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当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-04-02
Exploring the developmental mechanisms of tea plant trichomes using genomics and single-cell transcriptome sequencing
2026-Mar, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过基因组测序和单细胞转录组测序,探索了茶树毛状体的发育机制 首次提供了三倍体茶树品种的高质量染色体级别基因组组装,并构建了木本植物的单细胞图谱,鉴定了毛状体特异性标记基因和发育轨迹 NA 探索茶树毛状体的发育机制,为茶树育种提供遗传资源 福鼎大白茶(三倍体白茶品种)及其叶片组织 基因组学 NA PacBio长读长测序、Hi-C支架、单核RNA测序 NA 基因组序列、单细胞转录组数据 叶片组织混合样本 PacBio 长读长测序、Hi-C、单核RNA-seq NA NA
702 2026-04-01
Spatial omics insights into tumor myeloid cells: roles in tumorigenesis, prognosis, and therapy
2026-Mar-31, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了空间组学技术在肿瘤相关髓系细胞研究中的应用,探讨了其在肿瘤发生、预后和治疗中的作用 整合了新兴的空间蛋白质组学和转录组学研究,识别了调控肿瘤发生、预后和治疗反应的重复性空间结构,并提出了将空间模式转化为机制理解的分析框架 NA 探讨肿瘤相关髓系细胞在肿瘤进化、临床结果和治疗反应中的空间组织作用 肿瘤相关髓系细胞,包括巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞、树突状细胞及其相关谱系 数字病理学 癌症 空间组学技术,包括空间蛋白质组学和转录组学 NA RNA和蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
703 2026-04-01
Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study
2026-Mar-30, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个多模态预后模型,用于预测接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结局 结合了深度学习、常规影像组学、临床变量以及多组学分析(包括单细胞转录组数据),构建了一个具有生物学可解释性的融合模型,实现了比现有临床模型更精细的风险分层 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;模型的外部验证和临床应用仍需进一步前瞻性研究 开发并验证一个用于预测肝细胞癌患者接受TACE治疗后生存结局的多模态预后模型 肝细胞癌患者 计算机视觉 肝细胞癌 单细胞RNA测序,多组学分析 深度学习模型,常规影像组学模型,早期融合和晚期融合模型 图像,临床数据,转录组数据 1448名肝细胞癌患者(包括TACE队列1349人,随机试验生物标志物子集41人,单细胞RNA测序队列和TCGA队列50人) NA 单细胞RNA-seq NA NA
704 2026-04-01
Visinin-like protein 1 disrupts calcium homeostasis and promotes atrial fibrillation in human and rodent models
2026-Mar-23, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1
研究论文 本研究通过整合人类心房颤动患者和啮齿动物模型的转录组学与电生理学数据,揭示了视锥蛋白样蛋白1在破坏钙稳态和促进心房颤动中的关键作用,并验证了其作为治疗靶点的潜力 首次在心肌细胞中发现并证实VILIP-1通过依赖豆蔻酰化的运输机制增加钠钙交换体1的表面丰度,从而破坏钙稳态并诱发心房颤动,并发现两种FDA批准药物可通过靶向VILIP-1或其豆蔻酰化来减轻房颤易感性 研究主要基于动物模型和体外机制探索,在人类患者中的直接干预效果和长期安全性仍需进一步临床验证 探究视锥蛋白样蛋白1在心房颤动发生发展中的作用机制,并寻找潜在的治疗靶点 人类心房颤动患者的心房组织、起搏诱导的大鼠心房颤动模型以及心房心肌细胞 心血管疾病研究 心房颤动 bulk RNA测序、单细胞转录组学、电生理学分析 NA 转录组数据、电生理数据 人类AF患者和啮齿动物AF模型(具体数量未明确说明) NA bulk RNA-seq, single-cell transcriptomics NA NA
705 2026-04-01
TNFRSF21 Orchestrates Epithelial Keratinization and Tight Junction Integrity in Periodontitis-Associated Oral Mucosal Repair
2026-Mar-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
研究论文 本研究探讨了TNFRSF21在牙周炎相关口腔黏膜修复中调控上皮角化和紧密连接完整性的关键作用 首次揭示TNFRSF21通过调控角蛋白表达和与APP相互作用,在牙周炎上皮修复中的核心调控机制 研究主要基于体外模型和小鼠实验,临床转化仍需进一步验证 阐明TNFRSF在牙周炎发病和进展中的作用,并探索上皮角化修复机制以开发临床治疗策略 牙周炎患者的牙龈组织、体外角化模型、小鼠皮肤伤口模型 单细胞组学 牙周炎 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫共沉淀 NA RNA测序数据、蛋白质相互作用数据 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、小鼠伤口模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
706 2026-04-01
STGNET: extending panel coverage in imaging-based spatial transcriptomics using deep generative adversarial networks
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本研究提出了一种名为STGNET的深度学习框架,通过结合生成对抗网络和图神经网络来扩展成像空间转录组学的基因面板覆盖范围 首次将多阶段生成对抗网络与空间感知图卷积网络相结合,通过整合物理细胞邻近性和转录相似性来优化基因插补,从而突破现有成像空间转录组技术基因面板有限的瓶颈 方法性能依赖于单细胞RNA测序数据的质量,且在极稀疏或噪声较大的空间转录组数据中可能面临挑战 开发一种能够扩展成像空间转录组学基因覆盖范围的深度学习工具,以促进更全面的空间生物学发现 成像空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌 成像空间转录组学,单细胞RNA测序 生成对抗网络,图卷积网络 空间基因表达数据 九个不同的空间转录组数据集 NA 成像空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
707 2026-03-31
SAA/FPR2 Signaling Between Pericentral Hepatocytes and Macrophages Exacerbates Zonated Liver Transplant Injury
2026-Mar-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究整合单细胞和空间转录组学、染色质可及性分析、蛋白质组学和批量RNA-seq,发现SAA/FPR2信号在肝移植缺血再灌注损伤中加剧中心周围肝细胞损伤的机制 首次揭示FOXO1/SAA/FPR2轴在中心周围肝细胞易损性中的作用,并鉴定SAA为改善肝移植后区域损伤和移植结果的可治疗靶点 未说明具体局限性 阐明肝移植中中心周围肝细胞缺血再灌注损伤的区带机制 临床肝移植标本、小鼠肝缺血再灌注损伤模型、体外实验 数字病理学 肝移植缺血再灌注损伤 单细胞转录组学, 空间转录组学, 染色质可及性分析, 蛋白质组学, bulk RNA-seq NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 临床LT标本、小鼠HIRI模型和体外实验样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
708 2026-03-31
Integrating Multi-Omics Atlas to Uncover Genetic and Epigenetic Mechanisms and Reveal Cell State Evolution Across Ecotypes in Male Urological Cancers
2026-Mar-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组学数据,系统描绘了男性泌尿系统癌症的肿瘤微环境特征,并揭示了细胞状态在不同生态型间的演化过程 首次整合多组学图谱(scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学、DNA甲基化和SNP信息)系统解析男性泌尿系统癌症的遗传和表观遗传机制,并识别了针对肿瘤细胞分化过程的潜在治疗药物 未明确说明样本的具体数量及来源,且研究结果需要在更大规模的独立队列中进行验证 揭示男性泌尿系统癌症(包括肾透明细胞癌、膀胱癌和前列腺癌)的肿瘤异质性、微环境特征及细胞状态演化的多层调控机制 男性泌尿系统癌症(肾透明细胞癌、膀胱癌、前列腺癌)的肿瘤组织 数字病理学 前列腺癌 scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学, DNA甲基化分析, SNP分析 NA 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据、空间转录组数据、表观遗传数据、基因组变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
709 2026-03-31
Multi-Omics Analysis Identified LTB4R as a Peripheral Blood Diagnostic Biomarker for Colorectal Cancer
2026-Mar-11, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合肿瘤组织和外周血的多组学数据,构建了一个新的分析框架,以识别结直肠癌的外周血诊断生物标志物 构建了一个整合肿瘤组织和外周血测序数据的新分析框架,并首次确认LTB4R基因在结直肠癌患者外周血中显著上调,揭示了其在肿瘤进展中的潜在促癌作用 未明确说明样本量大小,且研究主要基于数据分析,缺乏实验验证 构建一个整合肿瘤组织和外周血测序数据的新分析框架,以识别结直肠癌的外周血诊断生物标志物 结直肠癌患者的肿瘤组织和外周血样本 生物信息学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 多组学数据(包括测序数据和临床数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
710 2026-03-31
Deciphering Cell Cycle Dynamics and Cell States in Single-cell RNA-seq data with SPAE
2026-Mar-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为SPAE的集成正弦与分段自编码器模型,用于在单细胞RNA测序数据中表征细胞周期动态和细胞状态 SPAE是一种基于自编码器的分段线性模型,相比现有方法,在细胞周期表征方面显著提高了准确性和鲁棒性,并能准确预测癌细胞周期转换及有效去除基因表达数据中的细胞周期效应 NA 解决在单细胞RNA测序数据中准确识别和分析细胞周期动态的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞周期动态和细胞状态 机器学习 NA 单细胞RNA测序 自编码器 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
711 2026-03-31
The role of OSM/OSMRβ axis in shaping the tumor microenvironment favoring MASLD-related HCC immune evasion
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究探讨了OSM/OSMRβ轴通过促进肿瘤细胞产生CCL15来塑造免疫抑制性肿瘤微环境,从而在MASH相关HCC中驱动免疫逃逸的作用 揭示了OSM/OSMRβ轴在MASH-HCC中通过自分泌信号促进CCL15产生并塑造免疫抑制性肿瘤微环境的新机制,提出了OSM作为HCC治疗潜在靶点 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,人类样本验证仍需进一步扩大;混合病因的TCGA数据分析可能引入混杂因素 探究OSM/OSMRβ轴在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)进展为肝细胞癌(HCC)过程中对肿瘤免疫微环境的调控作用 MASLD/MASH患者(伴或不伴HCC)、野生型和肝细胞特异性OSMRβ缺陷小鼠的MASH-HCC模型、肝癌细胞系(HepG2, Huh7)及免疫细胞系(THP-1) 肿瘤免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体外共培养实验、转录组分析、磷酸化检测 基因敲除小鼠模型、细胞共培养模型 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床样本数据 人类MASLD/MASH患者队列、TCGA数据库HCC患者数据、野生型及hOSMRβ-/-小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
712 2026-03-31
Multi-omics Analysis Revealed the Diagnostic and Therapeutic Value of Immunogenic Cell Death-derived SCN5A in Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
研究论文 本研究通过多组学分析探讨了免疫原性细胞死亡相关基因SCN5A在肝细胞癌中的诊断和治疗潜力 首次将SCN5A鉴定为肝细胞癌中与免疫原性细胞死亡相关的关键生物标志物和治疗靶点,并通过分子对接发现抗心律失常药物普罗帕酮可作为SCN5A的高亲和力结合剂,展现出抗肿瘤效果 研究主要基于数据库分析和体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证和临床样本的广泛验证 探索肝细胞癌的诊断和治疗新靶点 肝细胞癌 计算生物学与实验肿瘤学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学习、分子对接、siRNA敲低、CCK8、Transwell、伤口愈合、TUNEL检测 机器学习预后模型 RNA测序数据、细胞实验数据 四个数据库的综合分析,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
713 2026-03-31
Integrative Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveal Functional and Spatial Heterogeneity of Atrial and Ventricular Cardiomyocytes in the Heart
2026-Mar, Molecular biotechnology IF:2.4Q3
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了心脏中心房和心室心肌细胞的功能与空间异质性 首次整合单细胞RNA测序与空间定位技术,系统解析了心房和心室心肌细胞亚群的空间分布特征及其通过Igf2-Igf2r和Vegfb-Vegfr1等通路的细胞间通讯网络 研究基于分离的心脏细胞进行单细胞测序,可能丢失部分组织原位空间信息;样本来源和数量未具体说明 阐明心房和心室心肌细胞在心脏组织中的空间分布格局、细胞间通讯网络及其在能量代谢、泵功能和电信号传导中的功能差异 心脏组织中的心房心肌细胞和心室心肌细胞亚群 空间转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 PCA, t-SNE 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
714 2026-03-30
Bulk and single-cell transcriptome analyses combined with molecular simulations identify ferritinophagy as a key target for resveratrol in osteoarthritis
2026-Mar-28, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 本研究通过整合转录组数据、机器学习方法和分子模拟,揭示了白藜芦醇通过抑制NCOA4介导的铁蛋白自噬来缓解骨关节炎软骨细胞损伤的分子机制 首次结合批量与单细胞转录组分析及分子模拟,将铁蛋白自噬确定为白藜芦醇治疗骨关节炎的关键靶点,并验证了其通过调控NCOA4等核心蛋白发挥保护作用 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和规模有限 探究白藜芦醇是否通过调控铁蛋白自噬网络保护软骨,为骨关节炎治疗提供新靶点 人类关节软骨细胞(在IL-1β诱导的炎症模型中) 生物信息学与计算生物学 骨关节炎 转录组测序、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、透射电子显微镜、免疫荧光 机器学习方法(如加权基因共表达网络分析) 转录组数据(批量与单细胞)、蛋白质表达数据、细胞图像数据 未明确具体样本数量,涉及人类关节软骨细胞体外模型 NA 转录组测序 NA NA
715 2026-03-30
February in focus in HCB: spatial transcriptomics
2026-Mar-28, Histochemistry and cell biology IF:2.1Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
716 2026-03-30
Geometric quantification of cell phenotype transition manifolds with information geometry
2026-Mar-27, Cell systems IF:9.0Q1
研究论文 本文提出了一种名为SCIM的几何引导方法,利用信息几何学量化细胞表型转换(CPT)的低维流形 SCIM方法首次将单细胞基因表达谱嵌入为高斯分布,并自然定义Fisher度量,从而直接量化CPT流形的几何特性 方法依赖于RNA速度计算信息速度,可能受限于RNA速度估计的准确性 量化细胞表型转换过程中的低维流形几何结构 单细胞基因表达数据 机器学习 NA 单细胞测序 信息几何学方法 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
717 2026-03-30
Genome-wide identification and characterization of QTLs for transcriptional noise in human midbrain cells
2026-Mar-26, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过分析155名个体的诱导多能干细胞来源中脑细胞的单细胞RNA测序数据,在全基因组范围内识别并表征了转录噪声的数量性状位点,揭示了其与精神分裂症等人类性状的关联 首次在全基因组范围内系统识别转录噪声的数量性状位点,并发现其与精神分裂症关联信号的富集,以及疾病状态下特定神经元类型的转录噪声显著改变 研究主要基于诱导多能干细胞来源的细胞模型,可能无法完全反映体内复杂环境;样本量相对有限;功能验证有待进一步深入 探究遗传变异如何调控基因表达的细胞间变异(转录噪声),及其与人类性状(特别是精神分裂症)的关联机制 155名个体的诱导多能干细胞来源的中脑细胞,以及精神分裂症患者的大脑单细胞RNA测序数据 单细胞转录组学 精神分裂症 单细胞RNA测序,全基因组关联研究 NA 单细胞RNA测序数据,基因型数据 155名个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
718 2026-03-30
Mitochondria orchestrated immune microenvironment and response in health and disease-clinically relevant outlook and recommendations
2026-Mar-26, Journal of advanced research IF:11.4Q1
综述 本文系统综述了线粒体与免疫微环境之间的相互作用,包括线粒体在免疫细胞中的调控模式、细胞间线粒体通讯机制、疾病中的线粒体-免疫重塑病理机制、新型分析技术及靶向治疗策略 打破线粒体仅作为细胞能量工厂的传统认知,强调其通过代谢重编程、动力学重塑、自噬调控和细胞间通讯等多种方式精确调控免疫细胞功能,并指出线粒体-免疫重塑在多种疾病中存在三个保守检查点,为通用治疗靶点提供新视角 NA 深入理解线粒体的免疫调控功能,为开发新型免疫治疗策略提供理论支持和临床参考 线粒体与免疫微环境的相互作用,涵盖免疫细胞、细胞间通讯及多种疾病模型 NA 心血管疾病、自身免疫疾病、肿瘤、衰老 单细胞测序、多组学分析 NA NA NA NA NA NA NA
719 2026-03-30
Lipid Metabolism and Neurodegeneration: Mechanistic Insights and Therapeutic Targets
2026-Mar-26, Ageing research reviews IF:12.5Q1
综述 本文综述了脂质代谢在维持大脑稳态中的作用及其与神经炎症和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病)进展的关联,并探讨了靶向脂质通路的治疗策略 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核转录组学等先进技术揭示了不同细胞类型中脂质代谢的特异性改变,并提出了脂质组学作为早期诊断和治疗监测的生物标志物来源 NA 探讨脂质代谢与神经退行性疾病之间的机制联系,并识别潜在的治疗靶点 大脑中的脂质代谢途径、神经炎症过程以及神经退行性疾病(如阿尔茨海默病和帕金森病) 神经科学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核转录组学、脂质组学 NA 转录组数据、脂质组数据 NA NA 单细胞RNA测序、单核转录组学 NA NA
720 2026-03-30
Reduced cartilage matrix stiffness in temporomandibular joint osteoarthritis impairs the functions of superficial zone chondrocytes via downregulation of CREB5-PLPP3 signaling
2026-Mar-23, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了颞下颌关节骨关节炎中软骨基质刚度降低如何通过下调CREB5-PLPP3信号通路损害浅层区软骨细胞功能 揭示了软化细胞外基质通过减少PLPP3表达、抑制线粒体分裂和呼吸,以及下调PI3K-AKT通路损害浅层区软骨细胞功能的机制,并提出了PLPP3作为治疗靶点 NA 研究颞下颌关节骨关节炎中软骨基质刚度降低对浅层区软骨细胞功能的影响及其分子机制 颞下颌关节骨关节炎患者、大鼠模型以及体外培养的浅层区软骨细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序、mRNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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