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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 841 | 2026-03-18 |
Distinct Single-Cell Expression Pattern of the Soluble Epoxide Hydrolase and Cytochrome p450 Epoxygenases in Human and Mouse Small Intestinal Epithelia
2026 Mar-Apr, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554251403631
PMID:41449646
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据和原位杂交技术,首次绘制了人和小鼠小肠上皮细胞中多不饱和脂肪酸代谢酶(CYP-sEH轴)的高分辨率单细胞表达图谱 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了人和小鼠小肠上皮中CYP-sEH轴酶的表达模式,并揭示了其在辐射损伤再生模型中的动态变化 | 研究主要基于表达谱分析,酶的具体生物学功能和下游脂质介导物的功能验证仍需后续实验 | 阐明多不饱和脂肪酸代谢酶在小肠上皮中的细胞类型特异性表达模式及其在黏膜屏障稳态、上皮分化和损伤应答中的潜在作用 | 人和小鼠的小肠上皮细胞 | 单细胞组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序, RNAscope原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据, 原位杂交图像数据 | 未明确说明具体样本数量,但使用了公开可用的单细胞RNA测序数据集和辐射诱导的小肠损伤再生模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 842 | 2026-03-18 |
Integrated Multi-omics and Experimental Validation Reveal FDX1/LIAS-Mediated Cuproptosis as a Potential Driver of Diabetic Kidney Disease
2026-Mar, Biological trace element research
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12011-025-04798-5
PMID:41100003
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和实验验证,揭示了FDX1/LIAS介导的铜死亡可能是糖尿病肾病的一个潜在驱动因素 | 首次将铜死亡机制与糖尿病肾病联系起来,并通过整合bulk RNA-seq、单细胞RNA测序和空间转录组学等多层次数据,结合临床样本验证,提供了铜超载和铜死亡通路激活在DKD肾小管损伤中的新证据 | 研究主要基于动物模型和临床样本的相关性分析,铜死亡在DKD中的直接因果作用和具体分子机制仍需进一步的功能实验验证 | 探究铜死亡相关基因在糖尿病肾病中的作用和机制 | 糖尿病肾病患者的尿液样本、db/db糖尿病小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、临床尿液检测数据 | 糖尿病肾病患者的尿液样本和db/db糖尿病小鼠的肾脏组织(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 843 | 2026-03-18 |
Organization of mouse prefrontal cortex subnetwork revealed by spatial single-cell multi-omic analysis of SPIDER-Seq
2026-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwag004
PMID:41835227
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研究论文 | 本研究开发了SPIDER-Seq技术,结合病毒条形码追踪、单细胞测序和空间组学,构建了小鼠前额叶皮层的单细胞空间分子、细胞、解剖和投射组学图谱 | 开发了SPIDER-Seq新技术,首次整合了单细胞投射组学与转录组学,揭示了前额叶皮层神经元投射与基因表达的空间协调配置模式 | 研究仅聚焦于小鼠前额叶皮层,技术应用范围尚未扩展到其他脑区或物种 | 解析大脑连接组、解剖结构、转录组和空间组学整合的多模态图谱及其组织原则 | 小鼠前额叶皮层神经元 | 空间组学 | NA | 单细胞测序, 空间组学, 病毒条形码追踪 | 机器学习 | 单细胞多组学数据, 空间信息 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 844 | 2026-03-17 |
Whole-embryo spatial transcriptomics at subcellular resolution from gastrulation to organogenesis
2026-03-12, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adt3439
PMID:41818362
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研究论文 | 本研究开发了一种名为weMERFISH的全胚胎成像平台,用于在亚细胞分辨率下对斑马鱼胚胎进行空间转录组分析 | 首次实现了从原肠胚形成到器官发生阶段的全胚胎空间转录组分析,并创建了包含25,872个基因表达和294,954个染色质区域可及性的在线图谱 | 仅分析了495个基因的亚细胞表达模式,未覆盖全部基因;研究局限于斑马鱼模型 | 系统检测胚胎发育过程中的基因表达模式及其调控机制 | 斑马鱼胚胎 | 空间转录组学 | NA | 多重错误鲁棒荧光原位杂交(MERFISH),活体成像 | NA | 空间基因表达数据,染色质可及性数据,成像数据 | 斑马鱼胚胎(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学,荧光原位杂交 | weMERFISH(全胚胎MERFISH平台) | 全胚胎成像平台,用于亚细胞分辨率的多重错误鲁棒荧光原位杂交 |
| 845 | 2026-03-17 |
Precision Neurodegeneration: Integrating Molecular Mechanisms, Biomarkers, and Targeted Therapeutics
2026-Mar-11, CNS & neurological disorders drug targets
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综述 | 本文综述了神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病)的分子机制、生物标志物和靶向治疗的最新进展,强调精准医学的整合应用 | 整合了蛋白质错误折叠、小胶质细胞反应、表观遗传失调和代谢失败等多机制,并展示了基于生物标志物的精准诊断和自适应平台试验的创新方法 | NA | 综述神经退行性疾病的分子机制、生物标志物和靶向治疗的最新进展,推动精准医学在临床中的应用 | 神经退行性疾病(如阿尔茨海默病、帕金森病及相关tau蛋白病) | NA | 神经退行性疾病 | Cryo-EM, 单细胞转录组学, CRISPR-dCas9, PET, 表观遗传编辑 | NA | 分子机制数据、生物标志物数据、临床试验数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 846 | 2026-03-17 |
Distinct NK Cell Signatures Define Prognosis in HPV-Positive Versus HPV-Negative Head and Neck Cancer
2026-Mar-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18050845
PMID:41827778
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研究论文 | 本研究通过分析头颈鳞状细胞癌(HNSCC)的单细胞RNA测序数据,揭示了HPV状态如何塑造肿瘤浸润自然杀伤(NK)细胞的组成和功能,并识别了与预后相关的NK细胞亚群和可靶向的免疫逃逸机制 | 首次在HPV分层的HNSCC中系统描绘了肿瘤浸润NK细胞的转录组景观,识别出HPV阳性肿瘤中富集、与良好生存相关的特异性细胞毒性NK细胞亚群(CX3CR1+KLRB1+),并揭示了HPV阴性肿瘤中CLEC2-KLRB1抑制性轴这一新的免疫逃逸机制 | 临床转化需要在大型、前瞻性设计、解剖部位匹配的队列中进行验证,以区分HPV特异性效应与解剖部位依赖的免疫环境差异 | 阐明HPV状态在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中导致生存差异的免疫学机制,并识别新的治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者,根据HPV状态分为HPV阳性和HPV阴性两组 | 单细胞组学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),免疫组织化学(IHC) | NA | 单细胞转录组数据,组织切片图像数据 | 28名HNSCC患者(10名HPV阳性,18名HPV阴性)的scRNA-seq数据;10份FFPE组织切片的独立验证队列;TCGA-HNSC队列数据用于预后评估 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 847 | 2026-03-17 |
Optic Nerve Head Spatial Transcriptomic Change in Nonhuman Primate Early Experimental Glaucoma
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.22
PMID:41810892
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研究论文 | 本研究利用免疫组织化学和空间转录组学技术,探究了非人灵长类早期实验性青光眼中视神经头层状胶原和层后髓鞘的表达变化 | 首次在非人灵长类早期青光眼模型中,结合空间转录组学和免疫组化,揭示了视神经头不同区域(层前、层状、层后)的分子表达差异,特别是髓鞘相关基因的下调 | 样本量较小(n=3),且为实验性青光眼模型,结果向人类青光眼的直接外推需谨慎 | 探究早期青光眼发病过程中视神经头的空间分子变化 | 非人灵长类(食蟹猴)的视神经头组织 | 空间转录组学 | 青光眼 | 空间转录组学,免疫组织化学 | NA | 空间基因表达数据,组织图像 | 3只非人灵长类(单侧实验性青光眼模型) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 848 | 2026-03-17 |
Integrative single‑cell multi‑omics network analysis to elucidate epigenetic regulation in neurodevelopmental disorders
2026-Mar, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2026.100395
PMID:41580083
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研究论文 | 本研究提出一个整合单细胞多组学框架,结合scRNA-seq、scATAC-seq和单细胞DNA甲基化数据,揭示神经发育障碍中表观遗传调控机制 | 整合单细胞多组学数据,构建细胞类型特异性表观遗传调控网络,量化染色质可及性、甲基化状态和转录输出的协同偏差,识别SOX11和CHD8作为多层主调控因子 | 未明确说明样本量或数据来源的具体限制,可能受限于单细胞多组学技术的整合复杂性 | 阐明神经发育障碍的表观遗传调控机制 | 发育中的人和小鼠脑组织以及患者来源的神经祖细胞模型 | 单细胞多组学 | 神经发育障碍 | scRNA-seq, scATAC-seq, 单细胞DNA甲基化测序 | 典型相关分析、流形对齐、潜变量建模、网络推断 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 849 | 2026-03-17 |
Targeting pre-existing club-like cells in prostate cancer potentiates androgen deprivation therapy
2026-Mar, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00375-y
PMID:41629661
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了前列腺癌中类Club细胞的去势耐受性源于转录重编程,并提出了靶向FOSL1/AP-1和PIM激酶的双重靶向治疗策略 | 首次证明小鼠LSC前体细胞的去势耐受性由转录重编程而非内在特性驱动,并识别FOSL1/AP-1作为关键转录因子,同时将Pten LSC特征与人类侵袭性双阴性前列腺癌亚型相关联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限,且双重靶向药物的临床转化潜力需进一步评估 | 探究去势耐受性前体样细胞在前列腺癌治疗抵抗和肿瘤进展中的作用,并开发靶向治疗策略 | 小鼠LSC前体细胞(类人前列腺Club细胞)、人类双阴性前列腺癌亚型及体外和体内模型 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 850 | 2026-03-17 |
Dextrorotatory kynurenine suppresses acute rejection through inhibiting M1 macrophage-mediated inflammation
2026-Mar, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-026-00377-w
PMID:41644740
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研究论文 | 本研究揭示了右旋犬尿氨酸(D-Kyn)通过抑制M1巨噬细胞介导的炎症来减轻急性排斥反应,并阐明了其作用机制 | 首次发现右旋氨基酸D-Kyn在移植排斥中的关键免疫抑制作用,并揭示其通过PHGDH/TLR4/Caspase-1通路抑制M1巨噬细胞炎症活性的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本分析规模有限,需要更大规模的临床试验验证 | 探索右旋氨基酸在器官移植急性排斥反应中的免疫调节作用及治疗潜力 | 肾移植受者血清样本、小鼠皮肤和肾脏移植模型、M1巨噬细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 离子淌度质谱(IM-MS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 质谱数据、单细胞转录组数据 | 肾移植受者血清样本(具体数量未明确)、小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 851 | 2026-03-16 |
Single-cell RNA-seq of in vitro-cultured medullary thymic epithelial cells reveals a preserved differentiation trajectory under Aire deficiency
2026-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag038
PMID:41831309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了体外培养的野生型和Aire缺陷型小鼠髓质胸腺上皮细胞,揭示了Aire缺失下mTEC分化轨迹得以保留但转录多样性和功能减弱 | 首次在体外培养体系中结合单细胞RNA测序与拟时序分析,系统揭示了Aire作为转录放大器和成熟促进剂而非分化启动因子的新功能 | 研究基于体外培养模型,可能无法完全模拟体内胸腺微环境的复杂性;仅使用了部分功能缺失的Aire突变模型 | 阐明自身免疫调节因子Aire在髓质胸腺上皮细胞转录组驱动分化轨迹中的作用机制 | 体外培养的小鼠髓质胸腺上皮细胞(野生型与Aire突变型)及共培养的CD4+胸腺细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠mTEC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 852 | 2026-03-16 |
Disrupting USP14-mediated PARP1 dynamics reinstates MIC-A/B-driven antigen-independent CD8+ T cell killing in glioma
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb3800
PMID:41824572
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研究论文 | 本研究揭示了USP14通过去泛素化稳定PARP1,进而抑制MIC-A/B表达,导致胶质瘤中CD8+ T细胞功能耗竭的机制,并证明抑制USP14可恢复抗原非依赖性的T细胞杀伤功能 | 首次发现USP14通过K63连接的去泛素化稳定PARP1,调控NFIL3与MIC-A/B启动子的结合,从而抑制肿瘤细胞表面MIC-A/B表达,并证明靶向USP14可协同PD1阻断增强抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠胶质瘤模型,临床样本验证部分相对有限,USP14抑制剂的体内安全性和特异性需进一步评估 | 探究胶质瘤中MIC-A/B表达下调的机制,并寻找恢复CD8+ T细胞抗原非依赖性杀伤功能的免疫治疗新策略 | 小鼠胶质瘤模型、临床胶质瘤标本、CD8+ T细胞、肿瘤细胞表面的MIC-A/B配体 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、去泛素化酶筛选、蛋白质组学、共免疫沉淀、染色质免疫沉淀、免疫荧光、泛素化分析、颅内肿瘤模型 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、蛋白质相互作用数据、临床组织样本数据 | 未明确说明具体样本数量,包括小鼠模型和临床胶质瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 853 | 2026-03-16 |
Conjugated bile acids facilitate cholangiocyte senescence to promote cholestatic liver diseases via STING signaling
2026-Mar-12, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.020
PMID:41831676
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研究论文 | 本研究揭示了结合胆汁酸通过STING信号通路促进胆管细胞衰老,从而加剧胆汁淤积性肝病的机制 | 首次发现结合胆汁酸通过线粒体损伤和氧化DNA泄漏激活STING信号,诱导胆管细胞衰老和SASP,进而驱动巨噬细胞活化和炎症反应 | 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,需要进一步验证在人类中的直接治疗应用 | 探究结合胆汁酸和STING信号在胆汁淤积性肝病进展中的作用 | 原发性胆汁性胆管炎(PBC)和原发性硬化性胆管炎(PSC)患者样本、Abcb4-/-小鼠及胆管结扎(BDL)小鼠模型 | 单细胞组学与分子病理学 | 胆汁淤积性肝病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序(RNA-seq)、生化分析 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、生化数据 | PBC和PSC患者临床样本、Abcb4-/-小鼠模型、BDL小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 854 | 2026-03-16 |
Single-cell eQTL mapping reveals cell-type-specific genetic regulation in lung cancer
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101100
PMID:41386230
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研究论文 | 本研究构建了迄今最大规模的人类肺组织单细胞eQTL图谱,揭示了肺癌遗传易感性的细胞类型特异性调控机制 | 首次通过大规模单细胞RNA测序构建肺组织单细胞eQTL图谱,发现超过60%的sc-eQTLs具有细胞类型特异性,且近半数已确立的非小细胞肺癌易感位点表现出细胞类型特异性多效性遗传调控 | 研究基于222名捐赠者样本,虽然规模较大,但仍需更多样本来验证罕见细胞类型中的eQTLs,且功能验证实验有限 | 阐明肺癌遗传易感性的细胞类型特异性基因调控机制 | 人类肺组织中的17种细胞类型 | 单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | eQTL分析 | 单细胞转录组数据 | 222名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 多重单细胞RNA测序 |
| 855 | 2026-03-16 |
Untangling biological complexity: A deep learning approach to separating multiple signals in single-cell data
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101188
PMID:41819074
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CellUntangler的深度学习模型,用于在单细胞RNA测序数据中捕获和过滤多个生物信号 | 开发了基于深度学习的CellUntangler模型,能够分离单细胞数据中的多个生物信号,提高了信号解析的准确性 | NA | 开发一种深度学习方法来分离单细胞RNA测序数据中的多个生物信号 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 856 | 2026-03-16 |
Dual regulation of CXCR6+CD8+ T cells modulates cytotoxic and exhaustion-associated programs during prostate cancer progression
2026-Mar-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014276
PMID:41819547
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研究论文 | 本研究揭示了CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌进展中的双重调控机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次在前列腺癌中系统阐明了CXCR6+CD8+ T细胞的转录特征、调控网络和临床意义,发现了IL-10-STAT3-FOXO1-KLF2轴对CXCR6表达的抑制机制,并提出了靶向该轴联合抗PD-1治疗的协同策略 | 研究样本量相对有限(9例患者),主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 | 探究CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌中的身份特征、调控机制及治疗潜力 | 前列腺癌患者组织样本、小鼠模型、骨髓嵌合体及体外T细胞 | 单细胞组学与免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、流式细胞术、bulk RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR | NA | 单细胞转录组数据、图像数据、流式数据、测序数据 | 90,651个细胞(来自9例患者)及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 857 | 2026-03-16 |
Targeting endosomal trafficking-mediated antigen escape to resensitize myeloma to CAR-T therapy
2026-Mar-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014040
PMID:41802812
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研究论文 | 本研究揭示了多发性骨髓瘤中一种由RRM2驱动的、以前未被表征的抗原逃逸机制,并通过重新利用药物奥沙米特来恢复MICA/B表面表达,从而增强NKG2D CAR-T细胞的疗效 | 首次发现并表征了RRM2作为一种非经典运输调节器,通过激活RAB7A促进MICA/B向溶酶体降解,并同时阻断RAB11介导的回收,从而介导抗原逃逸;提出了通过亚毒性剂量的临床批准药物奥沙米特逆转此过程,以重新敏化肿瘤的联合治疗策略 | 研究主要基于临床前模型(如诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官和播散性异种移植模型),其结论在人体中的有效性和安全性仍需临床试验验证 | 阐明CAR-T治疗后肿瘤抗原逃逸的内在机制,并开发策略以重新敏化多发性骨髓瘤,增强CAR-T细胞免疫疗法的疗效 | 多发性骨髓瘤细胞、NKG2D CAR-T细胞、诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官、小鼠异种移植模型 | 肿瘤免疫学、细胞治疗 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、实时成像、共免疫沉淀、GTP下拉实验、共聚焦显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、实时成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 858 | 2026-03-16 |
Rejuvenation of THY1+ nucleus pulposus-derived stem cells promotes intervertebral disc regeneration through FGF10-FGFR1-CREB pathway and mitochondrial fission
2026-Mar-09, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.008
PMID:41812707
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研究论文 | 本研究揭示了THY1+ NPSCs在椎间盘再生中的关键作用,以及FGF10通过FGF10-FGFR1-CREB通路和线粒体分裂逆转细胞衰老的机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出THY1+ NPSCs作为椎间盘退变中的关键再生细胞群,并发现FGF10作为关键再生因子通过抑制CREB磷酸化和线粒体分裂来逆转细胞衰老 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化仍需进一步验证;机制研究虽深入,但其他潜在通路或因子可能未被完全探索 | 阐明NPSCs的再生驱动因素及其抗衰老机制,为椎间盘退变提供潜在治疗策略 | 椎间盘退变患者的临床样本、THY1+ NPSCs细胞、体外衰老模型及体内动物模型 | 单细胞组学与再生医学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、多重荧光染色 | NA | RNA测序数据、荧光成像数据 | 临床IVDD样本(具体数量未明确)、体外及体内模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 859 | 2026-03-16 |
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2026-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02855-4
PMID:41184554
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研究论文 | 本文提出了一种名为STORIES的新方法,利用最优传输扩展来学习空间感知的细胞命运潜力,以从空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹 | 该方法通过扩展最优传输框架,首次将空间信息整合到梯度流学习中,以分析空间分辨的转录组数据,相比现有方法具有更优的空间一致性 | 未明确提及具体局限性,但暗示现有梯度流学习方法在处理空间转录组数据时面临挑战,可能涉及计算复杂性或数据整合问题 | 从多个时间点的空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹,以研究动态生物过程如发育中的空间组织机制 | 空间转录组学数据,具体应用于蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输扩展的神经网络 | 空间转录组学数据 | 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 860 | 2026-03-16 |
Unraveling the VEGF-ETS1 axis: a transcriptomic and single-cell analysis of angiogenesis in endometriosis
2026-Mar, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03781-2
PMID:41543773
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据分析,揭示了VEGF-ETS1轴在子宫内膜异位症病理血管生成中的核心驱动作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别ETS1作为子宫内膜异位症中内皮细胞的关键转录调节因子,并阐明其通过放大VEGF信号通路促进血管生成的机制 | 研究主要基于转录组数据分析,缺乏体内功能验证实验,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究子宫内膜异位症中病理血管重塑的转录机制,识别关键调控因子和治疗靶点 | 子宫内膜异位症患者的病变组织,特别是卵巢子宫内膜异位囊肿,以及其中的内皮细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序,bulk转录组分析,功能富集分析,伪时间分析 | NA | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 三个独立转录组数据集和两个验证队列,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |