单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 961 - 980 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
961 2026-03-03
Evolutionary convergence and divergence of hippocampal cytoarchitecture between rodents and primates revealed by single-cell spatial transcriptomics
2026-Mar, National science review IF:16.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞空间转录组学分析,揭示了啮齿动物与灵长类海马体细胞结构的进化趋同与差异 首次利用单细胞空间转录组学技术,跨物种比较了猕猴、狨猴和小鼠海马体的转录组图谱,发现了灵长类特异性和层状特异性的谷氨酸能细胞类型,以及GABA能细胞的进化富集 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本物种数量较少,可能未涵盖所有相关进化分支 探究海马体细胞类型和空间分布的跨物种进化模式,为理解海马体功能演化提供分子和细胞基础 猕猴、狨猴和小鼠的海马体组织 数字病理学 NA 单细胞空间转录组学分析, 单核RNA测序 NA 空间转录组数据, RNA-seq数据 多个物种(猕猴、狨猴、小鼠)的海马体样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞空间转录组学, 单核RNA-seq NA NA
962 2026-03-03
Single-cell advances in the investigation of the pathogenesis and treatment of brain metastasis
2026-Mar, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
综述 本文综述了近年来应用单细胞RNA测序技术研究脑转移瘤的进展,重点关注肿瘤异质性、肿瘤微环境以及治疗反应 系统总结了单细胞RNA-seq技术在脑转移瘤研究中的应用,整合了多个研究对肿瘤细胞转录特征、免疫细胞变化及微环境组成的发现 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有研究的整合与分析 总结单细胞技术如何增进对脑转移瘤发病机制的理解,并探讨其对未来治疗策略的启示 脑转移瘤及其微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、血管细胞和基质细胞 数字病理学 脑转移瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
963 2026-03-03
Pitfalls in analysis and interpretation of single-cell RNA-seq data in cancer
2026-Mar, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
综述 本文讨论了癌症研究中单细胞和单核RNA测序数据分析的常见陷阱及其克服方法 系统性地识别并总结了癌症sc/snRNA-seq分析中的常见错误,包括统计分析、染色体畸变推断、轨迹分析和基于特征的批量RNA-seq数据分析中的潜在问题 作为一篇综述,未提供新的实验数据或具体案例分析,主要基于现有文献和经验进行讨论 旨在帮助研究人员避免单细胞RNA测序数据分析中的常见错误,提高分析质量和结果解释的可靠性 癌症研究中的单细胞和单核RNA测序数据 生物信息学 癌症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq) NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq NA NA
964 2026-03-03
Redefining the immune microenvironment of gliomas in the era of single-cell genomics
2026-Mar, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
综述 本文回顾了单细胞基因组学时代下对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的重新定义,并探讨了其对开发有效免疫疗法的影响 利用单细胞RNA测序等单细胞技术,系统性地重新定义了胶质瘤的免疫微环境,强调了非恶性细胞及其与癌细胞相互作用的重要性 本文为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有研究进行总结和展望 总结单细胞基因组学对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的研究进展,并探索其对免疫疗法开发的启示 胶质瘤的肿瘤免疫微环境(TIME),包括恶性细胞和非恶性细胞(如免疫细胞) 数字病理学 胶质瘤 单细胞RNA测序 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
965 2026-03-03
Current landscape of single-cell genomics in meningioma
2026-Mar, Neuro-oncology advances IF:3.7Q2
综述 本文综述了单细胞基因组学在脑膜瘤研究中的当前应用与未来机遇 整合了单细胞测序技术、空间分辨数据和功能基因组学方法,以单细胞分辨率全面研究脑膜瘤的转录组和表观基因组,揭示肿瘤内和肿瘤间的异质性 NA 探讨单细胞组学在脑膜瘤研究中的应用现状与未来发展方向 脑膜瘤 数字病理学 脑膜瘤 单细胞测序 NA 转录组数据、表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
966 2026-03-02
Cytoskeletal-related genes function as checkpoints for the maintenance of VSMC contractile phenotype and prevent pathological remodeling in arterial diseases
2026-Mar, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究构建了动脉疾病中血管平滑肌细胞表型转换的跨物种整合模型,识别了细胞骨架相关基因作为维持收缩表型的关键检查点,并验证其在病理重塑中的作用 通过单细胞RNA-seq数据分析,首次识别Fblim1、Tns1和Synpo2等细胞骨架相关基因作为VSMC表型转换的检查点,揭示了它们在防止病理重塑中的关键作用 研究主要基于公共数据集和动物模型,人类样本验证有限,且机制细节需进一步探索 构建VSMC表型转换的整合模型,识别调控基因并验证其在动脉疾病病理重塑中的功能 血管平滑肌细胞(VSMC)、动脉疾病(包括动脉粥样硬化和主动脉瘤) 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA-seq NA RNA-seq数据 公共单细胞RNA-seq数据集、实验动物动脉瘤样本、PDGF-BB处理的VSMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
967 2026-03-02
Spatial Single-cell Transcriptome Atlas of Mouse Thymus Reveals the T Lymphocyte Dynamics During Development
2026-Mar-01, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究通过空间单细胞转录组图谱揭示了小鼠胸腺在发育过程中的T淋巴细胞动态变化 首次构建了小鼠胸腺在四个发育阶段的空间单细胞转录组图谱,揭示了胸腺细胞组成和转录谱的动态重塑,特别是DP-T细胞亚群的空间分布和DC-DP-2相互作用的MHC-II通路富集 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本;样本量相对有限(四个时间点);空间分析分辨率可能受技术限制 解析胸腺微环境中淋巴细胞发育的分子动力学和空间组织 小鼠胸腺组织在3、9、15和33周四个发育阶段的免疫细胞 数字病理学 自身免疫疾病 单细胞RNA测序 空间轨迹分析 单细胞转录组数据 四个发育阶段(3、9、15、33周)的小鼠胸腺样本 NA 空间转录组学 NA NA
968 2026-03-01
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2026-Mar, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞纤维内吞以缓解肝纤维化的新机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 首次发现CLU通过LRP2受体特异性作用于肝脏间皮细胞(而非肝星状细胞),诱导其增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化,并设计了具有治疗潜力的模拟肽CLUtide 研究主要在动物模型中进行,CLUtide在人体中的安全性和有效性仍需进一步验证 探究CLU在肝纤维化中的作用机制及治疗潜力 肝纤维化患者及小鼠模型、CLU敲除小鼠、间皮细胞特异性LRP2敲除小鼠 NA 肝纤维化 单细胞RNA测序、免疫荧光、基因敲除、肽段设计 NA 基因表达数据、图像数据 患者及小鼠样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
969 2026-03-01
Endothelin-1/endothelin B receptor signalling mediates Prx1+ skeletal stem cells senescence: A driver of osteoporotic bone loss
2026-Mar, Journal of orthopaedic translation IF:5.9Q1
研究论文 本研究揭示了内皮素-1/内皮素B受体信号轴通过诱导Prx1+骨骼干细胞衰老,从而驱动骨质疏松性骨丢失的机制 首次将血管内皮素-1信号与骨骼干细胞衰老及骨质疏松联系起来,并确定了ETBR是关键的介导受体,为骨质疏松治疗提供了新的靶点 研究主要基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性仍需进一步验证;长期ETBR抑制的安全性和副作用有待评估 探究内皮素-1信号是否驱动骨骼干细胞衰老及其在骨质疏松发生中的作用机制 骨骼干细胞、间充质干细胞、衰老和卵巢切除小鼠模型、转基因小鼠模型 干细胞生物学与骨代谢研究 骨质疏松 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲除、药理学抑制 小鼠疾病模型(衰老、OVX)、转基因小鼠模型(TET-1, Prx1-Cre;ETBR fl/fl) 单细胞RNA测序数据、转录组数据、表型数据 涉及人类单细胞RNA测序数据集及多种小鼠模型,具体样本数量未在摘要中明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
970 2026-03-01
Dual Role of PSMB9 Linking Immune Activation and Tumor Adaptation in Hepatocellular Carcinoma With Therapeutic and Prognostic Implications
2026-Mar, Anticancer research IF:1.6Q4
研究论文 本研究探讨了PSMB9在肝细胞癌(HCC)中连接免疫激活与肿瘤适应的双重作用,及其治疗和预后意义 识别PSMB9作为HCC中免疫热表型的关键生物标志物,揭示其既促进免疫激活又预测不良生存的矛盾表型 未明确PSMB9促进肿瘤适应的具体分子机制,且研究基于回顾性队列,需前瞻性验证 探索HCC中免疫激活的分子决定因素及其预后和治疗意义 肝细胞癌(HCC)患者样本和HepG2细胞系 生物信息学与癌症研究 肝细胞癌 单样本基因集富集分析(ssGSEA)、差异表达基因筛选、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、体外功能实验 NA 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 TCGA-LIHC队列、HCC TACE治疗队列、多个免疫治疗和靶向治疗队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
971 2026-02-28
Hair follicle stem cell fate supports distinct clinical endotypes in hidradenitis suppurativa
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了毛囊干细胞在化脓性汗腺炎早期发病机制中的分化轨迹,并基于临床表型定义了三种疾病内型 首次通过单细胞RNA测序识别了毛囊干细胞在HS中的两种分化轨迹,并整合临床数据定义了三种疾病内型,为分层治疗提供了新见解 样本量相对有限(49例HS患者),且仅分析了病灶周围皮肤,未涵盖疾病所有阶段或全身性因素 探究毛囊干细胞命运在化脓性汗腺炎早期发病机制中的作用 HS患者和健康捐赠者的毛囊细胞群 单细胞组学 化脓性汗腺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 49例HS患者的病灶周围皮肤样本及健康捐赠者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
972 2026-02-28
Inflammatory niches as spatial drivers of disease mechanisms and targets for personalized treatment
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
综述 本文探讨了空间组织的炎症微环境作为疾病机制的空间驱动因素及其在个性化治疗中的靶点作用 整合单细胞测序与空间分析技术,揭示疾病特异性机制如银屑病表皮上层IL-36驱动的正反馈放大、化脓性汗腺炎的复杂炎症结构以及扁平苔藓中T细胞与基底角质形成细胞的相互作用 NA 研究炎症微环境在疾病机制中的作用,并探索其作为个性化治疗靶点的潜力 炎症微环境中的免疫细胞和非免疫细胞 数字病理学 银屑病、化脓性汗腺炎、扁平苔藓 单细胞测序、空间分析 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
973 2026-02-28
Solute carrier inhibitors in kidney disease therapy: mechanisms and clinical implications
2026-Mar, Diabetes research and clinical practice IF:6.1Q1
综述 本文系统综述了靶向五种溶质载体(SLC)的抑制剂在肾脏疾病治疗中的药理机制、生理病理作用及临床应用前景 聚焦于单细胞测序技术确认的、在肾小管上皮细胞中高表达的五种SLC作为已验证的治疗靶点,系统性地综述了其选择性抑制剂的开发与应用 NA 探讨溶质载体(SLC)抑制剂在肾脏疾病治疗中的作用机制与临床应用价值 五种已验证的SLC治疗靶点(SLC5A2, SLC7A11, SLC12A3, SLC22A12, SLC47A1)及其抑制剂 NA 慢性肾病、糖尿病肾病、急性肾损伤 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
974 2026-02-28
The exposomal imprint on rosacea: More than skin deep
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
综述 本文综述了暴露组(包括遗传、环境、生活方式等因素)在玫瑰痤疮发病机制中的作用,并探讨了其与多种共病的关系及未来管理策略 整合了暴露组框架来理解玫瑰痤疮,强调了从反应性治疗向基于暴露组信息的主动干预的范式转变,并提出了包含个性化护肤、微生物组靶向策略等的整体精准医学框架 本文为综述文章,主要总结现有研究,未提出新的原始数据或实验验证 探讨暴露组(遗传、环境、生活方式等因素的集合)对玫瑰痤疮发病机制的影响,并倡导基于暴露组信息的整体性、精准化管理策略 玫瑰痤疮(一种慢性炎症性皮肤病)及其与遗传、免疫、微生物组、环境因素和多种共病(如自身免疫、代谢、胃肠道疾病)的关联 NA 玫瑰痤疮 单细胞转录组学,孟德尔随机化研究 NA NA NA NA NA NA NA
975 2026-02-26
Spatial transcriptomics reveals the molecular signatures of prodromal and advanced α-synucleinopathy
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究应用空间转录组学技术,揭示了α-突触核蛋白病在啮齿动物模型和帕金森病患者中的分子特征,包括能量代谢通路的变化和特定信号标记的识别 首次结合空间转录组学与帕金森病患者微阵列数据,系统揭示了α-突触核蛋白病从前期到晚期阶段的分子动态变化,并识别出与病理进展一致的生物标记 研究基于转基因小鼠模型和有限的帕金森病患者队列,可能无法完全反映人类疾病的复杂性,且空间转录组学技术分辨率有限 探究α-突触核蛋白病在帕金森病中的分子机制和进展标志,为生物标记发现和靶向治疗提供依据 转基因M83小鼠模型的脑组织切片以及四个独立帕金森病患者队列的微阵列数据集 空间转录组学 帕金森病 空间转录组学,微阵列分析 NA 空间转录组数据,微阵列数据 转基因M83小鼠模型脑切片及四个独立帕金森病患者队列数据集 NA 空间转录组学 NA NA
976 2026-02-26
Neural network-assisted RNA velocity imputation for empowering transcript dynamics-based analyses
2026-Mar-20, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文提出了一种名为NARVI的深度学习框架,用于通过神经网络辅助RNA速度插补,以解决现有RNA速度估计工具因技术限制或模型假设而无法计算大量基因速度的问题 利用深度学习学习可计算基因的表达模式与速度之间的关系,从而准确估计原本无法计算的基因速度,扩展了基于转录动力学的下游分析范围 未在摘要中明确提及具体限制 解决RNA速度估计工具在单细胞转录组数据分析中因技术限制或模型假设导致的基因速度计算缺失问题,以增强基于转录动力学的下游分析能力 单细胞转录组数据集中的基因速度估计 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习框架(神经网络) 单细胞转录组数据 多个单细胞转录组数据集(未指定具体样本数量) NA 单细胞RNA-seq NA NA
977 2026-02-26
High-throughput proteomics uncovers molecular clusters and biomarkers of severity in bullous pemphigoid
2026-Mar, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 本研究通过高通量蛋白质组学分析,揭示了天疱疮(BP)中局部和全身炎症反应的分子特征,并识别了与疾病严重程度相关的生物标志物 首次使用Olink Target 96炎症面板全面分析BP的皮肤和血清蛋白质组,识别出CCL13等关键炎症蛋白,并基于蛋白质组数据定义了两种分子亚型,揭示了BP的生物学异质性 样本量相对较小(29例皮肤活检和27例匹配血清),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性研究验证 全面分析BP的局部和系统性炎症反应,探索其与疾病严重程度、临床特征和治疗结果的关联 天疱疮患者的皮肤活检和血清样本,以及健康对照样本 蛋白质组学 天疱疮 Olink Target 96炎症面板蛋白质组学分析,单细胞RNA测序 主成分分析、无监督聚类、差异表达分析、基因集富集分析、k-means聚类 蛋白质组数据、转录组数据 29例BP皮肤活检、27例匹配血清样本、14例健康对照 Olink 高通量蛋白质组学,单细胞RNA测序 Olink Target 96 Inflammation panel Olink Target 96炎症面板用于蛋白质组分析,公开可用的单细胞RNA测序数据集用于外部验证
978 2026-02-26
Molecular analysis of tumor recurrence using established cancer stem cell-line and drug discovery
2026-Mar, International journal of clinical oncology IF:2.4Q3
研究论文 本文通过开发LGR5特异性单克隆抗体和建立具有干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123,研究了癌症干细胞在肿瘤复发中的作用,并发现RNA聚合酶I抑制剂BMH-21能有效抑制复发 开发了LGR5特异性单克隆抗体和高灵敏度免疫荧光方法,建立了维持干细胞特性的结直肠癌细胞系PLR123及体外复发模型,并通过单细胞RNA测序和小分子筛选发现BMH-21作为新型抑制剂 未明确说明样本量或临床验证的局限性,研究主要基于细胞系和模型系统 阐明癌症干细胞在结直肠癌复发中的作用机制,并开发预防肿瘤复发的新疗法 结直肠癌干细胞、LGR5标记物、PLR123细胞系、肿瘤复发模型 癌症生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、免疫荧光、小分子筛选 体外复发模型 基因表达数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
979 2026-02-26
Correction to "A comparison of integration methods for single-cell RNA sequencing data and ATAC sequencing data"
2026-03, Quantitative biology (Beijing, China)
correction 本文是对先前发表的关于单细胞RNA测序数据与ATAC测序数据整合方法比较文章的更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
980 2026-02-25
Disulfidptosis in osteoarthritis: Role of SLC2A3 downregulation and potential therapeutic implications
2026-Mar, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 本研究分析了骨关节炎中二硫键死亡相关基因的表达,识别了潜在生物标志物和治疗先导化合物 首次在骨关节炎中系统研究二硫键死亡相关基因,并利用机器学习模型和单细胞分析识别关键基因SLC2A3,通过计算预测和分子对接发现talaroflavone作为潜在治疗化合物 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,需要进一步体内外实验确认SLC2A3的功能机制和talaroflavone的治疗效果 探究二硫键死亡在骨关节炎发展中的作用,识别相关生物标志物和潜在治疗靶点 骨关节炎组织样本、软骨细胞亚型 生物信息学 骨关节炎 RNA-seq, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blotting, 免疫组织化学 机器学习模型, GraphDTA 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的六个骨关节炎相关数据集 NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
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