单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 1052 篇文献,本页显示第 321 - 340 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2026-05-23
IgA autoantibodies promote inflammation, Th17 polarization and fibrotic responses in hidradenitis suppurativa
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文研究了IgA自身抗体在化脓性汗腺炎中促进炎症、Th17极化和纤维化反应的作用 首次系统揭示了IgA自身抗体通过巨噬细胞、中性粒细胞胞外陷阱和T细胞多重机制驱动HS慢性炎症和纤维化的致病网络 主要基于体外实验和临床样本关联分析,缺乏体内动物模型验证因果机制 阐明IgA自身抗体在化脓性汗腺炎发病机制中的致病作用 化脓性汗腺炎患者的皮肤病变组织、血清及免疫细胞 数字病理学 化脓性汗腺炎 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫荧光, 蛋白质印迹 NA 基因表达数据, 图像 HS患者皮肤病变样本(具体数量未在摘要中说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
322 2026-05-23
Cellular landscape and diagnostic value of TROP2 in cerebrospinal fluid of lung adenocarcinoma leptomeningeal metastases
2026-Mar-24, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序描绘肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液的细胞图谱并评估TROP2的诊断价值 首次系统描绘肺腺癌软脑膜转移脑脊液的单细胞转录组图谱,发现促肿瘤LGMN-SELENOP巨噬细胞和增殖性循环肿瘤细胞,并揭示NECTIN2_TIGIT和CD47_SIRPA免疫抑制轴,以及TROP2作为诊断生物标志物的潜力 样本量有限(仅6例患者),且结果需在更大队列中验证 研究肺腺癌软脑膜转移脑脊液的细胞特征并寻找诊断生物标志物 6例肺腺癌软脑膜转移患者脑脊液样本 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 6例肺腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
323 2026-05-23
RelA Signaling in Scgb1a1+ Progenitors Mediates Lower Airway Epithelial Atypia in RSV-Induced Post-Viral Lung Disease
2026-Mar-21, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究探讨RSV感染后慢性肺部疾病中Scgb1a1+祖细胞的RelA信号通路如何诱导下气道上皮异型 首次揭示RSV后病毒性肺病中Scgb1a1+祖细胞通过RelA信号调控上皮-间质微环境,驱动非典型肺泡2型细胞(aAT2)形成及ANGPTL4信号失调 主要基于小鼠模型,需进一步验证在人类RSV感染相关慢性肺病中的适用性 解析RSV感染后慢性气道疾病中先天免疫信号在呼吸道上皮祖细胞中的作用机制 Scgb1a1+祖细胞、非典型肺泡2型细胞(aAT2)、PDGFRβ间质细胞 机器学习 呼吸道合胞病毒感染后肺病 单细胞RNA测序、谱系追踪、条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 RSV后病毒性肺病小鼠模型,含RelA条件敲除组和对照组 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
324 2026-05-23
UniST: A Unified Computational Framework for 3D Spatial Transcriptomics Reconstruction
2026-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出UniST,一个统一生成式人工智能框架,用于从稀疏连续切片计算重建致密连续的三维空间转录组景观 将核点卷积与交叉注意力层、光流连续切片重建和隐式神经表达图自编码器三重模块整合,实现无需改变实验技术的端到端3D空间转录组重建 仍依赖稀疏切片数据;框架在极端组织缺失情况下的鲁棒性及不同平台间通用性的系统验证尚存局限 开发一种通用计算框架,从稀疏连续切片重建致密连续的三维空间转录组,以解决组织三维重建中的数据稀疏性和异质性问题 小鼠胚胎数据集及两种人类癌症组织(含肿瘤-免疫边界和三级淋巴结构) 机器学习和数字病理学 癌症 空间转录组学 核点卷积网络、交叉注意力机制、光流插值、隐式神经表达图自编码器 基因表达和空间坐标数据 小鼠胚胎(未明切片数)及2例人类癌症组织 NA 空间转录组学(多种平台) NA NA
325 2026-05-21
Spike-in probe-enhanced single-cell RNA-seq reveals post-infusion transcriptomic remodeling of "prime-and-kill" synNotch-CAR-T cells
2026-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种带有外源探针的增强型单细胞RNA测序工作流程,用于追踪和分析“prime-and-kill” synNotch-CAR-T细胞输注后的转录组重塑 首次采用定制外源探针增强单细胞RNA测序技术检测synNotch-CAR转录本,结合机器学习辅助分类器实现工程化细胞的高特异性和高灵敏度检测 外源探针检测敏感性在不同细胞类型间存在差异(E-SYNC细胞78.2% vs B-SYNC细胞60.0%),可能影响低丰度细胞的全面捕获 开发能够同时检测工程化细胞并进行转录组分析的单细胞RNA测序工作流程,以解析synNotch-CAR-T细胞输注后的动态行为 针对胶质母细胞瘤的synNotch-CAR-T细胞(E-SYNC和B-SYNC系统) 机器学习、数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、外源探针设计、机器学习辅助分类器 NA 单细胞转录组数据 胶质母细胞瘤异种移植模型中的脾脏、肺和脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
326 2026-05-21
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 NetTracer3D 是一个用于分析多样化显微与医学3D数据集的用户友好型工具 NetTracer3D 提供了三种广泛适用的网络分析模式(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络),并支持标准化数据格式和交互式探索,简化了3D图像分析流程 文章未明确提及局限性 开发一个集成工具,简化三维图像分析,促进不同数据集之间的整合、共享和分析 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结以及3D光片癌症图像 计算机视觉 癌症 CODEX, 无标记拉曼光谱, 光片显微镜 网络分析模型(连接网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络) 图像 多种样本,包括人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人类脑血管造影、淋巴结及3D光片癌症图像 NA 空间转录组学, CODEX NA NA
327 2026-05-21
Cross-Species Multi-Omics Profiling Identifies Conserved Activated Valvular Interstitial Cell Population Driving Myxomatous Mitral Valve Degeneration
2026-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 跨物种多组学分析揭示了在粘液样二尖瓣退行性变中保守的活化瓣膜间质细胞群 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学,跨物种(小鼠和人类)鉴定出一个保守的活化瓣膜间质细胞群,该细胞群富集促纤维化细胞外基质重塑程序,并优先定位于机械脆弱区域 研究生效细胞群的因果关系验证尚不充分,且人类样本数量有限 解析粘液样二尖瓣退行性变中瓣膜间质细胞的分子异质性及其在疾病发病机制中的状态特异性贡献 纤维蛋白-1缺陷小鼠模型和人类二尖瓣组织标本(包括正常、散发性二尖瓣脱垂和马凡综合征相关二尖瓣脱垂) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间表达数据 包含小鼠和人类样本,具体样本数未在摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学
328 2026-05-21
Vascular invasion-associated gene expression is detectable in pre-surgical biopsies of stage I lung adenocarcinoma
2026-Mar-24, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 检测I期肺腺癌术前活检标本中与血管侵犯相关的基因表达,以预测复发和手术获益 发现血管侵犯相关的基因特征在肿瘤侵袭灶之外也可检测到,并在术前活检中具有区分VI的潜力,支持术前风险分层 文中未明确提及具体局限性 识别能预测I期肺腺癌血管侵犯的生物标志物,以改善术前风险分层 I期肺腺癌肿瘤样本,包括切除肿瘤和术前活检标本 机器学习 肺癌 RNA-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据 162个切除肿瘤样本,及其子集用于空间转录组学;独立验证队列和多区域采样数据;术前活检队列 Illumina bulk RNA-seq, 空间转录组学 Illumina NovaSeq, 空间转录组平台未详述 bulk RNA测序使用Illumina平台,空间转录组学用于部分子集
329 2026-05-21
ZMAP: A single-cell meta-atlas of zebrafish embryonic development reveals a consensus hierarchy of cell identities
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 整合8个斑马鱼胚胎单细胞RNA测序数据集,构建统一参考图谱ZMAP,揭示细胞身份的分层共识 通过整合多个独立数据集,建立斑马鱼胚胎发育的共识层次注释本体和标记基因发现流水线,并提供交互式网络工具 未提及具体局限性,但跨研究整合可能受限于数据批次效应和原始注释差异 构建斑马鱼胚胎发育的单细胞整合参考图谱,实现跨研究一致性注释和细胞身份共识推断 斑马鱼胚胎发育中的单个细胞 计算生物学, 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 798,790个细胞,覆盖15个发育时间窗口 NA 单细胞RNA测序 NA 整合8个已发表的斑马鱼全胚胎scRNA-seq数据集
330 2026-05-21
Endometrial Hyperplasia Risk Is Increased by High-Fat Diet Via Estrogen-Driven Stromal Fibroblast Reprogramming Toward a Pro-Fibrotic State
2026-Mar-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序分析高脂饮食如何通过雌激素驱动的基质成纤维细胞重编程增加子宫内膜增生风险 首次揭示高脂饮食通过雌激素信号驱动成纤维细胞向促纤维化状态重编程,从而连接雌激素优势、基质纤维化、免疫清除缺陷和子宫内膜增生易感性之间的机制 研究基于小鼠模型,可能不完全代表人类子宫内膜增生的病理机制 阐明肥胖如何改变子宫内膜细胞状态并增加子宫内膜增生风险 对照饮食或高脂饮食喂养的对照小鼠和易发子宫内膜增生小鼠的子宫内膜组织 数字病理学 子宫内膜增生 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 对照饮食和高脂饮食喂养的小鼠子宫内膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
331 2026-05-21
Intranasal HSV-1 Infection Drives Region-Specific Interferon-Dominant Microglial Remodeling
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用多组学框架研究鼻内HSV-1感染如何驱动小胶质细胞区域特异性干扰素主导的重塑 首次整合单核RNA测序、染色质可及性分析和空间转录组学,在生理相关的鼻内HSV-1感染模型中解析小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 未提及明确限制 阐明急性HSV-1感染体内小胶质细胞反应的转录和表观遗传机制 鼻内HSV-1感染小鼠模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 数字病理学 神经退行性疾病 单核RNA测序、染色质可及性分析、空间转录组学 NA 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞多组学、空间转录组学 NA NA
332 2026-05-21
Spatial transcriptomics identifies dysregulated programs across neural and non-neural tissues in spinal muscular atrophy
2026-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用空间转录组学技术识别脊髓性肌萎缩症中神经和非神经组织的失调程序 首次在症状前SMA小鼠模型中使用空间转录组学分析整个腰椎区域的多组织转录变化,揭示了SMN缺乏在运动神经元丢失前即引起广泛组织重编程 NA 阐明SMN缺乏在神经和周围组织中的早期转录后果 症状前SMA小鼠和对照小鼠的腰椎横截面 数字病理学 脊髓性肌萎缩症 空间转录组学 NA 基因表达数据 SMA小鼠和对照小鼠(数量未明确说明) NA 空间转录组学 NA NA
333 2026-05-21
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Mar-04, The Journal of thoracic and cardiovascular surgery IF:4.9Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析肿瘤浸润自然杀伤细胞亚型,为非小细胞肺癌患者治疗分层提供依据 首次发现吸烟相关的两种自然杀伤细胞亚型(应激反应性和适应性免疫调节性)可预测手术或新辅助化学免疫治疗的疗效,为治疗策略优化提供细胞层面标志 样本量有限(单细胞RNA测序61例,验证集19例,转录组去卷积102例及24例新辅助治疗患者),结论需更大规模队列验证;仅基于转录组分析,缺乏功能性实验验证 识别与吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导可切除非小细胞肺癌的治疗分层 非小细胞肺癌患者肿瘤组织及相邻肺组织中的自然杀伤细胞亚型 数字病理学 非小细胞肺癌 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA 基因表达数据 61例肺组织(单细胞RNA测序)、19例侵袭性肺腺癌(验证)、102例切除非小细胞肺癌(批量RNA测序)、24例新辅助化学免疫治疗患者(批量RNA测序) Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台处理单细胞RNA-seq;Illumina NovaSeq用于批量RNA测序
334 2026-05-21
Multiscale confidence quantification for virtual spatial transcriptomics with UTOPIA
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出了UTOPIA框架,用于虚拟空间转录组学的多尺度置信度量化,从组织学图像预测基因表达或细胞类型 提出了模型无关的UTOPIA框架,能对虚拟空间转录组预测进行统计校准的置信度评分,并控制基因和细胞类型检测的假发现率 NA 解决虚拟空间转录组学预测的统计可靠性问题,确保预测的可信度并防止虚假生物学结论 虚拟空间转录组学预测的空间分辨率和生物粒度 计算机视觉, 机器学习 NA 空间转录组学 NA 图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
335 2026-05-21
Chronic cerebral hypoperfusion exacerbates amyloid and tau pathology by impairing glymphatic transport via AQP4- and VEGF-mediated pathways: insights from a vascular to mixed-type dementia model
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨慢性脑低灌注通过AQP4和VEGF介导的通路损伤类淋巴运输,加剧淀粉样蛋白和tau蛋白病理,并构建从血管性到混合型痴呆的模型 首次揭示CCH通过AQP4去极化和VEGF抑制导致类淋巴功能障碍及毒性蛋白积累的机制,并发现恢复血管张力可改善认知功能 未提及具体局限性 阐明慢性脑低灌注导致认知障碍的机制及其与神经退行性疾病的关系 APP/PS1转基因小鼠和野生型小鼠 神经科学 血管性痴呆,阿尔茨海默病 磁共振成像,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 NA 图像,基因表达数据 小鼠模型样本量未明确说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
336 2026-05-21
Population and single-cell analyses reveal immune cell-specific expression profiles associated with Alzheimer's disease risk
2026-03, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 通过群体和单细胞分析揭示了与阿尔茨海默病风险相关的免疫细胞特异性表达谱 整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞表达数量性状位点数据,结合脑组织空间转录组学,鉴定了13个与AD风险相关的基因,并揭示了其在未刺激和刺激的外周免疫细胞及脑浸润免疫细胞中的细胞类型和状态特异性表达 NA 探究外周免疫系统失调增加阿尔茨海默病风险的细胞类型特异性机制 阿尔茨海默病患者的外周免疫细胞和脑组织样本 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 基因组关联研究 NA 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 基因组关联研究样本量455,258 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
337 2026-05-20
Integrated single-cell transcriptomic atlas of human gastric and colorectal tissues across diverse phenotypes
2026-Mar-26, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 构建了涵盖多种表型的人类胃和结直肠组织的综合单细胞转录组图谱 首次整合大规模单细胞转录组数据,涵盖574,532个胃部细胞和479,629个结直肠细胞,跨越70种细胞类型和多种临床表型,并通过多种计算工具严格验证数据质量和细胞类型注释 未明确提及局限性 构建人类胃和结直肠组织的综合单细胞转录组图谱,以促进对胃癌和结直肠癌的元分析 来自229个人类胃组织和220个人类结直肠组织的细胞 数字病理学 胃癌, 结直肠癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 229个胃组织样本(574,532个细胞)和220个结直肠组织样本(479,629个细胞) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium NA
338 2026-05-20
Single cell transcriptomic atlas reveals distinct immune signatures following transfusion of COVID-19 convalescent plasma in severe COVID-19
2026-03, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 通过单细胞转录组图谱揭示新冠肺炎康复者血浆输注对重症COVID-19患者的免疫特征影响 首次在单细胞水平上分析重症COVID-19患者接受CCP输注前后的免疫细胞变化,发现S100A8在CD4记忆T细胞和B细胞中上调,以及CCP输注选择性地破坏NK细胞与TCR阴性T细胞和BCR阳性B细胞的通讯 样本量较小且仅观测了输注后24小时的时间点,可能未能完全反映长期免疫反应变化 阐明重症COVID-19患者接受康复者血浆输注后的免疫应答和促炎因子特征 重症COVID-19患者的PBMC样本 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 单细胞表达数据 重症COVID-19患者在CCP输注前后的PBMC样本 NA 单细胞RNA-seq NA 对PBMCs进行单细胞RNA测序
339 2026-05-20
Molecular profiling of sacral chordomas through methylation, spatial transcriptomics and multiplexed immunofluorescence
2026-Mar, ESMO rare cancers
研究论文 通过甲基化、空间转录组学和多重免疫荧光分析骶骨脊索瘤的分子特征 首次结合DNA甲基化谱、空间转录组学和多重免疫荧光对骶骨脊索瘤进行综合分子分析,发现两个不同的表观遗传聚类,并揭示肿瘤与基质区域间的差异基因表达及免疫检查点标志物的表达 样本量较小(29例患者),需要功能验证进一步证实研究结果 揭示骶骨脊索瘤的分子异质性及免疫微环境特征 29例骶骨脊索瘤患者的存档组织样本 数字病理学, 计算机视觉 脊索瘤(骶骨) DNA甲基化测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 无监督聚类, 多元线性回归 图像, 文本 29例骶骨脊索瘤患者,120个感兴趣区域 NA 空间转录组学, 多重免疫荧光 Digital Spatial Profiler (DSP) Digital Spatial Profiler (DSP) 用于基因表达分析,多重免疫荧光用于细胞群检测
340 2026-05-19
Genetic Evidence Supports a Potential Role of WTAP-related m6A Regulation in Vascular Dementia: Insights from Mendelian Randomization and Multi-omics Analyses
2026-Mar-24, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 通过孟德尔随机化和多组学分析,探讨WTAP相关m6A调控与血管性痴呆的潜在因果关系 首次系统评估m6A调控基因WTAP在血管性痴呆中的因果作用,结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序、微生物组中介分析和全表型关联研究,提出m6A调控可能通过肠道微生物影响脑血管生物学 研究基于遗传预测和关联分析,仍需功能性实验验证WTAP在VAD中的具体机制 利用人类遗传学和多组学数据揭示WTAP相关m6A修饰在血管性痴呆发病中的潜在因果作用 血管性痴呆患者脑组织样本及遗传变异数据 机器学习 血管性痴呆 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究, 加权基因共表达网络分析 NA 基因表达数据, 遗传变异数据, 单细胞转录组数据 GSE122063包含血管性痴呆与对照脑组织样本(具体数量未提供);GSE282111为单细胞测序数据(具体细胞数量未提供);FinnGen GWAS数据(具体样本量未提供) NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
回到顶部