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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-03-19 |
Epigenetic context defines the transcriptional activity of canonical and noncanonical NF-κB signaling in pancreatic cancer
2026-Mar-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-026-03019-9
PMID:41844578
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研究论文 | 本研究通过转录组、基因组和表观基因组分析,揭示了胰腺导管腺癌中NF-κB信号通路的经典与非经典途径在TNFα和TWEAK激活下的差异调控机制 | 首次系统比较了RELA和RELB在胰腺癌中的时空动态、染色质结合特性及与AP1的协同调控关系,并利用单细胞技术解析了它们在肿瘤微环境中的空间分布 | 研究主要基于体外刺激模型和有限的原发组织样本,尚未在更大队列或体内模型中验证功能后果 | 阐明胰腺导管腺癌中经典与非经典NF-κB信号通路的激活机制、转录调控功能及其在肿瘤微环境中的作用 | 胰腺导管腺癌细胞系及原发肿瘤组织 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组基因表达谱分析、全基因组占据图谱、表观基因组分析、单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、单细胞转录组数据、免疫荧光图像 | 未明确样本数量,涉及细胞系刺激实验和原发PDAC组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 382 | 2026-03-19 |
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70047-5
PMID:41844605
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,在小鼠模型中揭示了以血管为中心的细胞互作驱动日本脑炎进展的机制 | 首次结合Stereo-seq技术同时原位捕获宿主和病毒转录组,构建了日本脑炎发病机制的时空图谱,并明确了Ly6c2单核细胞作为主要病毒载体和IFN-γ来源的关键作用 | 研究仅使用雌性BALB/c小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异;结论主要基于小鼠模型,人类病理机制可能有所不同 | 阐明神经侵袭性病毒(特别是日本脑炎病毒)引起神经病理的细胞互作机制 | 日本脑炎病毒感染的雌性BALB/c小鼠脑组织 | 空间转录组学 | 日本脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 日本脑炎病毒感染的雌性BALB/c小鼠脑组织样本 | 华大智造 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术,可同时原位捕获宿主和病毒转录组 |
| 383 | 2026-03-19 |
A blueprint for local and distal invasion programs in glioblastoma
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70470-8
PMID:41844611
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和多路成像技术,探索胶质母细胞瘤的局部和远端侵袭程序 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多路成像,首次解耦了胶质母细胞瘤侵袭潜力与侵袭过程相关的转录特征,并揭示了不同细胞状态与侵袭路径的关联 | 研究基于异种移植模型,可能不完全反映人类胶质母细胞瘤的复杂性;样本量有限(20个患者来源模型) | 研究胶质母细胞瘤的侵袭机制,区分局部和远端侵袭的转录程序 | 胶质母细胞瘤患者来源的胶质瘤球模型和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多路成像 | NA | 转录组数据, 空间成像数据 | 20个患者来源的胶质瘤球模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 384 | 2026-03-19 |
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70558-1
PMID:41844641
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研究论文 | 本研究通过多模态成像揭示,PARP抑制剂在卵巢癌肿瘤中分布不均,其异质性积累与溶酶体药物储存相关,影响药物疗效 | 首次利用患者来源外植体多模态成像管道,在单细胞水平上展示PARP抑制剂(如rucaparib)的异质性积累,并发现溶酶体作为药物储存库驱动这种分布差异 | 研究主要聚焦于高分级浆液性卵巢癌,未广泛验证其他肿瘤类型;且仅针对特定PARP抑制剂(如rucaparib和niraparib),对olaparib的影响机制未明确 | 探究肿瘤异质性如何影响PARP抑制剂的细胞内分布和疗效,以克服临床耐药问题 | 高分级浆液性卵巢癌患者来源的肿瘤外植体及PARP抑制剂药物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多模态成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 385 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 386 | 2026-03-19 |
Human umbilical cord mesenchymal stromal cells therapy for neuromyelitis optica spectrum disorder: a phase 1/2a trial
2026-Mar-17, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-026-01720-x
PMID:41844898
|
研究论文 | 本研究评估了人脐带间充质干细胞治疗视神经脊髓炎谱系疾病的安全性和有效性 | 首次在临床试验中系统评估hUC-MSCs对NMOSD的疗效,并探索了其通过硫氧还蛋白和氧化磷酸化途径增强Treg细胞功能的潜在机制 | 单臂、开放标签设计,样本量较小(31例),缺乏对照组,随访时间有限(15个月) | 评估hUC-MSCs减少NMOSD复发和改善神经功能障碍的安全性与疗效 | 31名NMOSD患者 | NA | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序,代谢组学检测 | NA | 临床数据,MRI影像,单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | 31例NMOSD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2026-03-19 |
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Mar-17, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03029-6
PMID:41845065
|
研究论文 | 介绍了一种基于大语言模型的AI代理CellVoyager,用于自主生成和执行单细胞RNA测序分析 | CellVoyager在Jupyter笔记本环境中自主执行scRNA-seq分析,在预测已发表研究中的分析方法上优于GPT-4o和o3-mini,并能生成专家认可的新发现 | 仅评估于CellBench基准的76项研究,可能未涵盖所有scRNA-seq分析场景 | 开发自主AI代理以加速计算生物学并发现新见解 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | COVID-19 | scRNA-seq | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | 76项已发表scRNA-seq研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08032-1
PMID:41845371
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2026-03-19 |
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08004-5
PMID:41845425
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 391 | 2026-03-19 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Mar-17, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和多组学数据分析,识别了帕金森病外周血中与单核细胞相关的生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测了其潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA方法,在帕金森病外周血中鉴定出与单核细胞密切相关的生物标志物,并预测了靶向药物结合潜力 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证,样本来源和规模可能有限 | 阐明帕金森病中单核细胞相关的关键分子改变,以识别新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者的外周血单细胞数据及芯片数据集 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq, 芯片数据分析, 分子对接模拟 | Seurat, CellChat, hdWGCNA, Limma, AutoDocktools | 单细胞测序数据, 基因表达芯片数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 392 | 2026-03-19 |
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-Mar-17, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2026.01.006
PMID:41846175
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评论 | 本文讨论了长寿命IgE浆细胞在持久性过敏中的作用,基于遗传命运图谱和单细胞测序技术的新发现 | 通过遗传命运图谱和单细胞测序揭示了两种细胞群体(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)维持IgE的新机制 | NA | 探讨长寿命IgE浆细胞对持久性过敏的重要性 | IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞 | NA | 过敏性疾病 | 遗传命运图谱, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2026-03-19 |
Cathepsin B promotes asthma potentially via macrophage-associated autophagy and apoptosis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag020
PMID:41847863
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研究论文 | 本研究整合遗传学、转录组学和实验方法,揭示了组织蛋白酶B(CTSB)通过巨噬细胞相关的自噬和凋亡途径促进哮喘发病的机制 | 首次通过孟德尔随机化分析证实循环CTSB水平升高与哮喘风险存在因果关系,并利用单细胞RNA测序技术将CTSB表达定位到巨噬细胞,阐明了其通过调控自噬和凋亡影响哮喘的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外数据,在人类中的直接验证尚不充分;CTSB抑制剂的选择性及其在临床治疗中的安全性和有效性仍需进一步评估 | 探究组织蛋白酶B(CTSB)是否以及如何参与哮喘的发病机制 | 哮喘患者(人类数据)和C57BL/6小鼠卵清蛋白诱导的哮喘模型 | NA | 哮喘 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 遗传数据、转录组数据、实验数据 | 大规模GWAS数据、哮喘患者RNA-seq数据、scRNA-seq数据集、C57BL/6小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 394 | 2026-03-19 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型,并提供了分类和挑战分析 | 将多种scRNA-seq表示学习方法统一到表示学习范式下,提供概念分类和基准测试讨论 | 作为综述,未提出新方法,主要基于现有文献总结 | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法及其应用 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 395 | 2026-03-19 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 本文综述了miRNA及其靶向3'UTR在脑组织空间中的调控作用,重点关注神经发育和神经元功能,并总结了当前空间定量方法及未来研究方向 | 首次从3'UTR角度探讨miRNA在脑组织空间中的调控,强调同时量化miRNA和3'UTR的空间表达及异构体变异的重要性,并提出未来研究策略 | 当前尚无方法能同时量化miRNA和3'UTR在空间中的表达,且3'UTR异构体的空间变异研究不足 | 探讨miRNA介导的基因调控在脑组织空间中的作用,特别是在神经发育和神经元功能中的复杂功能 | 脑组织中的miRNA和3'UTR | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 396 | 2026-03-19 |
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-Mar-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250108
PMID:40910272
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的PDOs,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 | 首次通过单细胞转录组学分析来自同一肿瘤多个部位的PDOs,揭示了PDOs在基因表达上的相似性和差异性,并验证了神经内分泌肿瘤标志物的上调 | PDOs在反映肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 | 评估PDOs作为临床前模型在捕捉胃癌肿瘤内异质性方面的能力 | 来自单个胃癌肿瘤不同部位的PDOs | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自单个胃癌肿瘤多个部位的PDOs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2026-03-19 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis
2026-Mar-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
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研究论文 | 通过对六项独立的转录组学研究进行基于排名的荟萃分析,确定了白癜风皮损皮肤中一致的基因表达特征,揭示了以黑素细胞丢失为主导的稳健特征 | 首次采用基于排名的荟萃分析方法整合了来自不同平台(微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq)的多项独立研究数据,系统识别了白癜风皮损中一致且稳健的黑素细胞丢失特征,并发现了具有高黑素细胞特异性的新候选标记物 | 研究中观察到的免疫反应激活存在异质性,可能受采样方法和疾病特征的影响,需要进一步研究 | 识别白癜风皮损皮肤中一致的转录组特征,阐明其病理机制 | 白癜风患者的皮损皮肤样本 | 生物信息学 | 白癜风 | 转录组学分析,包括微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | 稳健排名聚合分析 | 基因表达数据 | 115个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 398 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-Mar-12, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111231
PMID:41831621
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性及其炎症重编程机制 | 首次在类风湿关节炎滑膜中系统鉴定出以C1(趋化因子)和C3(S100A8/A9)表型为主的浸润性中性粒细胞亚群,并发现NF-κB/STAT3轴是调控其炎症重编程的关键节点 | 样本量相对有限(8例单细胞测序患者),且功能验证主要依赖计算模拟,需后续实验验证 | 阐明类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性及其在炎症微环境中的作用机制 | 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | hdWGCNA(高维加权基因共表达网络分析) | 单细胞转录组数据 | 8例RA患者(66,539个细胞)用于单细胞测序,19例独立样本用于批量RNA-seq验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-03-19 |
PIN1 suppresses bladder cancer progression by inducing cellular senescence and activating the interferon response pathway
2026-Mar-12, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2026.112476
PMID:41831815
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了PIN1在膀胱癌中作为肿瘤抑制因子的新角色,其通过诱导细胞衰老和激活干扰素反应通路来抑制肿瘤进展 | 首次在膀胱癌中识别PIN1为肿瘤抑制因子,并阐明其通过激活干扰素通路诱导细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,临床验证和机制细节仍需进一步探索 | 探究PIN1在膀胱癌中的表达模式、生物学功能及其分子机制 | 膀胱癌组织、细胞系及小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Western blot, qRT-PCR, RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 临床标本数据, 体外实验数据 | 未明确指定样本数量,但涉及临床标本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2026-03-19 |
Inhibition of NFAT after human uterus transplant promotes loss of tissue-resident NK cells and attendant pregnancy complications
2026-Mar-11, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adp2196
PMID:41811989
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研究论文 | 本研究通过比较子宫移植受者与健康对照的样本,揭示了NFAT信号抑制导致组织驻留子宫自然杀伤细胞减少,进而引发妊娠并发症的机制 | 首次在人类中揭示了NFAT信号在调节子宫自然杀伤细胞组织驻留程序中的关键作用,并关联了子宫移植后妊娠并发症的生物学基础 | 研究基于子宫移植受者这一高风险人群,样本量可能有限,且机制研究主要依赖体外实验,需进一步验证 | 探究子宫移植后妊娠并发症的生物学机制,特别是组织驻留子宫自然杀伤细胞的作用 | 子宫移植受者的子宫内膜和蜕膜组织样本,以及健康对照的相应组织 | 单细胞组学 | 妊娠并发症 | 流式细胞术、免疫荧光显微镜、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像数据 | 子宫移植受者队列与健康对照的子宫内膜和蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |