本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2026-06-20 |
Single cell and multi-omics analysis reveal senescence-related molecular subtypes and a prognostic signature in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-02, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04674-1
PMID:41770477
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析,揭示了透明细胞肾细胞癌中与衰老相关的分子亚型并构建了预后风险评分模型 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据,系统表征ccRCC中细胞衰老的特征,并基于随机生存森林构建了具有强预后价值的风险评分模型,同时鉴定出ALDH18A1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究中使用的数据来自公共数据库,缺乏多中心前瞻性队列验证;另外,SASP特征的评估可能受限于现有数据的分辨率和选择偏差 | 阐明透明细胞肾细胞癌中细胞衰老的全面特征及其临床意义 | 透明细胞肾细胞癌患者样本和组织细胞系 | 计算机视觉 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | TCGA-KIRC队列537例,E-MTAB-1980队列101例,CPTAC-ccRCC队列105例,以及两个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 162 | 2026-06-19 |
Topological Data Analysis for Unsupervised Feature Selection in Large Scale Spatial Omics Data Sets
2026-Mar-04, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-026-01618-2
PMID:41779089
|
研究论文 | 应用持续同调(一种拓扑数据分析方法)进行大规模空间组学数据的无监督特征选择,并展示其在空间可变基因识别等下游任务中的应用 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组学特征选择,提供连续的基因空间结构量化指标,并证明其在不同空间组学模态(如空间代谢组学)中的自然扩展性 | 未提及具体局限性 | 开发一种基于拓扑数据分析的无监督特征选择方法,用于大规模空间组学数据集中空间结构量化与空间可变基因识别 | 公共空间转录组学数据中的肾脏疾病和心肌梗死样本,以及空间代谢组学样本 | 计算机视觉, 机器学习 | 肾脏疾病, 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间代谢组学 | 持续同调 | 空间转录组数据, 空间代谢组数据 | 未明确提及具体样本数量 | NA | 空间转录组学, 空间代谢组学 | NA | NA |
| 163 | 2026-06-18 |
ADAMTS7 promotes smooth muscle foam cell expansion in atherosclerosis
2026-03-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI187451
PMID:41609669
|
研究论文 | 研究ADAMTS7通过AP-1/PU.1/CD36调控轴促进平滑肌泡沫细胞形成,从而加剧动脉粥样硬化 | 首次揭示ADAMTS7在平滑肌细胞中的促动脉粥样硬化作用依赖于AP-1/PU.1/CD36调控轴,并利用单细胞RNA测序和条件性基因敲除/转基因小鼠模型阐明细胞特异性机制 | 未明确说明本研究的局限性 | 探究ADAMTS7在动脉粥样硬化中促进平滑肌泡沫细胞形成的细胞特异性机制 | 人类颈动脉粥样硬化组织及平滑肌细胞、内皮细胞特异性Adamts7条件性敲除和转基因小鼠 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | 人类动脉粥样硬化样本(数量未明确)及小鼠模型 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序,ATAC测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序,Illumina NovaSeq平台进行RNA测序和ATAC测序 |
| 164 | 2026-06-18 |
Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment
2026-03-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102793
PMID:41650958
|
研究论文 | 通过比较Jarid2和Ezh2的缺失,揭示Jarid2在造血干细胞谱系定植中依赖PRC2的功能 | 首次通过遗传学比较Jarid2和Ezh2缺失的造血干细胞和祖细胞,区分Jarid2依赖PRC2与非依赖PRC2的功能,并发现其在限制髓系分化潜能中的核心作用 | 仅研究了小鼠模型,可能不完全适用于人类造血系统;未完全阐明Jarid2的非经典PRC2独立功能 | 解析Jarid2在造血干细胞谱系定植中的PRC2依赖功能 | Jarid2或Ezh2基因缺陷的小鼠造血干细胞和祖细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Jarid2和Ezh2缺陷小鼠的骨髓祖细胞群体 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 165 | 2026-06-18 |
In situ spatial transcriptomics reveals novel markers of the limbal stem cell niche and ocular surface epithelia
2026-03-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2026.102792
PMID:41650959
|
研究论文 | 利用原位空间转录组学揭示了角膜缘干细胞生态位和眼表上皮的新型标志物 | 首次通过原位空间转录组学技术识别出Krt16和Nkiras1作为角膜缘干细胞和中性粒细胞的新型标志物,避免了单细胞RNA测序中空间定位丢失的问题 | 未明确提及 | 探索角膜缘干细胞的空间定位及其新型标志物,以改善角膜缘干细胞缺乏症的治疗 | 哺乳动物角膜缘干细胞及眼表上皮细胞 | 数字病理学 | 角膜缘干细胞缺乏症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 166 | 2026-06-18 |
Dermal fibroblasts respond to IL-4 and IL-13 and promote T cell recruitment in atopic dermatitis
2026-03-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI196108
PMID:41569693
|
研究论文 | 探究真皮成纤维细胞在特应性皮炎中如何响应IL-4和IL-13并促进T细胞募集 | 首次揭示IL-4Rα依赖的免疫作用成纤维细胞(IAFs)在特应性皮炎中的主动免疫角色 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人体内直接证据尚需进一步验证 | 阐明真皮成纤维细胞在2型免疫反应中的功能及其在特应性皮炎中的作用机制 | 人类特应性皮炎皮肤样本及2型炎症小鼠模型 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类AD皮肤样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 167 | 2026-06-18 |
Enrichment of Neural Crest Cells by Antibody Labeling and Flow Cytometry for Single-Cell Transcriptomics in a Lizard
2026-Mar, Evolution & development
IF:2.6Q2
DOI:10.1111/ede.70030
PMID:41709476
|
研究论文 | 提出一种通过抗体标记和流式细胞术富集蜥蜴神经嵴细胞的方法,用于单细胞转录组学研究 | 首次在缺乏转基因工具的非模式脊椎动物(普通壁蜥)中,利用抗体标记结合荧光激活细胞分选(FACS)富集神经嵴细胞,且效果与转基因方法相当 | 方法依赖于特异性抗体,可能对某些物种或组织适用性有限;未提及大规模应用或跨物种验证 | 开发一种无需转基因工具即可富集神经嵴细胞的方法,以拓展单细胞转录组学在发育和演化研究中的应用 | 普通壁蜥(Podarcis muralis)胚胎中的神经嵴细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 抗体标记、荧光激活细胞分选(FACS)、单细胞RNA测序、反转录定量聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据、显微图像、qPCR数据 | 壁蜥胚胎样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒(推测) |
| 168 | 2026-06-17 |
Spatial Transcriptomics of Human Decidua Identifies Molecular Signatures in Recurrent Pregnancy Loss
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf080
PMID:41031483
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析人类蜕膜,揭示复发性妊娠丢失中的分子特征 | 首次对健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜进行空间转录组分析,鉴定了两个不同的空间区域(植入区和腺体分泌区),并发现FOSL2是协调蜕膜自然杀伤细胞(dNK1)空间转化的关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 阐明人类蜕膜中免疫耐受的复杂空间和调控结构,为复发性妊娠丢失中的免疫耐受失调提供新见解 | 人类早期妊娠蜕膜组织,包括健康供体和复发性妊娠丢失患者 | 数字病理学 | 复发性妊娠丢失 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞染色质可及性数据,转录因子占用数据 | 健康供体和复发性妊娠丢失患者的早期妊娠蜕膜样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台 |
| 169 | 2026-06-15 |
[Crosstalk of keratin 17-positive epithelial cells with CD8+ T cells in oral lichen planus and clinical relevance]
2026-Mar-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 探究口腔扁平苔藓中角蛋白17阳性上皮细胞与CD8+ T细胞的相互作用及临床相关性 | 首次揭示KRT17阳性上皮细胞在口腔扁平苔藓中通过HLA-A/B/C-CD8和MIF-CD74/CXCR4通路与CD8+ T细胞交互,并发现KRT17表达与临床严重程度正相关 | 样本量较小,仅涉及有限例数的单细胞和批量测序样本,且未深入机制验证 | 理解KRT17阳性上皮细胞在口腔扁平苔藓发病机制中的作用及其与CD8+ T细胞互作的临床意义 | KRT17阳性上皮细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 口腔扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多重免疫荧光染色 | CellChat, CIBERSORT, Pearson相关性分析 | 基因表达数据, 免疫荧光图像 | 单细胞RNA测序:5例(2例NEOLP、2例EOLP、1例HC);批量RNA测序:40例(27例NEOLP、13例EOLP);免疫荧光:45例(20例NEOLP、20例EOLP、5例HC) | Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Illumina NovaSeq, Illumina unnamed | 单细胞RNA测序数据来自10x Genomics平台(隐含);批量RNA测序数据来自GSE213346数据集(Illumina平台) |
| 170 | 2026-06-15 |
Perivascular mesenchymal cells instruct ST2+ reparative macrophages to promote endovascular injury-induced neointimal hyperplasia in mice
2026-Mar-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68587-x
PMID:41794821
|
研究论文 | 通过小鼠血管内损伤模型,发现血管周围间充质细胞通过IL33-ST2-OPN轴引导ST2+修复性巨噬细胞促进新生内膜增生 | 首次揭示血管周围间充质细胞与ST2+修复性巨噬细胞之间的IL33-ST2-OPN信号轴,并证明通过局部水凝胶递送靶向Il33或Spp1的siRNA可有效缓解损伤诱导的新生内膜增生 | 研究仅限于雄性小鼠模型,且未探讨此机制在人类血管疾病中的直接适用性 | 探究血管周围间充质细胞在血管内损伤后免疫-基质细胞相互作用中的免疫调节机制 | 雄性小鼠的血管损伤模型中的血管周围间充质细胞、ST2+修复性巨噬细胞、血管平滑肌细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 时间分辨单细胞测序 |
| 171 | 2026-06-15 |
Epithelial plasticity shapes intratumoral heterogeneity and cell lineages in early-stage lung cancer
2026-Mar-06, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady8546
PMID:41790896
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析早期肺腺癌,系统定义肿瘤状态并揭示表型可塑性驱动的瘤内异质性和细胞谱系 | 首次在早期肺癌中通过单细胞和空间转录组学系统揭示表型可塑性(包括去分化和转分化)是瘤内异质性的关键维度,并识别出AT2向AT1转分化过程中的过渡态,发现KLF4和JDP2转录因子可重编程肿瘤进入过渡态并抑制进展 | 样本量较小(14例患者),需更多队列验证;未明确过渡态在肿瘤进展中的动态演变及治疗靶点转化潜力 | 阐明早期肺癌中瘤内异质性的起源和机制 | 早期肺腺癌患者(14例)的肿瘤细胞和组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、CUT&Tag、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据和空间转录组图像数据 | 14例早期肺腺癌患者,共103,375个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 172 | 2026-06-15 |
Amino acid metabolism-related model for prognosis and immunity in gastric cancer
2026-Mar-05, Amino acids
IF:3.0Q3
DOI:10.1007/s00726-026-03507-3
PMID:41784817
|
研究论文 | 构建基于氨基酸代谢相关基因的胃癌预后模型并分析其与免疫微环境的关联 | 首次系统整合TCGA和GEO数据构建氨基酸代谢相关基因(AAMRGs)预后模型,并结合单细胞RNA测序分析核心基因与免疫细胞的关系,通过PCR验证基因在胃癌细胞中的表达 | 未提及内部队列验证或外部多中心验证,以及模型在临床决策中的实际应用效果 | 系统研究胃癌中氨基酸代谢重编程并构建预后模型,验证基因标志物的预测价值和临床决策作用 | 胃癌患者样本数据及胃癌细胞系 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、PCR | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的胃癌样本,具体数量未提及 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | TCGA和GEO的bulk RNA-seq数据,以及scRNA-seq数据集分析 |
| 173 | 2026-06-15 |
Interferon-γ-Responsive Microglia-Derived Extracellular Vesicles Inhibited Neurogenesis After Stroke via MicroRNA-199a-5p/SIRT1 Axis
2026-Mar-03, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043532
PMID:41717953
|
研究论文 | 本研究揭示干扰素-γ反应性小胶质细胞来源的细胞外囊泡通过miR-199a-5p/SIRT1轴抑制中风后神经发生 | 首次发现干扰素-γ反应性小胶质细胞通过细胞外囊泡中的miR-199a-5p靶向SIRT1,抑制神经干细胞存活和分化,为缺血性中风治疗提供新靶点 | 主要基于小鼠模型,缺乏人体样本验证;miRNA调控网络可能还有其他通路参与 | 探讨干扰素-γ反应性小胶质细胞在中风后神经功能恢复中的作用及分子机制 | 成年雄性小鼠、小胶质细胞BV2细胞系、神经干细胞 | 数字病理学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序、miRNA测序、Western blot、实时定量PCR、荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据、miRNA表达数据 | 成年雄性小鼠(具体数量未在摘要中说明);scRNA-seq分析含多个脑组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 174 | 2026-06-15 |
IFN signaling is associated with radiotherapy response in malignant peripheral nerve sheath tumors
2026-Mar-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195652
PMID:41766654
|
研究论文 | 该研究结合多种转录组学和功能基因组学方法,揭示IFN信号通路在恶性外周神经鞘瘤放疗反应中的关键作用 | 首次通过整合单细胞转录组、CRISPR筛选和多平台分析,阐明I型IFN信号介导的放疗反应机制,并证明宿主T细胞和肿瘤IFN受体信号对放疗疗效的必要性 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化仍需进一步验证 | 探究恶性外周神经鞘瘤放疗反应异质性的生物学机制 | 恶性外周神经鞘瘤细胞、小鼠同种移植模型及患者样本 | 机器学习 | 恶性外周神经鞘瘤 | CRISPR干扰筛选、单细胞转录组测序、批量转录组测序 | NA | 转录组数据、CRISPR筛选数据 | 涉及MPNST细胞系、小鼠同种移植模型及人类切除标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 175 | 2026-06-15 |
Multifunctional LepR⁺ skeletal stem/progenitor cells for bone and marrow homeostasis
2026-Mar, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01698-z
PMID:41711875
|
综述 | 综述了瘦素受体阳性骨骼干/祖细胞在骨与骨髓稳态中的多功能作用 | 总结了LepR+ SSPCs在发育、成年、衰老和骨折愈合过程中的功能与谱系可塑性,并结合遗传标记和单细胞转录组学的最新进展 | 未明确讨论手段的局限性和未来研究方向 | 全面回顾骨骼干/祖细胞研究的历史背景和最新进展,特别聚焦LepR+ SSPCs | LepR+ 骨骼干/祖细胞(LepR+ SSPCs) | 机器学习 | 骨骼疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 176 | 2026-06-15 |
Phylogenomic Placement and Morphological Description of a Novel Phagotrophic Euglenid From Hawaii: Hokulea waialensis n. gen. et sp
2026 Mar-Apr, The Journal of eukaryotic microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1111/jeu.70069
PMID:41749340
|
研究论文 | 描述了一种来自夏威夷的新型吞噬性眼虫藻Hokulea waialensis n. gen. et sp.,并通过系统基因组学分析确定了其系统发育位置 | 发现了眼虫藻新属新种Hokulea waialensis,利用单细胞测序和系统基因组学数据揭示了其与Lentomonas和Decastava等属的进化关系 | 未在摘要中明确说明 | 阐明吞噬性眼虫藻中深分支类群的系统发育关系,以理解眼虫藻的进化 | 一种来自夏威夷的新鲜水域吞噬性眼虫藻物种Hokulea waialensis | 机器学习 | NA | 单细胞测序、系统基因组学 | NA | 基因组序列、形态图像 | 一个单细胞培养的物种样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 177 | 2026-06-15 |
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01458-3
PMID:41776110
|
研究论文 | 本文揭示了早期激活的细胞外基质蛋白ECM1通过调控机械-代谢通路影响肾脏纤维化微环境的空间和代谢动态 | 首次发现ECM1作为早期肾脏重塑调节因子,通过整合素α2β1-RhoC轴影响YAP活性,进而解除TEAD4对Pgc1a的抑制,增强线粒体氧化磷酸化,促进修复,揭示了纤维化中基质-线粒体选择性串扰的机械-代谢通路 | NA | 探索早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境中的调控机制 | 肾脏纤维化微环境、细胞外基质蛋白ECM1 | NA | 慢性肾病、肾脏纤维化 | 空间转录组学、蛋白质组学、基因敲除小鼠模型、AAV9介导的基因沉默 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | 全球Ecm1敲除小鼠、成纤维细胞特异性敲除小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 178 | 2026-06-15 |
scSCCNIA: similarity matrix based contrastive clustering with neighbor information aggregation for single-cell RNA sequencing data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag094
PMID:41785051
|
研究论文 | 提出一种基于相似性矩阵的对比聚类框架scSCCNIA,用于从单细胞RNA测序数据中准确识别细胞簇 | 采用拉普拉斯滤波器进行邻域信息聚合,通过特殊非共享参数孪生编码器构建不同图视图进行数据增强,并基于相似性矩阵的对比学习学习低维嵌入表示 | 未明确指出局限性 | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据细胞聚类算法,提高细胞类型识别准确率并促进下游分析 | 多个不同平台和细胞数量的单细胞RNA测序数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比聚类神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 多个不同平台和细胞数量的数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 179 | 2026-06-15 |
The Interaction Between Mitophagy Dysregulation and the Diabetic Bladder Microenvironment
2026-Mar, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.70199
PMID:41793088
|
综述 | 探讨线粒体自噬失调与糖尿病膀胱微环境之间的双向相互作用及其在糖尿病膀胱功能障碍进展中的作用 | 提出了一个以线粒体自噬失调与膀胱微环境损伤为核心的自增强反馈环路,并建议通过联合恢复线粒体自噬和调节微环境的策略实现治疗突破 | 所讨论的干预措施(如尿石素A、MCC950、纳米颗粒介导的PINK1 mRNA递送和CRISPR/Cas9基因编辑)仍处于探索阶段,缺乏充分的临床验证 | 阐明线粒体自噬失调与糖尿病膀胱微环境相互作用的机制,并提出靶向该反馈环路的潜在治疗策略 | 糖尿病膀胱功能障碍中的线粒体自噬、膀胱微环境及相关分子机制 | 数字病理学 | 糖尿病 | CRISPR/Cas9 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium 空间转录组学技术 |
| 180 | 2026-06-15 |
Assessment of dispersion metrics for estimating single-cell transcriptional variability
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014030
PMID:41770747
|
研究论文 | 系统比较了用于估算单细胞转录变异性的各种离散度指标 | 首次系统性评估多种统计指标对单细胞RNA测序数据中转录噪声的响应性,并发现方差均值比(Fano因子)在测量单细胞转录变异性方面具有线性关系和规模不变性 | 未提及具体局限性 | 评估并比较不同统计指标在测量单细胞转录变异性中的效果,以揭示生物学相关信息 | 单细胞RNA测序数据中的基因转录变异性 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 数值数据 | 模拟数据在不同离散度和计数大小下生成,以及来自不同复杂系统和跨平台测量的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |