台在炎症性肠病中的应用 | 首次在多个炎症性肠病研究联盟中系统比较CosMx和Xenium两种成像空间转录组学平台在结肠组织和回肠组织中的性能,验证CosMx在多中心研究中的操作可行性 | Xenium平台性能受组织类型、组织块质量和检测面板大小影响,且未提及单细胞空间转录组学在临床实践中的直接应用成本 | 为炎症性肠病研究联盟和临床试验建立单细胞分辨率空间转录组学的技术和生物学基准 | 非疾病对照、溃疡性结肠炎和克罗恩病患者的肠道组织切片 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 超过一百个肠道组织切片 | CosMx, Xenium | 空间转录组学 | CosMx, Xenium | 成像空间转录组学平台 |
| 205 | 2026-07-03 |
Repeated TLR7 activation induces cell type- and brain region-specific transcriptome changes in male mice
2026-Apr-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50920-5
PMID:42062470
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研究论文 | 重复TLR7激活诱导雄性小鼠细胞类型和脑区特异性转录组变化 | 首次通过单核RNA测序和原位空间转录组学揭示TLR7重复激活引起的细胞类型和脑区特异性转录组变化,特别是血脑屏障调节基因的变化 | 研究仅使用雄性小鼠,未涉及雌性小鼠或人类样本,且未完全阐明TLR7激活导致饮酒增加的具体机制 | 识别TLR7诱导的神经炎症中细胞类型特异性转录组模式,可能指导饮酒增加 | 雄性C57BL/6J小鼠 | 机器学习 | 酒精滥用 | 单核RNA测序,原位空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 两组小鼠,一半用于饮酒行为测试,另一半用于脑组织分析 | 10x Genomics | 单核RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Xenium | 10x Chromium用于单核RNA测序,10x Xenium用于原位空间转录组学 |
| 206 | 2026-07-03 |
CXCL5 is associated with neutrophil-driven intestinal inflammation and IL-17-associated epithelial signaling in inflammatory bowel disease
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-49523-x
PMID:42056229
|
研究论文 | 探究CXCL5在炎症性肠病中驱动中性粒细胞介导的肠道炎症及其与IL-17信号通路相互作用的作用机制 | 首次发现CXCL5在IBD中以阶段性方式参与中性粒细胞驱动的肠道炎症,并揭示CXCL5/IL-17A轴作为潜在治疗靶点 | CXCL5缺失在慢性结肠炎模型中未显著改变疾病严重程度,表明其作用具有阶段依赖性,需要进一步机制研究 | 研究CXCL5在炎症性肠病中的作用及其与IL-17信号通路的关联 | IBD患者结肠组织、急性/慢性鼠结肠炎模型、人肠道上皮细胞体外实验 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IBD患者结肠组织样本和公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2026-07-03 |
A machine learning-driven framework integrating cell death and senescence signatures for multi-target drug design and immunotherapy optimization in ovarian cancer
2026-Apr-26, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01448-4
PMID:42034671
|
研究论文 | 提出一种机器学习驱动框架,整合细胞死亡与衰老特征,用于卵巢癌的多靶点药物设计和免疫治疗优化 | 首次将非凋亡性细胞死亡和衰老通路整合到预测模型中,并利用多组学分析、单细胞RNA测序和人工智能工具开发针对RB1基因的靶向小分子化合物 | NA | 开发整合细胞死亡与衰老特征的机器学习预测模型,以优化卵巢癌的多靶点药物设计和免疫治疗策略 | 卵巢癌患者队列(1858例样本)和免疫治疗数据集,以及RB1基因的功能验证实验 | 机器学习 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 人工智能靶向分子设计 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞序列数据 | 1858例卵巢癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 208 | 2026-07-03 |
Functional characterization of specialized immune cells in a cnidarian reveals an ancestral antiviral program
2026-Apr-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72325-8
PMID:42031744
|
研究论文 | 本研究通过海葵Nematostella vectensis模型,表征了刺胞动物中与免疫相关的细胞程序,揭示了抗病毒免疫的古老起源 | 首次在刺胞动物中鉴定出参与抗病毒免疫的特化免疫细胞类型,并跨六放珊瑚亚纲揭示了保守的免疫反应 | NA | 探究刺胞动物免疫细胞的进化起源和抗病毒免疫机制 | 海葵Nematostella vectensis胚胎 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 209 | 2026-07-03 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics reveal divergent immunological and stromal programs in peritoneal versus ovarian endometriosis
2026-04-20, BMC women's health
DOI:10.1186/s12905-026-04456-5
PMID:42010552
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学揭示腹膜型与卵巢型子宫内膜异位症中差异的免疫和基质程序 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,系统比较了腹膜型和卵巢型子宫内膜异位症的细胞生态系统、空间组织及细胞间通讯差异,提出‘免疫热’与‘免疫冷’两种亚型概念 | 研究基于已发表数据的整合分析,样本主要来自单一时间点,缺乏纵向跟踪数据;空间转录组仅覆盖腹膜型及匹配在位内膜,未包含卵巢型空间数据;发现需进一步实验验证 | 阐明子宫内膜异位症不同亚型(腹膜型 vs 卵巢型)的免疫微环境特征及致病机制差异 | 对照子宫内膜、在位子宫内膜、腹膜型子宫内膜异位症、卵巢型子宫内膜异位症 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 81676个单细胞(来自对照内膜、在位内膜、腹膜型病灶、卵巢型病灶)及60个空间转录组区段(来自腹膜型病灶及匹配在位内膜) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 210 | 2026-07-02 |
Retinoic acid drives cell fate specification, maturation and retinal regionality in human retinal organoids
2026-Apr-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72130-3
PMID:42031716
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研究论文 | 视黄酸通过时空剂量调控驱动人视网膜类器官中的细胞命运特化、成熟及区域化特征 | 首次揭示视黄酸剂量依赖性地调控人视网膜类器官中黄斑样与外周样区域身份的建立,并结合单细胞与空间转录组学解析其机制 | 视黄酸浓度梯度在体内动态调控的复杂性尚未完全模拟,且类器官模型可能无法完全再现人视网膜的完整区域性特征 | 阐明视黄酸在人类视网膜发育中调控细胞命运、成熟及区域特化的分子机制 | 人视网膜类器官 | 数字病理学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质分析 | NA | 转录组数据、空间表达数据 | 人视网膜类器官样本,具体数目未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞转录组,10x Visium 用于空间转录组分析 |
| 211 | 2026-07-02 |
A macrophage MHC-I axis links intratumoral heterogeneity to terminal CD8+ T cell exhaustion in lung adenocarcinoma
2026-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01446-6
PMID:42031958
|
研究论文 | 通过整合批量、单细胞和空间转录组学数据,研究肺腺癌中肿瘤内异质性如何加剧CD8 T细胞耗竭 | 首次揭示巨噬细胞MHC-I轴连接肿瘤内异质性与终末期CD8+T细胞耗竭,并开发六基因决策树分类器预测表型 | 未提及具体的实验验证或临床干预结果,分类器的临床实用性需进一步验证 | 探索肺腺癌中肿瘤内异质性与CD8 T细胞耗竭之间的分子机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本(包括批量、单细胞和空间转录组数据) | 数字病理学 | 肺癌 | 批量转录组学、单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 未明确具体样本数量,但涉及多个队列的批量、单细胞和空间数据 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 212 | 2026-07-02 |
Deep learning for predicting pituitary neuroendocrine tumour lineage and high-risk subtypes from histology
2026-Apr-24, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01444-8
PMID:42031964
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研究论文 | 利用深度学习模型从常规H&E染色全切片图像预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 首次使用深度学习模型直接从常规H&E染色全切片图像中预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发,并通过空间转录组学验证了与复发相关的免疫和分子特征 | 复发预测的AUC仅为0.641,表明模型在预测复发方面性能有限 | 开发深度学习模型以预测垂体神经内分泌肿瘤的谱系、高风险亚型和复发 | 垂体神经内分泌肿瘤患者 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | NA | 深度学习 | 图像 | 训练集925例(中国科学技术大学),外部验证集:太和医院226例、华山医院193例 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 213 | 2026-07-02 |
DAPK2 Regulates PKM2 Phosphorylation at Threonine 45 to Facilitate Disturbed Flow-Induced Atherosclerosis
2026-Apr-14, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 该研究发现DAPK2通过磷酸化PKM2的苏氨酸45位点,促进扰动血流诱导的动脉粥样硬化形成 | 首次揭示DAPK2通过磷酸化PKM2的T45位点调控内皮细胞炎症反应,并鉴定该通路为动脉粥样硬化的新机制和治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床验证尚需进一步开展 | 阐明DAPK2在振荡剪切应力诱导的内皮细胞活化和动脉粥样硬化中的作用 | 人及小鼠动脉内皮细胞、Apoe-/-小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 质谱, 免疫共沉淀, 邻近连接法 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 包括公开数据库数据及小鼠模型样本(具体数量未明确) | Illumina | 单细胞RNA-seq, RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公开数据库包括基因芯片、RNA测序及单细胞RNA测序数据 |
| 214 | 2026-07-02 |
Tumor-derived ITIH2 activates PI3K\AKT pathway via THBS1 ubiquitination and promotes tumor angiogenesis in hepatocellular carcinoma
2026-Apr, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2026.168175
PMID:41616982
|
研究论文 | 研究发现肿瘤来源的ITIH2通过泛素化调控THBS1激活PI3K/AKT通路,促进肝细胞癌血管生成 | 首次发现ITIH2作为肝细胞癌预后生物标志物,通过泛素化介导的THBS1稳定性调控激活PI3K/AKT通路,促进血管生成,且不直接影响肿瘤细胞增殖或凋亡 | 未具体说明局限性,但可能包括样本量有限和机制细节需进一步验证 | 阐明肝细胞癌中血管生成与肿瘤进展之间的分子机制 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的血管内皮细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归、多变量Cox回归 | 单细胞转录组数据 | 2例肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 215 | 2026-07-02 |
Repeated proliferative events ameliorate age-associated accumulation of DNA damage in HSPCs
2026-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202503337
PMID:41611449
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研究论文 | 研究重复性增殖事件对造血干细胞和祖细胞年龄相关DNA损伤积累的改善作用 | 通过多次放血实验诱导小鼠HSPC持续增殖,发现重复增殖事件可清除年龄相关的DNA双链断裂积累,而不影响造血功能 | 未提供具体局限性信息 | 探究增殖速率增加对造血干细胞和祖细胞造血衰老的影响 | 小鼠和人的造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 机器学 | 老年疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 216 | 2026-07-02 |
Maternal obesity induces activator protein 1-mediated inflammatory response to impair embryonic neurogenesis
2026-04, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP289326
PMID:41823327
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研究论文 | 该论文通过单细胞RNA测序和ATAC测序揭示母体肥胖通过激活蛋白1介导的炎症反应损害胚胎神经发生的机制 | 首次利用单细胞多组学技术(scRNA-seq和scATAC-seq)揭示母体肥胖通过激活蛋白1(AP-1)转录因子增强炎症基因(如Tnf和Cd68)的染色质可及性,从而抑制神经发生的关键转录因子(如Neurod1、Neurog2和Ascl1)表达 | NA | 探究母体肥胖对胚胎神经发育影响的分子机制 | 母体肥胖小鼠及其E11.5和E13.5胚胎 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组、单细胞染色质可及性 | 母体肥胖小鼠(高脂饮食喂养2个月)及其E11.5和E13.5胚胎 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 217 | 2026-07-01 |
Genetic and chemical correction of cystic fibrosis reduces airway susceptibility to SARS-CoV-2
2026-04-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00223.2025
PMID:41556834
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研究论文 | 研究囊性纤维化患者的基因和化学校正如何降低气道对SARS-CoV-2的易感性 | 首次利用同基因诱导多能干细胞衍生气道模型,揭示CFTR调节剂ETI不仅在CF气道中,也能在非CF气道中降低SARS-CoV-2感染和炎症的广泛保护作用 | NA | 探究CFTR调节剂ETI如何减轻SARS-CoV-2感染和气道损伤及其潜在机制 | 诱导多能干细胞衍生的气道上皮模型、同基因CFTR校正细胞、原代气道上皮 | 数字病理学 | 囊性纤维化、COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多组iPSC衍生气道模型及原代上皮样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 218 | 2026-06-30 |
The PPTC7/BNIP3/NIX axis induces cGAS/STING-mediated senescence and augments CAR-T efficacy by repressing tumor-intrinsic mitophagy
2026-Apr-18, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-026-03713-7
PMID:41998669
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研究论文 | 本研究揭示PPTC7/BNIP3/NIX轴通过抑制肿瘤内在的线粒体自噬,诱导cGAS/STING介导的衰老,并增强CAR-T细胞疗法的疗效 | 首次发现PPTC7作为线粒体自噬的负调控因子,通过促进BNIP3和NIX的泛素化降解,抑制线粒体自噬,从而释放线粒体DNA激活cGAS/STING通路,增强肿瘤免疫原性和CAR-T疗效 | 未明确说明限制 | 探索多发性骨髓瘤中影响CAR-T疗法敏感性的肿瘤内在因素,尤其是线粒体自噬的调控机制 | 多发性骨髓瘤细胞及CAR-T细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 多发性骨髓瘤患者样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 公共单细胞RNA-seq数据 |
| 219 | 2026-06-30 |
CSTA and DDX24: potential biomarkers regulating ferroptosis in sepsis and their diagnostic value
2026-Apr-09, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-026-02358-x
PMID:41952180
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研究论文 | 通过多组学数据分析,发现CSTA和DDX24是脓毒症中铁死亡的潜在生物标志物,并验证其诊断价值 | 首次综合多个转录组数据集与单细胞测序数据,系统鉴定铁死亡关键调控基因CSTA和DDX24,并构建miRNA-mRNA互作网络 | 仅基于公开数据集和体外实验验证,缺乏体内动物模型和临床队列的进一步证实 | 探究脓毒症中铁死亡的分子调控机制,识别诊断和治疗新靶点 | 脓毒症相关转录组和单细胞测序数据集 | 计算机视觉 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, 机器学习 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2026-06-30 |
Circulating Immune Cells are Associated with Non-Inflammatory Pain in Rheumatoid Arthritis
2026-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.31.715669
PMID:41959259
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研究论文 | 本研究探索类风湿性关节炎患者中循环免疫细胞与非炎性疼痛的关联 | 通过多参数光谱流式细胞术和单细胞RNA测序,首次识别出与非塑性疼痛相关的免疫细胞群 | 样本量较小(39例RA患者,其中22例进行单细胞测序),且未包含纵向数据 | 阐明类风湿性关节炎患者中区分中枢性疼痛的细胞状态变化 | 类风湿性关节炎患者的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 多参数光谱流式细胞术、单细胞RNA-seq | NA | 细胞、基因表达数据 | 39例RA患者(其中22例进行单细胞RNA-seq分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |