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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-29 |
The role of OSM/OSMRβ axis in shaping the tumor microenvironment favoring MASLD-related HCC immune evasion
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001733
PMID:41779954
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研究论文 | 本研究探讨了OSM/OSMRβ轴通过促进肿瘤细胞产生CCL15,从而在MASH相关HCC中塑造免疫抑制性肿瘤微环境的作用 | 揭示了OSM/OSMRβ轴在MASH-HCC中通过自分泌信号促进CCL15产生并驱动免疫抑制微环境的新机制,为HCC治疗提供了潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类样本验证仍需扩大;混合病因的TCGA数据分析可能引入混杂因素 | 探究OSM/OSMRβ轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展为肝细胞癌(HCC)过程中对免疫抑制性肿瘤微环境的塑造作用 | MASLD/MASH患者(伴或不伴HCC)、野生型和肝细胞特异性OSMRβ缺陷小鼠的MASH相关HCC、肝癌细胞系(HepG2, Huh7)及免疫细胞系(THP-1) | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、体外共培养实验、转录组分析、磷酸化检测 | 基因敲除小鼠模型、细胞共培养模型 | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据、临床样本数据 | 人类MASLD/MASH患者队列、TCGA数据库HCC患者数据、野生型及hOSMRβ-/-小鼠模型、肝癌及免疫细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-03-29 |
Class A scavenger receptors promote tumor progression and induce a unique macrophage phenotype in a mouse model of spontaneous breast cancer
2026-Mar-03, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag026
PMID:41749430
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研究论文 | 本研究通过小鼠自发性乳腺癌模型,探讨了A类清道夫受体(SR-A)在肿瘤进展中的作用及其对肿瘤相关巨噬细胞表型的影响 | 首次在自发性乳腺癌模型中证实SR-A缺失可延缓肿瘤发生并减少肺转移,发现SR-A可与乳腺癌细胞表面聚糖结合,并通过单细胞RNA测序鉴定出具有高精氨酸酶1基因表达的独特SR-A依赖性TAM亚群 | 研究基于小鼠模型,其在人类乳腺癌中的直接相关性仍需进一步验证,SR-A的具体信号通路和下游效应分子尚未完全阐明 | 评估成纤维细胞激活蛋白酶(FAP)和SR-A在乳腺癌进展中的作用,特别是SR-A对肿瘤相关巨噬细胞表型及肿瘤微环境的影响 | 自发性乳腺癌小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和乳腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,通路分析 | NA | 基因表达数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2026-03-29 |
From Immunobiology to Clinical Application: Tumor-Infiltrating Lymphocytes in Melanoma
2026-Mar-03, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm16030147
PMID:41893014
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综述 | 本文综述了肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)在黑色素瘤中的生物学作用、预后预测价值以及基于TIL的过继细胞疗法(TIL-ACT)的临床应用 | 整合了TIL生物学、预后标志物及TIL-ACT在晚期黑色素瘤治疗中的最新进展,并强调了患者、肿瘤和TIL产品相关因素对疗效的影响 | 作为叙述性综述,可能未涵盖所有最新研究,且TIL-ACT的副作用和制造效率仍是挑战 | 探讨TILs在黑色素瘤免疫反应中的作用及其在过继细胞疗法中的临床应用 | 黑色素瘤患者及其肿瘤微环境中的TILs | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 84 | 2026-03-29 |
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-Mar, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09989-7
PMID:41639465
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和表观遗传数据构建了CD8 T细胞状态的综合图谱,并利用CRISPR筛选结合单细胞RNA测序技术,发现了调控T细胞分化的关键转录因子 | 构建了首个整合多组学数据的CD8 T细胞状态图谱,并通过体内Perturb-seq技术系统性鉴定出调控T细胞分化的新型转录因子 | 研究主要聚焦于CD8 T细胞,未涉及其他免疫细胞类型;体内筛选模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 系统鉴定调控CD8 T细胞分化的转录因子,为细胞免疫疗法提供新靶点 | CD8 T细胞的九种分化状态,特别是终末耗竭T细胞和组织驻留记忆T细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,表观遗传分析,CRISPR筛选 | NA | 转录组数据,表观遗传数据 | 涵盖九种CD8 T细胞状态 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 体内Perturb-seq(CRISPR筛选整合单细胞RNA测序) |
| 85 | 2026-03-29 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01652-z
PMID:41688738
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研究论文 | 本研究利用PS19小鼠模型,通过空间转录组分析揭示了在tau蛋白病明显病变前,海马CA3区糖酵解通路基因的早期上调,强调了代谢应激和胶质细胞激活在tau蛋白病及区域易感性中的作用 | 首次在PS19小鼠模型中,通过空间转录组学技术,在可检测的tau缠结病理出现前(2月龄)发现了海马CA3区糖酵解通路基因(如Pgk1)的早期上调,并揭示了区域特异性、时间动态的转录模式 | 研究基于转基因小鼠模型,其结果向人类疾病的直接转化可能存在限制;空间转录组分析可能受限于分辨率,未能解析单细胞水平的异质性 | 探究tau蛋白病进展中区域易感性与tau蛋白驱动的转录组变化之间的关系,特别是代谢失调的早期作用 | PS19转基因小鼠(tau P301S模型)的海马和皮质区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | PS19小鼠模型在选定疾病阶段的海马和皮质区域样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2026-03-29 |
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01458-3
PMID:41776110
|
研究论文 | 本研究揭示了ECM1作为肾脏纤维化早期调控因子,通过整合素α2β1-RhoC轴调控YAP活性,进而影响线粒体氧化磷酸化,从而塑造肾脏纤维化微环境的代谢与空间动态 | 首次发现ECM1是肾脏重塑的早期调控因子,并阐明其通过整合素α2β1-RhoC-YAP-TEAD4-Pgc1a信号轴调控线粒体代谢重编程,从而对抗纤维化进展的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步开展;ECM1在不同细胞类型中的特异性作用机制有待深入解析 | 探究早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境形成中的作用机制 | 小鼠肾脏组织、成纤维细胞、肾小管细胞 | 空间组学 | 慢性肾脏病 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、AAV9介导的基因敲低、条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据、组织学图像 | 全球性Ecm1敲除小鼠及成纤维细胞特异性敲除小鼠 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-03-29 |
A brain-gut excitatory peptide/CCHamide homolog regulates satiation and motivational state transitions in the Aplysia feeding circuit
2026-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111257
PMID:41654135
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研究论文 | 本研究在软体动物海兔中鉴定了EP/CCHa同源肽及其受体,揭示了该脑-肠肽作为饱食信号调控摄食动机状态转换的机制 | 首次在海兔中鉴定出EP/CCHa同源肽及其两个受体,发现其中一个受体意外地与节肢动物受体聚类,揭示了该肽通过特定中枢模式发生器中间神经元调控摄食动机状态转换的新机制 | 研究主要在海兔模型中进行,其发现是否适用于其他物种仍需进一步验证 | 探究EP/CCHa信号通路在摄食回路中的调控机制 | 海兔(Aplysia)的摄食回路及相关神经元 | 神经科学 | NA | 质谱分析、原位杂交、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 分子数据、细胞数据、行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2026-03-29 |
Lipid-dependent accrual of a subset of monocyte-derived macrophages is essential for tissue regeneration
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01480-5
PMID:41814078
|
研究论文 | 本研究揭示了一种脂质依赖性的单核细胞来源巨噬细胞亚群在肝脏损伤后组织再生中的关键作用 | 首次发现并表征了具有高脂质含量和强炎症反应的“脂质炎症性单核来源巨噬细胞”亚群,阐明其通过CD36-神经酰胺-IRE1α-XBP1-IL-6信号轴调控肝脏再生的新机制 | 研究主要聚焦于肝脏再生模型,在其他组织或疾病模型中的普适性有待验证;机制研究尚未完全解析脂质代谢与炎症信号整合的具体分子细节 | 探究肝脏损伤后免疫反应与代谢重编程如何协同调控肝细胞增殖和组织再生 | 小鼠肝脏损伤模型中的单核细胞来源巨噬细胞亚群、肝细胞 | 免疫代谢学 | 肝脏疾病 | 单细胞转录组学、定量脂质组学、多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-03-29 |
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2026-Mar, Nature metabolism
IF:18.9Q1
DOI:10.1038/s42255-026-01475-2
PMID:41820564
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类皮下脂肪组织中血管系统的细胞异质性及其在肥胖和2型糖尿病中的变化 | 首次在人类脂肪组织中系统描绘了血管细胞的单细胞图谱,并发现了一个具有内皮、间充质、脂肪细胞和免疫转录特征的独特内皮细胞亚群 | 研究仅针对皮下脂肪组织,未涉及内脏脂肪等其他脂肪类型;样本量相对有限(65名个体) | 阐明人类脂肪组织血管微环境的细胞组成及其在代谢状态变化中的作用 | 人类皮下脂肪组织中的血管细胞 | 单细胞组学 | 肥胖、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、全组织成像、计算分析 | NA | 单细胞转录组数据、成像数据 | 65名个体的近70,000个血管细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-03-29 |
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014008
PMID:41838767
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研究论文 | 本文首次在真实场景下系统性地评估了半监督单细胞RNA测序整合方法,并与无监督方法进行了比较 | 首次在真实条件下系统比较半监督与无监督单细胞RNA测序整合方法,并考虑了多种不完美标签场景 | 研究显示当前半监督方法在标签质量不确定时实际优势有限,且没有方法能始终优于最强的无监督方法 | 评估半监督单细胞RNA测序整合方法在真实场景下的性能与鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据整合方法 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | scANVI, ssSTACAS | 单细胞RNA测序数据 | 六个不同数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-29 |
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-Mar, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013610
PMID:41871169
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,分析了HDAC抑制剂在EBV阳性B淋巴母细胞中诱导的裂解异质性,定义了流产和耐药状态 | 首次在单细胞水平上揭示了HDAC抑制剂诱导EBV裂解复制的异质性,并识别了NF-κB和CD137/CD137L信号轴在阻止成功裂解复制中的作用 | 研究仅基于四种EBV阳性细胞系,未涉及体内模型或患者样本,可能限制了结果的普适性 | 探究HDAC抑制剂在EBV相关恶性肿瘤中诱导裂解复制的机制,并识别影响治疗反应的宿主因素 | 四种EBV阳性细胞系:P3HR1-ZHT BL、Jijoye BL、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞样细胞系 | 单细胞组学 | EBV相关恶性肿瘤(如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌) | 单细胞RNA测序,Cas9-RNP功能验证 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四种EBV阳性细胞系,具体单细胞数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-03-29 |
Computational framework for therapeutic target discovery via perturbation simulation: application to cystic fibrosis airway disease
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag129
PMID:41883030
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研究论文 | 本文提出了一种整合单细胞转录组学、加权基因共表达网络分析和计算扰动模拟的计算框架,用于系统性发现治疗靶点,并以囊性纤维化气道疾病为例进行应用 | 开发了一个结合多尺度生物数据整合与系统级扰动模拟的计算框架,能高效发现新颖治疗靶点,具有可扩展性和通用性 | 未在实验或临床层面进行验证,仅通过计算模拟评估靶点 | 开发一种计算框架,用于系统性发现复杂疾病的治疗靶点 | 囊性纤维化气道疾病患者 | 计算生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序 | 知识图谱、加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 38名患者,51,415个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2026-03-28 |
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD25178
PMID:41630526
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型探究了FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的作用 | 首次系统评估了FAM216A和CCDC166这两个睾丸富集基因在雄性生育中的功能,并发现其敲除不影响小鼠生育力 | 研究仅在小鼠模型中进行,未直接在牛等牲畜中验证,且可能存在物种特异性差异 | 探究FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的功能 | 基因敲除小鼠模型 | 生殖生物学 | 生育障碍 | 系统发育分析、序列比对、单细胞转录组数据分析、RT-PCR、基因敲除、组织化学染色、生育力分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因序列数据、转录组数据、组织切片图像 | 未明确说明具体样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-03-28 |
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec0986
PMID:41880492
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了在自身免疫性关节炎中,GM-CSF如何驱动炎症巨噬细胞的功能多样化,从而加剧关节炎症和疼痛 | 首次阐明GM-CSF在自身免疫性关节炎中促进Ly6C单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群,并识别出两个GM-CSF依赖的致病性巨噬细胞亚群,包括独特的EpCAM巨噬细胞亚群,后者表达与关节炎疼痛相关的促痛介质 | 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型,可能不完全反映所有类型的关节炎或人类疾病情况,且单细胞RNA测序数据可能受样本大小和技术限制影响 | 探究自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制,特别是GM-CSF在其中的作用 | 关节浸润的Ly6C单核细胞和GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 | 单细胞生物学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-03-28 |
Machine learning-directed massively parallel programmable nucleic acid amplification
2026-Mar-27, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aec9175
PMID:41880514
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研究论文 | 本研究开发了一种基于热力学的可编程核酸扩增技术,通过机器学习优化调控扩增效率,应用于DNA数据存储和临床RNA变异分析 | 提出通过引物标签补偿策略将序列特异性与杂交能量调控解耦,实现连续精确的扩增效率调控;构建机器学习模型显著提升预测精度;在DNA数据存储中实现近一个数量级的信息预览密度提升和稳健的文件隐写 | 未明确说明技术在实际临床样本中的大规模验证情况;单细胞测序和空间转录组学的扩展应用仅为预期方向 | 开发可动态调控扩增效率的分子诊断和DNA数据存储技术 | 核酸扩增过程、DNA数据存储系统、宫颈癌RNA变异 | 机器学习 | 宫颈癌 | 可编程核酸扩增技术、机器学习建模 | 机器学习模型 | 实验数据、测序数据 | 基于2483个实验数据构建模型,临床验证中进行了模拟测序深度测试 | NA | NA | NA | NA |
| 96 | 2026-03-28 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化分析,基于两个大型欧洲前瞻性队列数据,探讨了原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统性地使用孟德尔随机化方法验证了胃癌与特定继发性癌症(如食管癌和直肠癌)之间的因果关联,并进一步通过单细胞测序分析识别了PLK1癌症干细胞作为潜在驱动因素 | 研究主要基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他种族或地区人群,且孟德尔随机化分析依赖于遗传工具变量的假设 | 评估原发性肿瘤与继发性原发性恶性肿瘤之间的因果关系,以优化癌症幸存者的精准随访策略 | 涵盖八大人类器官系统的癌症类型,包括胃癌、食管癌、直肠癌等 | 遗传流行病学 | 多种癌症 | 孟德尔随机化分析,单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据,流行病学数据 | 两个大型欧洲前瞻性队列:UK Biobank(31种癌症类型)和FinnGen(28种癌症类型) | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 98 | 2026-03-28 |
Scalable cell-specific coexpression networks for granular regulatory pattern discovery with NeighbourNet
2026-Mar-26, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281171.125
PMID:41786602
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研究论文 | 本文提出了一种名为NeighbourNet (NNet)的新方法,用于从单细胞RNA测序数据构建细胞特异性共表达网络,以发现精细的调控模式 | NNet方法不依赖预定义的细胞簇或状态,而是通过主成分分析和K近邻局部回归为每个细胞构建特异性共表达网络,从而捕捉细胞间动态、细微的调控变异 | 方法性能可能受单细胞RNA测序数据固有噪声和稀疏性的影响,且K近邻回归在小样本情况下存在挑战 | 开发一种可扩展的计算方法,用于从单细胞分辨率数据中推断基因调控网络,以更精细地理解基因表达调控机制 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达谱 | 生物信息学,单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 主成分分析 (PCA), K近邻回归 (KNN regression) | 基因表达数据 (单细胞RNA测序数据) | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-03-28 |
Identifying prognosis-associated spatial patterns by integrating bulk RNA-seq and spatial transcriptomic data
2026-Mar-26, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3677899
PMID:41886327
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研究论文 | 本研究提出了一种名为stSurvTrans的深度迁移学习框架,用于识别与预后相关的空间模式,通过整合bulk RNA-seq和空间转录组数据 | 利用条件变分自编码器(CVAE)整合bulk RNA-seq和空间转录组数据,并采用Weibull模块将临床生存信息从bulk样本迁移到空间数据中 | NA | 将空间特征与生存信息关联起来,以识别与预后相关的空间模式 | 肝细胞癌(HCC)的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | 条件变分自编码器(CVAE), Weibull模块 | bulk RNA-seq数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-03-28 |
Smad7 Downregulation Promotes Ferroptosis in Pulmonary Arterial Hypertension via the TGF-β1-Smad2/3 Pathway
2026-Mar-26, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002832
PMID:41886369
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研究论文 | 本研究探讨了Smad7下调通过TGF-β1-Smad2/3通路促进肺动脉高压中铁死亡的作用机制 | 整合单细胞转录组测序、蛋白质组学和孟德尔随机化分析,首次揭示SMAD7作为PAH中铁死亡的负调控因子 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,人体样本验证不足 | 探究铁死亡在肺动脉高压中的致病机制及其对肺血管细胞景观的影响 | 肺动脉内皮细胞、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、MCT诱导的PAH大鼠模型、缺氧诱导的PAEC模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序、蛋白质组学、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据 | MCT诱导的PAH大鼠模型和缺氧诱导的PAEC模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |