单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1052 篇文献,本页显示第 881 - 900 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
881 2026-03-11
Single-cell RNA sequencing reveals population-based shifts in gene expression heterogeneity in an unstable, clonally derived CHO cell line
2026-Mar-09, Biotechnology progress IF:2.5Q3
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了稳定与不稳定CHO细胞系在基因表达异质性方面的变化,揭示了克隆群体内异质性对细胞系稳定性的影响 首次在克隆来源的CHO细胞培养中,利用单细胞RNA测序技术,系统评估了基因表达异质性随时间的变化,并关联了细胞系不稳定性与代谢通路活性的改变 研究仅针对特定CHO细胞系和单克隆抗体表达系统,结果可能不适用于其他细胞类型或表达体系,且样本时间点有限 探究CHO细胞系在长期培养过程中基因表达异质性的变化,以理解细胞系不稳定性的生物学机制 稳定和不稳定的CHO细胞系,这些细胞系表达相同的单克隆抗体 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 稳定和不稳定CHO细胞系在早期和晚期时间点的样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
882 2026-03-11
Non-Invasive Assessment of Complete Regression in Endometrial Cancer Patients Undergoing Fertility Preservation Using MRI-Based Radiomics and Immune Heterogeneity
2026-Mar, MedComm IF:10.7Q1
研究论文 本研究开发了一种基于MRI影像组学和免疫异质性的非侵入性工具,用于预测接受生育力保留治疗的子宫内膜癌患者的完全缓解情况 首次将MRI影像组学特征与单细胞RNA测序、批量RNA测序的分子谱分析相结合,构建了预测完全缓解的影像组学-临床列线图,并揭示了高评分组肿瘤微环境的免疫抑制和代谢活跃特征 研究为回顾性设计,样本量相对有限(146例患者),需要前瞻性多中心研究进一步验证 开发非侵入性工具以预测子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌患者接受生育力保留治疗后的完全缓解结局 被诊断为子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌并接受生育力保留治疗的年轻女性患者 数字病理学 子宫内膜癌 MRI影像组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习 机器学习模型(具体模型未明确说明),列线图 医学影像(MRI),基因表达数据 146例患者 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
883 2026-03-11
Generalized SIMEX Method: Polynomial Approximation for Extrapolation
2026-Mar, Statistics in medicine IF:1.8Q1
研究论文 本文提出了一种广义的SIMEX方法(GSIMEX),通过使用高阶多项式函数作为外推函数来处理严重的测量误差问题 扩展了传统的SIMEX方法,采用高阶多项式函数来近似未知的非线性外推函数,并集成了子集选择和模型平均策略以提高估计精度 未在摘要中明确说明 解决统计分析中测量误差导致的参数估计偏差问题,特别是在误差严重的情况下 测量误差模型、参数估计方法 机器学习 NA 模拟外推法(SIMEX)、多项式近似、子集选择、模型平均 多项式回归模型 模拟数据、空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
884 2026-03-11
Investigating the Role of MicroRNAs in Mesenchymal Stem Cell Osteogenic Differentiation
2026-Mar, Journal of biochemical and molecular toxicology IF:3.2Q2
综述 本文综述了microRNAs在间充质干细胞成骨分化中的调控作用及其在骨质疏松等骨骼疾病中的临床意义 系统整合了miRNA调控骨重塑的分子机制与临床转化应用,并展望了单细胞RNA测序等新技术在骨再生领域的应用前景 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 阐明miRNA在间充质干细胞成骨分化中的调控网络及其在骨骼疾病诊疗中的应用潜力 间充质干细胞、成骨细胞、microRNAs 分子生物学 骨质疏松 单细胞RNA测序 NA 文献数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
885 2026-03-10
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Macrophage-Granulosa Cell Crosstalk in Regulating Granulosa Cells Function in Sheep
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了绵羊卵巢中巨噬细胞与颗粒细胞之间的相互作用如何调控颗粒细胞功能 首次在绵羊中利用单细胞RNA测序比较高低繁殖力品种的卵巢细胞图谱,并验证了IGFBP2在巨噬细胞-颗粒细胞互作中的关键调控作用 研究仅基于两个绵羊品种,样本量较小;体外共培养实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 探究巨噬细胞与颗粒细胞间的细胞对话及其对颗粒细胞功能的调控机制 绵羊卵巢组织(来自高繁殖力胡羊和低繁殖力蒙古羊) 单细胞组学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两个绵羊品种的卵巢组织(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
886 2026-03-10
Single-Cell Sequencing and Transcriptomic Sequencing Exploration of the Mechanisms Governing Lactylation in Mitochondrial Diseases
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和转录组分析探索了乳酸化修饰在线粒体疾病中的作用机制 首次结合单细胞测序与转录组分析探索乳酸化在线粒体疾病中的角色,并利用机器学习识别出三个核心基因EIF3D、SOD1和RPS26 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR和Western blotting,样本来源和数量可能有限 探索乳酸化修饰与线粒体疾病之间的关联,以揭示其分子病理机制和潜在治疗策略 线粒体疾病患者的骨骼肌样本及相关的免疫细胞 生物信息学 线粒体疾病 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR, Western blotting 机器学习算法 RNA测序数据, 基因表达数据 线粒体疾病患者的骨骼肌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序, 转录组测序 NA NA
887 2026-03-10
A supramolecular peptide reprograms PD-L1+ tumor-associated macrophages to enhance antitumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society IF:10.5Q1
研究论文 本研究开发了一种超分子肽纳米平台MH-PDBP,用于重编程肺腺癌中的PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞,以增强抗肿瘤免疫 通过金亲和自组装构建了超分子肽纳米平台,并利用甘露糖化人血清白蛋白涂层实现选择性靶向肿瘤相关巨噬细胞,促进PD-L1的溶酶体降解并重编程巨噬细胞向M1表型转化 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 旨在克服肺腺癌中免疫抑制性肿瘤免疫微环境,增强免疫检查点抑制剂的疗效 肺腺癌患者样本、小鼠模型及肿瘤相关巨噬细胞 数字病理 肺癌 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 NA 图像、测序数据 来自免疫检查点抑制剂治疗的肺腺癌患者的多重免疫组织化学样本及公共单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
888 2026-03-10
OralDB: A Transcriptomic Resource for Mechanistic Exploration in Oral Diseases
2026-Mar-08, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本文介绍了OralDB,一个专为口腔疾病设计的首个全面、标准化、交互式的多模态转录组资源平台 首次创建了专门针对口腔疾病的综合性、标准化、交互式多模态转录组资源,整合了多种组学数据和疾病类型,解决了数据碎片化和批次效应问题 平台主要基于现有公共数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围,且未提及对新数据集的持续更新机制 开发一个标准化资源平台,以促进口腔疾病的分子机制探索和转化应用研究 口腔疾病,包括口腔癌、牙周炎和口腔黏膜疾病等 数字病理学 口腔癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、RNA-seq、微阵列 NA 转录组数据 2027个组织样本,覆盖73个高质量数据集和20种口腔疾病 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 微阵列 NA NA
889 2026-03-10
KAFSTExp: Kernel Adaptive Filtering With Nyström Approximation for Predicting Spatial Gene Expression From Histology Images
2026-Mar, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 本文提出了一种名为KAFSTExp的框架,利用病理学基础模型UNI提取组织学图像特征,并引入带Nyström近似的核最小均方算法来预测空间基因表达 首次将核自适应滤波与Nyström近似结合应用于从组织学图像预测空间基因表达,显著提高了预测精度并降低了计算成本 模型在有限的空间转录组数据集上的泛化能力可能受数据量限制,且依赖于特定病理学基础模型的特征提取 开发一种从低成本组织学图像预测空间基因表达的高效计算方法 空间转录组数据和组织病理学图像 数字病理学 肿瘤 核自适应滤波,Nyström近似 核最小均方算法,UNI基础模型 图像,基因表达数据 多个空间转录组数据集(具体数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
890 2026-03-10
Endothelial-to-mesenchymal transition primes vascular endothelial cells toward an osteochondrogenic fate
2026-Mar, Vascular pharmacology IF:3.5Q2
研究论文 本研究探讨了内皮-间充质转化(EndMT)如何促使血管内皮细胞向成骨和成软骨命运转化,从而在动脉粥样硬化中促进血管功能障碍和钙化 首次在体外和体内定义了EndMT衍生细胞的寡能性状态,并揭示了其向成骨和成软骨命运的转化,将内皮功能障碍与血管钙化联系起来 研究主要基于HUVECs和鼠类模型,可能无法完全反映人类动脉粥样硬化的复杂性 探究EndMT在动脉粥样硬化中的作用,特别是EndMT衍生细胞的分化潜力和功能特性 人脐静脉内皮细胞(HUVECs)和动脉粥样硬化模型小鼠中的内皮谱系追踪细胞 细胞生物学 动脉粥样硬化 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 未明确样本数量,但涉及HUVECs和鼠类模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
891 2026-03-10
Targeting IL27RA Enhances Immunotherapy in Triple-Negative Breast Cancer by Modulating Tumor Cells and the Tumor Microenvironment
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,发现IL27RA在三阴性乳腺癌恶性上皮细胞中的上调与免疫检查点阻断治疗抵抗相关,并揭示了其通过PI3K/AKT通路抑制MHC-I表达、损害CD8⁺ T细胞功能的机制 首次在单细胞水平上揭示了IL27RA在三阴性乳腺癌免疫治疗抵抗中的关键作用,并发现其通过非经典的PI3K/AKT通路而非传统的IL-27/STAT轴调控MHC-I表达 研究样本量有限,主要基于非病理完全缓解患者的配对样本;机制研究主要在动物模型中进行,需要进一步临床验证 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗抵抗的分子机制,并寻找新的治疗靶点 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本、小鼠原位肿瘤模型 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 非病理完全缓解患者的配对治疗前后肿瘤样本,以及3名病理完全缓解患者的独立队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
892 2026-03-10
CGRP Enhances the Regeneration of Bone Defects by Regulating Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells Through Promoting ANGPTL4 Secretion by Bone Blood Vessels
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示了降钙素基因相关肽(CGRP)通过促进骨血管分泌ANGPTL4来调节骨髓间充质干细胞,从而增强骨缺损再生的机制 首次阐明CGRP通过FAK-AKT-VEGF通路促进血管生成,并通过诱导骨血管内皮细胞分泌ANGPTL4驱动骨髓间充质干细胞成骨分化的双重作用机制,为骨再生提供了新的治疗策略 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,临床转化效果仍需进一步验证;单细胞RNA测序数据的分析深度和样本量可能有限 探究CGRP在骨缺损修复中通过血管介导的成骨作用机制 人类临床数据、小鼠骨缺损模型、人微血管内皮细胞系-1、骨髓间充质干细胞 单细胞组学 骨缺损/骨损伤 单细胞RNA测序,批量转录组测序,实验分析 NA 转录组数据,实验数据 未明确说明具体样本数量,涉及人类临床数据、小鼠模型和细胞系 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
893 2026-03-10
Targeting the CMKLR1-Mediated Signaling Rebalances Immunometabolism State in Middle-Age Testicular Macrophages
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了CMKLR1介导的睾丸巨噬细胞免疫代谢重编程在中年男性生殖功能衰退中的作用,并验证了靶向CMKLR1的治疗潜力 首次在人和小鼠睾丸中发现保守的CD206MHCII巨噬细胞亚群,并阐明其通过CMKLR1信号通路在中年期向糖酵解和促炎状态代谢重编程的机制,同时开发了新型CMKLR1拮抗剂肽P12C5 研究主要聚焦于中年阶段,对更年轻或更年老阶段的免疫代谢变化覆盖不足;新型拮抗剂肽的长期安全性和临床转化潜力需进一步验证 探究脂肪介导的信号如何与局部睾丸免疫相互作用,以及如何通过调节免疫代谢状态改善年龄相关的男性性腺功能减退 人和小鼠的睾丸组织,特别是其中的巨噬细胞亚群 单细胞组学 男性性腺功能减退 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 涉及人类和小鼠的睾丸样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
894 2026-03-09
Somatic cell dysfunction precedes testicular degeneration in a surgical model of cryptorchidism
2026-Mar-07, Pediatric surgery international IF:1.5Q3
研究论文 本研究通过建立成年小鼠手术诱导的单侧隐睾模型,结合bulk RNA测序和单细胞RNA-seq数据分析,揭示了隐睾相关睾丸损伤中体细胞功能障碍的早期特征 首次在成年小鼠手术诱导的隐睾模型中,通过时序转录组分析揭示了体细胞(如Sertoli细胞和管周肌样细胞)功能障碍先于睾丸退化的分子机制 研究基于成年小鼠手术模型,需要在发育性隐睾模型和人类组织中进行验证以确立临床相关性 探究隐睾手术后睾丸持续损伤的分子和细胞机制 成年小鼠睾丸组织 数字病理学 隐睾症 bulk RNA测序,单细胞RNA-seq NA RNA测序数据,组织学图像 小鼠睾丸组织在诱导后第0、3、7、10和14天收集,其中第0、3、7天的样本用于bulk RNA测序 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
895 2026-03-09
Spatial transcriptomics defines the molecular progression, invasion and immune landscape of IPMN and IPMN-derived pancreatic cancer
2026-Mar-06, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,定义了IPMN及其衍生的胰腺癌的分子进展、侵袭和免疫景观 通过空间全转录组分析,揭示了IPMN进展中的阶段特异性分子改变,并识别出两种不同的高级别IPMN亚型,以及从激活到抑制的免疫轨迹 样本量较小(12名患者用于空间分析,43名用于验证),可能限制结果的普遍性 表征IPMN在不同异型增生等级和组织学亚型中的分子和免疫特征,重点关注IPMN相关侵袭性癌 IPMN患者(包括高级别病变和侵袭性癌)的117个上皮、免疫和基质感兴趣区域 数字病理学 胰腺癌 空间全转录组分析 NA 空间转录组数据 12名患者用于空间分析,43名患者用于验证 NA 空间转录组学 Digital Spatial Profiling NA
896 2026-03-09
A male-pheromone-elevated transcription factor ZNF362.1 in female schistosomes determines sexual maturation
2026-Mar-06, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究揭示了雄性信息素BATT通过激活转录因子ZNF362.1调控雌性血吸虫性成熟的分子机制 首次鉴定出BATT响应性转录因子ZNF362.1作为雌性生殖发育的关键调节因子,并发现其通过激活CPEB1调控mRNA多聚腺苷化的下游通路 研究主要基于实验室模型,在自然感染环境中的验证尚需进一步研究 阐明血吸虫雌性性成熟的分子调控机制 血吸虫雌性个体及其生殖器官(卵巢和卵黄腺) 分子生物学 血吸虫病 单细胞转录组学、多组学分析、原位杂交、功能缺失研究 NA 转录组数据、空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
897 2026-03-09
SNUPN variants cause spinocerebellar atrophy by disrupting global splicing in cerebellar Purkinje cells
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过鉴定SNUPN基因致病性变异,揭示了snurportin-1功能缺陷通过破坏小脑浦肯野细胞的全局RNA剪接导致脊髓小脑萎缩的机制 首次将SNUPN基因突变与脊髓小脑萎缩联系起来,并利用基因敲入小鼠模型在体内证实了突变通过破坏U1 snRNP核输入导致浦肯野细胞剪接失调的致病机制 研究主要聚焦于小脑浦肯野细胞,对其他中枢神经系统区域的影响尚未充分探索;样本量相对较小(两个家族) 阐明SNUPN基因突变导致脊髓小脑萎缩的分子机制和病理生理过程 携带SNUPN致病性变异的人类患者家族、模拟患者变异的基因敲入小鼠、小脑浦肯野细胞 神经遗传学 脊髓小脑萎缩 RNA测序、单细胞RNA测序、体外核转运分析、基因敲入小鼠模型构建 基因敲入小鼠模型 基因组数据、转录组数据、组织形态学数据 两个家族的患者、基因敲入小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
898 2026-03-09
The Biomarkers and Underlying Mechanisms of Mitochondrial and Programmed Cell Death Related Genes in Epilepsy by Combining Transcriptome and Single-Cell Sequencing
2026-Mar, Journal of Korean Neurosurgical Society IF:1.4Q3
研究论文 本研究结合转录组和单细胞测序技术,探索了线粒体和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物及其潜在机制 首次结合转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定出与线粒体和程序性细胞死亡相关的癫痫生物标志物LTBR和IRF1,并探索了其作为药物靶点的潜力 研究依赖于公共数据集GSE134697和GSE168375,样本来源和数量可能有限;RT-qPCR验证的临床样本规模未明确说明 探究线粒体相关基因和程序性细胞死亡相关基因在癫痫中的生物标志物、作用机制及潜在治疗靶点 癫痫患者与对照样本的基因表达数据 生物信息学 癫痫 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 Spearman相关分析, cytoHubba插件算法, ROC曲线分析 基因表达数据 基于公共数据集GSE134697和GSE168375,具体样本数量未明确说明;另有RT-qPCR验证的临床样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
899 2026-03-09
Targeting NRP1 in Endothelial Cells Facilitates the Normalization of Scar Vessels and Prevents Fibrotic Scarring
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞测序等技术揭示了疤痕血管重塑特征,并发现靶向NRP1可抑制EndMT、促进血管正常化,从而预防疤痕形成 首次构建疤痕患者内皮细胞图谱,发现NRP1高表达内皮细胞具有间充质特征,并开发了靶向NRP1的功能性水凝胶喷雾用于预防疤痕 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究疤痕血管结构异常及内皮细胞异质性,寻找预防疤痕形成的治疗靶点 疤痕组织中的内皮细胞 数字病理学 皮肤疤痕 单细胞测序, 皮肤镜检查, 扫描电子显微镜, 免疫荧光染色 NA 单细胞RNA-seq数据, 图像数据 疤痕患者样本及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
900 2026-03-09
CANTAO: guiding clustering and annotation in single-cell RNA sequencing using average overlap
2026-Mar, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CANTAO的新方法,通过平均重叠度量来指导单细胞RNA测序数据的聚类和注释,以提高细胞身份识别的准确性和生物学意义 提出了平均重叠度量,通过比较差异表达基因的排名列表来定义单细胞聚类之间的距离,从而在未知细胞身份的情况下实现稳健的聚类比较和注释 未明确提及具体局限性,但可能依赖于差异表达基因的准确性,且在复杂或噪声数据中性能需进一步验证 开发一种方法以改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的评估和注释,特别是在未知细胞身份的情况下 单细胞RNA测序数据,包括已知真实细胞身份的基准数据集和未分选的小鼠胸腺细胞 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及基准数据集和小鼠胸腺细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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