单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1052 篇文献，本页显示第 1001 - 1020 篇。

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	平台公司	平台技术	具体产品	平台详情
1001	2026-02-16	Interpretable Aging Signatures in Human Retinal Cell Types Revealed by Single-Cell RNA Sequencing and Sparse Logistic Regression 2026-Mar, Ophthalmology science IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.xops.2025.101062 PMID:41684508	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和稀疏逻辑回归，揭示了中国人群视网膜细胞类型中可解释的衰老特征	首次在中国人群中利用机器学习模型推导出细胞类型特异性的视网膜衰老特征，揭示了保守的分子标志和独特的细胞脆弱性	样本量相对较小（18个视网膜，12名捐赠者），且为横断面研究，无法追踪个体衰老动态	表征人类视网膜衰老过程中的细胞类型特异性转录变化，并开发用于细胞年龄判别的机器学习模型	人类视网膜细胞	数字病理学	老年疾病	单细胞RNA测序	L1正则化逻辑回归加递归特征消除	单细胞转录组数据	18个未冷冻视网膜，来自12名中国捐赠者（9名年轻，34-55岁；9名老年，68-92岁），共223,612个细胞	10x Genomics	单细胞RNA-seq	10x Chromium	10x Chromium Single Cell 3' v3.1
1002	2026-02-15	Mechanistic insights into nitric oxide signaling in shaping root architecture under challenging environments 2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112903 PMID:41317792	综述	本文综述了一氧化氮（NO）在逆境条件下调控植物根系构型（RSA）的多重作用机制	整合了NO与ROS及植物激素信号网络的互作，并强调了单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器和高分辨率活细胞成像等新兴技术在解析NO-ROS互作中的潜力	NO介导的RSA调控的生化与分子机制仍复杂且部分未知，存在关键知识缺口	理解作物如何适应环境胁迫，特别是通过根系构型可塑性来增强胁迫抗性	植物根系，特别是根系构型（RSA）及其在胁迫下的发育	植物生物学	NA	单细胞转录组学、氧化还原敏感生物传感器、高分辨率活细胞成像	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1003	2026-02-15	Probing cellular landscapes in plants via single-cell transcriptomics 2026-Mar, Plant science : an international journal of experimental plant biology IF:4.2Q1 DOI:10.1016/j.plantsci.2025.112964 PMID:41455555	综述	本文全面综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在植物研究中的应用，包括其在解析细胞异质性、发育轨迹、应激响应以及整合空间转录组学和多组学方法方面的进展	整合了跨植物物种和组织类型的见解，提供了关于植物发育和适应的交叉视角，并批判性地评估了关键技术挑战及潜在解决方案	植物系统中scRNA-seq与功能基因组学及空间技术的整合仍然有限，在理解基因调控、应激响应和细胞命运决定方面存在关键空白	综述单细胞转录组学如何推进植物组织发育和应激响应的高分辨率解析，从而促进基因发现和性状改良	多种植物组织	自然语言处理	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学，多组学方法（如整合染色质可及性或蛋白质表达数据），CRISPR/Cas9介导的基因组编辑	NA	转录组数据	NA	NA	单细胞RNA-seq，空间转录omics	NA	NA
1004	2026-02-14	scRDiT: Generating Single-cell RNA-seq Data by Diffusion Transformers and Accelerating Sampling 2026-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences DOI:10.1007/s12539-025-00688-5 PMID:39982678	研究论文	本文提出了一种名为scRDiT的生成方法，通过扩散变换器生成单细胞RNA测序数据，并加速采样过程	结合去噪扩散概率模型和扩散变换器，首次将扩散变换器应用于单细胞RNA测序数据生成，并引入去噪扩散隐式模型以加速采样	仅基于两个不同的scRNA-seq数据集进行实验，未在更广泛的数据集上验证模型的泛化能力	开发一种生成虚拟单细胞RNA测序数据的方法，以捕获数据特征并生成具有类似统计属性的数据集	单细胞RNA测序数据	机器学习	NA	单细胞RNA测序	扩散变换器, 去噪扩散概率模型, 去噪扩散隐式模型	基因表达数据	NA	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1005	2026-02-14	Spatial transcriptomics in bone research: navigating hype and hurdles 2026-Mar, Pathology IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.pathol.2025.10.003 PMID:41475999	综述	本文回顾了空间转录组学在骨骼研究中的应用，探讨了其优势、局限性及未来方向	系统总结了空间转录组学在骨骼研究中的独特挑战，如骨组织脱钙处理，并提出了未来应用潜力	空间转录组学平台存在固有局限性，工作流程瓶颈和分析复杂性限制了其广泛应用	评估空间转录组学技术在骨骼研究中的适用性，并探讨如何克服相关技术障碍	骨骼组织样本，包括不同肌肉骨骼组织和动物模型	数字病理学	骨骼疾病	空间转录组学	NA	空间基因表达数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
1006	2026-02-14	Spatial and single-cell multi-omics reveal pro-angiogenic THY1⁺ fibroblast subtypes predicting prognosis in prostate cancer 2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2026.102664 PMID:41529384	研究论文	本研究通过空间和单细胞多组学分析，揭示了前列腺癌中促血管生成的THY1⁺成纤维细胞亚型及其与预后的关联	首次识别并验证了前列腺癌中一个独特的促血管生成THY1⁺癌症相关成纤维细胞亚型，并揭示了其通过CXCL6/CXCR2轴和THY1介导的VEGFA表达驱动肿瘤进展的机制	研究样本量相对有限（前瞻性队列n=84），且主要基于公共和单中心数据，需要更大规模的多中心验证	识别和验证与侵袭性前列腺癌相关的特定THY1⁺癌症相关成纤维细胞亚型	前列腺癌患者组织、癌症相关成纤维细胞、THY1⁺/THY1⁻成纤维细胞亚群、内皮细胞	数字病理学	前列腺癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、qPCR、多重免疫组化、ELISA、抗体阵列、管形成实验	LASSO Cox回归	多组学数据（转录组、蛋白质组）、图像数据、临床数据	公共队列（TCGA-PRAD, GEO）和前瞻性队列（FUSCC, n=84）	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学	NA	NA
1007	2026-02-14	Tumor-stroma contributes to immunotherapeutic resistance in non-small cell lung cancer via SEMA3C-mediated immunosuppressive tumor microenvironment 2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2026.102679 PMID:41558146	研究论文	本研究揭示了肿瘤-间质比例（TSP）作为非小细胞肺癌（NSCLC）免疫检查点阻断（ICB）耐药性的独立预后生物标志物，并鉴定出SEMA3C是介导免疫抑制性肿瘤微环境的关键分子	首次将TSP与NSCLC的ICB耐药性联系起来，并鉴定出SEMA3C作为TSP轴中的关键介质，通过调节癌症相关成纤维细胞（CAFs）功能促进免疫抑制性肿瘤微环境	研究主要基于TCGA队列和体外/体内实验，需要在更大的独立临床队列中进行验证，并且SEMA3C的具体下游信号通路尚未完全阐明	探究肿瘤-间质比例（TSP）在非小细胞肺癌（NSCLC）免疫治疗耐药性中的作用机制	非小细胞肺癌（NSCLC）患者样本、癌症相关成纤维细胞（CAFs）、肿瘤细胞、CD8⁺ T细胞	数字病理学	肺癌	H&E染色、转录组分析、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、功能验证实验	NA	图像数据、转录组数据、单细胞测序数据	TCGA-NSCLC队列患者（具体数量未在摘要中明确说明）	NA	单细胞RNA测序	NA	NA
1008	2026-02-14	Integrated multi-omics analysis of prognostic model and immune microenvironment in intrahepatic cholangiocarcinoma 2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2026.102675 PMID:41558145	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，构建了肝内胆管癌的五基因预后模型，并揭示了MT1X在肿瘤进展和免疫抑制微环境中的作用	首次结合单细胞与空间转录组学分析肝内胆管癌，识别了上皮-成纤维细胞亚群互作，并通过机器学习构建了五基因预后特征，同时通过功能实验验证了MT1X的促癌作用	研究可能受限于样本量或特定队列的异质性，且功能实验主要在体外进行，需要进一步体内验证	阐明肝内胆管癌的免疫景观并指导精准免疫治疗	肝内胆管癌（iCCA）	数字病理学	肝内胆管癌	单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq	机器学习	RNA-seq数据	NA	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq	NA	NA
1009	2026-02-14	POSTN⁺ cancer-associated fibroblast-CCL3⁺ macrophage crosstalk defines the immune-excluded tumor microenvironment in clear cell renal cell carcinoma 2026-Mar, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2026.102682 PMID:41579565	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组数据，揭示了透明细胞肾细胞癌中POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞之间的相互作用，定义了驱动免疫排斥和免疫治疗抵抗的基质-免疫信号轴	首次在透明细胞肾细胞癌中识别出POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞的空间共定位，并揭示其通过TGF-β、SPP1和IL-6信号通路形成纤维化屏障，导致免疫排斥和免疫治疗抵抗	研究主要基于转录组数据，缺乏功能实验验证；样本来源和数量可能限制结论的普适性；未涉及其他潜在免疫细胞亚型的影响	探究透明细胞肾细胞癌中免疫排斥肿瘤微环境的基质-免疫相互作用机制	透明细胞肾细胞癌患者的肿瘤微环境，特别是成纤维细胞亚型和巨噬细胞	数字病理学	肾细胞癌	单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学	聚类分析, 轨迹分析, 转录因子调控网络分析, 基因网络分析, CellChat, NicheNet, SpaGene	单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据	八个单细胞RNA测序数据集, 两个空间转录组数据集, TCGA-KIRC队列和ICB治疗队列	NA	单细胞RNA-seq, 空间转录组学	NA	NA
1010	2026-02-13	Zebrafish neural regeneration: mechanistic insights into human nervous system repair 2026-Mar-05, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2026.01.009 PMID:41525811	综述	本文综述了斑马鱼在神经再生研究中的关键发现，强调了其在模拟人类神经退行性疾病和指导治疗策略中的转化意义	整合了斑马鱼在视网膜、脊髓和大脑中神经再生的多系统机制，并引入了单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9等先进技术来解析再生过程中的细胞状态和调控网络	作为一篇综述文章，未涉及原始实验数据，且斑马鱼与人类在生理和病理上存在差异，其发现直接转化至临床应用仍需进一步验证	解码脊椎动物中枢神经系统的再生机制，以指导人类神经修复的治疗策略	斑马鱼（Danio rerio）作为研究模型，聚焦于其视网膜、脊髓和大脑的神经再生过程	再生医学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9, 谱系追踪, 多组学分析	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1011	2026-02-11	Inflammation-induced Neuronal Damage in CNS Tuberculosis: Molecular Mechanism and Therapeutic Targets 2026-Mar-15, Brain research IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.brainres.2026.150169 PMID:41558621	综述	本文综述了中枢神经系统结核病中神经炎症诱导神经元损伤的分子机制及潜在治疗靶点	提出了以胶质细胞驱动的炎症和线粒体功能障碍为核心的统一框架，为疾病发病机制提供了关键见解	NA	探讨中枢神经系统结核病中神经免疫机制及宿主导向治疗策略	中枢神经系统结核病（CNS-TB）相关的神经炎症和神经元损伤	NA	结核病	单细胞转录组学、免疫代谢分析	NA	文献数据	NA	NA	NA	NA	NA
1012	2026-02-08	Declining FXR expression coordinates neonatal beta cell mass development with microbial bile acid metabolism maturation in mice 2026-Mar, Diabetologia IF:8.4Q1 DOI:10.1007/s00125-025-06618-w PMID:41381886	研究论文	本研究揭示了新生儿胰岛β细胞中FXR表达下降与肠道微生物胆汁酸代谢成熟之间的协调机制，对维持正常β细胞发育和血糖稳态至关重要	首次发现β细胞FXR表达在出生后下降是程序性宿主反应，以应对微生物胆汁酸代谢成熟；通过基因工程小鼠模型证明持续FXR表达会损害β细胞发育；鉴定Casp6为FXR下游关键靶点；在人类糖尿病样本中验证了病理相关性	研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需扩大样本；抗生素和CASP6抑制剂的干预效果仅为部分恢复；具体信号通路细节有待进一步阐明	阐明微生物胆汁酸代谢和FXR信号在新生儿β细胞发育中的精确作用	小鼠胰岛β细胞、肠道微生物、胆汁酸代谢、人类糖尿病样本	发育生物学、代谢疾病研究	2型糖尿病	单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、谱系追踪、孟德尔随机化、蛋白质组学分析	基因敲入小鼠模型（βFxrKI）	基因表达数据、染色质可及性数据、蛋白质组数据、临床指标数据	小鼠发育不同阶段样本、人类糖尿病与非糖尿病供体胰岛样本	NA	单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq	NA	NA
1013	2026-02-08	Myeloid immune checkpoint blockade overcomes antibiotic resistance in bone infection by enhancing efferocytosis and suppressing MSC PANoptosis 2026-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101348 PMID:41483713	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，揭示了抗生素耐药性骨感染中巨噬细胞与间充质干细胞间SIRPα-Thbs1-CD47轴介导的免疫失调机制，并提出靶向该轴的治疗策略	首次整合单细胞RNA测序与体内外实验，阐明抗生素耐药性骨感染中巨噬细胞检查点介导的免疫失调与骨生成失败之间的机制联系	未明确说明样本来源的具体临床背景或患者群体特征，且体外实验可能无法完全模拟体内复杂微环境	探究抗生素耐药性骨感染中免疫-基质相互作用的细胞与分子机制，以克服骨再生障碍	感染性骨组织中的巨噬细胞、间充质干细胞和中性粒细胞等细胞类型	数字病理学	骨感染	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	101,336个单细胞	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1014	2026-02-08	Single-cell transcriptome analysis of patient-derived organoids captures inter- and intratumor heterogeneity and uncovers targetable pathways in high grade serous ovarian cancer 2026-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2026.101354 PMID:41520487	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析患者来源的类器官，揭示了高级别浆液性卵巢癌的肿瘤间和肿瘤内异质性，并识别了可靶向的通路	利用患者来源的类器官模型结合单细胞转录组学，首次系统表征了高级别浆液性卵巢癌的细胞异质性，并发现化疗耐药与氧化磷酸化代谢转换相关，为靶向治疗提供了新策略	研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境；样本量相对有限，需要更大规模验证	表征高级别浆液性卵巢癌患者来源类器官的细胞异质性，并探索化疗耐药的分子机制和可靶向脆弱性	高级别浆液性卵巢癌患者来源的类器官、腹水来源的卵巢癌细胞以及独立患者的组织样本	数字病理学	卵巢癌	单细胞转录组学、免疫组织化学分析	NA	单细胞转录组数据、组织图像数据	来自铂耐药和铂敏感高级别浆液性卵巢癌患者的活检样本衍生的类器官，以及独立患者的组织样本	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1015	2026-02-08	IFNα2b modulates anti-tumor immune responses involving STAT3-associated dendritic cell dysfunction in JAK2v617f-positive myeloproliferative neoplasms 2026-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2026.101352 PMID:41539239	研究论文	本研究探讨了JAK2v617f突变如何通过STAT3信号通路导致树突状细胞功能障碍，并评估了IFNα2b治疗对恢复抗肿瘤免疫反应的潜力	首次在JAK2v617f阳性骨髓增殖性肿瘤中，整合单细胞RNA测序和流式细胞术，系统揭示了STAT3介导的树突状细胞功能障碍机制，并证明了IFNα2b可通过调节STAT3/FGL2信号通路部分恢复免疫应答	研究主要基于体外实验和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；IFNα2b的免疫恢复效果仅为部分，且在不同亚型间存在差异	阐明JAK2v617f突变诱导的免疫改变机制，并评估IFNα2b作为免疫调节策略在骨髓增殖性肿瘤中的治疗潜力	JAK2v617f阳性骨髓增殖性肿瘤患者的免疫细胞（特别是树突状细胞和T细胞）	单细胞组学与免疫学	骨髓增殖性肿瘤	单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	单细胞转录组数据, 流式细胞数据	未明确样本数量，但涉及JAK2v617f阳性患者及其他亚型患者的比较	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1016	2026-02-08	Macrophage-associated immune-stromal crosstalks correlate with the tumor microenvironment in microsatellite-stable mucinous colorectal cancer 2026-Mar, Pathology, research and practice DOI:10.1016/j.prp.2026.156371 PMID:41558251	研究论文	本研究整合了三个公开的单细胞RNA测序数据集，全面描绘了微卫星稳定型黏液性结直肠癌的细胞生态系统，揭示了其独特的免疫抑制性肿瘤微环境特征	首次在单细胞水平上系统描绘了微卫星稳定型黏液性结直肠癌的免疫-基质互作网络，发现了以IL1B-IL1R2和CXCL8-CXCR2信号通路为核心的髓系免疫抑制网络，并构建了包含18个基因的黏液性结直肠癌免疫模块作为预后生物标志物	研究基于公开数据集进行二次分析，缺乏独立队列验证；未进行功能性实验验证发现的信号通路机制；样本量相对有限	阐明微卫星稳定型黏液性结直肠癌的肿瘤微环境特征，特别是免疫-基质相互作用网络	微卫星稳定型黏液性结直肠癌患者的肿瘤组织	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	三个公开数据集（具体样本数未明确说明）	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA
1017	2026-02-07	Harnessing spatial transcriptomics to understand host-parasite interactions in plants and animals 2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108760 PMID:41260341	综述	本文探讨了空间转录组学技术在动植物宿主-寄生虫相互作用研究中的应用与挑战	通过跨学科视角，将动物系统中的空间转录组学进展应用于植物寄生虫研究，为未来研究提供路线图	空间转录组学在植物-寄生虫相互作用中的应用仍有限，面临技术挑战	利用空间转录组学理解动植物宿主-寄生虫相互作用的分子机制，并寻找疾病控制新靶点	动植物中的专性寄生虫及其宿主	空间转录组学	寄生虫感染	空间转录组学	NA	空间转录组数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
1018	2026-02-07	The role of pathology in immunotherapy and targeted therapy for renal cell carcinoma 2026-Mar-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2 DOI:10.1097/MOU.0000000000001357 PMID:41319008	综述	本文综述了病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用，提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架	提出了一个整合形态学、免疫表型和分子谱的病理驱动框架，以指导肾细胞癌的个性化治疗策略，并探讨了新兴工具如液体活检、空间转录组学和AI辅助病理学的应用	可靠的预测性生物标志物仍未被满足，PD-L1表达临床效用有限，肿瘤微环境特征和基因组改变预测价值不一致	概述病理学在肾细胞癌免疫治疗和靶向治疗中的作用，并探讨如何整合多参数信息以推进精准肿瘤学	肾细胞癌	数字病理学	肾细胞癌	分子谱分析、液体活检、空间转录组学、AI辅助病理学	NA	NA	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
1019	2026-02-07	Spatial transcriptomics: integrating platforms and computational approaches for clinical insights 2026 Mar-Apr, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108791 PMID:41456695	综述	本文全面比较了空间转录组学的技术原理与数据分析流程，并总结了其最新应用及标准化现状	整合了不同平台和计算方法，为临床见解提供了一个清晰的理解框架，并强调了技术标准化的重要性	面临技术复杂性、数据分析困难以及缺乏标准化等挑战	促进空间转录组学技术的进一步发展和临床转化	空间转录组学技术及其在生物研究和病理诊断中的应用	数字病理学	NA	空间转录组学	NA	转录组数据	NA	NA	空间转录组学	NA	NA
1020	2026-02-06	Oyster cellular architecture and innate immune programs resolved by single-cell RNA sequencing 2026-Mar, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.fsi.2026.111128 PMID:41539414	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序解析了香港牡蛎的组织细胞结构及其先天免疫程序	首次在海洋无脊椎动物中构建了组织分辨的单细胞图谱，定义了二十种细胞类型，揭示了吞噬细胞谱系的三种终末策略以及神经、上皮和免疫细胞群之间以NCAM和PTPRM为中心的关键通讯通路	研究聚焦于单一物种（香港牡蛎），其发现向其他海洋无脊椎动物的普适性有待验证	解析海洋无脊椎动物屏障黏膜组织的细胞结构、功能分工及先天免疫程序	香港牡蛎（Crassostrea hongkongensis）的组织细胞	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量	NA	单细胞RNA-seq	NA	NA