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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-05-03 |
Targeted inhibition of Nrf2 potentiates antitumor immunity and enhances the efficacy of immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010841
PMID:41876134
|
研究论文 | 通过靶向抑制Nrf2增强肝细胞癌抗肿瘤免疫并提高免疫治疗效果 | 首次揭示Nrf2抑制通过下调PD-L1表达和上调MHC-I表达双重机制增强抗肿瘤免疫，并证明其与PD-1抗体和CAR-T细胞联合治疗的协同效应 | 研究主要基于小鼠模型，未在人类患者中验证；分子机制尚未完全阐明 | 探究抑制Nrf2对肝细胞癌免疫治疗耐药性的影响及其分子机制 | 肝细胞癌小鼠模型及肿瘤细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 同种异体移植肿瘤模型小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 562 | 2026-05-03 |
Integrative machine learning analysis suggests novel molecular targets for liver cancer diagnosis and therapy
2026-Mar-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04889-2
PMID:41866435
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研究论文 | 通过整合机器学习分析，确定用于肝癌诊断和治疗的新型分子靶点，并构建了一种包含8个基因的诊断模型 | 结合机器学习算法与单细胞测序数据，开发了一种诊断性能优越（AUC=1.000）的8基因诊断特征，并揭示了免疫浸润在肝细胞癌中的独特特征 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或外部验证数据集的代表性不足 | 通过识别关键分子靶点和通路，增强肝细胞癌的及时有效诊断和治疗 | 肝细胞癌患者与对照组的差异表达基因及相关免疫细胞浸润 | 机器学习 | 肝癌（肝细胞癌） | 微阵列基因表达谱、单细胞测序 | 机器学习算法（未具体说明，包括10折交叉验证） | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA（未在标题和摘要中明确说明） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-05-03 |
Multicellular origins of murine ovarian inflammaging
2026-Mar-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09826-1
PMID:41826404
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学，揭示小鼠卵巢衰老中多细胞起源的炎症老化机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术，鉴定了与年龄相关的巨噬细胞和T细胞亚群作为卵巢炎症老化的关键促炎信号来源，并预测了这些细胞与颗粒细胞之间的双向信号传导 | 未具体说明局限性 | 阐明卵巢炎症老化的多细胞机制，特别是免疫细胞在衰老过程中的功能及其对卵泡发育的影响 | 老年小鼠卵巢 | 自然语言处理 | 生殖衰老疾病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 老年小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium、10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒、10x Visium空间转录组试剂盒 |
| 564 | 2026-05-03 |
Reconstructing 3D transcriptional organization from spatial transcriptomics reveals consistent oncogenic translocations and developmental dynamics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag177
PMID:42059481
|
研究论文 | 介绍Cytocraft，一个从二维空间转录组数据重建三维转录组织结构的计算框架，并验证其在肺癌和蝾螈脑发育中的生物学应用 | 首次实现从二维空间转录组数据推断共享的、细胞类型特异的三维转录中心构型，并揭示癌症中MALAT1的定向易位和发育中转录中心重组的保守动态 | 基于仿真验证，可能受限于空间转录组数据的分辨率和噪声，真实三维构型推断的准确性尚需更多实验验证 | 开发一种能从二维空间数据重建三维转录组织结构的计算方法，以探索转录在发育和疾病中的空间组织规律 | 人类非小细胞肺癌样本和发育中的蝾螈脑 | 计算机视觉 | 肺癌 | 空间转录组学 | 计算框架 | 亚细胞空间转录组图谱 | 8例肺癌患者样本和蝾螈脑发育阶段样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 565 | 2026-05-03 |
Integrating and mapping single-cell transcriptomics across the entire gene expression space
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag204
PMID:42059480
|
研究论文 | 提出scGES深度学习框架，通过利用所有基因信息在完整基因表达空间整合单细胞转录组数据，校正批次效应 | 首次利用高度和低度可变基因的全基因表达空间进行批次效应校正，超越仅依赖高度可变基因的现有方法 | 未明确提及局限性 | 开发有效校正批次效应并整合单细胞转录组数据集的方法 | 单细胞转录组数据集及查询数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度学习框架 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2026-05-03 |
CaHoT-GRN: context-aware high-order topology learning for robust single-cell gene regulatory network inference
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag202
PMID:42059479
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研究论文 | 提出CaHoT-GRN框架，利用上下文感知的高阶拓扑学习实现稳健的单细胞基因调控网络推断 | 创新性地整合预训练生物大语言模型提取序列语义嵌入，并通过异质信息网络和相似性共注意力模块建模高阶基因相互作用与拓扑一致性 | 未在文中明确说明局限性，可能包括依赖预训练模型质量及计算复杂度较高 | 开发一种利用序列上下文信息和蛋白质相互作用知识的高阶拓扑学习框架，提升单细胞基因调控网络推断的准确性和鲁棒性 | 单细胞转录组数据集及相关的基因和蛋白质序列 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 预训练生物大语言模型、异质信息网络、相似性共注意力模块 | 序列数据、单细胞转录组数据 | 四种类型网络对应的单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2026-05-02 |
Circulating exhausted CD8+ effector memory cells differentiate immune checkpoint inhibitor-induced liver injury from other acute immune-mediated liver injuries
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014178
PMID:41895713
|
研究论文 | 本研究识别出一种循环CD8+效应记忆T细胞亚群，可区分免疫检查点抑制剂诱导的肝损伤与其他急性免疫介导的肝损伤 | 首次发现循环CD8+效应记忆T细胞亚群（高表达CD38、HLA-DR和CXCR3）可作为区分ChILI与DILI和AIH的生物标志物 | 样本量有限，且未提供具体验证队列规模 | 探索区分免疫检查点抑制剂诱导肝损伤与其他急性免疫介导肝损伤的生物标志物 | 接受免疫治疗的癌症患者（发生与未发生ChILI者）、DILI患者、AIH患者和健康对照 | 机器学习 | 免疫相关肝损伤 | 质谱流式细胞技术、流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 包括多个队列的ChILI、DILI、AIH患者及健康对照，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 568 | 2026-05-02 |
CX3CL1-CX3CR1 signaling orchestrates malignant progression of prostate cancer through luminal progenitor-macrophage crosstalk
2026-Mar-23, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01179-5
PMID:41870750
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学和基因工程小鼠模型，揭示了CX3CL1-CX3CR1信号轴在管腔祖细胞与肿瘤相关巨噬细胞互作中驱动前列腺癌恶性进展的机制 | 首次鉴定出管腔-2祖细胞与CX3CR1+巨噬细胞通过CX3CL1-CX3CR1轴形成免疫抑制微环境，并证明该信号轴在去势抵抗性前列腺癌进展中的关键角色 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证不足，且未深入探讨该信号轴在临床样本中的预后价值 | 阐明前列腺癌治疗抵抗和转移过程中，肿瘤微环境中特异性细胞互作机制 | 前列腺癌细胞、管腔祖细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习和数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学、基因编辑小鼠模型、原位同种异体移植模型 | NA | 单细胞转录组数据、动物模型实验数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3' 结合Illumina NovaSeq测序 |
| 569 | 2026-05-02 |
Deciphering lung adenocarcinoma heterogeneity: a multi-omics approach reveals nuclear division fibroblasts as prognosticators and therapeutic targets
2026-Mar-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08022-3
PMID:41862916
|
研究论文 | 通过多组学方法解析肺腺癌异质性，发现核分裂成纤维细胞作为预后标志物和治疗靶点 | 首次系统鉴定肺腺癌中核分裂成纤维细胞亚群，并基于此构建五基因预后模型，该模型优于49个已发表模型 | 高nLRS评分患者对免疫治疗的抵抗性需在肺腺癌特异性队列中前瞻性验证 | 系统表征肺腺癌相关成纤维细胞亚群，构建基于成纤维细胞的预后标志物 | 肺腺癌患者中的成纤维细胞亚群及其预后价值 | 机器学习 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习算法组合（100种） | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 2719例患者（19个队列）的bulk RNA数据，368,904个细胞（93个样本）的单细胞RNA数据，15,673个点（6个样本）的空间转录组数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 570 | 2026-05-02 |
Secondary analysis of influenza a virus-infected cells at single-cell resolution reveals host BANF1 response to individual and combinations of detected segments
2026-Mar-20, Virology journal
IF:4.0Q2
DOI:10.1186/s12985-026-03140-2
PMID:41862961
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据集，研究甲型流感病毒感染对宿主细胞代谢通路及基因表达的影响 | 利用单细胞分辨率揭示甲型流感病毒不同基因片段及组合对宿主基因表达的差异化影响 | 未明确提及局限性 | 理解甲型流感病毒复制对宿主细胞的细胞内效应，尤其是不同病毒片段对宿主反应的分子机制 | 感染H9N2甲型流感病毒的哺乳动物MDCK细胞 | 自然语言处理 | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2041个MDCK细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公开可用的scRNAseq数据集 |
| 571 | 2026-05-02 |
Telocyte Deletion Associated With Loss of Lymphatic Drainage and Exacerbation of Inflammatory-Erosive Arthritis in Mice
2026-Mar-16, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70131
PMID:41838025
|
研究论文 | 该研究通过转基因小鼠模型，发现滑膜淋巴系统（SLS）中端粒细胞（telocyte）的缺失与淋巴引流功能丧失及炎性糜烂性关节炎加重相关 | 首次发现关节周围淋巴管存在端粒细胞网络，并证明其缺失导致淋巴引流障碍和关节炎加剧，提出端粒细胞作为类风湿性关节炎新药物靶点 | 研究主要基于小鼠模型，可能限制向人类应用的直接转化；未深入探讨端粒细胞缺失的具体分子机制 | 阐明类风湿性关节炎中淋巴管收缩功能丧失的病因机制 | 转基因小鼠（Efhd1-CreERT2和Myoc-CreERT2小鼠）的关节引流淋巴系统 | 机器学习 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光显微术、电子显微镜、共聚焦显微镜、近红外成像、超声、显微CT | NA | 图像数据、基因表达数据 | 涉及多种转基因小鼠品系，具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2026-03-21 |
scZiva: imputation method for single-cell RNA-seq data with zero-inflated variational autoencoder
2026-Mar-19, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06422-2
PMID:41857511
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 573 | 2026-03-20 |
Lactylation-related gene signature for prognosis prediction and immune infiltration assessment in lung adenocarcinoma via bulk and single-cell RNA sequencing
2026-Mar-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04845-0
PMID:41851557
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 574 | 2026-05-01 |
Heterogeneity and Regulatory Mechanisms of ALK-Mutant and Wild-Type Epithelial Cells in Non-Small-Cell Lung Cancer: Single-Cell Transcriptomics and Chromatin Accessibility
2026-Mar-12, Pharmacology
IF:2.9Q2
DOI:10.1159/000550967
PMID:41818350
|
研究论文 | 利用单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示ALK突变型和野生型非小细胞肺癌上皮细胞的异质性与调控机制 | 首次整合scRNA-seq和scATAC-seq数据，比较ALK突变与野生型肿瘤的分子差异，并鉴定CEACAM6-AKT-EGR1信号轴在耐药和恶性进展中的作用 | 样本量较小，仅5例野生型和4例ALK突变型样本；未在动物模型中验证CEACAM6靶向治疗的疗效 | 解析ALK突变型和野生型NSCLC肿瘤上皮细胞的异质性和表观遗传调控差异 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | 机器学习, 数字病理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 9例非小细胞肺癌肿瘤组织样本（5例ALK野生型，4例ALK突变型） | Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | Illumina NovaSeq | 从GEO数据库获取GSE274934数据集的单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 |
| 575 | 2026-05-01 |
The landscape of B and plasma cells in breast cancer: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00917-0
PMID:41820356
|
研究论文 | 通过整合公开单细胞RNA测序数据和新生成的79份样本单细胞测序数据，构建了乳腺癌中B细胞和浆细胞的高分辨率图谱，揭示了其异质性和功能多样性 | 首次在乳腺癌中识别出两种肿瘤富集的B细胞亚群——CD200初始B细胞和ISG15非典型记忆B细胞，并验证了CD200 B细胞在抗肿瘤免疫和免疫检查点阻断治疗中的关键作用 | 未提及 | 解析乳腺癌中B细胞和浆细胞的异质性及其功能角色，探索其作为免疫治疗生物标志物和靶点的潜力 | 35名乳腺癌患者的79份样本（B细胞和浆细胞） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 基因表达数据、BCR序列数据、空间转录组学数据 | 35名患者共79份样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞BCR测序、空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 576 | 2026-05-01 |
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00915-2
PMID:41820369
|
研究论文 | 提出一个结合多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新框架，用于生成高质量、无标记、与苏木精-伊红染色等效的乳腺癌病理图像 | 通过引入显著性和全局特征一致性损失增强CycleGAN，实现无需像素级配准的非配对数据虚拟染色，且为非破坏性方法，同一组织切片可后续用于单细胞RNA测序或空间转录组学 | 未提及具体局限性 | 开发快速、非破坏性的诊断级乳腺癌病理图像生成方法，用于临床诊断和机制研究 | 临床样本、小鼠模型和类器官共培养样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 多光谱自发荧光成像 | CycleGAN | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 577 | 2026-05-01 |
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06937-6
PMID:41820393
|
研究论文 | 介绍了一个整合空间转录组学与H&E组织学图像的多组织数据集STHELAR，用于细胞类型注释 | 首次构建了包含16种组织类型、超过1100万个细胞的大规模多组织空间转录组数据集，并关联了H&E全切片图像，为直接从组织学图像预测细胞类型提供了参考资源 | 未提及具体限制，但可能存在数据来源于特定平台（Xenium FFPE）和细胞类别为十种泛癌类别的泛化局限性 | 通过整合空间转录组学与组织学图像，开发用于细胞类型注释的大规模数据集，以促进肿瘤微环境研究 | 来自22名癌症患者和9名非癌症患者的31个人类Xenium FFPE组织切片，涵盖16种组织类型 | 数字病理学, 空间转录组学 | 肿瘤（泛癌） | 空间转录组学, H&E染色 | 人工智能模型（用于从组织学图像预测细胞类型注释） | 图像, 基因表达数据 | 31个组织切片，来自31名患者（22例癌症，9例非癌症），包含超过1100万个细胞和50万个组织图像块 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium FFPE组织切片 |
| 578 | 2026-05-01 |
Low-dose chemotherapy remodels hepatic immune landscape and potentiates antitumor response to immune checkpoint blockade in cholangiocarcinoma
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001735
PMID:41779955
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研究论文 | 该研究探索低剂量吉西他滨/顺铂联合抗PD-L1治疗肝内胆管癌的疗效和机制 | 首次揭示低剂量化疗通过重塑肝内免疫景观并解除SPP1-VLA-4信号轴对CD8+T细胞的抑制，增强抗PD-L1免疫治疗的抗肿瘤应答 | 尚未明确低剂量化疗在不同肝内胆管癌亚型中的效果差异及长期疗效数据 | 优化肝内胆管癌治疗策略，降低化疗毒性并提高免疫治疗疗效 | 多种肝内胆管癌小鼠模型及患者来源的肿瘤组织和临床样本 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体内/体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多种小鼠模型及部分肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 579 | 2026-04-30 |
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s00285-026-02380-8
PMID:41866589
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研究论文 | 提出一种结合空间转录组数据的非局部反应-扩散数学模型，严格分析肿瘤内表型异质性的演化动态 | 首次将空间基因表达数据与非局部反应-扩散模型整合，开展严格的数学分析并揭示表观突变率决定肿瘤细胞表型集中分布的关键作用 | 模型假设依赖血管化肿瘤且参数空间维度较高，实际应用时计算复杂度较大 | 通过数学建模剖析肿瘤内表型异质性及其演化机制 | 血管化肿瘤及其内部异质性表型细胞群体 | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 非局部反应-扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 580 | 2026-04-30 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
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研究论文 | 通过整合15个人体组织中的三百万个单细胞进行单细胞RNA-seq数据分析，揭示了内皮细胞的异质性及其在血管类型和组织微环境中的信号传导机制 | 首次大规模整合多个组织单细胞转录组数据，开发计算流程分析代谢物或蛋白质介导的细胞间通讯，利用主题建模识别内皮细胞与其他组织驻留细胞之间的通讯模式 | 研究主要依赖公开数据集，可能受限于原始数据质量及组织覆盖的全面性 | 系统研究内皮细胞在血管类型和组织微环境背景下的异质性及其调控机制 | 人体15个组织中的内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题建模 | 单细胞转录组数据 | 15个人体组织中三百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |