单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 51 篇文献，本页显示第 41 - 51 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-13 |
Spatial transcriptomics in the human left atrial appendage and pulmonary vein sleeve
2026 Mar-Apr, Cardiovascular pathology : the official journal of the Society for Cardiovascular Pathology
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.carpath.2025.107802
PMID:41314481
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析人类左心耳和肺静脉袖组织的基因表达空间分布 | 首次在人类肺静脉和左心耳组织中应用空间转录组学技术，揭示了AF相关基因PITX2、SHOX2和HCN4的空间表达模式 | 样本来源于未使用的移植供体，可能无法完全代表AF患者的病理状态 | 探究心房颤动（AF）治疗中肺静脉隔离的分子机制和基因表达特征 | 人类肺静脉（PV）和左心耳（LAA）组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | Seurat聚类分析 | 空间转录组数据 | 未使用的移植供体组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-01-12 |
Integrating Mendelian randomization and multi-omics analysis unravels gut microbiota-driven metabolic mechanisms in sepsis and identifies diagnostic biomarkers through experimental validation
2026-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0296018
PMID:41509654
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化与多组学分析，揭示了肠道菌群通过代谢机制在脓毒症中的作用，并通过实验验证确定了诊断生物标志物 | 首次结合孟德尔随机化、多组学分析（包括转录组学、非靶向代谢组学和单细胞转录组学）及机器学习算法，系统性地探索了肠道菌群与脓毒症之间的因果关系和机制，并通过肺源性类器官模型进行了实验验证 | 研究可能受限于样本大小、人群特异性或未完全考虑的环境混杂因素，且类器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明肠道菌群及其代谢物在脓毒症炎症反应中的因果关系和机制，并识别诊断生物标志物 | 肠道菌群、代谢物（如脂肪酸）、脓毒症相关基因以及肺源性类器官模型 | 多组学分析 | 脓毒症 | 孟德尔随机化、转录组学、非靶向代谢组学、单细胞转录组学、机器学习算法 | 机器学习算法（未指定具体模型）、肺源性类器官模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 43 | 2026-01-09 |
Evaluating imputation methods for accurate estimation of cell population fractions in single-cell RNA sequencing
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf204
PMID:41503159
|
研究论文 | 本研究系统评估了八种单细胞RNA测序数据插补算法在准确估计细胞群体比例方面的性能 | 首次系统评估多种插补算法在改善细胞群体大小估计方面的能力，并定义了改善估计的条件 | 仅评估了八种算法，可能未涵盖所有现有方法；依赖于模拟和参考数据集，可能无法完全代表真实生物样本的复杂性 | 评估单细胞RNA测序数据插补方法在准确估计细胞群体比例方面的有效性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体比例估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | MAGIC, SAVER, scVI, DCA, scBiG, kNN-smoothing, scImpute, ALRA | 单细胞RNA测序数据 | 两个模拟数据集和一个深度测序参考数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-01-08 |
A protocol for high-quality single-cell RNA sequencing with cell surface protein quantification
2026-Mar, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000254
PMID:41488013
|
研究论文 | 本文提出了一种标准化协议，用于结合细胞表面蛋白定量进行高质量单细胞RNA测序 | 通过CITE-seq技术实现转录组和蛋白质组数据的同步分析，提供了一种兼容现有工作流程、成本高效且增强细胞类型分类分辨率的标准化方法 | NA | 开发一种标准化协议，以整合多模态单细胞数据，精确表征罕见细胞亚群 | 单细胞水平的转录组和蛋白质组数据 | 数字病理学 | NA | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 45 | 2026-01-04 |
Rap1b is a critical regulator of germinal vesicle breakdown in porcine oocytes
2026-Mar-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了Rap1b通过激活p38α MAPK信号通路调控猪卵母细胞生发泡破裂的关键作用 | 首次在猪卵母细胞中鉴定Rap1b作为p38 MAPK通路的上游调控因子，并阐明其通过促进p-MKK6激活p38α MAPK信号通路来调控GVBD的分子机制 | 研究主要基于体外成熟模型，体内生理环境的影响尚未评估；且分子互作的具体机制如Rap1b如何精确调控p-MKK6仍需进一步探索 | 阐明猪卵母细胞生发泡破裂的分子调控机制 | 猪卵母细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量，但使用猪卵母细胞进行实验 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2025-12-28 |
Lubricin maintains temporomandibular joint homeostasis by regulating synovial inflammation
2026-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.101051
PMID:41445976
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研究论文 | 本研究探讨了蛋白聚糖4（Prg4，即润滑素）在维持颞下颌关节稳态中的作用及其在颞下颌关节骨关节炎中的病理意义 | 首次利用高分辨率Visium HD空间转录组学揭示了Prg4在颞下颌关节中的区域特异性表达模式，并阐明了其在炎症过程中的时间依赖性调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探索Prg4在维持颞下颌关节稳态及治疗颞下颌关节骨关节炎中的潜在再生治疗应用 | 野生型和Prg4敲除小鼠的颞下颌关节、体外培养的滑膜细胞 | 空间转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 空间转录组学、谱系追踪、体外炎症刺激 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、基因表达数据 | 野生型和Prg4敲除小鼠模型，具体数量未明确说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 高分辨率Visium HD空间转录组学平台 |
| 47 | 2025-12-14 |
Fibroblast diversity within human gut-associated lymphoid tissues
2026-Mar-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250471
PMID:41379085
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，绘制了人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性图谱 | 首次识别CD24作为区分GALT成纤维细胞的标记物，并揭示了不同GALT亚型中成纤维细胞的功能差异 | 研究主要基于观察性数据，功能验证实验相对有限 | 探索人类肠道相关淋巴组织中成纤维细胞的多样性和功能 | 人类肠道相关淋巴组织（包括Peyer斑块、黏膜孤立淋巴滤泡和黏膜下孤立淋巴滤泡）中的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，共聚焦激光显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2025-11-27 |
CAP-CD56+CD271+ BMSCs exos-loaded PVA/SA sustained-release hydrogel attenuates chondrocyte senescence and ameliorates lumbar facet joint osteoarthritis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.027
PMID:41282412
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研究论文 | 本研究开发了一种新型CAP-CD56+CD271+ BMSCs外泌体-PVA/SA水凝胶缓释系统，用于治疗腰椎小关节骨关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定CD56+CD271+ BMSCs亚群，并开发了软骨细胞特异性抗原肽修饰的外泌体联合水凝胶缓释系统 | NA | 开发针对腰椎小关节骨关节炎的靶向治疗方法并阐明其分子机制 | 骨髓间充质干细胞亚群、外泌体、水凝胶材料和软骨细胞 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 分子实验, 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-11-27 |
Mechanically adaptive Mg-Ti composites guided by single-cell insights accelerate load-bearing bone regeneration via dual modulation of osteogenesis and osteoclastogenesis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.038
PMID:41282413
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研究论文 | 本研究开发了一种机械适应性Mg-Ti复合材料，通过单细胞RNA测序指导，实现成骨和破骨细胞生成的双重调节，加速承重骨再生 | 首次结合单细胞RNA测序揭示Mg选择性促进MSCs成骨分化并抑制破骨前体细胞成熟的分子机制，设计出机械性能随时间自适应优化的复合材料 | 研究仅报告了8周内的实验结果，长期效果和临床转化潜力需要进一步验证 | 开发能够同时满足机械稳定性和生物整合性的承重骨修复材料 | 镁钛复合材料在骨再生过程中的生物学效应和机械性能 | 组织工程与再生医学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，3D打印技术 | NA | 基因表达数据，机械性能数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-06 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 从转录组学角度探讨视神经损伤后的分子机制及神经修复策略 | 整合单细胞转录组学技术揭示视网膜神经节细胞亚型特异性反应，识别新的神经保护和再生相关基因 | 主要基于动物模型研究，临床转化仍需进一步验证 | 阐明视神经损伤分子机制并开发神经修复策略 | 视网膜神经节细胞 | 生物信息学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序,转录组分析,芯片分析,CRISPR-Cas9筛选,ATAC-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-06 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
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综述 | 本文综述了大脑屏障系统中驻留和募集巨噬细胞的起源、发育、分子特征和功能 | 重点关注小胶质细胞和边界相关巨噬细胞，并强调单细胞测序技术的最新进展 | NA | 探讨大脑屏障系统中巨噬细胞的作用机制 | 大脑屏障系统中的巨噬细胞（包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和募集巨噬细胞） | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |