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当前共找到 1052 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2026-05-28 |
Engineering Tregs-mediated immune tolerance via foxp3a overexpression to evade allograft transplantation barriers in zebrafish
2026-Mar-02, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2026.02.024
PMID:41780749
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研究论文 | 通过过表达foxp3a工程化Treg介导的免疫耐受，实现斑马鱼异体移植屏障的规避 | 首次在斑马鱼中通过全身过表达Foxp3a构建Tg(CMV:foxp3a)品系，利用单细胞RNA测序揭示免疫景观重塑，并成功加速性腺移植和生殖系干细胞移植，提供了一种基于Treg的免疫缺陷宿主替代方案 | 研究主要集中于斑马鱼模型，其免疫系统与哺乳动物存在差异，可能限制向哺乳动物移植应用的直接转化；另外，foxp3a过表达的长期安全性及潜在副作用未充分探讨 | 开发一种基于Treg的实用策略，通过foxp3a过表达诱导免疫耐受，以替代免疫缺陷宿主，用于斑马鱼的基因组操作和移植 | 斑马鱼（Danio rerio）的Tg(CMV:foxp3a)品系及其体内免疫细胞效应 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析、原位杂交 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼样品（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2026-05-27 |
STiLE: Automated Tissue Microarray Dearraying for Spatial Transcriptomics
2026-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712359
PMID:41890059
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研究论文 | 提出了一种名为 STiLE 的自动组织微阵列解阵工具，用于空间转录组学，仅基于细胞质心坐标实现高效解阵 | STiLE 无需组织学图像，仅使用细胞质心坐标即可完成解阵，对染色质量差和光照不均等伪影具有鲁棒性，并且平台无关 | NA | 开发一种自动化的组织微阵列解阵方法，克服现有方法依赖图像数据且不支持空间转录组学平台坐标输出的局限 | 组织微阵列样本中的细胞 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 细胞质心坐标 | 11个公共组织微阵列样本（每张载玻片含50-150个组织芯）及396个合成数据集 | Vizgen, 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学 | Vizgen MERSCOPE, 10x Xenium, NanoString CosMx | NA |
| 303 | 2026-05-27 |
Subcellular transcriptome sequencing with single cell APEX-seq identifies regulators of cell-cell interactions
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712496
PMID:41889815
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研究论文 | 提出单细胞APEX-seq方法，在亚细胞分辨率下绘制转录组图谱，并识别细胞间相互作用的调控因子 | 首次将APEX邻近标记与单细胞RNA测序结合，实现在单细胞水平上对亚细胞转录组的空间定位，解决了传统单细胞测序无法解析RNA亚细胞分布的问题 | 该方法依赖APEX标记效率，可能受限于探针设计和RNA回收率；目前仅应用于共培养体系，在复杂组织中的适用性待验证 | 开发单细胞分辨率的亚细胞转录组测序技术，以发现细胞间相互作用的新型调控因子 | 肿瘤-巨噬细胞共培养体系以及HER2+肿瘤细胞与CAR-T细胞的共培养体系 | 单细胞组学 | 肿瘤 | APEX-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据（RNA） | CAR-T细胞与HER2+肿瘤细胞共培养样本（短期和长期共培养） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium液滴系统结合APEX标记的内质网相关转录组捕获 |
| 304 | 2026-05-27 |
A Rare T-Cell Factor 4 Lineage-negative Epithelial Stem Cell Supports Wound Repair and APC-deletion-induced Colon Tumorigenesis
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712502
PMID:41889847
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研究论文 | 研究发现了结肠中一种稀有且表达T细胞因子4阴性（Lin-）的上皮干细胞群，该细胞在肠道屏障修复和APC缺失驱动的结肠肿瘤发生中发挥重要作用 | 首次鉴定出非隐窝基部柱状细胞的Lin-干细胞群，并证明其在APC单倍剂量不足背景下作为结肠肿瘤起源细胞的独特作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类组织中验证该干细胞群的存在与功能 | 探究肠道上皮屏障稳态维持及APC缺失诱导的结肠肿瘤发生中的新型干细胞机制 | 小鼠结肠上皮组织中的稀有干细胞群体 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞测序，谱系追踪，免疫组织化学 | NA | 测序数据，图像 | 小鼠结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2026-05-27 |
Binary-SPA: A Reference-Free Method for Cell Annotation in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.17.712369
PMID:41889971
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研究论文 | 提出一种无需外部参考数据的高分辨率空间转录组细胞注释方法Binary-SPA | 无需单细胞RNA测序参考数据集即可实现高精度细胞类型注释，通过两阶段策略结合二分类和锚点标签转移，消除了对外部参考数据的依赖 | 依赖预定义标记基因集，可能在某些组织或条件下标记基因定义不完整 | 开发一种不依赖外部参考数据的空间转录组细胞注释方法 | 高分辨率空间转录组数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 二分类器和锚点标签转移 | 空间转录组数据 | 包含骨髓活检等多种组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 306 | 2026-05-27 |
PalmaClust: A graph-fusion framework leveraging the Palma ratio for robust ultra-rare cell type detection in scRNA-seq data
2026-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712161
PMID:41890078
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research paper | 提出PalmaClust，一个基于帕尔马比率的图融合框架，用于在单细胞RNA测序数据中稳健检测超稀有细胞类型 | 首次将社会学中用于衡量尾部不平等的帕尔马比率引入单细胞RNA测序稀有细胞类型检测，通过融合基于不同基因选择统计量（帕尔马比率、基尼指数、法诺因子）的多个K近邻图，实现了对超稀有细胞群体的灵敏识别和校准置信度 | 文本未提及明确局限性，但可能依赖公共数据集的基准测试，缺乏对真实复杂组织样本的广泛验证 | 开发一种可扩展且统计稳健的方法，用于在单细胞RNA测序数据中灵敏检测稀有细胞群，同时提供校准置信度和可解释的分子特征 | 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞群，包括短暂祖细胞、治疗耐药肿瘤亚克隆和抗原特异性淋巴细胞 | machine learning | NA | scRNA-seq, graph-fusion clustering | KNN, graph-fusion | gene expression data | 多个公共单细胞RNA测序数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 307 | 2026-05-27 |
Preferential formation of NUP98-KDM5A condensates at specific H3K4me3-rich loci drives leukemogenic gene expression
2026-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.16.712262
PMID:41889846
|
研究论文 | 以NUP98-KDM5A为模型，研究染色体易位产生的融合蛋白如何通过染色质互作形成凝聚体并驱动致白血病基因表达 | 揭示了NUP98-KDM5A通过结合H3K4me3形成胶状凝聚体，并利用局部H3K4me3密度实现基因靶向选择性的机制，为理解染色质相关凝聚体解读表观遗传景观提供了通用框架 | 未提及 | 阐明NUP98融合蛋白的基因靶向和凝聚体行为的基本原理 | NUP98-KDM5A融合蛋白及其在白血病中的基因表达调控 | 机器学习 | 白血病 | 细胞成像、体外重建、基因组分析、单细胞测序 | NA | 图像、基因表达数据、单细胞测序数据 | 来自患者的单细胞测序数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 308 | 2026-05-27 |
Melanocyte loss dominates the vitiligo transcriptome: a rank-based meta-analysis
2026-Mar-12, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.07.26345817
PMID:41728299
|
研究论文 | 通过对六项独立转录组研究的秩次元分析，确定了白癜风中黑素细胞丢失的一致特征 | 首次通过秩次元分析方法整合多项转录组研究，识别出白癜风皮损中黑素细胞丢失的一致特征，并发现新的候选黑素细胞标记物 | 免疫激活的异质性可能受采样方法和疾病特征影响，需要进一步研究 | 识别白癜风的共识转录组特征 | 白癜风皮损样本 | 机器学习 | 白癜风 | RNA-seq 和 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 115个样本，包括微阵列、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 309 | 2026-05-27 |
Gsx2 regulates oligodendrocyte precursor formation in the zebrafish spinal cord
2026-03, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2026.01.001
PMID:41491310
|
研究论文 | 利用斑马鱼模型研究Gsx2基因通过单细胞多组学数据调控脊髓少突胶质前体细胞形成的作用机制 | 首次在斑马鱼脊髓中发现Gsx2在少突胶质前体细胞前体（pre-OPCs）中特异性表达，并通过基因敲除实验证明其调控OPC形成的时间窗口 | 仅基于斑马鱼模型验证，未在哺乳动物系统中进行功能验证；结论准确性和物种间保守性有待进一步确认 | 阐明神经前体细胞向少突胶质细胞谱系特化的分子调控机制，尤其关注Gsx2基因的功能 | 斑马鱼脊髓中的神经前体细胞（NPCs）及少突胶质前体细胞（OPCs） | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | 基因组编辑数据, 单细胞转录组数据, 单核表观组数据 | 斑马鱼gsx2纯合突变体胚胎及对照胚胎（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 310 | 2026-05-27 |
Uncovering causal relationships in single-cell omic studies with causarray
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag175
PMID:41985059
|
研究论文 | 提出causarray框架，用于在单细胞组学研究中通过伪批量与单细胞水平分析揭示因果关系 | 首次在单细胞组学数据中整合未测量混杂因素的广义调整方法与半参数推断，结合灵活机器学习技术以稳健估计处理效应 | 未在更多不同类型单细胞数据集或更大规模队列中验证方法的泛化能力 | 开发能有效消除选择偏倚和未测量混杂效应，从而在单细胞观察性数据中准确推断因果关系的计算框架 | 自闭症风险基因的小鼠胚胎脑内Perturb-seq数据集，以及阿尔茨海默病的人类脑转录组病例对照数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病，自闭症 | 单细胞测序，CRISPR，Perturb-seq | 半参数模型，机器学习 | 单细胞转录组数据 | 两个单细胞基因组研究：小鼠胚胎脑Perturb-seq数据集和三个阿尔茨海默病人类脑转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2026-05-25 |
AI-guided multi-omics analysis identifies NPC1-modulated susceptibility to SARS-CoV-2 infection under PM2.5 exposure
2026-Mar-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71196-3
PMID:41912520
|
研究论文 | 研究利用AI引导的多组学分析，鉴定NPC1调节PM2.5暴露下SARS-CoV-2感染易感性的分子机制 | 首次通过微调的单细胞转录组基础模型整合PM暴露与SARS-CoV-2感染共享转录特征，并结合流行病学、GWAS和功能基因组学揭示NPC1调节的内体-溶酶体通路污染相关易感性机制 | NA | 阐明空气细颗粒物暴露增加SARS-CoV-2感染风险的分子机制 | SARS-CoV-2感染易感性、PM2.5暴露、NPC1基因调控 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、全基因组关联研究、功能基因组学 | 基础模型 | 转录组数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 312 | 2026-05-25 |
Cardiomyocyte-derived GPX4 stabilizes BNIP3 to facilitate mitophagy and mitigate myocardial ischemia/reperfusion injury
2026-Mar-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71232-2
PMID:41904174
|
研究论文 | 研究发现心肌细胞来源的GPX4通过稳定BNIP3促进线粒体自噬，减轻心肌缺血再灌注损伤 | 首次揭示GPX4通过其U46活性位点增强BNIP3与USP20相互作用，减少BNIP3的K131位泛素化，从而稳定BNIP3并促进线粒体自噬的新机制，将GPX4与铁死亡相关的线粒体损伤联系起来 | 未提及 | 阐明GPX4在心肌缺血再灌注损伤中的效应及分子机制 | 心肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台 |
| 313 | 2026-05-25 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization during CD4+ T cell activation reveals immune-mediated mechanisms and drug targets for neuropsychiatric disorders
2026-Mar-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09941-z
PMID:41904330
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研究论文 | 结合单细胞转录组学、表达数量性状位点鉴定、孟德尔随机化和共定位分析，识别神经精神疾病在CD4+ T细胞激活过程中的致病基因、通路和药物靶点 | 首次在动态T细胞激活状态下整合单细胞转录组学与孟德尔随机化，发现时间特异性因果模式，并优先考虑RAC1和PARP1等21个潜在药物重定位靶点 | 未提及具体局限性，但可能包括样本量有限或因果推断的潜在混杂因素 | 阐明CD4+ T细胞激活在阿尔茨海默病和重度抑郁症免疫介导机制中的作用并识别药物靶点 | 阿尔茨海默病和重度抑郁症 | 机器学习 | 阿尔茨海默病, 重度抑郁症 | 单细胞RNA-seq, 表达数量性状位点分析, 孟德尔随机化 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 314 | 2026-05-25 |
The CD4+ T cell population partners with Tpex CD8+ T cells to mediate antitumor immunity in the tumor microenvironment
2026-Mar-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71161-0
PMID:41904165
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和质谱流式分析，发现CD4+ T细胞亚群Th7R与Tpex CD8+ T细胞在肿瘤微环境中协同作用，维持抗肿瘤免疫 | 首次鉴定出IL-7R CCR6+ Th1样CD4+ T细胞亚群（Th7R）作为Tpex的伴侣细胞，阐明其在三级淋巴结构中与Tpex共定位并支持抗肿瘤免疫的新机制 | 部分数据来自肾细胞癌样本，且主要基于肺癌患者，可能限制结论的普适性；小鼠模型为过继转移实验，人类研究为关联性分析，因果验证不足 | 探究肿瘤微环境中CD4+ T细胞如何与Tpex CD8+ T细胞协作以维持抗肿瘤免疫 | 肺癌患者（主要）和肾细胞癌患者的外周血、肿瘤和淋巴结样本 | 机器学习 | 肺癌, 肾细胞癌 | NA | NA | NA | 肺癌和肾细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 质谱流式 | NA | NA |
| 315 | 2026-05-25 |
Single-bacterial cell insights into mechanisms of ceftriaxone resistance in Neisseria subflava
2026-Mar-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68621-y
PMID:41896210
|
研究论文 | 通过单细菌细胞视角揭示头孢曲松耐药在奈瑟氏球菌亚种中的机制 | 首次结合实验进化和单细胞转录组学来解析奈瑟氏球菌亚种在抗生素压力下从共生菌向病原菌转变的多因素策略 | 尚未在更多临床菌株或体内模型中验证该适应性过程 | 研究抗生素压力如何驱动奈瑟氏球菌亚种适应并增强致病性 | 奈瑟氏球菌亚种（Neisseria subflava） | 机器学习和数字病理学 | 慢性呼吸系统疾病 | 全基因组测序、单细胞转录组学 | NA | 基因数据 | 实验进化过程中多个时间点的细菌培养样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 316 | 2026-05-23 |
Generative cerebral vasculature visualization using spatial transcriptomic data
2026-Mar-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-46455-4
PMID:41917199
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研究论文 | 利用空间转录组数据和生成式AI模型Tera-MIND预测并可视化脑部血管结构 | 首次利用空间转录组数据和生成式AI模型（Tera-MIND）从基因共表达模式预测脑部血管空间组织，无需额外组织处理 | NA | 预测脑部血管的空间组织，探索生成式AI在生物结构模拟中的应用潜力 | 小鼠大脑中的血管网络结构 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 扩散模型（Diffusion model） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 317 | 2026-05-23 |
Risk assessment of secondary primary malignancies: results from two large prospective European cohorts
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01380-7
PMID:41888349
|
研究论文 | 利用两个大型欧洲前瞻性队列数据进行孟德尔随机化分析，评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关系 | 首次系统验证原发肿瘤与继发性恶性肿瘤的因果关系，并使用单细胞测序分析揭示PLK1癌症干细胞可能是驱动因素 | 研究仅基于欧洲人群，可能限制结果的普遍性；此外，因果关系的机制尚未完全阐明 | 评估原发肿瘤与继发性恶性肿瘤之间的因果关联，为癌症幸存者的随访策略优化提供证据 | 来自UK Biobank（31种癌症类型）和FinnGen（28种癌症类型）的欧洲人群数据 | 机器学习 | 胃癌，食管癌，直肠癌 | NGS，单细胞测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据，临床数据 | 两个队列包含31种和28种癌症类型，具体样本量未详细说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2026-05-23 |
HarveST uses a heterogeneous graph learning framework to reveal spatial transcriptomics patterns
2026-Mar-27, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09841-2
PMID:41896336
|
研究论文 | 提出了一个基于异构图的框架HarveST，用于整合空间、转录组和基因-基因相互作用数据，以识别空间域和标记基因 | 首次将异构图学习框架应用于空间转录组学，结合自监督学习和部分监督细化双重训练策略，并引入随机游走重启算法识别空间域特异性的空间可变基因 | 暂未在标题和摘要中提及具体限制 | 开发一种能够精确识别空间域和标记基因的计算方法，以解决空间转录组学中的主要挑战 | 人类皮层组织、小鼠嗅球及肿瘤微环境中的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 异构图学习框架 | 空间转录组数据 | 涵盖人类皮层组织、小鼠嗅球和肿瘤微环境样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2026-05-23 |
AI-driven body composition atlas reveals its association with NSCLC immunotherapy outcome and molecular background: a multicenter study
2026-Mar-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01382-5
PMID:41896593
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研究论文 | 本研究通过整合八个独立队列，利用深度学习算法从CT图像中自动提取92项身体成分参数，揭示了其与非小细胞肺癌免疫治疗结局及分子背景的关联 | 首次全面分析多维身体成分与NSCLC免疫治疗结局的关联，并揭示性别差异和不同脂肪分布区域对免疫微环境的影响 | 未明确指出具体局限性 | 探究多维身体成分与NSCLC免疫治疗预后及分子机制的关联 | 非小细胞肺癌患者 | 计算机视觉 | 肺癌 | 深度学习、RNA-seq、单细胞RNA-seq | 深度学习算法 | CT影像 | 2,132例非小细胞肺癌患者（8个独立队列） | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2026-05-23 |
CD8+ T cells sustain vaccination-induced immunity against dissemination of contained tuberculosis in immunosuppressed hosts
2026-Mar-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70911-4
PMID:41876499
|
研究论文 | 在免疫抑制宿主中，CD8+ T细胞维持疫苗接种诱导的免疫反应，阻止结核分枝杆菌从局限的淋巴感染中扩散 | 首次揭示在CD4 T细胞缺失的情况下，CD8 T细胞能介导BCG疫苗接种诱导的保护作用，阻止结核分枝杆菌的扩散，并利用多参数成像、空间转录组和网络分析阐明了免疫抑制下非CD4免疫细胞的重定位机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体验证；B细胞在CD4 T细胞缺失时对遏制结核的作用虽被排除，但其他免疫细胞类型的作用仍需进一步探索 | 探究在免疫抑制条件下维持潜伏结核感染（LTBI）遏制状态的免疫学相关因素 | 小鼠模型中局限的淋巴结核分枝杆菌感染及其在免疫抑制下的扩散 | 机器学习 | 结核病 | 空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | 使用小鼠模型，包括免疫细胞缺陷小鼠、细胞耗竭和过继转移实验，具体样本数量未明确 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间基因表达平台 |