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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-07-12 |
Histone lactylation-driven feedback loop modulates pyrimidine metabolism to promote oral carcinogenesis
2026-Mar-19, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08580-w
PMID:41857010
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research paper | 本研究揭示了组蛋白乳酸化通过正反馈环路调节嘧啶代谢促进口腔癌发生的机制 | 首次发现组蛋白乳酸化(特别是H3K18la)通过激活TK1转录并形成糖酵解/H3K18la/TK1/β-catenin正反馈环路促进口腔癌发生,揭示了表观遗传调控与乳酸驱动的代谢重编程之间的新联系 | 组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的具体作用机制仍需进一步阐明,且研究主要基于体外和动物模型,临床转化尚需验证 | 探究组蛋白乳酸化在口腔癌发生中的作用及其分子机制 | 口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织、细胞系及4NQO诱导的舌癌模型 | digital pathology | lung cancer, prostate cancer, cardiovascular disease, geriatric disease | 免疫组化、CUT&Tag、scRNA-seq、ChIP-qPCR、糖酵解抑制剂、基因沉默 | NA | image, text | 研究涉及口腔白斑和口腔鳞状细胞癌组织样本,具体数量未在标题和摘要中说明 | 10x Genomics | scRNA-seq | 10x Chromium | NA |
| 22 | 2026-07-12 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies ALOX5 as a potential therapeutic target for tubulointerstitial inflammation in diabetic kidney disease
2026-Mar-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-44445-0
PMID:41857149
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,鉴定ALOX5为糖尿病肾病肾小管间质炎症的潜在治疗靶点 | 首次结合多组学数据、机器学习算法和单细胞测序,系统性鉴定ALOX5在糖尿病肾病肾小管间质炎症中的关键作用,并筛选出天然小分子和厚朴酚作为潜在抑制剂 | 研究主要基于公共数据集和生信分析,缺乏体内外实验验证,且未深入探讨ALOX5抑制剂的临床应用效果 | 识别糖尿病肾病肾小管组织中的关键炎症生物标志物,并阐明其免疫调控机制 | 糖尿病肾病患者的肾小管组织 | 机器学习和多组学分析 | 糖尿病肾病 | 差异表达分析、WGCNA、LASSO、随机森林、单细胞测序拟时序分析、多重免疫组化、分子对接 | LASSO、随机森林 | 转录组数据、单细胞测序数据 | 多个GEO数据集,具体样本量未明确说明 | NA | NA | NA | NA |
| 23 | 2026-07-12 |
Bulliform cells: anatomical, physiological, genetic, and computational perspectives on plants' drought adaptation
2026-Mar-19, Planta
IF:3.6Q1
DOI:10.1007/s00425-026-04984-2
PMID:41857245
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综述 | 本文从解剖、生理、遗传和计算多维度综合阐述了泡状细胞在植物干旱适应中的作用 | 提出了整合多组学、系统生物学和AI驱动建模的创新框架,以预测泡状细胞行为并优化作物抗旱性 | 关键知识空白仍然存在,特别是在泡状细胞如何响应复合非生物胁迫以及水分保持与叶片热调节之间的生理权衡方面 | 阐明泡状细胞在植物干旱适应中的核心作用,并探索其作为开发抗逆作物品种的潜在靶点 | 泡状细胞 | 机器学习和计算生物学 | 不适用 | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、数量性状位点定位、高通量成像、机器学习 | AI驱动模型 | 图像、转录组数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 24 | 2026-07-12 |
TimeVault: A molecular time machine for single cells
2026-Mar-19, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.019
PMID:41861790
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评论 | TimeVault作为一种分子时间机器,使研究者能够在细胞持续分裂和分化时重建过去的转录状态 | TimeVault通过将分子历史保留在完整细胞内,提供了传统单细胞RNA测序(scRNA-seq)的替代方案,传统方法仅捕获终末快照,而TimeVault可追溯细胞历史状态 | 未在摘要中提及具体限制 | 介绍TimeVault方法以重建单细胞过去转录状态 | 单细胞转录状态 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 25 | 2026-07-12 |
Generation of tetraploid organs in mice
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究结合CRISPR/Cas9、Cre-LoxP系统和囊胚互补技术,成功生成小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 首次利用四倍体胚胎干细胞(4-ESCs)通过囊胚互补在哺乳动物体内生成功能完整的四倍体器官,并系统分析了四倍体对发育轨迹的影响 | 四倍体器官的质量和体积显著低于二倍体对照,且四倍体对发育程序的改变可能影响器官功能 | 探索基于四倍体胚胎干细胞的囊胚互补技术用于器官再生的可行性 | 小鼠四倍体肝脏、心脏和胰腺组织 | 数字病理学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期E18.5的小鼠组织样本,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-07-12 |
Single-cell atlas of Exopalaemon carinicauda gills provides insights into pillar cell-mediated responses to low-salinity stress in crustaceans
2026-Mar-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和超微结构表征,定义了对虾鳃中支柱细胞介导的低盐胁迫反应的细胞机制 | 首次整合超微结构表征与单细胞RNA测序,揭示支柱细胞在低盐胁迫下的形态重塑、离子细胞谱系分化和酸性-碱平衡调节机制 | 未涉及其他组织或长期适应过程;单细胞数据可能受限于样本量和测序深度 | 阐明甲壳动物鳃对低盐胁迫适应的细胞机制,特别是支柱细胞的功能角色 | Exopalaemon carinicauda(脊尾白虾)鳃组织 | 单细胞转录组学 | 甲壳动物生理应激 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 11个转录组不同的细胞群,包括支柱细胞和间隔细胞等 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 27 | 2026-07-12 |
Alk-Fam150b (augmentor α) expression in the paraventricular nucleus of the mouse hypothalamus at molecular resolution, and its sensitivity to acute stress
2026-Mar, Journal of neuroendocrinology
IF:3.3Q2
DOI:10.1111/jne.70159
PMID:41856795
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多重原位杂交,在小鼠下丘脑室旁核中解析了Alk-Fam150b(augmentor α)的分子表达,并揭示了其对应激的敏感性 | 首次在分子水平上证明Fam150b和Alk在小鼠下丘脑室旁核中共同表达,包括促肾上腺皮质激素释放激素神经元,并发现CRH神经元以互斥方式表达Fam150b或Scgn,以及应激诱导的Fam150b表达上调受糖皮质激素反馈调控 | 未明确Fam150b和Alk在室旁核中的功能作用,以及augmentor α-ALK信号在摄食和体重控制应激诱导变化中的具体机制 | 研究Alk-Fam150b(augmentor α)在小鼠下丘脑室旁核中的表达及其对应激的敏感性 | 成年小鼠下丘脑室旁核中的神经元,特别是促肾上腺皮质激素释放激素神经元 | 分子生物学 | 应激相关疾病 | 单细胞RNA测序, 多重原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间表达数据 | 小鼠样品(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 28 | 2026-07-12 |
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70817
PMID:41857481
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research paper | 本文研究了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的抑癌作用及其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用机制 | 首次揭示PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A进而调控PI3K/Akt信号通路促进垂体肿瘤发生的分子机制 | NA | 探究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及其分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)样本及细胞系 | machine learning | pituitary neuroendocrine tumors(垂体神经内分泌肿瘤) | single-cell sequencing(单细胞测序),免疫荧光染色 | NA | gene expression data(基因表达数据) | 62例PitNETs患者样本 | NA | single-cell RNA-seq(单细胞RNA测序) | NA | NA |
| 29 | 2026-07-12 |
Prior-guided factorization for reliable imputation of scRNA-seq data
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014051
PMID:41860953
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研究论文 | 提出一种基于先验知识引导的因子分解方法用于单细胞RNA测序数据的可靠填补 | 提出scZN框架,将数据观测建模为RNA两态转录过程与dropout的联合作用,利用非负矩阵分解、先验知识约束和多重正则化,实现可解释的缺失值填补和表达重建 | 论文未明确提及局限性 | 解决scRNA-seq数据中dropout噪声与生物真实零表达的区分问题,提升数据填补的准确性和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | 多个真实数据集,包括胚胎干细胞、小鼠齿状回和海马体数据,以及阿尔茨海默病数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 30 | 2026-07-10 |
CPNE1: A novel therapeutic target for myopia progression - from genetic GWAS discovery to functional validation in vitro and vivo
2026-Mar-26, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08050-z
PMID:41888893
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研究论文 | 通过遗传GWAS发现与功能验证,揭示CPNE1在近视进展中的新型治疗靶点作用 | 首次通过GWAS荟萃分析与SMR方法确定CPNE1为近视相关基因,并在体外和体内实验验证其通过调控巩膜重塑抑制眼轴伸长,提出了CPNE1作为近视治疗新靶点的创新观点 | 未提及具体局限性,但可能包括样本量限制或动物模型与人类疾病的差异 | 识别与近视相关的关键调控基因并验证CPNE1的治疗潜力 | 近视患者眼组织样本、透镜诱导近视(LIM)小鼠模型、巩膜成纤维细胞 | 基因组学 | 近视 | 全基因组关联研究(GWAS)、孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、腺相关病毒(AAV)介导的基因过表达 | LASSO回归,SMR,贝叶斯共定位分析 | 基因组数据、转录组数据、单细胞RNA数据 | 41,468例近视病例与817,202例对照(来自两个大规模GWAS) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 31 | 2026-07-10 |
Peripheral monocyte ratio as a predictive biomarker for metastasis-directed therapy in prostate cancer: insights from an exploratory study
2026-Mar-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15854-1
PMID:41888707
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研究论文 | 探索性研究发现外周血单核细胞比例可作为前列腺癌转移导向治疗的预测性生物标志物 | 首次提出外周血CD14高表达(经典)与CD14低表达(非经典)单核细胞比例可作为寡转移前列腺癌患者接受转移导向治疗(MDT)前的预测性生物标志物,并发现该比例与生化完全缓解和生化无进展显著相关 | 初步研究结果,样本量较小(26例),需进一步验证;单细胞RNA测序仅针对前列腺癌转移灶,未包含原发灶数据 | 探索寡转移前列腺癌患者在接受转移导向治疗(SBRT联合间歇性雄激素剥夺治疗)前的外周血单核细胞比例能否作为预测疗效的生物标志物 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 外周血单核细胞数据、单细胞转录组数据 | 26例激素敏感性寡转移前列腺癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于分析前列腺癌转移灶 |
| 32 | 2026-07-10 |
Multi-omics integration reveals ANXA6-high γδ T cell-endothelial communication as a potential link between periodontitis and MASLD
2026-03-25, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00690-7
PMID:41876560
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研究论文 | 通过多组学整合策略揭示ANXA6-high γδ T细胞与内皮细胞通讯是牙周炎与代谢功能障碍相关脂肪性肝病共病的潜在联系 | 首次通过整合多组学数据发现ANXA6-high γδ T细胞-内皮细胞通讯作为牙周炎与MASLD共病的共享免疫特征,并鉴定ANXA6为关键跨疾病候选基因 | NA | 探究牙周炎与MASLD共病的分子基础,揭示共享的免疫特征和潜在治疗靶点 | 牙周炎和MASLD患者样本 | 机器学习和数字病理 | 牙周炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq、空间转录组学、单细胞测序、机器学习 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-07-10 |
Pseudomonas plecoglossicida disrupts intestinal homeostasis through manipulation of palmitoleic acid microbial metabolism
2026-03-24, NPJ biofilms and microbiomes
IF:7.8Q1
DOI:10.1038/s41522-026-00963-3
PMID:41876561
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序、16S rDNA测序和代谢组学技术,揭示了非肠道病原菌斜生假单胞菌通过消耗棕榈油酸破坏斜带石斑鱼肠道稳态并导致厌食的机制 | 首次发现非肠道病原菌通过操纵宿主肠道微生物代谢产物(棕榈油酸)而非传统细胞因子途径诱导病理性厌食,并验证了外源棕榈油酸补充作为潜在治疗策略 | 未明确鉴定出与色氨酸衍生代谢物相关的关键细菌,且仅针对鱼类模型,未在哺乳动物中验证 | 探究非肠道病原菌感染如何通过肠道微生物和代谢稳态失调引起鱼类病理性厌食 | 斜带石斑鱼感染斜生假单胞菌模型 | 微生物组学 | 感染性疾病 | 单细胞测序, 16S rDNA测序, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 微生物组成数据, 代谢物数据 | 感染斜生假单胞菌的斜带石斑鱼肠道样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 16S rRNA测序 | NA | NA |
| 34 | 2026-07-10 |
Identification of Smmhc-expressing mesenchymal cells in orofacial bone at single-cell resolution
2026-03-23, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-026-00518-4
PMID:41866504
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定口颌骨中表达Smmhc的间充质细胞 | 发现了一个此前未被识别的口颌骨间充质干细胞亚群Smmhc MSCs,并通过谱系示踪证明了其多能性和在颅面骨稳态中的关键作用 | 未明确说明,但基于摘要推断可能包括研究仅在小鼠模型中进行,结果向人类转化的有效性需进一步验证 | 阐明口颌骨间充质干细胞的异质性并鉴定关键亚群 | 小鼠口颌骨来源的间充质干细胞/基质细胞 | 数字病理学 | 颅面骨发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠口颌骨组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 35 | 2026-07-10 |
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-03-13, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00681-8
PMID:41826372
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研究论文 | 本研究通过整合基因与轻度创伤性脑损伤的交互作用全基因组关联研究和单细胞RNA测序基因调控网络,揭示神经元和胶质细胞网络如何影响儿童青少年创伤性脑损伤后的认知功能 | 首次将全基因组关联研究中的基因-创伤性脑损伤交互作用与单细胞RNA测序的基因调控网络相结合,在细胞类型和脑区层面揭示轻度创伤性脑损伤影响神经认知的分子机制 | 未明确提及研究局限性 | 阐明轻度创伤性脑损伤影响神经认知的细胞类型特异性关键调控因子和分子机制 | 来自青少年脑认知发展队列的儿童青少年及其学习记忆相关的神经认知表现 | 机器学习 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究 | 多基因风险评分模型 | 基因表达数据, 神经认知数据 | 基于青少年脑认知发展队列数据,具体样本量未明确说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序基因调控网络分析 |
| 36 | 2026-07-10 |
A Chromosome-level Assembly and Functional Genomic Resources for the Model Annelid Capitella teleta
2026-Mar-02, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evag041
PMID:41732109
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研究论文 | 通过整合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获技术,构建了环节动物模式物种Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组参考组装,并提供了功能基因组资源 | 首次实现环节动物模式物种的染色体水平基因组组装,揭示了核基因组与线粒体基因组之间高度重排的进化模式,以及基因家族库与染色体进化之间的解耦现象 | 未提及具体局限性,但可能受限于实验室品系的遗传多样性代表性不足 | 提供环节动物模式物种C. teleta的最新基因组资源和功能基因组工具,推动进化发育生物学和比较基因组学研究 | 实验室品系的环节动物Capitella teleta | 基因组学 | NA | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | 基因组序列, 染色质构象, 转录组, 开放染色质, DNA甲基化 | 单个实验室品系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | NA |
| 37 | 2026-07-09 |
Insights into tick-pathogen interactions - a single cell RNA sequencing approach of transcriptional changes during ehrlichial infection
2026-Mar-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.19.712879
PMID:41889848
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示蝉细胞对艾希体感染的转录动态变化 | 首次利用单细胞RNA测序解析ISE6蝉细胞系的异质性及其在艾希体感染过程中的时间依赖性转录变化 | 未说明具体局限性 | 探究蝉细胞系对艾希体感染的转录响应机制 | ISE6蝉胚胎细胞系及其感染艾希体后的转录谱 | 机器学习和单细胞转录组学 | 蜱传疾病(艾希体病) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序分析(具体样本数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3’测序平台 |
| 38 | 2026-07-09 |
Distinct spatial patterning and transcriptomic landscapes of human neural organoids by localized delivery of morphogens
2026-Mar-05, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.01.008
PMID:41734763
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可在无Matrigel条件下产生稳定的空间形态发生素梯度,用于人神经类器官的模式化 | 首次报道一种无Matrigel、基于被动扩散的形态发生素梯度生成器(PdMG),可稳定建立陡峭的外源空间形态发生素梯度,实现人神经类器官的稳健区域化 | 当前技术难以在神经类器官中生成稳定、界限明确的梯度以实现稳健区域化 | 研究人类大脑区域化过程中单个形态发生素的作用,并建立模拟空间-时间形态发生素动态的类器官模型 | 人神经类器官 | 机器学习, 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人神经类器官(具体样本量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 39 | 2026-07-09 |
BiGCN Learns B Cell Functional States by Integrating Single-Cell Transcriptomes and BCR Repertoires
2026-Mar, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202501919
PMID:41725270
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研究论文 | 提出BiGCN方法,通过整合单细胞转录组和BCR库数据,学习B细胞功能状态 | 首次在单细胞分辨率下显式整合转录组和BCR数据,利用图卷积网络框架统一嵌入,高保真表征B细胞状态和克隆关系 | NA | 开发能够整合单细胞转录组和BCR库数据的方法,以揭示B细胞的功能多样性 | B细胞 | 机器学习 | 感染性疾病, 自身免疫病, 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | 图卷积网络 | 转录组数据, BCR序列数据 | 涵盖感染性疾病、自身免疫病和泛癌图谱的多组配对单细胞RNA测序和单细胞BCR测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-07-09 |
Single-cell transcriptomics reveals phenotypic and functional alterations of erythroid progenitor cells in tuberculosis patients
2026-Mar, Tuberculosis (Edinburgh, Scotland)
DOI:10.1016/j.tube.2026.102746
PMID:41734583
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研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示结核病患者红细胞祖细胞的表型和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了结核病不同阶段(潜伏感染、活动性、播散性)及肺组织中红细胞祖细胞的异质性,发现了疾病特异性亚群及其代谢重编程,并建立了基于EPC标志基因的潜伏结核预测模型 | NA | 探究结核病对红细胞祖细胞动态变化的影响及其与免疫细胞的双向调控机制 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核患者的外周血单个核细胞,以及结核肺组织和邻近未受累区域 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康对照、潜伏结核、结核病和播散性结核队列的外周血样本以及结核肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |