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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-05-04 |
Endothelial Adgrl2 Expression and Alternative Splicing Controls the Cerebrovasculature
2026-04-22, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.0019-26.2026
PMID:41876233
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研究论文 | 研究内皮细胞Adgrl2表达和可变剪接对脑血管系统发育和功能的影响 | 发现Adgrl2基因在神经元和内皮细胞中通过细胞类型特异性可变剪接产生不同异构体,分别调控神经回路组装和脑血管稳态 | 主要基于小鼠模型,人类脑血管中Adgrl2的类似功能尚需验证 | 探究Adgrl2在内皮细胞中的功能及其可变剪接对脑血管完整性及血脑屏障稳态的调控机制 | 小鼠(雌雄兼用)的脑血管内皮细胞和神经元 | 神经生物学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 182 | 2026-05-04 |
Anemoside B4 alleviates pulmonary fibrosis by targeting the Keap1/Nrf2 axis to suppress NLRP3 inflammasome-mediated pyroptosis and epithelial-mesenchymal transition
2026-Apr-20, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2026.158223
PMID:42068876
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研究论文 | 探讨Anemoside B4通过调节Keap1/Nrf2轴抑制NLRP3炎症小体介导的细胞焦亡和上皮-间充质转化从而缓解肺纤维化 | 首次发现Anemoside B4作为预防性而非治疗性药物,通过靶向Keap1激活Nrf2抗氧化反应、抑制NLRP3依赖的细胞焦亡及分泌组驱动的上皮-间充质转化,为肺纤维化的早期干预提供潜在候选药物 | 未提及具体局限性 | 明确Anemoside B4对肺纤维化的保护作用及分子机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型(野生型和Nlrp3-/-小鼠) | 数字病理学 | 肺纤维化 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 分子对接, Co-IP, CETSA | NA | 基因表达数据 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型,包括野生型和Nlrp3-/-小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 183 | 2026-05-04 |
Single-Cell RNA Sequencing of Lung Tissue in a Rat Model of Acute Respiratory Distress Syndrome
2026-04-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70491
PMID:42044167
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研究论文 | 介绍了一种在脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中进行肺组织单细胞RNA测序的标准化方案,揭示了21种细胞群体和6种巨噬细胞/单核细胞亚群的转录特征 | 建立了可重复的单细胞RNA测序工作流程,包括优化的组织解离、严格质量控制、双细胞去除和批次效应校正,首次在ARDS大鼠模型中识别了六种巨噬细胞/单核细胞亚群的独特转录特征 | 该研究基于动物模型,其发现可能不完全适用于人类ARDS;同时技术变异可能影响结果的稳定性和可重复性 | 开发并标准化用于ARDS肺组织单细胞RNA测序的分析流程,以深入解析细胞异质性和炎症机制 | 脂多糖诱导的大鼠急性呼吸窘迫综合征模型中的肺组织细胞 | 数字病理学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 大鼠肺组织样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2026-05-04 |
A Protocol for Harvesting Single-cell Suspension from Mouse Corneas
2026-04-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69844
PMID:42008475
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研究论文 | 建立从小鼠角膜组织中制备高质量单细胞悬液的稳健方案 | 针对角膜组织致密复杂结构,优化了胶原酶A和胰蛋白酶顺序消化方法,获得高细胞数、高活力(≥94.6%)和高单细胞比例(96.3%)的悬液,满足scRNA-seq等下游应用要求 | NA | 建立从小鼠全角膜制备高质量单细胞悬液的标准化方案 | 小鼠全角膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 小鼠角膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2026-05-04 |
Mapping Infant Immunity with Minimal Input: Integrative Single-cell and Multiomic Profiling
2026-04-03, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/70279
PMID:42008512
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研究论文 | 提出一套优化方案,利用微量新生儿血液进行整合单细胞和多组学免疫分析,揭示早期生命免疫系统的独特轨迹 | 针对新生儿血容量极低的限制,开发了从微量样本中实现高维免疫谱分析的综合方案,整合流式细胞术、蛋白质组学和单细胞RNA测序技术,为早期生命免疫研究提供了新方法 | 主要受限于新生儿血容量低,尤其是极低出生体重或极度早产儿,可安全采集的样本量极为有限 | 探索新生儿早期生命免疫系统的动态变化和独特适应性,通过微量血液样本实现高维度免疫谱分析 | 新生儿的循环免疫细胞,包括极低出生体重和极度早产儿 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习, 数字病理 | NA | 流式细胞术, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2026-05-04 |
The Spatially Resolved Kidney Transcriptome Signatures in Rat Models of Trauma-Induced Acute Kidney Injury
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001045
PMID:41396698
|
研究论文 | 利用整体和空间转录组学在大鼠模型中定义了出血性休克、横纹肌溶解及其组合对肾脏的早期反应 | 首次在创伤诱导的急性肾损伤大鼠模型中应用商用小鼠空间转录组探针,实现了成本效益高且区域特异性的基因表达谱分析,并揭示了横纹肌溶解作为转录变化主要驱动因素及协同致死反应的分子机制 | 未提及 | 定义出血性休克和横纹肌溶解单独及组合对大鼠肾脏的早期转录反应机制 | 创伤诱导急性肾损伤的大鼠模型 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、整体转录组学 | NA | 文本、图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、整体RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq, MGI DNBSEQ | 商用小鼠空间转录组探针应用于大鼠肾组织、整体RNA测序 |
| 187 | 2026-05-04 |
Artificial soil (ArtSoil): Recreating soil conditions in synthetic plant growth media
2026-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70833
PMID:41911577
|
research paper | 开发了一种名为人工土壤(ArtSoil)的合成植物生长培养基,能够模拟土壤条件,支持植物生长并维持土壤微生物组,避免了传统培养基中蔗糖的副作用 | 首次提出一种无需添加糖分的合成培养基,通过添加水性土壤提取物保持土壤微生物组和土壤因素,使植物在类似土壤的条件下生长,更接近自然状态 | 文章未明确说明ArtSoil在不同土壤类型或长期培养中的稳定性,以及其在实际农业应用中的可行性 | 开发一种更接近土壤条件的合成植物生长培养基,以便在实验室中准确研究植物生理和多组学特征 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana) | machine learning | NA | NA | NA | single-cell transcriptomics data | 拟南芥样本在不同生长条件下进行比较,未提供具体数量 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 188 | 2026-05-04 |
Molecular Characterization of the Effect of Glucagon-Like Peptide-1 Receptor Agonist Semaglutide in the Nephrotoxic Serum Nephritis Mouse Model
2026-Apr-01, Kidney360
IF:3.2Q1
DOI:10.34067/KID.0000001067
PMID:41945470
|
研究论文 | 探究胰高血糖素样肽-1受体激动剂Semaglutide在肾毒性血清肾炎小鼠模型中的作用机制 | 首次在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中揭示Semaglutide通过抗炎、抗纤维化及改善肾血流动力学独立于代谢效应的肾脏保护作用 | 仅在小鼠模型中进行研究,尚未在人类中验证;未涉及长期治疗效果评估 | 阐明Semaglutide在非肥胖非糖尿病慢性肾病模型中的肾脏保护机制 | 肾毒性血清肾炎小鼠模型 | 机器学习 | 慢性肾病 | 空间转录组测序、单细胞核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台用于肾脏组织切片分析;10x Chromium单细胞核RNA测序用于肾细胞亚群分析 |
| 189 | 2026-05-04 |
Cell type annotation for scATAC-seq via DNA large language model and graph domain adaptation
2026-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014226
PMID:42060707
|
研究论文 | 提出scLLMDA框架,利用DNA大语言模型和图域自适应实现scATAC-seq细胞类型注释 | 首次结合DNA特异性语言模型和图神经网络进行域自适应,捕获峰值序列上下文嵌入与细胞邻域结构,解决了跨模态注释的模态不匹配和信号失真问题 | 文章未明确提到局限性,但可能依赖参考数据的质量与相似性,且大规模数据集的计算效率有待验证 | 开发更准确和鲁棒的scATAC-seq细胞类型注释方法 | 单细胞ATAC-seq数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | ATAC-seq | DNA大语言模型、图神经网络 | 序列数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 190 | 2026-05-03 |
Deep-learning-based de novo discovery and design of therapeutics that reverse disease-associated transcriptional phenotypes
2026-Apr-30, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.02.016
PMID:41850287
|
研究论文 | 提出基于深度学习的药物发现平台GPS,通过逆转疾病相关的转录表型实现从头药物发现和优化 | 首次将转录组特征直接用于从头药物发现而非仅药物重定位,并开发仅从化学结构预测转录扰动特征的方法 | 未充分讨论模型在复杂疾病中的泛化性及化合物合成可行性 | 开发基于深度学习的药物发现平台,通过逆转疾病相关转录特征实现新药发现 | 肝细胞癌和特发性肺纤维化疾病模型 | 机器学习 | 肝细胞癌, 特发性肺纤维化 | RNA-seq | 深度学习模型(具体架构未明确)、树搜索优化方法 | 转录组数据、化学结构数据 | 多个疾病案例及两项验证(肝细胞癌:两个化合物系列;特发性肺纤维化:一个重定位候选和一种新抗纤维化化合物) | NA | NA | NA | NA |
| 191 | 2026-05-03 |
Comprehensive analysis of ATF3 as a diagnostic and prognostic biomarker from pan-cancer to clear cell renal cell carcinoma
2026-Apr-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05113-x
PMID:42056650
|
研究论文 | 全面分析ATF3从泛癌到肾透明细胞癌作为诊断和预后生物标志物的作用 | 首次系统评估ATF3在多种癌症类型中的表达、诊断效能、预后意义及其与肿瘤免疫微环境的关联,并利用单细胞RNA测序阐明其在肾透明细胞癌细胞水平的具体作用 | 主要依赖公共数据库分析,缺乏大规模临床样本验证;ATF3在泛癌中的功能机制尚未深入阐明 | 评估ATF3在泛癌和肾透明细胞癌中的诊断和预后价值,并探索其在肿瘤免疫微环境中的作用 | ATF3基因在多种癌症中的表达及功能 | 机器学习 | 肾透明细胞癌 | 实时荧光定量PCR, Western blot, 免疫荧光, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中多种癌症的样本数据及肾透明细胞癌细胞系 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 192 | 2026-05-03 |
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr-30, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00912
PMID:42066623
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,确定PEBP1为缺血性卒中后神经恢复的治疗靶点,并通过实验验证其抑制效果 | 首次结合单细胞转录组学与大规模遗传学数据(孟德尔随机化)系统识别PEBP1为卒中后神经损伤的关键介质,并利用药理学抑制(FerroLOXIN-1)和基因敲低(AAV-BI30介导的shRNA)双重策略验证其治疗潜力 | 潜在脱靶效应需进一步验证;研究仅基于欧洲生物信息学研究所和英国生物银行的数据集,缺乏其他人群(如亚洲人群)的验证;体内模型仅采用大脑中动脉闭塞模型,可能无法完全模拟人类卒中异质性 | 探索缺血性卒中后神经功能恢复的新基因靶点,评估PEBP1抑制的治疗潜力 | 缺血性卒中患者(欧洲人群)、小鼠大脑中动脉闭塞模型、内皮细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、遗传变异数据 | 初始数据集:34,593例病例和624,214例对照;验证数据集:86,668例病例和1,503,898例对照;英国生物银行:26,052例病例和487,214例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2026-05-03 |
A conserved re-epithelialization program underlies malignancy in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Apr-30, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2026.03.021
PMID:42066759
|
研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学识别胰腺导管腺癌中保守的再上皮化程序MP10,并揭示其在PanIN向PDAC进展中的作用机制 | 首次发现保守的再上皮化程序MP10标记侵袭性胰腺癌细胞,并揭示其与伤口边缘角质细胞再上皮化的相似性,以及FOSL1转录因子在侵袭中的驱动作用 | 未明确提及研究限制,可能包括样本数量有限或机制验证不足 | 探究胰腺导管腺癌从PanIN进展为侵袭性癌症的分子机制 | 人类胰腺导管腺癌组织和小鼠PanIN向PDAC进展模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高分辨率空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2026-04-30 |
Characterizing Infiltrating Macrophages in Intracranial Aneurysm with IA Animal Models and Spatial Transcriptomics
2026-Apr-29, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-026-01437-6
PMID:42053685
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 195 | 2026-05-03 |
GPR124 regulates hyaloid blood vessel regression and is associated with endothelial-mesenchymal transition
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50835-1
PMID:42056280
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研究论文 | 本研究揭示了GPR124在调节玻璃体血管退化中的作用,并发现其与内皮-间质转化相关 | 首次识别GPR124作为玻璃体血管退化的关键调节因子,并发现其通过WNT/β-catenin信号和内皮-间质转化促进血管重塑 | 未明确GPR124下游的具体分子机制,且仅在小鼠模型中验证,缺乏人类数据 | 阐明GPR124在玻璃体血管退化过程中的功能和机制 | 小鼠玻璃体血管内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色 | 基因敲除小鼠模型(Gpr124条件性敲除) | 基因表达数据、图像 | 使用他莫昔芬诱导的内皮特异性Gpr124敲除小鼠模型,具体样本量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析玻璃体血管内皮细胞 |
| 196 | 2026-05-03 |
scDecorr: feature decorrelation based representation learning enables self-supervised alignment of multiple single-cell experiments
2026-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-50586-z
PMID:42056283
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研究论文 | 提出scDecorr框架,利用特征去相关自监督学习实现单细胞RNA测序数据的稳健表示学习和跨批次整合 | 首次将特征去相关自监督学习用于单细胞数据整合,通过最大化扭曲嵌入相似性并去相关化组件来捕获生物信号、消除技术噪声,结合无监督域适应实现跨批次域不变表示 | 未提及具体局限性 | 开发高效的单细胞RNA测序数据表示学习和整合方法,以克服数据稀疏性、高变异性和技术批次效应 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自监督学习模型 | 基因表达数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 197 | 2026-05-03 |
LMCD1 aggravates cardiac fibrosis after myocardial infarction via activating STAT5A
2026-Apr-29, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2026.120153
PMID:42066818
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研究论文 | 本研究揭示LMCD1通过激活STAT5A加剧心肌梗死后心脏纤维化 | 首次发现LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的驱动作用,并阐明其通过直接结合并激活STAT5A促进心脏成纤维细胞活化的新机制 | 仅在小鼠模型和体外细胞实验中验证,缺乏临床样本数据支持,且未探讨LMCD1的翻译后修饰调控机制 | 探究LMCD1在心肌梗死后心脏纤维化中的功能及其分子机制 | 小鼠心肌梗死模型及TGF-β1诱导的原代心脏成纤维细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据 | 公开的单细胞RNA测序数据集及小鼠组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 198 | 2026-05-03 |
A NETs-centric multi-omics framework prioritizes PGLYRP1 and MMP9 as subtype-associated thromboinflammatory biomarker candidates and putative therapeutic hypotheses in ischemic stroke
2026-Apr-29, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2026.107422
PMID:42066918
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研究论文 | 本研究通过多组学策略鉴定缺血性卒中中与NETs相关的亚型特异性血栓炎症生物标志物候选基因和潜在治疗假说 | 首次整合多队列外周血转录组学、机器学习特征选择、孟德尔随机化和单细胞RNA测序等多组学方法,从NETs角度系统解析缺血性卒中亚型特异性血栓炎症模式,并识别出PGLYRP1和MMP9作为候选生物标志物和治疗靶点 | 仍需进一步验证候选生物标志物在更大独立队列中的临床效能,以及候选化合物Naringin的体内治疗潜力 | 鉴定缺血性卒中中NETs相关亚型特异性血栓炎症生物标志物和潜在治疗靶点 | 缺血性卒中患者的外周血样本和单细胞转录组数据 | 机器学习 | 脑血管疾病 | 转录组测序、单细胞RNA测序、分子动力学模拟 | 机器学习特征选择模型 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 多队列缺血性卒中患者,具体样本量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 199 | 2026-05-03 |
Alveolar Type 2 Cell Dysfunction Is Associated with Bile Acid Alterations in Experimental Hepatopulmonary Syndrome
2026-Apr-28, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1093/ajrcmb/aanag067
PMID:42048159
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研究论文 | 本研究通过实验性肝肺综合征模型,发现肺泡2型细胞功能障碍与胆汁酸变化相关 | 首次揭示肝肺综合征中胆汁酸水平升高与AT2细胞功能改变的直接关联,并发现FXR激动剂可恢复AT2细胞功能 | 仅使用小鼠模型,且未完全阐明胆汁酸调控AT2细胞的具体分子机制 | 探究肝肺综合征中肺泡功能障碍的机制,特别是AT2细胞与胆汁酸的关系 | 胆总管结扎小鼠模型中的肺泡2型细胞和胆汁酸 | 数字病理学 | 肝肺综合征 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 质谱胆汁酸分析 | NA | RNA测序数据, 质谱数据 | 胆总管结扎小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2026-05-03 |
Immune dysregulation and cellular dysfunction mediate di-n-pentyl phthalate-induced hepatotoxicity: Insights from single-cell RNA sequencing
2026-Apr-28, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116114
PMID:42061636
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究邻苯二甲酸二正戊酯(DNPP)诱导肝脏毒性的免疫失调与细胞功能障碍机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示DNPP暴露导致肝脏毒性中T-NK细胞、髓系细胞和内皮细胞亚群的显著变化及基因表达下调 | NA | 阐明DNPP诱导肝脏毒性的潜在机制,特别是免疫稳态破坏和细胞功能损伤的作用 | DNPP暴露的小鼠肝脏组织 | 数字病理学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | DNPP暴露小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |