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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-04-23 |
Extracellular vesicle miR-93-5p cargo regulates glomerular endothelial cell damage in Alport syndrome
2026-Mar-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197643
PMID:41869725
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研究论文 | 本研究探讨了miR-93-5p在Alport综合征中调节肾小球内皮细胞损伤的作用,以及人羊水干细胞来源的细胞外囊泡通过其miR-93-5p货物介导疾病修饰活性的机制 | 首次揭示miR-93-5p在Alport综合征肾小球内皮细胞中的特异性下调,并证明hAFSC-EVs通过传递miR-93-5p调节VEGFR1和VEGFR2信号通路,从而恢复肾小球内皮细胞功能 | 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且未详细探讨miR-93-5p在其他肾细胞类型中的作用 | 探究miR-93-5p在缓解Alport综合征肾小球损伤中的作用,以及hAFSC-EVs的疾病修饰活性是否由其miR-93-5p货物介导 | Alport综合征模型中的肾小球内皮细胞、人羊水干细胞来源的细胞外囊泡以及患者活检组织 | 数字病理学 | Alport综合征 | 空间转录组学分析、空间分子成像、转录组学和蛋白质组学分析 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、空间转录组数据、成像数据 | 未明确指定样本数量,但包括动物模型和患者活检组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 522 | 2026-04-23 |
Temporal Dynamics of Endothelium After Radiation Injury Reveal a Transient Pro-Angiogenic Capillary Subpopulation Associated with Skin Repair
2026-Mar-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27062879
PMID:41898737
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠皮肤辐射损伤后血管内皮细胞的动态功能状态,并发现了一个与皮肤修复相关的短暂促血管生成毛细血管亚群 | 首次在辐射损伤模型中系统描绘了血管内皮细胞的时间动态变化,并鉴定出一个具有促血管生成功能的短暂毛细血管亚群(capVEC2),揭示了其在血管-表皮通讯中的作用 | 研究基于小鼠模型,人体内的响应可能不同;单细胞测序数据主要反映转录组水平的变化,需要后续功能实验验证 | 阐明辐射损伤后血管内皮细胞的动态功能状态和调控机制 | 小鼠背部皮肤的血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 轨迹推断、通路富集、转录因子活性推断、细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据 | 多个辐射后时间点收集的小鼠背部皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 523 | 2026-04-23 |
In Vitro and In Vivo Validation of Endothelium-Derived Potential Therapeutics for Myocardial Ischemia/Reperfusion Injury Identified by an AI-Enhanced Single-Cell and Virtual-Cell Paradigm
2026-Mar-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27062743
PMID:41898604
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研究论文 | 本研究结合单细胞图谱分析、AI模拟和实验验证,识别出S100A8是心肌缺血/再灌注损伤中血管炎症的关键分子,并发现穿心莲内酯可通过靶向S100A8通路发挥保护作用 | 首次将单细胞分析、AI模拟(包括虚拟细胞范式、AlphaFold3结构预测和分子对接)与体内外实验相结合,系统性地识别并验证了S100A8作为MI/R损伤的治疗靶点及穿心莲内酯的潜在疗效 | 研究主要基于小鼠模型,其在人体中的有效性和安全性仍需进一步验证;AI模拟的预测准确性依赖于现有数据库和算法,可能存在偏差 | 识别心肌缺血/再灌注损伤中内皮细胞功能障碍的关键分子,并寻找潜在的治疗药物 | 小鼠心肌缺血/再灌注损伤模型中的内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, AI模拟, 分子对接, 虚拟敲除模拟 | hdWGCNA, AlphaFold3, AutoDock | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-04-23 |
Single-Cell Multi-Tissue T Cell Clonal Dynamics Reveal Distinct Immune Coercion Landscapes in MSI and MSS Colorectal Cancer
2026-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27062689
PMID:41898550
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组和T细胞受体测序数据,揭示了MSI和MSS结直肠癌中T细胞克隆动力学的不同模式及其与免疫治疗反应的关系 | 开发了TCR重建流程TORBiT,首次从T细胞克隆动力学角度揭示了MSI和MSS结直肠癌中两种不同的免疫胁迫模式 | 样本量相对较小(43个样本),且仅针对结直肠癌,结果可能无法推广到其他癌症类型 | 阐明结直肠癌中T细胞克隆动力学与免疫治疗反应的关系 | MSI和MSS结直肠癌患者的血液和组织样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | 43个血液和组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq | NA | NA |
| 525 | 2026-04-23 |
Decoding Fibroblast Diversity Associated with the Postnatal Loss of Cardiac Regenerative Capacity
2026-Mar-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27062709
PMID:41898567
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,解码了与出生后心脏再生能力丧失相关的成纤维细胞多样性 | 首次在单细胞水平上系统比较了再生性新生儿与非再生性成年小鼠心脏成纤维细胞的异质性、细胞外基质程序和通讯网络差异 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量相对有限;未深入探究CF3亚群在成年损伤中弱诱导的具体机制 | 探究心脏成纤维细胞异质性如何影响出生后心脏再生能力的丧失 | 小鼠左心室中的代谢活性CD45/CD31非肌细胞(富集成纤维细胞群体) | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,批量转录组数据 | 正常新生儿(P3)和成年(P84)小鼠左心室样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2026-04-23 |
ESPeR-seq: Extremely Sensitive and Pure, End-to-end, RNA-seq library preparation
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.12.711386
PMID:41959175
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研究论文 | 本文提出了一种名为ESPeR-seq的新型RNA-seq文库制备方法,旨在解决现有单细胞RNA测序技术中的非特异性PCR产物、转录终止位点捕获不准确以及虚假UMI生成等问题 | 开发了Omega-dT引物实现精确链特异性转录终止位点捕获,并采用含尿嘧啶的TSO和尿嘧啶不耐受DNA聚合酶的'多重锁定'生化机制消除PCR背景和虚假UMI | 未在摘要中明确说明方法的具体应用限制或技术瓶颈 | 开发高灵敏度、高纯度的端到端RNA-seq文库制备方法,提升单细胞RNA测序的定量准确性和全长异构体分辨率 | 单细胞RNA测序文库制备技术 | 单细胞测序技术 | NA | RNA-seq | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 527 | 2026-04-23 |
Spatial transcriptomics for gene discovery identifies Slc13a5 as a modulator of bone mechanoadaptation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.11.711126
PMID:41958988
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,在小鼠胫骨中识别了机械负荷诱导的基因表达变化,并发现Slc13a5作为骨机械适应性的调节因子 | 首次应用空间转录组学(GeoMx, NanoString)在骨组织中系统分析机械负荷下的基因表达空间变化,并验证了跨平台一致性基因 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;空间转录组学技术可能受限于分辨率和样本数量 | 识别骨机械适应性的关键分子调节因子,以开发针对骨脆性增加的治疗策略 | 小鼠胫骨的骨膜和骨组织区域,特别是在张力和压缩区域 | 空间转录组学 | 骨脆性疾病 | 空间转录组学,RNA-seq,激光捕获显微切割 | NA | 空间基因表达数据,RNA-seq数据 | 小鼠胫骨样本,具体数量未在摘要中明确说明 | NanoString | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学平台 |
| 528 | 2026-04-23 |
STEVE: Single-cell Transcriptomics Expression Visualization and Evaluation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.10.710898
PMID:41959208
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研究论文 | 本文介绍了一个名为STEVE的定量框架,用于评估单细胞RNA测序研究中细胞类型注释的准确性、稳健性和可重复性 | STEVE是首个系统性框架,以数据集特定方式或完整分析流程为背景,评估细胞类型注释的稳健性,并整合了三个互补的评估模块 | NA | 开发一个框架来评估和提升单细胞RNA测序中细胞类型注释的准确性和可重复性 | 单细胞RNA测序数据及其细胞类型注释 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个独立的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2026-04-23 |
Exploring the human brain: spatial transcriptomics challenges and approaches in post-mortem analysis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf452
PMID:41349001
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综述 | 本文回顾了空间转录组学技术在人类大脑死后分析中的应用、挑战与机遇 | 系统比较了空间转录组学工具,并总结了其在人类大脑研究中的具体应用与挑战 | NA | 探讨空间转录组学在人类大脑研究中的挑战与机遇,为研究人员提供指导 | 人类大脑 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 530 | 2026-04-23 |
Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986
PMID:39885670
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综述 | 本文综述了大脑屏障系统中巨噬细胞(包括小胶质细胞、边界相关巨噬细胞和募集巨噬细胞)的起源、发育、重要分子和功能,并强调了单细胞测序等新技术带来的进展 | 聚焦于大脑屏障系统中的巨噬细胞亚群,系统梳理了其起源、分子特征和功能,并整合了单细胞测序等新技术的最新发现 | 是一篇综述性文章,未报告原始实验数据或提出新的理论模型 | 总结大脑屏障系统中巨噬细胞的生物学特性、功能及研究进展 | 大脑屏障系统中的巨噬细胞,主要包括小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 神经免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 531 | 2026-04-23 |
Molecular mechanisms after optic nerve injury: Neurorepair strategies from a transcriptomic perspective
2026-Mar-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00794
PMID:40313107
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综述 | 本文从转录组学角度综述了视神经损伤后的分子机制,并探讨了神经修复策略 | 整合单细胞转录组学、转录组分析和芯片分析,揭示了视神经损伤和青光眼诱导的神经元退行性变的分子机制,并识别了与视网膜神经节细胞保护和再生相关的基因及关键转录因子 | 综述性质文章,未涉及原始实验数据,未来需结合多组学方法和计算模型进行更深入的研究 | 阐明视神经损伤的分子机制并探索神经修复策略 | 视网膜神经节细胞 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 芯片分析, CRISPR-Cas9筛选, ATAC-seq分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 高通量测序, ATAC-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-04-23 |
Scavenging of Isolevuglandins Attenuates Neutrophil Migration and Neutrophil Extracellular Trap Formation in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Mar, ACR open rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/acr2.90015
PMID:41852193
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研究论文 | 本研究探讨了异戊二烯醛在系统性红斑狼疮中通过驱动中性粒细胞迁移和中性粒细胞胞外陷阱形成促进自身免疫和血管炎症的作用 | 首次证明异戊二烯醛清除剂能有效抑制SLE患者和小鼠模型中的NETosis,揭示了isoLGs在SLE病理中的新机制 | 样本量较小(SLE患者n=6,小鼠n=11-15),且研究主要基于体外和动物模型,需进一步临床验证 | 探究异戊二烯醛在系统性红斑狼疮中性粒细胞胞外陷阱形成和疾病活动中的作用 | 系统性红斑狼疮患者的中性粒细胞和SLE易感小鼠的淋巴组织 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 免疫荧光、单细胞测序、流式细胞术 | NA | 图像、序列数据、流式数据 | SLE患者6例,B6.SLE123小鼠11-15只 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 533 | 2026-04-21 |
A uniquely leptin sensitive hypothalamic neuron population limits hyperphagia and weight gain in diet-induced obesity
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.714161
PMID:41929083
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研究论文 | 本研究通过结合空间转录组学和单核RNA测序技术,在小鼠饮食诱导肥胖模型中鉴定出一个独特的、对瘦素保持敏感的下丘脑神经元亚群,该亚群通过限制摄食行为来调控体重增加 | 首次在肥胖状态下,识别出一个通过共表达GLP-1受体而保持瘦素敏感性的特定下丘脑神经元亚群,并揭示了其在抑制过度摄食和体重增加中的关键作用 | 研究基于小鼠模型,其在人类中的直接相关性尚需验证;研究聚焦于特定神经元亚群,其他可能参与瘦素信号通路的细胞类型未被全面探讨 | 探究在肥胖状态下,哪些神经基质仍保持对瘦素的敏感性并介导其对摄食行为的抑制作用 | 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠模型中的下丘脑神经元 | 神经科学,代谢研究 | 肥胖症 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单核RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | NA |
| 534 | 2026-04-21 |
Spatial Distribution of K13-Positive Airway Epithelial Cells in Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2026-Mar-23, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14030728
PMID:41898372
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研究论文 | 本研究探讨了K13阳性气道上皮细胞在特发性肺纤维化(IPF)中的空间分布及其在疾病进展中的作用 | 首次揭示了K13阳性hillock细胞在IPF远端气道中异常激活并驱动近端化表型转变,通过单细胞分析鉴定了相关的促纤维化亚群和信号通路 | 研究主要基于组织样本的空间分析和单细胞数据重分析,缺乏直接的体内功能验证实验 | 阐明特发性肺纤维化(IPF)中远端气道重塑的细胞机制,特别是上皮干细胞的作用 | IPF患者和对照组的肺组织样本,重点关注K13阳性气道上皮细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间免疫荧光,多重染色,体外培养实验 | CellChat(用于细胞间通讯推断) | 空间成像数据,单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及IPF和对照肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2026-04-21 |
RBX1+ CAFs Drives Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Progression Through Tenascin C Overexpression
2026-Mar-22, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18061024
PMID:41899625
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研究论文 | 本研究揭示了RBX1+癌症相关成纤维细胞通过上调Tenascin C表达驱动胰腺导管腺癌进展的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出RBX1在CAF亚群中的特异性表达,并阐明其通过调控Tenascin C促进PDAC进展的新机制 | 研究样本主要来自单一医疗中心,缺乏多中心验证;体内实验仅使用异种移植模型,未涉及基因工程小鼠模型 | 探究E3泛素连接酶在胰腺癌基质成纤维细胞中的作用及其对肿瘤进展的影响 | 胰腺导管腺癌组织样本、癌症相关成纤维细胞、PAAD细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blotting、假时间分析、细胞通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据 | 来自哈尔滨医科大学第一附属医院的胰腺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-04-21 |
Modern Pathology-Driven Strategies in Neoadjuvant Immunotherapy for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: From Residual Tumor Quantification to Spatial and AI-Based Biomarkers
2026-Mar-21, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18061020
PMID:41899621
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综述 | 本文综述了头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中基于病理学的策略,包括残留肿瘤量化、空间分析和人工智能生物标志物 | 整合了数字病理学和人工智能辅助图像分析,以增强病理反应评估的可重复性,并实现高分辨率映射,同时强调从解剖学分期向生物学驱动反应分层的转变 | 作为叙述性综述,可能未涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 | 探讨头颈部鳞状细胞癌新辅助免疫治疗中病理学驱动的反应评估策略及其在指导治疗和临床试验设计中的应用 | 头颈部鳞状细胞癌患者的新辅助治疗标本 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序、空间转录组学、多重免疫分析 | 人工智能辅助图像分析 | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-04-21 |
Mixed Lymphocyte Reaction: Functional Immune Profiling in Transplantation and Beyond
2026-Mar-20, Diagnostics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/diagnostics16060929
PMID:41897662
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综述 | 本文是一篇关于混合淋巴细胞反应(MLR)的叙述性综述,旨在提供该领域的实用、非系统性综合,涵盖MLR的设计、读出方法及转化应用,并强调新技术如何将其从批量增殖扩展为多维免疫分析 | 强调MLR作为一种功能性兼容性探针在HLA分型之外的持续价值,并整合了如scRNA-seq和TCR测序等下一代技术,以提升其分辨率和应用范围 | 本文为叙述性、非系统性综述,可能未全面涵盖所有相关研究,且依赖于现有文献,缺乏原始数据分析 | 提供MLR的现代实践导向综合,以改进其在移植、免疫治疗和免疫调节研究中的可重复性和转化准备度 | 混合淋巴细胞反应(MLR)作为一种体外功能测定,用于模拟应答T细胞与同种异体抗原呈递细胞(APCs)之间的相互作用 | 免疫学 | 移植相关疾病 | 混合淋巴细胞反应(MLR)、流式细胞术、scRNA-seq、TCR测序 | NA | 功能测定数据、增殖数据、细胞因子/趋化因子谱、细胞毒性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | NA |
| 538 | 2026-04-21 |
Causal Effects of a Hepatic Senescence Gene Set on MASLD Fibrosis: A Mendelian Randomization Study and Quercetin Molecular Docking Analysis
2026-Mar-17, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14030701
PMID:41898346
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了肝脏衰老相关基因集与MASLD肝纤维化之间的因果关系,并结合分子对接分析了槲皮素的潜在干预作用 | 首次将孟德尔随机化、免疫浸润分析、单细胞RNA测序和分子对接技术结合,系统揭示了GBP2基因在肝纤维化和胆管癌中的双重作用,并提出了槲皮素通过IRF1间接调控GBP2的新机制 | 研究主要基于遗传关联和计算模拟,缺乏体内外实验验证;样本来源和数量在部分分析中可能有限;分子对接结果需要进一步实验确认 | 探究肝脏衰老相关基因集与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)肝纤维化之间的因果关系及潜在治疗靶点 | 肝脏衰老相关基因集(SHGS)、GBP2基因、肝纤维化、胆管癌、槲皮素 | 生物信息学 | 肝病 | 孟德尔随机化(MR)、CIBERSORT算法、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-04-21 |
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-03-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250108
PMID:40910272
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的病人来源类器官,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 | 首次通过单细胞转录组学分析来自同一肿瘤多个部位的PDOs,揭示了其在基因表达上的相似性和差异性,并验证了神经内分泌肿瘤标志物的上调 | PDOs在反映肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 | 评估病人来源类器官在捕捉胃癌肿瘤内异质性方面的临床效用 | 胃癌患者肿瘤不同部位的病人来源类器官 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自单个胃癌肿瘤不同部位的多个PDOs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2026-04-21 |
Bridging the Precision Gap in Rheumatoid Arthritis: Spatial Transcriptomics, Spatial Proteomics, and Artificial Intelligence in Precision Health
2026-Mar-14, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14030668
PMID:41898314
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综述 | 本文综述了空间转录组学、空间蛋白质组学与人工智能如何共同推动类风湿关节炎的精准医疗发展 | 整合空间组学技术与人工智能,以解决类风湿关节炎治疗中的精准性差距,实现个体化分子和空间疾病图谱的匹配 | NA | 探讨空间组学与人工智能在类风湿关节炎精准医疗中的应用,以缩小治疗策略与个体疾病特征之间的差距 | 类风湿关节炎的免疫微环境和组织异质性 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间分子数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |