单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-09-16 |
CosMxScope: Scalable Reconstruction and Digital Pathology Integration of Imaging-Based Spatial Transcriptomics Data
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.713520
PMID:41959506
|
研究论文 | 介绍了一个轻量级开源Python框架CosMxScope，用于重建CosMx空间转录组数据的全切片图像，并将其与数字病理学工具（如QuPath）集成，实现空间转录组数据与组织病理学的可视化分析 | 开发了CosMxScope开源框架，首次实现了将CosMx SMI的FOV图像块拼接为重建全切片图像，并将细胞分割多边形和转录本坐标转换为GeoJSON对象，使其可直接在QuPath等数字病理学工具中进行交互式分析 | 摘要中未明确提及 limitations | 构建一个连接CosMx空间转录组数据输出与组织病理学可视化环境的桥梁工具，支持基于病理学的空间分析工作流 | CosMx SMI平台产生的人类和小鼠组织的空间转录组数据，包括FOV图像块、亚细胞转录本坐标和细胞分割多边形 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学、单细胞空间多模态组学成像 | NA | 图像、空间转录本坐标、细胞分割多边形 | NA | NanoString | 空间转录组学、单细胞空间多模态组学 | CosMx Spatial Molecular Imager (SMI) | CosMx SMI可在全切片组织上以单细胞和亚细胞分辨率测量每个细胞中数千个RNA或蛋白质靶标 |
| 82 | 2026-09-16 |
Hot Zones for Liver Cancer: Metabolic Zonation, Ferroptosis, and the Origins of HCC
2026-03-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-5839
PMID:41490712
|
研究论文 | 该研究利用小鼠遗传学在特定肝脏分区引入致癌突变，并结合空间转录组学追踪癌前肝细胞，揭示了肝细胞癌主要起源于小叶中央区（zone 3）肝细胞，且Gstm2/3通过抑制铁死亡促进肿瘤发生 | 首次定义肝脏的“致瘤分区”（tumorigenic zonation），发现克隆扩增与致瘤潜力存在显著分离，并鉴定Gstm2和Gstm3通过维持氧化还原平衡和抑制铁死亡驱动HCC发生 | NA | 探究肝脏代谢分区与肝细胞癌起源的关系，以及铁死亡在HCC发生中的作用 | 小鼠肝脏分区特异性肝细胞、肝细胞癌前病变细胞 | 空间转录组学 | 肝癌 | 空间转录组学、小鼠遗传学、功能筛选 | NA | 空间转录组数据、图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-09-16 |
Spatially Resolved Opto-Omics Uncovers Functional Microglial Subtypes in Brain Metastasis
2026-03-16, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-5539
PMID:41834497
|
评论 | 本文是一篇关于利用光遗传学与单细胞转录组学结合的新方法（opto-omics）来研究脑转移中功能性小胶质细胞亚型的评论文章 | 提出了“opto-omics”方法，将光转换荧光蛋白技术与单细胞转录组学结合，实现了对活体中空间定位细胞转录命运的分析，能够在小鼠脑内原位对迁移至播散肿瘤细胞附近的小胶质细胞进行光转换和转录组分析 | NA | 研究脑转移肿瘤微环境中功能性小胶质细胞亚型的特征和功能 | 小鼠脑转移模型中的小胶质细胞 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 脑转移, 肿瘤 | 光遗传学, 单细胞转录组测序 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 84 | 2026-09-16 |
Dissecting the differentiation origins of intestinal metaplasia and early intestinal-type gastric cancer in gastric antrum by single-cell RNA profiling
2026-Mar-10, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01355-8
PMID:41807518
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序数据分析了胃窦癌前病变和早期肠型胃癌中上皮细胞的分化轨迹，揭示了肠化生和早期肠型胃癌的分化起源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了胃窦不同疾病阶段上皮细胞的分化轨迹，发现KIAA0101PRAP1祖细胞可能是早期肠型胃癌的潜在起源 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究胃窦不同疾病阶段中细胞分化的起源及其致癌潜力，特别是肠化生和早期肠型胃癌的分化起源 | 胃窦活检样本中的上皮细胞，来自癌前病变和早期胃癌患者 | 单细胞转录组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2026-09-16 |
Identification of cryosensitive niches and a targetable FOS/AP‑1 program in the human ovarian cortex by single‑cell and spatial transcriptomics
2026-03-03, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04757-4
PMID:41776587
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术，鉴定了人卵巢皮质中对冷冻保存敏感的细胞亚群，并揭示了FOS/AP-1信号通路在冷冻损伤中的关键作用 | 首次在单细胞和空间水平上系统鉴定卵巢冷冻损伤敏感的细胞亚群，发现FOS/AP-1通路在玻璃化冷冻-快速复温后被激活，并证明T-5224抑制剂可挽救冷冻卵巢的形态和功能 | 样本量有限（仅3例性别重置手术患者），缺乏长期移植或体内功能验证实验 | 鉴定对冷冻-复温敏感的卵巢细胞群体，阐明卵巢冷冻损伤相关的关键转录组改变和信号通路 | 接受性别重置手术患者的卵巢皮质组织、卵母细胞 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 生殖医学, 卵巢冷冻保存 | 单细胞RNA-seq, Smart-seq2, 空间转录组学, β-半乳糖苷酶染色, 免疫荧光, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像 | 52,665个卵巢细胞（27,185个新鲜细胞和25,480个冻融细胞）以及110个卵母细胞（66个新鲜和44个玻璃化冷冻-快速复温） | 10x Genomics, Illumina, BGI | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Smart-seq2, BGI Stereo-seq | 10x Genomics单细胞RNA-seq用于解离的卵巢细胞悬液，Smart-seq2平台用于卵母细胞分析，BGI Stereo-seq用于空间转录组学 |
| 86 | 2026-09-16 |
Transfer of Damaged Mitochondria from Cancer Cells to Cancer-Associated Fibroblasts Promotes Tyrosine Kinase Inhibitor Tolerance in EGFR-Mutant Lung Cancer
2026-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0433
PMID:41329713
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现了与EGFR-TKI耐药和不良预后相关的RGS5+MYL9+癌症相关成纤维细胞群体，并揭示了其通过接受肿瘤来源的受损线粒体促进耐药持久细胞存活的机制 | 首次发现RGS5+MYL9+ CAF群体作为代谢汇接受肿瘤来源的受损线粒体以促进DTP存活，揭示了CCL11信号招募CAFs至DTP生态位以及TKI诱导的线粒体ROS通过Miro1/RhoA激活形成隧道纳米管的机制，并提出fasudil联合治疗克服EGFR-TKI耐药的新策略 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究EGFR突变肺腺癌中癌症相关成纤维细胞与耐药持久细胞之间的相互作用机制，寻找克服EGFR-TKI耐药的治疗靶点 | EGFR突变肺腺癌中的耐药持久细胞和癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2026-09-16 |
Oncolytic HSV-1-Mediated JAG1 Blockade Induces Glioma Senescence-Associated Secretory Phenotype to Increase Macrophage Activation and Cetuximab-Mediated Senolysis
2026-03-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1402
PMID:41411618
|
研究论文 | 该研究构建了一种拮抗JAG1的溶瘤单纯疱疹病毒（OD-0J1），通过抑制Notch信号和CDK1诱导胶质瘤细胞衰老及衰老相关分泌表型，重塑肿瘤相关巨噬细胞，并结合西妥昔单抗实现衰老细胞清除，增强抗肿瘤疗效 | 首次构建了JAG1拮抗型溶瘤HSV-1（OD-0J1），揭示了JAG1阻断通过抑制CDK1激活G2-M检查点进而诱导胶质瘤细胞衰老的机制，发现衰老细胞中EGFR激活是逃逸死亡的途径，并提出西妥昔单抗作为衰老细胞清除剂与溶瘤病毒联合治疗的新策略 | 研究主要基于临床前小鼠模型，人体临床试验数据有限，OD-0J1的长期安全性和有效性仍需进一步验证，且衰老相关分泌表型在体内的复杂调控网络尚未完全阐明 | 探究内源性JAG1介导的信号通路在胶质瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中的作用，并评估JAG1拮抗型溶瘤HSV-1的抗肿瘤疗效及联合治疗策略 | 胶质瘤细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAM）、裸鼠和人源化小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学、溶瘤病毒治疗 | 胶质瘤 | 溶瘤病毒工程、单细胞RNA测序、流式细胞术、激酶组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-09-16 |
The transcriptional landscape of developing human trisomy 21 lungs
2026-03-01, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2025-0217OC
PMID:40997082
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，对产前21三体综合征（T21）与非T21人类肺组织进行了转录组分析，揭示了T21肺部在组织病理异常起始阶段的分子变化 | 首次在单细胞水平上描述了产前T21肺部的转录组景观，识别出上皮细胞过早分化、间充质细胞中关键细胞外基质分子的广泛诱导以及内皮细胞中IFN信号通路的过度激活 | 样本量较小（T21组n=5，非T21组n=4），可能限制了统计效力和结果的普遍性 | 描述产前T21肺部在单细胞水平上的分子变化，以加深对唐氏综合征肺部并发症起源的理解 | 产前T21（n=5）和非T21（n=4）人类肺组织 | 数字病理学, 机器学习 | 唐氏综合征, 肺部疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 荧光原位杂交 | Seurat聚类分析, UMAP降维, 差异表达分析 | 基因表达数据, 图像 | T21组5例产前肺组织样本，非T21组4例产前肺组织样本，共9例 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2026-09-16 |
Single-cell network analysis reveals gene expression programs for Arabidopsis epidermis development and metabolism
2026-03, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70819
PMID:41880598
|
研究论文 | 整合11个拟南芥地上部和叶片单细胞RNA-seq数据集，构建表皮细胞基因共表达网络AtEpidermisGGM，鉴定120个基因表达程序，揭示表皮发育与代谢的调控模块 | 首次构建拟南芥表皮单细胞基因共表达网络，发现并验证DMS1/2调控气孔密度、DGC1/2/3控制气孔运动的新功能 | 基于公共数据集的整合分析，可能受批次效应和细胞类型注释精度影响；未在更多突变体中验证所有GEP功能 | 解析拟南芥表皮发育和代谢的基因调控程序 | 拟南芥地上部和叶片的表皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq | SingleCellGGM | 基因表达数据 | 30247个表皮细胞，来自11个公共单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-09-14 |
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-03-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08004-5
PMID:41845425
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学，揭示了食管鳞状细胞癌中LAMA3+恶性细胞和SPP1+巨噬细胞形成的免疫抑制微环境及其协同促进免疫逃逸的机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学，鉴定出位于侵袭前沿的LAMA3+上皮亚群和SPP1+巨噬细胞，并通过NicheNet建模揭示了二者之间的配体-受体相互作用及其协同驱动促结缔组织增生和免疫排斥微环境的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 解析食管鳞状细胞癌肿瘤微环境的细胞组成、空间组织和肿瘤-免疫相互作用，阐明驱动微环境异质性的细胞和空间机制 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）组织 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NicheNet | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2026-09-14 |
Integrative bibliometrics and spatial transcriptomics identify CAF-associated genes and immune niches in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04694-x
PMID:41838222
|
研究论文 | 本文整合文献计量学与空间转录组学等多组学数据，系统揭示肝细胞癌中癌症相关成纤维细胞（CAF）在耐药、转移和免疫微环境重塑中的关键作用及机制。 | 将文献计量学分析与多组学及空间转录组数据整合，首次系统识别CAF相关基因及其在肝细胞癌中的空间定位与免疫细胞共定位特征 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 通过整合文献计量分析与多组学及空间转录组数据，系统阐明CAF在肝细胞癌治疗耐药、转移和免疫微环境重塑中的关键作用与机制 | 肝细胞癌（HCC）相关研究文献、转录组数据集和空间转录组数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 文献计量学分析, 多组学整合分析, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像, 转录组数据 | 266篇原创研究文献，以及来自GEO、TCGA和ICGC的转录组数据集和空间转录组数据 | NA | 空间转录组学, 转录组测序 | NA | NA |
| 92 | 2026-09-14 |
Spatial transcriptomic map of the mouse urinary bladder
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42931-z
PMID:41840076
|
研究论文 | 本文利用Visium HD技术构建了小鼠膀胱的近单细胞分辨率空间转录组图谱，并分析了不同组织层的基因表达模式 | 首次使用Visium HD技术（8×8 μm bins）构建小鼠膀胱的精细空间转录组图谱，识别出13个不同细胞簇，并发现平滑肌存在四个空间上不同的亚群，而传统非空间scRNA-seq通常只能检测到一个平滑肌簇 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类膀胱或其他病理条件下验证；空间分辨率虽接近单细胞但并非真正的单细胞水平；分析仅局限于基因表达，未涉及蛋白或代谢层面 | 构建小鼠膀胱的空间转录组图谱，以在空间背景下解析膀胱各组织层和细胞类型的基因表达特征 | 小鼠膀胱组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 图像和文本（空间转录组数据） | 66,471个bins，9,364个基因 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | Visium HD技术，8×8 μm bins |
| 93 | 2026-09-14 |
A cross-scale multimodal framework identifies clinically actionable immunotherapy biomarkers in melanoma through bulk to single-cell and spatial transcriptomics integration
2026-03-16, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00919-w
PMID:41840725
|
研究论文 | 该研究通过多组学整合、机器学习、单细胞和空间转录组学，识别了黑色素瘤的分子亚型和预后标志物，并验证了免疫治疗反应 | 开发了跨尺度多模态框架，整合bulk至单细胞和空间转录组学数据，识别了临床可操作的免疫治疗生物标志物 | 摘要中未明确提及研究限制 | 识别黑色素瘤的分子亚型和预后标志物，以预测患者预后和免疫治疗反应 | 黑色素瘤患者和相关的分子数据 | 数字病理学、机器学习 | 黑色素瘤 | 多组学整合、转录组范围关联研究、单细胞转录组学、空间转录组学 | 机器学习模型（如CMLS） | 批量转录组数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | TCGA-SKCM队列、GEO独立元队列、GTEx和UK Biobank数据集 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2026-09-14 |
The MEK1/2-IRF4 axis fosters T follicular helper cell differentiationand antitumor humoral immune response
2026-03-16, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08023-2
PMID:41840714
|
研究论文 | 该研究揭示MEK1/2信号通路通过IRF4调控Tfh细胞分化，从而影响抗肿瘤体液免疫应答 | 首次发现MEK1/2-IRF4轴是Tfh细胞分化和抗肿瘤体液免疫的关键调控通路，并证明MEK抑制剂可增强Tfh浸润和体液免疫应答 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究Tfh细胞分化在抗肿瘤免疫中的分子机制，并寻找增强抗肿瘤体液免疫的治疗策略 | T细胞特异性Mek1/2敲除小鼠、小鼠肿瘤模型、黑色素瘤患者TCGA-SKCM队列 | 免疫学 | 黑色素瘤 | RNA-seq、ATAC-seq、scRNA-seq、流式细胞术、过表达实验 | NA | RNA-seq数据、ATAC-seq数据、scRNA-seq数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、bulk ATAC-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-09-14 |
Identified BIRC5 and HDAC1 as novel diagnostic biomarkers linked to centrosome-immune crosstalk for cutaneous squamous cell carcinoma via machine learning-based multi-omics analysis
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04547-7
PMID:41838306
|
研究论文 | 本研究通过基于机器学习的多组学分析，识别出BIRC5和HDAC1作为与中心体-免疫串扰相关的皮肤鳞状细胞癌新型诊断生物标志物 | 首次通过101种组合模型（来自10种机器学习算法）筛选中心体与免疫相关生物标志物，并结合人工神经网络分析及单细胞RNA测序揭示BIRC5和HDAC1在cSCC中心体-免疫串扰中的作用 | 研究主要基于公共数据库和RT-qPCR验证，缺乏大规模临床队列验证及体内功能实验 | 探索中心体改变与免疫调节之间的相互作用，寻找cSCC的新型诊断生物标志物和治疗靶点 | 皮肤鳞状细胞癌（cSCC）患者样本及公共数据库数据 | 机器学习 | 皮肤鳞状细胞癌 | RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 人工神经网络（ANN）, 机器学习组合模型 | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2026-09-14 |
Multi-omics data reveal B cell regulated immune heterogeneity of MIF signaling pathway in uveal melanoma
2026-Mar-16, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04257-8
PMID:41840673
|
研究论文 | 本研究通过批量RNA测序、单细胞RNA测序和蛋白质组学等多组学数据分析，揭示了葡萄膜黑色素瘤中B细胞受体调控的免疫异质性及MIF信号通路的关键作用 | 首次采用TRUST4算法重建和分析葡萄膜黑色素瘤中的BCR免疫组库，发现特定的IGK、IGH、IGL-V和J基因在UM中显著高表达；结合蛋白质组学和单细胞RNA测序揭示了转移性UM中浆B细胞通过CXCR4-CD74相互作用调控MIF信号通路，并通过UM细胞系验证了MIF-CD74在肿瘤增殖中的作用 | 临床队列样本量较小（仅5例原发性和5例转移性UM患者）；研究主要基于生物信息学分析和体外细胞系验证，缺乏体内动物模型实验和更大规模的临床验证 | 探索B细胞受体在葡萄膜黑色素瘤发病机制中的作用，特别是转移性UM中的免疫异质性，以确定其为未来治疗的潜在靶点 | 葡萄膜黑色素瘤患者的肿瘤组织和血液样本、UM细胞系 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、TRUST4算法 | NA | RNA测序数据、蛋白质组数据、图像 | 10例UM患者血液样本（5例原发性，5例转移性）、批量RNA-seq数据集、单细胞RNA-seq数据集、UM细胞系 | NA | 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 97 | 2026-09-14 |
Harnessing γδ T cells for B7-H3-targeting CAR therapy to enhance anti-tumor therapy in glioblastoma
2026-03-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07994-6
PMID:41832583
|
研究论文 | 该研究将靶向B7-H3的CAR导入γδ T细胞，并在体外和胶质母细胞瘤小鼠模型中验证其抗肿瘤效果优于传统αβ T细胞 | 首次将B7-H3靶向CAR与γδ T细胞结合，利用γδ T细胞固有肿瘤归巢和免疫调节能力与抗原特异性细胞毒性实现协同抗肿瘤 | 研究主要基于体外实验和小鼠异种移植模型，尚未开展临床验证；样本来源为健康供者PBMC，未评估患者来源γδ T细胞的功能 | 探索B7-H3 CAR-γδ T细胞在胶质母细胞瘤免疫治疗中的抗肿瘤效能及机制 | 人γδ T细胞、传统αβ T细胞、B7-H3阳性胶质瘤细胞系（U87、U251）及胶质瘤异种移植NSG小鼠 | 数字病理, 机器学习 | 脑胶质瘤 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 流式细胞术, 细胞毒性实验, 细胞因子释放实验, 免疫荧光 | NA | 文本, 图像 | 来自健康供者PBMC扩增的γδ T细胞和αβ T细胞、U87和U251胶质瘤细胞系、NSG小鼠胶质瘤异种移植模型；TCGA和CGGA队列的bulk及单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-09-14 |
Endothelial cells temporally orchestrate lymphocyte dynamics and functional outcomes after ischemic stroke
2026-Mar-14, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00794-6
PMID:41832563
|
研究论文 | 本研究通过tMCAO模型结合单细胞RNA测序和多种实验手段，揭示了缺血性卒中后T细胞、B细胞和NK细胞在时间和空间上的动态变化及其对脑修复的功能影响 | 首次系统性地定义了卒中后T细胞、B细胞和NK细胞在外周和中枢的时空动态差异，发现了反应性内皮微静脉（REV）作为淋巴细胞进入脑实质的关键通道，并揭示了不同淋巴细胞亚群在卒中不同阶段的功能特异性 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 明确卒中后T细胞、B细胞和NK细胞在外周和中枢的时空动态，研究其穿越脑血管内皮的迁移机制及其对脑免疫微环境重塑的作用 | 缺血性卒中后的T细胞、B细胞、NK细胞以及脑血管内皮细胞 | 数字病理学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, FACS, 流式细胞术, RT-PCR, 免疫荧光染色, 激光共聚焦显微镜, 多色免疫组化 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2026-09-14 |
Spatial transcriptomic landscape of invasion patterns in human papillomavirus-associated endocervical adenocarcinoma
2026-Mar-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43717-z
PMID:41820442
|
研究论文 | 该研究利用全转录组空间转录组学技术，分析了HPV相关宫颈腺癌不同侵袭模式中肿瘤上皮和周围间质免疫微环境的基因表达差异 | 首次使用空间转录组学在同一肿瘤内比较不同侵袭模式，控制了患者间异质性，并发现了与高风险侵袭相关的ECM重塑和巨噬细胞增加，以及一个四基因预后标志物 | 样本量较小（仅7例），需要在更大队列中验证 | 探讨HPV相关宫颈腺癌不同侵袭模式（Silva分型）的分子机制 | HPV相关宫颈腺癌组织样本 | 空间转录组学 | 宫颈癌 | 全转录组空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 7例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 100 | 2026-09-14 |
Human neuronal differentiation under Aβ exposure: a single-cell transcriptomic and epigenomic dataset
2026-Mar-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06971-4
PMID:41807428
|
研究论文 | 该研究构建了人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞在Aβ1-42暴露下的单细胞多组学数据集，包含四个分化时间点的配对scRNA-seq和scATAC-seq数据 | 首次提供了人类神经祖细胞分化过程中Aβ暴露下的配对单细胞转录组和表观基因组多模态数据集，涵盖四个时间点，并进行了转录组与公共海马体bulk RNA-seq数据的比较验证 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 研究Aβ暴露对人类神经祖细胞向神经元分化过程中转录组和染色质可及性动态变化的影响 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经祖细胞 | 机器学习, 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 图像, 文本 | RNA分析42,575个高质量细胞，ATAC分析30,192个高质量细胞，覆盖4个时间点（第0、7、13、20天），分基线和Aβ暴露两种条件 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞多组学平台，同时获取scRNA-seq和scATAC-seq图谱 |