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当前共找到 1050 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2026-04-04
Bayesian Hyperspherical Graph Mixture-of-Experts Deciphers Cell-Cell Interaction in Spatial Transcriptomics
2026 Mar-Apr, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为B-HGME的无监督贝叶斯框架,用于从空间转录组数据中联合推断空间域和细胞-细胞相互作用网络 提出了首个结合超球面嵌入和贝叶斯混合专家模型的框架,用于无监督地推断具有方向性和长程性的细胞-细胞相互作用,并提供了原则性的不确定性量化 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 开发一种计算框架,以无监督和可解释的方式从空间转录组数据中准确推断细胞-细胞相互作用和空间域 空间转录组数据中的细胞及其相互作用 空间转录组学 NA 空间转录组学 贝叶斯超球面图混合专家模型 空间转录组数据 来自六个主要空间转录组平台的多个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
422 2026-04-04
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
研究论文 本研究通过DNA甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术,对骶骨脊索瘤的分子异质性进行了综合分析 首次结合甲基化分析、空间转录组学和多重免疫荧光技术,揭示了骶骨脊索瘤中与复发相关的独特表观遗传特征,并识别了免疫检查点标记物TIM3、CD47和PD-1的表达模式 研究为回顾性设计,样本量相对较小(29例患者),且缺乏功能验证实验 探究骶骨脊索瘤的分子异质性和肿瘤微环境特征 骶骨脊索瘤患者及其存档组织 数字病理学 脊索瘤 DNA甲基化分析,空间转录组学,多重免疫荧光 无监督聚类,多元线性回归分析 甲基化数据,空间基因表达数据,免疫荧光图像数据 29例骶骨脊索瘤患者 NA 空间转录组学 Digital Spatial Profiler (DSP) NA
423 2026-04-02
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine IF:3.8Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析,揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 首次在CTEPH中整合多组学数据(单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化)进行互补分析,并识别出具有遗传支持的新型候选基因(如ETS1和FGR)及其诊断潜力 样本量相对有限,且为观察性研究,需进一步功能验证和更大队列验证 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 NA 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 未明确具体样本数,涉及CTEPH患者队列 NA 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 NA NA
424 2026-04-02
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics IF:6.7Q1
研究论文 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架,用于空间转录组学数据插补,并利用自然图像进行协同训练 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略,利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域;2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示;3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN),在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 NA 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战,实现从稀疏输入进行准确数据插补 空间转录组学数据 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 级联数据一致性插补网络(CDCIN) 空间转录组学数据,自然图像 多种组织类型(包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织) NA 空间转录组学 NA NA
425 2026-04-02
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文提出了一种基于空间转录组数据的生成式AI模型,用于预测大脑血管系统的空间组织结构 利用空间mRNA引导的生成模型Tera-MIND,通过Cldn5和Acta2基因的共表达模式及其学习到的注意力图,在细胞级别分辨率上预测大脑血管空间组织 NA 探索大脑血管系统的结构变异性和区域特异性功能,以解释疾病模型中的神经学改变 小鼠大脑血管系统 数字病理学 神经疾病 空间转录组学 生成式AI模型,基于patch和边界感知的扩散模型 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
426 2026-04-02
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和机器学习方法,系统性地揭示了VDAC2在泛癌中的致癌作用及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路影响肿瘤进展和免疫逃逸的机制 首次在泛癌层面系统性地整合了批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据来研究VDAC2,并识别了VDAC2-BAK1-IFNγ这一在消化系统癌症中重要的新通路 体外实验验证主要集中于胃癌细胞,需要在更多癌症类型和体内模型中进行进一步验证 系统性地挖掘VDAC2在泛癌中的作用,探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 泛癌数据集、胃癌细胞系 机器学习 泛癌(重点关注消化系统癌症) 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, RT-PCR, 细胞共培养, CCK-8检测, Transwell侵袭实验, ELISA NA 转录组数据, 细胞实验数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
427 2026-04-02
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法,探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合,系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用,需进一步实验验证;单细胞数据未明确说明样本来源和数量 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 单细胞转录组学 心血管疾病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 NA 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 基于NHANES数据库的流行病学队列(具体样本数未说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
428 2026-04-02
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程,并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态,特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 研究主要基于体外实验模型,尚未在临床样本中得到充分验证 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 癌症细胞克隆 单细胞组学 癌症 DNA条形码技术、单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
429 2026-04-02
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍,发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂,其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台,首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍,揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据,体内实验验证可能受模型特异性限制,未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍,以提高心肌细胞诱导效率,促进心脏再生 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程,特别是在心肌梗死后的病理微环境中 单细胞组学 心血管疾病 Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 NA 单细胞RNA测序数据 涉及140个潜在障碍的筛选 NA 单细胞RNA-seq NA 定制化Perturb-seq平台,适用于复杂病理环境
430 2026-04-02
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术,构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱,揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术,高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态,明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉,并发现CD4谱系是转录默认程序,而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;空间转录组学分辨率有限,可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱,以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 小鼠胸腺中的胸腺细胞 单细胞组学 NA 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 NA NA
431 2026-04-02
In Vivo CRISPR Screening Identifies the Glutamate Receptor GRIA2 as Promoting Peritoneal Metastasis of Gastric Cancer via Calcium-Dependent β-Catenin Activation
2026-Mar-10, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过体内CRISPR筛选发现谷氨酸受体GRIA2通过钙依赖性β-连环蛋白激活促进胃癌腹膜转移 首次通过体内全基因组CRISPR/Cas9筛选鉴定出GRIA2作为胃癌腹膜转移的关键驱动因子,并揭示了癌症相关成纤维细胞通过谷氨酸旁分泌轴促进转移的新机制 研究主要基于小鼠模型和临床样本分析,尚未在人体中进行直接干预验证 探索胃癌腹膜转移的新治疗靶点 胃癌细胞、腹膜转移灶、癌症相关成纤维细胞 癌症生物学 胃癌 CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据、临床病理数据 细胞系来源和患者来源的类器官异种移植小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
432 2026-04-02
COL8A1-positive cancer-associated fibroblasts are drivers of 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2026-Mar-05, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究揭示了COL8A1阳性癌症相关成纤维细胞通过COL8A1/ITGB1介导的上皮-间质转化轴驱动结直肠癌对5-氟尿嘧啶耐药的新机制 首次鉴定出COL8A1阳性成纤维细胞亚群作为5-FU耐药的关键驱动因素,并阐明了其通过COL8A1/ITGB1信号轴诱导EMT的具体分子机制 研究样本量相对有限(24个队列),体内验证主要在异种移植模型中进行,缺乏更接近人体微环境的模型验证 探究结直肠癌中5-氟尿嘧啶获得性耐药的基质细胞驱动机制 结直肠癌组织、癌症相关成纤维细胞、肿瘤细胞系、小鼠异种移植模型 单细胞组学 结直肠癌 单细胞RNA测序、多组学分析、CRISPR/Cas9基因编辑、siRNA干扰、免疫化学分析 细胞通讯模型 单细胞转录组数据、多组学数据、体外实验数据、体内实验数据 24个结直肠癌队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
433 2026-04-02
Exploring the developmental mechanisms of tea plant trichomes using genomics and single-cell transcriptome sequencing
2026-Mar, Horticulture research IF:7.6Q1
研究论文 本研究通过基因组测序和单细胞转录组测序,探索了茶树毛状体的发育机制 首次提供了三倍体茶树品种的高质量染色体级别基因组组装,并构建了木本植物的单细胞图谱,鉴定了毛状体特异性标记基因和发育轨迹 NA 探索茶树毛状体的发育机制,为茶树育种提供遗传资源 福鼎大白茶(三倍体白茶品种)及其叶片组织 基因组学 NA PacBio长读长测序、Hi-C支架、单核RNA测序 NA 基因组序列、单细胞转录组数据 叶片组织混合样本 PacBio 长读长测序、Hi-C、单核RNA-seq NA NA
434 2026-04-01
Dissociable perfusion chip (DPC): perfusable microfluidic chip for single-cell screening of anti-cancer drugs in live glioblastoma explants
2026-Mar-31, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本研究介绍了一种可拆卸灌注芯片,用于在活体胶质母细胞瘤组织切片中进行单细胞水平的抗癌药物筛选 开发了一种新型微流控芯片,通过机械夹层而非化学附着的方式固定组织切片,实现了正压灌注和非破坏性组织解离,从而允许对厚组织切片进行并行培养、药物扰动以及下游单细胞RNA测序 这是一项概念验证工作,未来需要用于多种药物的筛选,并在更多新鲜人源胶质母细胞瘤切片上进行进一步验证 开发一种能够直接在人源肿瘤组织中快速、高分辨率地识别细胞类型特异性药物反应的新方法 人源胶质母细胞瘤手术切除的新鲜组织切片 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,微流控技术 NA 单细胞RNA测序数据,荧光测定数据 来自人类患者和小鼠模型的胶质母细胞瘤组织切片 NA 单细胞RNA-seq NA NA
435 2026-04-01
Human Papillomavirus (HPV) Infected Epithelial Cells and FBLN1+ Fibroreticular Cells Govern the Immunogenic Tumor Microenvironment in HPV-Associated Oropharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar-31, Clinical and experimental otorhinolaryngology IF:2.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了HPV相关口咽鳞状细胞癌中FBLN1+纤维网状细胞在塑造免疫原性肿瘤微环境中的关键作用 首次在HPV相关口咽鳞状细胞癌中鉴定出FBLN1+纤维网状细胞亚群,并通过空间定位分析揭示了其与肿瘤细胞和免疫细胞的密切关联,阐明了其通过表达SLIT2分子促进免疫细胞招募的机制 样本量相对较小(10个样本),未进行功能验证实验,研究结果需要在更大队列中验证 探究HPV相关口咽鳞状细胞癌预后较好的肿瘤微环境机制 口咽鳞状细胞癌患者组织样本(包括HPV阳性和阴性)及正常扁桃体组织 数字病理学 口咽鳞状细胞癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 10个样本(2个非HPV相关OPSCC, 5个HPV相关OPSCC, 3个正常扁桃体) NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
436 2026-04-01
Spatial omics insights into tumor myeloid cells: roles in tumorigenesis, prognosis, and therapy
2026-Mar-31, Molecular biology reports IF:2.6Q3
综述 本文综述了空间组学技术在肿瘤相关髓系细胞研究中的应用,探讨了其在肿瘤发生、预后和治疗中的作用 整合了新兴的空间蛋白质组学和转录组学研究,识别了调控肿瘤发生、预后和治疗反应的重复性空间结构,并提出了将空间模式转化为机制理解的分析框架 NA 探讨肿瘤相关髓系细胞在肿瘤进化、临床结果和治疗反应中的空间组织作用 肿瘤相关髓系细胞,包括巨噬细胞、单核细胞、中性粒细胞、树突状细胞及其相关谱系 数字病理学 癌症 空间组学技术,包括空间蛋白质组学和转录组学 NA RNA和蛋白质表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
437 2026-04-01
Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study
2026-Mar-30, Gut IF:23.0Q1
研究论文 本研究开发并验证了一个多模态预后模型,用于预测接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结局 结合了深度学习、常规影像组学、临床变量以及多组学分析(包括单细胞转录组数据),构建了一个具有生物学可解释性的融合模型,实现了比现有临床模型更精细的风险分层 研究为回顾性多中心设计,可能存在选择偏倚;模型的外部验证和临床应用仍需进一步前瞻性研究 开发并验证一个用于预测肝细胞癌患者接受TACE治疗后生存结局的多模态预后模型 肝细胞癌患者 计算机视觉 肝细胞癌 单细胞RNA测序,多组学分析 深度学习模型,常规影像组学模型,早期融合和晚期融合模型 图像,临床数据,转录组数据 1448名肝细胞癌患者(包括TACE队列1349人,随机试验生物标志物子集41人,单细胞RNA测序队列和TCGA队列50人) NA 单细胞RNA-seq NA NA
438 2026-04-01
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究揭示了E3泛素连接酶RNF128通过稳定SCD1促进代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 首次发现RNF128通过K63连接泛素化稳定SCD1,阻断其自噬-溶酶体降解,从而驱动脂质积累,并验证了靶向RNF128的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外肝细胞实验,人类临床验证尚需进一步研究 探究RNF128在代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展中的作用机制及治疗靶点潜力 人类MASLD肝脏样本、高脂高胆固醇饮食诱导的小鼠模型、肝细胞 分子生物学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 RNA-seq、单细胞RNA测序、蛋白质组学、泛素化组学、GalNAc-ASO、shRNA-AAV NA 基因表达数据、蛋白质数据 未明确具体样本数量,包括人类肝脏样本和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq NA NA
439 2026-04-01
Cell neighborhood topology directs rare cell population identification
2026-Mar-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文介绍了一种名为RareQ的快速可扩展框架,用于通过单细胞组学数据评估每个细胞的k近邻邻域的紧密性来检测稀有细胞 提出了一种基于细胞邻域拓扑结构的新方法RareQ,该方法在准确度、灵敏度和效率方面优于现有方法,并能识别模态特异性和共享的稀有细胞 未在摘要中明确说明 开发一种高效识别稀有细胞的方法,以增强对组织结构和疾病机制的理解 单细胞组学数据和空间转录组学数据中的稀有细胞 数字病理学 NA 单细胞组学 NA 单细胞组学数据、空间转录组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
440 2026-04-01
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过AI引导的多组学分析,揭示了PM2.5暴露下NPC1基因调控SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 利用微调的单细胞转录组学基础模型,首次整合AI引导的转录组学、流行病学、GWAS、功能基因组学和体外验证,系统解码了环境暴露对健康的影响 机制研究主要在体外实验中进行,需要更多体内实验和临床数据进一步验证 阐明PM2.5暴露如何增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 PM2.5暴露与SARS-CoV-2感染的关联机制 机器学习 SARS-CoV-2感染 单细胞转录组学、全基因组关联研究(GWAS)、功能基因组学分析 基础模型(微调) 转录组数据、流行病学数据、遗传数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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