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当前共找到 945 篇文献,本页显示第 181 - 200 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
181 2026-07-10
A Muribaculaceae-enriched microbiota exacerbates TLR4-dependent Acinetobacter baumannii-induced hyperinflammatory sepsis
2026-Apr-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究揭示了富含Muribaculaceae的肠道菌群通过TLR4依赖性过度炎症加剧鲍曼不动杆菌诱导的高炎症性败血症 首次发现特定肠道菌群配置(富含Muribaculaceae)通过TLR4依赖性方式调节宿主对鲍曼不动杆菌感染的炎症反应阈值,而非病原体清除能力,决定败血症结局 仅使用雌性C57BL/6小鼠模型,未在其他物种或性别中验证;未明确热稳定低分子量代谢物的具体化学身份 探究肠道菌群配置如何影响宿主对鲍曼不动杆菌诱导败血症的易感性及其分子机制 雌性C57BL/6小鼠及其肠道菌群,特别是Sangeribacter muris KT1-3菌株 机器学习 败血症 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 多个雌性C57BL/6小鼠群体 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
182 2026-07-10
Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA
2026-Apr-29, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种名为SpaCNA的计算框架,用于从空间转录组数据中稳健检测拷贝数改变 整合多模态信息(基因表达与空间位置),利用隐藏马尔可夫随机场模型实现空间连续的CNA检测,并支持三维重建 未提及局限性 开发高精度检测空间转录组中拷贝数改变的方法,以分析肿瘤内异质性和空间肿瘤生物学 模拟数据及乳腺癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌的真实空间转录组数据集 计算生物学 乳腺癌, 结直肠癌, 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学 隐藏马尔可夫随机场 基因表达数据 多个模拟数据集及三组真实癌症数据集 NA 空间转录组学 NA NA
183 2026-07-10
Tumor cell-derived IFN spatially reprograms osteopontin-enriched macrophage niches to promote PARP inhibitor resistance
2026-Apr-15, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 该研究通过整合空间分析、单细胞RNA测序和多重免疫组化,发现肿瘤细胞衍生的干扰素通过STAT信号诱导肿瘤相关巨噬细胞表达骨桥蛋白,形成免疫抑制性微环境,导致PARP抑制剂耐药 首次揭示肿瘤细胞来源的干扰素在空间上重编程骨桥蛋白富集的巨噬细胞微环境,建立干扰素-骨桥蛋白空间轴介导的PARP抑制剂耐药新机制,并证明骨桥蛋白可作为预后生物标志物和治疗靶点 未描述具体局限性 探究PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中耐药的空间免疫微环境机制 前瞻性新辅助尼拉帕利单药治疗临床试验中的初治高级别浆液性卵巢癌标本 数字病理学 卵巢癌 PhenoCycler-Fusion空间分析,单细胞RNA测序,多重免疫组化 NA 空间蛋白质组学数据,单细胞转录组数据,组织切片图像数据 来自前瞻性临床试验的卵巢癌患者标本,具体数量未标出 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 PhenoCycler-Fusion PhenoCycler-Fusion空间分析平台
184 2026-07-10
A colon mimetic screening approach reveals Lactobacillus fermentum as a microbiome-based therapy for COPD
2026-04-14, NPJ biofilms and microbiomes IF:7.8Q1
研究论文 通过结肠模拟个性化药物元分析筛选平台发现发酵乳杆菌作为慢性阻塞性肺疾病的微生物组疗法 首次利用结肠模拟个性化药物元分析筛选平台从重度COPD患者粪便样本中筛选出具有治疗潜力的发酵乳杆菌,并通过单细胞转录组学和粪便微生物组分析揭示其作用机制 研究仅处于临床前阶段,未进行人体临床试验验证 评估发酵乳杆菌对COPD的治疗效果及其作用机制 烟雾暴露小鼠模型 机器学习 慢性阻塞性肺疾病 RNA测序, 单细胞转录组学 个性化药物元分析筛选平台 基因表达数据, 微生物组数据 重度COPD患者粪便样本用于筛选,烟雾暴露小鼠用于治疗实验,具体样本数量未说明 NA 单细胞RNA测序, 粪便微生物组分析 NA NA
185 2026-07-10
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态变化 首次整合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出DDIT4作为骨质疏松症的风险因子,并构建了预测性能良好的诺模图 研究样本量有限,标记物的临床验证尚需更大规模队列研究支持 揭示骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关基因标志物及其免疫机制,以改善诊断和治疗 骨质疏松症患者组织样本及公开数据库中的表达数据 机器学习 骨质疏松症 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、qRT-PCR、Western blot NA 基因表达数据 未明确样本数量,涉及公开数据库及实验验证样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
186 2026-07-10
Inflammasome adaptor ASC promotes sustained neuroinflammation and mild cognitive impairment in a closed-head injury model
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序分析闭合性轻度脑损伤模型,发现炎症小体接头蛋白ASC在神经炎症和轻度认知障碍中发挥关键作用 首次揭示ASC作为主要炎症小体接头蛋白在轻度闭合性脑损伤后持续神经炎症和认知缺陷中的关键作用 NA 探究闭合性轻度脑损伤后炎症小体相关基因的细胞表达及其功能意义 闭合性轻度脑损伤小鼠模型及其皮质组织 机器学习 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
187 2026-07-10
RETN exacerbates sepsis by GBP5/NLRP3 signaling pathway-mediated pyroptosis of macrophage
2026-04, Genes and immunity IF:5.0Q2
研究论文 本文揭示RETN通过GBP5/NLRP3信号通路介导巨噬细胞焦亡加重脓毒症的作用机制 首次证明RETN/GBP5/NLRP3信号轴调控巨噬细胞焦亡加重脓毒症,为脓毒症发病机制研究和临床治疗提供新靶点 未提及具体研究局限性 探究RETN影响脓毒症病理生理的特异性通路 脓毒症患者巨噬细胞及小鼠模型 机器学 脓毒症 单细胞测序,RNA测序 NA 基因表达数据 脓毒症患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
188 2026-07-09
Immune landscape in NOD.H-2h4 mouse model thyroid revealed by single-cell RNA sequencing
2026-Apr-16, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序分析NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的免疫景观,揭示桥本甲状腺炎的细胞机制 构建了NOD.H-2h4小鼠模型甲状腺的单细胞转录组图谱,首次揭示甲状腺细胞可塑性和调节性T细胞功能障碍可能是疾病进展的驱动因素 未明确提及局限性 阐明桥本甲状腺炎中每种甲状腺细胞类型在免疫失调中的具体作用 NOD.H-2h4小鼠甲状腺组织 单细胞转录组学 桥本甲状腺炎 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 38,461个细胞,来自三个疾病阶段(4、8和16周)的甲状腺组织 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
189 2026-07-09
Attenuating age-related decline in dendritic cell migration improves vaccine efficacy via gut-immune crosstalk
2026-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析发现衰老过程中树突状细胞迁移缺陷,并通过口服酵母纳米颗粒增强其功能以改善疫苗效力 揭示了衰老中树突状细胞迁移缺陷是免疫衰退的关键机制,并开发了口服酵母纳米颗粒的非侵入性策略来增强树突状细胞功能 未明确提及 探究树突状细胞在衰老相关疫苗效力下降中的作用及改善策略 年轻与老年小鼠的淋巴结、树突状细胞及肠道免疫系统 机器学习 老年病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 年轻与老年小鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
190 2026-07-08
Single-cell analysis reveals cellular heterogeneity and limits of marker-based assessment in retinal ganglion cell-enriched organoid cultures
2026-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
研究论文 通过单细胞分析揭示视网膜神经节细胞富集类器官培养中的细胞异质性和基于标记物评估的局限性 首次利用单细胞RNA测序全面表征视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成,发现基于标记物评估可能高估RGC身份,并揭示了部分特化的RGC状态和非目标细胞群 样本间存在显著变异,且未完全确定功能性RGC亚型的规范程度 评估视网膜神经节细胞富集类器官培养的细胞组成和发育保真度 人类多能干细胞来源的视网膜类器官衍生的视网膜神经节细胞富集培养物 单细胞基因组学 视网膜神经疾病 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 基因表达数据 4个样本,共73,642个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
191 2026-07-08
Single-cell transcriptomics brings stroke thrombi into cellular and molecular focus: A commentary on "characterizing stroke clots using single-cell sequencing"
2026-Apr-10, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1
评论 本文评论了Renedo等人利用单细胞RNA测序对人类缺血性卒中血栓进行表征的研究,揭示了血栓并非惰性栓塞物质,而是具有结构化免疫活性的微环境 强调单细胞转录组学为卒中血栓研究带来细胞和分子层面的新视角,指出血栓保留病因特异性细胞和功能特征 未在摘要中明确提及具体局限性 评论单细胞转录组学在卒中血栓研究中的应用价值 人类缺血性卒中血栓样本 单细胞转录组学 脑血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
192 2026-07-08
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA-seq、TCGA WGCNA和空间转录组学,鉴定HSPB1为结直肠癌中调控Treg/CD8+ T细胞比例的关键因子,并证明靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 首次发现HSPB1通过CCL20-CCR6轴调控Treg募集,从而维持肿瘤免疫抑制微环境,并验证其双重抗肿瘤作用 研究主要基于小鼠皮下肿瘤模型和体外实验,缺乏临床样本验证及HSPB1抑制剂的长期安全性数据 探究结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例失衡的分子调控机制 结直肠癌肿瘤细胞、Treg细胞、CD8+ T细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, CRISPR-Cas9基因编辑, 多重流式细胞术, bulk RNA-seq NA 基因表达数据, 图像数据 结直肠癌患者肿瘤样本(具体数量未明确)以及MC38和SW480细胞系 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium单细胞3'测序、10x Visium空间转录组学
193 2026-07-08
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示成纤维细胞激活蛋白通过非酶促机制促进胸主动脉夹层,涉及FAP/PLAUR/ITGB1/FAK信号轴介导的成纤维细胞-巨噬细胞互作与促炎性巨噬细胞极化 首次发现FAP通过非酶促位点直接结合巨噬细胞PLAUR,激活ITGB1/FAK通路诱导促炎性巨噬细胞极化,而非依靠其酶活性驱动TAD进展 未提及研究局限性,但可能包括动物模型与人类TAD的差异、β-氨基丙腈诱导模型的局限性 阐明成纤维细胞激活蛋白在胸主动脉夹层发病机制中的生物学功能及分子机制 人类TAD标本、β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型、全身性和成纤维细胞特异性Fap基因敲除小鼠 机器学习 心血管疾病 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 表面等离子共振, 免疫共沉淀 NA 图像, 文本 人类TAD标本及小鼠模型,具体样本量未提及 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
194 2026-07-08
Single-Cell Analysis of Chemotherapy-induced Remodeling Reveals CD276-driven Basal-like Chemoresistance in Pancreatic Cancer
2026-04, Gastroenterology IF:25.7Q1
research paper 该研究通过单细胞RNA测序分析化疗前后配对样本,揭示了胰腺导管腺癌中由CD276驱动的基底样化疗耐药机制 首次在单细胞分辨率下描绘化疗重塑肿瘤细胞可塑性和微环境的动态过程,并发现CD276/B7-H3作为双重功能免疫检查点驱动化疗耐药 临床样本量相对有限(28例),主要发现需在更大队列中验证 探究化疗如何重塑胰腺导管腺癌的肿瘤细胞可塑性和肿瘤微环境以影响临床结局 接受白蛋白紫杉醇联合吉西他滨化疗的胰腺导管腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检组织和外周血单核细胞 digital pathology pancreatic cancer single-cell RNA sequencing, multiplex immunofluorescence, spatial transcriptomics, CRISPR-Cas9 knockout NA single-cell transcriptomic data, spatial transcriptomic data, immunofluorescence images 28例胰腺癌患者的配对治疗前后肿瘤活检组织和外周血单核细胞 10x Genomics single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics 10x Chromium, 10x Visium HD 10x Chromium单细胞测序,10x Visium HD空间转录组学(2微米分辨率)
195 2026-07-06
An integrative single-nucleus multiomic atlas of the human left ventricle identifies gene regulatory network dynamics across cardiac development, aging, and disease
2026-Apr-06, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 整合人类左心室多组学单核图谱,揭示心脏发育、老化与疾病中的基因调控网络动态 首次构建整合单核RNA-seq与ATAC-seq的多组学心脏细胞图谱,发现发育与疾病驱动的分子重塑高度重叠,并识别导致胎儿基因程序重激活的细胞类型特异性转录因子 未明确提及研究限制,但可能包括样本来源有限或技术偏差 解析人类心脏在发育、老化及疾病过程中的基因调控网络机制 人类左心室心脏细胞(来自299名供体的单核RNA-seq和106名供体的单核ATAC-seq数据) 机器学习 心血管疾病 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 299名供体(单核RNA-seq)和106名供体(单核ATAC-seq) NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
196 2026-07-06
NK Cell Activation by Platinum Boosts Immunotherapy in HR+/HER2- Breast Cancer
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 通过多组学和单细胞RNA测序揭示铂类药物通过激活NK细胞增强HR+/HER2-乳腺癌免疫治疗效果的新机制 首次发现铂类药物可通过NF-κB通路增强NK细胞活性,与免疫治疗产生协同效应,为HR+/HER2-乳腺癌提供联合治疗策略 NA 探索HR+/HER2-乳腺癌免疫治疗疗效受限的机制并寻找增强策略 HR+/HER2-乳腺癌肿瘤微环境中的NK细胞及铂类药物的免疫调节作用 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 多组学分析 NA 单细胞转录组数据, 临床队列数据 包括细胞系、患者来源肿瘤样本及临床队列 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
197 2026-07-05
Accurate profiling of single-cell alternative transcript start sites by correcting RNA degradation
2026-Apr-28, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发scATS工具,通过校正RNA降解,实现单细胞层面精确的替代转录起始位点分析,并揭示其在造血和肺癌中的作用 提出scATS方法,首次在亚型和样本水平估计RNA降解并校正其对TSS定量的影响,同时结合机器学习管道LRS识别与肺癌相关的TSS,实验验证了特定TSS亚型对癌细胞增殖和迁移的促进作用 未说明 解决RNA降解导致的读段覆盖不均匀问题,提高单细胞RNA-seq数据中转录起始位点定量的准确性,并揭示TSS在基因调控中的功能 造血过程中的细胞和肺癌细胞系(包括CCR6、CCR2和RTKN2等基因的TSS亚型) 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序、机器学习 机器学习管道(LRS) 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,涉及造血过程和肺癌细胞系 NA 单细胞RNA测序(5' scRNA-seq) NA NA
198 2026-07-05
Targeting ANXA1/TRKA axis enhances immunotherapy sensitivity in neural invasion-positive gastric cancer
2026-Apr-09, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示神经浸润阳性胃癌中ANXA1/TRKA轴导致CD8⁺T细胞耗竭并降低免疫治疗敏感性 首次阐明神经浸润阳性胃癌中ANXA1/TRKA轴通过阻断NEDD4L介导的TRKA泛素化降解,促进糖酵解代谢和CD8⁺T细胞耗竭,并提出A11肽联合TRKA抑制剂逆转T细胞耗竭的新策略 未明确提及,可能需进一步在更大样本或临床环境中验证其普遍性和治疗有效性 阐明神经浸润阳性胃癌的免疫微环境特征及分子机制,以增强免疫治疗敏感性 神经浸润阳性胃癌和阴性胃癌患者的肿瘤标本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、多重免疫组化 NA 基因表达数据 未明确提及,基于临床肿瘤标本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
199 2026-07-05
TMEM184A promotes progression and drug resistance in colorectal cancer: a bioinformatics and clinical study
2026-Apr-03, Scientific reports IF:3.8Q1
research paper 整合单细胞转录组学、空间转录组学、分子对接和多队列公共数据库,系统阐明结直肠癌中上皮细胞驱动的耐药机制,并通过临床病理石蜡样本评估关键蛋白TMEM184A的临床意义和预后价值 首次结合单细胞测序与空间转录组学揭示TMEM184A在结直肠癌上皮细胞耐药亚群中的驱动作用,并通过分子对接验证其与拉帕替尼等EGFR酪氨酸激酶抑制剂的强结合能力 样本仅限于病理石蜡切片,未在独立大样本队列中验证;功能性实验数据不足,缺乏体内外模型直接证明TMEM184A调控脂质代谢引发耐药的具体机制 阐明结直肠癌中耐药相关的分子机制并鉴定关键蛋白TMEM184A作为预后标志物和治疗靶点的潜力 结直肠癌肿瘤及癌旁组织样本 digital pathology colorectal cancer single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, molecular docking, tissue microarray, immunohistochemistry machine learning (unspecified) single-cell RNA-seq data, spatial transcriptomics data, bulk gene expression data, drug sensitivity data, tissue microarray images 多队列公共数据库样本及临床石蜡病理切片(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics 10x Chromium, 10x Visium NA
200 2026-07-05
Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics
2026-04-02, Cold Spring Harbor perspectives in medicine IF:7.8Q1
综述 探讨基因组学与生物信息学技术在帕金森病研究中的应用及其对分子机制理解的影响 综述了从1997年发现首个帕金森病相关风险基因至今,新技术如何革命性改变对遗传和分子机制的研究,特别是单细胞转录组学在揭示细胞类型特异性失调中的作用 未提及具体局限性 讨论神经基因组学和生物信息学如何应用于解析帕金森病这一复杂疾病的本质,以识别治疗干预的新靶点 帕金森病的遗传和分子机制 机器学习 帕金森病 基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学 NA 基因组数据、转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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