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当前共找到 1054 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2026-06-13 |
ANKRD1 sustains a neurogenic BMSC niche and counters cognitive aging
2026-Mar-01, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-026-00428-5
PMID:41764190
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示了ANKRD1在维持神经源性骨髓间充质干细胞龛及对抗认知衰老中的关键作用 | 首次发现ANKRD1作为维持神经源性龛的关键调控因子，并通过结合超级增强子维持染色质开放性，且通过神经元靶向递送可挽救衰老小鼠的空间记忆缺陷 | 未提及 | 阐明颅颌面骨髓间充质干细胞中神经源性潜能维持的机制及其对认知衰老的影响 | 颅颌面骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其神经源干细胞龛 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 未提及具体样本量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | NA |
| 362 | 2026-06-13 |
Integrating feature selection with unsupervised deep embedding for clustering single-cell RNA-seq data
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag082
PMID:41766647
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研究论文 | 提出一个统一框架FSSC，将特征选择与无监督深度嵌入整合，用于单细胞RNA-seq数据的聚类 | 首次在单细胞RNA-seq聚类中联合优化特征选择与聚类损失，利用零膨胀负二项自编码器和组Lasso惩罚同步学习低维表示并选择判别性基因集 | 未提及计算复杂度或对大规模数据集的扩展性，可能依赖于模拟与真实数据集的验证范围 | 解决单细胞RNA-seq数据聚类中特征选择与聚类分离导致的次优问题，实现联合优化以提高聚类准确性和基因选择生物学意义 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达特征和细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 零膨胀负二项自编码器 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2026-06-13 |
Exploring the phthalates-induced neurotoxicity mechanisms of neurodegenerative diseases via network toxicology, single-cell transcriptomics and molecular dynamic simulation
2026-Mar-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119954
PMID:41780475
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研究论文 | 通过网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟，探索邻苯二甲酸酯引起神经退行性疾病的神经毒性机制 | 首次结合网络毒理学、单细胞转录组学和分子动力学模拟，系统揭示邻苯二甲酸酯通过BCL2和星形胶质细胞表型转换诱发神经退行性疾病的机制 | 邻苯二甲酸酯与神经退行性疾病关联的临床样本数据有限，且主要基于帕金森病患者组织样本 | 探索邻苯二甲酸酯暴露与神经退行性疾病之间的潜在机制 | 邻苯二甲酸酯（特别是DEHP和DiBP）及其对血脑屏障、星形胶质细胞和神经退行性疾病的影响 | 机器学习 | 帕金森病、路易体病、阿尔茨海默病 | 网络毒理学、单细胞转录组学、分子动力学模拟、分子对接 | 诊断模型 | 单细胞转录组数据 | 帕金森病患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2026-06-13 |
Developing a Metabolic-Associated Prognostic Index for Risk Stratification and Therapeutic Guidance in Stage I Lung Adenocarcinoma via Multiomics Analysis
2026-Mar, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-00897
PMID:41771017
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研究论文 | 通过多组学分析开发代谢相关预后指数，用于I期肺腺癌的风险分层和治疗指导 | 首次系统性地将代谢重编程与I期肺腺癌的预后关联，利用机器学习组合方法开发了代谢相关预后指数（MAPI），并在单细胞水平验证了其与恶性进展的关联 | 研究主要依赖公开数据库中的回顾性数据，且MAPI的临床应用尚需前瞻性队列验证 | 开发一个生物学可解释且临床适用的代谢相关预后指数，用于I期肺腺癌的风险分层和精准治疗决策 | I期肺腺癌肿瘤样本及临床数据 | 机器学习, 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 差异表达分析 | 机器学习组合模型 | 基因表达数据, 临床数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA、GEO和EGA数据库的I期肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 365 | 2026-06-11 |
COL8A1-positive cancer-associated fibroblasts are drivers of 5-fluorouracil resistance in colorectal cancer
2026-Mar-05, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02306-1
PMID:41784732
|
研究论文 | 发现COL8A1阳性癌症相关成纤维细胞驱动结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药性 | 首次鉴定COL8A1阳性成纤维细胞亚群通过COL8A1/ITGB1介导的上皮间质转化轴驱动5-FU耐药 | 多组学分析依赖公开数据，功能验证主要在体外和异种移植模型中进行 | 探究癌症相关成纤维细胞在结直肠癌5-FU耐药中的功能和作用机制 | 结直肠癌患者队列数据、肿瘤细胞和成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、siRNA干扰、异种移植、免疫化学分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、细胞实验数据 | 24个结直肠癌队列的多组学数据 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序，Illumina NovaSeq批量测序 |
| 366 | 2026-06-11 |
Deep learning linking mechanistic models to single-cell transcriptomics data reveals transcriptional bursting in response to DNA damage
2026-Mar-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.100623
PMID:41779826
|
研究论文 | 提出DeepTX框架，利用深度学习将机制模型与单细胞转录组数据连接，揭示DNA损伤反应中的转录爆发动力学 | 首次将深度学习方法与机制模型结合，实现从单细胞RNA测序数据中快速准确推断全基因组转录爆发动力学，并揭示不同DNA损伤药物诱导的转录爆发波动与细胞命运决定的关联 | 未提及具体局限性 | 揭示全基因组范围内转录爆发如何响应DNA损伤，并理解其与细胞命运决定的关系 | 小鼠胚胎干细胞和人结肠癌细胞中的DNA损伤药物处理数据 | 机器学习, 计算生物学 | 癌症 | scRNA-seq | 深度学习（DeepTX框架，可能包含神经网络） | 单细胞转录组数据 | 多个DNA损伤药物处理数据集（具体数量未明确给定） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2026-06-11 |
Multi-omics analysis of NEDD1 in hepatocellular carcinoma: biological function, prognostic value, and clinical significance
2026-Mar-03, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-42505-z
PMID:41775913
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示NEDD1在肝细胞癌中的生物学功能、预后价值和临床意义 | 首次利用单细胞及空间转录组学数据揭示NEDD1-MZT2B功能模块在肿瘤细胞及免疫抑制性巨噬细胞中的细胞环境依赖性异质性 | 多组学分析主要基于公共数据库，临床样本量有限，且NEDD1-MZT2B模块的功能机制仍需进一步验证 | 探索NEDD1在肝细胞癌中的致癌作用、调控机制及肿瘤微环境相互作用 | 肝细胞癌患者组织样本、HCC细胞系及皮下移植瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | NGS, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 表达数据, 表观遗传学数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | TCGA、GEO公共数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞数据集GSE140228, 空间转录组数据集HRA000437 |
| 368 | 2026-06-11 |
HIV-seq reveals gene expression differences between HIV-transcribing cells from viremic and suppressed people with HIV
2026-Mar-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68797-3
PMID:41776157
|
研究论文 | 通过HIV-seq方法，揭示病毒血症和ART抑制状态下HIV感染者中转录HIV基因的细胞的基因表达差异 | 开发了一种名为HIV-seq的新方法，通过在单细胞RNA-seq中引入针对HIV保守区域的捕获序列，显著提高了对低丰度HIV转录本的检测效率 | 未在摘要中明确说明局限性 | 研究ART抑制期间HIV转录细胞的持久性机制及其基因表达特征 | HIV感染者中的HIV转录细胞 | 单细胞转录组学 | HIV感染 | scRNA-seq（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | HIV-seq方法自定义捕获序列 |
| 369 | 2026-06-11 |
Microglial CR3-mediated synaptic pruning in the dmPFC promotes the generation and maintenance of chronic muscle pain via glutamatergic dysfunction
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-026-01666-7
PMID:41765955
|
研究论文 | 该论文通过多种技术手段揭示了慢性肌肉痛大鼠背内侧前额叶皮质中小胶质细胞CR3介导的突触修剪通过谷氨酸能功能障碍促进疼痛的产生和维持 | 首次阐明小胶质细胞CR3依赖的突触修剪抑制谷氨酸能神经元兴奋性和突触可塑性在慢性肌肉痛产生和维持中的关键作用，揭示了小胶质细胞-神经元相互作用新机制 | 研究主要基于大鼠模型，结果向人类转化可能需要进一步验证 | 探究慢性肌肉痛产生和维持的复杂机制 | 慢性肌肉痛大鼠模型 | 神经科学 | 慢性肌肉痛 | 纤维光度法、膜片钳、场电位记录、光遗传化学遗传激活、单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | NA | 电生理数据、基因表达数据、荧光成像数据 | 慢性肌肉痛大鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2026-06-11 |
Machine Learning Reveals the Association Between Gene Expression and Immune Infiltration in Colorectal Cancer: A Comprehensive Study From Single-Cell to Survival Analysis
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71049
PMID:41772406
|
研究论文 | 利用机器学习分析单细胞RNA测序数据，揭示结直肠癌中基因表达与免疫浸润的关联，并识别新型分子亚型和生物标志物 | 首次将机器学习应用于单细胞RNA测序分析，以解析结直肠癌中基因表达谱与免疫细胞浸润之间的复杂相互作用，并识别出两个具有不同预后效果的新型分子亚型以及CD19、MAP2、CALB2和TGFB2作为关键免疫调节生物标志物 | 未提及 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中基因表达与免疫细胞浸润的分子机制，并开发预测性模型以指导临床治疗决策 | 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、CIBERSORT、ESTIMATE、UMAP、t-SNE | 机器学习模型（含无监督聚类、生存分析、基因集富集分析） | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 371 | 2026-06-11 |
Immune Microenvironment Dynamics and Therapeutic Targets in GIST Revealed by Multi-Omics and Functional Validation
2026-Mar, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71069
PMID:41772383
|
研究论文 | 通过多组学分析和功能验证，揭示胃肠道间质瘤免疫微环境动态变化及潜在治疗靶点 | 首次结合孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序和功能实验，系统鉴定出MYBL1和AIF1L作为调节CD8 T细胞功能和PD-1应答的关键介质 | 未提及具体局限性信息 | 阐明胃肠道间质瘤免疫微环境的因果机制及识别治疗靶点 | 胃肠道间质瘤患者肿瘤组织、细胞系（GIST-882）及CD8 T细胞 | 机器学习 | 胃肠道间质瘤 | 孟德尔随机化分析、单细胞RNA测序、批量RNA测序、细胞共培养模型、功能实验（增殖、迁移、侵袭和蛋白摄取追踪） | NA | 基因表达数据、免疫细胞表型数据、血浆代谢物数据 | 731种免疫细胞表型（孟德尔随机化分析）及多个肿瘤样本（scRNA-seq和bulk RNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2026-06-11 |
Dendritic Cell-Associated MARCKSL1 Regulates Fibroblast Differentiation During Wound Healing
2026 Mar-Apr, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70143
PMID:41782175
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠疤痕组织，发现树突状细胞中的MARCKSL1调节成纤维细胞分化，影响伤口愈合中的疤痕形成 | 首次揭示树突状细胞中的MARCKSL1基因在伤口愈合过程中调控成纤维细胞分化及其在疤痕形成中的关键作用 | 主要基于小鼠模型，人类伤口愈合中的机制有待验证；MARCKSL1抑制剂的安全性和长期效果尚未明确 | 阐明树突状细胞相关MARCKSL1在伤口愈合中调控成纤维细胞分化的机制，探索疤痕预防的新治疗途径 | 成年小鼠疤痕组织 和 小鼠胎儿伤口愈合模型中的树突状细胞和成纤维细胞 | 机器学习和数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），shRNA转导 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠疤痕组织（具体数目未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 373 | 2026-06-11 |
The Immune Cell Atlas of "Longevity Molecular Tag": Identification of Principal Immune Cell Subsets and Their Underlying Molecular Regulatory Mechanisms
2026-Mar, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70431
PMID:41784043
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序数据，识别与长寿表型相关的免疫细胞亚群，并揭示其分子调控机制 | 整合全生命周期单细胞数据与超长寿人群转录组数据，利用Scissor算法构建“长寿分子标签”免疫细胞图谱，发现NK细胞、CD8 T细胞和γδ T细胞等细胞毒性免疫细胞与长寿正相关，而CD4 T细胞、B细胞和树突状细胞与炎症信号通路相关 | NA | 揭示长寿人群中免疫细胞亚群及其分子调控机制，探索免疫衰老调节策略 | 东亚人群全生命周期的单细胞RNA测序数据和广西百岁老人队列的批量转录组数据 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | Scissor算法 | 基因表达数据 | 东亚人群全生命周期样本及广西百岁老人队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2026-06-10 |
Intracellular bacteria modulate the immune microenvironment of oral squamous cell carcinoma
2026-Mar-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117019
PMID:41722049
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研究论文 | 利用INVADEseq技术揭示细胞内细菌如何调节口腔鳞状细胞癌的免疫微环境，影响新辅助免疫检查点阻断疗法的效果 | 首次应用INVADEseq技术同时捕获宿主单细胞RNA测序数据和细菌特征，揭示细胞内细菌通过多种机制影响免疫检查点阻断疗法的疗效 | 未明确说明局限性，但研究中提及细胞内细菌可能降低治疗效果的机制仍需进一步验证 | 探索细胞内细菌在口腔鳞状细胞癌微环境中调节免疫功能的机制，特别是对新辅助免疫检查点阻断疗法的影响 | 口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | INVADEseq、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、细菌特征数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | INVADEseq技术基于10x Chromium平台进行单细胞RNA测序及细菌特征捕获 |
| 375 | 2026-06-10 |
Single-cell profiling of the subgingival bacteria reveals transcriptional heterogeneity and niche-specific programs
2026-Mar-11, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2026.01.017
PMID:41720093
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序框架分析龈下细菌异质性和生态位特异性程序，揭示牙周炎发病机制 | 首次在单细胞分辨率下分析龈下细菌的转录异质性，构建了包含285个物种、133,458个细胞的图谱，并鉴定出与疾病相关的功能亚群 | 未提及方法局限性，但可能存在低微生物量和宿主污染的技术挑战 | 探索健康与牙周炎状态下龈下细菌的功能异质性和生态位特异性程序 | 龈下细菌群落 | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16个龈下样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 376 | 2026-06-10 |
Nuclear condensates of BZU2/ZmMUTE modulate transcription to realize structural heterogeneity of the maize stomatal complex
2026-Mar-03, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koag040
PMID:41718014
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研究论文 | 本文揭示了玉米BZU2/ZmMUTE核凝聚体通过液-液相分离调控气孔复合体细胞异质性的机制 | 首次发现转录因子ZmMUTE通过液-液相分离形成核凝聚体，调控玉米四细胞气孔复合体的功能与空间异质性，并揭示其内在无序区IDR4在DNA结合、靶基因激活及细胞间移动中的多重作用 | 未明确说明具体局限性 | 探究转录因子ZmMUTE在玉米气孔发育中如何通过动态活性实现细胞命运决定的结构异质性 | 玉米四细胞气孔复合体及其发育过程中的细胞类型异质性 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 玉米样本的基因型和单细胞RNA-seq分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于细胞类型特异性转录程序分析 |
| 377 | 2026-06-09 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 | 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联，提出免疫治疗潜力 | 样本量较小（94例），且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 | 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征，为潜在治疗策略提供依据 | 激素受体阳性（HR+）和阴性（HR-）乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 靶向基因表达谱分析（AmoyDx Master Panel），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 94例乳腺癌患者（53例HR+，41例HR-） | AmoyDx | 靶向基因表达谱分析，单细胞RNA测序 | AmoyDx Master Panel | NA |
| 378 | 2026-06-08 |
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD25178
PMID:41630526
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研究论文 | 通过基因敲除小鼠模型研究了FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的作用 | 首次系统评估了睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在哺乳动物中的保守性及其对雄性生育功能的影响 | 仅在特定实验条件下评估了基因功能，未考虑其他生理过程或疾病状态下的潜在作用 | 探究睾丸富集基因FAM216A和CCDC166在雄性生育力中的功能及潜在冗余机制 | FAM216A和CCDC166基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | NA | 基因敲除、单细胞转录组测序、RT-PCR、组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 基因敲除小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 379 | 2026-06-08 |
Identification of a potential relationship between pigmented villonodular synovitis and atherosclerosis using comprehensive bioinformatics analyses
2026-Mar, Biomarkers : biochemical indicators of exposure, response, and susceptibility to chemicals
IF:2.0Q4
DOI:10.1080/1354750X.2026.2625237
PMID:41630435
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研究论文 | 通过综合生物信息学分析，探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎与动脉粥样硬化之间的潜在关系 | 首次利用生物信息学方法结合公共数据库，系统性地揭示了PVNS与AS之间的共享基因和免疫机制，并识别出CSF2RB作为关键诊断和治疗靶点 | 研究基于公共数据集，样本量有限，且缺乏独立的队列验证；机制分析依赖于生物信息学预测，需进一步实验验证 | 探究色素沉着绒毛结节性滑膜炎的发病机制及其与动脉粥样硬化的潜在关联 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化患者 | 生物信息学 | 色素沉着绒毛结节性滑膜炎和动脉粥样硬化 | 生物信息学分析、免疫组织化学、单细胞RNA-seq | 机器学习 | 基因表达数据（微阵列和scRNA-seq） | 基于多个公共数据集（GSE3698、GSE28829、GSE100927、GSE155527），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 380 | 2026-06-08 |
WDR72 Is Required for Urinary Acidification and Normal H+-ATPase Activity in Intercalated Cells in Mice
2026-Mar, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70165
PMID:41636123
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研究论文 | 本研究探讨WDR72在肾脏酸化过程中的作用及其对H+-ATP酶活性的调控机制 | 首次发现WDR72是A型插入细胞依赖性尿液酸化的关键调控因子，并揭示了性别特异性代谢表型的新机制 | 未阐明WDR72调控H+-ATP酶活性的具体分子机制，且仅在小鼠模型中验证 | 研究WDR72在肾脏酸碱平衡中的作用及其表达定位 | 人类和小鼠肾脏组织、Wdr72基因敲除小鼠 | 机器学习 | 远端肾小管酸中毒 | 单细胞转录组测序、免疫组化、微灌注 | NA | 基因表达数据、蛋白定位数据 | 人肾组织样本（数量未说明）、小鼠（雌雄各若干） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据分析人类和鼠类肾脏细胞的WDR72表达 |