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当前共找到 934 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-03-18 |
Dynamics of phage-host interactions in Bacteroides fragilis resolved by single-cell transcriptomics
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70381-8
PMID:41839859
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研究论文 | 本研究利用细菌单细胞RNA测序技术，分析了约50,000个感染裂解噬菌体的脆弱拟杆菌细胞的转录组，揭示了噬菌体-宿主相互作用的动态过程及细菌防御机制 | 首次将细菌单细胞RNA测序应用于噬菌体-宿主相互作用研究，量化了单个细菌细胞中噬菌体感染的异步进程，并发现了未感染细菌的表型亚群及其防御相关基因表达 | 研究仅针对一种人类病原共生菌（脆弱拟杆菌）和一种裂解噬菌体，样本来源和感染条件可能限制结果的普适性 | 探究噬菌体与宿主细菌相互作用的动态过程及细菌防御机制 | 脆弱拟杆菌（Bacteroides fragilis）及其感染的裂解噬菌体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约50,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2026-03-18 |
Illuminating cell states by a comprehensive and interpretable single cell foundation model
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70071-5
PMID:41839876
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CellVQ的综合可解释单细胞基础模型，旨在解决单细胞数据稀疏性、异质性和可解释性差的问题 | 提出了CellVQ模型，包含单细胞离散化（SCD）模块以有效表示细胞嵌入，并引入了CellVQ-Graph插件工具，用于构建知识图谱以促进生物学发现 | 未明确提及具体限制，但可能涉及模型在更广泛或更复杂数据集上的泛化能力验证 | 开发一个适用于细胞生物学社区的可应用和可泛化的AI工具，以增强单细胞数据的表示和解释 | 单细胞数据，包括基因、细胞通信和注释等多模态信息 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基础模型 | 单细胞数据 | 6800万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-03-18 |
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70528-7
PMID:41839892
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研究论文 | FineST是一种深度对比学习模型，通过整合组织学图像和空间转录组数据，实现高分辨率RNA表达估算和细胞间通讯模式分析 | 首次利用组织学基础模型融合空间转录组和组织学图像，实现核级分辨率的配体-受体相互作用分析 | 方法依赖于组织学图像的可用性，且在数据稀疏性极高的情况下可能仍有局限性 | 开发一种整合组织学与空间转录组数据的深度学习方法，以提升细胞间通讯分析的精度 | 结直肠癌和乳腺癌的空间转录组数据，包括VisiumHD和Xenium平台生成的数据 | 数字病理学 | 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 | 空间转录组学, 深度对比学习 | 对比学习模型 | 空间转录组数据, 组织学图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | VisiumHD, Xenium | 10x VisiumHD, 10x Xenium |
| 444 | 2026-03-18 |
Single-cell transcriptomics reveals heterogeneity and immune microenvironment in lymphatic metastasis of head and neck squamous cell carcinoma
2026-Mar-16, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-026-00392-4
PMID:41839993
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析头颈部鳞状细胞癌淋巴转移的异质性和免疫微环境 | 首次对头颈部鳞状细胞癌的淋巴结转移组织和正常淋巴结组织进行单细胞RNA测序比较分析，揭示了与肿瘤发生和转移相关的特定细胞亚群 | 样本量相对较小（7个转移组织和5个非转移组织），可能限制统计功效和普遍性 | 探究头颈部鳞状细胞癌淋巴转移的细胞异质性和免疫微环境特征 | 头颈部鳞状细胞癌患者的淋巴结转移组织和非转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 预后模型（基于基因表达） | 单细胞转录组数据 | 7个淋巴转移组织和5个非转移组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2026-03-18 |
Decoding clone evolution in HER2 amplified breast cancer through single-cell and spatial transcriptomics analysis of copy number variations
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44476-7
PMID:41840060
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 446 | 2026-03-18 |
Spatial transcriptomic map of the mouse urinary bladder
2026-Mar-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42931-z
PMID:41840076
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研究论文 | 本研究利用Visium HD技术构建了小鼠膀胱的空间转录组图谱，以近单细胞分辨率揭示了膀胱主要组织区域的基因表达模式 | 首次以8×8微米分辨率绘制小鼠膀胱空间转录组图谱，发现平滑肌存在四个空间簇，与传统单细胞RNA测序的单簇识别形成对比 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类膀胱组织；空间分辨率虽高但未达到完全单细胞水平 | 构建小鼠膀胱的空间转录组图谱以补充传统组织学和单细胞RNA测序的不足 | 小鼠膀胱组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 66,471个空间区域（bins）和9,364个基因 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD技术，使用8×8微米空间区域 |
| 447 | 2026-03-18 |
SPP1high fibrogenic macrophages mediate protective fibrotic remodeling and promote vascular stability in hypertension-associated aortic dissection
2026-Mar-16, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04798-9
PMID:41840626
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，揭示了高血压相关主动脉夹层中SPP1高表达纤维化巨噬细胞在促进血管稳定性和保护性纤维化重塑中的关键作用 | 首次识别并验证了SPP1高表达纤维化巨噬细胞在主动脉夹层中的保护性作用，并揭示了TGF-β1-SPP1轴在驱动这一修复性髓系程序中的机制 | 样本量相对较小（每组3例主动脉样本），且部分患者配对样本有限（n=10），可能影响结果的普遍性 | 旨在识别与血管完整性相关的巨噬细胞状态，并探索其在高血压相关主动脉夹层中的机制和治疗潜力 | 高血压相关主动脉夹层、马凡综合征相关主动脉夹层患者及健康捐赠者的主动脉组织、外周血和撕裂邻近血液样本 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、血清细胞因子数据 | 主动脉样本每组3例，血液样本每组30例，配对撕裂邻近样本10例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2026-03-18 |
A cross-scale multimodal framework identifies clinically actionable immunotherapy biomarkers in melanoma through bulk to single-cell and spatial transcriptomics integration
2026-Mar-16, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-026-00919-w
PMID:41840725
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 449 | 2026-03-18 |
BGN/MDK Axis in the Melanoma Tumor Microenvironment Strengthens Tumor Malignancy by Modulating Cancer Cells and Cancer-Associated Fibroblasts Crosstalk
2026-Mar-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514590
PMID:41833003
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研究论文 | 本研究揭示了黑色素瘤肿瘤微环境中BGN/MDK轴通过调控癌细胞与癌症相关成纤维细胞的相互作用，增强肿瘤恶性程度的关键机制 | 首次发现m6A修饰蛋白协同上调BGN表达，并阐明BGN通过AEBP1调控MDK信号通路，驱动CAFs激活并减少CD8⁺ T细胞浸润的空间转录组学证据 | 研究主要基于体外/体内实验和测序分析，临床样本验证和长期疗效数据尚不充分 | 探究黑色素瘤肿瘤微环境中BGN的功能及其调控CAFs形成的分子机制 | 黑色素瘤细胞、癌症相关成纤维细胞、正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 体外/体内实验, 功能分析, 分子检测 | NA | 转录组数据, 空间表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2026-03-18 |
Mast cell-derived MIF Polarizes Th17 cells to drive lung adenocarcinoma progression
2026-Mar-14, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-026-04358-3
PMID:41831036
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研究论文 | 本研究揭示了肥大细胞通过分泌MIF极化Th17细胞，从而驱动肺腺癌进展的新机制 | 首次阐明了肥大细胞通过MIF信号轴极化Th17细胞促进肺腺癌进展的具体机制，并确定了MC-MIF-Th17轴作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于回顾性临床数据和动物模型，需要在更大规模的前瞻性临床队列中进一步验证 | 探究肺腺癌肿瘤微环境中肥大细胞与Th17细胞的相互作用机制及其在疾病进展中的作用 | 肺腺癌患者组织样本、小鼠原位肺癌模型、体外共培养系统 | 数字病理学 | 肺癌 | 多重免疫组化染色、单细胞RNA测序、空间转录组学分析 | NA | 图像、转录组数据、临床数据 | 肺腺癌患者组织样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 451 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration enhances cell type resolution and discovery of clinically relevant states in complex tissues
2026-Mar-13, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04002-4
PMID:41821037
|
研究论文 | 本文系统评估了单细胞多模态数据整合策略，以肾脏为例，提升复杂组织中细胞类型的分辨率和临床相关状态的发现 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，用于细胞身份对齐和整合策略评估，并首次在肾脏图谱中识别出WFDC2表达厚升支和Norn细胞等罕见细胞类型 | 研究主要基于肾脏和心脏组织，可能未覆盖所有复杂组织类型，且样本量相对有限 | 评估单细胞多模态数据整合策略，以增强复杂组织中细胞类型的分辨率和发现临床相关状态 | 肾脏皮质和心脏组织中的单细胞和单核多模态数据 | 单细胞分析 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习 | 单细胞多模态数据 | 119,744个高质量核/细胞，来自19名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 452 | 2026-03-18 |
Integrating multiomic layers to decode psychiatric disease mechanisms
2026-Mar-13, Current opinion in genetics & development
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.gde.2026.102451
PMID:41831411
|
综述 | 本文综述了整合多组学技术解码精神疾病机制的最新进展 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学和空间分析等多组学层，将遗传变异与基因调控、细胞类型脆弱性和环路功能障碍联系起来 | NA | 解码精神疾病的机制，为生物标志物发现、患者分层和精准治疗策略奠定基础 | 精神分裂症、双相情感障碍和重度抑郁症等精神疾病 | 自然语言处理 | 精神疾病 | 单细胞转录组学、表观基因组学、蛋白质组学、空间分析 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 453 | 2026-03-18 |
scTWAS: a powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2026-Mar-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70374-7
PMID:41820391
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTWAS的统计方法，用于利用单细胞数据进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究 | 开发了首个专门针对单细胞RNA测序数据挑战（如强噪声、技术变异和高稀疏性）的统计框架，通过潜变量模型和基于矩的估计方法，在细胞类型水平上提升了基因表达预测和关联检测能力 | 未明确说明方法对样本量或细胞数量的具体要求，也未讨论其在其他组织类型或疾病中的泛化性能 | 开发一种统计方法，以利用单细胞RNA测序数据进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究，从而更精确地识别与复杂性状和疾病相关的基因 | 血液和脑组织中的免疫细胞类型，以及阿尔茨海默病相关的细胞亚型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜变量模型 | 单细胞基因表达数据 | 涉及29种血液学性状和三种免疫相关疾病的数据，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2026-03-18 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2026-Mar-12, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101329
PMID:41825449
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研究论文 | 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数无限混合模型，用于同时进行单细胞RNA测序数据的聚类和标记基因选择 | NCLUSION模型利用贝叶斯稀疏先验同时进行聚类和标记基因识别，避免了传统方法中用户指定启发式规则和事后差异表达分析导致的假阳性率膨胀问题 | NA | 开发一种可扩展的非参数聚类方法，用于单细胞RNA测序数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 非参数无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2026-03-18 |
Multidimensional profiling of heterogeneity in supratentorial ependymomas
2026-Mar-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10214-2
PMID:41813893
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学以及活细胞成像技术，揭示了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织和动态行为 | 首次在幕上室管膜瘤中识别出两种不同的祖细胞样状态，并揭示了肿瘤的空间组织模式及脑内细胞对肿瘤异质性的影响 | NA | 阐明幕上室管膜瘤的发育特征和微环境因素，以理解其异常细胞转化和行为 | 幕上室管膜瘤的细胞状态、空间组织和动态行为 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 活细胞成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 456 | 2026-03-18 |
Guanylate-binding proteins balance iNOS/Arg-1 in myeloid cells during L. major infection and promote host defense to infection
2026-Mar-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02825-25
PMID:41805192
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白（Gbps）在利什曼原虫感染期间通过调节巨噬细胞中iNOS/Arg-1平衡来促进宿主防御的机制 | 揭示了Gbps在宿主防御中的关键作用，其保护功能不依赖于Gbps对寄生虫的定位，并发现Gbps通过协调巨噬细胞中iNOS的表达发挥独特的免疫调节作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；Gbps的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究Gbps在皮肤利什曼病感染期间对宿主免疫防御的调控作用 | C57BL/6小鼠、骨髓来源巨噬细胞、单核细胞、利什曼原虫 | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | Gbp敲除小鼠和C57BL/6对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2026-03-18 |
Identification of altered immune landscape at single-cell resolution in NSCLC brain metastasis and its association with poor immune checkpoint inhibitor responses
2026-03-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70715-6
PMID:41807427
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了非小细胞肺癌脑转移中免疫景观的改变及其与免疫检查点抑制剂反应不良的关联 | 首次在单细胞分辨率下描绘了NSCLC脑转移的免疫景观，并识别出与免疫治疗反应相关的七基因脑转移免疫特征 | 研究样本量相对有限，且机制验证仍需进一步实验 | 探究NSCLC脑转移中免疫抑制机制及免疫治疗反应降低的原因 | 非小细胞肺癌的原发肿瘤和脑转移灶中的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 101,959个肿瘤浸润免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2026-03-18 |
Epilepsy-associated FOXJ3 variants link a transcriptional program of the PTEN-mTOR pathway to neuronal specification and cortical lamination
2026-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69241-2
PMID:41803108
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研究论文 | 本文发现FOXJ3基因的致病性变异与常染色体显性局灶性癫痫和局灶性皮质发育不良相关，并揭示了FOXJ3通过调控PTEN-mTOR通路在神经元分化和皮质层化中的作用 | 首次将FOXJ3基因变异与局灶性皮质发育不良和癫痫联系起来，并阐明其通过转录调控PTEN-mTOR通路影响神经元迁移和皮质结构 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本的验证和临床相关性需进一步探索 | 探究局灶性皮质发育不良和癫痫的分子机制，特别是FOXJ3基因变异在其中的作用 | FOXJ3基因变异患者、小鼠大脑皮质、神经祖细胞和神经元 | 神经科学 | 癫痫 | ChIP-seq, scRNA-seq, 子宫内电穿孔 | NA | 基因组数据、单细胞RNA测序数据、染色质免疫沉淀测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2026-03-18 |
Ribosomal modifications are associated with mesenchymal fate selection in the neural crest lineage
2026-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70375-6
PMID:41803115
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了核糖体RNA修饰和核糖体组装因子在神经嵴细胞间充质命运选择中的关键作用，并探讨了其在神经母细胞瘤中的临床意义 | 首次将特定的rRNA修饰（如U1248位点的m¹acp³ψ）和核糖体组装因子（EMG1、NHP2、TSR3）与神经嵴细胞的间充质命运决定直接关联，并发现这些机制在神经母细胞瘤的肿瘤进展中具有保守功能 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验，在人类发育中的直接验证尚不充分；神经母细胞瘤患者数据的分析为相关性研究，因果关系需进一步验证 | 探究核糖体修饰和组装在神经嵴细胞命运决定和肿瘤进展中的作用机制 | 神经嵴细胞、颅面发育、神经母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | Smart-seq2单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、患者临床数据 | 未明确说明具体样本数量，包括小鼠模型、细胞系和神经母细胞瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞转录组测序技术 |
| 460 | 2026-03-18 |
Multi-modal dissection of cell-type specific TDP-43 pathology in the motor cortex
2026-03-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69944-6
PMID:41803120
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法解析了运动皮层中细胞类型特异性的TDP-43病理，揭示了兴奋性皮层神经元是主要受影响群体，并识别了特定细胞类型及其转录异常 | 结合流式细胞术核分选测序、单核多组学ATAC-seq与RNA-seq以及空间转录组学，首次在死后ALS/ALS-FTD运动皮层样本中系统定义了受TDP-43病理影响的神经元细胞类型及其特异性转录变化 | 研究基于死后组织样本，可能无法完全反映疾病早期动态过程；样本量相对有限（共82例），且仅聚焦于运动皮层区域 | 解析肌萎缩侧索硬化症（ALS）及相关额颞叶痴呆（ALS-FTD）中TDP-43病理的细胞类型特异性机制，为靶向治疗提供依据 | 死后ALS/ALS-FTD患者的运动皮层组织样本（30例ALS、20例ALS-FTD及32例对照） | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 流式细胞术核分选测序、单核多组学ATAC-seq、RNA-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 82例样本（30例ALS、20例ALS-FTD、32例对照） | NA | 单核多组学ATAC-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |