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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2026-03-21 |
Identification of Cuproptosis-Associated Biomarker Candidates in Hypertrophic Cardiomyopathy via Machine Learning and Multi-Omics Integration
2026-Mar, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05533-5
PMID:41484731
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研究论文 | 本研究通过机器学习和多组学整合方法,识别了与肥厚型心肌病相关的铜死亡生物标志物候选基因 | 首次将铜死亡相关基因与肥厚型心肌病关联,并利用机器学习和多组学数据整合识别新的生物标志物候选基因 | 研究结果为关联性和假设生成性质,需要前瞻性临床评估和机制研究(如铜稳态扰动和基因操作)才能进行任何治疗推断 | 识别肥厚型心肌病的新型生物标志物候选物和治疗靶点 | 健康对照和肥厚型心肌病患者的RNA-seq数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 机器学习诊断模型 | RNA-seq数据 | 来自健康对照和HCM患者的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2026-03-21 |
Integrated Multi-Omics Analysis Reveals Cytokine Network Dynamics and Prognostic Signatures in Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma
2026-Mar, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05528-2
PMID:41484748
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了乙型肝炎病毒相关肝细胞癌中细胞因子网络的动态变化及其预后意义 | 整合了bulk RNA测序、单细胞RNA测序及功能验证,首次构建了基于细胞因子的LASSO风险模型,并揭示了细胞因子在肿瘤异质性和免疫抑制中的作用 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的全面验证,且样本来源和队列规模可能限制了模型的普适性 | 探究细胞因子在HBV-HCC中的预后价值及其驱动肿瘤进展的机制 | 乙型肝炎病毒相关肝细胞癌患者样本及体外细胞模型 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 血清学分析, 体外功能实验 | LASSO回归模型 | RNA测序数据, 单细胞转录组数据, 血清数据 | 未明确具体样本数量,但包含训练和验证队列的患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 323 | 2026-01-10 |
TEAD4 and RXRA Regulate the Function of Nucleus Pulposus Cells in Intervertebral Disc Degeneration Via the TNF-α/NF-κB Pathway: An Integrated Analysis of Single-Cell RNA-Seq, Bulk RNA-Seq, and In Vitro Validation
2026-Mar, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05534-4
PMID:41511606
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 324 | 2026-03-21 |
Silencing CCL5 suppresses ferroptosis to alleviate calcific aortic valve disease through chemokine pathway inhibition
2026-Mar, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了CCL5通过激活趋化因子信号通路诱导铁死亡,从而促进钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)进展的机制 | 首次阐明CCL5通过调控趋化因子信号通路和铁死亡在CAVD中的关键作用,并提出了靶向CCL5作为治疗CAVD的新策略 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体临床试验中验证,且具体信号通路的上下游调控细节有待进一步探索 | 探究CCL5在CAVD进展中的调控功能,特别是通过趋化因子信号通路和铁死亡的作用机制 | 人类主动脉瓣间质细胞(VICs)和Apoe-/-小鼠模型 | 分子生物学与病理学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、病理染色、酶联免疫吸附试验、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 325 | 2026-03-21 |
Heterogeneity and Clinical Relevance of Human Adipose Stromal and Progenitor Cells
2026-Mar, Diabetes & metabolism journal
IF:6.8Q1
DOI:10.4093/dmj.2025.1182
PMID:41813260
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综述 | 本文综述了人类脂肪基质和祖细胞(ASPCs)的异质性及其临床相关性,总结了单细胞转录组学等先进方法在定义ASPC亚型中的应用 | 通过系统比较近期单细胞转录组数据集,首次识别出至少八种不同的ASPC亚型,并整合了其在代谢疾病中的功能失调证据 | 不同研究间存在生物学和方法学变异性,部分细胞类型未一致检测到,需要进一步验证研究 | 阐明人类白色脂肪组织中ASPCs的异质性及其在代谢疾病中的临床意义 | 人类白色脂肪组织中的脂肪基质和祖细胞(ASPCs) | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 326 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomic profiling identifies therapeutic subpopulations of adipose-derived mesenchymal stromal cells for human keloid management
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05463-0
PMID:41511717
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,鉴定了脂肪来源间充质基质细胞中具有抑制瘢痕疙瘩形成潜能的治疗性亚群,并在小型猪模型中验证了其疗效 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出脂肪来源间充质基质细胞中能够特异性抑制瘢痕疙瘩成纤维细胞和角质形成细胞发展的治疗性亚群,并揭示了其通过调控关键枢纽基因(如NOG、IL6、APP、NOTCH1)发挥作用的分子机制 | 研究主要在体外和小型猪模型中进行,尚未在人体临床试验中验证;对ASC亚群抑制瘢痕形成的具体信号通路和长期安全性需进一步探究 | 阐明脂肪来源间充质基质细胞治疗人类瘢痕疙瘩的潜力及其作用机制 | 瘢痕疙瘩成纤维细胞、瘢痕疙瘩角质形成细胞、脂肪来源间充质基质细胞 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 327 | 2026-03-21 |
Advances in the application of spatial transcriptomics in understanding development and disease
2026-Mar, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05470-1
PMID:41511721
|
综述 | 本文综述了空间转录组学技术在理解发育和疾病中的应用进展 | 将空间转录组学作为一个总括性术语,区分了组织水平ST和空间解析单细胞转录组学,并整合了多模态数据 | NA | 综述空间转录组学方法学进展及其在发育和临床问题中的应用 | 空间转录组学技术及其在组织空间基因表达分析中的应用 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学,包括RNA、DNA、ATAC、CUT&Tag和Ribo-seq等多模态测序 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,单细胞多组学 | NA | NA |
| 328 | 2026-03-21 |
TUSCAN: Tumor segmentation and classification analysis in spatial transcriptomics
2026-Mar, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1014058
PMID:41843898
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为TUSCAN的新型计算方法,用于在空间转录组学数据中识别和分类肿瘤区域 | 提出了一种结合空间转录组学数据和H&E染色图像构建空间拷贝数变异谱的方法,以提高肿瘤区域识别的准确性,并提供了可解释的克隆进化推断 | NA | 提高空间转录组学数据中肿瘤区域识别的准确性 | 肿瘤组织切片 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,H&E染色 | NA | 空间转录组学数据,图像数据 | 多个来自不同平台的数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 329 | 2026-03-21 |
Single-cell sequencing reveals unexpected genetic diversity among Bodo spp. flagellates and their bacterial endosymbionts
2026-Mar, Microbial genomics
IF:4.0Q2
DOI:10.1099/mgen.0.001642
PMID:41848149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了Bodo属鞭毛虫及其细菌内共生体之间意想不到的遗传多样性 | 首次对未培养的Bodo属鞭毛虫进行单细胞测序,发现了三个潜在新物种,并揭示了宿主与内共生体之间协同进化的多样性模式 | 样本仅来自英国一处淡水地点,样本量较小(7个细胞),可能无法代表全球Bodo属的完整多样性 | 探究自由生活鞭毛虫Bodo属及其内共生体的遗传多样性和物种界定 | Bodo属鞭毛虫及其Holosporales目细菌内共生体 | 微生物基因组学 | NA | 单细胞测序、比较基因组学 | NA | 基因组序列数据 | 7个未培养的Bodo属细胞 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 330 | 2026-03-21 |
The PKA/MBD2 Axis Transcriptionally Represses INPP5A to Modulate PI3K/Akt Signaling and Accelerate Pituitary Tumorigenesis
2026-Mar, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70817
PMID:41857481
|
研究论文 | 本研究探讨了INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及分子机制,重点关注其与PI3K/Akt信号通路和表观遗传调控因子MBD2的相互作用 | 揭示了PKA/MBD2轴通过转录抑制INPP5A来调节PI3K/Akt信号通路并加速垂体肿瘤发生的新机制 | 研究主要基于体外实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型的验证 | 研究INPP5A在垂体神经内分泌肿瘤恶性进展中的调控作用及分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 肿瘤生物学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞测序、免疫荧光染色、统计分析 | NA | 单细胞测序数据、临床样本数据 | 62例垂体神经内分泌肿瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2026-03-21 |
Single-cell transcriptomics reveals pathogen-specific monocyte heterogeneity and potential biomarkers in gram-positive versus gram-negative bloodstream infections
2026-Mar-01, World journal of emergency medicine
IF:2.6Q1
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染中病原特异性的单细胞异质性,并鉴定了潜在的生物标志物 | 首次在单细胞水平上系统比较了革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染对宿主单核细胞转录组的特异性影响,并发现了S100A12与降钙素原联合作为鉴别诊断生物标志物的潜力 | 单细胞测序样本量较小(仅4名患者),临床验证队列规模有限,需要更大规模的前瞻性研究进行验证 | 阐明革兰氏阳性菌与革兰氏阴性菌血流感染在单细胞水平的宿主免疫反应差异,并寻找鉴别诊断的生物标志物 | 健康志愿者、革兰氏阴性菌血流感染脓毒症患者、革兰氏阳性菌血流感染脓毒症患者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 血流感染/脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 单细胞测序:4名患者(2名GNB-BSI,2名GPC-BSI)+健康志愿者;临床验证:85名患者(45名GNB-BSI,40名GPC-BSI) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 332 | 2026-03-20 |
Species-specific roles of SP1 in bovine and human embryonic genome activation and early embryonic development
2026-Mar-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2526998123
PMID:41849396
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了牛胚胎中主要胚胎基因组激活的异步启动,并探讨了转录因子SP1在牛和人类胚胎中调控胚胎基因组激活和早期发育的保守及物种特异性作用 | 首次在牛胚胎中揭示主要胚胎基因组激活在8细胞阶段的异步启动,并通过多组学分析阐明了SP1在调控胚胎基因组激活中的保守和物种特异性机制 | 研究主要基于体外胚胎模型,可能无法完全反映体内胚胎发育的复杂性,且样本量相对有限 | 探究牛和人类胚胎中胚胎基因组激活的分子特征及转录因子SP1的调控作用 | 牛和人类早期胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2026-03-20 |
Red panda intestinal organoids for the functional analysis of Lactobacillus salivarius
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.114844
PMID:41852748
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研究论文 | 本研究建立了红熊猫肠道类器官培养系统,用于分析唾液乳杆菌P103的益生功能 | 首次成功建立红熊猫肠道类器官,并利用单细胞RNA测序验证其组织特异性细胞类型和功能,为濒危物种研究提供了可传代、冻存和复苏的模型系统 | 未在摘要中明确提及具体限制,可能包括类器官与体内环境的差异或样本规模有限 | 研究红熊猫肠道类器官的建立及其在宿主-微生物相互作用机制分析中的应用,减少野生动物研究对动物模型的依赖 | 红熊猫肠道类器官及唾液乳杆菌P103 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2026-03-20 |
The ATF5-GPER1 axis drives female protection in hepatocellular carcinoma through dual tumor-suppressive and immune-modulatory mechanisms
2026-Mar-19, Bioscience trends
IF:5.7Q1
DOI:10.5582/bst.2026.01026
PMID:41850858
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习,揭示了ATF5-GPER1轴通过抑制肿瘤增殖、诱导凋亡以及重塑免疫微环境,驱动肝细胞癌女性保护性现象的分子机制 | 首次整合bulk转录组学、单细胞RNA测序与机器学习,系统性地识别并验证了ATF5作为女性保护性基因,并阐明其通过激活GPER1形成雌激素响应模块,在肿瘤细胞和免疫细胞中发挥双重抑制作用的机制 | 研究主要基于回顾性队列和公共数据集,需要在更大规模的前瞻性队列中进行验证;体外细胞实验(HepG2)的发现需要在更复杂的体内模型中进一步确认 | 探究肝细胞癌性别二态性(女性生存优势)的分子机制,并识别相关的生物标志物 | 肝细胞癌患者(包括男性和女性)的肿瘤组织、肿瘤细胞系(HepG2)以及相关的转录组和单细胞数据 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 机器学习(LASSO, SVM, 随机森林), 组织芯片验证 | LASSO, SVM, 随机森林 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 临床生存数据, 组织芯片图像数据 | bulk转录组数据来自3个公共数据集(GSE39791, TCGA-LIHC, GSE14520);单细胞RNA测序数据来自5个数据集,共58名患者的238,982个细胞;组织芯片验证包含167个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 335 | 2026-03-20 |
Targeting the ferritinophagy axis: multi-target regulation of TFRC/FTH1/NCOA4 by artesunate ameliorates salivary gland dysfunction in Sjögren's Disease
2026-Mar-19, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-026-01354-8
PMID:41851758
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研究论文 | 本研究探讨了青蒿琥酯通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而改善干燥综合征小鼠唾液腺功能障碍的机制 | 首次揭示了青蒿琥酯通过双重靶向铁蛋白自噬轴(TFRC/FTH1/NCOA4)并增强抗氧化防御来改善干燥综合征唾液腺功能障碍的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人类患者中进行验证,且具体分子结合机制需进一步实验确认 | 探究青蒿琥酯是否通过调节TFRC/FTH1/NCOA4轴抑制铁死亡,从而缓解干燥综合征的唾液腺功能障碍 | 非肥胖糖尿病小鼠(干燥综合征模型)和IFN-γ诱导的人唾液腺细胞系A253 | NA | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 分子对接, Western印迹, 免疫荧光, 流式细胞术, 功能测定 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 336 | 2026-03-20 |
Single-cell atlas of B cell heterogeneity in lacrimal IgG4-related disorders: Unraveling the transition from inflammatory exhaustion to clonal malignancy
2026-Mar-19, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70498
PMID:41853890
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性,揭示了从炎症性耗竭向克隆性恶性肿瘤转变的关键差异 | 首次在单细胞水平上比较了IgG4-ROD和IgG4阳性MALT淋巴瘤中B细胞的分化轨迹和分子特征,识别了记忆B细胞分化状态作为恶性转化的关键节点 | 样本量较小(仅6例患者),且仅分析了泪腺组织,可能无法完全代表疾病的全貌 | 探究泪腺IgG4相关疾病中B细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 4例IgG4-ROD患者和2例IgG4阳性MALT淋巴瘤患者的泪腺组织 | 数字病理学 | 眼部疾病(IgG4相关疾病) | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 6例患者(4例IgG4-ROD,2例MALT淋巴瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 337 | 2026-03-20 |
Uncovering the therapeutic mechanism of Baicalein in diabetic retinopathy through ferroptosis regulation
2026-Mar-18, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2026.2646309
PMID:41848783
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研究论文 | 本研究通过网络药理学和单细胞转录组学方法,探讨了黄芩素通过调控铁死亡治疗糖尿病视网膜病变的潜在机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序数据,系统揭示了黄芩素通过靶向铁死亡通路治疗糖尿病视网膜病变的多靶点作用机制,并利用分子对接与动力学模拟验证了关键靶点的结合稳定性 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟,缺乏体内实验验证;单细胞数据样本来源有限,临床转化潜力需进一步评估 | 探究黄芩素治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,重点关注其对铁死亡通路的调控作用 | 糖尿病视网膜病变相关的差异表达基因、铁死亡相关基因、黄芩素作用靶点及视网膜单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 网络药理学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、通路富集分析 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 | 基于公共数据库GSE102485和GSE178121的基因表达数据集,未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2026-03-20 |
Rudolf Buchheim Award 2026: Toward a ToxAtlas of carbon-based nanomaterials: single-cell RNA sequencing reveals initiating cell circuits in pulmonary inflammation
2026-Mar-18, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05170-7
PMID:41848856
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统解析了碳基纳米材料诱导肺部炎症的起始细胞回路,并构建了毒理学图谱 | 首次在单细胞分辨率下,将碳基纳米材料的物理化学特性与细胞特异性炎症起始、应激反应及免疫细胞招募联系起来,为基于作用模式的危害评估提供了概念框架 | 研究基于小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;且仅关注了早期炎症起始事件,长期效应未涉及 | 推进对碳基纳米材料引发呼吸道炎症机制的理解,支持更安全的纳米材料理性设计及特异性体外检测方法的开发 | 暴露于碳基纳米材料(炭黑样碳纳米颗粒、柔性双壁碳纳米管、针状多壁碳纳米管)的小鼠肺部细胞 | 毒理学 | 肺部炎症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 339 | 2026-03-20 |
The Application of Single-cell RNA Sequencing Technology in the Research of Sino-Nasal Diseases
2026-Mar-18, Clinical reviews in allergy & immunology
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s12016-026-09145-7
PMID:41849011
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 340 | 2026-03-20 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Cytotrophoblast Subtypes and Senescence in Recurrent Spontaneous Abortion
2026-Mar-18, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaag030
PMID:41849438
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,揭示了复发性自然流产(RSA)绒毛组织中细胞滋养层细胞的亚型特征及细胞衰老现象 | 首次在RSA绒毛组织中鉴定出三种细胞滋养层细胞亚型(CTB1、CTB2、CTB3),并发现CTB2和CTB3亚型存在显著的细胞衰老特征 | 研究样本量未明确说明,且未涉及其他可能影响胎盘发育的细胞类型或分子机制 | 探究复发性自然流产(RSA)的发病机制,特别是滋养层细胞的功能异常 | 对照组和RSA患者的绒毛组织 | 单细胞转录组学 | 复发性自然流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |