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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2026-07-08
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
综述 探讨微RNA在脑组织空间中的调控作用,重点关注3'非翻译区视角 首次系统讨论空间转录组学中同时量化miRNA及其靶标3'UTR的局限性,并提出未来研究方向 目前尚无方法能在空间上同时量化miRNA与3'UTR,且空间上3'UTR异构体变异研究不足 总结miRNA介导的基因调控在神经发育和神经元功能中的作用,并梳理空间量化miRNA和3'UTR的实验与计算方法 脑组织中miRNA及其靶标3'UTR在空间上的调控机制 自然语言处理 NA 空间转录组学 NA RNA表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
42 2026-07-08
LncRNA NEAT1 promotes immunosuppression in gastric cancer under endoplasmic reticulum stress by maintaining the M6A methylation of SEMA3A in CAFs
2026-Mar-04, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 揭示内质网应激下lncRNA NEAT1通过维持CAFs中SEMA3A的m6A甲基化促进胃癌免疫抑制的机制 首次阐明内质网应激条件下癌症相关成纤维细胞中lncRNA NEAT1/METTL3/SEMA3A轴在胃癌免疫抑制中的作用,并开发靶向αvβ3的阳离子脂质体递送siNEAT1联合抗PD1治疗策略 未提及明显局限性 探究内质网应激下癌症相关成纤维细胞在胃癌免疫抑制中的作用机制,并开发联合免疫治疗策略 胃癌组织、癌症相关成纤维细胞、外泌体、T细胞 计算机视觉 胃癌 质谱、转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA pull-down、RIP-qPCR、流式细胞术、ELISA NA 质谱数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
43 2026-07-08
Integrated Single-Cell analysis Reveals molecular correlation of maternal-to-zygotic transition between human and pig embryo
2026-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA测序数据,揭示人类和猪胚胎从母体到合子转变过程中的分子相关性 首次系统性比较人类和猪胚胎早期发育中母体-合子转变的分子特征,发现核心转录因子和染色质重塑相关基因在物种间的共性与差异 采样点有限,仅覆盖卵母细胞到桑椹胚阶段,未能涵盖后续发育阶段;且物种间比较可能受样本量差异影响 阐明人类和猪胚胎早期发育中母体-合子转变的分子调控机制及其物种特异性 人类和猪胚胎,从卵母细胞到桑椹胚的发育阶段 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) Seurat, Monocle3, SCENIC 单细胞转录组数据 139个人类和猪的样本(卵母细胞到桑椹胚阶段) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 单细胞RNA测序数据使用Illumina NovaSeq平台生成
44 2026-07-08
RASIP1-positive TECs in pancreatic adenocarcinoma: a potential novel type of endothelial cells correlated with "hot" tumors
2026-Mar-04, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序与空间转录组学,鉴定胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞为一种新型内皮细胞亚群,其与“热”肿瘤特征相关并通过ERK信号调控免疫微环境 首次发现并表征胰腺癌中RASIP1阳性内皮细胞作为独特的内皮亚群,揭示其通过调节白细胞跨内皮迁移和ICAM1信号促进T细胞浸润的机制 研究主要基于转录组测序和体外实验,缺乏体内动物模型验证RASIP1靶向治疗的抗肿瘤效果 探究胰腺癌中内皮细胞在调控免疫细胞浸润和肿瘤免疫微环境中的作用机制 胰腺导管腺癌组织样本及RASIP1阳性肿瘤内皮细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫组化 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据、组织病理图像 人类胰腺癌组织样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序结合GEPIA分析和空间转录组学
45 2026-07-08
Reshaping the colorectal cancer immune microenvironment: insights from single-cell and spatial omics
2026-Mar-04, Cancer cell international IF:5.3Q1
综述 利用单细胞和空间组学技术揭示结直肠癌免疫微环境的重塑机制 整合单细胞RNA测序与空间转录组学数据,定义结直肠癌肿瘤微环境中的空间生态位和相互作用网络,并总结新的免疫治疗策略 未提及 综述单细胞RNA测序和空间转录组学在结直肠癌免疫微环境研究中的应用,总结细胞异质性、空间生态位和功能相互作用 结直肠癌肿瘤微环境中的免疫细胞、基质细胞和细胞外基质 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
46 2026-07-08
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示Tnfsf15在Alport综合征早期上调对肾小球损伤和蛋白尿的保护作用 首次在Alport综合征小鼠模型中利用单细胞RNA测序鉴定出Tnfsf15在疾病早期(蛋白尿和结构异常出现前)即上调,并通过基因敲除实验证实其具有保护作用 未提及,但可能限于动物模型研究,结论是否适用于人类尚需验证 探究Alport综合征早期肾小球内的分子变化及Tnfsf15的功能 Col4a5 G5X Alport小鼠模型 单细胞转录组学 Alport综合征(肾脏疾病) 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 两个时间点(5周龄和8周龄)的小鼠肾小球样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3' 测序
47 2026-07-08
SpaJoint: a transfer learning method for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 提出了一种基于迁移学习的空间转录组学解卷积方法SpaJoint,有效整合单细胞RNA测序和空间转录组数据,实现细胞类型空间分布的高精度预测 首次将迁移学习应用于空间转录组解卷积,通过考虑不同空间位置间的空间相关性,实现了出色的细胞类型组成预测和空间区域识别性能 NA 开发一种高效、稳健的空间转录组解卷积方法,以解析组织内不同细胞类型的空间分布 空间转录组和单细胞RNA测序数据集 机器学习 NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 迁移学习模型 基因表达数据 NA NA 空间转录组学、单细胞RNA测序 NA NA
48 2026-07-06
Spatial and cellular composition of lung fibrosis induced by multi-walled carbon nanotubes
2026-Mar-04, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 通过空间转录组学、mRNA测序、代谢组学和微生物组分析,研究多壁碳纳米管暴露如何影响肺部免疫反应和肠道稳态,揭示肺-肠轴联系的分子机制 首次整合空间转录组学与多组学方法,发现Slamf7-Slamf7相互作用是巨噬细胞超级活化的关键驱动因素,为传统中医肺-肠理论提供现代分子证据 研究主要基于小鼠模型,人类相关性有待验证;空间转录组学的分辨率可能限制单细胞水平分析;仅检测了短期暴露效应 阐明多壁碳纳米管诱导肺纤维化的免疫机制及其对肠道的影响 多壁碳纳米管暴露后的小鼠肺组织和肠道组织 数字病理学 肺纤维化 空间转录组学,mRNA-seq,代谢组学,16S rRNA微生物组分析 NA 基因表达数据,代谢物谱,微生物组序列 小鼠样本(具体数量未在摘要中明确) NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA NA
49 2026-07-06
iAODE for benchmarking and continuum modeling of single-cell chromatin accessibility
2026-Mar-03, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 引入iAODE模型,用于单细胞染色质可及性的基准测试和连续建模 将变分自编码器与潜在神经ODE、低权重KL正则化和可解释重构瓶颈相结合,学习生成性、时间连续的潜在空间 未明确说明局限性 开发能够编码时间连续性的单细胞染色质可及性数据分析方法 单细胞染色质可及性数据和单细胞RNA测序数据 机器学习 NA scATAC-seq, scRNA-seq 变分自编码器, 神经ODE 单细胞染色质可及性数据, 单细胞RNA测序数据 248个scATAC-seq数据集和123个scRNA-seq数据集 NA 单细胞ATAC测序, 单细胞RNA测序 NA NA
50 2026-07-06
Pharmacological stabilization of hypoxia-inducible factor 1-α dampens the interferon response and promotes glycolysis in Aicardi-Goutières syndrome
2026-Mar-03, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞转录组学和靶向代谢组学分析Aicardi-Goutières综合征患者外周血样本,发现HIF-1α表达活性下降导致代谢向氧化磷酸化转变,药物稳定HIF-1α可逆转代谢开关并减轻干扰素反应 首次揭示HIF-1α在AGS中的表达缺失与代谢重编程的关联,并证明药物稳定HIF-1α可逆转代谢开关、减轻炎症反应 体外细胞模型与临床实际存在差异,药物稳定HIF-1α的长期效果及安全性需进一步验证 探究AGS中干扰素介导的慢性炎症的代谢机制及潜在治疗靶点 携带ADAR1、RNASEH2B或SAMHD1突变的AGS患者外周血单核细胞和树突状细胞 数字病理学 艾卡迪-古蒂埃综合征 单细胞转录组测序、靶向代谢组学 机器学习模型、差异基因表达分析 单细胞基因表达数据、代谢组学数据 AGS患者外周血样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2026-07-06
Dysregulation of ferroptosis-related genes and the ACSL4-mediated ferroptosis-PD-L1 axis in prostate cancer pathogenesis
2026-Mar-03, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了前列腺癌中铁死亡相关基因的失调以及ACSL4介导的铁死亡-PD-L1轴在癌症发病机制中的作用 首次揭示铁死亡与PD-L1之间的串扰机制,并鉴定出ACSL4是连接铁死亡和免疫微环境的关键调控因子 主要基于TCGA公共数据,缺乏大规模临床样本验证;铁死亡与PD-L1轴的分子机制研究仍需进一步深化 探究前列腺癌中铁死亡相关基因的失调模式及ACSL4/PD-L1轴在铁死亡与免疫微环境间的交互作用 前列腺癌组织和正常组织样本及相关细胞系 数字病理学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 Lasso-Cox回归模型 基因表达数据 TCGA数据库中的前列腺癌和正常组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2026-07-06
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过在三价流感疫苗中设计跨越多个血凝素头部表位的抗原变异,重新编程免疫优势层级,从而在连续免疫中拓宽保护性免疫应答 首次证明通过连续疫苗间针对血凝素头部多个表位(A、B、D)的定向变异,可重编程表位层级,将回忆反应重新导向保守的亚显性头部和茎部表位,从而突破免疫印记限制 仅基于雪貂模型验证,尚未在人类临床试验中确认该策略的效果和安全性;研究未探讨长期免疫持续性及对多季病毒株的交叉保护效果 探索通过定向抗原变异重塑表位免疫层级,以克服免疫印记对流感疫苗保护广度的限制 雪貂模型(模拟人类免疫印记样回忆反应)以及H3N2流感病毒株 机器学习, 蛋白质结构预测 流感病毒感染 单细胞转录组测序, ELISpot实验, 中和抗体检测, 抗原表位作图, 结构分析 NA 基因表达数据, 抗体结合数据, 病毒载量数据 使用动物模型(雪貂)并设置不同疫苗序列组,具体样本数未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 使用10x Genomics平台进行单细胞转录组分析
53 2026-07-05
Prussian blue analogue-mineralized ginseng-derived vesicles promote PPARγ nuclear translocation to suppress tumor vasculogenic mimicry and reverse the immunosuppressive microenvironment
2026-Mar-18, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 开发了一种仿生纳米平台GDVs@CuPBA-iRGD,通过铜基普鲁士蓝类似物在人参源囊泡上原位矿化,并偶联肿瘤穿透肽iRGD,用于抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境 首次将人参源囊泡与铜基普鲁士蓝类似物结合,通过PPARγ核转位机制抑制血管生成拟态,并利用单细胞RNA测序揭示其激活抗肿瘤免疫的后续效应 研究主要基于肝细胞癌模型,对其他肿瘤类型的适用性有待验证;纳米平台的长期毒性和临床转化潜力需进一步评估 开发一种抑制肿瘤血管生成拟态并逆转免疫抑制微环境的创新治疗策略 肝细胞癌(HCC)细胞和小鼠模型 机器学习 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠肝细胞癌模型样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'试剂盒
54 2026-07-05
M[Formula: see text]DGAT: Multi-view multi-scale dynamic graph attention network(GAT) based prediction of Parkinson's disease(PD) progression using whole-blood RNA sequencing data
2026-Mar-02, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出了多视图多尺度动态图注意力网络(M³DGAT),利用全血RNA测序数据预测帕金森病进展 首次融合多视图(时间、空间)与多尺度信息,并采用计数草图双线性融合策略整合时空视图,在动态图表示中编码疾病进展动态信息 论文未提及具体局限性 预测神经退行性疾病(如帕金森病)的进展轨迹,包括疾病阶段和认知评分 帕金森病患者全血RNA测序数据 机器学习 帕金森病 RNA测序 动态图注意力网络(DGAT) 基因表达数据 来自PPMI和PDBP队列的人体血液样本 NA NA NA NA
55 2026-07-05
Inhibition of 5αR2 promotes postoperative wound repair in BPH patients after TURP by alleviating fibrosis and inflammation
2026-03-01, Asian journal of andrology IF:3.0Q1
研究论文 探究5αR2抑制剂对良性前列腺增生患者经尿道前列腺切除术后伤口愈合的影响,发现其通过减轻纤维化和炎症促进恢复 首次通过随机临床试验结合动物模型和类器官实验,系统揭示5αR2抑制剂通过抑制纤维化和炎症加速BPH术后伤口修复的分子机制 未提及长期随访数据及潜在副作用评估,样本量较小(87例患者和12只比格犬) 评估5αR2抑制剂对BPH患者TURP术后伤口愈合、炎症控制和纤维化减少的效果 良性前列腺增生患者、比格犬、膀胱类器官 数字病理学 前列腺疾病 单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验,组织学分析 NA 基因表达数据,组织图像,蛋白质数据 87例BPH患者(治疗组47例,对照组42例),12只比格犬 NA 单细胞RNA测序 NA NA
56 2026-07-04
Cancer-immunity cycle-based molecular subtypes in breast cancer predict the response to immune checkpoint inhibitors
2026-Mar-05, Cancer biology & medicine IF:5.6Q1
研究论文 基于癌症免疫循环分子亚型预测乳腺癌对免疫检查点抑制剂的反应 首次基于癌症免疫循环构建分子亚型系统,并通过多组学分析(基因组学、代谢组学、单细胞RNA测序)揭示各亚型的肿瘤微环境、基因组和代谢特征差异,为精准免疫治疗提供新框架 未明确提及局限性(基于摘要信息无法推断) 建立基于癌症免疫循环的分子亚型分类方法,评估乳腺癌免疫状态并预测免疫检查点抑制剂疗效 乳腺癌患者(队列n=752)及泛癌免疫检查点抑制剂治疗队列 机器学习 乳腺癌 RNA测序、基因组学分析、代谢组学分析、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、基因组数据、代谢组数据、单细胞转录组数据 752例乳腺癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
57 2026-07-04
Single-Cell Profiling of Splenic Immune Ageing and Chronic Stress Adaptations in Mice With Natural Microbiota
2026-03, European journal of immunology IF:4.5Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序技术,对自然微生物群小鼠的脾脏免疫衰老和慢性应激适应进行了全面分析 首次通过跨队列单细胞研究,构建了包含超过27万脾细胞的综合图谱,揭示了脾脏免疫衰老的保守特征,并发现了慢性应激对年龄相关变化的有限对抗作用 未明确说明实验小鼠的品系和性别,以及慢性应激模型的具体构建方法,可能影响结果的普适性 探究脾脏免疫衰老及慢性应激适应过程的细胞和分子特征 年轻、老年和慢性应激的老年小鼠脾细胞 单细胞组学 免疫衰老相关疾病 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 来自3组小鼠的脾细胞,整合其他数据集后总计超过27万脾细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
58 2026-07-03
Lymph node colonization induces tissue remodeling via immunosuppressive fibroblast-myeloid cell niches supporting metastatic tolerance
2026-Mar-09, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 本研究利用空间蛋白质组学、空间转录组学及黑色素瘤淋巴结转移体内模型,探讨了头颈癌患者淋巴结定植诱导的免疫抑制机制,发现肿瘤相关成纤维细胞与髓系细胞形成的免疫抑制微环境促进全身性免疫耐受和转移进展 首次通过空间多组学整合分析揭示淋巴结内成纤维细胞-髓系细胞免疫抑制微环境的空间分布特征及其对T细胞功能障碍和调节性T细胞激活的驱动作用,并证明该免疫抑制效应可扩散至未受累淋巴结区域,形成全身性免疫抑制状态 主要基于头颈癌和黑色素瘤模型,其他癌症类型中的普适性尚需验证;样本量和队列规模未明确说明 阐明淋巴结定植在癌症全身免疫抑制中的主动驱动作用及其促进转移的分子机制 头颈癌患者原发肿瘤及配对淋巴结组织、黑色素瘤淋巴结转移小鼠模型 数字病理学 头颈癌,黑色素瘤 空间蛋白质组学,空间转录组学 NA 空间蛋白质组数据,空间转录组数据 头颈癌患者肿瘤及淋巴结样本(具体数量未说明)、黑色素瘤淋巴结转移小鼠模型 NA 空间转录组学 NA NA
59 2026-07-03
Challenges and advances in drug resistance and tolerance in cancer
2026-Mar-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1
会议报告 该文章综述了癌症药物耐药性与耐受性的生物学机制、微环境相互作用及前沿技术平台,提出了针对适应性耐受状态的转化治疗策略 整合了单细胞和空间转录组学、染色质可及性分析、类器官共培养平台及AI驱动的空间推断等前沿方法,揭示耐药性作为肿瘤微环境内进化适应和生态交互形成的连续谱系概念 其内容主要基于会议报告的综合,缺乏系统性文献综述的深度,且未提供具体研究数据或实证结果 剖析癌症药物耐药、适应性抵抗和免疫逃逸的多层次生物学机制,并提出新的治疗策略 癌症细胞内在可塑性、染色质重编程、应激响应转录网络、肿瘤微环境中的炎性信号、基质异质性、机械转导和旁分泌串扰等 数字病理学 癌症 单细胞和空间转录组学、染色质可及性分析、类器官共培养平台、AI驱动空间推断 NA 图像、文本 NA 10x Genomics, Illumina, BGI 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq, BGI MGISEQ 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium FFPE空间转录组学平台、Illumina NovaSeq高通量测序系统、BGI MGISEQ测序平台
60 2026-07-03
CD20+FCRL4+ B Cells Activate CD8+ T Cells via MHC-I Restriction in Nasopharyngeal Carcinoma Anti-Tumor Immunity
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞测序数据鉴定鼻咽癌中CD20+FCRL4+ B细胞亚群,并揭示其通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的抗肿瘤免疫机制 首次发现CD20+FCRL4+ B细胞亚群在鼻咽癌中的存在及其通过MHC-I途径激活CD8+ T细胞的新机制,并揭示了IFNγ在此过程中的关键作用及与PD-1表达和免疫治疗反应的相关性 未说明具体局限性 探索鼻咽癌中B细胞亚型及其与CD8+ T细胞的相互作用,阐明其在抗肿瘤免疫中的功能 鼻咽癌组织样本及CD20+FCRL4+ B细胞亚群 数字病理学 鼻咽癌 单细胞测序,免疫组化,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,组织切片图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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