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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 341 | 2026-05-19 |
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250250
PMID:40685857
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析急性期发热伴血小板减少综合征患者外周血单个核细胞中淋巴细胞的异质性,并探究糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 | 首次在单细胞水平揭示急性期SFTS患者淋巴细胞的异质性及糖皮质激素治疗的免疫调控作用,为优化临床用药提供新见解 | 样本量较小(3名健康志愿者和13名患者),且仅关注急性期,缺乏纵向动态监测 | 探究急性期SFTS中淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴细胞的影响 | 急性期SFTS患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3名健康志愿者和13名急性期SFTS患者,共120886个淋巴细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒进行单细胞捕获及mRNA 3'端转录本测序 |
| 342 | 2026-05-19 |
Oligodendrocyte Precursor Cells Shape Retinogeniculate Refinement Via a CHD8-Dependent Phagocytic Pathway
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.3.64
PMID:41914968
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研究论文 | 本研究揭示了少突胶质前体细胞通过CHD8依赖性吞噬途径在视觉发育关键期内修剪多余突触的机制 | 首次发现少突胶质前体细胞是视觉发育关键期的主要突触吞噬细胞,并揭示CHD8作为上游调控因子直接促进吞噬相关基因表达 | 未提及具体局限性 | 鉴定视觉发育关键期内主要胶质吞噬细胞及其调控机制,并探讨与自闭症病理的关联 | 小鼠背外侧膝状体中的少突胶质前体细胞及突触修剪过程 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞测序, 三维成像, 条件性基因敲除, 体内电生理评估 | NA | 图像, 转录组数据 | 小鼠模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 343 | 2026-05-18 |
Dynamics of phage-host interactions in Bacteroides fragilis resolved by single-cell transcriptomics
2026-Mar-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70381-8
PMID:41839859
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研究论文 | 利用细菌单细胞RNA测序技术解析了脆弱拟杆菌与烈性噬菌体相互作用的动态过程 | 首次将细菌单细胞转录组学应用于噬菌体-宿主互作研究,从单细胞分辨率揭示了感染的非同步性进程及未感染表型亚群的分子机制 | 未提供具体方法的可扩展性讨论及其他宿主-噬菌体系统的验证 | 探究噬菌体感染过程中细菌群体的异质性及防御机制 | 人源共生菌脆弱拟杆菌及其烈性噬菌体 | 微生物组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 约50,000个细菌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 344 | 2026-05-16 |
Spatially defined danger zone shapes gastric cancer progression through CCDC80+ fibroblast-induced CD8+ T cell dysfunction
2026-03-07, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-026-02287-1
PMID:41793512
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研究论文 | 通过空间转录组学鉴定胃癌进展中的“危险区域”,揭示CCDC80+成纤维细胞驱动的CD8+ T细胞功能障碍机制 | 首次定义并表征胃癌中的“危险区域”空间结构,结合非负矩阵分解和XGBoost模型进行亚型分类和预后预测,并利用LightGBM模型直接从H&E切片预测危险区域评分 | 未明确提及,但可能包括样本量有限、机制验证依赖体外共培养体系、模型泛化性需进一步验证 | 探究胃癌肿瘤微环境的空间异质性及其对免疫治疗反应和预后的影响机制 | 侵袭性小鼠肿瘤和人类胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学 | XGBoost, LightGBM, 非负矩阵分解 | 空间转录组数据、H&E染色图像 | 小鼠肿瘤样本和人类胃癌样本(具体数量未在摘要中明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 345 | 2026-05-17 |
RNF128 aggravates metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease progression via stabilization of SCD1
2026-Mar-30, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001757
PMID:41911552
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研究论文 | 本研究揭示了RNF128通过稳定SCD1加重代谢功能障碍相关脂肪性肝病进展的机制 | 首次发现E3泛素连接酶RNF128通过催化SCD1的K63连接泛素化并阻断其自噬溶酶体降解,促进脂质积累,并验证了靶向RNF128的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类MASLD的异质性和复杂性可能限制其直接临床转化 | 阐明RNF128在MASLD进展中的功能及其分子机制,并评估其治疗靶点潜力 | 人类MASLD肝脏组织、饮食诱导的MASLD小鼠模型、肝细胞特异性RNF128敲除和过表达模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, 泛素组学分析 | NA | RNA序列数据, 蛋白质组学数据, 泛素组学数据 | 未明确说明具体样本量,涉及人类肝脏样本和小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 346 | 2026-05-17 |
KIF11 prevents retinal endothelial ferroptosis in familial exudative vitreoretinopathy by inhibiting phosphorylation-driven PRDX1 phase separation
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71009-7
PMID:41872221
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研究论文 | 通过bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,发现KIF11是家族性渗出性玻璃体视网膜病变中视网膜内皮细胞的关键下游效应因子,并通过抑制磷酸化驱动的PRDX1相分离来阻止铁死亡 | 首次揭示β-catenin/KIF11/PRDX1轴依赖的铁死亡机制在家族性渗出性玻璃体视网膜病变中的作用,并强调铁死亡靶向和抗氧化策略作为潜在疗法 | 未提及 | 探究家族性渗出性玻璃体视网膜病变的发病机制,特别是下游致病机制 | 视网膜内皮细胞和小鼠模型 | 数字病理学 | 家族性渗出性玻璃体视网膜病变 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠组织样本(具体数量未提及) | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 使用bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析视网膜内皮细胞 |
| 347 | 2026-05-17 |
Asymmetric histone inheritance regulates olfactory stem cell fates during regeneration
2026-Mar-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70987-y
PMID:41872193
|
研究论文 | 本文揭示了小鼠嗅觉上皮再生过程中水平基底细胞(HBCs)的不对称组蛋白遗传模式及其对干细胞命运和功能恢复的影响 | 首次在哺乳动物成体干细胞中证明组蛋白H4、H3和H3.3的不对称遗传,并揭示其通过p63转录因子调控细胞命运和神经组织再生的机制 | 未明确说明限制 | 探究嗅觉干细胞在再生过程中的组蛋白不对称遗传及其生物学意义 | 小鼠嗅觉上皮中的水平基底细胞(HBCs)及其子代细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠嗅觉上皮组织和培养的HBC子代细胞对 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 348 | 2026-05-17 |
Ganglioside-Mediated Neural-Acinar Crosstalk Facilitates Pancreatic Carcinogenesis via Metaplastic Niche Remodeling
2026-Mar-16, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2026.02.033
PMID:41850539
|
研究论文 | 本研究揭示了神经-腺泡细胞间通过神经节苷脂介导的相互作用在胰腺癌发生中的作用机制 | 首次阐明神经节苷脂GM3在腺泡-导管化生与神经重塑双向串扰中的关键作用,发现β-1,4-半乳糖基转移酶5在胰腺癌早期病变中的过表达及其作为治疗靶点的潜力 | 未提供具体局限性信息 | 系统研究胰腺导管腺癌发生过程中腺泡-导管化生与神经重塑之间的相互作用机制 | 小鼠ADM模型、胰腺上皮内瘤变病变、PDAC病变、小鼠及人类细胞系和组织标本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 质谱脂质组学分析、单细胞RNA测序、基因过表达/敲低、免疫组化、免疫印迹 | NA | 转录组数据、脂质组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 349 | 2026-05-17 |
Integrated multi-omics analysis reveals that MARCKS reprograms the immunosuppressive microenvironment to drive hepatocellular carcinoma progression
2026-Mar-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01372-7
PMID:41813922
|
科研论文 | 通过多组学综合分析揭示MARCKS在肝细胞癌中重编程免疫抑制微环境以驱动肿瘤进展的机制 | 首次整合批量转录组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统阐明MARCKS在肝细胞癌免疫微环境中的调控作用及其通过JAK/STAT3信号通路促进M2型巨噬细胞极化的新机制 | 主要依靠临床样本和细胞系实验,缺乏大规模前瞻性队列验证,MARCKS作为治疗靶点的体内药效学验证尚不充分 | 阐明MARCKS在肝细胞癌免疫抑制微环境中的作用机制及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌患者肿瘤组织样本和肝癌细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多免疫荧光 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 免疫荧光图像 | 多组肝细胞癌临床样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 350 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics of urothelial carcinoma with basal/squamous differentiation identifies Galectin-7 as a specific marker of squamous lineage commitment
2026-Mar-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04927-z
PMID:41917522
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 351 | 2026-05-16 |
Tumor-infiltrating immature innate lymphoid cells in colorectal cancer are biased toward ILC1/tissue-resident NK cell differentiation
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71085-9
PMID:41896575
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序等技术分析结直肠癌及腹膜转移患者的肿瘤浸润未成熟先天淋巴细胞偏向ILC1/组织驻留NK细胞分化的特征 | 首次揭示结直肠癌及腹膜转移肿瘤中未成熟先天淋巴细胞(nILC)转录组偏向分化为ILC1/组织驻留NK细胞,并通过共培养实验验证其分化能力 | 未明确说明研究的局限性 | 探究结直肠癌及腹膜转移中先天淋巴细胞的功能及其分化偏向 | 结直肠癌及腹膜转移患者的肿瘤样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、分化实验 | NA | 基因表达数据 | 11名患者用于单细胞RNA测序,8名用于流式细胞术,24名用于分化实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 352 | 2026-05-16 |
Fel d 1-Expressing Plant-Derived Bioparticle: A Novel Treatment for Cat Allergy
2026-Mar-19, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70280
PMID:41856757
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研究论文 | 本研究评估了一种由植物来源生物颗粒表达的Fel d 1过敏原(Fel d 1 eBP)对猫过敏的过敏原性和免疫原性 | 首次利用植物源生物颗粒表达猫主要过敏原Fel d 1,并证明其低过敏原性和诱导耐受的潜力,为猫过敏的过敏原免疫治疗提供了新候选方案 | 样本量较小(仅12名猫过敏者和12名非特应性对照),且为开放标签的0期研究,缺乏双盲对照和长期随访数据 | 探究Fel d 1 eBP的过敏原性和免疫调节特性,评估其作为猫过敏免疫治疗候选物的可行性 | 猫过敏受试者和非特应性对照者的T细胞、B细胞、嗜碱性粒细胞、单核细胞、幼稚B细胞和皮肤反应 | 数字病理学 | 猫过敏 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名猫过敏受试者和12名非特应性对照者的细胞样本,以及20名猫过敏个体的皮肤测试 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 353 | 2026-05-16 |
Müller glia-mediated regeneration restores neuronal diversity and retinal circuit organization in the adult zebrafish
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.15.711785
PMID:41889825
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研究论文 | 该研究通过诱导谱系追踪、单细胞RNA测序和形态学分析,发现成年斑马鱼中Müller胶质介导的再生能恢复神经元多样性和视网膜回路组织 | 首次在单细胞水平系统评估了成年斑马鱼Müller胶质介导的再生神经元与原生神经元的分子和结构相似性,揭示了损伤背景对再生神经元比例的影响 | 未详细说明再生神经元与原生神经元之间剩余差异的长期演变,且仅针对特定损伤模型(光照损伤和NMDA损伤) | 阐明Müller胶质来源的再生神经元能否恢复丢失神经元的身份、多样性和结构特征 | 成年斑马鱼视网膜中的Müller胶质及其再生神经元 | 再生神经科学 | 视网膜损伤 | 单细胞RNA测序、诱导谱系追踪、形态学分析 | NA | 单细胞转录组数据、形态学数据 | 成年斑马鱼视网膜样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 354 | 2026-05-16 |
Single-cell multi-omic analysis of mitochondrial mutational mosaicism and dynamics
2026-03-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70399-y
PMID:41839886
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研究论文 | 通过单细胞ATAC-seq和POLG敲入HEK293细胞系,引入scmtMPM和scwMSS两个指标,研究线粒体DNA突变嵌合体和动态变化 | 首次提出scmtMPM和scwMSS两种指标,实现单细胞层面线粒体DNA突变负荷和体细胞嵌合体的量化分析 | 研究主要基于细胞系和有限的人类样本,突变景观的临床应用需进一步验证 | 揭示单细胞水平线粒体DNA突变景观的异质性和动态变化 | 人类健康供体和线粒体疾病患者样本中的单个细胞 | 机器学习 | 线粒体疾病 | 单细胞ATAC-seq | NA | 测序数据 | 人类健康供体和线粒体疾病患者样本,具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 355 | 2026-05-16 |
ChatSpatial: Schema-Enforced Agentic Orchestration for Reproducible and Cross-Platform Spatial Transcriptomics
2026-Mar-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.26.708361
PMID:41890081
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研究论文 | ChatSpatial是一个基于大语言模型(LLM)的对话式分析平台,通过预验证工具模式(schema)整合60多种空间转录组分析方法,实现跨Python和R生态系统的可重复、跨平台分析 | 创新性地采用模式强制编排机制(Schema-Enforced Orchestration),由LLM从预验证的工具模式中选择而非生成自由代码,确保分析工作流的近确定性可重复性 | NA | 解决空间转录组数据分析中跨平台工具兼容性差、可重复性低的难题,构建统一的对话式分析工作流 | 空间转录组数据及其分析方法和工具 | 自然语言处理 | 卵巢癌,口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 大语言模型(LLM) | 文本(对话指令及分析结果) | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 356 | 2026-05-16 |
Selective B-cell subset depletion underlies increased infection risk in patients with MM treated with anti-BCMA vs anti-GPRC5D bsAbs
2026-Mar-05, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029572
PMID:41405507
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研究论文 | 探究抗BCMA与抗GPRC5D双特异性抗体在多发性骨髓瘤治疗中导致不同感染风险的选择性B细胞亚群耗竭机制 | 首次揭示抗BCMA双特异性抗体不仅耗竭浆细胞,还会从早期前B细胞阶段开始耗竭B细胞,而抗GPRC5D仅靶向浆细胞,为感染风险差异提供机制见解 | 需进一步验证MIcγ1小鼠模型作为阴性对照的结论在人类中的普适性,且临床感染风险与B细胞耗竭的直接因果关系未完全确立 | 阐明抗BCMA与抗GPRC5D双特异性抗体在多发性骨髓瘤患者中引起不同感染风险的机制 | 多发性骨髓瘤患者和健康供体的骨髓样本 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,新一代高通量流式细胞术 | NA | 基因表达数据,免疫表型数据 | 62例复发多发性骨髓瘤患者,31例用于流式细胞术,8例用于单细胞RNA测序,11例患者和8例健康供体用于初步单细胞RNA测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 357 | 2026-05-16 |
Optic Atrophy 1-Mediated Mitochondrial Hyperfusion Orchestrates Yes-Associated Protein 1 Nuclear Translocation to Sustain Ameloblastoma Stemness
2026-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.12.002
PMID:41478350
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研究论文 | 揭示了OPA1介导的线粒体过度融合通过YAP1核转位驱动成釉细胞瘤干性的机制 | 首次发现OPA1介导的线粒体过度融合通过抑制Hippo信号通路促进YAP1核转位,从而维持成釉细胞瘤干性,并提出OPA1作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 阐明成釉细胞瘤干性维持的分子机制及潜在治疗靶点 | 成釉细胞瘤组织样本、hTERT-AM细胞系、患者来源的类器官 | 数字病理学 | 成釉细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 原发性成釉细胞瘤标本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 358 | 2026-05-16 |
Targeting N-Cadherin and Tubulin α 1A in Neuroblastoma Bone Marrow Metastasis: Insights from Single-Cell Analysis and Drug Screening
2026-03, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.12.004
PMID:41485549
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析和药物筛选,揭示N-钙粘蛋白和微管蛋白α1A在神经母细胞瘤骨髓转移中的关键作用及潜在治疗靶点 | 首次结合单细胞转录组分析和孟德尔随机化方法,鉴定CDH2和TUBA1A为神经母细胞瘤骨髓转移的关键基因,并发现2,3-二甲氧基-1,4-萘醌通过下调其表达发挥抑制活性 | 研究中未提及样本规模及体内实验验证的局限性 | 探究神经母细胞瘤骨髓转移的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 有和无骨髓转移的神经母细胞瘤患者样本及细胞系 | 单细胞组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 359 | 2026-05-16 |
SAGE: Spatially Aware Gene Selection and Dual-View Embedding Fusion for Domain Identification in Spatial Transcriptomics
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202520333
PMID:41486374
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研究论文 | 提出SAGE框架,结合主题驱动基因选择与双视图嵌入融合,用于空间转录组数据中空间域的准确识别 | 首次将非负矩阵分解主题建模与分类器重要性评分结合进行基因选择,并通过共识精炼和对比图表示学习融合局部表达图与非局部主题驱动图 | 未提及具体局限性(从摘要中无法提取) | 提高空间转录组数据中空间域分割的准确性,并增强基因级别的可解释性 | 空间转录组数据中的组织切片空间域 | 数字病理学 | 乳腺癌、黑色素瘤 | 空间转录组学 | 非负矩阵分解、对比图表示学习 | 空间转录组数据 | 34个真实世界数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 360 | 2026-05-16 |
Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas
2026-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516965
PMID:41489092
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研究论文 | 通过空间分辨多组学揭示颅咽管瘤中代谢重塑和自噬激活的机制 | 首次整合单细胞空间转录组学和空间分辨代谢组学,揭示肿瘤上皮细胞亚群的空间分离与分子异质性,并发现“囊液-肿瘤细胞”和“胆碱/乙醇胺-PC/PE”代谢轴如何耦合自噬激活 | 未明确提及,但可能受限于样本量、平台分辨率或功能验证的深度 | 探究颅咽管瘤进展和复发的驱动因素 | 成釉细胞型颅咽管瘤组织及囊液样本 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞空间转录组学,空间分辨代谢组学,AFADESI-MSI,批量代谢组学,多免疫组化 | NA | 空间转录组数据,代谢组数据,组织图像 | 未明确说明具体数量,可能包括多例ACP组织样本 | NanoString, NA, NA | 单细胞空间转录组学, 空间分辨代谢组学 | CosMx SMI, AFADESI-MSI | CosMx SMI用于单细胞空间转录组分析,AFADESI-MSI用于空间分辨代谢组分析 |