单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 51 篇文献,本页显示第 21 - 40 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
21 2026-01-29
Single-cell transcriptome sequencing revealing the microenvironment of breast fibroepithelial tumor
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了青少年与成人乳腺纤维上皮性肿瘤微环境的差异 首次在单细胞分辨率上比较了青少年与成人乳腺巨大纤维上皮性肿瘤的分子特征和细胞间通讯网络,并鉴定出青少年特异的抗原呈递成纤维细胞亚群 样本量较小(仅3例青少年病例和1例成人病例),且为观察性研究,需进一步功能验证 阐明青少年巨大乳腺纤维上皮性肿瘤的生物学基础,以指导靶向治疗 乳腺纤维上皮性肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4例患者(3例青少年,1例成人),共计26,737个细胞 BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System
22 2026-01-27
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-Mar, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1
研究论文 本研究探讨了钾通道调节因子1(KCMF1)在卵巢癌中的生物学功能及其通过调节HRI泛素化抑制整合应激反应(ISR)的机制 首次揭示了KCMF1通过调控HRI泛素化抑制ISR通路促进卵巢癌进展的新机制,并鉴定出Plantainoside D作为新型KCMF1抑制剂 研究主要基于细胞系和异种移植模型,缺乏临床患者样本的深入验证 探究KCMF1在卵巢癌中的生物学功能及分子机制 卵巢癌细胞系、异种移植小鼠模型 肿瘤生物学 卵巢癌 单细胞测序、qRT-PCR、免疫组化、Western blot、Ni-NTA pull-down 异种移植小鼠模型 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 未明确样本数量,使用细胞系和动物模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
23 2026-01-26
Gsx2 regulates oligodendrocyte precursor formation in the zebrafish spinal cord
2026-Mar, Developmental biology IF:2.5Q2
研究论文 本研究利用斑马鱼模型,通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序技术,揭示了Gsx2在调控脊髓中少突胶质前体细胞形成时间中的作用 首次在斑马鱼中识别出pre-OPCs亚群,并发现Gsx2通过调控基因网络影响OPC形成的时机,而非分化过程 研究主要基于斑马鱼模型,结果在哺乳动物中的普适性需进一步验证 探究脊髓中神经祖细胞向少突胶质细胞谱系分化的机制 斑马鱼脊髓中的神经祖细胞、pre-OPCs和少突胶质前体细胞 发育生物学 NA 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因组编辑 NA 单细胞转录组数据, 单核染色质可及性数据 斑马鱼胚胎样本 NA 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq NA NA
24 2026-01-25
ACADVL upregulation is associated with placental ferroptosis in intrahepatic cholestasis of pregnancy
2026-Mar, Biochimica et biophysica acta. Molecular and cell biology of lipids
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序、脂质组学和公共RNA-seq数据,探讨了妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)中胎盘铁死亡的机制,发现ACADVL上调与线粒体功能障碍和铁死亡相关 首次提出ACADVL、脂质代谢、线粒体功能障碍和铁死亡在ICP发病机制中的关联模型,并利用多组学方法验证了绒毛细胞滋养层(VCT)中的关键作用 研究机制尚未完全阐明,且样本来源和实验验证可能有限,需要进一步在体功能研究确认 探究ICP中胎盘功能障碍的分子机制,特别是铁死亡和线粒体相关基因的作用 妊娠期肝内胆汁淤积症(ICP)患者的胎盘组织,重点关注绒毛细胞滋养层(VCT) 生物信息学 妊娠期肝内胆汁淤积症 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)脂质组学、RNA-seq、免疫组化、免疫荧光、Western blotting、透射电子显微镜 随机森林、支持向量机、LASSO回归 单细胞转录组数据、脂质组学数据、公共RNA-seq数据、蛋白质表达数据 未明确指定样本数量,但涉及ICP患者胎盘组织 NA 单细胞RNA-seq, 脂质组学, RNA-seq NA NA
25 2026-01-25
Identification of the disulfidptosis-related gene IQGAP1 as a potential diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2026-Mar-01, Brain research IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和转录组数据,首次发现二硫化物死亡相关基因IQGAP1在帕金森病中表达上调,并构建了帕金森病的诊断模型 首次将新发现的细胞死亡形式——二硫化物死亡与帕金森病联系起来,并识别出IQGAP1作为潜在诊断生物标志物 研究主要基于转录组数据分析,需要进一步的体内外功能实验验证IQGAP1在帕金森病发病机制中的具体作用 探究二硫化物死亡相关基因在帕金森病中的表达模式、功能及其作为诊断生物标志物的潜力 帕金森病患者与健康对照的转录组数据及单细胞RNA测序数据 生物信息学 帕金森病 单细胞RNA测序,定量实时逆转录PCR,差异表达分析,LASSO回归,随机森林算法 诊断模型 转录组数据,单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的帕金森病与健康对照样本数据集,以及外部验证队列 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq NA NA
26 2026-01-22
Comparative spatial whole transcriptome analysis of matched frozen and formalin-fixed paraffin-embedded colorectal cancer tissues
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过空间全转录组分析比较了匹配的冷冻和福尔马林固定石蜡包埋结直肠癌组织的基因表达谱 首次使用空间全转录组技术系统比较FFPE、FF和SF三种组织保存方法在结直肠癌样本中的表现,揭示了不同方法在细胞形态分辨和基因表达水平上的优势 研究仅基于单例IV期结直肠癌患者的36个组织区域,样本量有限,需要更大规模验证 评估不同组织保存方法(FFPE、FF、SF)对结直肠癌空间转录组分析质量的影响 结直肠癌组织样本 空间转录组学 结直肠癌 空间全转录组分析 NA 空间转录组数据 36个组织区域(来自1例IV期结直肠癌患者) NA 空间转录组学 NA NA
27 2026-01-22
Extracellular vesicles derived from adipose-derived mesenchymal stem/stromal cells prevent synovial inflammation and attenuate cartilage degeneration in rodent osteoarthritis
2026-Mar, Regenerative therapy IF:3.4Q2
研究论文 本研究探讨了脂肪来源间充质干细胞衍生的细胞外囊泡(MSC-EVs)在啮齿动物骨关节炎模型中减轻滑膜炎症和软骨退化的作用 首次结合单细胞RNA测序技术,在体内外系统评估MSC-EVs对骨关节炎的免疫调节和软骨保护作用,并揭示了其促进巨噬细胞向M2表型极化的新机制 研究仅在啮齿动物模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;MSC-EVs的具体作用分子机制尚未完全阐明 评估脂肪来源MSC-EVs作为骨关节炎疾病修饰疗法的治疗潜力 RAW264.7巨噬样细胞、人滑膜细胞、MIA诱导的骨关节炎大鼠模型 单细胞组学 骨关节炎 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 细胞实验(RAW264.7细胞、人滑膜细胞)和动物模型(MIA诱导OA大鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
28 2026-01-20
C-X-C chemokine receptor CXCR4 mediates diurnal changes in the aggregation and dispersion of CD8+ T cells within the tumor microenvironment
2026-Mar-15, International journal of cancer IF:5.7Q1
研究论文 本研究揭示了CXCR4介导的CD8+ T细胞在肿瘤微环境中昼夜节律性聚集与分散的机制,并提出了通过时间依赖性抑制CXCR4来增强免疫检查点抑制剂疗效的新策略 首次发现肿瘤浸润CD8+ T细胞中CXCR4表达的昼夜节律性变化及其通过TGF-β-SMAD信号通路受SMAD7时间依赖性调控的机制,并证明在CXCR4表达高峰时相给予抑制剂可促进T细胞在肿瘤组织中的分散,从而增强免疫治疗效果 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA-seq数据的重分析,在人体中的直接验证尚不充分;昼夜节律调控的具体分子机制细节仍需进一步阐明 探究肿瘤微环境中CD8+ T细胞空间分布的昼夜节律变化机制及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 肿瘤浸润CD8+ T细胞、脾脏T细胞、表达CXCL12的癌症相关成纤维细胞(CAFs)、肺癌患者T细胞单细胞RNA-seq数据 肿瘤免疫学 肺癌 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
29 2026-01-20
Single-cell transcriptomic analysis reveals the molecular alterations of endothelial cells during ageing
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组分析揭示了年轻与年老主动脉中内皮细胞的分子变化,探讨了血管老化的潜在机制 首次在单细胞水平上系统比较了年轻与年老主动脉内皮细胞的转录组差异,并提出了AP-1和Egr1作为血管老化关键转录因子的新见解 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源单一(主动脉),未涵盖其他血管类型;机制研究尚待深入实验验证 探究血管老化过程中内皮细胞的分子变化机制 年轻与年老小鼠主动脉内皮细胞 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 年轻组与年老组小鼠主动脉样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
30 2026-01-20
Expression profiles of GPR56 and CD99 in T cells of AIDS patients and assessment of diagnostic value
2026-Mar, Diagnostic microbiology and infectious disease IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术,分析了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的表达动态,评估其作为疾病进展和诊断生物标志物的潜力 首次系统评估了GPR56和CD99在艾滋病患者T细胞亚群中的蛋白表达谱,并发现CD8⁺GPR56⁺CD99⁺ T细胞亚群对HIV感染具有高诊断准确性 样本量相对较小(36例患者和35例对照),且年龄和性别分布存在差异,可能影响结果的普适性 探究GPR56和CD99在艾滋病进展中的表达变化,并评估其作为诊断生物标志物的价值 艾滋病患者和健康对照者的外周血T细胞 生物信息学 艾滋病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 蛋白质表达数据 36例艾滋病患者(男性31例,女性5例,年龄41.58±12.42岁)和35例健康对照(男性25例,女性10例,年龄32.17±12.09岁) NA 单细胞RNA测序 NA NA
31 2026-01-20
Inhibition of c-Jun/Bak signaling alleviates endothelial cell senescence and inflammation caused by mitochondrial dysfunction in DMED
2026-Mar, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析,揭示了c-Jun/Bak信号通路是糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的关键驱动因素 首次在糖尿病性勃起功能障碍中鉴定出c-Jun/Bak信号通路作为内皮细胞衰老和炎症的关键驱动机制,并提出了靶向该通路线粒体调控的治疗新策略 研究主要基于啮齿动物模型,人类糖尿病的复杂性使得转化应用面临挑战,需要进一步研究 探究糖尿病性勃起功能障碍中内皮细胞衰老和炎症的分子机制,并寻找潜在治疗靶点 糖尿病性勃起功能障碍大鼠的阴茎海绵体内皮细胞及体外细胞模型 数字病理学 糖尿病并发症 单细胞RNA测序, 转录组分析 NA RNA测序数据 糖尿病性勃起功能障碍大鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
32 2026-01-20
Mitochondrial dysregulation as a central mechanism in autism spectrum disorder pathogenesis
2026-Mar, Journal of neuroimmunology IF:2.9Q2
研究论文 本研究探讨线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的作用,使用多种临床前模型 通过整合母体免疫激活和ASD高风险基因敲除模型,结合转录组分析和单细胞RNA-seq数据,揭示了线粒体代谢在ASD中的核心作用,并强调了其在人类大脑发育中的相关性 研究主要基于临床前动物模型,人类数据的直接验证有限,且环境因素与线粒体功能障碍的具体联系机制仍需进一步阐明 探究线粒体功能障碍和代谢紊乱在自闭症谱系障碍发病机制中的角色 小鼠脑组织、母体免疫激活模型、ASD高风险基因敲除模型、人类胎儿单细胞图谱数据 神经科学 自闭症谱系障碍 转录组分析、单细胞RNA-seq、功能富集分析(GO和KEGG) NA 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
33 2026-01-18
CD44-mediated copper accumulation drives Ly6Chi macrophages activation in ulcerative colitis
2026-Mar, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了在溃疡性结肠炎中,CD44介导的铜积累驱动Ly6Chi巨噬细胞活化的关键机制 首次阐明了CD44通过调控铜稳态(抑制铜输出蛋白ATP7A)导致铜积累,进而驱动Ly6Chi巨噬细胞活化的新机制 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类患者组织中进行充分验证;具体的CD44-ATP7A调控分子通路细节有待进一步阐明 阐明溃疡性结肠炎炎症进展中Ly6Chi巨噬细胞活化的驱动机制 Ly6Chi巨噬细胞、溃疡性结肠炎小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据 使用了公共单细胞RNA-seq数据集GSE264408,并涉及溃疡性结肠炎小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
34 2026-01-18
Aspartame promotes ovarian cancer progression: A multi-omics study integrating mendelian randomization, network toxicology, and in vitro validation
2026-Mar, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1
研究论文 本研究采用多组学方法探究了人工甜味剂阿斯巴甜与卵巢癌之间的因果关系及其潜在机制 首次整合孟德尔随机化、网络毒理学、机器学习算法(LASSO、SVM、随机森林)以及体外实验验证,系统揭示了阿斯巴甜通过上调AURKA、CCND1和RAD51等关键基因表达促进卵巢癌进展的潜在机制 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型或大规模人群队列的直接验证,因果关系的确立仍需进一步研究 探究人工甜味剂阿斯巴甜与卵巢癌发生发展的因果关系及分子机制 卵巢癌(OC)、阿斯巴甜、核心靶基因(AURKA、CCND1、RAD51) 生物信息学与计算生物学 卵巢癌 孟德尔随机化分析、网络毒理学、机器学习算法(LASSO、SVM、随机森林)、分子对接模拟、体外细胞实验 LASSO、SVM、随机森林 基因组数据、转录组数据(bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq) NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
35 2026-01-18
JOSD2 alleviates hypertensive renal disease through deubiquitinating AKT in renal tubular epithelial cells
2026-Mar, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了去泛素化酶JOSD2通过去泛素化AKT并促进其自噬降解,从而减轻高血压肾病中的肾小管上皮细胞损伤和纤维化 首次发现JOSD2是AKT的去泛素化酶,并阐明了JOSD2-AKT轴在高血压肾病中的保护作用机制 研究主要在动物模型中进行,尚未在人体样本或临床试验中验证 探索高血压肾病的新型治疗靶点 小鼠模型、肾小管上皮细胞 NA 高血压肾病 单细胞RNA测序、质谱分析、免疫共沉淀 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 野生型和Josd2敲除小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
36 2026-01-18
Plasticizer mixture exposure-induced preeclampsia pathogenesis: Integrated single-cell and bulk transcriptomics, network toxicology, and molecular docking insights
2026-Mar, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞与批量转录组学、网络毒理学和分子对接技术,揭示了增塑剂混合物暴露诱导子痫前期发病的机制 首次系统研究了ATBC、DEP、DMP和DOP四种增塑剂混合暴露对子痫前期的影响,并综合运用多种组学与计算生物学方法识别关键生物标志物和细胞亚群 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏大规模人群流行病学证据和体内实验验证 阐明增塑剂混合物暴露导致子痫前期的生物学靶点和致病机制 子痫前期患者胎盘组织、绒毛细胞滋养层细胞 数字病理学 子痫前期 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, 免疫组化, 分子对接, 分子动力学模拟 机器学习 基因表达数据, 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量,涉及PE患者和对照组胎盘组织 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
37 2025-12-02
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases IF:6.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
38 2026-01-16
Unveiling CDKN1A and RELA: Machine learning-driven aging biomarkers for precision diagnosis and therapy in knee osteoarthritis
2026-Mar, Journal of orthopaedics IF:1.5Q3
研究论文 本研究通过整合转录组数据和机器学习方法,鉴定出CDKN1A和RELA作为膝骨关节炎中下调的生物标志物,并进行了实验验证 首次结合多数据集、多种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)和单细胞RNA测序分析,系统性地识别膝骨关节炎中与衰老相关的核心生物标志物,并探索其与免疫细胞浸润、代谢通路及潜在治疗化合物(姜黄素)的关联 研究主要基于公共数据集和生物信息学分析,实验验证仅在动物模型中进行,缺乏大规模临床样本验证;机器学习模型的泛化能力有待进一步在不同队列中验证 系统识别膝骨关节炎中与衰老相关的生物标志物,以用于精准诊断和治疗 膝骨关节炎(KOA)相关的基因表达数据、衰老相关基因、小鼠KOA模型 机器学习 骨关节炎 基因表达分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、分子对接、qRT-PCR、Western blotting LASSO回归、SVM-RFE、随机森林 基因表达数据(微阵列、RNA-seq)、单细胞RNA测序数据 两个公共基因表达数据集(GSE12021、GSE169077)和一个单细胞RNA测序数据集(GSE176308),以及小鼠KOA模型 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
39 2026-01-15
Single-cell and spatial profiling highlights TB-induced myofibroblasts as drivers of lung pathology
2026-03-02, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了结核病诱导的肌成纤维细胞作为肺病理驱动因素的关键作用 首次在结核病研究中结合单细胞RNA测序和空间转录组学,识别出MMP1+CXCL5+成纤维细胞亚群作为疾病严重程度和细菌负荷的关联因素,并揭示了其与SPP1+巨噬细胞的相互作用网络 研究样本量有限,且部分发现依赖于非人灵长类动物模型,需进一步在更大规模人类队列中验证 探究结核病肺免疫病理的细胞驱动因素 结核病感染者和未感染者的肺组织 数字病理学 结核病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学, 流式细胞术 NA 基因表达数据, 空间定位数据 来自结核病感染者和未感染者的肺组织样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
40 2026-01-14
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 本文对商业单细胞RNA测序技术进行了全面评估,比较了多种平台的性能指标和实际应用因素 首次在单细胞TCR恢复可用检测中比较了T细胞特异性性能,并综合评估了细胞回收率、灵敏度对稀有细胞亚型解析能力的影响 研究主要基于PBMC样本,可能不适用于其他组织类型;未涵盖所有商业平台 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 来自不同供者的标准化PBMC样本 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个供者的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq, TCR分析 NA 评估了七种全转录组mRNA检测试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒
回到顶部