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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-05-12 |
Bisphenol a exposure and major depressive disorder: an integrative analysis combining network toxicology, molecular docking, genetic epidemiology, and transcriptomic validation
2026-Mar-30, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-03862-5
PMID:41912493
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研究论文 | 整合网络毒理学、分子对接、遗传流行病学和转录组学验证分析双酚A暴露与重度抑郁症的关系 | 首次综合运用网络毒理学、基于汇总数据的孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、分子对接和实验验证等多维方法,系统揭示双酚A暴露导致重度抑郁症的分子机制 | 未提及具体局限性 | 探究双酚A暴露对重度抑郁症的潜在毒理学机制 | 双酚A暴露与重度抑郁症相关的分子靶点及因果机制 | 机器学习 | 重度抑郁症 | 网络毒理学, 分子对接, 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析, 批量RNA测序, 酶联免疫吸附测定, 定量实时聚合酶链反应 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2026-05-12 |
Antagonistic SMAD2/3 control of TIMP-1, VEGF-A, and hypoxia signaling in myofibroblasts shapes histotype-specific angiogenesis in lung cancer
2026-Mar-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08677-2
PMID:41912498
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研究论文 | 研究发现肺癌相关肌成纤维细胞中SMAD2/3对TIMP-1、VEGF-A和缺氧信号通路的拮抗调控决定了肺癌组织学亚型特异的血管生成模式 | 首次揭示了肿瘤相关肌成纤维细胞通过SMAD3依赖的TIMP-1和VEGF-A过量产生驱动肺腺癌血管生成,而鳞状细胞癌中SMAD2补偿性上调导致血管生成能力减弱 | 未明确提及研究的局限性 | 探究肿瘤相关肌成纤维细胞在非小细胞肺癌两种主要组织学亚型中调控血管生成的机制 | 肿瘤相关肌成纤维细胞、非小细胞肺癌患者样本、内皮细胞 | machine learning | lung cancer | RNA-seq, scRNA-seq, 血管生成检测阵列, 遗传扰动 | NA | 转录组数据、血管生成功能数据 | 多个患者队列 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-05-12 |
Spatial transcriptomics in the human adult ovary: insights into key signalling pathways during follicular atresia
2026-Mar-26, Human reproduction (Oxford, England)
DOI:10.1093/humrep/deag051
PMID:41886635
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研究论文 | 利用空间转录组学探究人类成年卵巢中卵泡闭锁期间WNT、TGFβ/BMP、NOTCH和HH等关键信号通路 | 首次应用空间转录组学技术研究人类卵巢卵泡闭锁,揭示了不同卵泡类型中关键信号通路的动态变化 | 研究基于跨性别男性捐赠者的卵巢组织,无法排除睾酮治疗对卵泡动力学的影响 | 阐明WNT、TGFβ/BMP、NOTCH和HH信号通路在人类成年卵巢卵泡闭锁进程中的作用 | 人类卵巢组织中的健康与不同闭锁阶段的小窦状卵泡 | 生物信息学 | 妇科疾病 | 空间转录组学、单分子荧光原位杂交 | NA | 空间转录组数据 | 6名捐赠者的16个卵巢组织区域,包含21个直径0.5-4毫米的小窦状卵泡 | Resolve BioSciences | 空间转录组学 | Molecular Cartography平台 | Resolve BioSciences Molecular Cartography平台,冷冻切片上多重单分子荧光原位杂交 |
| 64 | 2026-05-12 |
CXCR6+ T cells promote apoptosis and necroptosis in proximal tubules during AKI-to-CKD transition
2026-Mar-24, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08644-x
PMID:41876471
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研究论文 | 本研究利用小鼠模型,整合批量及单细胞RNA测序与免疫组化和蛋白质分析,揭示了CXCR6+ T细胞在急性肾损伤向慢性肾脏病转化过程中通过促进近端肾小管凋亡和坏死性凋亡的作用机制 | 首次鉴定CXCR6+ T细胞作为免疫驱动肾小管细胞死亡的关键介质,并揭示CXCL16-CXCR6轴在适应不良修复中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的验证有限 | 探索免疫浸润如何促进肾小管损伤和细胞死亡,特别是急性肾损伤向慢性肾脏病转化过程中的机制 | 近端肾小管细胞和T细胞(特别是CXCR6+ T细胞) | 机器学习 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-05-12 |
Dynamic changes of the immune microenvironment in ovarian cancer following neoadjuvant chemotherapy
2026-Mar-23, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03070-6
PMID:41872134
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研究论文 | 本研究探讨高级别浆液性卵巢癌在新辅助化疗后免疫微环境的动态变化,揭示前列腺素介导的免疫抑制微环境在化疗耐药中的关键作用 | 首次揭示前列腺素在卵巢癌化疗后免疫抑制微环境形成中的关键作用,并发现顺铂联合前列腺素特异性抑制剂可显著提高治疗效果 | 主要基于公开的scRNA-seq数据和体外体内实验验证,临床样本来源有限 | 探索卵巢癌新辅助化疗后免疫微环境变化及化疗耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者肿瘤样本及小鼠模型 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自公开数据集的卵巢癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-05-12 |
TRIM21-Mediated ubiquitination of FBL suppresses PI3K/AKT signaling and tumor progression in clear cell renal cell carcinoma
2026-Mar-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-026-06113-4
PMID:41863623
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research paper | 本研究揭示了TRIM21介导的FBL泛素化通过调控PI3K/AKT信号通路抑制透明细胞肾细胞癌的肿瘤进展 | 首次发现TRIM21作为FBL的新型E3泛素连接酶,通过K48连接的多聚泛素化修饰FBL的K292位点,促进其蛋白酶体降解,从而抑制PI3K/AKT信号通路 | 未提及具体局限性 | 探究FBL在透明细胞肾细胞癌中的致癌机制及其与TRIM21的相互作用 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)细胞及其肿瘤组织样本 | machine learning | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组学、蛋白质组学、免疫沉淀-质谱联用、分子对接 | NA | 单细胞转录组数据、批量转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2026-05-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
|
研究论文 | 组蛋白乳酸化驱动的正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌变 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录促进嘧啶生物合成,形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 具体局限性未在摘要中提及 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌变中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织及细胞 | 计算机视觉 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq | NA | 图像, 文本 | 涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用CUT&Tag、单细胞RNA测序、ChIP-qPCR等技术 |
| 68 | 2026-05-12 |
A microfluidic-engineered vascularized endometrium micro-organoid platform for functional repair of intrauterine adhesion
2026-03-18, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/ae4f26
PMID:41802406
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研究论文 | 提出一种微流控生物制造策略,构建血管化子宫内膜微类器官,用于修复宫腔粘连 | 利用微流控技术共包封子宫内膜基质细胞、上皮类器官和内皮细胞,构建具有血管结构的类器官,并通过转录组和单细胞测序揭示内皮细胞缓解缺氧炎症和促进上皮稳态的机制 | 研究中未提及具体局限性,可能包括临床转化中的规模化和长期效果评估不足 | 开发可再生的血管化子宫内膜微类器官平台,用于子宫内膜修复和疾病建模 | 人子宫内膜基质细胞、上皮类器官、内皮细胞(HUVECs) | 数字病理学 | 妇科疾病(宫腔粘连) | 微流控生物制造、转录组测序、单细胞测序 | NA | 转录组数据、单细胞数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 69 | 2026-05-12 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
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研究论文 | 本研究探讨了胰腺癌中经典和非经典NF-κB信号通路转录活性的表观遗传背景依赖性 | 发现RELA和RELB在不同染色质可及性区域结合,RELB与AP1基序共定位,揭示TNFα和TWEAK分别通过RELA和RELB调控不同转录程序 | 未完全阐明上游信号激活机制及体内功能验证 | 阐明胰腺导管腺癌中RELA和RELB的差异激活和功能 | 胰腺导管腺癌细胞系和原发肿瘤组织 | 机器学习 | 胰腺癌 | RNA-seq, ChIP-seq, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 表观基因组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-05-12 |
Lysine attenuates acute lung injury by restoring α-tubulin acetylation and ciliary activity
2026-Mar-16, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03025-x
PMID:41839843
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序分析与靶向血浆代谢组学,发现赖氨酸在急性肺损伤中显著减少,补充赖氨酸可通过恢复α-微管蛋白乙酰化与纤毛活性减轻肺损伤 | 首次揭示赖氨酸通过乙酰辅酶A恢复α-微管蛋白乙酰化,调节纤毛TRPC1定位进而阻断钙内流与上皮修复受损,将氨基酸代谢与纤毛信号相连接 | 具体机制有待阐明,特别是赖氨酸代谢在肺泡上皮不同细胞亚型间的精细调控及其临床转化需进一步验证 | 探究氨基酸代谢中的赖氨酸在急性肺损伤后肺泡上皮修复中的作用及其分子机制 | 急性肺损伤患者样本、小鼠及非人灵长类ALI模型 | 机器学习 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序、靶向血浆代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据及代谢物数据 | 人类ALI样本及对应小鼠与灵长类实验动物 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 71 | 2026-05-12 |
MAPK14/SLC7A11/GPX4 axis dysregulation drives podocyte ferroptosis via mediating glycerophospholipid metabolism
2026-Mar-11, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-02990-7
PMID:41813669
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研究论文 | 通过综合多组学方法解析糖尿病肾病的细胞特异性发病机制,发现足细胞铁死亡及MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调的关键作用,并验证了黄芪甲苷IV的治疗潜力 | 首次通过单细胞RNA测序与空间代谢组学等多组学整合,揭示足细胞铁死亡在糖尿病肾病中的核心驱动作用,并锁定MAPK14/SLC7A11/GPX4轴失调机制 | 未提及具体研究局限性 | 探索糖尿病肾病的细胞特异性病理机制及潜在治疗靶点 | 人类糖尿病肾脏组织及足细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间代谢组数据, 临床代谢组数据 | 人类糖尿病肾脏样本(具体数量未提及) | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 空间代谢组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序,Illumina NovaSeq高通量测序 |
| 72 | 2026-05-12 |
RPS26 Expression as a Predictive Biomarker and Functional Modulator in Sublingual Immunotherapy for Japanese Cedar Pollinosis
2026-Mar-06, International archives of allergy and immunology
IF:2.5Q3
DOI:10.1159/000551442
PMID:41790586
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研究论文 | 研究核糖体蛋白基因RPS26表达作为日本柳杉花粉症舌下特异性免疫治疗疗效的预测性生物标志物及功能调节因子 | 首次通过单细胞RNA测序发现RPS26表达与SLIT临床应答密切相关,并揭示其通过调控IL-10表达和Treg细胞稳定性参与免疫耐受 | 样本量较小(35例患者),且RPS26并非普遍适用的预测性生物标志物,需更大规模前瞻性研究验证其临床效用 | 确定RPS26表达是否有助于SLIT疗效,并明确其在T细胞动力学、细胞因子产生和表观遗传调控通路中的作用 | 日本柳杉花粉症患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 过敏性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 35例患者(治疗前),其中26例配对样本(治疗1年后) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序 |
| 73 | 2026-05-12 |
Transcriptional factor ZMYM3 promotes hepatocellular carcinoma metastasis by upregulating CTTN and inducing invadopodia formation
2026-Mar-03, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08506-6
PMID:41775697
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研究论文 | 研究发现转录因子ZMYM3通过上调CTTN并诱导侵足形成促进肝细胞癌转移 | 首次揭示ZMYM3在肝细胞癌中上调并通过直接结合CTTN启动子促进侵足形成和上皮间质转化,从而增强肿瘤侵袭和转移能力 | 研究仅限于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内模型验证及ZMYM3作为治疗靶点的直接证据 | 探究ZMYM3在肝细胞癌侵袭和转移中的分子机制,以寻找有效治疗策略 | 肝细胞癌组织样本、门静脉癌栓样本以及HCC细胞系 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA测序、染色质免疫沉淀测序、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、测序数据 | TCGA和GEO数据集中的肝细胞癌样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2026-05-12 |
PlantscRNAdb 4.0: Improved marker identification and annotation under a cell-type uniformity for plants
2026-03-02, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.12.026
PMID:41449796
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研究论文 | PlantscRNAdb 4.0数据库更新,引入新的植物细胞类型本体(POCT)和HCMarker工具,覆盖33个植物物种,提供标准化和精确的细胞类型注释 | 引入植物细胞类型本体(POCT)以实现统一的细胞类型命名,开发HCMarker多指标评分系统用于高置信度标记基因鉴定,并推出PCmaster_anno深度学习工具以自动注释植物细胞类型 | 未提及具体局限性 | 改善植物单细胞RNA-seq数据的标记基因鉴定和细胞类型注释标准化 | 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 深度学习 | 基因表达数据 | 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2026-05-10 |
The tumor-associated fibroblasts regulate urothelial carcinoma progression
2026-Mar-19, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaf032
PMID:40973873
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间增强分辨率组学测序和UTUC免疫荧光芯片队列构建了CAFs的综合微环境图谱,并研究了CAFs在UTUC进展中的作用 | 首次构建上尿路上皮癌中肿瘤相关成纤维细胞的全面微环境图谱,并通过多组学技术揭示其与肿瘤细胞亚群的相互作用信号及共同预后标志物 | 研究仅基于有限样本和特定平台,未涉及功能性验证或临床干预实验 | 阐明肿瘤相关成纤维细胞在上尿路上皮癌进展中的调控机制及与膀胱尿路上皮癌的共享预后标志物 | 上尿路上皮癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关成纤维细胞亚群及肿瘤上皮细胞 | 数字病理学 | 上尿路上皮癌、膀胱尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、空间增强分辨率组学测序、免疫荧光芯片 | NA | 基因表达数据、空间转录组学数据、免疫荧光图像 | 包含UTUC免疫荧光芯片队列的多组学样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序和单细胞核RNA测序使用10x Chromium平台,空间增强分辨率组学测序使用特定空间平台 |
| 76 | 2026-05-10 |
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-03, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09989-7
PMID:41639465
|
研究论文 | 通过构建CD8 T细胞状态图谱,系统定义驱动T细胞程序分化的转录因子 | 首次整合转录组和表观遗传数据构建九种CD8 T细胞状态图谱,结合体内CRISPR筛选与单细胞测序发现新型TEX选择性转录因子ZSCAN20和JDP2 | 未明确说明局限性 | 系统定义驱动CD8 T细胞状态分化的转录因子,为精准工程化T细胞免疫治疗提供平台 | CD8 T细胞的多种分化状态(包括终末耗竭T细胞、组织驻留记忆T细胞等) | 自然语言处理 | 癌症 | CRISPR筛选、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、表观遗传数据 | 九种CD8 T细胞状态的数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 77 | 2026-05-09 |
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04836-1
PMID:41904745
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研究论文 | 通过整合转录组分析,发现IGSF9驱动恶性转化并可预测早期肺腺癌 | 首次发现IGSF9作为早期肺腺癌的诊断生物标志物,并揭示其在恶性转化中的多重作用,包括免疫逃逸、肿瘤细胞迁移和侵袭以及干细胞样AT2亚群向恶性状态的转化 | 未明确阐述研究样本数量、平台具体配置等细节,可能需要在更大规模队列中验证 | 阐明早期肺腺癌的分子机制并识别有效的诊断生物标志物 | 早期肺腺癌患者样本及肿瘤微环境中的肺泡细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 肺腺癌 | scRNA-seq,机器学习 | 随机森林和LASSO | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2026-03-28 |
Preterm birth skews the developmental trajectory of myeloid-derived suppressor cells in the first 48 hours of life: single-cell transcriptomics and inferred intercellular communication
2026-Mar-27, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-026-01459-8
PMID:41888646
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 79 | 2026-05-09 |
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04916-2
PMID:41894110
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研究论文 | 通过多组学数据分析和验证结直肠癌肝转移中的肥大细胞及其富集基因的作用 | 首次结合批量测序和单细胞RNA测序数据,系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化,并构建基于三个富集基因(APOC1、SPP1、CLU)的预测模型 | 未明确提及样本来源或外部验证的局限性,可能缺少对不同亚型肥大细胞的深入功能验证 | 确定肥大细胞及富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 | 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌、肝转移 | 批量测序、单细胞RNA测序、免疫组化 | 预测模型(基于基因表达) | 基因表达数据、组织样本图像 | 四个批量测序数据集共223个样本,一个单细胞RNA测序数据集,以及临床样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-05-09 |
Transcriptional mechanisms of sex-biased gene expression and their connections to disease-associated variation
2026-Mar-23, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddag019
PMID:41934611
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研究论文 | 利用单细胞RNA-seq分析480个淋巴母细胞系,发现1200个性别偏向表达基因及其与疾病关联的转录调控机制 | 首次大规模系统揭示性别偏向表达的转录调控机制,发现4个X染色体剂量调控的转录因子(FOSL1、ZNF730、ZFX、ZNF726)贡献了79%的性别偏向表达,并鉴定了2390个性别偏向eQTL及其在多种疾病中的富集 | 独立数据集的验证结果较为有限,且主要基于淋巴母细胞系数据,组织特异性验证仅部分覆盖 | 探究人类性别差异表达的转录调控机制及其与疾病遗传变异的关联 | 480个人类淋巴母细胞系(LCLs)以及来自GTEx项目的多种组织样本 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq | 线性模型 | 转录组 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |