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当前共找到 1052 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-05-01 |
Artificial intelligence assisted multi-model pathological diagnosis of breast cancer based on multispectral autofluorescence images
2026-Mar-12, NPJ breast cancer
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s41523-026-00915-2
PMID:41820369
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研究论文 | 提出一个结合多光谱自发荧光成像与优化深度学习架构的新框架，用于生成高质量、无标记、与苏木精-伊红染色等效的乳腺癌病理图像 | 通过引入显著性和全局特征一致性损失增强CycleGAN，实现无需像素级配准的非配对数据虚拟染色，且为非破坏性方法，同一组织切片可后续用于单细胞RNA测序或空间转录组学 | 未提及具体局限性 | 开发快速、非破坏性的诊断级乳腺癌病理图像生成方法，用于临床诊断和机制研究 | 临床样本、小鼠模型和类器官共培养样本 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 多光谱自发荧光成像 | CycleGAN | 图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 462 | 2026-05-01 |
STHELAR, a multi-tissue dataset linking spatial transcriptomics and histology for cell type annotation
2026-Mar-12, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06937-6
PMID:41820393
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研究论文 | 介绍了一个整合空间转录组学与H&E组织学图像的多组织数据集STHELAR，用于细胞类型注释 | 首次构建了包含16种组织类型、超过1100万个细胞的大规模多组织空间转录组数据集，并关联了H&E全切片图像，为直接从组织学图像预测细胞类型提供了参考资源 | 未提及具体限制，但可能存在数据来源于特定平台（Xenium FFPE）和细胞类别为十种泛癌类别的泛化局限性 | 通过整合空间转录组学与组织学图像，开发用于细胞类型注释的大规模数据集，以促进肿瘤微环境研究 | 来自22名癌症患者和9名非癌症患者的31个人类Xenium FFPE组织切片，涵盖16种组织类型 | 数字病理学, 空间转录组学 | 肿瘤（泛癌） | 空间转录组学, H&E染色 | 人工智能模型（用于从组织学图像预测细胞类型注释） | 图像, 基因表达数据 | 31个组织切片，来自31名患者（22例癌症，9例非癌症），包含超过1100万个细胞和50万个组织图像块 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium FFPE组织切片 |
| 463 | 2026-05-01 |
Low-dose chemotherapy remodels hepatic immune landscape and potentiates antitumor response to immune checkpoint blockade in cholangiocarcinoma
2026-Mar-04, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001735
PMID:41779955
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研究论文 | 该研究探索低剂量吉西他滨/顺铂联合抗PD-L1治疗肝内胆管癌的疗效和机制 | 首次揭示低剂量化疗通过重塑肝内免疫景观并解除SPP1-VLA-4信号轴对CD8+T细胞的抑制，增强抗PD-L1免疫治疗的抗肿瘤应答 | 尚未明确低剂量化疗在不同肝内胆管癌亚型中的效果差异及长期疗效数据 | 优化肝内胆管癌治疗策略，降低化疗毒性并提高免疫治疗疗效 | 多种肝内胆管癌小鼠模型及患者来源的肿瘤组织和临床样本 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 体内/体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 多种小鼠模型及部分肝内胆管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 464 | 2026-04-30 |
Mucosal Inflammation Shapes Human Neutrophil States in Tissue and Circulation
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.21.713286
PMID:42051301
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、光谱流式细胞术和空间蛋白质组学，研究牙龈、血液和口腔中中性粒细胞在健康与牙周炎状态下的组织特异性状态及其系统性影响 | 首次在健康与疾病状态下系统性表征人类口腔粘膜中性粒细胞的组织特异性状态，揭示牙周炎通过血液样中性粒细胞亚群浸润和转录噪声增加破坏粘膜免疫调节程序，并发现局部炎症可系统性重塑循环中性粒细胞——共享一个Rho-GTPase调控程序，该程序在多种人类炎症性疾病中普遍存在 | 未提及具体限制 | 探究口腔粘膜组织中中性粒细胞在健康与炎症性疾病中的组织特异性状态及其对循环中性粒细胞的系统性影响 | 健康个体和牙周炎患者的牙龈组织、血液和口腔腔隙中的中性粒细胞 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序、光谱流式细胞术、空间蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、流式细胞术数据、空间蛋白质组数据 | 健康个体和牙周炎患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 465 | 2026-04-30 |
Mathematical dissection of tumor phenotypic heterogeneity in a spatial data-informed nonlocal reaction-diffusion model
2026-Mar-22, Journal of mathematical biology
IF:2.2Q2
DOI:10.1007/s00285-026-02380-8
PMID:41866589
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研究论文 | 提出一种结合空间转录组数据的非局部反应-扩散数学模型，严格分析肿瘤内表型异质性的演化动态 | 首次将空间基因表达数据与非局部反应-扩散模型整合，开展严格的数学分析并揭示表观突变率决定肿瘤细胞表型集中分布的关键作用 | 模型假设依赖血管化肿瘤且参数空间维度较高，实际应用时计算复杂度较大 | 通过数学建模剖析肿瘤内表型异质性及其演化机制 | 血管化肿瘤及其内部异质性表型细胞群体 | 机器学习 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | 非局部反应-扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2026-04-30 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
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研究论文 | 通过整合15个人体组织中的三百万个单细胞进行单细胞RNA-seq数据分析，揭示了内皮细胞的异质性及其在血管类型和组织微环境中的信号传导机制 | 首次大规模整合多个组织单细胞转录组数据，开发计算流程分析代谢物或蛋白质介导的细胞间通讯，利用主题建模识别内皮细胞与其他组织驻留细胞之间的通讯模式 | 研究主要依赖公开数据集，可能受限于原始数据质量及组织覆盖的全面性 | 系统研究内皮细胞在血管类型和组织微环境背景下的异质性及其调控机制 | 人体15个组织中的内皮细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 主题建模 | 单细胞转录组数据 | 15个人体组织中三百万个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2026-04-30 |
Dynamic and cell-type specific transcriptional reprogramming underlies the floral transition in the maize shoot apical meristem
2026-Mar-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04033-x
PMID:41851888
|
研究论文 | 通过整合时间序列批量RNA-seq、单细胞转录组学、染色质可及性和转录因子结合谱，构建玉米茎尖分生组织花转变的时空分子框架，揭示动态和细胞类型特异性转录重编程机制 | 首次构建了玉米花转变的完整时空调控框架，发现花转变并非由统一的转录开关驱动，而是源自空间上不同的茎尖分生组织区域的协同作用，并鉴定出ZmMADS69-ZmRap2.7-ZMM4调控模块以及UNBRANCHED2和UNBRANCHED3在促进花转变中的新角色 | 未明确提及局限性 | 研究玉米茎尖分生组织在花转变过程中的转录重编程和细胞身份变化的分子机制 | 玉米茎尖分生组织 | 机器学习 | NA | 批量RNA-seq， 单细胞转录组学， 染色质可及性分析， 转录因子结合谱分析 | NA | 转录组数据， 染色质可及性数据 | 时间序列样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA-seq， 批量RNA-seq | NA | NA |
| 468 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 469 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 470 | 2026-04-28 |
Artificial intelligence-assisted spatial omics-based biomimetic nanoplatform for intelligent and precise intervention in the immunosuppressive core region of ovarian cancer
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01345-w
PMID:41814059
|
综述 | 综述了人工智能辅助的空间组学基于仿生纳米平台用于卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 提出人工智能辅助的闭环治疗框架，整合识别、递送和反馈，实现个性化精准免疫治疗，并系统梳理了空间组学鉴定免疫抑制核心区域的方法 | 空间图谱标准化、递送系统稳定性和跨平台兼容性仍需进一步技术突破 | 实现卵巢癌免疫抑制核心区域的智能精准干预 | 卵巢癌免疫抑制肿瘤微环境中的核心区域，包括调节性T细胞、肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞构成的“排斥结构” | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 471 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物，并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及，但一般可能包括：机制验证仅在小鼠模型中进行，未在人类样本中确认；4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP（免疫共沉淀）、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据（scRNA-Seq）、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠（多个）及野生型对照小鼠；具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 472 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 473 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
|
研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能，包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法，涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集，揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究，Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法，为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法（STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV） | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 474 | 2026-04-29 |
Regulation of spikelet number during wheat spike development
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698073
PMID:41835394
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综述 | 本文综述了小麦穗发育过程中调控小穗数目的基因网络与分子机制，重点探讨了顶端分生组织向花序分生组织转变、小穗分生组织形成速率及终端小穗转化时间等关键过程 | 整合了近年空间转录组学、单细胞分析及多组学技术在小麦穗发育研究中的最新应用，系统梳理了促进小穗数增加的突变体（如超数小穗和分枝结构）及其育种应用进展 | 目前将超数小穗突变导入商业品种时面临育性和籽粒重量的权衡问题，且对多基因组合效应的田间验证研究仍有限 | 阐明小麦穗部小穗数目（SNS）的遗传调控网络及其对产量的影响机制 | 小麦穗部发育过程中的花序分生组织（IM）、小穗分生组织（SM）及终端小穗（TS） | 植物遗传学与作物育种 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多组学 | NA | NA |
| 475 | 2026-04-28 |
Intercellular communication is a heritable dimension of human tissue architecture
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.29.715138
PMID:41959167
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研究论文 | 本研究提出EdgeMap方法，整合空间转录组学与GWAS摘要统计，将性状遗传力分解为细胞内在和细胞间组成部分，并解析细胞间信号为特定配体-受体通道 | 首次将遗传效应定位到细胞间分子界面，建立细胞间通讯作为遗传架构的可遗传维度 | 未明确说明限制 | 探究细胞间通讯在组织架构中的遗传性及其对疾病风险的贡献 | 17种人类性状和5种人体组织 | 机器学习 | 双相情感障碍、心血管疾病、肝脏疾病 | 空间转录组学、GWAS摘要统计 | EdgeMap | 空间转录组数据 | 多种组织切片及独立GWAS队列 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 细胞分割的Visium HD |
| 476 | 2026-04-28 |
The Human Male Mammary Gland has Similar Epithelial Populations to Female but Distinct Composition and Transcriptional Properties
2026-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.27.714915
PMID:41959192
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研究论文 | 论文通过单细胞RNA测序描绘了正常成人男性乳腺的细胞图谱，发现其与女性乳腺具有相同的上皮细胞类型，但组成和转录特性不同 | 首次以单细胞分辨率描述正常男性乳腺的细胞和转录特征，揭示了男性乳腺中管腔成熟细胞比例增加、基底细胞和管腔祖细胞减少的特异性组成，以及区别于女性的基因表达、RNA加工、炎症信号和雌激素受体通路活性差异 | 未提及具体局限性 | 填补正常男性乳腺单细胞层面表征的空白，为男性乳腺癌的细胞基础提供参考 | 正常成人乳腺组织样本（来自3名男性和14名女性捐赠者） | 数字病理学, 机器学习 | 男性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17名捐赠者（3名男性、14名女性），共174471个细胞（含18117个男性来源细胞） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'转录组测序 |
| 477 | 2026-04-28 |
High-dimensional multiomics reveals perturbations to IL-6/IL-6R axis and RUNX3 in CD4+ T cells during third trimester pregnancy
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.26.711478
PMID:41959409
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研究论文 | 通过高维多组学分析揭示妊娠晚期CD4+ T细胞中IL-6/IL-6R轴和RUNX3的扰动 | 首次结合流式细胞术筛选>350个表面蛋白和单细胞RNA测序（含>130种CITE-seq条形码抗体）系统分析妊娠期CD4+ T细胞的表面蛋白组和转录组变化 | 研究对象仅限于足月妊娠（>37周）样本，未包含早产或整个妊娠周期的纵向数据 | 理解妊娠期CD4+ T细胞表面蛋白质组和转录组的分子变化及其免疫调节机制 | 正常妊娠女性血液和蜕膜中的CD4+ T细胞，以及非妊娠女性血液中的CD4+ T细胞 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITE-seq | NA | 蛋白质表达数据, 基因表达数据 | 足月妊娠（>37周）女性的血液和蜕膜样本，以及非妊娠女性的血液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 结合CITE-seq抗体标记 |
| 478 | 2026-04-28 |
CosMxScope: Scalable Reconstruction and Digital Pathology Integration of Imaging-Based Spatial Transcriptomics Data
2026-Mar-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.713520
PMID:41959506
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研究论文 | CosMxScope是一个轻量级开源Python框架，用于重建成像型空间转录组学数据并与数字病理学工具整合 | 将CosMx空间分子成像仪数据与广泛使用的数字病理学环境（如QuPath）桥接，提供FOV图像拼接、细胞分割多边形和转录坐标转换为GeoJSON对象的功能，促进空间转录组学与病理学分析工作流的结合 | 该框架专为CosMx SMI平台设计，可能不适用于其他空间转录组学平台 | 开发一个实用的工具，实现空间转录组学数据与数字病理学可视化环境的交互式探索和整合 | 人类和小鼠组织的CosMx空间分子成像数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和转录坐标 | 多个正在进行的研究项目涉及人类和小鼠组织 | NA | 空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪，用于单细胞空间多组学分析，可测量每个细胞数千个RNA或蛋白质靶标 |
| 479 | 2026-04-27 |
A Composite interaction Score: Prioritizing cell-cell interactions from single-cell RNA-seq with application to pre-menopausal epithelial barriers
2026-Mar-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.046
PMID:41875947
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研究论文 | 提出Composite Interaction Score (CIS)方法，整合六种细胞-细胞相互作用预测工具，优先排序来自单细胞RNA-seq的相互作用 | 通过排名偏差精度加权工具间一致性，强调排名列表顶部的一致性，优于简单平均值基线，并应用于上皮屏障组织 | 未明确提及局限性 | 开发优先排序细胞-细胞相互作用的共识策略，强调可重复性和生物学相关性 | 肠、皮肤和子宫的上皮屏障组织 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 来自肠、皮肤和子宫的单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2026-04-27 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了AGPAT3通过脂质重塑调控肿瘤细胞对IFNγ介导的铁死亡易感性，并增强免疫检查点抑制剂疗效的机制 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑促进铁死亡，并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习预测模型以提升免疫治疗效果 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，临床样本分析有限，且未深入探讨AGPAT3在其他免疫微环境细胞中的作用 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的潜力及其分子机制 | 肿瘤细胞（涉及IFN-γ信号通路和铁死亡敏感性） | 机器学习， 生物信息学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序， 脂质组学， 转录组学， ChIP-seq， CUT&Tag | 机器学习模型（针对铁死亡相关基因） | 单细胞RNA测序数据， 脂质组数据， 转录组数据 | 大型单细胞RNA测序数据集（具体样本量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |