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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-09-21 |
Distribution and Levels of Insulin-like Growth Factor 2 Receptor Across Mouse Brain Cell Types
2026-Mar, Receptors (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/receptors5010001
PMID:41725679
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研究论文 | 本研究通过双重和多重免疫荧光染色结合单细胞RNA测序数据库,系统比较了成年雄性C57BL/6J小鼠不同脑区和细胞类型中IGF-2R蛋白的分布与水平 | 首次对小鼠全脑多种细胞类型和亚细胞结构中IGF-2R蛋白水平进行系统性比较评估,并将蛋白分布与公开单细胞RNA测序数据库中的Igf2r mRNA表达进行对比验证 | 研究仅基于成年雄性C57BL/6J小鼠,未涵盖雌性、不同年龄阶段或其他品系,且主要依赖免疫荧光半定量分析,缺乏功能性实验验证 | 阐明IGF-2R在不同脑细胞类型和亚细胞区域的分布与表达水平,为其脑功能和治疗靶向研究提供基础 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的多个脑区及不同脑细胞类型 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 免疫荧光染色,单细胞RNA测序 | NA | 图像,文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-09-21 |
Decoding the Mechanisms of Hepatocellular Carcinoma Cancer Stem Cells and Identifying Potential Therapeutic Strategies Based on Single-cell Omics
2026 Mar-Apr, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20577
PMID:41771574
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学数据系统解析肝细胞癌癌症干细胞的细胞与空间异质性,并构建预后模型及预测潜在治疗化合物 | 首次基于单细胞组学系统构建肝细胞癌癌症干细胞图谱,揭示其在肿瘤-基质界面的空间富集特征,并整合GEO生存数据构建12基因预后模型,同时通过Connectivity Map预测靶向癌症干细胞的候选化合物 | 数据来源于公共数据库HCCDB v2.0而非自测数据,预后模型仅在GEO数据集(GSE76427、GSE14520)中验证,候选化合物的癌症干细胞抑制活性仅通过计算预测,缺乏实验验证 | 系统表征肝细胞癌相关癌症干细胞,识别预后生物标志物及潜在治疗策略 | 肝细胞癌癌症干细胞及肝细胞癌患者样本 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 拷贝数变异分析, 基因调控网络分析, 通路富集分析, 拟时序轨迹推断, 细胞通讯分析 | Harmony, UMAP, Louvain聚类, SCENIC, GSVA, Monocle, CytoTRACE2, CellChat | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 63 | 2026-09-21 |
Female iPSC X-chromosome inactivation (XCI) erosion and its transcriptomic effects during CRISPR gene editing and neural differentiation
2026-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.27.708613
PMID:41890091
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研究论文 | 该研究利用批量RNA测序和单细胞RNA测序,探究了CRISPR基因编辑和神经分化过程中女性iPSC的X染色体失活侵蚀现象及其对转录组分析的影响 | 首次系统性地揭示了CRISPR编辑和神经分化对女性iPSC中XCI侵蚀的影响,发现XCI侵蚀在CRISPR编辑的iPSC中具有变异性但在神经元中基本保持,并证明了XCI侵蚀对差异表达基因分析的混杂效应 | 研究主要基于有限数量的供体细胞系,XCI侵蚀的分子机制尚未完全阐明,且未涉及其他类型的神经细胞或脑区 | 研究CRISPR基因编辑和神经分化对女性iPSC中X染色体失活侵蚀的影响,以及其对转录组差异表达基因分析的混杂效应 | 女性iPSC细胞系及其分化而来的神经元 | 机器学习 | 神经系统疾病 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CRISPR基因编辑 | NA | 转录组数据 | 来自4个供体细胞系的数百个CRISPR编辑的女性iPSC细胞系(针对66个基因),以及42个编辑基因子集的iPSC衍生神经元的单细胞RNA-seq数据 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-09-21 |
Therapeutic strategy for cervical gastric-type adenocarcinoma by targeting CLU to relieve CLU-associated stress and sensitize chemotherapy
2026-Mar, Precision clinical medicine
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/pcmedi/pbag003
PMID:41878236
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序,揭示了宫颈胃型腺癌(GAS)中CLU相关热应激的关键细胞亚群及其促进免疫逃逸的机制,并基于肿瘤类器官验证了靶向CLU联合顺铂的治疗策略 | 首次构建了GAS来源的肿瘤类器官,揭示了CLU相关热应激在GAS恶性微环境和免疫逃逸中的关键作用,建立了四基因预后标志物(CLU、PDGFB、TIGIT、C3),并提出了靶向CLU联合化疗的新治疗策略 | 单细胞RNA测序样本量较小(仅3例GAS和2例UEA),验证队列样本量有限,需要更大规模的多中心研究进一步验证 | 探索宫颈胃型腺癌的致癌机制和有效治疗靶点 | 宫颈胃型腺癌(GAS)患者和宫颈腺癌(ADC)患者 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、免疫组化染色、多色免疫组化染色 | 肿瘤类器官模型 | 图像、文本 | 172例患者(19例NHPVA和153例HPVA ADC)用于临床病理分析,3例GAS和2例UEA用于单细胞测序,25例GAS和25例UEA用于免疫组化验证,2例GAS用于多色免疫组化验证,GAS来源的肿瘤类器官用于药物实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5'(包含V(D)J富集) |
| 65 | 2026-09-20 |
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526998123
PMID:41849396
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研究论文 | 该研究通过牛胚胎单细胞RNA测序揭示主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动,并比较牛与人类胚胎中SP1在EGA和早期发育中的物种特异性作用 | 首次揭示牛胚胎主要EGA在8细胞期卵裂球间异步启动;发现EGA过程中蛋白质积累与转录及翻译激活存在差异;阐明SP1在牛和人类胚胎EGA中的保守及物种特异性功能 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 揭示胚胎基因组激活(EGA)的分子特征及调控该过程的转录因子,并探究SP1在牛和人类早期胚胎发育中的作用 | 牛胚胎和人类胚胎 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq、多组学分析 | NA | 文本、图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 66 | 2026-09-20 |
Type 2 lymphocytes restrict type 3 lymphocytes during liver fibrosis and colocalize in fibroblast niches
2026-Mar-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea6805
PMID:41811951
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研究论文 | 该研究通过小鼠肝损伤和纤维化模型、三维显微镜和空间转录组学,发现2型淋巴细胞(主要是ILC2)与3型淋巴细胞及成纤维细胞生态位空间共定位,并相互制约调节肝纤维化 | 揭示了2型淋巴细胞和3型淋巴细胞在肝纤维化中的空间关联和相互制约作用,以及它们与成纤维细胞生态位的共定位 | 研究主要基于小鼠模型,人类肝脏疾病的适用性需要进一步验证 | 探究2型淋巴细胞和3型淋巴细胞的空间定位如何影响肝脏修复或病理性纤维化 | 小鼠肝脏中的2型淋巴细胞(包括ILC2)、3型淋巴细胞(包括γδ T细胞)、成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 空间转录组学 | 肝纤维化 | 空间转录组学, 三维显微镜 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-09-20 |
scDEcrypter: Uncertainty-aware differential expression analysis for viral infection in scRNA-seq
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.09.710583
PMID:41959296
|
研究论文 | 本文提出了 scDEcrypter,一种带惩罚的双向混合模型,利用部分标签进行病毒感染单细胞RNA测序数据的差异表达分析 | 提出了带惩罚的双向混合模型,利用感染状态和细胞类型等变量的部分标签,并采用数据拆分策略避免double-dipping,实现快速、基于似然的差异表达推断 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解决病毒感染单细胞RNA测序研究中病毒reads稀疏、感染细胞标签不足以及旁观者反应干扰差异表达分析的问题 | 病毒感染单细胞RNA测序数据中的感染细胞状态及感染相关基因 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 带惩罚的双向混合模型 | 文本 | 两个不同的病毒感染数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2026-09-20 |
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20251067
PMID:41489684
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析结核感染与阴性个体的肺组织,揭示了TB诱导的肌成纤维细胞在肺病理中的驱动作用 | 首次识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群,表达肌成纤维细胞样基因签名,并与严重疾病和更高细菌载量相关;通过网络分析揭示了该成纤维细胞与SPP1+巨噬细胞在肉芽肿袖套中的相互作用 | 摘要中未提及研究限制 | 定义人类结核免疫病理的细胞驱动因素,并寻找新型结核治疗的潜在靶点 | 结核感染和结核阴性个体的肺组织 | 数字病理学 | 肺结核 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 69 | 2026-09-20 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals cellular and molecular changes in EGFR-positive lung adenocarcinoma before and after Furmonertinib treatment
2026-03, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01706-y
PMID:41307822
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研究论文 | 通过对EGFR阳性肺腺癌患者Furmonertinib治疗前后肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞RNA测序,揭示肿瘤微环境重塑、转录组适应及细胞间通讯网络重编程 | 首次系统整合公开和自有数据集,对EGFR阳性肺腺癌患者在Furmonertinib治疗前后的肿瘤及配对癌旁组织进行单细胞转录组分析,揭示了肿瘤微环境重塑、转录组重编程及细胞间通讯网络变化 | 摘要中未明确说明样本量及具体研究局限性 | 阐明EGFR阳性肺腺癌患者对Furmonertinib响应和适应的细胞及分子机制,特别是肿瘤微环境的变化 | EGFR阳性肺腺癌患者治疗前后的肿瘤组织及配对癌旁组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2026-09-20 |
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.carpath.2025.107802
PMID:41314481
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研究论文 | 该研究利用空间转录组学技术分析了人类左心耳和肺静脉袖套组织,以探究心房颤动(AF)相关基因的空间表达模式 | 首次对人类肺静脉和左心耳组织进行空间转录组学研究,克服了获取PV组织的挑战,并揭示了AF相关基因如SHOX2在PV中的潜在重要性 | 样本来源于未使用的移植供体,可能无法完全代表AF患者的病理状态;每个55微米直径空间区域可能包含多种细胞,分辨率有限 | 通过空间转录组学揭示人类肺静脉和左心耳组织的细胞类型分布和空间区域特征,以及AF相关基因的空间表达 | 人类肺静脉(PV)和左心耳(LAA)组织 | 空间转录组学 | 心房颤动 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 来自未使用移植供体的人类PV和LAA组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 71 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 72 | 2026-09-20 |
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101277
PMID:41621162
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研究论文 | 本研究通过转录组分析、单细胞与空间转录组学、体内实验等手段,探究CCR1在胃癌免疫微环境中激活或抑制免疫应答的作用机制 | 首次系统阐明CCR1在胃癌中作为免疫应答激活因子的决定性作用,揭示CCR1通过NF-κB和MAPK通路上调CXCL9/CXCL10促进T细胞浸润的机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究CCR1在胃癌中是促进还是抑制肿瘤进展,并阐明其调控免疫微环境的分子机制 | 胃癌患者组织样本、CCR1敲除小鼠模型 | digital pathology | 胃癌 | 转录组分析、单细胞转录组测序、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 | NA | 转录组数据、图像 | NA | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 73 | 2026-09-20 |
Experimental study of tumor-associated macrophage-derived SPP1 inhibit CD8+ T cells to promote Colorectal cancer progression
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101276
PMID:41633116
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组分析,揭示了肿瘤相关巨噬细胞来源的SPP1通过CD44信号抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化,从而促进结直肠癌进展 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学鉴定出高表达SPP1的肿瘤相关巨噬细胞亚群,并阐明TAM来源的SPP1通过CD44介导的LCK-ZAP70-LAT信号通路抑制CD8⁺ T细胞向Tc1分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验,缺乏临床患者样本验证,且SPP1-CD44轴的具体下游分子机制仍需进一步探讨 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在结直肠癌免疫微环境中的免疫调节作用及其分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞和CD8⁺ T细胞,以及MC38细胞系和CL2MDP脂质体处理的巨噬细胞清除小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2026-09-20 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101281
PMID:41655499
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研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量RNA测序数据,揭示了乳腺癌中肥大细胞基于精氨酸代谢的异质性,并识别出与精氨酸代谢相关的标志物 | 首次基于精氨酸代谢活性将乳腺癌中的肥大细胞分为高活性和低活性两个亚群,揭示了HAS细胞在TNBC中的富集及其促肿瘤机制,并构建了五基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,功能验证仅限于OAT基因,其他模型基因的功能尚未验证,且缺乏前瞻性临床试验数据 | 探究精氨酸代谢是否定义了乳腺癌中转录和功能上不同的肥大细胞亚群,并揭示其在肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌(BRCA)特别是三阴性乳腺癌(TNBC)中的肥大细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | LASSO-Cox, Seurat-Louvain聚类, Monocle2, CellChat, hdWGCNA | 图像, 文本 | 272,592个细胞(GSE161529);空间转录组数据(GSE243022);批量RNA-seq数据(TCGA, GSE42568) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | 10x Chromium, Illumina测序平台 | 10x Chromium单细胞3'端文库构建,Illumina平台测序,空间转录组使用10x Visium |
| 75 | 2026-09-20 |
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101286
PMID:41666535
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研究论文 | 该研究探究了长期他莫昔芬治疗对乳腺癌肺转移微环境形成的影响,发现其通过重塑脂质驱动的肺纤维化微环境促进肿瘤转移 | 首次揭示长期他莫昔芬治疗可通过诱导肺纤维化和脂质代谢重编程重塑转移微环境,进而促进ER阳性乳腺癌肺转移,并提出靶向脂质代谢可能作为限制转移的治疗策略 | 研究主要基于PyMT和4T1小鼠同种移植模型,尚需进一步在人类临床样本中验证;他莫昔芬促进转移的具体分子机制仍需深入探究 | 探究长期他莫昔芬治疗对乳腺癌转移微环境形成的影响及其潜在机制 | ER阳性乳腺癌小鼠模型(PyMT和4T1同种移植模型)及他莫昔芬处理后的肺组织 | 肿瘤生物学、单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫荧光、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、图像 | PyMT和4T1同种移植小鼠模型的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 76 | 2026-09-20 |
SMARCA4 deficiency in glioblastoma: Mitochondrial transfer from MSCs and the clinical dilemma in targeting the tumor microenvironment
2026-03, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101288
PMID:41692001
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研究论文 | 该研究探讨了SMARCA4在胶质母细胞瘤进展中的作用,重点关注肿瘤微环境中间充质基质细胞的线粒体转移 | 首次揭示了SMARCA4缺陷的间充质基质细胞通过微管依赖性线粒体转移促进胶质母细胞瘤生长的机制 | 研究主要基于体外实验和免疫缺陷异种移植模型,需要进一步验证在人体中的适用性 | 探究SMARCA4表达与胶质母细胞瘤进展的相关性及其在肿瘤微环境中的作用 | 胶质母细胞瘤细胞、间充质基质细胞、免疫缺陷小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2026-09-20 |
From noise to models to numbers: Evaluating negative binomial models and parameter estimations in single-cell RNA-seq
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014014
PMID:41838800
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研究论文 | 本文通过计算效率高的模型选择技术,探讨了单细胞RNA测序数据中负二项分布模型与基因表达动力学参数之间的关系,并评估了参数估计的准确性。 | 揭示了负二项分布广泛适用的参数范围,并指出其拟合良好并不唯一指示转录爆发;同时发现即使校正技术噪声后,爆发参数估计仍存在较大误差,但爆发频率的基因排序相对可靠。 | 研究主要基于模拟数据,实际scRNA-seq数据的验证有限;参数估计误差较大,尤其在小样本情况下;未全面考虑所有可能的噪声来源和模型复杂性。 | 探究负二项分布模型在scRNA-seq数据中广泛适用的原因,评估其与基因表达动力学参数的关系及参数估计的准确性。 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达计数分布,以及模拟生成的基因表达数据,包括哺乳动物基因。 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 负二项分布模型、Beta-Poisson模型、泊松模型 | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-09-19 |
p21-Positive Senescent Stromal Cells Promote Prostate Cancer Immune Suppression and Progression That Can Be Reversed by Senolytic Therapy
2026-Mar-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-25-1212
PMID:41135083
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研究论文 | 该研究利用前列腺癌患者样本和小鼠模型,发现p16+和p21+衰老细胞在恶性进展中积累并与免疫抑制相关,其中p21+非肿瘤基质细胞表达最高的SASP,清除这些细胞可逆转免疫抑制并抑制肿瘤生长 | 首次揭示了p16和p21标记不同的上皮和基质衰老细胞群,发现p21+非肿瘤基质细胞表达最高的SASP,并证明靶向清除p21+衰老基质细胞可激活抗肿瘤CD8+ T细胞免疫并增强免疫检查点阻断疗效 | 摘要中未明确提及研究的具体局限性 | 探究衰老细胞在前列腺癌免疫抑制和进展中的作用,以及靶向清除衰老细胞是否可作为治疗策略 | 前列腺癌患者样本和小鼠模型 | 单细胞测序、肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | single-cell sequencing, 免疫组织化学, 流式细胞术 | NA | 单细胞测序数据、图像、文本 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-09-19 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveal Keratinocytes as Key Players in Vulvar Lichen Sclerosus Pathogenesis
2026-Mar, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.08.022
PMID:40886965
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研究论文 | 该研究利用空间转录组和单细胞转录组技术分析外阴硬化性苔藓的病变、非病变和健康皮肤,揭示角质形成细胞在发病机制中的核心作用 | 首次结合空间和单细胞转录组学揭示外阴硬化性苔藓中角质形成细胞的双重角色:既是微环境信号(如IFN-γ)的靶点,又是炎症警报素(如S100A8/9)的来源,并发现了跨多种细胞类型的统一分子变化 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 阐明外阴硬化性苔藓的分子发病机制,寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 外阴硬化性苔藓患者的病变皮肤、非病变皮肤以及健康对照者的外阴皮肤组织 | 数字病理学 | 外阴硬化性苔藓 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2026-09-16 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third trimester pregnancy
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.711478
PMID:41959409
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序结合CITE-seq技术,分析了妊娠晚期孕妇血液和蜕膜中CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组,揭示了IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 首次在妊娠晚期对血液和蜕膜CD4+ T细胞进行高维多组学分析,整合了超过350种表面蛋白筛选与单细胞转录组及CITE-seq抗体标记数据,发现了IL-6/IL-6R信号轴的扰动以及蜕膜CD69+组织驻留样CD4+ T细胞中RUNX3表达增加 | 样本仅来自足月妊娠(>37周),未涵盖早产或妊娠并发症样本,无法直接验证差异性表达的免疫特征与妊娠并发症之间的因果关系 | 理解妊娠期间CD4+ T细胞的表面蛋白质组和转录组变化,揭示其在胎盘发育过程中的适应与调控机制 | 足月妊娠(>37周)孕妇的血液和蜕膜CD4+ T细胞,以及非妊娠女性血液CD4+ T细胞 | 单细胞多组学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据, 转录组数据 | 足月妊娠孕妇血液和蜕膜样本及非妊娠女性血液样本,筛选超过350种表面蛋白,单细胞转录组分析使用超过130种CITE-seq条形码抗体 | NA | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | NA |