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当前共找到 934 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-03-28 |
Spatial Transcriptomics of TMJ Reveals a Remodeling Fibroblast-Immune Microenvironment Driving Arthritis Pain
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519816
PMID:41498747
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研究论文 | 本研究应用空间转录组学技术解析颞下颌关节关节炎的细胞微环境重塑，揭示了成纤维细胞-免疫细胞相互作用通过Igf1-Il33轴驱动关节炎疼痛的新机制 | 首次在成年小鼠颞下颌关节应用seqFISH空间转录组学技术，发现了新的细胞类型，绘制了细胞类型的解剖位置图谱，并揭示了关节炎诱导的成纤维细胞-免疫细胞微环境重塑及其通过Igf1-Il33轴驱动疼痛的机制 | 研究主要基于小鼠模型，虽然在患者滑膜组织中进行了验证，但人类样本的深入机制仍需进一步探索 | 探究颞下颌关节关节炎中细胞类型解剖组织与细胞微环境在疼痛性关节炎中的功能重要性 | 成年小鼠颞下颌关节及患者滑膜组织 | 空间转录组学 | 关节炎 | seqFISH (顺序荧光原位杂交) 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 成年小鼠颞下颌关节及患者滑膜组织（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | seqFISH | 顺序荧光原位杂交空间转录组技术 |
| 162 | 2026-03-28 |
Identification of a Force-Induced Sox9+Acan+ Transitional Subpopulation Linked to FGF2-FGFR2-ERK Signaling in Orthodontic Bone Remodeling
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519330
PMID:41572365
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定了一个在正畸骨重塑中受机械力诱导的Sox9+Acan+过渡亚群，并揭示了其通过FGF2-FGFR2-ERK信号通路促进破骨细胞分化和骨吸收的机制 | 首次在正畸骨重塑中识别出一个共表达Sox9和Acan的机械敏感过渡性细胞亚群，并阐明了其通过FGF2-FGFR2-ERK信号与巨噬细胞相互作用调控骨吸收的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；单细胞测序数据可能受技术偏差影响；GelMA@siRNA水凝胶系统的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究正畸力诱导的骨重塑中细胞异质性及机械敏感细胞亚群在正畸性炎症性牙根吸收中的作用机制 | 小鼠正畸牙移动模型中的间充质谱系细胞、免疫细胞（特别是巨噬细胞）及骨组织 | 单细胞组学 | 正畸性炎症性牙根吸收 | 单细胞RNA测序，RNAscope，多重免疫组化，机械刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 小鼠模型样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 163 | 2026-03-28 |
Improving atlas-scale single-cell annotation models with hierarchical cross-entropy loss
2026-Mar, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00945-z
PMID:41617882
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研究论文 | 本文提出了一种分层交叉熵损失函数，用于改进单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 | 引入分层交叉熵损失，将模型目标与生物层次结构对齐，无需额外计算成本即可提升分布外性能12-15% | 未明确说明模型在特定疾病或数据集上的具体限制，且强调需要新数据生成以改善注释细胞类型间的连通性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性和泛化能力 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释模型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性模型、transformer | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 164 | 2026-03-28 |
Partially shared multi-modal embedding learns holistic representation of cell state
2026-Mar, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00948-w
PMID:41741805
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研究论文 | 本文提出了一种名为APOLLO的计算框架，通过部分共享的多模态嵌入学习细胞状态的整体表示 | APOLLO框架自动学习多模态间的部分信息共享，使用具有部分重叠潜在空间的自动编码器，通过潜在优化学习，能够预测缺失模态并解耦与特定表型相关的模态或细胞区室 | NA | 开发一个计算框架以整合单细胞多模态数据，提供更可解释和全面的细胞状态视图 | 模拟数据及四种配对单细胞数据应用，包括SHARE-seq（scRNA-seq和scATAC-seq）、CITE-seq（scRNA-seq和蛋白质丰度）以及两个多重成像数据集 | 机器学习 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, 蛋白质丰度测量, 多重成像 | 自动编码器（Autoencoder） | 单细胞多模态数据（包括基因表达、染色质可及性、蛋白质丰度和成像数据） | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 165 | 2026-03-28 |
The RNA-binding protein SRSF3 controls epicardial formation by regulating splicing and proliferation
2026-Mar-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204918
PMID:41601313
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研究论文 | 本研究揭示了RNA结合蛋白SRSF3通过调控剪接和增殖在心脏外膜形成中的关键作用 | 首次发现SRSF3在胚胎前心外膜和心外膜层高表达，并证明其缺失会导致增殖停滞，影响心外膜形成；通过单细胞RNA测序揭示非重组细胞的代偿性增殖现象 | 未完全阐明SRSF3调控细胞周期调节因子的具体分子机制；研究主要基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 探究RNA结合蛋白SRSF3在心脏外膜形成和功能调控中的分子机制 | 小鼠胚胎前心外膜和心外膜细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，内源性irCLIP | NA | RNA测序数据，蛋白质-RNA相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 166 | 2026-03-28 |
Conversion of Transplanted Mature Hepatocytes into Afp+ Reprogrammed Cells for Liver Regeneration After Injury
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202517126
PMID:41609487
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研究论文 | 本研究揭示了移植的成熟肝细胞在肝损伤后通过转化为甲胎蛋白阳性的重编程细胞（Afp rHeps）来驱动肝脏再生的分子机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序等技术，系统阐明了移植成熟肝细胞转化为Afp+重编程细胞的动态过程及其调控网络，特别是发现了PPARγ/AFP代谢轴和TNF-α/AP-1有丝分裂信号的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肝脏再生中的普适性仍需进一步验证；单细胞测序技术虽然能揭示细胞异质性，但可能无法完全捕捉到所有低丰度细胞类型或瞬时状态 | 探究移植的成熟肝细胞在肝脏损伤后驱动再生的具体细胞与分子机制 | 移植的成熟肝细胞及其在损伤肝脏微环境中的命运转变 | 单细胞组学与再生医学 | 肝衰竭/肝损伤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq), 谱系追踪, 连续移植 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 167 | 2026-03-28 |
Identifying Clones in Myelodysplastic Syndromes by Using Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70189
PMID:41886772
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 168 | 2026-03-28 |
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708613
PMID:41890091
|
研究论文 | 本研究探讨了女性诱导多能干细胞在CRISPR基因编辑和神经分化过程中X染色体失活侵蚀的转录组效应 | 首次系统研究了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC XCI侵蚀的影响，揭示了其在神经元中引起的等位基因特异性表达偏倚及其对差异表达基因分析的混淆效应 | 研究主要基于有限供体细胞系（4个），且单细胞RNA-seq仅覆盖42个编辑基因的子集 | 探究女性iPSC在CRISPR编辑和神经分化过程中XCI侵蚀的转录组影响及其对神经发育疾病建模的意义 | 女性诱导多能干细胞及其分化的神经元 | 单细胞组学 | 神经发育障碍 | CRISPR基因编辑, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系（来自4个供体，针对66个基因），以及iPSC衍生神经元的单细胞RNA-seq数据（针对42个编辑基因的子集） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2026-03-27 |
The Impact of Low-Protein Diet on the Molecular and Cellular Development of the Fetal Kidney
2026-Mar-26, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000001053
PMID:41885952
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研究论文 | 本研究探讨了母体低蛋白饮食对胎儿肾脏发育中分子和细胞过程的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和成像技术，全面解析低蛋白饮食如何通过影响代谢、细胞周期和信号通路来损害肾单位祖细胞的承诺和分化 | 研究基于动物模型，可能无法完全反映人类情况，且未探讨长期健康后果 | 揭示低蛋白饮食导致肾单位数量减少的细胞和分子机制 | 胎儿肾脏发育过程，特别是肾单位祖细胞和输尿管芽分支形态发生 | 数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序，断层扫描成像，共聚焦显微镜 | NA | 图像，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 170 | 2026-03-25 |
Exosomal miR-26a-5p From Urine-Derived Stem Cells Mitigates Renal Fibrosis via Targeting NRAS
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504385RR
PMID:41874363
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研究论文 | 本研究揭示了尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS基因，抑制MAPK信号通路和机械微环境激活，从而缓解肾纤维化的分子机制 | 首次发现尿液来源干细胞外泌体中的miR-26a-5p通过靶向NRAS并抑制下游MAPK信号通路及机械信号分子（如PTK2、SRC等），从而减轻肾纤维化 | NA | 探究尿液来源干细胞外泌体中的miRNA是否能抑制肾纤维化及其分子机制 | 肾纤维化过程、尿液来源干细胞、外泌体、miR-26a-5p、NRAS基因 | 分子生物学 | 慢性肾病 | miRNA高通量测序、整合转录组分析、单细胞测序分析、双荧光素酶报告基因检测 | NA | 测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 171 | 2026-03-25 |
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Mar-24, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后心脏内调节性T细胞的组织适应轨迹，并发现CCL1-CCR8轴对于Treg的募集和功能至关重要，从而保护心肌免受损伤 | 首次描绘了Treg从纵隔淋巴结到心脏的分化轨迹，并确立了CCL1-CCR8轴作为Treg募集和发挥心脏保护功能的关键通路 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩大样本量以确认临床普适性 | 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹、募集机制及其在心脏修复中的作用 | 小鼠心肌梗死模型、调节性T细胞、CCR8和CCL1基因修饰小鼠、以及心肌梗死患者的血液和心脏组织 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及多种基因修饰小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 172 | 2026-03-25 |
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-24, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.6c01481
PMID:41808385
|
研究论文 | 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台，并通过多组学分析揭示了其靶向肿瘤和调节免疫的双重作用机制 | 开发了一种结合热触发局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束，并首次采用无针注射方式递送，同时利用单细胞测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学技术深入解析了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 | NA | 开发一种新型的黑色素瘤治疗策略，旨在提高紫杉醇的局部暴露、减少全身毒性并增强抗肿瘤效果 | 黑色素瘤 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 173 | 2026-03-25 |
AutoGERN: Single-Cell RNA-Seq Gene Regulatory Network Inference via Explicit Link Modeling and Adaptive Architectures
2026-Mar-24, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag143
PMID:41871930
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研究论文 | 本文提出了AutoGERN，一种基于图神经网络（GNN）的框架，专门用于从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中推断基因调控网络（GRN） | AutoGERN通过显式建模调控信息、学习表达性链接嵌入，并采用双消息传递空间和自适应架构搜索，提高了GRN推断的性能和鲁棒性 | 未在摘要中明确提及 | 开发一种能够从scRNA-seq数据中准确推断基因调控网络的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络（GNN），多层感知机（MLP） | 基因表达数据 | 多个真实scRNA-seq数据集（未指定具体数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 174 | 2026-03-25 |
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71009-7
PMID:41872221
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研究论文 | 本研究阐明了家族性渗出性玻璃体视网膜病变中β-catenin/KIF11/PRDX1轴通过诱导铁死亡导致血管缺陷的分子机制 | 首次揭示了KIF11通过抑制PRDX1磷酸化驱动的液-液相分离来防止视网膜内皮细胞铁死亡，并提出了靶向铁死亡和抗氧化策略作为潜在疗法 | 研究主要基于小鼠模型，其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步验证 | 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的下游致病机制 | 视网膜内皮细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 多组学研究 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies epithelial cell-related biomarkers and immune subtypes in focal segmental glomerulosclerosis
2026-Mar-24, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-026-05101-8
PMID:41872652
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，鉴定了局灶节段性肾小球硬化症中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据系统分析FSGS中上皮细胞相关的分子改变，并构建了具有高诊断准确性的三基因标志物 | 分析基于公共数据集，需要进一步的实验验证来确认其机制相关性 | 鉴定FSGS中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型，以改善诊断和患者分层 | 局灶节段性肾小球硬化症患者 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | 随机森林, 支持向量机 | 转录组数据 | 多个公共数据集（GSE200818, GSE200828, GSE176465, GSE133288, GSE108109） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-03-25 |
Adipose tissue microvascular is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Mar-24, AIDS (London, England)
DOI:10.1097/QAD.0000000000004491
PMID:41873969
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研究论文 | 本研究探讨了接受当代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者中，皮下脂肪组织微血管重塑与胰岛素抵抗及血浆脂质组改变之间的关联 | 首次在长期接受当代ART且病毒抑制的HIV感染者中，结合单细胞RNA测序分析脂肪组织细胞组成与无靶向血浆脂质组学，揭示了微血管重塑与胰岛素抵抗相关脂质特征的联系 | 研究为横断面观察性设计，无法确定因果关系；样本量相对有限（n=127），且女性比例较低（23%） | 探究HIV感染者脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质，并阐明其与胰岛素抵抗的关联 | 接受长期当代抗逆转录病毒治疗且病毒抑制的HIV感染者 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，无靶向脂质组学分析 | 逻辑回归和线性回归模型 | 单细胞RNA测序数据，血浆脂质组学数据 | 127名HIV感染者（含59名进行单细胞RNA测序的腹部皮下脂肪组织样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 177 | 2026-03-25 |
Cytokine-driven PANoptosis of alveolar macrophages mediated by STAT1 underlies acute lung injury in hypervirulent Klebsiella pneumoniae infection
2026-Mar-24, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03958-25
PMID:41874176
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研究论文 | 本研究揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染通过STAT1依赖的PANoptosis导致肺泡巨噬细胞死亡，进而引发急性肺损伤的机制 | 首次发现高毒力肺炎克雷伯菌感染可诱导肺泡巨噬细胞发生PANoptosis（一种协同的细胞死亡过程），并阐明STAT1转录因子在此过程中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的机制验证尚需进一步研究；STAT1信号通路与其他细胞死亡通路的交互作用有待深入探索 | 探究高毒力肺炎克雷伯菌感染导致急性肺损伤的免疫病理机制 | 小鼠肺泡巨噬细胞、高毒力肺炎克雷伯菌 | 免疫学、感染性疾病 | 急性肺损伤、肺炎、败血症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、细胞通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 178 | 2026-03-25 |
Novel protein biomarkers for risk stratification and personalized medicine
2026-Mar-24, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfag068
PMID:41874429
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研究论文 | 本研究探讨了尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为反映肾小管损伤与修复的药效学生物标志物，在慢性肾脏病中分别对应内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂的治疗反应 | 首次将尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为机制导向的药效学生物标志物，分别用于评估内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂在慢性肾脏病中的治疗反应，并揭示了其与不同病因、糖尿病状态及血糖控制的异质性关联 | 研究基于两个独立的临床试验人群，可能存在队列特异性偏差；生物标志物的长期预后价值及临床转化应用仍需进一步验证 | 评估尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为慢性肾脏病治疗中机制特异性药效学生物标志物的可行性 | 慢性肾脏病患者 | 临床医学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液生物标志物测量数据、血清生物标志物数据、单细胞RNA测序数据 | 来自SONAR和DAPA-CKD两个随机临床试验的人群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-03-25 |
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-0775
PMID:41874448
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研究论文 | 本文介绍了一种名为IN-DEPTH的流程，用于在同一玻片上整合空间转录组学和蛋白质组学数据，以揭示肿瘤微环境中的空间重组机制 | 开发了IN-DEPTH工作流，实现单细胞空间蛋白质组学成像引导的转录组捕获，避免了RNA信号损失，并提出了SGCC框架用于整合多模态数据 | 未明确提及具体的技术限制或样本量不足等问题 | 旨在开发一种可扩展的空间多组学方法，以揭示临床相关的肿瘤微环境机制并支持空间多模态AI模型构建 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）组织，包括EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 空间转录组学，空间蛋白质组学，单细胞成像 | NA | 图像，转录组数据，蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞空间蛋白质组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 180 | 2026-03-25 |
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-Mar-23, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281001.125
PMID:41633767
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研究论文 | 本文提出了一种名为spRefine的深度学习框架，利用基因组语言模型对空间转录组数据进行联合去噪和插补 | 开发了一个无参考框架，利用基因组语言模型联合处理空间转录组数据的噪声和缺失值问题，并展示了其在数据整合、模型预训练及发现新生物学信号方面的优势 | 未明确提及具体局限性 | 解决空间转录组数据中高噪声水平和基因测量缺失的问题，以提高数据质量和下游分析效果 | 空间转录组数据 | 计算生物学/生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架，基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |