单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 521 - 540 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
521 2026-05-12
RPS26 Expression as a Predictive Biomarker and Functional Modulator in Sublingual Immunotherapy for Japanese Cedar Pollinosis
2026-Mar-06, International archives of allergy and immunology IF:2.5Q3
研究论文 研究核糖体蛋白基因RPS26表达作为日本柳杉花粉症舌下特异性免疫治疗疗效的预测性生物标志物及功能调节因子 首次通过单细胞RNA测序发现RPS26表达与SLIT临床应答密切相关,并揭示其通过调控IL-10表达和Treg细胞稳定性参与免疫耐受 样本量较小(35例患者),且RPS26并非普遍适用的预测性生物标志物,需更大规模前瞻性研究验证其临床效用 确定RPS26表达是否有助于SLIT疗效,并明确其在T细胞动力学、细胞因子产生和表观遗传调控通路中的作用 日本柳杉花粉症患者的外周血单核细胞 数字病理学 过敏性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 35例患者(治疗前),其中26例配对样本(治疗1年后) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'端测序
522 2026-05-12
PlantscRNAdb 4.0: Improved marker identification and annotation under a cell-type uniformity for plants
2026-03-02, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 PlantscRNAdb 4.0数据库更新,引入新的植物细胞类型本体(POCT)和HCMarker工具,覆盖33个植物物种,提供标准化和精确的细胞类型注释 引入植物细胞类型本体(POCT)以实现统一的细胞类型命名,开发HCMarker多指标评分系统用于高置信度标记基因鉴定,并推出PCmaster_anno深度学习工具以自动注释植物细胞类型 未提及具体局限性 改善植物单细胞RNA-seq数据的标记基因鉴定和细胞类型注释标准化 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 深度学习 基因表达数据 33种植物物种的107个单细胞RNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
523 2026-05-10
Atlas-guided discovery of transcription factors for T cell programming
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 通过构建CD8 T细胞状态图谱,系统定义驱动T细胞程序分化的转录因子 首次整合转录组和表观遗传数据构建九种CD8 T细胞状态图谱,结合体内CRISPR筛选与单细胞测序发现新型TEX选择性转录因子ZSCAN20和JDP2 未明确说明局限性 系统定义驱动CD8 T细胞状态分化的转录因子,为精准工程化T细胞免疫治疗提供平台 CD8 T细胞的多种分化状态(包括终末耗竭T细胞、组织驻留记忆T细胞等) 自然语言处理 癌症 CRISPR筛选、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、表观遗传数据 九种CD8 T细胞状态的数据 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
524 2026-05-09
IGSF9 drives malignant transformation and predicts early-stage lung adenocarcinoma in integrated transcriptomic analyses
2026-Mar-29, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合转录组分析,发现IGSF9驱动恶性转化并可预测早期肺腺癌 首次发现IGSF9作为早期肺腺癌的诊断生物标志物,并揭示其在恶性转化中的多重作用,包括免疫逃逸、肿瘤细胞迁移和侵袭以及干细胞样AT2亚群向恶性状态的转化 未明确阐述研究样本数量、平台具体配置等细节,可能需要在更大规模队列中验证 阐明早期肺腺癌的分子机制并识别有效的诊断生物标志物 早期肺腺癌患者样本及肿瘤微环境中的肺泡细胞 机器学习和单细胞转录组学 肺腺癌 scRNA-seq,机器学习 随机森林和LASSO 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
525 2026-05-09
Analysis and validation of mast cells and enriched genes in colorectal cancer with liver metastasis by multi-omics data
2026-Mar-27, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过多组学数据分析和验证结直肠癌肝转移中的肥大细胞及其富集基因的作用 首次结合批量测序和单细胞RNA测序数据,系统分析肥大细胞在结直肠癌肝转移中的比例变化,并构建基于三个富集基因(APOC1、SPP1、CLU)的预测模型 未明确提及样本来源或外部验证的局限性,可能缺少对不同亚型肥大细胞的深入功能验证 确定肥大细胞及富集基因在结直肠癌肝转移中的作用 结直肠癌患者的原发肿瘤和肝转移组织样本 数字病理学 结直肠癌、肝转移 批量测序、单细胞RNA测序、免疫组化 预测模型(基于基因表达) 基因表达数据、组织样本图像 四个批量测序数据集共223个样本,一个单细胞RNA测序数据集,以及临床样本 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
526 2026-05-09
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 利用空间转录组技术构建日本脑炎发病机制的综合时空图谱 首次同时原位捕获宿主和病毒转录组,构建日本脑炎发病的综合时空图谱,并揭示Ly6c2单核细胞和Ackr1内皮细胞在病毒传播和神经炎症中的关键作用 仅在小鼠模型中验证,需要进一步在人类样本中验证;未详细讨论其他细胞类型和信号的潜在贡献 研究日本脑炎病毒(JEV)感染引起的神经病理过程中的细胞互作机制 日本脑炎病毒感染的小鼠大脑 数字病理学 日本脑炎 空间转录组学 NA 空间基因表达数据 雌性BALB/c小鼠,具体样本数量未提及 华大基因 空间转录组学 Stereo-seq Stereo-seq空间转录组技术
527 2026-05-09
A blueprint for local and distal invasion programs in glioblastoma
2026-Mar-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像技术,探讨胶质母细胞瘤的局部和远端侵袭程序 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和多重复用成像结合,系统解析胶质母细胞瘤的远端和局部侵袭潜力及其转录程序 研究主要基于异种移植小鼠模型,可能无法完全模拟人类胶质母细胞瘤的微环境 阐明胶质母细胞瘤侵袭的分子机制,区分侵袭潜力与侵袭过程相关的转录特征 20种患者来源的胶质瘤球体模型及小鼠原位异种移植模型 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重复用成像 NA 基因表达数据、空间转录组数据、成像数据 20种患者来源的胶质瘤球体模型 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
528 2026-05-09
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 使用多模态成像揭示溶酶体药物储库导致PARP抑制剂在肿瘤内呈异质性分布 首次通过患者来源的外植体多模态成像管线,在单细胞水平上显示PARP抑制剂积累的高度异质性,并发现溶酶体作为弱碱性PARP抑制剂的药物储库影响核内药物浓度和疗效 未提及具体局限性 研究肿瘤异质性对药物分布和疗效的影响,特别是PARP抑制剂在高级别浆液性卵巢癌中的细胞内在积累差异 患者来源的外植体、高级别浆液性卵巢癌肿瘤组织 数字病理学 卵巢癌 多模态成像、空间转录组学 NA 图像、转录组数据 多个患者来源的外植体样本(具体数量未明确) NA 空间转录组学 NA NA
529 2026-05-09
Local antibody feedback enforces a checkpoint on affinity maturation in the germinal center and promotes epitope spreading
2026-Mar-10, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 研究局部抗体反馈如何通过种系中心调节亲和力成熟并促进表位扩散 首次揭示局部表位特异性竞争通过抗体反馈回路直接影响种系中心反应,低亲和力B细胞在特定条件下比高亲和力B细胞更持久,并促进免疫反应向替代表位扩散 该研究基于小鼠模型,可能无法完全代表人类免疫系统的复杂性,且未深入探讨长期免疫记忆形成的影响 探究局部抗体反馈如何在种系中心中调控亲和力成熟的检查点并影响表位扩散 小鼠模型及携带特定亲和力B细胞受体的B细胞 机器学习 人类免疫缺陷病毒感染 NA NA 基因表达数据 小鼠模型,具体数量未提供 NA 空间转录组学 NA NA
530 2026-05-09
Acute Inflammation Drives Corneal Pathological Regeneration
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序描绘急性炎症诱导的角膜病理再生过程中的转录组和表观遗传组图谱 首次提供炎症角膜的时间分辨单细胞转录组和表观遗传组综合图谱,揭示细胞类型特异性基因调控元件和顺式调控染色质相互作用 未明确说明局限性 表征急性炎症诱导的角膜转录组和表观遗传组重塑 脂多糖或PBS处理后第5天和第10天的角膜缘-角膜组织 数字病理学 角膜炎症性疾病 scRNA-seq, scATAC-seq, 免疫荧光 NA 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 未明确说明样本量 10x Genomics 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序
531 2026-05-09
Deconvolving cell-type-specific gene expression profiles from bulk RNA-seq samples
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 开发基于U-Net的深度学习算法BLUE,从bulk RNA-seq样本中解卷积出细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱 提出U-Net架构的深度学习算法BLUE,能同时预测细胞类型比例和细胞类型特异性基因表达谱,显著优于现有解卷积算法 NA 整合bulk RNA-seq和scRNA-seq的优势,从bulk RNA-seq数据中推断细胞类型特异性基因表达信息 bulk RNA-seq样本和scRNA-seq数据集 机器学习 癌症 RNA-seq U-Net 基因表达数据 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
532 2026-05-08
Lineage-Specific Sex-Biased Transcriptional Programs in Healthy Human Truncal Skin Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞转录组学构建健康人类躯干皮肤的性别解析图谱,揭示谱系特异性性别偏向转录程序 首次在单细胞分辨率下系统描绘健康人类躯干皮肤的性别差异,发现性别偏向基因呈谱系特异性而非广泛表达变化 样本量有限(12名捐赠者),且仅聚焦躯干皮肤,未涵盖其他身体部位 明确健康成人躯干皮肤在细胞组成和基因表达上的性别关联差异 健康人类躯干皮肤的细胞组成和性别偏向转录程序 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 12名捐赠者(5男,7女),共107,967个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
533 2026-05-08
Lactylation-Associated Immune Metabolic Reprogramming Identifies S100A2 and S100A14 as Candidate Diagnostic Biomarkers in Primary Open-Angle Glaucoma: An Integrated Bulk and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析,确定S100A2和S100A14作为原发性开角型青光眼的候选诊断生物标志物,并揭示其与免疫代谢重编程的相关性 首次将乳酰化相关免疫代谢重编程与原发性开角型青光眼联系起来,通过机器学习识别出S100A2和S100A14作为候选诊断标志物,并利用单细胞分析揭示其细胞类型特异性表达模式 NA 探索原发性开角型青光眼中乳酰化相关的免疫代谢重编程,并识别可靠的诊断生物标志物 原发性开角型青光眼患者的骨小梁组织样本 数字病理学 原发性开角型青光眼 RNA-seq, 单细胞RNA测序 机器学习模型 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
534 2026-05-08
Single-Cell Multi-Omics Reveal Gene Regulatory Mechanisms Underlying Cardiac Embryonic Development
2026-Mar-31, Genes IF:2.8Q2
综述 综述单细胞多组学技术在解析心脏胚胎发育基因调控机制中的应用 系统总结了单细胞多组学(如scRNA-seq、scATAC-seq、空间转录组学)在构建高分辨率心脏细胞图谱、揭示细胞异质性和谱系分化机制方面的最新进展 技术方法仍需进一步完善,整合分析策略有待优化以更全面揭示发育过程 阐明单细胞多组学技术如何揭示心脏胚胎发生中的基因调控机制及其对先天性心脏病的启示 心脏胚胎发育过程中的细胞类型、谱系轨迹和基因调控网络 数字病理学 先天性心脏病 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA NA
535 2026-05-08
Astrocytes in neuroinflammation and brain cancer
2026-Mar-30, Molecular biomedicine IF:6.3Q1
综述 合成单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学和多重成像证据,描绘星形胶质细胞在神经炎症和脑癌中的主要肿瘤相关程序,并提出4D时空映射框架和胶质液体活检概念 提出基于星形胶质细胞的4D时空映射框架和胶质液体活检概念,识别可干预的分子节点 尚缺乏临床纵向采样和空间图谱验证,星形胶质细胞靶向干预的体内验证和患者分层需要进一步研究 阐明星形胶质细胞在脑癌(尤其是胶质瘤)进展中的状态转变机制,并探索治疗转化策略 肿瘤相关星形胶质细胞 数字病理学 脑癌(胶质瘤) 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学、多重成像 NA 图像、文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序,10x Visium空间转录组学
536 2026-05-08
Integrated Multi-Omics and Machine Learning Framework Identifies Diagnostic Signatures and Druggable Targets in Breast Cancer
2026-Mar-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合多组学与机器学习框架,鉴定乳腺癌诊断标志物及可药靶点 首次结合127种机器学习算法与SMR因果推断,筛选出关键诊断基因CHEK1,并利用AI辅助虚拟筛选与分子对接优先识别靶向化合物 研究结果为基于计算预测的假设生成,尚需实验验证才能得出治疗结论 鉴定乳腺癌高灵敏度、高特异性的诊断生物标志物及靶向治疗分子靶点 乳腺癌转录组数据,包括7个GEO数据集与TCGA-BRCA队列(共1231个样本) 机器学习 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞转录组测序 集成机器学习(127种算法组合) 转录组数据、单细胞转录组数据 1231个乳腺癌样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq(推测) NA
537 2026-05-08
Single-Cell Sequencing Reveals γδT Cell Heterogeneity Under Distinct Microsatellite Statuses as a Potential Biomarker for Immunotherapy and Prognosis in Colorectal Cancer
2026-Mar-29, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过单细胞测序揭示不同微卫星状态下γδT细胞的异质性,并探讨其作为结直肠癌免疫治疗和预后生物标志物的潜力 首次在单细胞分辨率下鉴定出微卫星不稳定结直肠癌中富集的C4_CXCL13 γδT细胞亚群,该亚群具有耗竭样T细胞表型但保留强大的细胞毒功能,并基于其17个标记基因构建了与生存、免疫浸润和治疗反应相关的特征评分 基于公共数据集的验证可能受限于样本异质性,且功能验证实验不够充分 阐明不同微卫星状态下γδT细胞的异质性特征及其在调控结直肠癌免疫治疗反应中的作用 结直肠癌患者中的γδT细胞亚群 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量转录组分析 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据 NA(基于公共数据集,未明确样本数量) NA(未在标题和摘要中提及具体平台公司) 单细胞RNA测序 NA NA
538 2026-05-08
Th17-driven CD8+ T cells in hUC-MSC and CAR T-cell dual immunotherapy for superior anti-tumor efficacy
2026-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 开发了一种新型双重细胞免疫疗法,将人脐带间充质干细胞与CD19 CAR T细胞联合使用,以增强抗肿瘤效果并减轻副作用 首次揭示hUC-MSC通过Th17分化诱导CD8 NK样细胞毒性T淋巴细胞,从而在肿瘤高负荷条件下增强CAR T细胞疗效 基于异种移植模型,可能无法完全模拟人体免疫环境 探索hUC-MSC与CAR T细胞联合疗法在肿瘤高负荷条件下的抗肿瘤效果和安全性 人脐带间充质干细胞和CD19 CAR T细胞 机器学习 血液恶性肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 高负荷B细胞淋巴瘤异种移植模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
539 2026-05-08
HIF1 inhibition targets tumoral and myeloid cells, and is a promising therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer
2026-Mar-27, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学揭示HIF1抑制靶向肿瘤和髓系细胞,为转移性去势抵抗性前列腺癌提供有前景的治疗策略 首次结合单细胞和空间转录组学揭示HIF1信号在PTEN/TP53缺失的前列腺癌中调控髓系细胞浸润和转移微环境,并提出HIF1抑制优于直接髓系细胞阻断的治疗效果 仅在小鼠模型中进行验证,需在人类样本和临床试验中进一步确认 阐明HIF1信号在转移性去势抵抗性前列腺癌中的肿瘤和免疫微环境调控机制 PTEN和TP53双敲除的前列腺癌小鼠模型及肿瘤相关髓系细胞 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、流式细胞术、免疫组化 NA 转录组数据 小鼠前列腺肿瘤组织样本及肝转移灶 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
540 2026-05-08
Unraveling Circadian Rhythm Disorder-Related Gene Signatures and Molecular Subtypes in Ulcerative Colitis: An Analysis of Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2026-Mar-27, Genes IF:2.8Q2
研究论文 通过整合批量与单细胞转录组数据,揭示昼夜节律紊乱相关基因特征及溃疡性结肠炎的分子亚型 首次建立昼夜节律紊乱与溃疡性结肠炎发病之间的强关联,并基于此开发了高风险预测模型及分子亚型 需要进一步的临床验证来确认模型的预测准确性 研究昼夜节律紊乱在溃疡性结肠炎中的作用及意义 溃疡性结肠炎患者和小鼠模型 自然语言处理 溃疡性结肠炎 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RT-PCR Lasso, SVM-RFE, 随机森林 转录组数据 五个独立UC队列的批量测序数据 NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部