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当前共找到 934 篇文献,本页显示第 501 - 520 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
501 2026-03-16
Untangling biological complexity: A deep learning approach to separating multiple signals in single-cell data
2026-Mar-11, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本文介绍了一种名为CellUntangler的深度学习模型,用于在单细胞RNA测序数据中捕获和过滤多个生物信号 开发了基于深度学习的CellUntangler模型,能够分离单细胞数据中的多个生物信号,提高了信号解析的准确性 NA 开发一种深度学习方法来分离单细胞RNA测序数据中的多个生物信号 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度学习模型 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
502 2026-03-16
Dual regulation of CXCR6+CD8+ T cells modulates cytotoxic and exhaustion-associated programs during prostate cancer progression
2026-Mar-11, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌进展中的双重调控机制及其在抗肿瘤免疫中的关键作用 首次在前列腺癌中系统阐明了CXCR6+CD8+ T细胞的转录特征、调控网络和临床意义,发现了IL-10-STAT3-FOXO1-KLF2轴对CXCR6表达的抑制机制,并提出了靶向该轴联合抗PD-1治疗的协同策略 研究样本量相对有限(9例患者),主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证 探究CXCR6+CD8+ T细胞在前列腺癌中的身份特征、调控机制及治疗潜力 前列腺癌患者组织样本、小鼠模型、骨髓嵌合体及体外T细胞 单细胞组学与免疫学 前列腺癌 单细胞RNA测序、多色免疫荧光、流式细胞术、bulk RNA-seq、染色质免疫沉淀-qPCR NA 单细胞转录组数据、图像数据、流式数据、测序数据 90,651个细胞(来自9例患者)及小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
503 2026-03-16
Comparison with Ezh2 reveals the PRC2-dependent functions of Jarid2 in hematopoietic stem Cell lineage commitment
2026-Mar-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过比较Jarid2和Ezh2缺失对造血干细胞谱系分化的影响,揭示了Jarid2在PRC2依赖性功能中的主要作用 通过单细胞转录组学分析,明确了Jarid2与Ezh2在造血分化中的不同作用,特别是Jarid2在限制髓系分化潜能中的PRC2依赖性功能 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类造血系统;且未深入探讨PRC2非依赖性机制的具体分子途径 阐明Jarid2在造血干细胞谱系定向中的PRC2依赖性和非依赖性功能 小鼠多能祖细胞(MPPs)和造血干细胞 NA NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
504 2026-03-16
In situ spatial transcriptomics reveals novel markers of the limbal stem cell niche and ocular surface epithelia
2026-Mar-10, Stem cell reports IF:5.9Q2
研究论文 本研究利用原位空间转录组学技术揭示了角膜缘干细胞生态位和眼表上皮的新标记物 通过原位空间转录组学避免了单细胞RNA测序中空间位置信息的丢失,首次鉴定出Krt16和Nkiras1作为角膜缘干细胞和中性粒细胞的新标记物 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证可能有限;空间转录组学技术分辨率可能不足以完全解析所有细胞亚群 识别角膜缘干细胞生态位的分子标记物,以改善角膜缘干细胞缺乏症的治疗策略 哺乳动物角膜和角膜缘组织,包括干细胞和中性粒细胞 空间转录组学 角膜缘干细胞缺乏症 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
505 2026-03-16
Targeting endosomal trafficking-mediated antigen escape to resensitize myeloma to CAR-T therapy
2026-Mar-09, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示了多发性骨髓瘤中一种由RRM2驱动的、以前未被表征的抗原逃逸机制,并通过重新利用药物奥沙米特来恢复MICA/B表面表达,从而增强NKG2D CAR-T细胞的疗效 首次发现并表征了RRM2作为一种非经典运输调节器,通过激活RAB7A促进MICA/B向溶酶体降解,并同时阻断RAB11介导的回收,从而介导抗原逃逸;提出了通过亚毒性剂量的临床批准药物奥沙米特逆转此过程,以重新敏化肿瘤的联合治疗策略 研究主要基于临床前模型(如诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官和播散性异种移植模型),其结论在人体中的有效性和安全性仍需临床试验验证 阐明CAR-T治疗后肿瘤抗原逃逸的内在机制,并开发策略以重新敏化多发性骨髓瘤,增强CAR-T细胞免疫疗法的疗效 多发性骨髓瘤细胞、NKG2D CAR-T细胞、诱导多能干细胞衍生的骨髓瘤类器官、小鼠异种移植模型 肿瘤免疫学、细胞治疗 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、多重免疫荧光、实时成像、共免疫沉淀、GTP下拉实验、共聚焦显微镜 NA 单细胞RNA测序数据、免疫荧光图像、实时成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
506 2026-03-16
Rejuvenation of THY1+ nucleus pulposus-derived stem cells promotes intervertebral disc regeneration through FGF10-FGFR1-CREB pathway and mitochondrial fission
2026-Mar-09, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究揭示了THY1+ NPSCs在椎间盘再生中的关键作用,以及FGF10通过FGF10-FGFR1-CREB通路和线粒体分裂逆转细胞衰老的机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出THY1+ NPSCs作为椎间盘退变中的关键再生细胞群,并发现FGF10作为关键再生因子通过抑制CREB磷酸化和线粒体分裂来逆转细胞衰老 研究主要基于体外和动物模型,临床转化仍需进一步验证;机制研究虽深入,但其他潜在通路或因子可能未被完全探索 阐明NPSCs的再生驱动因素及其抗衰老机制,为椎间盘退变提供潜在治疗策略 椎间盘退变患者的临床样本、THY1+ NPSCs细胞、体外衰老模型及体内动物模型 单细胞组学与再生医学 椎间盘退变 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、多重荧光染色 NA RNA测序数据、荧光成像数据 临床IVDD样本(具体数量未明确)、体外及体内模型 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
507 2026-03-16
Single-cell profiling of tumor lineage plasticity and the immune microenvironment in transformed small cell lung cancer
2026-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化过程中的肿瘤细胞异质性和免疫微环境 首次在单细胞水平上揭示了T-SCLC转化中的干细胞样恶性细胞亚群及其与ISG+淋巴细胞的相互作用机制 样本量相对较小(12例患者),且为观察性研究,需要更大队列验证 探究非小细胞肺癌向小细胞肺癌转化的分子机制和免疫微环境变化 肺癌患者肿瘤组织(包括LUAD、T-SCLC和SCLC) 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色,体外共培养实验 NA 单细胞转录组数据,图像数据 12例患者(5例LUAD、3例T-SCLC、4例SCLC)共73,195个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
508 2026-03-16
STORIES: learning cell fate landscapes from spatial transcriptomics using optimal transport
2026-Mar, Nature methods IF:36.1Q1
研究论文 本文提出了一种名为STORIES的新方法,利用最优传输扩展来学习空间感知的细胞命运潜力,以从空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹 该方法通过扩展最优传输框架,首次将空间信息整合到梯度流学习中,以分析空间分辨的转录组数据,相比现有方法具有更优的空间一致性 未明确提及具体局限性,但暗示现有梯度流学习方法在处理空间转录组数据时面临挑战,可能涉及计算复杂性或数据整合问题 从多个时间点的空间转录组学数据中推断细胞命运轨迹,以研究动态生物过程如发育中的空间组织机制 空间转录组学数据,具体应用于蝾螈神经再生和小鼠胶质细胞生成过程 空间转录组学 NA 空间转录组学 最优传输扩展的神经网络 空间转录组学数据 三个大型Stereo-seq时空图谱数据集 NA 空间转录组学 Stereo-seq NA
509 2026-03-16
Unraveling the VEGF-ETS1 axis: a transcriptomic and single-cell analysis of angiogenesis in endometriosis
2026-Mar, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞转录组数据分析,揭示了VEGF-ETS1轴在子宫内膜异位症病理血管生成中的核心驱动作用 首次通过单细胞RNA测序技术识别ETS1作为子宫内膜异位症中内皮细胞的关键转录调节因子,并阐明其通过放大VEGF信号通路促进血管生成的机制 研究主要基于转录组数据分析,缺乏体内功能验证实验,且样本来源和数量可能限制结论的普适性 探究子宫内膜异位症中病理血管重塑的转录机制,识别关键调控因子和治疗靶点 子宫内膜异位症患者的病变组织,特别是卵巢子宫内膜异位囊肿,以及其中的内皮细胞和巨噬细胞 数字病理学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序,bulk转录组分析,功能富集分析,伪时间分析 NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 三个独立转录组数据集和两个验证队列,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
510 2026-03-16
The proliferative Scissor+ gene signature model uncovers the ISG15-KPNA2 axis as a critical driver of malignancy in ccRCC
2026-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,识别了ccRCC中的增殖性细胞亚群,构建了一个基于11个基因的预后模型,并揭示了ISG15通过泛素-蛋白酶体途径调控KPNA2稳定性从而驱动ccRCC恶性进展的新机制 首次在ccRCC中应用Scissor算法识别与表型相关的增殖性恶性亚群,并构建了一个基于机器学习的稳健预后模型,同时发现了ISG15-KPNA2轴作为ccRCC恶性进展的关键驱动因子 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模前瞻性临床队列验证,且未深入探讨ISG15-KPNA2轴在肿瘤微环境中的细胞间相互作用 阐明透明细胞肾细胞癌中增殖性细胞亚群的转录特征及其临床意义,并探索关键驱动基因的分子机制 透明细胞肾细胞癌患者样本、细胞系及小鼠异种移植模型 生物信息学与癌症生物学 肾细胞癌 单细胞RNA测序、批量转录组测序、机器学习算法、功能验证实验(CCK-8、克隆形成、伤口愈合、Transwell、免疫共沉淀、免疫荧光、泛素化分析) Lasso+plsRcox模型及117种机器学习算法 单细胞RNA-seq数据、批量转录组数据 整合了GSE156632(单细胞RNA-seq)、TCGA-KIRC、EMTAB1980和CPTAC等多个队列的数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
511 2026-03-16
PDE4B deficiency aids macrophage differentiation and contributes to Cryptococcus neoformans brain infection
2026-Mar, PLoS pathogens IF:5.5Q1
研究论文 本研究揭示了磷酸二酯酶4B(PDE4B)在调控巨噬细胞功能编程中的作用,并支持巨噬细胞介导的新型隐球菌脑部感染机制 首次通过单细胞RNA测序在隐球菌脑膜炎小鼠模型中鉴定出PDE4B是调控感染相关巨噬细胞功能的关键候选调节因子,并阐明了其通过cAMP/PKA信号通路影响巨噬细胞迁移和穿越血脑屏障能力的机制 研究主要在动物模型和体外实验中进行,其结论在人类患者中的直接适用性尚需进一步验证 探究隐球菌脑膜炎中巨噬细胞作为“特洛伊木马”介导新型隐球菌入侵大脑的分子机制 新型隐球菌感染的小鼠模型及其脑部浸润的免疫细胞,特别是巨噬细胞 数字病理学 隐球菌脑膜炎 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
512 2026-03-15
From Single-Cell Clusters to Causality: ITCH Engagement for CKD Uncovered by Integrative Analysis of MR and MAGMA
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过整合人类肾脏单细胞RNA测序数据与遗传关联及因果推断框架,识别并验证了ITCH作为慢性肾脏病(CKD)的潜在易感基因 采用供体感知的伪批量策略缓解单细胞数据中的假重复问题,并整合转录组差异表达、孟德尔随机化(MR)和MAGMA基因水平关联分析等多层证据,首次将ITCH确立为CKD的高置信度候选基因 研究主要基于已有数据集和计算模拟,实验验证仅在动物模型中进行,尚未在人体中进行功能验证;药物预测部分为假设生成性质,需后续实验测试 识别慢性肾脏病(CKD)的潜在分子靶点 人类肾脏组织、实验性肾损伤模型 生物信息学 慢性肾脏病 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)、MAGMA基因关联分析、免疫组织化学、分子对接、分子动力学模拟 NA 单细胞转录组数据、GWAS汇总统计数据、图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
513 2026-03-15
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Mar-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
综述 本文综述了空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展,强调其在揭示疾病机制和指导治疗策略方面的潜力 整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学技术,为肺纤维化提供前所未有的组织架构背景下的高通量可视化分析 NA 推进肺纤维化的机制理解和治疗策略开发 肺纤维化,特别是特发性肺纤维化(IPF) 数字病理学 肺纤维化 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间代谢组学,空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
514 2026-03-15
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,在骨关节炎患者的软骨组织中鉴定出一个具有祖细胞样特征的软骨细胞亚群 在骨关节炎软骨中首次鉴定出三个新的软骨细胞亚群,包括一个具有祖细胞样特征的亚群,并描绘了其转录组特征和分化轨迹 研究样本量较小,且缺乏功能验证和空间定位验证 解析骨关节炎软骨细胞的异质性,并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞 骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 单细胞组学 骨关节炎 单细胞RNA测序 无监督聚类,伪时间轨迹分析 单细胞转录组数据 6名终末期骨关节炎患者的约14,000个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 基于液滴的单细胞RNA测序
515 2026-03-15
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究通过整合转录组学和单细胞分析,识别出ITGAX⁺巨噬细胞作为前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 首次将ITGAX确定为前列腺癌预后基因,并通过单细胞RNA测序揭示其在巨噬细胞亚群中的富集及其与免疫抑制微环境的关联 研究主要基于TCGA等公共数据集,缺乏实验验证;样本量相对有限,且未涉及不同种族或亚型的比较分析 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物,以更好地理解疾病进展并为未来诊断或治疗策略提供信息 前列腺癌患者的肿瘤和正常前列腺组织样本 数字病理学 前列腺癌 转录组学分析、单细胞RNA测序 ESTIMATE算法、免疫去卷积算法、Cox回归、PPI网络分析、GSEA功能预测 转录组数据、临床数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 551个样本(499个肿瘤样本和52个正常前列腺样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
516 2026-03-15
Loop of N2-polarized neutrophils and exhausted CD8 + T cells induces immunotherapy resistance in NSCLC
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本研究通过整合大规模单细胞RNA测序数据,揭示了非小细胞肺癌中N2极化中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间形成正反馈环路导致免疫治疗耐药的机制,并基于此构建了深度学习预测模型 首次发现并表征了N2中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间通过ICAM1-整合素和CCL5-CCR1轴形成的自我维持免疫抑制环路,并基于该环路构建了可预测免疫治疗响应的深度学习模型 研究主要基于计算分析,需要进一步的实验验证来确认分子机制;模型在更多癌症类型中的普适性仍需验证 探究非小细胞肺癌中免疫抑制微环境的形成机制,并开发预测免疫治疗响应的临床模型 非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境中的N2极化中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞 计算生物学 肺癌 单细胞RNA测序,通路富集分析,细胞间通讯分析,深度学习建模 深度神经网络 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 大规模单细胞RNA测序数据集和多个bulk RNA测序队列 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
517 2026-03-15
Unraveling the role of cuproptosis in pulmonary fibrosis pathogenesis and prognosis: an integrative single-cell transcriptomics and microarray analysis
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry IF:3.5Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和微阵列分析,揭示了铜死亡在肺纤维化发病机制和预后中的作用,并构建了一个基于4个铜死亡相关基因的预后风险模型 首次将铜死亡这一新型细胞死亡途径与肺纤维化联系起来,并通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据构建了一个稳健的预后风险评分模型 研究主要基于小鼠模型和回顾性患者数据,需要在更大规模的前瞻性临床队列中进行验证 阐明铜死亡在肺纤维化中的生物学功能并建立预后预测模型 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型、TGF-β1刺激的成纤维细胞、以及特发性肺纤维化患者样本 数字病理学 肺纤维化 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组织化学 LASSO回归, Cox回归 基因表达数据 GSE70866队列患者数据、小鼠模型、人类IPF样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
518 2026-03-15
Single-cell RNA sequencing unravels chondrocyte heterogeneity and immune cell interactions in knee osteoarthritis pathogenesis
2026-Mar-13, Clinical rheumatology IF:2.9Q2
研究论文 本研究通过整合公共GEO数据库中的单细胞RNA测序数据,系统分析了膝骨关节炎中软骨细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 首次在膝骨关节炎中识别出八个软骨细胞亚群,并揭示了MIF信号在促进炎症微环境形成中的关键作用,以及C1Q+巨噬细胞通过补体级联反应增强淋巴细胞介导的细胞毒性 研究基于公共数据库的二次观察性分析,样本量相对有限(20例患者和6例健康供体),且未进行实验验证 全面表征膝骨关节炎中疾病特异性软骨细胞亚群及其分子特征,并解码浸润免疫细胞的组成多样性 膝骨关节炎患者和健康供体的软骨细胞及免疫细胞 数字病理学 骨关节炎 单细胞RNA测序 t-SNE聚类、伪时间分析、CellChat 单细胞RNA测序数据 20例膝骨关节炎患者和6例健康供体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
519 2026-03-15
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-Mar-13, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 本研究整合了基因与轻度创伤性脑损伤(mTBI)交互作用的全基因组关联研究(GWAS)和单细胞RNA测序基因调控网络,以揭示调控mTBI后神经认知结果(特别是学习和记忆表现)的细胞类型特异性关键调节因子和分子机制 首次结合全基因组关联研究与单细胞RNA测序基因调控网络,在青少年脑认知发展(ABCD)队列中,从细胞类型特异性角度解析mTBI影响神经认知的复杂调控网络,并识别出海马体和皮层区域神经元与胶质细胞中的关键网络调节因子 研究基于观察性队列,可能受混杂因素影响;单细胞RNA测序数据可能未完全覆盖所有相关细胞类型或脑区;结果需要在独立队列中进一步验证 阐明轻度创伤性脑损伤(mTBI)影响青少年神经认知表现的生物学机制,特别是学习和记忆功能 青少年脑认知发展(ABCD)研究队列中的儿童和青少年,重点关注mTBI患者 神经科学 创伤性脑损伤 全基因组关联研究(GWAS),单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基于通路的多基因风险评分模型 基因组数据,单细胞转录组数据,神经认知评估数据 ABCD研究队列参与者(具体样本量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
520 2026-03-15
Multicellular origins of murine ovarian inflammaging
2026-Mar-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 本研究整合单细胞和空间转录组学,揭示了小鼠卵巢衰老过程中免疫细胞亚群的增加及其在促炎信号传导中的关键作用 首次整合单细胞和空间转录组学技术,系统定义了衰老小鼠卵巢中免疫细胞亚群(如巨噬细胞和T细胞)的组成变化及其双向信号传导机制,为卵巢炎症衰老提供了新的分子机制见解 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类卵巢中验证;空间转录组学的分辨率可能限制了对特定细胞类型相互作用的精确解析 探究卵巢衰老过程中免疫细胞的功能及其对炎症衰老表型的贡献 衰老小鼠的卵巢组织 数字病理学 老年疾病 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
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