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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-05-09 |
Acute Inflammation Drives Corneal Pathological Regeneration
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.58
PMID:41910526
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序描绘急性炎症诱导的角膜病理再生过程中的转录组和表观遗传组图谱 | 首次提供炎症角膜的时间分辨单细胞转录组和表观遗传组综合图谱,揭示细胞类型特异性基因调控元件和顺式调控染色质相互作用 | 未明确说明局限性 | 表征急性炎症诱导的角膜转录组和表观遗传组重塑 | 脂多糖或PBS处理后第5天和第10天的角膜缘-角膜组织 | 数字病理学 | 角膜炎症性疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 未明确说明样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序 |
| 82 | 2026-05-09 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01652-z
PMID:41688738
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研究论文 | 利用空间转录组分析PS19小鼠模型在tau蛋白病变发生前的代谢变化,发现糖酵解通路基因在易感脑区早于可见病理变化出现上调 | 首次通过空间转录组学揭示CA3区域糖酵解通路基因Pgk1在可检测的tau蛋白缠结出现前即发生上调,且与缠结严重程度相关,区域特异性代谢失调为tau蛋白病变早期标志 | 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;未深入探讨早期糖酵解上调的确切机制 | 研究tau蛋白病变与脑区特异性转录组变化的关系,特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 | PS19 tau P301S转基因小鼠模型的海马区和皮层区域 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | PS19小鼠模型在2、4、6个月等不同时间点的海马和皮层样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术用于PS19小鼠脑组织切片分析 |
| 83 | 2026-05-09 |
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014101
PMID:41886524
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研究论文 | 开发基于U-Net的深度学习算法BLUE,从bulk RNA-seq样本中解卷积出细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 | 提出U-Net架构的深度学习算法BLUE,能同时预测细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱,显著优于现有解卷积算法 | NA | 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的优势,从bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性基因表达信息 | bulk RNA-seq样本和scRNA-seq数据集 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq | U-Net | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-05-08 |
Lineage-Specific Sex-Biased Transcriptional Programs in Healthy Human Truncal Skin Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040415
PMID:42074533
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研究论文 | 通过单细胞转录组学构建健康人类躯干皮肤的性别解析图谱,揭示谱系特异性性别偏向转录程序 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘健康人类躯干皮肤的性别差异,发现性别偏向基因呈谱系特异性而非广泛表达变化 | 样本量有限(12名捐赠者),且仅聚焦躯干皮肤,未涵盖其他身体部位 | 明确健康成人躯干皮肤在细胞组成和基因表达上的性别关联差异 | 健康人类躯干皮肤的细胞组成和性别偏向转录程序 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名捐赠者(5男,7女),共107,967个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 85 | 2026-05-08 |
Lactylation-Associated Immune Metabolic Reprogramming Identifies S100A2 and S100A14 as Candidate Diagnostic Biomarkers in Primary Open-Angle Glaucoma: An Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040403
PMID:42074521
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研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析,确定S100A2和S100A14作为原发性开角型青光眼的候选诊断生物标志物,并揭示其与免疫代谢重编程的相关性 | 首次将乳酰化相关免疫代谢重编程与原发性开角型青光眼联系起来,通过机器学习识别出S100A2和S100A14作为候选诊断标志物,并利用单细胞分析揭示其细胞类型特异性表达模式 | NA | 探索原发性开角型青光眼中乳酰化相关的免疫代谢重编程,并识别可靠的诊断生物标志物 | 原发性开角型青光眼患者的骨小梁组织样本 | 数字病理学 | 原发性开角型青光眼 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-05-08 |
Single-Cell Multi-Omics Reveal Gene Regulatory Mechanisms Underlying Cardiac Embryonic Development
2026-Mar-31, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040414
PMID:42074532
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综述 | 综述单细胞多组学技术在解析心脏胚胎发育基因调控机制中的应用 | 系统总结了单细胞多组学(如scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)在构建高分辨率心脏细胞图谱、揭示细胞异质性和谱系分化机制方面的最新进展 | 技术方法仍需进一步完善,整合分析策略有待优化以更全面揭示发育过程 | 阐明单细胞多组学技术如何揭示心脏胚胎发生中的基因调控机制及其对先天性心脏病的启示 | 心脏胚胎发育过程中的细胞类型、谱系轨迹和基因调控网络 | 数字病理学 | 先天性心脏病 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-05-08 |
Astrocytes in neuroinflammation and brain cancer
2026-Mar-30, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-026-00439-y
PMID:41910655
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综述 | 合成单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学和多重成像证据,描绘星形胶质细胞在神经炎症和脑癌中的主要肿瘤相关程序,并提出4D时空映射框架和胶质液体活检概念 | 提出基于星形胶质细胞的4D时空映射框架和胶质液体活检概念,识别可干预的分子节点 | 尚缺乏临床纵向采样和空间图谱验证,星形胶质细胞靶向干预的体内验证和患者分层需要进一步研究 | 阐明星形胶质细胞在脑癌(尤其是胶质瘤)进展中的状态转变机制,并探索治疗转化策略 | 肿瘤相关星形胶质细胞 | 数字病理学 | 脑癌(胶质瘤) | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、多重成像 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学 |
| 88 | 2026-05-08 |
Integrated Multi-Omics and Machine Learning Framework Identifies Diagnostic Signatures and Druggable Targets in Breast Cancer
2026-Mar-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040396
PMID:42074514
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研究论文 | 通过整合多组学与机器学习框架,鉴定乳腺癌诊断标志物及可药靶点 | 首次结合127种机器学习算法与SMR因果推断,筛选出关键诊断基因CHEK1,并利用AI辅助虚拟筛选与分子对接优先识别靶向化合物 | 研究结果为基于计算预测的假设生成,尚需实验验证才能得出治疗结论 | 鉴定乳腺癌高灵敏度、高特异性的诊断生物标志物及靶向治疗分子靶点 | 乳腺癌转录组数据,包括7个GEO数据集与TCGA-BRCA队列(共1231个样本) | 机器学习 | 乳腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序 | 集成机器学习(127种算法组合) | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 1231个乳腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq(推测) | NA |
| 89 | 2026-05-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals γδT Cell Heterogeneity Under Distinct Microsatellite Statuses as a Potential Biomarker for Immunotherapy and Prognosis in Colorectal Cancer
2026-Mar-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040387
PMID:42074506
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示不同微卫星状态下γδT细胞的异质性,并探讨其作为结直肠癌免疫治疗和预后生物标志物的潜力 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出微卫星不稳定结直肠癌中富集的C4_CXCL13 γδT细胞亚群,该亚群具有耗竭样T细胞表型但保留强大的细胞毒功能,并基于其17个标记基因构建了与生存、免疫浸润和治疗反应相关的特征评分 | 基于公共数据集的验证可能受限于样本异质性,且功能验证实验不够充分 | 阐明不同微卫星状态下γδT细胞的异质性特征及其在调控结直肠癌免疫治疗反应中的作用 | 结直肠癌患者中的γδT细胞亚群 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | NA(基于公共数据集,未明确样本数量) | NA(未在标题和摘要中提及具体平台公司) | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-05-08 |
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08656-7
PMID:41896206
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研究论文 | 开发了一种新型双重细胞免疫疗法,将人脐带间充质干细胞与CD19 CAR T细胞联合使用,以增强抗肿瘤效果并减轻副作用 | 首次揭示hUC-MSC通过Th17分化诱导CD8 NK样细胞毒性T淋巴细胞,从而在肿瘤高负荷条件下增强CAR T细胞疗效 | 基于异种移植模型,可能无法完全模拟人体免疫环境 | 探索hUC-MSC与CAR T细胞联合疗法在肿瘤高负荷条件下的抗肿瘤效果和安全性 | 人脐带间充质干细胞和CD19 CAR T细胞 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 高负荷B细胞淋巴瘤异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 91 | 2026-05-08 |
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08590-8
PMID:41896221
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示HIF1抑制靶向肿瘤和髓系细胞,为转移性去势抵抗性前列腺癌提供有前景的治疗策略 | 首次结合单细胞和空间转录组学揭示HIF1信号在PTEN/TP53缺失的前列腺癌中调控髓系细胞浸润和转移微环境,并提出HIF1抑制优于直接髓系细胞阻断的治疗效果 | 仅在小鼠模型中进行验证,需在人类样本和临床试验中进一步确认 | 阐明HIF1信号在转移性去势抵抗性前列腺癌中的肿瘤和免疫微环境调控机制 | PTEN和TP53双敲除的前列腺癌小鼠模型及肿瘤相关髓系细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、免疫组化 | NA | 转录组数据 | 小鼠前列腺肿瘤组织样本及肝转移灶 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 92 | 2026-05-08 |
Unraveling Circadian Rhythm Disorder-Related Gene Signatures and Molecular Subtypes in Ulcerative Colitis: An Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-27, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040383
PMID:42074501
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研究论文 | 通过整合批量与单细胞转录组数据,揭示昼夜节律紊乱相关基因特征及溃疡性结肠炎的分子亚型 | 首次建立昼夜节律紊乱与溃疡性结肠炎发病之间的强关联,并基于此开发了高风险预测模型及分子亚型 | 需要进一步的临床验证来确认模型的预测准确性 | 研究昼夜节律紊乱在溃疡性结肠炎中的作用及意义 | 溃疡性结肠炎患者和小鼠模型 | 自然语言处理 | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR | Lasso, SVM-RFE, 随机森林 | 转录组数据 | 五个独立UC队列的批量测序数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-05-08 |
Spatial and Functional Immune Profiling Identifies Impaired Vascular Repair in Human Myocardial Infarction
2026-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040755
PMID:42072296
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研究论文 | 通过对人类心肌梗死组织的空间转录组学和功能性分析,揭示CD8 T细胞和抗原呈递细胞在梗死区域的动态相互作用以及内皮祖细胞功能障碍对血管修复的影响 | 首次在人类心肌梗死样本中结合空间转录组学和功能性检测,绘制免疫-基质细胞在梗死区域的时空动态图谱,发现抗原呈递细胞驱动的CD8 T细胞募集及内皮祖细胞功能障碍是血管修复受损的关键特征 | 样本量较小(仅纳入少数患者),且空间分析局限于两个时间点(梗死后第2天和第6天),可能未能捕捉到完整的免疫-血管修复动态过程 | 阐明人类心肌梗死后免疫-基质细胞的空间互作及其对血管修复的影响 | 人类心肌梗死组织(梗死后第2天和第6天)及外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 流式细胞术, 内皮祖细胞集落形成实验 | NA | 基因表达数据, 细胞组成数据, 信号通路数据 | 有限数量的心肌梗死患者组织及外周血样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 94 | 2026-05-08 |
Cellular Senescence in Neurodegeneration: From Cell Types to Therapeutic Opportunities
2026-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040758
PMID:42072300
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综述 | 综述了细胞衰老在中枢神经系统神经退行性疾病中的作用,包括其机制、检测方法和治疗策略 | 特别强调了SASP在神经炎症、血管功能障碍和神经组织损伤中的角色,以及使用机器学习工具和转录组学方法改进衰老细胞检测的准确性 | 常用的衰老标志物特异性有限,存在假阳性检测风险;针对衰老细胞的治疗策略(如senolytics和senomorphics)存在临床挑战和局限性 | 探讨细胞衰老在神经退行性疾病发病中的作用,并总结相关治疗机会 | 中枢神经系统中的衰老细胞、神经退行性疾病(阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症) | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症 | qRT-PCR、ELISA、RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2026-05-08 |
Transcriptional Heterogeneity of Cardiac Remodeling Between Type 1 and Type 2 Diabetes
2026-Mar-25, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040746
PMID:42072287
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research paper | 本研究结合RNA测序和单细胞RNA测序,揭示了1型和2型糖尿病导致的心脏重塑在转录组水平上的异同,发现两型糖尿病在通路变化上比基因变化更具一致性 | 首次系统比较1型和2型糖尿病心脏重塑的转录异质性,揭示两型糖尿病在信号通路层面比基因层面具有更高的一致性,并针对内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞三类细胞进行深入分析 | 仅使用小鼠模型,未在人体样本中验证;未详细说明样本量和重复次数;缺乏功能验证实验 | 探究1型和2型糖尿病心脏重塑的转录异质性,识别共享和特异性的基因及通路变化 | 1型糖尿病和2型糖尿病小鼠模型的心脏组织 | digital pathology | cardiovascular disease | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 96 | 2026-05-08 |
A single-cell transcriptome atlas reveals the transcriptionally earliest state in rice callus
2026-Mar-25, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-026-08596-6
PMID:41882557
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示水稻愈伤组织转录最早期的细胞状态 | 首次利用单细胞RNA测序构建水稻胚性和分化愈伤组织的转录组图谱,鉴定出愈伤组织创始细胞和茎尖分生细胞分别代表胚性和分化愈伤组织的最早期转录状态 | NA | 解析水稻愈伤组织发育过程中细胞命运转变的初始状态和调控因子 | 水稻(Oryza sativa L.)胚性和分化愈伤组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 水稻胚性和分化愈伤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 97 | 2026-05-08 |
The expression characteristics of miR-206-3p in musculoskeletal tissue and its clinical significance
2026-Mar-25, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-026-06785-5
PMID:41882698
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研究论文 | 探讨miR-206-3p在骨肌组织中的表达特征及其与老年骨肌减少症患者临床参数的相关性 | 挑战了miR-206传统上被视为肌肉特异性分子的观点,发现其在骨-肌肉祖细胞中共表达,并作为骨肌交互的关键分子枢纽 | 未明确说明局限性,但研究基于老年髋部骨折患者的前瞻性队列,可能限制普适性 | 阐明miR-206-3p在骨肌组织中的表达模式和细胞特异性,及其与肌力、步速和骨密度的相关性 | 158例老年髋部骨折患者(79例骨肌减少症和79例对照)的骨肌组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | qRT-PCR, 原位杂交, scRNA-seq | NA | 图像与序列数据 | 158例患者(79例骨肌减少症,79例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2026-05-08 |
Deep Single-Cell Transcriptomic Profiling of Bovine Milk Somatic Cells Revealed Expression of Stem Cell Related Transcription Factors
2026-Mar-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040365
PMID:42074484
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研究论文 | 利用深度单细胞转录组测序技术解析牛乳体细胞中干细胞相关转录因子的表达 | 通过深度单细胞RNA测序揭示了低深度测序未能检测的稀有转录因子,强调了测序深度对解析细胞转录状态和功能异质性的重要性 | 仅包含两头泌乳中期荷斯坦奶牛的数据,样本量有限 | 进一步表征牛乳体细胞的单细胞转录组,重点关注高分辨率基因表达谱和细胞异质性 | 两头健康泌乳中期的荷斯坦奶牛的牛乳体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2头荷斯坦奶牛 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的微流控平台进行单细胞转录组测序 |
| 99 | 2026-05-08 |
Elevation of liver elasticity following radiofrequency ablation reflects neutrophil-mediated abscopal effect in liver cancer
2026-Mar-23, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101824
PMID:41881314
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研究论文 | 该研究探讨了肝癌射频消融术后肝脏弹性值升高与中性粒细胞介导的远隔效应之间的关系 | 首次发现射频消融术后肝脏剪切波弹性成像(SWE)值动态变化可作为中性粒细胞介导免疫应答的非侵入性生物标志物,并验证CD40激动剂联合治疗可增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于单中心临床数据和动物模型,未来需多中心验证及长期随访数据 | 探究射频消融术后SWE值变化与中性粒细胞免疫应答的关联,并开发辅助治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)患者及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 图像 | 102例患者和4-6只/组小鼠 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 100 | 2026-05-08 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法,识别ALOX5作为糖尿病肾病肾小管间质性炎症的潜在治疗靶点 | 首次综合运用多组学数据、机器学习和单细胞测序技术,揭示ALOX5在肾小管间质性炎症中的关键作用,并筛选出天然小分子和厚朴酚作为潜在抑制剂 | ALOX5的具体免疫调控机制仍需进一步验证,且研究主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内实验证据 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物并阐明其免疫调控机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织及浸润的巨噬细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 转录组测序,单细胞测序,多重免疫组化 | LASSO,随机森林 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 多个GEO转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |