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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2026-05-08 |
Spatial and Functional Immune Profiling Identifies Impaired Vascular Repair in Human Myocardial Infarction
2026-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040755
PMID:42072296
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研究论文 | 通过对人类心肌梗死组织的空间转录组学和功能性分析，揭示CD8 T细胞和抗原呈递细胞在梗死区域的动态相互作用以及内皮祖细胞功能障碍对血管修复的影响 | 首次在人类心肌梗死样本中结合空间转录组学和功能性检测，绘制免疫-基质细胞在梗死区域的时空动态图谱，发现抗原呈递细胞驱动的CD8 T细胞募集及内皮祖细胞功能障碍是血管修复受损的关键特征 | 样本量较小（仅纳入少数患者），且空间分析局限于两个时间点（梗死后第2天和第6天），可能未能捕捉到完整的免疫-血管修复动态过程 | 阐明人类心肌梗死后免疫-基质细胞的空间互作及其对血管修复的影响 | 人类心肌梗死组织（梗死后第2天和第6天）及外周血样本 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 流式细胞术, 内皮祖细胞集落形成实验 | NA | 基因表达数据, 细胞组成数据, 信号通路数据 | 有限数量的心肌梗死患者组织及外周血样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 542 | 2026-05-08 |
Cellular Senescence in Neurodegeneration: From Cell Types to Therapeutic Opportunities
2026-Mar-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040758
PMID:42072300
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综述 | 综述了细胞衰老在中枢神经系统神经退行性疾病中的作用，包括其机制、检测方法和治疗策略 | 特别强调了SASP在神经炎症、血管功能障碍和神经组织损伤中的角色，以及使用机器学习工具和转录组学方法改进衰老细胞检测的准确性 | 常用的衰老标志物特异性有限，存在假阳性检测风险；针对衰老细胞的治疗策略（如senolytics和senomorphics）存在临床挑战和局限性 | 探讨细胞衰老在神经退行性疾病发病中的作用，并总结相关治疗机会 | 中枢神经系统中的衰老细胞、神经退行性疾病（阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症） | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病、帕金森病、多发性硬化症 | qRT-PCR、ELISA、RNA测序、单细胞RNA测序 | 机器学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 543 | 2026-05-08 |
Transcriptional Heterogeneity of Cardiac Remodeling Between Type 1 and Type 2 Diabetes
2026-Mar-25, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14040746
PMID:42072287
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research paper | 本研究结合RNA测序和单细胞RNA测序，揭示了1型和2型糖尿病导致的心脏重塑在转录组水平上的异同，发现两型糖尿病在通路变化上比基因变化更具一致性 | 首次系统比较1型和2型糖尿病心脏重塑的转录异质性，揭示两型糖尿病在信号通路层面比基因层面具有更高的一致性，并针对内皮细胞、巨噬细胞和成纤维细胞三类细胞进行深入分析 | 仅使用小鼠模型，未在人体样本中验证；未详细说明样本量和重复次数；缺乏功能验证实验 | 探究1型和2型糖尿病心脏重塑的转录异质性，识别共享和特异性的基因及通路变化 | 1型糖尿病和2型糖尿病小鼠模型的心脏组织 | digital pathology | cardiovascular disease | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 544 | 2026-05-08 |
A single-cell transcriptome atlas reveals the transcriptionally earliest state in rice callus
2026-Mar-25, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-026-08596-6
PMID:41882557
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示水稻愈伤组织转录最早期的细胞状态 | 首次利用单细胞RNA测序构建水稻胚性和分化愈伤组织的转录组图谱，鉴定出愈伤组织创始细胞和茎尖分生细胞分别代表胚性和分化愈伤组织的最早期转录状态 | NA | 解析水稻愈伤组织发育过程中细胞命运转变的初始状态和调控因子 | 水稻（Oryza sativa L.）胚性和分化愈伤组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 水稻胚性和分化愈伤组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 545 | 2026-05-08 |
The expression characteristics of miR-206-3p in musculoskeletal tissue and its clinical significance
2026-Mar-25, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-026-06785-5
PMID:41882698
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研究论文 | 探讨miR-206-3p在骨肌组织中的表达特征及其与老年骨肌减少症患者临床参数的相关性 | 挑战了miR-206传统上被视为肌肉特异性分子的观点，发现其在骨-肌肉祖细胞中共表达，并作为骨肌交互的关键分子枢纽 | 未明确说明局限性，但研究基于老年髋部骨折患者的前瞻性队列，可能限制普适性 | 阐明miR-206-3p在骨肌组织中的表达模式和细胞特异性，及其与肌力、步速和骨密度的相关性 | 158例老年髋部骨折患者（79例骨肌减少症和79例对照）的骨肌组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | qRT-PCR, 原位杂交, scRNA-seq | NA | 图像与序列数据 | 158例患者（79例骨肌减少症，79例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 546 | 2026-05-08 |
Deep Single-Cell Transcriptomic Profiling of Bovine Milk Somatic Cells Revealed Expression of Stem Cell Related Transcription Factors
2026-Mar-24, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040365
PMID:42074484
|
研究论文 | 利用深度单细胞转录组测序技术解析牛乳体细胞中干细胞相关转录因子的表达 | 通过深度单细胞RNA测序揭示了低深度测序未能检测的稀有转录因子，强调了测序深度对解析细胞转录状态和功能异质性的重要性 | 仅包含两头泌乳中期荷斯坦奶牛的数据，样本量有限 | 进一步表征牛乳体细胞的单细胞转录组，重点关注高分辨率基因表达谱和细胞异质性 | 两头健康泌乳中期的荷斯坦奶牛的牛乳体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2头荷斯坦奶牛 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的微流控平台进行单细胞转录组测序 |
| 547 | 2026-05-08 |
Celcomen: spatial causal disentanglement for single-cell and tissue perturbation modeling
2026-Mar-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69856-5
PMID:41851134
|
研究论文 | Celcomen通过生成图神经网络在空间转录组学数据中解构细胞内和细胞间基因调控程序 | 首次将数学因果关系框架应用于空间转录组学，实现虚拟组织的扰动模型生成后扰动反事实数据 | NA | 建模疾病和治疗引起的单细胞空间分辨组织反应 | 人类胶质母细胞瘤、人类胎儿脾脏和小鼠肺癌样本 | 机器学习 | 多发性疾病 | 空间转录组学 | 生成图神经网络 | 空间转录组数据 | 人类胶质母细胞瘤样本、人类胎儿脾脏样本和小鼠肺癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 548 | 2026-05-08 |
Illuminating cell states by a comprehensive and interpretable single cell foundation model
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70071-5
PMID:41839876
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研究论文 | 引入CellVQ模型，通过大规模单细胞数据集和单细胞离散化模块，提升泛化能力和可解释性 | 提出单细胞离散化模块将高维稀疏数据转化为细胞编码，并开发CellVQ-Graph工具整合多模态数据构建知识图谱 | 实际应用中仍面临数据稀疏性和异质性的挑战 | 开发一个真正适用且可泛化的单细胞基础模型，提高数据表示、泛化能力和可解释性 | 单细胞测序数据及多模态数据（基因、细胞通讯、注释） | 机器学习 | 非特定疾病 | 单细胞测序 | CellVQ基础模型 | 单细胞数据、基因、细胞通讯、注释 | 6800万细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 549 | 2026-05-08 |
scTWAS: a powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2026-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70374-7
PMID:41820391
|
research paper | 提出scTWAS统计框架，利用单细胞数据进行细胞类型特异性转录组全关联研究 | 首次开发针对单细胞数据的TWAS方法，通过潜变量模型和矩估计应对单细胞数据的强噪声、技术变异和高稀疏性挑战 | 未明确提及局限性 | 开发一种使用单细胞数据进行细胞类型特异性TWAS的统计方法 | 血液和脑组织中的单细胞数据，29种血液学特征和三种免疫相关疾病，以及阿尔茨海默病 | machine learning | 阿尔茨海默病，免疫相关疾病 | scRNA-seq | 潜变量模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2026-05-08 |
CRISPR-based functional genomics for dissecting therapeutic dependency in primary acute myeloid leukemia samples
2026-Mar-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.003
PMID:41759529
|
研究论文 | 开发了一种优化的CRISPR平台，用于在原代急性髓系白血病样本中进行功能基因组学分析，以解析治疗依赖性 | 首次将CRISPR功能基因组学直接应用于原代急性髓系白血病患者样本，结合体外和体内CRISPR-Cas9敲除及CRISPRi筛选，并集成Perturb-seq技术解析调控网络和细胞异质性 | 主要依赖患者来源的异种移植模型和原代样本，可能无法完全模拟体内微环境；筛选结果需要进一步临床验证 | 建立一种通用且稳健的框架，利用CRISPR功能基因组学直接解析原代AML患者样本中的癌症依赖性和细胞异质性 | 原发性急性髓系白血病样本，包括患者来源的异种移植模型和原代样本 | 功能基因组学 | 急性髓系白血病 | CRISPR-Cas9, CRISPRi, Perturb-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2026-05-08 |
Robust and efficient annotation of cell states through gene signature scoring
2026-03-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280926.125
PMID:41708334
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研究论文 | 系统评估现有基因签名评分方法并开发调整邻居评分算法，显著提高单细胞RNA测序数据中细胞状态注释的准确性和稳定性 | 提出调整邻居评分算法，通过增强对照基因选择显著改善分数稳定性和跨签名可比性，实现与监督方法相当的无监督细胞状态注释 | 未明确说明，但可能依赖先验的基因签名定义，且在高度异质性数据中的泛化性能有待进一步验证 | 开发稳健高效的基因签名评分框架，改进单细胞RNA测序分析中的无监督细胞状态注释 | 九个健康和癌症单细胞RNA测序数据集中的细胞状态 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 调整邻居评分 | 单细胞转录组数据 | 九个健康和癌症单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2026-05-08 |
GSTA1 Conferred Tolerance to Osimertinib and Provided Strategies to Overcome Drug-Tolerant Persister in EGFR-Mutant Lung Adenocarcinoma
2026-03, Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer
IF:21.0Q1
DOI:10.1016/j.jtho.2025.10.001
PMID:41076079
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析EGFR突变肺腺癌患者样本，揭示了GSTA1在奥希替尼耐药持久性细胞中的作用及克服策略 | 首次阐明RSPH1-CALML4-GSTA1调控轴及PROS1-AXL信号通路在药物耐受持久性细胞形成中的机制，并提出GSTA1抑制剂curzerene联合奥希替尼的可行治疗方案 | 药物耐受持久性细胞形成机制尚不完全清楚，限制TKI治疗后耐受状态或耐药出现时的治疗选择 | 解析EGFR-TKI诱导的药物耐受持久性细胞的细胞和转录组特征，探索克服药物耐受和耐药的新策略 | 接受一线奥希替尼治疗的肺腺癌患者样本（包括基线、药物耐受持久性状态和稳定耐药状态） | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 553 | 2026-05-04 |
Cell confinement initiates a delayed but heritable loss of chromosomes
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117053
PMID:41811846
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研究论文 | 本研究通过染色体报告系统量化活细胞中在物理压缩后发生的染色体丢失现象，发现细胞压缩会触发延迟但可遗传的染色体丢失 | 首次使用染色体报告系统（ChReporters）在活细胞中定量测量物理压缩导致的染色体丢失，并揭示压缩后延迟出现的染色体错误分离机制 | 研究主要基于体外细胞实验，体内肿瘤微环境中更复杂的力学因素和多细胞相互作用未被充分模拟 | 探究细胞物理压缩如何引发可遗传的染色体丢失及其分子机制 | 活体哺乳动物细胞 | 计算机视觉 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 未明确说明样本数量，涉及多种细胞系和药物处理条件 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 554 | 2026-05-04 |
scComm: a contrastive learning framework for deciphering cell-cell communications at single-cell resolution
2026-Mar-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04043-9
PMID:41877186
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研究论文 | 提出scComm框架，利用监督对比学习在单细胞分辨率下推断细胞间通讯，并在结直肠癌和肝癌研究中揭示新见解 | 首次将监督对比学习应用于单细胞分辨率的细胞间通讯推断，克服传统聚类方法忽视细胞内异质性的局限，并在多种癌症分析中展示优越性能 | 未提及计算资源需求或对大规模数据集的扩展性，也未讨论模型对噪声数据的鲁棒性 | 开发能高分辨率解析细胞间通讯的计算方法，以发现传统方法遗漏的生物学见解 | 单细胞RNA测序数据模拟样本，以及结直肠癌和肝癌患者的真实scRNA-seq数据 | 机器学习 | 结直肠癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 对比学习网络 | 单细胞基因表达数据（模拟和真实数据） | 模拟数据集（具体数量未说明），以及结直肠癌和肝癌患者的scRNA-seq样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2026-05-04 |
Single-cell and spatial profiling reveal cDC2A-CXCL13+CD8+ T-epithelial cell crosstalk and cytotoxicity through TNFRSF9 in cutaneous and mucosal lichen planus
2026-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70506-z
PMID:41832141
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学分析揭示皮肤和黏膜扁平苔藓中cDC2A-CXCL13+CD8+ T细胞与上皮细胞通过TNFRSF9的相互作用和细胞毒性机制 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和蛋白质组学数据，系统揭示了cDC2A细胞在驱动CXCL13+CD8+ T细胞介导的上皮细胞毒性中的关键作用，并发现TNFRSF9通路是潜在治疗靶点 | 样本量有限（28例患者和18例对照），且仅分析了皮肤和黏膜两种亚型，未覆盖其他变体；功能性验证实验未在文中提及 | 解析皮肤和黏膜扁平苔藓的免疫微环境，阐明T细胞与上皮细胞相互作用的分子机制 | 皮肤和黏膜扁平苔藓患者的组织样本 | 数字病理学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 28例患者和18例健康对照的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 556 | 2026-05-04 |
stGrads: decoding spatial gene expression gradients through proximity-driven analysis in complex tissues
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag201
PMID:42061906
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研究论文 | 提出stGrads计算框架，通过邻近驱动分析解码复杂组织中的空间基因表达梯度 | 首次将空间邻近建模与基于衰减的信号传播相结合，在基因表达和细胞组成水平上表征特定细胞类型诱导的空间梯度 | 未明确说明局限性 | 开发一种通用且高效的计算工具，用于表征复杂组织环境中的空间相互作用和功能响应 | 多种空间转录组数据集中的组织样本 | 计算机视觉、机器学习 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 多个空间转录组数据集（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 557 | 2026-05-03 |
Association between craniosynostosis and phospholipid metabolism: Insights from single-cell and transcriptomic analysis
2026-Mar-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000048030
PMID:41894269
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研究论文 | 通过多组学方法研究颅缝早闭与磷脂代谢之间的关联，并探索他汀类药物的潜在治疗效果 | 首次从磷脂代谢角度探索颅缝早闭的发病机制，结合孟德尔随机化、转录组分析、单细胞RNA测序及药物靶点分析等多种方法 | 他汀类药物相关遗传证据为探索性发现，统计学显著性受限于样本量，需在更大队列和实验模型中进一步验证 | 揭示颅缝早闭与磷脂代谢的关联，并评估他汀类药物的潜在治疗作用 | 颅缝早闭患者和小鼠颅缝组织 | 数字病理学 | 小儿颅面畸形 | 孟德尔随机化、转录组测序、单细胞RNA测序、药物靶点分析、分子对接 | NA | 基因表达数据、脂质性状数据 | 临床样本（具体数量未提及）及小鼠颅缝组织 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 558 | 2026-05-03 |
Pharmacologic targeting of the dopamine D2 receptor impacts the efficacy of immune checkpoint blockade in melanoma
2026-Mar-27, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014080
PMID:41895714
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研究论文 | 通过调节多巴胺D2受体影响免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤的效果 | 首次发现通过FDA批准的药物靶向多巴胺D2受体可增强免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤的效果，并揭示了不依赖催乳素的直接免疫调节机制 | 研究仅在动物模型中进行，未在人类患者中验证效果 | 探讨调节多巴胺D2受体对免疫检查点抑制剂治疗黑色素瘤疗效的影响及其潜在机制 | 小鼠黑色素瘤模型（B16F0和MEL11443细胞系）及PRL-locus响应和未响应的小鼠 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、免疫组化 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 多种小鼠模型，包括C57BL/6小鼠、Collaborative Cross小鼠和F1杂交小鼠，具体数量未在摘要中说明 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序和批量RNA测序平台 |
| 559 | 2026-05-03 |
SPTEdU-seq enables parallel optics-free newborn cell tracking and spatial total transcriptional dynamics in intact microenvironments
2026-Mar-26, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.001
PMID:41895283
|
研究论文 | 开发了SPTEdU-seq技术，整合空间全转录组与EdU标记，实现新生细胞追踪与空间总转录动态分析 | 首次实现无需光学成像的新生细胞追踪与空间全转录组联合分析，能同时检测编码和非编码RNA及剪接异构体 | NA | 建立同时捕获基因表达和增殖动态的空间转录组学方法 | 小鼠发育和成体大脑、小鼠缺血性中风模型、小鼠和人类肾肿瘤组织 | 数字病理学 | 缺血性中风、肾肿瘤 | 空间转录组学、EdU标记 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠和人类组织样本（具体数量未说明） | NA | 空间转录组学 | SPTEdU-seq | 整合总转录本捕获与EdU标记的空间转录组学平台 |
| 560 | 2026-05-03 |
Targeting SPP1 +TAMs associated with liver metastasis reverses immunosuppression and synergizes with immunotherapy in colorectal cancer
2026-Mar-25, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014128
PMID:41881501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示结直肠癌中SPP1+肿瘤相关巨噬细胞与肝转移相关的免疫抑制机制，并验证联合治疗策略 | 首次系统性描绘SPP1+ TAMs在结直肠癌原发灶与转移灶中的空间、发育及代谢异质性，发现其两种代谢亚型（糖酵解型ATP5F1E+和氧化磷酸化型MT-CO1+）及组织特异性分布 | 研究主要基于单细胞转录组数据，功能验证依赖小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞在原发灶与转移灶微环境中的空间和代谢异质性及其免疫抑制机制 | 结直肠癌患者原发肿瘤、癌旁正常组织、肝转移灶、淋巴结转移灶及外周血样本 | 机器学习, 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫组化 | UMAP聚类, 伪时间推断, RNA速率, CellChat | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 来自多中心队列共998204个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒用于单细胞RNA测序，10x Visium用于空间转录组分析 |