单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 1054 篇文献,本页显示第 301 - 320 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
301 2026-06-29
Integrative bioinformatics reveals complement dysregulation: critical insights into C1q, C1r, and C1s in aortic dissection pathogenesis
2026-Mar-10, Molecular genetics and genomics : MGG IF:2.3Q3
研究论文 通过整合生物信息学揭示补体失调在主动脉夹层发病机制中的作用,重点关注C1q、C1r和C1s 首次联合差异表达分析、孟德尔随机化和单细胞RNA测序系统阐明C1r作为主动脉夹层的诊断和机制标志物,并区分C1q的非因果性临床价值 NA 阐明补体失调对主动脉夹层的贡献并识别具有诊断和机制相关性的补体相关生物标志物 主动脉夹层患者样本及公开数据集GSE153434 生物信息学 心血管疾病 RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫荧光 NA 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 血清蛋白数据 NA NA 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
302 2026-06-29
AI-powered radiogenomics: imaging-driven diagnosis and discovery of cancer's molecular and cellular landscape
2026-Mar-10, Molecular genetics and genomics : MGG IF:2.3Q3
综述 综述AI驱动的放射基因组学在癌症分子与细胞景观无创诊断和发现中的进展 整合人工智能(包括CNN、GAN、Transformer等)与多组学数据,推动放射基因组学从传统成像向定量特征自动化提取和稳健相关分析的转变 数据协调、标准化、伦理考量及跨人群验证等挑战仍需解决 总结AI驱动的放射基因组学在临床相关性和实验室诊断中的应用,强调其精准肿瘤学潜力 主要癌症类型(乳腺癌、肺癌、脑癌、前列腺癌)的成像表型与多组学数据 计算机视觉 乳腺癌、肺癌、脑癌、前列腺癌 放射基因组学 CNN、GAN、Transformer 影像 NA NA NA NA NA
303 2026-06-29
Smarce1-dependent modulation of Stat3 signaling governs cardiomyocyte proliferation
2026-Mar-10, Biological research IF:4.3Q1
研究论文 本研究鉴定Smarce1作为斑马鱼心肌细胞增殖的关键调控因子,揭示了它通过调节Stat3信号传导来影响心脏生长的表观遗传机制 首次发现SWI/SNF染色质重塑复合体核心亚基Smarce1在心肌细胞增殖中的关键作用,并建立了一个保守的Smarce1-Stat3轴,连接了染色质重塑与增殖信号传导 未明确说明局限性 揭示调控心脏发育和再生过程中心肌细胞增殖的分子机制 斑马鱼心肌细胞 分子生物学 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA 转录组和表观基因组数据 NA NA 单细胞RNA测序, ATAC测序, 批量RNA测序 NA NA
304 2026-06-29
Comprehensive analysis of the potential role of Ferroptosis-related genes in glioblastoma multiforme
2026-Mar-09, Neurological sciences : official journal of the Italian Neurological Society and of the Italian Society of Clinical Neurophysiology IF:2.7Q3
研究论文 通过多组学方法分析铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的潜在作用,并构建预后风险模型 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的细胞类型特异性分布和空间定位 研究基于公共数据库TCGA-GBM数据,样本量有限,且风险模型的预后性能AUC值中等,有待外部验证 探索铁死亡相关基因在胶质母细胞瘤中的作用及其预后评估潜力 胶质母细胞瘤患者 机器学学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 基因集变异分析 Cox回归, LASSO回归 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
305 2026-06-29
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示ACSL4介导的铁死亡在免疫球蛋白A肾病进展中的作用 首次通过scRNA-seq鉴定出IgAN中ACSL4+的髓袢细胞亚群,并揭示其通过铁死亡途径促进疾病进展的新机制 研究未在体内模型中验证ACSL4+ LOHs的致病功能,且样本量可能有限 探究ACSL4介导的铁死亡在免疫球蛋白A肾病进展中的机制 免疫球蛋白A肾病患者的肾组织样本 数字病理学 肾疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 IgAN组和对照组的肾组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
306 2026-06-29
Intraovarian injection of autologous platelet-rich plasma combined with peripheral blood mononuclear cells improves ovarian function in advanced-age women with diminished ovarian reserve: a clinical retrospective cohort and single-cell transcriptomic analysis
2026-Mar-07, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
研究论文 对高龄卵巢储备功能减退患者进行卵巢内注射自体富血小板血浆与外周血单个核细胞联合治疗,评估其对卵巢功能的改善作用,并结合单细胞转录组分析探索潜在机制 首次在临床上评估PRP与外周血单个核细胞联合卵巢内注射对高龄DOR患者的疗效,并通过动物模型单细胞转录组分析揭示潜在机制,涉及颗粒细胞间通讯改变和蛋白质合成与能量代谢通路的激活 非随机对照研究,样本量有限,未评估妊娠或活产结局,结果需前瞻性随机对照试验验证 初步评估卵巢内注射PRP联合外周血单个核细胞对高龄卵巢储备功能减退患者卵巢功能的改善效果和潜在机制 122例高龄卵巢储备功能减退患者(进行IVF-ET)和13月龄DOR大鼠模型 机器学习的其他应用 卵巢储备功能减退(DOR) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 122例患者(回顾性队列,含空白对照45例、PRP组47例、PRP+PBMCs组30例);动物实验每组5只大鼠 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
307 2026-06-29
Amino acid metabolism-related genes signature correlates with immune infiltration and predicts clinic prognosis in osteosarcoma
2026-Mar-07, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 本研究基于氨基酸代谢相关基因构建预后模型,揭示其在骨肉瘤免疫浸润中的作用 首次构建基于五个氨基酸代谢相关基因的预后风险模型,并验证其与传统临床因素相比的优越预后预测能力 未提及具体局限性 探究氨基酸代谢相关风险特征在骨肉瘤预后评估和免疫细胞浸润中的作用 骨肉瘤患者的临床和转录组数据 机器学习 骨肉瘤 RNA-seq Cox回归模型, LASSO回归 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 来自TARGET和GEO数据库的骨肉瘤患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
308 2026-06-29
Functional genomics integration of glycolysis-related gene networks reveals prognostic biomarkers and immune microenvironment regulation in breast cancer
2026-Mar-06, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 通过整合糖酵解相关基因网络的多组学分析,构建乳腺癌预后生物标志物,并揭示其对免疫微环境的调控机制 首次结合糖酵解相关基因的预后模型与单细胞测序、孟德尔随机化及分子对接技术,全面解析糖酵解重编程在乳腺癌免疫微环境中的作用及因果关系 未提及具体的局限性,但可能包括数据来源的异质性、样本量有限或模型验证范围不足 探究糖酵解相关基因在乳腺癌中的预后价值及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 乳腺癌患者的多组学数据(TCGA、METABRIC、GEO单细胞RNA-seq数据)及糖酵解相关基因 机器学习 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接, PCR Cox回归, LASSO回归, 一致性聚类 基因表达数据, 单细胞转录组数据, eQTL数据 TCGA和METABRIC数据库中的乳腺癌样本(具体数量未提供)及GEO单细胞数据 Illumina, 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq Illumina NovaSeq, 10x Chromium NA
309 2026-06-29
Clusterin elaborated by renal tubular epithelial cells under high oxalate stress serves as a matrix protein to facilitate kidney stone formation
2026-Mar-06, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 通过多组学方法鉴定肾小管上皮细胞分泌的簇蛋白作为基质蛋白促进草酸钙肾结石形成 首次揭示TWIST1-CLU调控轴在肾草酸钙结石形成中的关键作用,并发现CLU可作为潜在治疗靶点 尚未明确CLU在结石形成中的其他潜在机制及体内长期影响 阐明肾小管上皮细胞来源的簇蛋白在草酸钙肾结石形成中的作用及分子机制 肾小管上皮细胞、草酸钙肾结石患者肾组织标本、小鼠模型 机器学习 肾结石 蛋白质组学、转录组学、单细胞转录组测序 NA 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞转录组数据 人肾标本(结石患者与对照)、小鼠模型 NA 蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
310 2026-06-29
High-fat diet leads to male reproductive dysfunction by disrupting lipid-droplet-mediated organelle crosstalk
2026-Mar-06, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 高脂饮食通过破坏脂滴介导的线粒体-内质网接触导致男性生殖功能障碍 首次揭示脂滴在调控线粒体-内质网接触中的关键作用,为高脂饮食引起的男性生殖功能障碍提供新机制 未明确提及,需进一步研究脂滴介导的细胞器互作在人类中的适用性 探究高脂饮食导致男性生殖功能障碍的分子机制 高脂饮食小鼠的睾丸间质细胞 数字病理学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序、质谱蛋白质组学、流式细胞术、透射电子显微镜 NA 基因表达数据、蛋白质组数据、图像数据 高脂饮食小鼠(未提供具体数量) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 已发表的单细胞RNA测序数据(平台细节未明确说明)
311 2026-06-29
Decoding the ubiquitination-immunity axis in idiopathic pulmonary fibrosis: diagnostic insights and therapeutic implications
2026-Mar-06, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过分析泛素化相关基因在特发性肺纤维化中的诊断和免疫意义,构建了诊断模型并揭示了UBD在疾病发展中的关键作用 首次将泛素化相关基因与特发性肺纤维化的免疫浸润特征系统关联,并发现UBD作为新的促纤维化因子和中性粒细胞浸润调节因子 研究基于公开数据集和动物模型,且缺乏临床队列验证;具体分子机制尚未完全阐明 探究泛素化相关基因在特发性肺纤维化中的诊断价值和免疫调控功能 特发性肺纤维化患者肺组织样本、小鼠原代肺成纤维细胞 机器学习 肺纤维化 RNA测序、单细胞RNA测序、CIBERSORT算法 LASSO回归 基因表达数据、单细胞转录组数据 3个批量RNA测序数据集(GSE110147、GSE53845、GSE32537)和1个单细胞RNA测序数据集(GSE122960) NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序 NA 从Gene Expression Omnibus数据库获取的数据集
312 2026-06-29
Mechanistic Insights from Human Studies in Axial Spondyloarthritis: A T Cell Story
2026-Mar-05, Current rheumatology reports IF:5.7Q1
综述 本文综述了中轴型脊柱关节炎中T细胞驱动疾病机制的最新研究,包括CD8+和CD4+ T细胞的作用以及精准医学进展 通过高通量TCR测序和单细胞RNA测序发现公共TRAV21/TRBV9 TCR克隆,并首次通过靶向TRBV9+ T细胞的单克隆抗体(seniprutug)提供临床概念验证,揭示CD4 Th17细胞是关节滑膜中IL-17的主要来源 主要基于HLA-B*27阳性患者,未充分讨论HLA-B*27阴性患者的机制差异;临床证据主要来自一个小样本临床试验 阐明中轴型脊柱关节炎中HLA-B*27与T细胞介导炎症的分子和临床机制 强直性脊柱炎患者 机器学习 脊柱关节炎 高通量TCR测序、单细胞RNA测序 NA 序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
313 2026-06-29
Atherosclerotic plaque-derived extracellular vesicles mediate smooth muscle cell phenotypic switching and promote vascular remodeling : EVs promote VSMC phenotypic switching
2026-Mar-05, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 发现动脉粥样硬化斑块来源的细胞外囊泡通过miR-23a-3p/Myl12b通路介导血管平滑肌细胞表型转换,加剧血管重塑 首次揭示动脉粥样硬化微环境中细胞外囊泡作为原位刺激因子,通过miR-23a-3p靶向Myl12b调控MRTFA核转位,促进血管平滑肌细胞表型转换的新机制 仅在大鼠模型和体外实验中验证,缺乏人体组织直接干预证据,且未涉及其他细胞类型(如内皮细胞、巨噬细胞)的交互作用 阐明动脉粥样硬化斑块来源的细胞外囊泡在血管平滑肌细胞表型转换和血管重塑中的作用机制 Ldlr基因敲除大鼠和人类动脉粥样硬化斑块中的血管平滑肌细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞测序, miRNA分析 NA 单细胞转录组数据 Ldlr敲除大鼠载脂蛋白E模型(高胆固醇饮食+部分颈动脉结扎)及人类动脉粥样硬化斑块组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
314 2026-06-29
HDAC6 inhibition reprograms endothelial and macrophage responses to protect the lung in endotoxemia
2026-Mar-05, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示HDAC6抑制在败血症相关肺损伤中通过重编程内皮细胞和巨噬细胞反应发挥保护作用 首次在单细胞水平上解析了HDAC6抑制对不同细胞类型(内皮细胞和巨噬细胞)在肺损伤中的差异化调控作用,并发现其促进血管新生相关基因表达 NA 探究HDAC6抑制在败血症相关急性肺损伤中对内皮细胞和巨噬细胞的细胞类型特异性保护机制 小鼠败血症模型中的肺内皮细胞和巨噬细胞 数字病理学 败血症相关肺损伤 单细胞RNA测序、RNA-seq NA 基因表达数据 小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
315 2026-06-29
DNA methylation-regulated AKAP12 expression modulates ECM remodeling and ADP/FAD ratio to influence prognosis in ovarian cancer
2026-Mar-05, Journal of ovarian research IF:3.8Q1
research paper 本研究整合多组学分析,探讨DNA甲基化调控的AKAP12表达如何通过ECM重塑和ADP/FAD比率影响卵巢癌预后 首次揭示AKAP12在卵巢癌中由DNA甲基化调控,并通过ADP/FAD比率和ECM重塑影响预后的新机制,结合单细胞测序和孟德尔随机化分析 基于公共数据库和计算机模拟敲除,缺乏体外和体内实验验证 探索AKAP12在卵巢癌中的表达、DNA甲基化调控及其下游代谢效应,揭示其对预后的影响 卵巢癌患者样本数据(TCGA和GEO数据集)中的AKAP12基因表达、DNA甲基化和代谢因子 machine learning ovarian cancer 单细胞RNA测序、DNA甲基化测序、孟德尔随机化 多组学整合分析模型 gene expression, DNA methylation, single-cell RNA-seq TCGA和两个GEO数据集(GSE26712和GSE17260)的多队列样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
316 2026-06-29
Spatial transcriptomics and artificial intelligence: a scoping review of emerging applications in head and neck pathology
2026-Mar-04, Head and neck pathology
综述 系统梳理了空间转录组学与人工智能在头颈部病理学中的应用现状及未来方向 首次针对空间转录组学联合人工智能在头颈病理学中的研究进行范围综述,强调多模态融合框架的潜在价值 仅纳入10项研究,样本量有限;缺乏前瞻性验证;检索时间截至2025年5月,可能遗漏最新进展 评估空间转录组学与人工智能在头颈病理诊断、风险分层和恶性转化预测中的应用潜力 头颈部病变组织及口腔潜在恶性疾病(OPMDs)样本 数字病理学 头颈部肿瘤 空间转录组学 NA 基因表达数据、组织学图像、临床元数据 10项研究(具体样本量未提及) NA 空间转录组学 NA 未明确具体平台配置信息
317 2026-06-29
Network-Based Prioritization of Network-Peripheral Gene Modules in Autism Spectrum Disorder Using Integrative Transcriptomic and Proteomic Data
2026-Mar-04, Journal of molecular neuroscience : MN IF:2.8Q2
研究论文 通过整合转录组和蛋白质组数据,优先识别自闭症谱系障碍中的网络外周基因模块 提出一种可复现的计算框架,优先关注分子相互作用网络拓扑外周中非中枢但功能相关的基因模块,而非传统的中枢基因 未提供明确限制信息 利用整合组学数据识别自闭症谱系障碍相关的外周基因模块及其生物学功能 人脑皮层样本中的转录组、蛋白质组和单细胞RNA-seq数据集 机器学习, 数字病理学 自闭症谱系障碍 RNA-seq, 蛋白质组学 NA 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
318 2026-06-29
SDF2L1 modulates oxLDL-induced endoplasmic reticulum stress, protein aggregation, and O-mannosylation in myocardial infarction and lung cancer
2026-Mar-04, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 研究SDF2L1蛋白在氧化低密度脂蛋白诱导的心肌梗死和肺癌中的调控作用,涉及内质网应激、蛋白聚集和O-甘露糖基化 首次揭示SDF2L1通过调节O-甘露糖基化参与oxLDL诱导的内质网应激和蛋白聚集,并阐明其在心肌梗死和肺癌中的双重调控作用 未探讨SDF2L1在临床样本中的表达与预后的直接关联,且体内实验仅使用全身性敲除小鼠模型,缺乏组织特异性分析 探讨SDF2L1在oxLDL相关心血管疾病和癌症中的功能及分子机制 人心肌梗死和肺癌组织空间转录组数据、EA.hy926内皮细胞和A549肺上皮细胞、Sdf2l1敲除小鼠 数字病理学 心血管疾病, 肺癌 空间转录组学, CRISPR-Cas9, Western blotting, qPCR, PROTEOSTAT, ELISA, LC-MS/MS糖蛋白组学 NA 空间转录组数据, 图像, 分子生物学数据 心肌梗死和肺癌组织空间转录组数据集(未明确样本数量)、体外细胞模型、体内小鼠模型(Sdf2l1-/-) 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台用于人组织切片分析
319 2026-06-29
Senescent epithelial cells remodel the tumor microenvironment and drive early LUAD progression: a multiomics risk model and single-cell analysis
2026-Mar-03, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 基于多组学风险模型和单细胞分析,揭示衰老上皮细胞重塑肿瘤微环境并驱动早期肺腺癌进展 首次通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,鉴定出一个由衰老相关基因DKK1驱动的独特上皮亚群(E9),该亚群在肿瘤早期阶段表现出衰老特征、干细胞性和细胞间通讯能力,并证明了COL17A1和DKK1高表达与不良临床结局相关 研究主要基于公共数据库(TCGA)和计算分析,缺乏体外或体内功能验证实验来直接确认DKK1在衰老上皮亚群中的具体机制 探索衰老细胞在肺腺癌进展和免疫逃逸中的具体作用,并建立衰老相关风险模型以改善预后预测和治疗靶点 肺腺癌患者的肿瘤组织和相关细胞亚群 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 LASSO回归 基因表达数据 来自TCGA的批量RNA测序样本,以及单细胞RNA测序数据中的上皮细胞亚群 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
320 2026-06-29
Transcriptomic profiles from normal and tumor tissue samples reveal distinct venule populations and novel tumor endothelial cell markers in breast cancer
2026-Mar-03, Breast cancer research : BCR IF:6.1Q1
研究论文 通过整合单细胞RNA-seq数据,揭示正常乳腺与乳腺肿瘤内皮细胞的转录组差异,发现新的肿瘤内皮细胞标志物ADM5 首次识别出ADM5作为乳腺及其他癌症的肿瘤内皮细胞新标志物,并发现肿瘤静脉内皮细胞亚型与正常的表型差异及内皮无反应性 基于公共数据集,未进行实验验证;样本量有限;可能遗漏其他肿瘤类型中的差异 表征正常乳腺与乳腺肿瘤内皮细胞差异,识别新的肿瘤特异性血管治疗靶点 正常乳腺和乳腺肿瘤组织中的内皮细胞 单细胞转录组学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 公开可用的单细胞RNA-seq数据集,未明确样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部