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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-04-30 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
|
研究论文 | 通过整合时间序列批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱，构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架，揭示动态和细胞类型特异性转录重编程机制 | 首次构建了玉米花转变的完整时空调控框架，发现花转变并非由统一的转录开关驱动，而是源自空间上不同的茎尖分生组织区域的协同作用，并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块以及UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新角色 | 未明确提及局限性 | 研究玉米茎尖分生组织在花转变过程中的转录重编程和细胞身份变化的分子机制 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq， 单细胞转录组学， 染色质可及性分析， 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据， 染色质可及性数据 | 时间序列样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 584 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
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综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架，整合识别、递送和反馈，实现个性化精准免疫治疗，并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域，包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 585 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
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研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物，并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及，但一般可能包括：机制验证仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中确认；4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP（免疫共沉淀）、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据（scRNA-Seq）、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠（多个）及野生型对照小鼠；具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 587 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
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研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能，包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法，涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集，揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究，Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法，为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法（STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV） | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 588 | 2026-04-28 |
The Human Male Mammary Gland has Similar Epithelial Populations to Female but Distinct Composition and Transcriptional Properties
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714915
PMID:41959192
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研究论文 | 论文通过单细胞RNA测序描绘了正常成人男性乳腺的细胞图谱，发现其与女性乳腺具有相同的上皮细胞类型，但组成和转录特性不同 | 首次以单细胞分辨率描述正常男性乳腺的细胞和转录特征，揭示了男性乳腺中管腔成熟细胞比例增加、基底细胞和管腔祖细胞减少的特异性组成，以及区别于女性的基因表达、RNA加工、炎症信号和雌激素受体通路活性差异 | 未提及具体局限性 | 填补正常男性乳腺单细胞层面表征的空白，为男性乳腺癌的细胞基础提供参考 | 正常成人乳腺组织样本（来自3名男性和14名女性捐赠者） | 数字病理学, 机器学习 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17名捐赠者（3名男性、14名女性），共174471个细胞（含18117个男性来源细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 589 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
|
研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法，整合六种细胞-细胞相互作用预测工具，优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性，强调排名列表顶部的一致性，优于简单平均值基线，并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略，强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2026-04-25 |
Comprehensive bioinformatics analysis and experimental validation reveal the role of circadian rhythm-related genes in the crosstalk between osteoporosis and atherosclerosis
2026-Mar-27, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-026-10216-5
PMID:41896290
|
研究论文 | 通过综合分析生物信息学和实验验证，揭示昼夜节律相关基因在骨质疏松与动脉粥样硬化共病中的关键作用 | 首次鉴定出AEBP1作为骨质疏松和动脉粥样硬化共病的关键共享标志基因，并揭示昼夜节律在骨髓基质细胞和血管平滑肌细胞中的调控机制 | 尚需进一步验证AEBP1作为治疗靶点的具体功能机制，且动物模型可能不完全模拟人类疾病复杂性 | 探索骨质疏松和动脉粥样硬化共存的共享标志基因及细胞机制 | 骨质疏松和动脉粥样硬化相关的单细胞RNA测序数据和mRNA表达谱，自然衰老小鼠和腺嘌呤诱导小鼠模型 | 生物信息学 | 骨质疏松, 动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序, mRNA表达谱分析 | hdWGCNA, AUCell | 基因表达数据 | 人类骨髓样本（9种细胞系17个亚群）和颈动脉样本（6种细胞系18个亚群），小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2026-04-25 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101329
PMID:41825449
|
研究论文 | 提出一种可扩展的非参数聚类方法NCLUSION，用于单细胞RNA-seq数据的统一标记基因选择与聚类分析 | 利用贝叶斯稀疏先验的非参数无限混合模型，同时实现标记基因识别和聚类，并采用变分推理算法支持百万级细胞规模 | 未明确说明局限性，但可能依赖公开数据集验证，需进一步评估在多样化样本中的泛化能力 | 开发一种无需用户预定义参数的聚类方法，以鲁棒统计方式同时识别标记基因并降低假发现率 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数无限混合模型 | 基因表达数据 | 模拟数据及公开scRNA-seq数据集（未提供具体数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 592 | 2026-04-25 |
Interpretable learning of temporal cellular dynamics from single-cell data
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101342
PMID:41875867
|
研究论文 | 提出NeuroVelo方法，通过结合最优线性投影和非线性神经常微分方程，从静态单细胞转录组数据中重建时间细胞动态 | 将动力学系统理论应用于优化潜在空间，同时确定细胞转变和识别驱动基因表达时间动态的基因相互作用 | 未提及明确局限性 | 从静态单细胞数据中重建时间细胞动态并识别驱动细胞命运的基因调控网络 | 单细胞转录组数据中的细胞动态变化 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 神经常微分方程 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序（single-cell RNA-seq） | NA | NA |
| 593 | 2026-04-25 |
Comparative analysis of nuclei isolation methods for brain single-nucleus RNA sequencing
2026-Mar-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101337
PMID:41875869
|
研究论文 | 比较三种不同的细胞核分离方法在脑组织单细胞核RNA测序中的效果 | 首次系统评估不同细胞核分离策略对核完整性和snRNA-seq数据质量的影响，填补了该领域的方法学空白 | 仅针对脑组织进行测试，其他组织类型的适用性尚需验证 | 评估不同细胞核分离方法对snRNA-seq数据质量的影响 | 脑组织中的细胞核 | 数字病理学 | 未指定 | 单细胞核RNA测序 | 未指定 | RNA测序数据 | 未详细说明 | 未指定 | 单细胞核RNA测序 | 未指定 | 未指定 |
| 594 | 2026-04-25 |
From a Multi-Omics Signature to a Therapeutic Candidate: Computational Prediction and Experimental Validation in Liver Fibrosis
2026-Mar-17, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030495
PMID:41901341
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研究论文 | 通过多组学特征开发肝纤维化进展标志物，并验证候选药物Withaferin A的抗纤维化活性 | 提出了一个跨病因稳健的六基因肝纤维化进展标志物，结合单细胞RNA测序和药物重定位方法发现并验证了Withaferin A的抗纤维化作用 | 研究仅基于公开数据集和动物模型验证，缺乏大样本临床队列的进一步评估 | 开发跨病因的肝纤维化进展预测标志物并发现潜在治疗药物 | 肝纤维化患者样本、小鼠模型及肝星状细胞系LX-2 | 计算机视觉 | 肝纤维化 | RNA-seq， 单细胞RNA测序（scRNA-seq）， 机器学习 | 随机森林， XGBoost， LASSO， Boruta | 基因表达数据， 单细胞转录组数据 | 训练队列368例，外部验证队列4个独立数据集，共涉及数百例样本；动物实验使用CCl4诱导小鼠模型 | Illumina | bulk RNA-seq， 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 595 | 2026-04-25 |
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04969-8
PMID:41827033
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示骨关节炎软骨中一种疑似祖细胞样软骨细胞亚群 | 首次在骨关节炎软骨中鉴定出一个表达祖细胞相关基因特征的软骨细胞亚群（PLC），并基于伪时间轨迹分析推测其处于分化层次的上游位置 | 功能性验证和空间定位验证仍需进一步开展，当前结论基于转录组推断 | 解析骨关节炎软骨的单细胞转录组图谱并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞亚群 | 6名终末期骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6名终末期骨关节炎患者，约14,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序（10x Chromium平台） |
| 596 | 2026-04-25 |
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04737-3
PMID:41824168
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研究论文 | 整合转录组学和单细胞分析揭示ITGAX+巨噬细胞是前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 | 首次通过整合TCGA转录组数据和单细胞RNA测序，鉴定出ITGAX+巨噬细胞在前列腺癌中作为关键免疫抑制因子，并揭示其与T细胞的抑制性相互作用 | 基于单一TCGA队列，缺乏独立的外部验证；还需要进一步的功能实验验证ITGAX+巨噬细胞的免疫抑制机制 | 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物，并阐明其免疫调控机制 | 前列腺癌患者肿瘤样本（499例肿瘤和52例正常前列腺样本） | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 499例肿瘤样本和52例正常前列腺样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2026-04-25 |
Single-cell transcriptomics reveals lipid metabolism reprogramming in macrophages in vitro during early stages of Leishmania donovani infection
2026-Mar-13, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07361-w
PMID:41827050
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研究论文 | 利用单细胞转录组测序技术分析杜氏利什曼原虫感染早期巨噬细胞的脂质代谢重编程 | 首次在单细胞水平揭示杜氏利什曼原虫感染早期巨噬细胞中Fabp4/Cd36脂质代谢通路的激活以及衰老相关基因的诱导，并发现M2型巨噬细胞更有利于寄生虫生存 | 论文摘要未提及具体局限性 | 探索杜氏利什曼原虫感染巨噬细胞的发病机制 | 小鼠巨噬细胞 | NA | 内脏利什曼病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠巨噬细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2026-04-25 |
Subtype specific immune-metabolic reprogramming in preeclampsia revealed by multiomics and serum biomarkers
2026-03, Hypertension research : official journal of the Japanese Society of Hypertension
IF:4.3Q1
DOI:10.1038/s41440-025-02504-5
PMID:41419624
|
研究论文 | 该研究整合单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学分析早发型和晚发型子痫前期的胎盘免疫-代谢重编程，并鉴定出早期妊娠血清标志物 | 首次同时整合胎盘单细胞RNA测序、空间转录组学和空间代谢组学揭示子痫前期两种亚型（早发与晚发）的特异性免疫-代谢重编程机制，并基于前瞻性队列发现三种早期妊娠血清代谢物可实现早发型子痫前期的有效预测 | 未明确说明研究局限性 | 解析早发型与晚发型子痫前期在细胞水平、转录组和代谢组的差异驱动因素，并探索早期妊娠血清标志物 | 人类胎盘组织及母体血清样本 | 机器 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学, 血清代谢组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 代谢物丰度数据 | 199例妊娠前瞻性队列（包括子痫前期患者和匹配对照） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 空间代谢组学, 血清代谢组学 | NA | NA |
| 599 | 2026-04-24 |
TAZ alleviates ischemic stroke injury by activating Foxo1: Usp1-mediated deubiquitination is the pivotal mechanism
2026-Mar-30, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本文揭示了转录共激活因子TAZ通过Usp1介导的去泛素化稳定自身并激活Foxo1，从而减轻缺血性脑卒中氧化损伤和神经元凋亡的机制 | 首次发现Usp1-TAZ-Foxo1轴是缺血性脑卒中抗氧化防御和神经元存活的關鍵调控通路，并阐明了TAZ通过去泛素化稳定的分子机制 | 仅使用了小鼠模型和体外神经元损伤模型，研究结果尚需在临床样本中验证；机制细节如Usp1对TAZ的特异性调控仍需进一步探索 | 阐明转录共激活因子TAZ在缺血性脑卒中中调控氧化损伤的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型及氧糖剥夺/复氧神经元损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 600 | 2026-04-24 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
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研究论文 | 该研究对57例来那度胺相关B细胞急性淋巴细胞白血病（LenB-ALL）进行了全面的分子特征分析，揭示了三种突变亚群，并发现IDH2 R140Q突变在LenB-ALL中高度富集 | 首次将来那度胺相关B-ALL定义为IDH2突变克隆造血与IKAROS缺失协同作用的分子亚型，并阐明了来那度胺通过促进IDH2突变克隆扩增及IKAROS下调导致B前体细胞成熟阻滞的致癌机制 | 研究样本量有限且为回顾性分析，未探索IDH2突变在不同种族人群中的差异，未明确继发白血病中其他遗传或表观遗传改变的具体类型 | 阐明来那度胺相关B-ALL的分子特征及致病机制 | 57例来那度胺治疗多发性骨髓瘤后继发B-ALL的患者标本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病, 多发性骨髓瘤 | NGS, RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列, RNA序列, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 57例来那度胺相关B-ALL患者标本及对照样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |