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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2026-09-13 |
Directed differentiation of bovine trophoblast stem cells: A useful in vitro model for placenta development
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2600783123
PMID:41811437
|
研究论文 | 该研究建立了一种牛滋养层干细胞体外定向分化方案，用于生成双核滋养层巨细胞并研究胎盘发育机制 | 首次建立了牛滋养层干细胞向双核滋养层巨细胞定向分化的体外方案，并结合单细胞转录组分析和可诱导GCM1表达工程化干细胞，揭示了TGC谱系特化的发育程序和调控机制 | 该研究为体外模型，可能无法完全模拟体内胎盘发育的复杂微环境；GCM1调控机制的下游靶基因网络尚未完全阐明 | 探索牛胎盘滋养层分化的细胞和分子机制，建立可用于研究胎盘发育的体外模型 | 牛滋养层干细胞（TSCs）及其分化产生的双核滋养层巨细胞（TGC） | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 102 | 2026-09-13 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-03-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定出一种SPP1高表达的促纤维化巨噬细胞群体，该群体在高血压相关主动脉夹层中通过TGF-β1-SPP1轴促进保护性纤维化重塑和血管稳定 | 首次鉴定出SPP1高表达促纤维化巨噬细胞群体，揭示其作为低炎症巨噬细胞与基质活跃状态之间的转录桥梁作用，并阐明TGF-β1-SPP1轴在主动脉壁结构稳定中的保护性机制 | 单细胞RNA测序每组样本量较小（n=3），小鼠模型结果需进一步在人类中验证，SPP1高表达巨噬细胞在慢性阶段的长期效应尚不明确 | 鉴定与血管完整性相关的巨噬细胞状态，并确定这些状态是否可以在机制上或治疗上加以利用 | 高血压相关主动脉夹层患者、Marfan综合征相关主动脉夹层患者及供体对照的胸主动脉组织、外周血和撕裂邻近血液样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA | NA | 转录组数据、图像 | 单细胞RNA测序每组3例（共9例），外周血和撕裂邻近血液样本每组30例（共90例），配对术中撕裂邻近采样10例，另包含人单核细胞和小鼠巨噬细胞功能验证实验及小鼠主动脉夹层模型 adoptive transfer 实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2026-09-13 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-03-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
|
研究论文 | 利用保留复杂胶质母细胞瘤微环境的人新皮层脑切片模型，通过PIC-seq、空间转录组学及基因调控网络重建，解析NKG2D CAR-T细胞与肿瘤生态系统之间的相互作用 | 采用能保留复杂胶质母细胞瘤微环境的人新皮层脑切片模型，结合PIC-seq、空间转录组学和基因调控网络重建，揭示CAR-T细胞与髓系细胞间的配体-受体信号互作，并鉴定MAF和BACH2为CD8 T细胞状态的候选调控因子 | 摘要中未明确说明 | 探究胶质母细胞瘤微环境中CAR-T细胞功能快速失调相关的微环境和转录变化，识别可用于工程化更持久细胞治疗的候选通路和调控因子 | NKG2D CAR-T细胞、肿瘤生态系统、肿瘤相关巨噬细胞、间充质样胶质母细胞瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | PIC-seq、空间转录组学、基因调控网络重建 | NA | 图像、文本 | NA | NA | PIC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 104 | 2026-09-13 |
Downregulated lysyl oxidase in plasma extracellular vesicles: a biomarker linked to brain metastasis risk in lung adenocarcinoma
2026-03-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04785-0
PMID:41814259
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法分析肺腺癌患者血浆细胞外囊泡蛋白，发现赖氨酰氧化酶（LOX）下调与脑转移风险相关，可作为无创生物标志物 | 首次发现血浆细胞外囊泡来源的LOX下调与肺腺癌脑转移风险相关，提出PI3K/AKT-LOX-ECM调控轴可能促进脑嗜性转移，并通过多组学验证策略确认其作为无创生物标志物的潜力 | 摘要未明确提及研究局限性 | 识别与肺腺癌脑转移相关的血浆细胞外囊泡来源蛋白 | 肺腺癌患者血浆细胞外囊泡、组织蛋白、单细胞转录组数据 | 蛋白质组学、单细胞转录组学、机器学习 | 肺癌（肺腺癌脑转移） | 数据非依赖性采集质谱蛋白质组学、组织蛋白质组学、单细胞转录组学（TISCH2）、蛋白质印迹、ELISA | LASSO、随机森林、SVM | 蛋白质组数据、转录组数据、图像/文本 | 发现队列：59例IV期LUAD患者（30例脑转移 vs 29例非脑转移）；组织蛋白质组验证：13例；独立血浆队列验证：158例 | NA | bulk蛋白质组学、单细胞转录组学、ELISA | NA | 数据非依赖性采集质谱、TISCH2单细胞转录组数据库、ELISA检测 |
| 105 | 2026-09-13 |
Mitochondrial apoptosis gene-based pathomics for ovarian cancer prognosis
2026-Mar-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-40121-5
PMID:41820464
|
研究论文 | 该研究通过整合数字病理特征与线粒体凋亡基因表达，开发并验证了一个用于卵巢癌预后的线粒体凋亡相关病理迁移学习模型（MAR-PTL） | 构建了结合ResNet50提取的H&E切片深度学习特征与转录组数据的迁移学习框架，首次将线粒体凋亡基因与病理组学特征关联用于卵巢癌预后，并揭示了BCL2L2的核心预后作用及其与特定ResNet特征的显著相关性 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发并验证一个整合数字病理特征与线粒体凋亡基因表达的卵巢癌预后模型，并阐明其潜在机制 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 转录组测序， 单细胞RNA测序 | ResNet50， 迁移学习 | 图像， 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq， 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2026-09-13 |
Spatial cartography of human thymus enables the geopositioning of lineage transcription factors in rare mimetic thymic epithelial cells
2026-Mar-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68596-w
PMID:41807357
|
研究论文 | 该研究利用Stereo-seq空间转录组技术构建了人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱，揭示了胸腺的架构特征以及调控稀有模拟性胸腺上皮细胞的谱系转录因子 | 首次利用Stereo-seq空间转录组技术构建人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱，并识别出调控稀有模拟性胸腺上皮细胞的谱系定义转录因子 | 摘要中未提及 | 构建人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱，揭示胸腺的独特架构特征及调控稀有细胞类型的转录因子 | 人类胎儿胸腺（受孕后13、14、17或18周）和儿童胸腺（7周以及2、5、6岁） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据，蛋白质组数据 | 8例人类胸腺样本，包括胎儿（受孕后13、14、17或18周）和儿童（7周以及2、5、6岁） | BGI | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |
| 107 | 2026-09-13 |
Gene expression dynamics of human and mouse craniofacial development at the single-cell level
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70232-6
PMID:41803119
|
研究论文 | 通过单核RNA测序分析人类妊娠后4至8周的颅面发育过程，并与小鼠发育阶段进行比较，揭示细胞类型的保守性和颅面畸形的细胞起源 | 首次在单细胞水平系统描绘人类颅面发育从妊娠后4至8周的基因表达动态图谱，鉴定了多种间充质、上皮和颅神经嵴细胞亚型，并揭示了特定细胞亚型与正常面部形态及口面裂常见风险因素的关联 | 研究仅覆盖妊娠后4至8周的发育窗口，未能涵盖更早或更晚的发育阶段；人类样本数量有限；跨物种比较可能存在物种特异性差异 | 填补人类颅面发育过程中细胞类型和基因表达动态认识的空白，理解正常颅面发育的细胞机制及口面裂等颅面畸形的细胞起源 | 人类和小鼠的颅面发育组织，涵盖妊娠后4至8周的人类胚胎及相应小鼠发育阶段 | 单细胞组学、发育生物学 | 口面裂、颅面畸形 | 单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 人类妊娠后4至8周的颅面发育组织样本（具体数量未在摘要中说明），以及相应发育阶段的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | NA |
| 108 | 2026-09-13 |
Immune landscape in liver of neonatal mice with phlebotomy-induced anemia
2026-Mar, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04361-x
PMID:40962864
|
研究论文 | 本研究利用放血诱导贫血（PIA）的新生小鼠模型，通过单细胞RNA测序和流式细胞术分析贫血肝脏中的免疫细胞图谱 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示放血诱导贫血新生小鼠肝脏免疫景观的改变，发现Ly6C2+单核细胞和Gypa+红系细胞增多而淋巴细胞减少，并揭示单核细胞的促炎趋化表型及淋巴细胞的脂质代谢抑制 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类早产儿中验证；样本量相对有限；未深入探讨贫血导致肝脏免疫景观改变的分子机制 | 探究放血诱导贫血对新生小鼠肝脏免疫细胞图谱的影响 | C57BL/6新生小鼠（出生后第2-10天接受定时放血诱导严重贫血）的肝脏免疫细胞 | 单细胞组学 | 贫血 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞术数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2026-09-10 |
LAML-Pro: Joint Maximum Likelihood Inference of Cell Genotypes and Cell Lineage Trees
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714879
PMID:41959070
|
研究论文 | 介绍了一种名为LAML-Pro的算法，该算法利用最大似然方法联合推断细胞基因型与细胞谱系树 | 提出了一种联合推断细胞基因型和细胞谱系树的新算法，该算法基于概率混合型缺失观测（PMMO）模型，能够纠正基因型错误并提高谱系树推断的准确性，优于传统分步方法 | 文章中未明确提及局限性 | 开发一种联合推断细胞基因型和细胞谱系树的算法，以克服传统两步法因基因型错误导致的谱系树不准确问题 | 细胞基因型及细胞谱系树 | 机器学习 | NA | NA | 概率模型（PMMO）和最大似然估计 | 模拟数据集和成像数据 | 数千细胞（模拟数据）及两个成像谱系追踪系统的数据 | NA | 成像 | NA | NA |
| 110 | 2026-03-19 |
Correction to 'Integrating Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing Identifies and Validates Lactylation-Related Signatures for Intervertebral Disc Degeneration'
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71061
PMID:41845558
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 111 | 2026-09-09 |
AICellType: a large language model-based platform for accurate cell type annotation
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag151
PMID:42001469
|
研究论文 | 开发了基于大型语言模型的平台AICellType，用于单细胞和空间转录组数据中的准确细胞类型注释 | 系统评估了79个大型语言模型，并利用综合框架结合本体结构和语义推理，开发了AICellType平台，其性能优越且成本高效 | 未明确提及局限性 | 提高细胞类型注释的准确性和适应性，应对现有方法依赖静态基因标记的局限性 | 单细胞和空间转录组数据集 | 自然语言处理,数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序和空间转录组测序 | 大型语言模型 | 基因表达数据 | 1130个单细胞和空间转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 112 | 2026-09-09 |
Spatial multi-omics integration by cross-modal graph contrastive learning
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag192
PMID:42001472
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研究论文 | 提出CoMo，一种基于图的框架，通过跨模态图对比学习整合空间多组学数据，以改进空间域识别 | 利用交叉注意力机制和双重对比学习损失（邻居感知和聚类感知）实现空间多组学特征融合与空间一致域识别 | 未提及具体局限性，但可能受限于技术偏差和生物复杂性 | 开发一种计算工具，用于空间多组学数据的综合分析，以全面表征组织 | 空间多组学数据集（包括空间转录组、蛋白质组和表观基因组） | 机器学习 | NA | 空间多组学技术（如空间转录组、空间蛋白质组、空间表观基因组） | 图对比学习模型（CoMo） | 空间组学数据 | 五个空间组学数据集 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间表观基因组学 | NA | NA |
| 113 | 2026-09-09 |
Evaluating reference-mixture matching in cell-type deconvolution with single-cell RNA-seq references
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag184
PMID:42007519
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研究论文 | 系统评估单细胞RNA-seq参考数据集在不同匹配条件下对细胞类型反卷积性能的影响 | 首次系统评估参考样本匹配程度对七种反卷积算法性能的影响，并推荐使用稳健方法如DISSECT | 研究仅基于外周血单核细胞数据，可能不适用于其他组织或疾病类型 | 评估不同参考匹配条件下的反卷积方法性能，并提供推荐 | 来自系统性红斑狼疮患者和健康对照的外周血单核细胞样本 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | NA | CIBERSORTx S-mode, CIBERSORTx NS-mode, MuSiC2, InstaPrism, BLADE, DISSECT, Scaden | bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据（模拟及公开数据） | 40个样本（20例狼疮患者+20例健康对照），另有独立样本用于模拟混合和公开bulk数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 114 | 2026-09-07 |
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04824-5
PMID:41870799
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研究论文 | 综合单细胞、空间转录组和机器学习方法，构建三阴性乳腺癌干性特征预测模型，揭示核心干性基因及其调控机制 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组和机器学习相结合，构建基于XGBoost的五基因干性风险预测模型，并利用虚拟敲除实验验证核心基因功能 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征与肿瘤进展的分子调控机制，并构建预测模型 | 三阴性乳腺癌细胞群体及其干性相关基因 | 机器学习 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组测序、批量转录组测序 | XGBoost | 基因表达数据、空间转录数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 115 | 2026-09-07 |
Integrated single-cell and functional analyses define strategies to enhance dendritic cell immunostimulatory capacity
2026-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04815-6
PMID:41824152
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，定义了增强树突状细胞免疫刺激能力的策略 | 首次整合单细胞转录组分析与功能验证，揭示PD-L1阻断和CD40刺激联合可增强树突状细胞成熟和抗原呈递能力 | 研究仅限于体外实验，缺乏体内验证 | 优化基于树突状细胞的癌症疫苗，提升个性化免疫治疗效果 | 树突状细胞及其亚群，以及其与T细胞的相互作用 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 116 | 2026-09-07 |
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04761-3
PMID:41820703
|
研究论文 | 结合转录组和单细胞数据构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型 | 首次将转录组与单细胞RNA测序数据相结合，构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型，并通过细胞通信和拟时序分析揭示关键细胞的分化方向 | 未明确提及局限性 | 构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型，并探索其分子机制 | 骨肉瘤患者样本及糖基化相关基因 | 机器学习 | 骨肉瘤 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | LASSO回归, COX回归, WGCNA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多个骨肉瘤数据集，包括GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048，具体样本数未提供 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2026-09-07 |
A lactylation-related gene signature predicts prognosis and immunotherapy response in clear cell renal cell carcinoma based on machine learning and multi-omics analysis
2026-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04781-z
PMID:41817785
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研究论文 | 本研究基于机器学习和多组学分析，构建了一个乳酸化相关基因签名（LRGS），用于预测透明细胞肾细胞癌（ccRCC）的预后和免疫治疗反应。 | 首次利用乳酸化相关基因构建LRGS，结合机器学习和多组学分析，并通过体外实验验证了关键风险基因SHC1的功能。 | 基于公共数据集和体外实验，缺乏体内验证和前瞻性临床验证；机制探索尚浅。 | 开发乳酸化相关基因签名，系统评估其在ccRCC预后预测和治疗分层中的价值。 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）患者，包括TCGA-KIRC和E-MTAB-1980队列的数据。 | 机器学习 | 肾细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习模型（具体类型未提及，可能包括LASSO、随机森林等） | 转录组数据（bulk和单细胞RNA测序） | TCGA-KIRC和E-MTAB-1980队列（具体数量未提及） | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 118 | 2026-09-07 |
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04790-y
PMID:41811593
|
综述 | 本文综述了间充质基质细胞和血管周细胞在肿瘤微环境中朝向促肿瘤表型的汇聚现象，并提出了一个分类框架以解析其复杂功能。 | 提出了一个实用的“MSC-血管周细胞状态”分类框架，强调多标记、空间分辨分析以解析其复杂功能，为靶向治疗开辟新前景。 | 未明确提及局限性，但暗示当前方法（如抗VEGF单药治疗）存在局限，且需要更严格的空间分析来验证功能。 | 综合当前证据，阐明MSCs和血管周细胞在肿瘤微环境中向促肿瘤表型汇聚的机制，并探讨其对治疗策略的影响。 | 间充质基质细胞和血管周细胞及其在实体瘤和血液恶性肿瘤中的表型转变。 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌、血液恶性肿瘤等 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 119 | 2026-09-07 |
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43404-z
PMID:41807716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示HIF3A通过转录上调TXNIP促进阿尔茨海默病中星形胶质细胞的氧化应激，为治疗提供新靶点 | 首次在单细胞水平揭示HIF3A在星形胶质细胞中通过直接结合TXNIP启动子调控氧化应激的机制，并采用多种机器学习和功能实验进行验证 | 未提供明确的局限性说明 | 阐明阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制，并识别关键基因作为潜在治疗靶点 | 阿尔茨海默病相关的单细胞RNA测序数据，涉及多种细胞类型，重点是星形胶质细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq | 机器学习 | 单细胞基因表达数据 | NA（未提供具体样本数量） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 120 | 2026-09-07 |
Mechanism of action of Astragalus membranaceus for treating diabetic foot ulcers based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-41921-5
PMID:41807627
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研究论文 | 结合单细胞RNA测序和网络药理学，探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的分子机制 | 首次在单细胞水平上解析黄芪治疗糖尿病足溃疡的机制，将黄芪活性成分与巨噬细胞异质性联系起来 | 研究基于公开数据集和临床样本，需进一步的功能和转化研究验证 | 探索黄芪治疗糖尿病足溃疡的潜在分子机制 | 糖尿病足溃疡和足部非溃疡组织样本 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、qPCR验证 | NA | 单细胞基因表达数据、药物化合物结构数据 | 单细胞队列含4个非糖尿病足溃疡和5个糖尿病足溃疡样本；临床验证队列含6个NFU和9个DFU患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |