单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 1021 - 1040 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1021 2026-02-08
Macrophage-associated immune-stromal crosstalks correlate with the tumor microenvironment in microsatellite-stable mucinous colorectal cancer
2026-Mar, Pathology, research and practice
研究论文 本研究整合了三个公开的单细胞RNA测序数据集,全面描绘了微卫星稳定型黏液性结直肠癌的细胞生态系统,揭示了其独特的免疫抑制性肿瘤微环境特征 首次在单细胞水平上系统描绘了微卫星稳定型黏液性结直肠癌的免疫-基质互作网络,发现了以IL1B-IL1R2和CXCL8-CXCR2信号通路为核心的髓系免疫抑制网络,并构建了包含18个基因的黏液性结直肠癌免疫模块作为预后生物标志物 研究基于公开数据集进行二次分析,缺乏独立队列验证;未进行功能性实验验证发现的信号通路机制;样本量相对有限 阐明微卫星稳定型黏液性结直肠癌的肿瘤微环境特征,特别是免疫-基质相互作用网络 微卫星稳定型黏液性结直肠癌患者的肿瘤组织 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三个公开数据集(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1022 2026-02-07
Harnessing spatial transcriptomics to understand host-parasite interactions in plants and animals
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文探讨了空间转录组学技术在动植物宿主-寄生虫相互作用研究中的应用与挑战 通过跨学科视角,将动物系统中的空间转录组学进展应用于植物寄生虫研究,为未来研究提供路线图 空间转录组学在植物-寄生虫相互作用中的应用仍有限,面临技术挑战 利用空间转录组学理解动植物宿主-寄生虫相互作用的分子机制,并寻找疾病控制新靶点 动植物中的专性寄生虫及其宿主 空间转录组学 寄生虫感染 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1023 2026-02-07
The role of pathology in immunotherapy and targeted therapy for renal cell carcinoma
2026-Mar-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2
综述 本文综述了病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用,提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架 提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架,以指导肾细胞癌的个性化治疗策略,并探讨了新兴工具如液体活检、空间转录组学和AI辅助病理学的应用 可靠的预测性生物标志物仍未被满足,PD-L1表达临床效用有限,肿瘤微环境特征和基因组改变预测价值不一致 概述病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用,并探讨如何整合多参数信息以推进精准肿瘤学 肾细胞癌 数字病理学 肾细胞癌 分子谱分析、液体活检、空间转录组学、AI辅助病理学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
1024 2026-02-07
Spatial transcriptomics: integrating platforms and computational approaches for clinical insights
2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1
综述 本文全面比较了空间转录组学的技术原理与数据分析流程,并总结了其最新应用及标准化现状 整合了不同平台和计算方法,为临床见解提供了一个清晰的理解框架,并强调了技术标准化的重要性 面临技术复杂性、数据分析困难以及缺乏标准化等挑战 促进空间转录组学技术的进一步发展和临床转化 空间转录组学技术及其在生物研究和病理诊断中的应用 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1025 2026-02-06
Oyster cellular architecture and innate immune programs resolved by single-cell RNA sequencing
2026-Mar, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了香港牡蛎的组织细胞结构及其先天免疫程序 首次在海洋无脊椎动物中构建了组织分辨的单细胞图谱,定义了二十种细胞类型,揭示了吞噬细胞谱系的三种终末策略以及神经、上皮和免疫细胞群之间以NCAM和PTPRM为中心的关键通讯通路 研究聚焦于单一物种(香港牡蛎),其发现向其他海洋无脊椎动物的普适性有待验证 解析海洋无脊椎动物屏障黏膜组织的细胞结构、功能分工及先天免疫程序 香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)的组织细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1026 2026-02-05
Spatial transcriptomics: challenges and future directions in musculoskeletal diseases
2026-Mar-01, Current opinion in rheumatology IF:5.2Q1
综述 本文综述了空间转录组学在肌肉骨骼疾病研究中的最新进展、挑战及未来方向 探讨空间转录组学如何革新肌肉骨骼疾病研究,通过原位基因表达分析揭示组织内细胞的空间转录组异质性 空间转录组学在肌肉骨骼组织应用中面临广泛推广的挑战,具体限制未详细说明 旨在总结空间转录组学在揭示肌肉骨骼疾病分子机制中的作用,并讨论其应用挑战与未来改进机会 肌肉骨骼系统及其相关疾病 数字病理学 肌肉骨骼疾病 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
1027 2026-02-05
Multi-omics mapping identifies CYBA-mediated mitochondrial dysfunction driving macrophage polarization and ferroptosis via Nrf2 pathway in atherosclerosis
2026-Mar, APL bioengineering IF:6.6Q1
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了CYBA通过抑制Nrf2通路介导的抗氧化反应,导致线粒体功能障碍,从而驱动巨噬细胞向促炎表型极化和铁死亡,促进动脉粥样硬化斑块形成 首次将CYBA鉴定为连接线粒体功能障碍与巨噬细胞表型改变及铁死亡的关键氧化应激调节因子,并阐明了其通过抑制Nrf2通路发挥作用的分子机制 研究主要基于细胞模型(THP-1巨噬细胞)和ApoE小鼠模型,尚未在人体组织或临床样本中得到验证 探究CYBA在动脉粥样硬化中如何通过调控线粒体功能影响巨噬细胞表型极化和铁死亡 THP-1巨噬细胞、ApoE基因敲除小鼠、动脉粥样硬化斑块 生物信息学 心血管疾病 多组学分析、单细胞RNA测序、机器学习、免疫荧光 机器学习模型 基因表达数据、单细胞转录组数据 细胞模型(THP-1巨噬细胞)和动物模型(ApoE小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1028 2026-02-05
Identification of factors conferring resistance to trastuzumab deruxtecan in advanced gastric cancer: a translational study from the single-arm, phase II, DESTINY-Gastric06 trial
2026-Mar, Precision clinical medicine IF:5.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了晚期胃癌中曲妥珠单抗德鲁替康(T-DXd)的原发性和获得性耐药机制 首次在单细胞水平上系统揭示了T-DXd在胃癌中的耐药机制,并识别了MUC3A和胱抑素C等关键生物标志物 研究样本来源于单臂II期临床试验,样本量可能有限,且为观察性研究,需要进一步功能验证 阐明胃癌对T-DXd的原发性和获得性耐药机制 胃癌肿瘤组织样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,免疫组化,功能实验 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CellChat细胞通讯分析 单细胞RNA测序数据,图像数据 来自DESTINY-Gastric06试验的胃癌肿瘤组织样本(包括初治基线样本及耐药样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1029 2026-02-03
Meflin/ISLR is a meningeal cell-specific marker involved in the development of meninges and meningioma progression
2026-Mar, Brain pathology (Zurich, Switzerland)
研究论文 本研究探讨了Meflin/ISLR作为脑膜细胞特异性标志物在脑膜发育和脑膜瘤进展中的作用 首次揭示了Meflin在脑膜发育中的早期表达模式及其在脑膜瘤中与WNT信号通路激活的潜在关联 研究主要基于小鼠模型和人类组织样本的观察性分析,缺乏直接的机制验证实验 探究Meflin在脑膜发育和脑膜瘤病理生理学中的功能 小鼠胚胎脑膜、人类脑膜瘤组织样本 NA 脑膜瘤 单细胞RNA测序、谱系追踪、基因表达分析 NA RNA测序数据、组织样本 小鼠模型和人类脑膜瘤样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1030 2026-02-02
A single cell transcriptomics-based analysis provides mechanistic insights into the chronic low-concentration effects on hematopoietic disruption in zebrafish(Danio rerio) by Antinomy
2026-Mar-01, Chemico-biological interactions IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了低浓度锑暴露对斑马鱼造血功能的慢性影响及其机制 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析低浓度锑暴露下斑马鱼造血细胞群体的变化,并阐明IL-17通路介导的炎症反应在锑毒性中的作用 研究仅基于斑马鱼模型,结果外推至哺乳动物或人类需谨慎;未探讨长期暴露后的恢复潜力 探究低浓度锑暴露对造血功能的慢性毒性效应及分子机制 斑马鱼(Danio rerio) 单细胞组学 造血功能障碍 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 斑马鱼暴露于0、5、50、500和5000 μg/L锑浓度28天 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1031 2026-01-29
Single-cell transcriptome sequencing revealing the microenvironment of breast fibroepithelial tumor
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了青少年与成人乳腺纤维上皮性肿瘤微环境的差异 首次在单细胞分辨率上比较了青少年与成人乳腺巨大纤维上皮性肿瘤的分子特征和细胞间通讯网络,并鉴定出青少年特异的抗原呈递成纤维细胞亚群 样本量较小(仅3例青少年病例和1例成人病例),且为观察性研究,需进一步功能验证 阐明青少年巨大乳腺纤维上皮性肿瘤的生物学基础,以指导靶向治疗 乳腺纤维上皮性肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4例患者(3例青少年,1例成人),共计26,737个细胞 BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System
1032 2026-01-25
ACADVL upregulation is associated with placental ferroptosis in intrahepatic cholestasis of pregnancy
2026-Mar, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、脂质组学和公共RNA-seq数据,探讨了妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)中胎盘铁死亡的机制,发现ACADVL上调与线粒体功能障碍和铁死亡相关 首次提出ACADVL、脂质代谢、线粒体功能障碍和铁死亡在ICP发病机制中的关联模型,并利用多组学方法验证了绒毛细胞滋养层(VCT)中的关键作用 研究机制尚未完全阐明,且样本来源和实验验证可能有限,需要进一步在体功能研究确认 探究ICP中胎盘功能障碍的分子机制,特别是铁死亡和线粒体相关基因的作用 妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)患者的胎盘组织,重点关注绒毛细胞滋养层(VCT) 生物信息学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)脂质组学、RNA-seq、免疫组化、免疫荧光、Western blotting、透射电子显微镜 随机森林、支持向量机、LASSO回归 单细胞转录组数据、脂质组学数据、公共RNA-seq数据、蛋白质表达数据 未明确指定样本数量,但涉及ICP患者胎盘组织 NA 单细胞RNA-seq, 脂质组学, RNA-seq NA NA
1033 2026-01-25
Identification of the disulfidptosis-related gene IQGAP1 as a potential diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2026-Mar-01, Brain research IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和转录组数据,首次发现二硫化物死亡相关基因IQGAP1在帕金森病中表达上调,并构建了帕金森病的诊断模型 首次将新发现的细胞死亡形式——二硫化物死亡与帕金森病联系起来,并识别出IQGAP1作为潜在诊断生物标志物 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的体内外功能实验验证IQGAP1在帕金森病发病机制中的具体作用 探究二硫化物死亡相关基因在帕金森病中的表达模式、功能及其作为诊断生物标志物的潜力 帕金森病患者与健康对照的转录组数据及单细胞RNA测序数据 生物信息学 帕金森病 单细胞RNA测序,定量实时逆转录PCR,差异表达分析,LASSO回归,随机森林算法 诊断模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的帕金森病与健康对照样本数据集,以及外部验证队列 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq NA NA
1034 2026-01-22
Comparative spatial whole transcriptome analysis of matched frozen and formalin-fixed paraffin-embedded colorectal cancer tissues
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过空间全转录组分析比较了匹配的冷冻和福尔马林固定石蜡包埋结直肠癌组织的基因表达谱 首次使用空间全转录组技术系统比较FFPE、FF和SF三种组织保存方法在结直肠癌样本中的表现,揭示了不同方法在细胞形态分辨和基因表达水平上的优势 研究仅基于单例IV期结直肠癌患者的36个组织区域,样本量有限,需要更大规模验证 评估不同组织保存方法(FFPE、FF、SF)对结直肠癌空间转录组分析质量的影响 结直肠癌组织样本 空间转录组学 结直肠癌 空间全转录组分析 NA 空间转录组数据 36个组织区域(来自1例IV期结直肠癌患者) NA 空间转录组学 NA NA
1035 2026-01-22
Extracellular vesicles derived from adipose-derived mesenchymal stem/stromal cells prevent synovial inflammation and attenuate cartilage degeneration in rodent osteoarthritis
2026-Mar, Regenerative therapy IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了脂肪来源间充质干细胞衍生的细胞外囊泡(MSC-EVs)在啮齿动物骨关节炎模型中减轻滑膜炎症和软骨退化的作用 首次结合单细胞RNA测序技术,在体内外系统评估MSC-EVs对骨关节炎的免疫调节和软骨保护作用,并揭示了其促进巨噬细胞向M2表型极化的新机制 研究仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;MSC-EVs的具体作用分子机制尚未完全阐明 评估脂肪来源MSC-EVs作为骨关节炎疾病修饰疗法的治疗潜力 RAW264.7巨噬样细胞、人滑膜细胞、MIA诱导的骨关节炎大鼠模型 单细胞组学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 细胞实验(RAW264.7细胞、人滑膜细胞)和动物模型(MIA诱导OA大鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1036 2026-01-20
C-X-C chemokine receptor CXCR4 mediates diurnal changes in the aggregation and dispersion of CD8+ T cells within the tumor microenvironment
2026-Mar-15, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了CXCR4介导的CD8+ T细胞在肿瘤微环境中昼夜节律性聚集与分散的机制,并提出了通过时间依赖性抑制CXCR4来增强免疫检查点抑制剂疗效的新策略 首次发现肿瘤浸润CD8+ T细胞中CXCR4表达的昼夜节律性变化及其通过TGF-β-SMAD信号通路受SMAD7时间依赖性调控的机制,并证明在CXCR4表达高峰时相给予抑制剂可促进T细胞在肿瘤组织中的分散,从而增强免疫治疗效果 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA-seq数据的重分析,在人体中的直接验证尚不充分;昼夜节律调控的具体分子机制细节仍需进一步阐明 探究肿瘤微环境中CD8+ T细胞空间分布的昼夜节律变化机制及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 肿瘤浸润CD8+ T细胞、脾脏T细胞、表达CXCL12的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肺癌患者T细胞单细胞RNA-seq数据 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
1037 2026-01-20
Single-cell transcriptomic analysis reveals the molecular alterations of endothelial cells during ageing
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了年轻与年老主动脉中内皮细胞的分子变化,探讨了血管老化的潜在机制 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与年老主动脉内皮细胞的转录组差异,并提出了AP-1和Egr1作为血管老化关键转录因子的新见解 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一(主动脉),未涵盖其他血管类型;机制研究尚待深入实验验证 探究血管老化过程中内皮细胞的分子变化机制 年轻与年老小鼠主动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻组与年老组小鼠主动脉样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
1038 2026-01-20
Expression profiles of GPR56 and CD99 in T cells of AIDS patients and assessment of diagnostic value
2026-Mar, Diagnostic microbiology and infectious disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的表达动态,评估其作为疾病进展和诊断生物标志物的潜力 首次系统评估了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的蛋白表达谱,并发现CD8⁺GPR56⁺CD99⁺ T细胞亚群对HIV感染具有高诊断准确性 样本量相对较小(36例患者和35例对照),且年龄和性别分布存在差异,可能影响结果的普适性 探究GPR56和CD99在艾滋病进展中的表达变化,并评估其作为诊断生物标志物的价值 艾滋病患者和健康对照者的外周血T细胞 生物信息学 艾滋病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 36例艾滋病患者(男性31例,女性5例,年龄41.58±12.42岁)和35例健康对照(男性25例,女性10例,年龄32.17±12.09岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
1039 2026-01-20
Inhibition of c-Jun/Bak signaling alleviates endothelial cell senescence and inflammation caused by mitochondrial dysfunction in DMED
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了c-Jun/Bak信号通路是糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的关键驱动因素 首次在糖尿病性勃起功能障碍中鉴定出c-Jun/Bak信号通路作为内皮细胞衰老和炎症的关键驱动机制,并提出了靶向该通路线粒体调控的治疗新策略 研究主要基于啮齿动物模型,人类糖尿病的复杂性使得转化应用面临挑战,需要进一步研究 探究糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 糖尿病性勃起功能障碍大鼠的阴茎海绵体内皮细胞及体外细胞模型 数字病理学 糖尿病并发症 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA RNA测序数据 糖尿病性勃起功能障碍大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
1040 2026-01-20
Mitochondrial dysregulation as a central mechanism in autism spectrum disorder pathogenesis
2026-Mar, Journal of neuroimmunology IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的作用,使用多种临床前模型 通过整合母体免疫激活和ASD高风险基因敲除模型,结合转录组分析和单细胞RNA-seq数据,揭示了线粒体代谢在ASD中的核心作用,并强调了其在人类大脑发育中的相关性 研究主要基于临床前动物模型,人类数据的直接验证有限,且环境因素与线粒体功能障碍的具体联系机制仍需进一步阐明 探究线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的角色 小鼠脑组织、母体免疫激活模型、ASD高风险基因敲除模型、人类胎儿单细胞图谱数据 神经科学 自闭症谱系障碍 转录组分析、单细胞RNA-seq、功能富集分析(GO和KEGG) NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部