单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 601 - 620 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
601 2026-04-24
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用改良的CRISPRi单细胞筛选技术在K562细胞中敲低六个转录因子,重建基因调控网络并评估技术潜力与局限性 优化CROP-seq方案实现sgRNA高效捕获,无需单独富集步骤,并揭示如LMO2-GATA2等新调控相互作用 仅约40-50%靶基因实现有效敲低,扰动效率存在实验间差异,需进一步优化标准化 评估联合CRISPRi和单细胞RNA测序的筛选技术在基因功能解析和调控网络重建中的潜力与局限性 K562细胞系中的六个转录因子(LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2、RUNX1) 功能性基因组学 NA CRISPRi、单细胞RNA测序、CROP-seq NA 单细胞RNA测序数据 K562细胞系,具体样本数未提及 NA 单细胞RNA测序 CROP-seq 改良CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) 方案,从cDNA文库直接捕获sgRNA
602 2026-04-24
The MDM2-p53 Axis in Osteosarcoma: Current Understanding of Regulatory Mechanisms and Targeted Therapeutic Strategies
2026-Mar-13, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
综述 系统阐述骨肉瘤中MDM2-p53通路的分子机制及靶向治疗策略 综述了新兴MDM2抑制剂(如APG-115)进入II期临床试验的突破进展,并引入单细胞测序和AI辅助药物设计加速开发 多数药物尚未在骨肉瘤专用队列中验证,早期抑制剂存在疗效有限与剂量限制性毒性 阐明MDM2-p53通路调控机制并总结靶向治疗策略 骨肉瘤患者及MDM2-p53通路相关分子机制 机器学习 骨肉瘤 NA NA NA NA NA NA NA NA
603 2026-04-24
Comprehensive In Silico Investigation of L-Glutamine Transporters and Metabolism in Glioblastoma
2026-Mar-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
研究论文 通过计算生物学方法系统研究了胶质母细胞瘤中L-谷氨酰胺转运蛋白和代谢的调控机制 首次系统整合多组学数据(转录组、表观遗传、单细胞RNA测序等)鉴定了三个与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义的基因(CP、SLC25A13、SLC38A2),并揭示其通过不同机制驱动GBM恶性进展 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏独立实验验证,药物基因组学分析和分子对接仅作为辅助验证层 系统鉴定胶质母细胞瘤中与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义和生物学合理性的调控因子 胶质母细胞瘤(GBM)中谷氨酰胺代谢相关基因 机器学习 脑肿瘤 RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 NA 转录组数据、蛋白质表达数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 TCGA和GTEx数据库的转录组数据,CGGA数据库的生存验证数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
604 2026-04-24
Iron and Copper Homeostasis in Cardiometabolic Disease: Therapeutic Potential of Chelators
2026-Mar-09, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
综述 本文综述了铁和铜稳态失衡在心代谢疾病中的作用,重点阐述了铁死亡和铜死亡两种细胞死亡形式,并探讨了金属螯合剂在治疗中的潜力 整合了单细胞转录组学、脂质组学和金属组学与机器学习衍生的基因特征,揭示了铁-铜轴的统一分子机制及其作为治疗靶点的可行性 翻译受限于生物标志物变异性、系统性安全性问题以及缺乏大型前瞻性临床试验 探讨铁和铜稳态在心代谢疾病中的机制,并评估金属螯合剂的治疗潜力 冠状动脉疾病、心肌梗死、心力衰竭、动脉粥样硬化和糖尿病并发症等心代谢疾病 机器学习 心血管疾病 单细胞转录组学、脂质组学、金属组学 机器学习衍生的基因签名 文本 不适用 NA NA NA NA
605 2026-04-24
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2026-Mar-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 通过AI量化肝纤维形态表型,揭示代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)的分子改变 首次利用人工智能算法FibroNest定量分析MASLD肝活检中的纤维形态表型,并结合多组学分析(转录组、空间单细胞转录组)揭示纤维形态与分子改变的关联 样本量较小(94例肝活检),且仅12例合并肝细胞癌,可能限制发现的普遍性 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关的分子改变,探索纤维形态对疾病进展和潜在机制的指示作用 94例MASLD患者的肝活检样本(其中12例合并肝细胞癌) 计算机视觉、机器学习、数字病理 代谢功能障碍相关脂肪性肝病、肝细胞癌 转录组测序、空间单细胞转录组 FibroNest算法 图像、转录组数据、空间基因表达数据 94例MASLD患者肝活检样本,其中12例合并肝细胞癌 PharmaNest, CosMx 数字病理、空间转录组学 FibroNest, CosMx FibroNest用于肝纤维形态量化,CosMx用于空间单细胞转录组分析
606 2026-04-23
Pathogenic Ifit1 + neutrophils driven by IRF7 promote liver injury and represent a therapeutic target in acute liver failure
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序识别了急性肝衰竭中致病性Ifit1+中性粒细胞亚群,并揭示了IRF7调控该亚群分化的机制,提出靶向抑制作为治疗策略 首次在急性肝衰竭中鉴定出Ifit1+中性粒细胞亚群,并阐明其通过IRF7-FGL2轴驱动肝损伤的机制,开发了肝靶向纳米颗粒递送抑制剂的新疗法 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;纳米颗粒疗法的长期安全性和疗效需进一步评估 识别急性肝衰竭中的致病性中性粒细胞亚群并探索治疗靶点 小鼠和人类急性肝衰竭患者的肝脏组织及中性粒细胞 数字病理学 急性肝衰竭 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 小鼠和人类肝脏组织样本(具体数量未明确) NA 单细胞RNA-seq NA NA
607 2026-04-23
Single-cell profiling of BAL in preschool cystic fibrosis reveals macrophage dysregulation and ivacaftor-modified inflammatory programs in the early life lung
2026-Mar-30, Mucosal immunology IF:7.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和表面蛋白表达分析,构建了幼儿囊性纤维化患者支气管肺泡灌洗液的细胞图谱,揭示了巨噬细胞功能失调及ivacaftor对炎症程序的调节作用 首次在学龄前囊性纤维化患者中,通过整合单细胞转录组和表面蛋白数据,创建了大规模儿科下呼吸道细胞图谱,并发现巨噬细胞基因表达广泛失调及ivacaftor对特定炎症通路的恢复作用 研究未检测到lumacaftor/ivacaftor联合疗法在转录反应上的可观察变化,样本量相对有限,且结果可能受幼儿特定生理阶段影响 探究囊性纤维化早期肺部炎症机制及CFTR调节剂对免疫细胞功能的影响 学龄前囊性纤维化儿童的支气管肺泡灌洗液样本 数字病理学 囊性纤维化 单细胞RNA测序, 高度多重表面蛋白表达分析 NA 单细胞转录组数据, 蛋白表达数据 45个支气管肺泡灌洗液样本,超过190,000个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 多组学分析 NA NA
608 2026-04-23
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究探讨了miR-93-5p在Alport综合征中调节肾小球内皮细胞损伤的作用,以及人羊水干细胞来源的细胞外囊泡通过其miR-93-5p货物介导疾病修饰活性的机制 首次揭示miR-93-5p在Alport综合征肾小球内皮细胞中的特异性下调,并证明hAFSC-EVs通过传递miR-93-5p调节VEGFR1和VEGFR2信号通路,从而恢复肾小球内皮细胞功能 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且未详细探讨miR-93-5p在其他肾细胞类型中的作用 探究miR-93-5p在缓解Alport综合征肾小球损伤中的作用,以及hAFSC-EVs的疾病修饰活性是否由其miR-93-5p货物介导 Alport综合征模型中的肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡以及患者活检组织 数字病理学 Alport综合征 空间转录组学分析、空间分子成像、转录组学和蛋白质组学分析 NA 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、成像数据 未明确指定样本数量,但包括动物模型和患者活检组织 NA 空间转录组学 NA NA
609 2026-04-23
Temporal Dynamics of Endothelium After Radiation Injury Reveal a Transient Pro-Angiogenic Capillary Subpopulation Associated with Skin Repair
2026-Mar-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠皮肤辐射损伤后血管内皮细胞的动态功能状态,并发现了一个与皮肤修复相关的短暂促血管生成毛细血管亚群 首次在辐射损伤模型中系统描绘了血管内皮细胞的时间动态变化,并鉴定出一个具有促血管生成功能的短暂毛细血管亚群(capVEC2),揭示了其在血管-表皮通讯中的作用 研究基于小鼠模型,人体内的响应可能不同;单细胞测序数据主要反映转录组水平的变化,需要后续功能实验验证 阐明辐射损伤后血管内皮细胞的动态功能状态和调控机制 小鼠背部皮肤的血管内皮细胞 单细胞组学 辐射损伤 单细胞RNA测序 轨迹推断、通路富集、转录因子活性推断、细胞间通讯分析 单细胞转录组数据 多个辐射后时间点收集的小鼠背部皮肤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
610 2026-04-23
In Vitro and In Vivo Validation of Endothelium-Derived Potential Therapeutics for Myocardial Ischemia/Reperfusion Injury Identified by an AI-Enhanced Single-Cell and Virtual-Cell Paradigm
2026-Mar-18, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究结合单细胞图谱分析、AI模拟和实验验证,识别出S100A8是心肌缺血/再灌注损伤中血管炎症的关键分子,并发现穿心莲内酯可通过靶向S100A8通路发挥保护作用 首次将单细胞分析、AI模拟(包括虚拟细胞范式、AlphaFold3结构预测和分子对接)与体内外实验相结合,系统性地识别并验证了S100A8作为MI/R损伤的治疗靶点及穿心莲内酯的潜在疗效 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的有效性和安全性仍需进一步验证;AI模拟的预测准确性依赖于现有数据库和算法,可能存在偏差 识别心肌缺血/再灌注损伤中内皮细胞功能障碍的关键分子,并寻找潜在的治疗药物 小鼠心肌缺血/再灌注损伤模型中的内皮细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, AI模拟, 分子对接, 虚拟敲除模拟 hdWGCNA, AlphaFold3, AutoDock 单细胞RNA测序数据, 蛋白质网络数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
611 2026-04-23
Single-Cell Multi-Tissue T Cell Clonal Dynamics Reveal Distinct Immune Coercion Landscapes in MSI and MSS Colorectal Cancer
2026-Mar-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组和T细胞受体测序数据,揭示了MSI和MSS结直肠癌中T细胞克隆动力学的不同模式及其与免疫治疗反应的关系 开发了TCR重建流程TORBiT,首次从T细胞克隆动力学角度揭示了MSI和MSS结直肠癌中两种不同的免疫胁迫模式 样本量相对较小(43个样本),且仅针对结直肠癌,结果可能无法推广到其他癌症类型 阐明结直肠癌中T细胞克隆动力学与免疫治疗反应的关系 MSI和MSS结直肠癌患者的血液和组织样本 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 43个血液和组织样本 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
612 2026-04-23
Decoding Fibroblast Diversity Associated with the Postnatal Loss of Cardiac Regenerative Capacity
2026-Mar-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,解码了与出生后心脏再生能力丧失相关的成纤维细胞多样性 首次在单细胞水平上系统比较了再生性新生儿与非再生性成年小鼠心脏成纤维细胞的异质性、细胞外基质程序和通讯网络差异 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量相对有限;未深入探究CF3亚群在成年损伤中弱诱导的具体机制 探究心脏成纤维细胞异质性如何影响出生后心脏再生能力的丧失 小鼠左心室中的代谢活性CD45/CD31非肌细胞(富集成纤维细胞群体) 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 NA 单细胞转录组数据,批量转录组数据 正常新生儿(P3)和成年(P84)小鼠左心室样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
613 2026-04-23
Spatial transcriptomics for gene discovery identifies Slc13a5 as a modulator of bone mechanoadaptation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,在小鼠胫骨中识别了机械负荷诱导的基因表达变化,并发现Slc13a5作为骨机械适应性的调节因子 首次应用空间转录组学(GeoMx, NanoString)在骨组织中系统分析机械负荷下的基因表达空间变化,并验证了跨平台一致性基因 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;空间转录组学技术可能受限于分辨率和样本数量 识别骨机械适应性的关键分子调节因子,以开发针对骨脆性增加的治疗策略 小鼠胫骨的骨膜和骨组织区域,特别是在张力和压缩区域 空间转录组学 骨脆性疾病 空间转录组学,RNA-seq,激光捕获显微切割 NA 空间基因表达数据,RNA-seq数据 小鼠胫骨样本,具体数量未在摘要中明确说明 NanoString 空间转录组学 GeoMx GeoMx空间转录组学平台
614 2026-04-23
Exploring the human brain: spatial transcriptomics challenges and approaches in post-mortem analysis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
综述 本文回顾了空间转录组学技术在人类大脑死后分析中的应用、挑战与机遇 系统比较了空间转录组学工具,并总结了其在人类大脑研究中的具体应用与挑战 NA 探讨空间转录组学在人类大脑研究中的挑战与机遇,为研究人员提供指导 人类大脑 数字病理学 神经系统疾病 空间转录组学 NA mRNA表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
615 2026-04-23
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了大脑屏障系统中巨噬细胞(包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和募集巨噬细胞)的起源、发育、重要分子和功能,并强调了单细胞测序等新技术带来的进展 聚焦于大脑屏障系统中的巨噬细胞亚群,系统梳理了其起源、分子特征和功能,并整合了单细胞测序等新技术的最新发现 是一篇综述性文章,未报告原始实验数据或提出新的理论模型 总结大脑屏障系统中巨噬细胞的生物学特性、功能及研究进展 大脑屏障系统中的巨噬细胞,主要包括小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 神经免疫学 NA 单细胞测序 NA NA NA NA NA NA NA
616 2026-04-23
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文从转录组学角度综述了视神经损伤后的分子机制,并探讨了神经修复策略 整合单细胞转录组学、转录组分析和芯片分析,揭示了视神经损伤和青光眼诱导的神经元退行性变的分子机制,并识别了与视网膜神经节细胞保护和再生相关的基因及关键转录因子 综述性质文章,未涉及原始实验数据,未来需结合多组学方法和计算模型进行更深入的研究 阐明视神经损伤的分子机制并探索神经修复策略 视网膜神经节细胞 数字病理学 青光眼 单细胞RNA测序, 转录组分析, 芯片分析, CRISPR-Cas9筛选, ATAC-seq分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 高通量测序, ATAC-seq NA NA
617 2026-04-21
A uniquely leptin sensitive hypothalamic neuron population limits hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在小鼠饮食诱导肥胖模型中鉴定出一个独特的、对瘦素保持敏感的下丘脑神经元亚群,该亚群通过限制摄食行为来调控体重增加 首次在肥胖状态下,识别出一个通过共表达GLP-1受体而保持瘦素敏感性的特定下丘脑神经元亚群,并揭示了其在抑制过度摄食和体重增加中的关键作用 研究基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性尚需验证;研究聚焦于特定神经元亚群,其他可能参与瘦素信号通路的细胞类型未被全面探讨 探究在肥胖状态下,哪些神经基质仍保持对瘦素的敏感性并介导其对摄食行为的抑制作用 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠模型中的下丘脑神经元 神经科学,代谢研究 肥胖症 空间转录组学,单核RNA测序 NA 空间转录组数据,单核RNA测序数据 NA NA 空间转录组学,单核RNA测序 NA NA
618 2026-04-21
Spatial Distribution of K13-Positive Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Mar-23, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本研究探讨了K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化(IPF)中的空间分布及其在疾病进展中的作用 首次揭示了K13阳性hillock细胞在IPF远端气道中异常激活并驱动近端化表型转变,通过单细胞分析鉴定了相关的促纤维化亚群和信号通路 研究主要基于组织样本的空间分析和单细胞数据重分析,缺乏直接的体内功能验证实验 阐明特发性肺纤维化(IPF)中远端气道重塑的细胞机制,特别是上皮干细胞的作用 IPF患者和对照组的肺组织样本,重点关注K13阳性气道上皮细胞 数字病理学 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间免疫荧光,多重染色,体外培养实验 CellChat(用于细胞间通讯推断) 空间成像数据,单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及IPF和对照肺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
619 2026-04-21
RBX1+ CAFs Drives Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression Through Tenascin C Overexpression
2026-Mar-22, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究揭示了RBX1+癌症相关成纤维细胞通过上调Tenascin C表达驱动胰腺导管腺癌进展的机制 首次在单细胞水平上鉴定出RBX1在CAF亚群中的特异性表达,并阐明其通过调控Tenascin C促进PDAC进展的新机制 研究样本主要来自单一医疗中心,缺乏多中心验证;体内实验仅使用异种移植模型,未涉及基因工程小鼠模型 探究E3泛素连接酶在胰腺癌基质成纤维细胞中的作用及其对肿瘤进展的影响 胰腺导管腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、PAAD细胞系 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blotting、假时间分析、细胞通讯分析 NA 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 来自哈尔滨医科大学第一附属医院的胰腺组织样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
620 2026-04-21
Modern Pathology-Driven Strategies in Neoadjuvant Immunotherapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From Residual Tumor Quantification to Spatial and AI-Based Biomarkers
2026-Mar-21, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文综述了头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中基于病理学的策略,包括残留肿瘤量化、空间分析和人工智能生物标志物 整合了数字病理学和人工智能辅助图像分析,以增强病理反应评估的可重复性,并实现高分辨率映射,同时强调从解剖学分期向生物学驱动反应分层的转变 作为叙述性综述,可能未涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 探讨头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中病理学驱动的反应评估策略及其在指导治疗和临床试验设计中的应用 头颈部鳞状细胞癌患者的新辅助治疗标本 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫分析 人工智能辅助图像分析 图像、文本 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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