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当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 921 - 940 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
921 2026-03-09
SOX9 protein in goblet cells as a critical mediator and potential therapeutic target in Barrett's esophagus: An integrated bioinformatics analysis
2026-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,发现SOX9蛋白在杯状细胞中作为巴雷特食管的关键介质和潜在治疗靶点 首次通过多组学分析结合单细胞RNA测序,在单细胞分辨率下验证SOX9在巴雷特食管杯状细胞中的表达及其与疾病进展的相关性 研究依赖于现有数据集,样本量可能有限,且分子对接结果需实验验证 探索巴雷特食管的分子标志物和潜在治疗靶点,以改善早期诊断和靶向干预策略 巴雷特食管患者组织样本,包括上皮和基质亚型 生物信息学 食管腺癌前病变(巴雷特食管) bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, PPI网络分析, LASSO回归, CIBERSORT免疫分析, 分子对接 NA RNA-seq数据,单细胞基因表达数据 四个bulk RNA-seq数据集和两个巴雷特食管患者队列的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
922 2026-03-09
Cell-Type-Specific and Variety-Specific Responses to Salt Stress in Wheat Root Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究首次利用单细胞转录组学技术,揭示了小麦根系在盐胁迫下细胞类型特异性和品种特异性的响应机制 首次构建了盐胁迫下小麦根尖的单细胞转录组图谱,鉴定了17种细胞类型,并发现了根毛细胞与盐胁迫的强关联性及品种特异性响应 研究聚焦于根尖区域,未涵盖整个根系;样本来自特定生长阶段,可能无法完全反映不同发育时期的响应 探究小麦根系在盐胁迫下的细胞类型特异性分子机制及耐盐品种的适应性基础 盐敏感(CS)和耐盐(DK)小麦品种的根尖细胞 单细胞转录组学 非疾病研究(植物胁迫生理) 单细胞核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 188,270个高质量根细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
923 2026-03-09
Spatial transcriptomic analysis of foveolar-type gastric adenoma with raspberry-like appearance
2026-Mar, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析,揭示了具有树莓样外观的胃小凹型腺瘤的独特分子特征,包括异常的粘蛋白表达谱和VEGF驱动的血管生成机制 首次将空间转录组学技术应用于FGA-RA这一罕见亚型,揭示了其独特的MUC17与MUC5AC共表达模式,并阐明了KLF4突变如何通过影响上皮分化和血管生成通路共同塑造其树莓样外观 研究仅基于一个代表性病例进行空间转录组学分析,样本量有限;免疫组化验证仅使用了6个活检样本 阐明FGA-RA上皮表型和浅表毛细血管增殖特征的分子基础 具有树莓样外观的胃小凹型腺瘤(FGA-RA)组织 数字病理学 胃癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织图像 1例代表性病例用于空间转录组分析,6例活检样本用于免疫组化验证 10x Genomics 空间转录组学 Visium Visium空间转录组学平台,用于分析福尔马林固定石蜡包埋组织
924 2026-03-09
Castl: robust identification of spatially variable genes in spatial transcriptomics via an ensemble-based framework
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一个名为Castl的集成框架,用于在空间转录组学中稳健识别空间可变基因,通过整合多种检测方法并设计统计聚合模块来减少方法特异性偏差 Castl是一个基于集成的框架,通过统计设计的聚合模块整合多种检测方法,无需预定义核函数或空间邻域图等算法假设,从而在异质数据集中提高敏感性并控制假发现率 NA 开发一个稳健的框架来识别空间转录组学中的空间可变基因,以阐明组织结构和空间表达模式 空间转录组学数据中的空间可变基因 空间转录组学 NA 空间转录组学 集成框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
925 2026-03-07
Unveiling the Roles of PRDX6 and SLC6A9 in Intracerebral Hemorrhage-Associated White Matter Lesions
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,揭示了PRDX6和SLC6A9在脑出血相关白质病变中的潜在作用 首次将两性状孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,系统探索脑出血后白质病变的遗传贡献者,并识别出PRDX6和SLC6A9的关键作用 研究主要基于生物信息学分析和动物模型数据,尚未在临床样本中进行实验验证,且分子机制的具体作用通路仍需进一步阐明 探究脑出血诱导的白质病变的分子机制,识别潜在的遗传风险基因 脑出血相关的白质病变,重点关注PRDX6和SLC6A9基因 生物信息学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,表达数量性状位点分析,功能富集分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及正常和脑出血影响的小鼠脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
926 2026-03-07
Mosaic human cortical organoids model mTOR-related focal cortical dysplasia through DEPDC5 deletion
2026-Mar-06, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用患者来源的人类皮质类器官建立了DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,模拟了mTOR相关局灶性皮质发育不良的病理特征 首次在人类皮质类器官中建立DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,系统揭示了该基因缺陷如何通过影响神经元分化、信号通路和细胞代谢导致癫痫病理 研究基于体外类器官模型,与真实脑组织环境存在差异;单细胞测序仅涵盖三个发育阶段 探究DEPDC5基因缺陷导致局灶性皮质发育不良II型的分子机制 患者来源的人类皮质类器官 神经科学 癫痫 单细胞转录组测序 人类皮质类器官模型 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
927 2026-03-07
Type I interferon-induced CD169+ macrophages play a protective role in periodontitis
2026-Mar-06, Journal of periodontology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了I型干扰素诱导的CD169+巨噬细胞在牙周炎中的保护作用及其分化机制 首次在牙周炎背景下系统描述了CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其通过产生CCL18和IL10维持免疫稳态的保护性功能,并明确了I型干扰素-IRF7轴在其分化中的关键作用 研究样本量相对有限(健康对照8例,牙周炎患者10例),且主要基于观察性数据和动物模型验证,其治疗转化潜力仍需进一步临床研究证实 探究牙周组织中CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其对牙周炎的影响 人牙周组织样本(健康对照与牙周炎患者)及小鼠模型 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,免疫荧光染色,流式细胞术,SCENIC分析,体外实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据 18例人牙周组织样本(健康对照8例,牙周炎患者10例)及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
928 2026-03-07
SpatioFreq: A Deep Learning Framework for Decoding Cellular and Tissue Landscapes Across Organisms Using Spatial Transcriptomics
2026-Mar-06, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文提出了一个名为SpatioFreq的深度学习框架,用于通过空间转录组学解码生物体中的细胞和组织景观 引入了一种创新方法,利用拉普拉斯矩阵提取频域特征以检测空间数据中的细微结构和动态模式,并结合图自监督对比学习优化空间数据中的长程依赖关系,通过双任务设计实现任务间信息共享 未明确提及 提高空间转录组学分析的准确性和效率,揭示组织内细胞的空间组织结构 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 深度学习框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
929 2026-03-07
Dual-Targeting BCMA-CD19 CAR-T Cell Therapy in Systemic Lupus Erythematosus: Single-Cell and Immune Repertoire Analysis Reveals Mechanisms of Immune Reconstitution
2026-Mar-05, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和免疫受体测序,探讨了BCMA-CD19双靶向CAR-T疗法在系统性红斑狼疮患者中诱导外周免疫重建的机制 首次在SLE患者中应用双靶向CAR-T疗法,并通过单细胞分析揭示了其对浆细胞谱系的深度耗竭和免疫分子特征的逆转 样本量较小(仅5名患者),且为探索性研究,需要更大规模的直接比较研究来确认临床优势 研究BCMA-CD19双靶向CAR-T疗法在系统性红斑狼疮患者中的外周免疫重建机制 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞 单细胞测序分析 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序,BCR/TCR测序 NA 单细胞转录组数据,免疫受体序列数据 5名SLE患者(双靶向治疗组),整合公共数据集共15名受试者,分析176,182个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
930 2026-03-07
stSCI: A multi-task learning framework for integrative analysis of single-cell and spatial transcriptomics data
2026-Mar-02, Innovation (Cambridge (Mass.))
研究论文 本文提出了一种名为stSCI的多任务学习框架,用于整合分析单细胞和空间转录组数据 stSCI通过融合模块和三个专门优化任务,生成生物学保留的联合潜在表示,支持五种关键分析,并在13个不同ST数据集上优于27种现有方法 NA 解决空间转录组数据分辨率低和RNA捕获效率不足的问题,实现单细胞与空间数据的整合分析 单细胞和空间转录组数据 计算生物学 感染性疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 多任务学习框架 基因表达数据 13个不同的空间转录组数据集 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
931 2026-03-07
Metabolic quiescence of naive-like memory T cells precedes and maintains antigen-specific T cell memory
2026-Mar, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本文通过流式细胞术和单细胞RNA测序,研究了黄热病疫苗接种后人类抗原特异性CD8 T细胞的纵向代谢和表型特征 揭示了幼稚样记忆T细胞的代谢静止状态在抗原特异性T细胞记忆形成和维持中的关键作用,并首次在人类中纵向关联代谢活动与细胞命运 研究仅基于黄热病疫苗接种模型,可能不适用于其他感染或疾病情境;样本时间点有限,未覆盖所有免疫阶段 探究人类抗原特异性CD8 T细胞在免疫记忆形成过程中的代谢动态及其与细胞命运的关联 人类黄热病疫苗接种后的抗原特异性CD8 T细胞 免疫学 传染病 流式细胞术, 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 人类疫苗接种后样本,覆盖急性期(第7-28天)和长期(26年后)时间点 NA 单细胞RNA-seq NA NA
932 2026-03-07
Identification of 5-Gene Prognostic Markers and Functional Verification of RRBP1 in 5-Fluorouracil Resistance of Colorectal Cancer by Multi-Omics Analysis and Experimental Verification
2026-Mar, Chemical biology & drug design IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,识别了结直肠癌中5-氟尿嘧啶耐药的关键预后标志物,并揭示了RRBP1在耐药机制中的功能 结合多组学数据构建了5基因预后模型,并通过单细胞RNA测序和体外实验首次验证了RRBP1在调节糖酵解和干细胞特性中驱动5-FU耐药的作用 研究主要基于公共数据集和体外细胞实验,缺乏大规模临床样本验证和体内动物模型实验 识别预测结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药的关键因素并阐明其功能机制 结直肠癌患者数据集和细胞系 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, qRT-PCR, CCK-8检测, 糖酵解代谢分析 回归分析, 预后模型 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 基于GEO(GSE196900, GSE166555)和TCGA-COAD数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
933 2026-03-07
Crosstalk between SPP1+ macrophages and ITGA5+ fibroblasts promotes hepatocellular carcinoma metastasis
2026-Mar-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝细胞癌发展过程中免疫微环境的动态转录组图谱,并发现SPP1+巨噬细胞与ITGA5+成纤维细胞之间的相互作用促进肝癌转移 首次构建了从健康肝脏到肝炎、肝硬化再到肝细胞癌的全阶段免疫微环境动态转录组图谱,并揭示了SPP1-ITGA5相互作用通过诱导MMP2分泌促进肝癌恶性进展的新机制 研究主要基于转录组数据,蛋白质水平和功能验证仍需进一步深入;动物模型可能无法完全模拟人类肝癌的复杂微环境 阐明肝细胞癌发展过程中免疫微环境的动态变化及其在肿瘤转移中的作用机制 肝细胞癌发展过程中的免疫微环境细胞(包括巨噬细胞、B细胞、成纤维细胞等) 单细胞组学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫荧光,共免疫沉淀,细胞共培养,小鼠移植模型 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像,体外实验数据,体内实验数据 涵盖健康肝脏、肝炎、肝硬化和肝细胞癌多个阶段的样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
934 2026-03-07
Molecular Mechanisms of Rotator Cuff Degeneration Identified by Spatial Transcriptomics and Multiplex Immunofluorescence
2026-Mar, Journal of orthopaedic research : official publication of the Orthopaedic Research Society IF:2.1Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学和多重免疫荧光技术,探究了老年肩袖撕裂患者与年龄匹配对照者肩袖组织的基因表达和空间异质性,以揭示关键分子通路 首次结合空间转录组学和多重免疫荧光技术,在肩袖撕裂组织中识别出具有区域特异性表达的修复相关基因(如COMP、CHI3L1、MT1X、FMOD),并揭示了PI3K-AKT和ECM-受体相互作用通路在疾病过程中的核心作用 样本量相对较小(每组10例),且研究主要聚焦于老年患者,可能无法完全代表所有年龄段的肩袖撕裂病理机制 揭示肩袖撕裂的分子机制,识别潜在的病理通路和治疗靶点 老年肩袖撕裂患者和年龄匹配对照者的肩袖肌腱组织 数字病理学 肩袖撕裂 空间转录组学,多重免疫荧光 NA 空间转录组数据,免疫荧光图像 20例(10例肩袖撕裂患者,10例对照) NA 空间转录组学 NA NA
935 2026-03-07
Effect of platelet-rich plasma in refractory vitiligo by promoting the differentiation of dermal melanocyte progenitors via IGFBP-2/RhoA/YAP pathway
2026-Mar-01, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究评估了富血小板血浆联合308纳米准分子光疗法治疗难治性肢端白癜风的临床疗效,并揭示了其通过IGFBP-2/RhoA/YAP信号通路促进真皮黑素细胞祖细胞分化的机制 首次将真皮黑素细胞祖细胞确立为一种新的、不依赖毛囊的黑素细胞来源,并阐明了富血小板血浆通过IGFBP-2/RhoA/YAP信号轴驱动其分化的具体分子机制,为治疗抵抗性白癜风提供了新的治疗策略 本研究为单中心、前瞻性、随机分体临床试验,样本量相对较小(n=30),且主要针对稳定期肢端白癜风患者,结果外推至其他类型白癜风或更大人群需谨慎 评估富血小板血浆联合308纳米准分子光疗法治疗难治性白癜风的疗效并探索其作用机制 稳定期肢端白癜风患者、真皮黑素细胞祖细胞、无毛皮肤类器官模型 NA 白癜风 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质微阵列 NA 临床数据, 转录组数据, 蛋白质数据 30名稳定期肢端白癜风患者(20名分体治疗,10名仅PRP治疗) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
936 2026-01-17
Altered trophoblasts, macrophages, and immunologic microenvironment in the placenta: Implications of poorly controlled type 2 diabetes mellitus revealed by single-cell transcriptomics
2026-Mar-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
937 2026-03-06
SCGB1A1 suppresses prostate cancer proliferation and metastasis by modulating the MAPK signaling pathway
2026-Mar-04, International urology and nephrology IF:1.8Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现SCGB1A1在抑制前列腺癌细胞增殖和转移中的作用,并揭示其通过调控MAPK信号通路发挥肿瘤抑制功能 首次通过单细胞转录组学分析发现SCGB1A1⁺上皮细胞在前列腺癌组织中显著减少,并揭示SCGB1A1通过负调控MAPK信号通路抑制肿瘤细胞增殖、迁移和上皮-间质转化 研究主要基于体外细胞实验和公共数据库分析,缺乏大规模临床样本验证和体内动物模型实验 探究SCGB1A1在前列腺癌发生发展中的分子机制及其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 前列腺癌细胞系、前列腺组织样本、公共数据库中的前列腺癌单细胞RNA测序数据 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、细胞实验数据 未明确具体样本数量,包括前列腺癌细胞系和组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
938 2026-03-06
Endocrine Resistance Score Based on Three Key Genes Predicts Prognosis and Reveals Potential Therapeutic Targets for ER+HER2- Breast Cancer
2026-Mar, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究基于CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个关键基因构建了内分泌抵抗评分(ERS),用于预测ER+HER2-乳腺癌患者的预后并揭示潜在治疗靶点 首次通过长期雌激素剥夺构建内分泌抵抗细胞系,并基于转录组分析鉴定出三个关键基因(CLEC3A、PCDH10、ST3GAL1)构建预后评分模型,同时揭示了CLEC3A通过上调PI3K-AKT通路促进内分泌抵抗的机制 研究主要基于细胞系和回顾性数据分析,需要进一步的前瞻性临床研究验证 探索ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗的分子机制,开发预后预测模型并寻找潜在治疗靶点 ER+HER2-乳腺癌细胞系、接受内分泌治疗的ER+HER2-乳腺癌患者组织样本 数字病理学 乳腺癌 转录组分析、单细胞RNA测序、Cox回归分析 预后评分模型(ERS)、列线图模型 基因表达数据、临床预后数据 未明确具体样本数量,涉及内分泌抵抗细胞系和患者组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
939 2026-03-06
Western Diet Inhibits FUT7-Mediated Treg Intestinal Homing to Disrupt the Homeostasis of Intestinal Epithelial Cells in Crohn's Disease
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了西方饮食通过抑制FUT7介导的调节性T细胞肠道归巢,从而破坏克罗恩病中肠道上皮细胞稳态的机制 首次阐明了西方饮食通过下调Tregs中FUT7表达,削弱Tregs与肠道上皮细胞之间的信号串扰,进而破坏肠道屏障的具体分子通路 研究主要基于小鼠模型,人类患者数据仅涉及FUT7表达水平,需进一步验证该机制在人类中的普适性 探究西方饮食如何破坏克罗恩病中肠道上皮细胞的稳态 调节性T细胞、肠道上皮细胞、克罗恩病小鼠模型及患者样本 单细胞组学与空间转录组学 克罗恩病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间基因表达数据 小鼠模型及活动期克罗恩病患者样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
940 2026-03-06
Vitamin D Regulates Olfactory Function via Dual Transcriptional and mTOR-Dependent Translational Control of Synaptic Proteins
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了维生素D通过VDR受体,在嗅觉系统中通过转录和mTOR依赖的翻译机制调控突触蛋白表达,从而影响嗅觉功能 首次发现维生素D通过VDR-mTOR翻译调控轴与经典转录调控并行作用,将营养状态与突触功能及感觉处理联系起来 研究主要基于小鼠模型,人类中的具体机制仍需进一步验证 探究维生素D缺乏与神经功能障碍的细胞类型特异性机制 小鼠(从断奶到成年期控制维生素D水平) 神经科学 神经功能障碍 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq) NA 基因表达数据、空间转录组数据、染色质结合数据 NA NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
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