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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-03-11 |
Single-cell RNA sequencing reveals population-based shifts in gene expression heterogeneity in an unstable, clonally derived CHO cell line
2026-Mar-09, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.88502
PMID:41803018
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了稳定与不稳定CHO细胞系在基因表达异质性方面的变化,揭示了克隆群体内异质性对细胞系稳定性的影响 | 首次在克隆来源的CHO细胞培养中,利用单细胞RNA测序技术,系统评估了基因表达异质性随时间的变化,并关联了细胞系不稳定性与代谢通路活性的改变 | 研究仅针对特定CHO细胞系和单克隆抗体表达系统,结果可能不适用于其他细胞类型或表达体系,且样本时间点有限 | 探究CHO细胞系在长期培养过程中基因表达异质性的变化,以理解细胞系不稳定性的生物学机制 | 稳定和不稳定的CHO细胞系,这些细胞系表达相同的单克隆抗体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 稳定和不稳定CHO细胞系在早期和晚期时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-03-11 |
Gene expression dynamics of human and mouse craniofacial development at the single-cell level
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70232-6
PMID:41803119
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研究论文 | 本文通过单核RNA测序技术,研究了人类和小鼠颅面发育过程中的基因表达动态,识别了多种细胞亚型并揭示了其功能保守性 | 首次在单细胞水平上系统比较人类和小鼠颅面发育的基因表达,识别了与正常面部形态和口面裂风险相关的细胞亚型 | 研究仅涵盖受孕后4至8周的人类样本,可能未覆盖更早或更晚的发育阶段 | 理解人类颅面发育的细胞类型和基因表达动态 | 人类和小鼠的颅面发育组织 | 单细胞组学 | 口面裂 | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA序列数据 | 涵盖人类受孕后4至8周的样本,具体数量未明确 | NA | 单核RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 623 | 2026-03-11 |
DGM: deep graph clustering with mincut for analysis of single-cell transcriptomics
2026-Mar-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12694-y
PMID:41803718
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 624 | 2026-03-11 |
Single-cell RNA-seq and in vitro study reveal Fusobacterium nucleatum impairs β-cell identity in type 2 diabetes via the NF-κB-CDKN1C axis
2026-Mar-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07981-x
PMID:41803883
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 625 | 2026-03-11 |
CD19+Ki67+B cells regulated by NAMPT as key modulators in triple-negative breast cancer with brain metastasis
2026-Mar-09, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02251-6
PMID:41803986
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了CD19+Ki67+B细胞通过激活NAMPT/ITGA5/ITGB1通路驱动三阴性乳腺癌脑转移的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出CD19+Ki67+B细胞作为三阴性乳腺癌脑转移的关键调节细胞,并阐明了其通过NAMPT/ITGA5/ITGB1信号通路促进肿瘤进展的具体机制 | 样本量相对较小(15例患者进行scRNA-seq),功能验证主要在类器官模型中进行,需进一步在体内模型和更大队列中验证 | 探究三阴性乳腺癌脑转移的免疫调节机制,并寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者(包括有和无脑转移者)的肿瘤组织、B细胞亚群、肿瘤类器官 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组分析、多重免疫荧光、类器官共培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、免疫荧光图像 | 15例患者(8例转移,7例非转移)进行scRNA-seq;两个独立RNA-seq队列(TCGA, GSE65194);湘雅真实世界队列;74例患者样本进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-03-11 |
Non-Invasive Assessment of Complete Regression in Endometrial Cancer Patients Undergoing Fertility Preservation Using MRI-Based Radiomics and Immune Heterogeneity
2026-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70666
PMID:41799934
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研究论文 | 本研究开发了一种基于MRI影像组学和免疫异质性的非侵入性工具,用于预测接受生育力保留治疗的子宫内膜癌患者的完全缓解情况 | 首次将MRI影像组学特征与单细胞RNA测序、批量RNA测序的分子谱分析相结合,构建了预测完全缓解的影像组学-临床列线图,并揭示了高评分组肿瘤微环境的免疫抑制和代谢活跃特征 | 研究为回顾性设计,样本量相对有限(146例患者),需要前瞻性多中心研究进一步验证 | 开发非侵入性工具以预测子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌患者接受生育力保留治疗后的完全缓解结局 | 被诊断为子宫内膜不典型增生或早期子宫内膜癌并接受生育力保留治疗的年轻女性患者 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | MRI影像组学,单细胞RNA测序,批量RNA测序,机器学习 | 机器学习模型(具体模型未明确说明),列线图 | 医学影像(MRI),基因表达数据 | 146例患者 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-03-11 |
Generalized SIMEX Method: Polynomial Approximation for Extrapolation
2026-Mar, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.70460
PMID:41804018
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研究论文 | 本文提出了一种广义的SIMEX方法(GSIMEX),通过使用高阶多项式函数作为外推函数来处理严重的测量误差问题 | 扩展了传统的SIMEX方法,采用高阶多项式函数来近似未知的非线性外推函数,并集成了子集选择和模型平均策略以提高估计精度 | 未在摘要中明确说明 | 解决统计分析中测量误差导致的参数估计偏差问题,特别是在误差严重的情况下 | 测量误差模型、参数估计方法 | 机器学习 | NA | 模拟外推法(SIMEX)、多项式近似、子集选择、模型平均 | 多项式回归模型 | 模拟数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 628 | 2026-03-11 |
Investigating the Role of MicroRNAs in Mesenchymal Stem Cell Osteogenic Differentiation
2026-Mar, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70724
PMID:41805079
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综述 | 本文综述了microRNAs在间充质干细胞成骨分化中的调控作用及其在骨质疏松等骨骼疾病中的临床意义 | 系统整合了miRNA调控骨重塑的分子机制与临床转化应用,并展望了单细胞RNA测序等新技术在骨再生领域的应用前景 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,主要基于现有文献进行归纳总结 | 阐明miRNA在间充质干细胞成骨分化中的调控网络及其在骨骼疾病诊疗中的应用潜力 | 间充质干细胞、成骨细胞、microRNAs | 分子生物学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-03-10 |
Bioinformatics Analysis Reveals ALDH5A1: A Novel Molecular Brake on Th17 Cell Pathogenicity in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503998R
PMID:41797515
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析揭示了ALDH5A1作为系统性红斑狼疮中Th17细胞致病性的新型分子制动器 | 首次将ALDH5A1鉴定为与系统性红斑狼疮中Th17细胞分化相关的关键基因,并构建了基于谷氨酰胺代谢相关基因的风险列线图 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,体内验证仅使用了小鼠模型,缺乏更广泛的临床队列验证 | 识别系统性红斑狼疮进展中与Th17细胞分化相关的基因,并探讨其在疾病发病机制中的作用 | 系统性红斑狼疮患者、小鼠模型以及体外培养的CD4 T细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | RNA-seq, scRNA-seq, siRNA, 过表达质粒 | 随机森林模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量,涉及GEO数据库数据、SLE患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-03-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Macrophage-Granulosa Cell Crosstalk in Regulating Granulosa Cells Function in Sheep
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502486RR
PMID:41801067
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了绵羊卵巢中巨噬细胞与颗粒细胞之间的相互作用如何调控颗粒细胞功能 | 首次在绵羊中利用单细胞RNA测序比较高低繁殖力品种的卵巢细胞图谱,并验证了IGFBP2在巨噬细胞-颗粒细胞互作中的关键调控作用 | 研究仅基于两个绵羊品种,样本量较小;体外共培养实验可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究巨噬细胞与颗粒细胞间的细胞对话及其对颗粒细胞功能的调控机制 | 绵羊卵巢组织(来自高繁殖力胡羊和低繁殖力蒙古羊) | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 两个绵羊品种的卵巢组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2026-03-10 |
Single-Cell Sequencing and Transcriptomic Sequencing Exploration of the Mechanisms Governing Lactylation in Mitochondrial Diseases
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504230R
PMID:41801247
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和转录组分析探索了乳酸化修饰在线粒体疾病中的作用机制 | 首次结合单细胞测序与转录组分析探索乳酸化在线粒体疾病中的角色,并利用机器学习识别出三个核心基因EIF3D、SOD1和RPS26 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于qRT-PCR和Western blotting,样本来源和数量可能有限 | 探索乳酸化修饰与线粒体疾病之间的关联,以揭示其分子病理机制和潜在治疗策略 | 线粒体疾病患者的骨骼肌样本及相关的免疫细胞 | 生物信息学 | 线粒体疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, qRT-PCR, Western blotting | 机器学习算法 | RNA测序数据, 基因表达数据 | 线粒体疾病患者的骨骼肌样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 632 | 2026-03-10 |
A supramolecular peptide reprograms PD-L1+ tumor-associated macrophages to enhance antitumor immunity in lung adenocarcinoma
2026-Mar-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2026.114657
PMID:41580126
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研究论文 | 本研究开发了一种超分子肽纳米平台MH-PDBP,用于重编程肺腺癌中的PD-L1阳性肿瘤相关巨噬细胞,以增强抗肿瘤免疫 | 通过金亲和自组装构建了超分子肽纳米平台,并利用甘露糖化人血清白蛋白涂层实现选择性靶向肿瘤相关巨噬细胞,促进PD-L1的溶酶体降解并重编程巨噬细胞向M1表型转化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证其安全性和有效性 | 旨在克服肺腺癌中免疫抑制性肿瘤免疫微环境,增强免疫检查点抑制剂的疗效 | 肺腺癌患者样本、小鼠模型及肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理 | 肺癌 | 多重免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、测序数据 | 来自免疫检查点抑制剂治疗的肺腺癌患者的多重免疫组织化学样本及公共单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 633 | 2026-03-10 |
Molecular subtypes in pancreatic cancer: from academic promise to clinical reality
2026-Mar-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02614-9
PMID:41796340
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌分子分型的研究进展,从学术发现到临床应用的转化挑战及未来方向 | 整合多组学数据深化了对分子亚型生物学的理解,并提出了一个优先考虑验证简便性、上下文相关性和实际效用的临床实施路线图 | 分子分型的临床采用受到可重复性有限、技术挑战和实施障碍的限制,且治疗诱导的分子可塑性可能损害静态生物标志物的可靠性 | 旨在综合PDAC分型的关键进展,批判性地审视转化障碍,并提出临床实施的实用路线图 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其分子亚型,特别是经典/祖细胞(GATA6高)和基底样/鳞状(GATA6低)亚型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 转录组分析、多组学整合、免疫组织化学评估、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、多组学数据、免疫组织化学图像、单细胞RNA测序数据、空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 634 | 2026-03-10 |
Clu+ transitional alveolar epithelial cells promote lung injury repair and fibrosis progression
2026-Mar-09, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70389
PMID:41797553
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研究论文 | 本研究探讨了肺泡上皮细胞中一个名为RAEs的过渡亚群在肺损伤修复和纤维化进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别并表征了Clu、Igfbp6和Krt19标记的RAEs过渡细胞群,揭示了其在调节细胞外基质分泌和促进纤维化进展中的关键功能 | 研究主要基于小鼠模型和人类MRC-5细胞系,尚未在更广泛的人类临床样本中进行验证 | 探究肺损伤后过渡细胞群在炎症向纤维化转变过程中的作用机制 | 肺泡上皮细胞过渡亚群(RAEs)、激活的成纤维细胞、小鼠肺损伤模型和人类MRC-5细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、免疫印迹、苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞RNA测序数据、图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及小鼠模型和人类细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-03-10 |
Guidelines for Evaluating Endothelial Function in Vascular Tissue
2026-Mar-09, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00656.2025
PMID:41801061
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指南 | 本文提供了一套评估血管组织中内皮功能的标准化指南,旨在整合传统功能检测与现代分子方法 | 首次由领域内专家团队达成共识,系统性地将单细胞转录组学、蛋白质组学等新兴技术与传统功能检测方法相结合,为评估内皮功能提供创新性框架 | 指南主要基于专家共识,可能未涵盖所有新兴技术,且在实际应用中需根据具体研究条件进行调整 | 建立评估血管内皮功能的最佳实践标准,促进内皮生物学研究的严谨性、可重复性和新发现 | 血管组织中的内皮细胞及其功能 | 血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、蛋白质组学、高级成像技术、传统功能检测(如肌动描记术) | NA | 转录组数据、蛋白质数据、影像数据、功能检测数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2026-03-10 |
Integrated multi-omics analysis identifies and validates endoplasmic reticulum stress and mitophagy-related biomarkers in MASLD
2026-Mar-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43311-3
PMID:41796234
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研究论文 | 本研究通过整合GEO数据挖掘、机器学习与单细胞RNA测序分析,揭示了内质网应激和线粒体自噬在代谢功能障碍相关脂肪肝病进展中的关键作用,并识别了NR4A1作为潜在治疗靶点 | 首次整合多组学方法(包括GEO数据挖掘、机器学习和scRNA-seq)系统研究内质网应激和线粒体自噬在MASLD中的机制,并识别NR4A1作为关键调控因子,同时通过虚拟筛选发现潜在治疗化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证,缺乏深入的体内功能机制研究和临床试验验证 | 阐明内质网应激和线粒体自噬在MASLD进展中的具体机制,并识别针对这些通路的候选治疗靶点和药物 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)患者数据、小鼠模型、肝细胞以及人类肝组织样本 | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | GEO数据挖掘、机器学习、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、功能富集分析、免疫浸润分析、分子对接 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 涉及GEO数据库中的MASLD患者数据、FFA处理的肝细胞、MASLD小鼠模型以及人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-03-10 |
Sensory Nerves Regulate Odontoblast Differentiation via the SPP1/ITGA4 Axis During Tooth Root Development
2026-Mar-08, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70129
PMID:41796694
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研究论文 | 本研究揭示了感觉神经通过SPP1/ITGA4轴调控牙根发育过程中成牙本质细胞分化的新机制 | 首次阐明了感觉神经通过分泌SPP1与牙乳头细胞上的ITGA4受体相互作用,从而调控牙根发育中成牙本质细胞分化的具体分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类牙根发育中的直接适用性有待验证;体内功能验证实验的样本量相对有限 | 探究感觉神经在牙根发育过程中调控干细胞/祖细胞命运决定的作用及分子机制 | 小鼠牙乳头细胞、三叉神经节、牙胚 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、亚肾囊共培养、免疫共沉淀、邻近连接实验、siRNA敲低 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | 小鼠出生后3.5天和30天的三叉神经节与磨牙组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-03-10 |
OralDB: A Transcriptomic Resource for Mechanistic Exploration in Oral Diseases
2026-Mar-08, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345251410498
PMID:41796996
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研究论文 | 本文介绍了OralDB,一个专为口腔疾病设计的首个全面、标准化、交互式的多模态转录组资源平台 | 首次创建了专门针对口腔疾病的综合性、标准化、交互式多模态转录组资源,整合了多种组学数据和疾病类型,解决了数据碎片化和批次效应问题 | 平台主要基于现有公共数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围,且未提及对新数据集的持续更新机制 | 开发一个标准化资源平台,以促进口腔疾病的分子机制探索和转化应用研究 | 口腔疾病,包括口腔癌、牙周炎和口腔黏膜疾病等 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间转录组学(ST)、RNA-seq、微阵列 | NA | 转录组数据 | 2027个组织样本,覆盖73个高质量数据集和20种口腔疾病 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 639 | 2026-03-10 |
Integrative assessment of gamete and embryo quality in porcine in vitro production: A comprehensive review
2026-Mar-07, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101207
PMID:41797246
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综述 | 本文全面综述了猪体外胚胎生产中配子(卵母细胞和精子)及胚胎质量的评估方法、当前挑战与未来发展方向 | 整合了来自其他哺乳动物模型的见解,以突出通用原则和物种特异性挑战,并系统性地探讨了将先进成像、代谢组学、单细胞转录组学以及人工智能和多组学数据驱动框架等新兴技术应用于猪体外胚胎生产质量评估的潜力与路径 | 文中提到,许多新兴评估方法(如先进成像、代谢组学、单细胞转录组学、人工智能等)在常规实践中的广泛应用仍需进一步的验证、实验室间标准化以及成本效益评估 | 旨在通过整合生物学见解与技术创新,推动建立更高效、可重复和可预测的猪辅助生殖技术,以提升猪体外胚胎生产的效率、可重复性和转化价值 | 猪的配子(卵母细胞、精子)以及在体外生产的胚胎 | NA | NA | 先进成像,代谢组学,单细胞转录组学,高通量组学,机器学习 | 机器学习 | 图像,代谢物数据,转录组数据,多参数数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 640 | 2026-03-10 |
CRISPR-based functional genomics for dissecting therapeutic dependency in primary acute myeloid leukemia samples
2026-Mar-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.003
PMID:41759529
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研究论文 | 本文开发了一种优化的基于CRISPR的功能基因组学平台,用于在患者来源的异种移植和原发性急性髓系白血病样本中进行功能筛选 | 将CRISPR功能基因组学直接应用于异质性的原发性肿瘤样本,而非仅限于小鼠模型或已建立的癌细胞系,并整合了CRISPR敲除、CRISPR干扰和单细胞RNA测序技术 | 研究主要聚焦于急性髓系白血病,可能不直接适用于其他癌症类型,且依赖于患者样本的可用性和异质性 | 利用CRISPR功能基因组学直接剖析原发性急性髓系白血病样本中的治疗依赖性和细胞异质性 | 患者来源的异种移植和原发性急性髓系白血病样本 | 功能基因组学 | 急性髓系白血病 | CRISPR-Cas9敲除、CRISPR干扰、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |