单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 761 - 780 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
761 2026-03-25
CCR8 Expression on Regulatory T Cells Reveals Trajectories of Tissue Adaptation and Protects Against Myocardial Infarction-Induced Tissue Damage
2026-Mar-24, Circulation IF:35.5Q1
研究论文 本研究揭示了心肌梗死后心脏内调节性T细胞的组织适应轨迹,并发现CCL1-CCR8轴对于Treg的募集和功能至关重要,从而保护心肌免受损伤 首次描绘了Treg从纵隔淋巴结到心脏的分化轨迹,并确立了CCL1-CCR8轴作为Treg募集和发挥心脏保护功能的关键通路 研究主要基于小鼠模型,人类样本的验证仍需进一步扩大样本量以确认临床普适性 探究心肌梗死后心脏特异性调节性T细胞的发育轨迹、募集机制及其在心脏修复中的作用 小鼠心肌梗死模型、调节性T细胞、CCR8和CCL1基因修饰小鼠、以及心肌梗死患者的血液和心脏组织 免疫学 心血管疾病 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA RNA测序数据 涉及多种基因修饰小鼠模型及人类心肌梗死患者样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
762 2026-03-25
In Situ Needle-Free Injection of Multiretention Micelles for Melanoma Therapy with Multiomics Insights into Tumor Targeting and Immune Modulation
2026-Mar-24, ACS nano IF:15.8Q1
研究论文 本文报道了一种用于黑色素瘤治疗的无针原位注射多滞留纳米胶束平台,并通过多组学分析揭示了其靶向肿瘤和调节免疫的双重作用机制 开发了一种结合热触发局部沉积、pH响应释放和叶酸受体靶向的多滞留纳米胶束,并首次采用无针注射方式递送,同时利用单细胞测序、空间转录组学和蛋白质组学等多组学技术深入解析了其直接抑制肿瘤和重塑免疫微环境的双重作用机制 NA 开发一种新型的黑色素瘤治疗策略,旨在提高紫杉醇的局部暴露、减少全身毒性并增强抗肿瘤效果 黑色素瘤 数字病理学 黑色素瘤 单细胞测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
763 2026-03-25
Tissue-restricted secondary TCR engagement drives the transition from stem-like to CD200+ Egr2hi arthritogenic Th17 cells
2026-Mar-23, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体分析,揭示了关节炎致病性T17细胞的异质性及其向高度致病状态转变的关键调控机制 首次发现关节组织中限制性的次级TCR信号是驱动T17细胞从干细胞样状态向CD200+ Egr2hi高度致病状态选择性转变的关键决定因素,而非炎症信号的默认进程 研究基于小鼠自身免疫性关节炎模型,其在人体中的普适性仍需验证 探究自身免疫性关节炎中致病性T17细胞的异质性、发育轨迹及其增强致病性的机制 关节组织中的CD4 T细胞,特别是白介素-17产生的辅助T细胞和调节性T细胞 单细胞组学 自身免疫性关节炎 单细胞RNA测序,谱系追踪,T细胞受体库分析 NA 单细胞转录组数据,TCR序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
764 2026-03-25
kUncited referencesCo-localization analysis of spatial transcriptomics in ligand-receptor pairs from tumor microenvironment
2026-Mar-21, Critical reviews in oncology/hematology
综述 本文综述了基于空间转录组学的共定位分析在肿瘤微环境中配体-受体对研究中的应用、计算方法和未来前景 系统性地整合了空间原位信息以提升配体-受体对分析的准确性,并探讨了人工智能技术在该领域的应用潜力 作为一篇综述文章,未提出新的实验方法或模型,主要基于现有文献进行总结和展望 探讨空间转录组学共定位分析在识别肿瘤微环境中细胞间相互作用(特别是配体-受体对)中的应用价值 肿瘤微环境中的细胞间相互作用及配体-受体对 空间转录组学 肿瘤 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
765 2026-03-25
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 提出了一套端到端的scGPT微调协议,实现了自动化数据处理、模型微调和评估,并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 需要用户具备基本的生物信息学知识,对Python和Linux有最低要求 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战,特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 Transformer (scGPT) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
766 2026-03-25
Integrating Single-Cell RNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Ischemic Injury Promoting Polyomavirus Replication by DNA Damage Response
2026-Mar, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,揭示了缺血性损伤通过激活DNA损伤应答通路促进多瘤病毒复制的分子机制,并鉴定出CDK1为关键枢纽基因 首次结合单细胞与批量转录组数据,系统解析缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子通路,并跨物种验证CDK1的关键作用 研究主要基于测序数据的生物信息学分析,实验验证部分仅限于细胞水平的siRNA敲降,缺乏动物模型或临床样本的进一步验证 阐明缺血性损伤促进BK多瘤病毒复制的分子机制,寻找关键调控通路和基因 BK多瘤病毒(BKPyV)及其在肾移植患者中的再激活机制 生物信息学 肾移植相关病毒感染 单细胞RNA测序,批量RNA测序,siRNA敲降实验 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
767 2026-03-25
Systems Biology of Metabolic Dysregulation in Ankylosing Spondylitis Using scRNA-Seq Data
2026-Mar, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,通过构建基因组尺度代谢模型,分析了强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的代谢失调,并识别了关键的蛋白质相互作用网络重连 整合单细胞RNA测序与基因组尺度代谢模型,首次在强直性脊柱炎中系统量化免疫细胞类型的代谢通路活性和反应通量差异,并识别了跨细胞类型的重连蛋白质枢纽 研究基于外周血单个核细胞,可能无法完全反映疾病在关节等靶组织中的局部代谢变化,且样本量未明确说明 揭示强直性脊柱炎的免疫细胞代谢重编程机制,以发现转化治疗靶点和生物标志物 强直性脊柱炎患者和健康对照的外周血单个核细胞,包括CD14单核细胞、CD4记忆T细胞、CD4初始T细胞和CD8 T细胞等免疫细胞亚型 系统生物学 强直性脊柱炎 单细胞RNA测序 基因组尺度代谢模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
768 2026-03-24
IL-4 treatment induces apoptosis of blood monocytes and proliferation of recruited injury-associated macrophages to resolve liver injury
2026-Mar-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了IL-4在急性肝损伤模型中的作用机制,发现其通过诱导血液单核细胞凋亡和促进损伤相关巨噬细胞增殖来促进肝损伤修复 揭示了IL-4治疗通过改变损伤相关髓系细胞的组成、数量和功能来促进肝损伤修复的新途径 研究主要基于小鼠模型,人类应用需进一步验证;未详细探讨IL-4在其他器官损伤中的普适性 阐明IL-4在肝损伤修复中的治疗机制 小鼠急性肝损伤模型中的髓系细胞(单核细胞和巨噬细胞) NA 肝损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA single-cell RNA-seq NA NA
769 2026-03-24
Methods of muscle atrophy analysis at the single-nucleus level
2026-Mar-20, Mechanisms of ageing and development IF:5.3Q1
研究论文 本文介绍了一种针对骨骼肌的组织解离和细胞核分离的详细协议,并概述了适用于单细胞核RNA测序数据的生物信息学分析流程 优化了骨骼肌的单细胞核RNA测序样本制备方法,并提供了针对肌肉萎缩状态的转录组比较分析流程 NA 研究肌肉萎缩的分子机制,特别是在衰老和神经肌肉病理条件下的肌肉功能衰退 骨骼肌组织,特别是肌肉纤维的细胞核 数字病理学 老年疾病 单细胞核RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
770 2026-03-24
Reactive astrocyte subpopulations with high Gfap and C4b expression in different Alzheimer's disease mouse models: Single-cell nuclear transcriptome analysis
2026-Mar-14, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞核转录组测序分析,在阿尔茨海默病小鼠模型中识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并揭示了其在疾病早期发病机制中的潜在作用 首次在阿尔茨海默病小鼠模型中,利用单细胞核转录组测序技术,识别出具有高Gfap和C4b表达的反应性星形胶质细胞亚群,并发现其与RNA剪接通路相关,为疾病异质性提供了新的细胞和分子基础 研究样本量较小(仅涉及4只阿尔茨海默病模型小鼠和1只对照小鼠),且仅基于小鼠模型,可能无法完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性 探究阿尔茨海默病早期阶段的细胞异质性和细胞类型特异性分子扰动,以识别新的靶向治疗策略 阿尔茨海默病小鼠模型(载脂蛋白E4敲入和淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠)的海马组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞核转录组测序 NA 转录组数据 4只阿尔茨海默病模型小鼠(3只8月龄淀粉样前体蛋白/早老素1小鼠和1只6月龄载脂蛋白E4敲入小鼠)和1只6月龄载脂蛋白E3敲入对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
771 2026-03-24
Candidate pharmacogenetic signals at CCL2 and ITPA associated with JAK inhibitor response in Taiwanese rheumatoid arthritis
2026-Mar-12, Clinical and experimental rheumatology IF:3.4Q2
研究论文 本研究旨在通过遗传学和单细胞分析,识别与台湾类风湿关节炎患者对JAK抑制剂治疗反应相关的候选基因信号 整合了候选SNP分析、细胞类型特异性eQTL资源(scQTLbase)和单细胞RNA测序数据,以支持基因水平关联,并优先确定了CCL2和ITPA作为JAK抑制剂反应的候选药物遗传学信号 研究使用基于持续性的有效性终点,且次要EULAR结果评估为探索性,需要独立复制使用标准化ACR/EULAR结果 识别台湾类风湿关节炎患者中JAK抑制剂有效性的遗传预测因子 台湾类风湿关节炎患者 自然语言处理 类风湿关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 遗传数据、单细胞RNA测序数据 275名接受JAK抑制剂治疗的RA患者(有效组217人,无效组58人) NA 单细胞RNA测序 NA NA
772 2026-03-24
A Zero-Inflated Hierarchical Generalized Transformation Model to Address Non-Normality in Spatially-Informed Cell-Type Deconvolution
2026-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT),用于解决口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的非正态性和高零膨胀问题,以改进细胞类型反卷积的准确性 开发了零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)作为辅助贝叶斯技术,结合条件自回归反卷积(CARD)框架,首次解决了OSCC空间转录组数据的高零膨胀问题,并量化了细胞类型比例估计的不确定性 NA 改进口腔鳞状细胞癌(OSCC)空间转录组数据中的细胞类型反卷积方法,以更准确地解析肿瘤微环境 口腔鳞状细胞癌(OSCC)的空间转录组数据 数字病理学 口腔鳞状细胞癌 空间转录组学 零膨胀分层广义变换模型(ZI-HGT)与条件自回归反卷积(CARD)结合 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
773 2026-03-24
Hormone signaling and immune programs define differential endocrine responsiveness in high-risk breast tissue
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学,揭示了激素信号和免疫程序作为乳腺组织内分泌反应性的关键决定因素 首次在背景实质强化(BPE)背景下,结合单核RNA测序和空间转录组学技术,识别出激素驱动和免疫相关上皮细胞程序,并验证了它们对内分泌治疗的不同敏感性 研究样本可能有限,未详细说明BPE患者亚组的临床特征或长期随访结果 探究乳腺组织中内分泌反应性的决定因素,以解释与癌症预防相关的放射学标记 高风险乳腺组织,特别是与背景实质强化(BPE)相关的组织 数字病理学 乳腺癌 单核RNA测序,空间转录组学 NA RNA测序数据,空间转录组数据 NA NA 单核RNA测序,空间转录组学 NA NA
774 2026-03-24
Mechanistic insights into B-cell activation and autoreactivity regulation in active SLE and remission
2026-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了活动性系统性红斑狼疮、药物免费缓解期和健康对照中B细胞的分子机制,揭示了疾病活动与缓解的免疫特征 首次在单细胞水平上定义了活动性SLE与缓解期B细胞的转录组差异,并识别了与“免疫重置”状态相关的特定B细胞亚群和信号通路 研究样本量有限,且仅分析了外周血B细胞,未涉及组织驻留细胞或其他免疫细胞类型 阐明活动性系统性红斑狼疮与缓解期之间的细胞和分子机制差异 系统性红斑狼疮患者(活动期和缓解期)及健康对照的外周血B细胞 单细胞组学 系统性红斑狼疮 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 三个队列:活动性SLE患者、长期药物免费缓解期SLE患者和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
775 2026-03-24
Spontaneous aging-associated inflammation and genome instability in the immune system of turquoise killifish
2026-Mar, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,探讨了短寿命脊椎动物绿松石鳉鱼免疫系统中的自发衰老相关炎症和基因组不稳定性 首次在绿松石鳉鱼中系统揭示了免疫系统随年龄变化的分子和细胞特征,包括炎症增加和DNA损伤积累 研究局限于鳉鱼模型,可能不完全适用于人类衰老机制 探究鳉鱼免疫系统衰老的分子和细胞基础,以开发针对免疫系统的抗衰老干预策略 绿松石鳉鱼的肾脏骨髓细胞和血浆 单细胞组学 衰老相关疾病 单细胞RNA测序, 细胞计数, 体外功能实验, 蛋白质组学分析 NA RNA序列数据, 蛋白质组数据 年轻成年和老年鳉鱼的肾脏骨髓细胞及血浆样本 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 NA NA
776 2026-03-23
CD4+ T cells in Type 1 Diabetes: Inferring Stage-specific Dysregulation from scRNA-seq
2026-Mar-21, Genomics, proteomics & bioinformatics
研究论文 本研究通过对1型糖尿病儿童、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞进行大规模单细胞转录组分析,揭示了疾病不同阶段的特异性免疫失调特征 首次通过大规模单细胞转录组分析系统描绘了1型糖尿病不同疾病阶段的系统性免疫重塑图谱,并识别出阶段特异性的免疫特征和细胞间通讯变化 研究样本仅来自儿童外周血,未涉及胰腺组织或其他器官;观察性研究无法确定因果关系;样本量虽大但仍需进一步验证 阐明1型糖尿病的细胞和分子机制,识别疾病阶段的特异性免疫失调特征 1型糖尿病儿童患者、一级亲属及健康对照的外周血单个核细胞 单细胞组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 大规模样本(具体数量未明确说明),包括儿童T1D患者、一级亲属和健康对照 NA 单细胞RNA-seq NA NA
777 2026-03-23
RARRES1 marks an immune-cold, chemoresistance-associated malignant epithelial subpopulation enriched in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-19, Cancer immunology, immunotherapy : CII
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,识别了胰腺导管腺癌中一个与化疗耐药和免疫抑制相关的恶性上皮亚群,并确定RARRES1为其核心上调基因及新的泛癌预后生物标志物 首次在PDAC中鉴定出一个富含于进展性疾病和肝转移样本的恶性上皮亚群,该亚群具有免疫冷表型,并发现RARRES1作为其核心调控基因及新的泛癌预后生物标志物 样本量相对较小(27个样本),功能验证主要基于吉西他滨耐药细胞,需进一步在更大队列和体内模型中验证 探究胰腺导管腺癌化疗耐药和免疫逃逸的细胞机制,识别关键恶性上皮亚群及其分子驱动因素 胰腺导管腺癌患者样本(包括初治、化疗暴露的原发肿瘤和肝转移样本)及吉西他滨耐药细胞 单细胞组学 胰腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拷贝数变异推断、基因集富集分析、细胞间通讯分析、非负矩阵分解分析、药物敏感性预测、Western blotting NA 单细胞RNA测序数据、TCGA/ICGC泛癌生存数据 27个样本(包括初治和化疗暴露的原发肿瘤及肝转移样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
778 2026-03-23
Unraveling the mechanism of tripterygium glycosides tablets-induced liver injury and the protective role of total glucosides of peony from immune-metabolic dysregulation to multi-cellular cascade
2026-Mar-19, Chinese medicine IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和病理学验证,阐明了雷公藤多苷片诱导肝损伤的致病性铁-脂轴及其多细胞级联机制,并揭示了白芍总苷的保护作用 首次通过单细胞RNA测序技术系统揭示了雷公藤多苷片肝损伤的致病性铁-脂轴及其多细胞级联机制,并明确了白芍总苷作为多靶点解毒剂的作用 研究基于小鼠模型,其结论在人体中的适用性有待进一步验证 探究雷公藤多苷片诱导肝损伤的机制及白芍总苷的保护作用 小鼠模型(雷公藤多苷片组、对照组、雷公藤多苷片+白芍总苷组) 单细胞组学 药物性肝损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、病理学图像 对照小鼠模型(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
779 2026-03-23
Cellular and molecular landscapes of human tendons across the lifespan revealed by spatial and single-cell transcriptomics
2026-Mar-19, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究结合组织学、单核、单细胞和空间转录组分析,揭示了人类肌腱在胚胎、胎儿和成年阶段(包括断裂肌腱)的细胞和分子景观 首次系统整合单细胞和空间转录组学,全面描绘人类肌腱生命周期中的细胞动态变化,并识别出胚胎祖细胞状态及其在发育中的分化 研究主要基于人类样本,可能受样本数量或个体差异影响,且未深入探讨治疗靶点的功能验证 探究人类肌腱在发育和衰老过程中的细胞结构和分子机制,以理解肌腱修复能力随年龄下降的原因 人类跟腱和股四头肌腱,涵盖胚胎、胎儿和成年阶段(包括断裂肌腱) 数字病理学 肌腱损伤 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 人类肌腱样本,包括胚胎、胎儿和成年阶段(具体数量未在摘要中明确) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
780 2026-03-23
Adolescent exposure to environmental silver nanoparticles induces spermatogenic impairment and Sertoli cell dysfunction: Integrative single-cell transcriptomics, metabolomics and mechanistic dissection
2026-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学、代谢组学和功能实验,系统揭示了银纳米颗粒(AgNPs)暴露对青春期大鼠睾丸的细胞重塑和生殖毒性机制 首次整合单细胞转录组学、代谢组学和体外功能实验,在单细胞分辨率下系统解析AgNPs诱导的睾丸细胞类型特异性毒性及分子机制 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本仅使用原代支持细胞,需进一步验证在人类体内的直接相关性 探究银纳米颗粒(AgNPs)暴露对男性生殖系统的毒性作用及其细胞与分子机制 青春期大鼠睾丸组织、C18-4、GC-2、TM4细胞系以及人原代支持细胞 单细胞组学 男性不育 单细胞转录组学、代谢组学、功能实验 NA 转录组数据、代谢组数据 青春期大鼠(具体数量未明确)及多种细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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