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当前共找到 1050 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 162 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
|
综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架，整合识别、递送和反馈，实现个性化精准免疫治疗，并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域，包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物，并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及，但一般可能包括：机制验证仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中确认；4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP（免疫共沉淀）、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据（scRNA-Seq）、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠（多个）及野生型对照小鼠；具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
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研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能，包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法，涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集，揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究，Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法，为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法（STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV） | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 166 | 2026-04-29 |
A single-cell atlas of the human airways from patients with allergic rhinitis comorbid with asthma
2026-Mar-24, Annals of allergy, asthma & immunology : official publication of the American College of Allergy, Asthma, & Immunology
DOI:10.1016/j.anai.2026.03.013
PMID:41887463
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序技术，绘制了过敏性鼻炎合并哮喘患者气道的单细胞图谱，揭示了上下气道细胞组成和转录变化的相似性及炎症反应机制 | 首次对过敏性鼻炎合并哮喘患者多个不同微解剖区域的气道刷取样本进行单细胞RNA分析，发现了病变气道纤毛细胞结构损伤和上皮屏障破坏，并鉴定出GZMA-PARD3通路在体外破坏气道上皮屏障 | 仅纳入有限样本量，且为横断面研究、缺乏纵向随访数据 | 研究过敏性鼻炎合并哮喘患者上下气道细胞种群分布和转录变化，探索慢性炎症条件下细胞图谱的异同 | 过敏性鼻炎合并哮喘患者及健康志愿者的鼻腔和支气管刷取细胞 | machine learning | asthma | single-cell RNA-seq | NA | single-cell transcriptomic data | 若干名过敏性鼻炎合并哮喘患者和健康志愿者的鼻腔及支气管刷取样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 167 | 2026-04-29 |
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698073
PMID:41835394
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综述 | 本文综述了小麦穗发育过程中调控小穗数目的基因网络与分子机制，重点探讨了顶端分生组织向花序分生组织转变、小穗分生组织形成速率及终端小穗转化时间等关键过程 | 整合了近年空间转录组学、单细胞分析及多组学技术在小麦穗发育研究中的最新应用，系统梳理了促进小穗数增加的突变体（如超数小穗和分枝结构）及其育种应用进展 | 目前将超数小穗突变导入商业品种时面临育性和籽粒重量的权衡问题，且对多基因组合效应的田间验证研究仍有限 | 阐明小麦穗部小穗数目（SNS）的遗传调控网络及其对产量的影响机制 | 小麦穗部发育过程中的花序分生组织（IM）、小穗分生组织（SM）及终端小穗（TS） | 植物遗传学与作物育种 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 168 | 2026-04-28 |
LAML-Pro: Joint Maximum Likelihood Inference of Cell Genotypes and Cell Lineage Trees
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714879
PMID:41959070
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研究论文 | 提出一种名为LAML-Pro的算法，能够联合推断细胞基因型和细胞谱系树，以克服现有两步法因基因型错误导致谱系树不准确的问题 | 提出基于概率混合型缺失观测（PMMO）模型的联合推断方法，利用状态转移的稀疏性在数千个细胞中快速构建谱系树，并纠正基因型错误 | 仅适用于基于成像的谱系追踪数据，对新一代测序数据适用性未明确说明 | 开发一种能够从动态谱系追踪数据中同时推断细胞基因型和谱系树的算法，以提高谱系重建的准确性 | 模拟数据以及两种基于成像的谱系追踪系统产生的实验数据 | 机器学习 | NA | 基因组编辑诱导突变、单细胞成像 | PMMO（概率混合型缺失观测模型）、最大似然估计 | 成像数据（荧光成像）、模拟基因型数据 | 模拟数据中数千个细胞；实验数据中两种成像谱系追踪系统的样本 | NA | 单细胞成像 | NA | NA |
| 169 | 2026-04-28 |
Intercellular communication is a heritable dimension of human tissue architecture
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.29.715138
PMID:41959167
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研究论文 | 本研究提出EdgeMap方法，整合空间转录组学与GWAS摘要统计，将性状遗传力分解为细胞内在和细胞间组成部分，并解析细胞间信号为特定配体-受体通道 | 首次将遗传效应定位到细胞间分子界面，建立细胞间通讯作为遗传架构的可遗传维度 | 未明确说明限制 | 探究细胞间通讯在组织架构中的遗传性及其对疾病风险的贡献 | 17种人类性状和5种人体组织 | 机器学习 | 双相情感障碍、心血管疾病、肝脏疾病 | 空间转录组学、GWAS摘要统计 | EdgeMap | 空间转录组数据 | 多种组织切片及独立GWAS队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 细胞分割的Visium HD |
| 170 | 2026-04-28 |
The Human Male Mammary Gland has Similar Epithelial Populations to Female but Distinct Composition and Transcriptional Properties
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714915
PMID:41959192
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研究论文 | 论文通过单细胞RNA测序描绘了正常成人男性乳腺的细胞图谱，发现其与女性乳腺具有相同的上皮细胞类型，但组成和转录特性不同 | 首次以单细胞分辨率描述正常男性乳腺的细胞和转录特征，揭示了男性乳腺中管腔成熟细胞比例增加、基底细胞和管腔祖细胞减少的特异性组成，以及区别于女性的基因表达、RNA加工、炎症信号和雌激素受体通路活性差异 | 未提及具体局限性 | 填补正常男性乳腺单细胞层面表征的空白，为男性乳腺癌的细胞基础提供参考 | 正常成人乳腺组织样本（来自3名男性和14名女性捐赠者） | 数字病理学, 机器学习 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17名捐赠者（3名男性、14名女性），共174471个细胞（含18117个男性来源细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 171 | 2026-04-28 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third trimester pregnancy
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.711478
PMID:41959409
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研究论文 | 通过高维多组学分析揭示妊娠晚期CD4+ T细胞中IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 首次结合流式细胞术筛选>350个表面蛋白和单细胞RNA测序（含>130种CITE-seq条形码抗体）系统分析妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白组和转录组变化 | 研究对象仅限于足月妊娠（>37周）样本，未包含早产或整个妊娠周期的纵向数据 | 理解妊娠期CD4+ T细胞表面蛋白质组和转录组的分子变化及其免疫调节机制 | 正常妊娠女性血液和蜕膜中的CD4+ T细胞，以及非妊娠女性血液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 足月妊娠（>37周）女性的血液和蜕膜样本，以及非妊娠女性的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 结合CITE-seq抗体标记 |
| 172 | 2026-04-28 |
CosMxScope: Scalable Reconstruction and Digital Pathology Integration of Imaging-Based Spatial Transcriptomics Data
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.713520
PMID:41959506
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研究论文 | CosMxScope是一个轻量级开源Python框架，用于重建成像型空间转录组学数据并与数字病理学工具整合 | 将CosMx空间分子成像仪数据与广泛使用的数字病理学环境（如QuPath）桥接，提供FOV图像拼接、细胞分割多边形和转录坐标转换为GeoJSON对象的功能，促进空间转录组学与病理学分析工作流的结合 | 该框架专为CosMx SMI平台设计，可能不适用于其他空间转录组学平台 | 开发一个实用的工具，实现空间转录组学数据与数字病理学可视化环境的交互式探索和整合 | 人类和小鼠组织的CosMx空间分子成像数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和转录坐标 | 多个正在进行的研究项目涉及人类和小鼠组织 | NA | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪，用于单细胞空间多组学分析，可测量每个细胞数千个RNA或蛋白质靶标 |
| 173 | 2026-04-28 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
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review | 本综述从解剖学、生理学、遗传学和计算学角度综合探讨了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了多组学、系统生物学和AI驱动建模的综合框架，用于预测泡状细胞行为以优化作物抗逆性 | 对泡状细胞在复合非生物胁迫下的响应机制以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡的理解仍存在显著知识空白 | 整合泡状细胞的结构、功能和调控知识，推动抗胁迫作物品种的开发 | 泡状细胞（禾本科叶片上的特化表皮运动细胞） | machine learning | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联分析、QTL定位 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 高分辨率成像、单细胞转录组学技术 |
| 174 | 2026-04-27 |
Exploring the immune environment of glioblastoma in humanized mouse models
2026-Mar-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag073
PMID:41913047
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研究论文 | 通过建立人源化小鼠模型，探索胶质母细胞瘤的免疫微环境 | 首次利用表达关键人细胞因子的免疫缺陷小鼠模型，结合患者来源异种移植物和单细胞RNA测序，成功构建了模拟复发胶质母细胞瘤免疫特征的人源化小鼠模型 | 未明确提及具体局限性，但可能包括模型对肿瘤异质性复制的有限性和人源化小鼠免疫系统完全重建的挑战 | 建立能够模拟人类复发胶质母细胞瘤免疫环境的动物模型，以促进新疗法特别是免疫疗法的研究 | 胶质母细胞瘤患者来源的异种移植物及人源化小鼠中的肿瘤和免疫细胞 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 未明确提及具体样本数量，涉及多个人源化小鼠模型和患者数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序 |
| 175 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
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研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法，整合六种细胞-细胞相互作用预测工具，优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性，强调排名列表顶部的一致性，优于简单平均值基线，并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略，强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-03-18 |
Single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to reveal the molecular mechanisms related to integrated stress responses in atherosclerosis
2026-Mar-17, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-03862-y
PMID:41840716
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08032-1
PMID:41845371
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2026-04-27 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了AGPAT3通过脂质重塑调控肿瘤细胞对IFNγ介导的铁死亡易感性，并增强免疫检查点抑制剂疗效的机制 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑促进铁死亡，并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型以提升免疫治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，临床样本分析有限，且未深入探讨AGPAT3在其他免疫微环境细胞中的作用 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞（涉及IFN-γ信号通路和铁死亡敏感性） | 机器学习， 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序， 脂质组学， 转录组学， ChIP-seq， CUT&Tag | 机器学习模型（针对铁死亡相关基因） | 单细胞RNA测序数据， 脂质组数据， 转录组数据 | 大型单细胞RNA测序数据集（具体样本量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 179 | 2026-04-27 |
Dissecting the differentiation origins of intestinal metaplasia and early intestinal-type gastric cancer in gastric antrum by single-cell RNA profiling
2026-Mar-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01355-8
PMID:41807518
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序剖析胃窦肠上皮化生和早期肠型胃癌的分化起源 | 首次通过单细胞测序详细描绘了胃疾病不同阶段（非萎缩性胃炎、慢性萎缩性胃炎、肠上皮化生和早期肠型胃癌）中上皮细胞的分化轨迹，揭示了祖细胞、腺体粘液细胞和凹坑粘液细胞在不同阶段的分化潜能，并鉴定出KIAA0101PRAP1祖细胞可能是早期肠型胃癌的潜在起源 | 尚未明确阐述不同疾病阶段细胞分化的分子机制及其致癌潜力的具体调控通路 | 探讨胃疾病不同阶段的细胞分化起源及其致癌潜力，为肠型胃癌的分子机制研究提供新见解 | 胃窦活检组织中的上皮细胞，包括祖细胞、腺体粘液细胞、凹坑粘液细胞、肠样干细胞表型细胞、成熟肠细胞、分泌前细胞和杯状细胞等 | 单细胞转录组学 | 肠型胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自具有癌前病变和早期胃癌患者的胃窦活检样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 180 | 2026-04-27 |
The changing landscape of gene expression analysis
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag185
PMID:42028808
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述评 | 综述了基因表达分析在过去25年中的技术演进，并展望了未来发展方向 | 通过分析707,831篇开放获取全文文章，将计算工具映射到统一时间线，并提出了三个未来方向：可搜索的转录组知识库、基因表达分析基础模型和可编程调控设计 | 未明确讨论现有技术在实际应用中的成本、可重复性和临床转化挑战 | 梳理基因表达分析的方法学里程碑和计算工具演进，并预测未来趋势 | 707,831篇开放获取全文文章中的生物信息学计算工具和文献计量学数据 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 表达序列标签, 微阵列, RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | 统计学框架, 端到端分析生态系统 | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |