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当前共找到 934 篇文献,本页显示第 681 - 700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-03-09
CANTAO: guiding clustering and annotation in single-cell RNA sequencing using average overlap
2026-Mar, Molecular systems biology IF:8.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CANTAO的新方法,通过平均重叠度量来指导单细胞RNA测序数据的聚类和注释,以提高细胞身份识别的准确性和生物学意义 提出了平均重叠度量,通过比较差异表达基因的排名列表来定义单细胞聚类之间的距离,从而在未知细胞身份的情况下实现稳健的聚类比较和注释 未明确提及具体局限性,但可能依赖于差异表达基因的准确性,且在复杂或噪声数据中性能需进一步验证 开发一种方法以改进单细胞RNA测序数据中细胞聚类的评估和注释,特别是在未知细胞身份的情况下 单细胞RNA测序数据,包括已知真实细胞身份的基准数据集和未分选的小鼠胸腺细胞 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 未明确指定样本数量,但涉及基准数据集和小鼠胸腺细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
682 2026-03-09
Single-Cell and Multiomic Analysis Reveals Neutrophil Heterogeneity and Prognostic Value in Cervical Lesions
2026-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示了宫颈病变中中性粒细胞的异质性,并构建了基于中性粒细胞浸润的风险预后模型 首次在宫颈癌中系统鉴定出五个中性粒细胞亚群(N0-N4),发现N4亚群在疾病进展中显著增加,并揭示了其通过Wnt信号通路和细胞外基质重塑促进肿瘤进展的新机制 样本量相对有限(20例),且为回顾性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 探究中性粒细胞在宫颈癌肿瘤微环境中的异质性及其在疾病进展和预后中的作用 宫颈活检组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序,空间转录组学,组织微阵列分析 风险预后模型 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织图像数据 20例宫颈活检样本(涵盖不同疾病阶段) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
683 2026-03-09
Evolution of the Spatial transcriptomic landscape during the progression of high-grade pancreatic intraductal papillary mucinous neoplasms to invasive cancer
2026-Mar, Pancreatology : official journal of the International Association of Pancreatology (IAP) ... [et al.] IF:2.8Q2
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,分析了同一患者正常胰腺、高级别IPMN和侵袭性PDAC样本,揭示了IPMN向PDAC进展过程中的分子机制和微环境变化 首次在IPMN向PDAC进展中整合空间转录组学与多计算分析方法,识别了ELF3/MYC/KLF4扩增、7个功能异质性亚克隆以及免疫-基质景观重塑 样本量较小(仅3个新鲜组织样本),且来自单一患者,可能限制结果的普遍性 阐明高级别胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤向侵袭性胰腺导管腺癌进展的分子机制和微环境动态 同一患者的正常胰腺组织、高级别IPMN组织和侵袭性PDAC组织 空间转录组学 胰腺癌 空间转录组学 Spatial inferCNV, SpaCET, CellChat 空间转录组数据 3个新鲜组织样本(来自同一患者) NA 空间转录组学 NA NA
684 2026-03-09
Endometrial immune profile: A predictor of pregnancy success
2026-Mar, Reproductive biology IF:2.5Q3
综述 本文全面评估了子宫内膜免疫细胞组成与功能在健康与病理状态下的差异,并探讨了免疫失调如何影响妊娠成功 整合了从传统免疫组化到高分辨率单细胞转录组学等诊断方法,并提出了基于免疫谱的个性化诊断和治疗框架 作为综述文章,未涉及原始实验数据,且免疫谱的临床应用仍需进一步验证 探讨子宫内膜免疫谱作为妊娠成功预测因子的作用,并指导个性化不孕症治疗 子宫内膜免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、子宫自然杀伤细胞和调节性T细胞)及其在月经周期中的动态变化 生殖医学与免疫学 不孕症相关疾病(包括反复种植失败、反复妊娠丢失、子宫内膜异位症和多囊卵巢综合征) 免疫组化、流式细胞术、单细胞转录组学 NA 文本综述 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
685 2026-03-09
CD20+FCRL4+ B Cells Activate CD8+ T Cells via MHC-I Restriction in Nasopharyngeal Carcinoma Anti-Tumor Immunity
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过单细胞测序等技术,揭示了鼻咽癌中CD20+FCRL4+ B细胞亚群通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞并增强抗肿瘤免疫的机制 首次在鼻咽癌中鉴定出CD20+FCRL4+ B细胞亚群,并阐明其通过MHC-I限制性途径激活CD8+ T细胞的具体分子机制,特别是发现了IFNγ通过上调WDFY4增强B细胞抗原呈递功能 研究主要基于体外和动物模型,人体内验证尚不充分;B细胞亚群的具体发育来源和调控网络仍需进一步探索 探究鼻咽癌肿瘤微环境中B细胞的功能及其与其他免疫细胞的相互作用机制 鼻咽癌患者样本、CD20+FCRL4+ B细胞亚群、CD8+ T细胞 肿瘤免疫学 鼻咽癌 单细胞测序、免疫组织化学、流式细胞术、体外共培养系统、动物模型 NA 单细胞测序数据、组织图像、流式细胞数据 未明确具体样本数量,但包含鼻咽癌患者样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
686 2026-03-09
Phf6 truncating mutation drives leukemogenesis via disrupted epigenetic regulation in mice
2026-Mar, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究通过构建表达患者来源截短Phf6突变的小鼠模型,揭示了截短PHF6通过破坏表观遗传调控驱动白血病的机制 首次证明截短PHF6具有功能获得性效应,而非单纯的失活,并发现其通过增强KAT6B乙酰转移酶活性改变H3K27ac全基因组占据来驱动白血病发生 研究基于小鼠模型,其在人类疾病中的完全转化需进一步验证 阐明截短PHF6突变在白血病发生中的具体作用机制 表达患者来源截短Phf6突变的转基因小鼠模型(Phf6Tg)及其造血干细胞/祖细胞 表观遗传学与血液肿瘤学 血液系统恶性肿瘤(白血病) 单细胞RNA测序,表观遗传学分析 转基因小鼠模型 基因表达数据,表观遗传修饰数据 转基因小鼠模型及其造血细胞 NA single-cell RNA-seq NA NA
687 2026-03-09
The Role of CCR1 as a decisive factor for immune response activation versus suppression phenotypes in gastric cancer
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了趋化因子受体CCR1在胃癌免疫微环境中的作用,发现其通过激活巨噬细胞中的NF-κB和MAPK通路上调CXCL9/CXCL10,从而促进T细胞募集并抑制肿瘤进展 首次在胃癌中系统阐明CCR1通过巨噬细胞调控T细胞浸润的机制,并利用单细胞和空间转录组学技术揭示了CCR1的细胞特异性表达模式 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证相对有限,且未探讨CCR1在其他免疫细胞亚群中的潜在作用 探究CCR1在胃癌免疫微环境中促进或抑制肿瘤进展的具体作用机制 胃癌患者临床样本、CCR1基因敲除小鼠模型、巨噬细胞 肿瘤免疫学 胃癌 转录组分析、单细胞RNA-seq、空间转录组学、Western blotting、qRT-PCR、免疫荧光 动物模型(小鼠) 转录组数据、临床数据、图像数据 未明确样本数量,包含患者分层样本、小鼠模型及体外实验 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
688 2026-03-09
SMARCA4 deficiency in glioblastoma: Mitochondrial transfer from MSCs and the clinical dilemma in targeting the tumor microenvironment
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了SMARCA4在胶质母细胞瘤(GBM)进展中的作用,特别是通过间充质基质细胞(MSCs)的线粒体转移机制 揭示了SMARCA4作为MSCs关键调节因子,通过线粒体转移促进GBM生长,为靶向肿瘤微环境提供了新治疗策略 研究主要基于免疫缺陷异种移植模型,可能不完全反映人类GBM的复杂性,且机制细节需进一步验证 探究SMARCA4表达与GBM进展的相关性,并聚焦于肿瘤微环境中的MSCs作用 胶质母细胞瘤(GBM)细胞、间充质基质细胞(MSCs)以及免疫缺陷异种移植模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
689 2026-03-09
SOX9 protein in goblet cells as a critical mediator and potential therapeutic target in Barrett's esophagus: An integrated bioinformatics analysis
2026-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过整合生物信息学分析,发现SOX9蛋白在杯状细胞中作为巴雷特食管的关键介质和潜在治疗靶点 首次通过多组学分析结合单细胞RNA测序,在单细胞分辨率下验证SOX9在巴雷特食管杯状细胞中的表达及其与疾病进展的相关性 研究依赖于现有数据集,样本量可能有限,且分子对接结果需实验验证 探索巴雷特食管的分子标志物和潜在治疗靶点,以改善早期诊断和靶向干预策略 巴雷特食管患者组织样本,包括上皮和基质亚型 生物信息学 食管腺癌前病变(巴雷特食管) bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, PPI网络分析, LASSO回归, CIBERSORT免疫分析, 分子对接 NA RNA-seq数据,单细胞基因表达数据 四个bulk RNA-seq数据集和两个巴雷特食管患者队列的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
690 2026-03-09
Cell-Type-Specific and Variety-Specific Responses to Salt Stress in Wheat Root Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究首次利用单细胞转录组学技术,揭示了小麦根系在盐胁迫下细胞类型特异性和品种特异性的响应机制 首次构建了盐胁迫下小麦根尖的单细胞转录组图谱,鉴定了17种细胞类型,并发现了根毛细胞与盐胁迫的强关联性及品种特异性响应 研究聚焦于根尖区域,未涵盖整个根系;样本来自特定生长阶段,可能无法完全反映不同发育时期的响应 探究小麦根系在盐胁迫下的细胞类型特异性分子机制及耐盐品种的适应性基础 盐敏感(CS)和耐盐(DK)小麦品种的根尖细胞 单细胞转录组学 非疾病研究(植物胁迫生理) 单细胞核RNA测序 NA 单细胞转录组数据 188,270个高质量根细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
691 2026-03-09
Spatial transcriptomic analysis of foveolar-type gastric adenoma with raspberry-like appearance
2026-Mar, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学分析,揭示了具有树莓样外观的胃小凹型腺瘤的独特分子特征,包括异常的粘蛋白表达谱和VEGF驱动的血管生成机制 首次将空间转录组学技术应用于FGA-RA这一罕见亚型,揭示了其独特的MUC17与MUC5AC共表达模式,并阐明了KLF4突变如何通过影响上皮分化和血管生成通路共同塑造其树莓样外观 研究仅基于一个代表性病例进行空间转录组学分析,样本量有限;免疫组化验证仅使用了6个活检样本 阐明FGA-RA上皮表型和浅表毛细血管增殖特征的分子基础 具有树莓样外观的胃小凹型腺瘤(FGA-RA)组织 数字病理学 胃癌 空间转录组学,免疫组织化学 NA 空间转录组数据,组织图像 1例代表性病例用于空间转录组分析,6例活检样本用于免疫组化验证 10x Genomics 空间转录组学 Visium Visium空间转录组学平台,用于分析福尔马林固定石蜡包埋组织
692 2026-03-09
Immune Microenvironment Dynamics and Therapeutic Targets in GIST Revealed by Multi-Omics and Functional Validation
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本研究通过多组学分析和功能验证,揭示了胃肠道间质瘤免疫微环境的动态变化,并确定了MYBL1和AIF1L作为调节CD8 T细胞功能和PD-1反应的关键介质 整合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和功能验证,首次系统性地揭示了GIST免疫微环境的动态重塑过程,并发现了MYBL1和AIF1L与PD-1阻断剂的协同抗肿瘤效应 研究主要基于细胞模型和测序数据分析,缺乏大规模临床队列验证;功能验证主要在体外进行,体内疗效需要进一步确认 探究胃肠道间质瘤免疫微环境在肿瘤进展过程中的动态变化,并寻找新的免疫治疗靶点 胃肠道间质瘤的免疫微环境、免疫细胞表型、血浆代谢物以及候选基因MYBL1和AIF1L 生物信息学与计算生物学 胃肠道间质瘤 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、bulk RNA测序、细胞共培养模型、功能测定(增殖、迁移、侵袭、蛋白摄取追踪) 细胞共培养模型 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 731个免疫细胞表型的孟德尔随机化分析,具体组织样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
693 2026-03-09
scSCCNIA: similarity matrix based contrastive clustering with neighbor information aggregation for single-cell RNA sequencing data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种名为scSCCNIA的新型对比聚类框架,用于从单细胞RNA测序数据中准确识别细胞簇 采用拉普拉斯滤波器进行邻居信息聚合,使用具有特殊非共享参数的孪生编码器构建不同图视图以进行数据增强,并通过基于相似性矩阵的对比学习学习潜在的低维嵌入表示 NA 提高单细胞RNA测序数据中细胞聚类和细胞类型识别的准确性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 对比学习框架,包含孪生编码器 单细胞RNA测序数据 多个来自不同平台且细胞数量各异的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
694 2026-03-09
Castl: robust identification of spatially variable genes in spatial transcriptomics via an ensemble-based framework
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文介绍了一个名为Castl的集成框架,用于在空间转录组学中稳健识别空间可变基因,通过整合多种检测方法并设计统计聚合模块来减少方法特异性偏差 Castl是一个基于集成的框架,通过统计设计的聚合模块整合多种检测方法,无需预定义核函数或空间邻域图等算法假设,从而在异质数据集中提高敏感性并控制假发现率 NA 开发一个稳健的框架来识别空间转录组学中的空间可变基因,以阐明组织结构和空间表达模式 空间转录组学数据中的空间可变基因 空间转录组学 NA 空间转录组学 集成框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
695 2026-03-07
Unveiling the Roles of PRDX6 and SLC6A9 in Intracerebral Hemorrhage-Associated White Matter Lesions
2026-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合生物信息学方法,结合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序,揭示了PRDX6和SLC6A9在脑出血相关白质病变中的潜在作用 首次将两性状孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合,系统探索脑出血后白质病变的遗传贡献者,并识别出PRDX6和SLC6A9的关键作用 研究主要基于生物信息学分析和动物模型数据,尚未在临床样本中进行实验验证,且分子机制的具体作用通路仍需进一步阐明 探究脑出血诱导的白质病变的分子机制,识别潜在的遗传风险基因 脑出血相关的白质病变,重点关注PRDX6和SLC6A9基因 生物信息学 脑血管疾病 单细胞RNA测序,孟德尔随机化分析,表达数量性状位点分析,功能富集分析 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及正常和脑出血影响的小鼠脑组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
696 2026-03-07
Identification of Poor Prognosis-Associated Fibroblast Subpopulation Signature Genes Utilizing the Scissor Algorithm to Classify Colorectal Cancer Subtypes and Evaluate the Immune Landscape
2026-Mar-06, Gut and liver IF:3.4Q2
研究论文 本研究利用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据,首次识别出与结直肠癌不良预后显著相关的成纤维细胞亚群,并揭示了其在促进转移和免疫抑制微环境中的作用 首次应用Scissor算法整合单细胞与批量转录组数据识别结直肠癌中与预后相关的成纤维细胞亚群,并系统揭示了该亚群通过激活促转移通路和塑造免疫抑制微环境影响临床预后的机制 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏独立的前瞻性队列验证;Scissor算法对数据质量和临床信息的完整性依赖较强 识别结直肠癌中与不良预后相关的成纤维细胞亚群,解析其分子特征及对肿瘤微环境的影响,为预后评估和个性化治疗提供新视角 结直肠癌患者肿瘤组织中的成纤维细胞亚群 数字病理学 结直肠癌 RNA-seq Scissor算法 转录组数据(批量与单细胞) 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
697 2026-03-07
Mosaic human cortical organoids model mTOR-related focal cortical dysplasia through DEPDC5 deletion
2026-Mar-06, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究利用患者来源的人类皮质类器官建立了DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,模拟了mTOR相关局灶性皮质发育不良的病理特征 首次在人类皮质类器官中建立DEPDC5双等位基因失活嵌合模型,系统揭示了该基因缺陷如何通过影响神经元分化、信号通路和细胞代谢导致癫痫病理 研究基于体外类器官模型,与真实脑组织环境存在差异;单细胞测序仅涵盖三个发育阶段 探究DEPDC5基因缺陷导致局灶性皮质发育不良II型的分子机制 患者来源的人类皮质类器官 神经科学 癫痫 单细胞转录组测序 人类皮质类器官模型 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
698 2026-03-07
Type I interferon-induced CD169+ macrophages play a protective role in periodontitis
2026-Mar-06, Journal of periodontology IF:4.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了I型干扰素诱导的CD169+巨噬细胞在牙周炎中的保护作用及其分化机制 首次在牙周炎背景下系统描述了CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其通过产生CCL18和IL10维持免疫稳态的保护性功能,并明确了I型干扰素-IRF7轴在其分化中的关键作用 研究样本量相对有限(健康对照8例,牙周炎患者10例),且主要基于观察性数据和动物模型验证,其治疗转化潜力仍需进一步临床研究证实 探究牙周组织中CD169+巨噬细胞的转录特征、分化微环境及其对牙周炎的影响 人牙周组织样本(健康对照与牙周炎患者)及小鼠模型 数字病理学 牙周炎 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色,免疫荧光染色,流式细胞术,SCENIC分析,体外实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据 18例人牙周组织样本(健康对照8例,牙周炎患者10例)及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
699 2026-03-07
SpatioFreq: A Deep Learning Framework for Decoding Cellular and Tissue Landscapes Across Organisms Using Spatial Transcriptomics
2026-Mar-06, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 本文提出了一个名为SpatioFreq的深度学习框架,用于通过空间转录组学解码生物体中的细胞和组织景观 引入了一种创新方法,利用拉普拉斯矩阵提取频域特征以检测空间数据中的细微结构和动态模式,并结合图自监督对比学习优化空间数据中的长程依赖关系,通过双任务设计实现任务间信息共享 未明确提及 提高空间转录组学分析的准确性和效率,揭示组织内细胞的空间组织结构 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 深度学习框架 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
700 2026-03-07
Histological, ultrastructural, and single-cell profiling reveal immune-mediated remodeling in gallbladder inflammation
2026-Mar-05, Cell and tissue research IF:3.2Q3
研究论文 本研究通过组织学、超微结构和单细胞分析,揭示了胆囊炎症中免疫介导的重塑过程 首次结合单细胞RNA测序与超微结构分析,系统定义了急性与慢性胆囊炎症中不同的免疫-基质程序 样本量相对有限(41例患者),且未探讨炎症状态之间的时间动态转换 旨在阐明急性与慢性胆囊炎症的细胞和结构特征,并关联上皮、免疫和基质改变 胆囊炎症患者(包括急性胆囊炎和慢性胆石症)的组织与血液样本 数字病理学 胆囊疾病 单细胞RNA测序,组织病理学,免疫组化,透射电子显微镜,靶向细胞因子表达分析 NA 单细胞转录组数据,组织图像,血液样本数据 41例患者(12例急性胆囊炎,29例慢性胆石症) NA 单细胞RNA测序 NA NA
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