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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 801 | 2026-01-10 |
TEAD4 and RXRA Regulate the Function of Nucleus Pulposus Cells in Intervertebral Disc Degeneration Via the TNF-α/NF-κB Pathway: An Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq, Bulk RNA-Seq, and In Vitro Validation
2026-Mar, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05534-4
PMID:41511606
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 802 | 2026-03-21 |
Silencing CCL5 suppresses ferroptosis to alleviate calcific aortic valve disease through chemokine pathway inhibition
2026-Mar, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了CCL5通过激活趋化因子信号通路诱导铁死亡,从而促进钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)进展的机制 | 首次阐明CCL5通过调控趋化因子信号通路和铁死亡在CAVD中的关键作用,并提出了靶向CCL5作为治疗CAVD的新策略 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体临床试验中验证,且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究CCL5在CAVD进展中的调控功能,特别是通过趋化因子信号通路和铁死亡的作用机制 | 人类主动脉瓣间质细胞(VICs)和Apoe-/-小鼠模型 | 分子生物学与病理学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、病理染色、酶联免疫吸附试验、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 803 | 2026-03-21 |
Heterogeneity and Clinical Relevance of Human Adipose Stromal and Progenitor Cells
2026-Mar, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2025.1182
PMID:41813260
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综述 | 本文综述了人类脂肪基质和祖细胞(ASPCs)的异质性及其临床相关性,总结了单细胞转录组学等先进方法在定义ASPC亚型中的应用 | 通过系统比较近期单细胞转录组数据集,首次识别出至少八种不同的ASPC亚型,并整合了其在代谢疾病中的功能失调证据 | 不同研究间存在生物学和方法学变异性,部分细胞类型未一致检测到,需要进一步验证研究 | 阐明人类白色脂肪组织中ASPCs的异质性及其在代谢疾病中的临床意义 | 人类白色脂肪组织中的脂肪基质和祖细胞(ASPCs) | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 804 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomic profiling identifies therapeutic subpopulations of adipose-derived mesenchymal stromal cells for human keloid management
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05463-0
PMID:41511717
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,鉴定了脂肪来源间充质基质细胞中具有抑制瘢痕疙瘩形成潜能的治疗性亚群,并在小型猪模型中验证了其疗效 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出脂肪来源间充质基质细胞中能够特异性抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞和角质形成细胞发展的治疗性亚群,并揭示了其通过调控关键枢纽基因(如NOG、IL6、APP、NOTCH1)发挥作用的分子机制 | 研究主要在体外和小型猪模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;对ASC亚群抑制瘢痕形成的具体信号通路和长期安全性需进一步探究 | 阐明脂肪来源间充质基质细胞治疗人类瘢痕疙瘩的潜力及其作用机制 | 瘢痕疙瘩成纤维细胞、瘢痕疙瘩角质形成细胞、脂肪来源间充质基质细胞 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 805 | 2026-03-21 |
Advances in the application of spatial transcriptomics in understanding development and disease
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05470-1
PMID:41511721
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在理解发育和疾病中的应用进展 | 将空间转录组学作为一个总括性术语,区分了组织水平ST和空间解析单细胞转录组学,并整合了多模态数据 | NA | 综述空间转录组学方法学进展及其在发育和临床问题中的应用 | 空间转录组学技术及其在组织空间基因表达分析中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,包括RNA、DNA、ATAC、CUT&Tag和Ribo-seq等多模态测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 806 | 2026-03-21 |
TUSCAN: Tumor segmentation and classification analysis in spatial transcriptomics
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014058
PMID:41843898
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TUSCAN的新型计算方法,用于在空间转录组学数据中识别和分类肿瘤区域 | 提出了一种结合空间转录组学数据和H&E染色图像构建空间拷贝数变异谱的方法,以提高肿瘤区域识别的准确性,并提供了可解释的克隆进化推断 | NA | 提高空间转录组学数据中肿瘤区域识别的准确性 | 肿瘤组织切片 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,H&E染色 | NA | 空间转录组学数据,图像数据 | 多个来自不同平台的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 807 | 2026-03-21 |
Single-cell sequencing reveals unexpected genetic diversity among Bodo spp. flagellates and their bacterial endosymbionts
2026-Mar, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001642
PMID:41848149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体之间意想不到的遗传多样性 | 首次对未培养的Bodo属鞭毛虫进行单细胞测序,发现了三个潜在新物种,并揭示了宿主与内共生体之间协同进化的多样性模式 | 样本仅来自英国一处淡水地点,样本量较小(7个细胞),可能无法代表全球Bodo属的完整多样性 | 探究自由生活鞭毛虫Bodo属及其内共生体的遗传多样性和物种界定 | Bodo属鞭毛虫及其Holosporales目细菌内共生体 | 微生物基因组学 | NA | 单细胞测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据 | 7个未培养的Bodo属细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 808 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen-specific monocyte heterogeneity and potential biomarkers in gram-positive versus gram-negative bloodstream infections
2026-Mar-01, World journal of emergency medicine
IF:2.6Q1
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染中病原特异性的单细胞异质性,并鉴定了潜在的生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统比较了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染对宿主单核细胞转录组的特异性影响,并发现了S100A12与降钙素原联合作为鉴别诊断生物标志物的潜力 | 单细胞测序样本量较小(仅4名患者),临床验证队列规模有限,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 阐明革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染在单细胞水平的宿主免疫反应差异,并寻找鉴别诊断的生物标志物 | 健康志愿者、革兰氏阴性菌血流感染脓毒症患者、革兰氏阳性菌血流感染脓毒症患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 血流感染/脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 单细胞测序:4名患者(2名GNB-BSI,2名GPC-BSI)+健康志愿者;临床验证:85名患者(45名GNB-BSI,40名GPC-BSI) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 809 | 2026-03-20 |
Red panda intestinal organoids for the functional analysis of Lactobacillus salivarius
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114844
PMID:41852748
|
研究论文 | 本研究建立了红熊猫肠道类器官培养系统,用于分析唾液乳杆菌P103的益生功能 | 首次成功建立红熊猫肠道类器官,并利用单细胞RNA测序验证其组织特异性细胞类型和功能,为濒危物种研究提供了可传代、冻存和复苏的模型系统 | 未在摘要中明确提及具体限制,可能包括类器官与体内环境的差异或样本规模有限 | 研究红熊猫肠道类器官的建立及其在宿主-微生物相互作用机制分析中的应用,减少野生动物研究对动物模型的依赖 | 红熊猫肠道类器官及唾液乳杆菌P103 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 810 | 2026-03-20 |
Targeting the ferritinophagy axis: multi-target regulation of TFRC/FTH1/NCOA4 by artesunate ameliorates salivary gland dysfunction in Sjögren's Disease
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01354-8
PMID:41851758
|
研究论文 | 本研究探讨了青蒿琥酯通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而改善干燥综合征小鼠唾液腺功能障碍的机制 | 首次揭示了青蒿琥酯通过双重靶向铁蛋白自噬轴(TFRC/FTH1/NCOA4)并增强抗氧化防御来改善干燥综合征唾液腺功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人类患者中进行验证,且具体分子结合机制需进一步实验确认 | 探究青蒿琥酯是否通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而缓解干燥综合征的唾液腺功能障碍 | 非肥胖糖尿病小鼠(干燥综合征模型)和IFN-γ诱导的人唾液腺细胞系A253 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, Western印迹, 免疫荧光, 流式细胞术, 功能测定 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 811 | 2026-03-20 |
Uncovering the therapeutic mechanism of Baicalein in diabetic retinopathy through ferroptosis regulation
2026-Mar-18, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2026.2646309
PMID:41848783
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞转录组学方法,探讨了黄芩素通过调控铁死亡治疗糖尿病视网膜病变的潜在机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序数据,系统揭示了黄芩素通过靶向铁死亡通路治疗糖尿病视网膜病变的多靶点作用机制,并利用分子对接与动力学模拟验证了关键靶点的结合稳定性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟,缺乏体内实验验证;单细胞数据样本来源有限,临床转化潜力需进一步评估 | 探究黄芩素治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,重点关注其对铁死亡通路的调控作用 | 糖尿病视网膜病变相关的差异表达基因、铁死亡相关基因、黄芩素作用靶点及视网膜单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 | 基于公共数据库GSE102485和GSE178121的基因表达数据集,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 812 | 2026-03-20 |
Spi-1 proto-oncogene regulates mRNA hypertranscription and malignant progression in head and neck cancer
2026-Mar-18, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02669-6
PMID:41851070
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子SPI1通过驱动mRNA超转录促进头颈鳞状细胞癌恶性进展的机制 | 首次在头颈鳞状细胞癌中明确了mRNA特异性超转录的作用,并鉴定出SPI1是其关键调控因子 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,需要更多临床样本验证 | 探究mRNA超转录在头颈鳞状细胞癌恶性进展中的作用及其分子驱动机制 | 头颈鳞状细胞癌细胞系、异种移植模型及单细胞转录组数据 | 癌症生物学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学、ChIP-seq、RNA-seq、功能获得/缺失实验 | NA | 转录组数据、基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 813 | 2026-03-20 |
Spatial heterogeneity of MDSCs mediated by ANXA1-FPRs signaling drives immune suppression in OSCC progression
2026-03-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70861-x
PMID:41851114
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了口腔鳞状细胞癌中MDSCs的空间异质性及其通过ANXA1-FPR2信号介导免疫抑制的机制 | 首次揭示了MDSCs在OSCC进展中的空间动态变化(从肿瘤核心浸润到边缘定位)及其通过ANXA1-FPR2信号通路维持免疫抑制的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚需进一步开展;空间异质性的功能影响需更多实验证实 | 探究口腔鳞状细胞癌免疫抑制微环境中细胞空间异质性的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)肿瘤微环境中的髓源性抑制细胞(MDSCs)和CD8 T细胞 | 空间转录组学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 814 | 2026-03-20 |
Bacterial reporter-paired scRNA sequencing reveals cross talk between zinc starvation and zinc toxicity in macrophage antibacterial defense
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2530503123
PMID:41802048
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研究论文 | 本研究通过细菌报告基因配对单细胞RNA测序技术,揭示了巨噬细胞抗菌防御中锌饥饿与锌毒性之间的相互作用机制 | 开发了细菌报告基因配对单细胞RNA测序新方法,首次在单细胞分辨率下同时分析宿主巨噬细胞和细胞内细菌的转录组,揭示了锌饥饿与锌毒性在抗菌防御中的协同作用 | 研究主要基于体外培养的人单核细胞衍生巨噬细胞模型,未在体内复杂微环境中验证;细菌菌株类型有限 | 阐明巨噬细胞利用锌毒性抗菌的分子机制 | 人单核细胞衍生巨噬细胞(HMDM)和锌应激报告细菌菌株 | 单细胞组学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,使用人单核细胞衍生巨噬细胞和细菌共培养系统 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 细菌报告基因配对单细胞RNA测序(bacterial reporter-paired scRNA sequencing) |
| 815 | 2026-03-20 |
Psoriasis-like disease prevents squamous skin tumor development by neutrophil-driven inflammation
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2536378123
PMID:41802042
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了银屑病样疾病如何通过中性粒细胞驱动的炎症反应抑制皮肤鳞状细胞癌的发展 | 首次发现严重银屑病样疾病中,中性粒细胞依赖的炎症反应能预防皮肤鳞状细胞肿瘤的发生,并阐明了中性粒细胞通过释放细胞毒性颗粒和NETs、诱导角质形成细胞衰老等机制发挥抗肿瘤作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类银屑病患者的临床相关性仍需进一步验证 | 探究慢性皮肤和全身炎症如何影响鳞状皮肤肿瘤的起始和进展 | 银屑病样疾病小鼠模型和皮肤鳞状细胞癌小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 816 | 2026-03-20 |
Pareto optimality reveals an atlas of cellular archetypes
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2530194123
PMID:41802062
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研究论文 | 本文通过帕累托最优性理论分析单细胞转录组数据,揭示了细胞类型内表型变异的普遍组织原则 | 首次将帕累托最优性理论应用于单细胞转录组学,以无偏方式识别细胞功能原型,并推导出低维流形表示 | 方法依赖于Tabula Sapiens Atlas数据,可能未涵盖所有细胞类型或条件,且理论假设需进一步实验验证 | 探索细胞类型内表型变异的普遍组织原则,并构建细胞功能原型图谱 | 人类多种细胞类型和组织的单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多目标优化模型 | 单细胞转录组数据 | Tabula Sapiens Atlas中的多组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 817 | 2026-03-20 |
Single-cell analyses identify independent aging processes that compete to determine cellular fate in budding yeast
2026-Mar-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2534452123
PMID:41811451
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和纵向荧光显微镜技术,系统解析了酵母衰老过程中的异质性,揭示了独立衰老进程如何竞争决定细胞命运 | 提出“竞争风险模型”,挑战了rDNA不稳定性和线粒体功能障碍互斥的传统观点,表明它们可并行发生,且环境应激反应(ESR)是线粒体功能下降的早期生物标志而非寿命决定因素 | 研究主要基于酵母模型,结果在高等生物中的普适性需进一步验证,且单细胞技术可能无法完全捕获所有分子动态 | 解析酵母衰老过程中表型异质性的分子驱动机制,探究不同衰老轨迹的独立性与竞争关系 | 芽殖酵母(Saccharomyces cerevisiae)的衰老细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞转录组学,纵向荧光显微镜 | NA | 转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 818 | 2026-03-20 |
The Fd4 transcription factor translates transient spatial cues in progenitors into long-term lineage identity
2026-Mar-17, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.109188
PMID:41842930
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现转录因子Fd4,它能够将神经祖细胞接收的短暂空间信号转化为长期的谱系特异性神经元身份 | 首次鉴定出Fd4作为“谱系身份基因”的先驱成员,连接了发育过程中的瞬时空间信号与谱系特异性终端选择基因的长期表达 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物系统中的普适性尚未验证 | 探究神经祖细胞如何在空间信号消失后维持其独特身份,以确保其后代表达正确的谱系特异性终端选择基因 | 果蝇的神经祖细胞(神经母细胞NB7-1)及其新生神经元后代 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 819 | 2026-03-20 |
Decoding neurodegeneration one cell at a time
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI199841
PMID:41837285
|
综述 | 本文综述了单细胞基因组学技术如何推动对神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子理解 | 利用单细胞转录组学、表观基因组学和空间转录组学等前沿技术,系统解析多种神经退行性疾病的细胞类型特异性分子状态 | 依赖现有技术描述性图谱,因果机制验证需进一步通过单细胞扰动筛选等技术拓展 | 揭示神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子基础 | 阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症、额颞叶痴呆和亨廷顿病中的特定神经元亚型 | 单细胞基因组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组学、单细胞表观基因组学、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、表观基因组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 820 | 2026-03-20 |
Characterization of intestinal immune responses in generalized human and murine lipodystrophy
2026-Mar-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI192322
PMID:41837291
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研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序,探讨了获得性全身性脂肪营养不良症(AGL)中肠道免疫反应的特征,揭示了T细胞克隆性扩张与NRAS突变的关系 | 首次在AGL合并克罗恩病的患者中,结合单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,发现T细胞克隆性扩张与体细胞NRAS突变相关,而非单纯由脂肪组织缺失引起 | 研究仅基于一名患者和鼠类模型,样本量有限,且未深入探讨NRAS突变的具体机制 | 探究脂肪组织缺失对肠道炎症的影响,以及AGL中T细胞克隆性扩张的病因 | 一名AGL合并克罗恩病的患者以及脂肪营养不良小鼠模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 一名患者和鼠类模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |