单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202603-202603] [清除筛选条件]
当前共找到 1052 篇文献,本页显示第 281 - 300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
281 2026-06-04
Humoral IgG1 responses to tumor antigens underpin clinical outcomes in immune checkpoint blockade
2026-Mar, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 本研究探讨了抗PD-1治疗肝细胞癌患者中IgG1浆细胞的体液免疫应答及其对临床结局的影响 首次揭示抗PD-1治疗诱导肿瘤特异性IgG1浆细胞反应,并与T细胞活性协同促进临床获益,建立了体液-细胞免疫轴的新机制 样本量较小(38例肝细胞癌患者),且主要基于新辅助治疗队列,可能无法完全代表晚期或不同治疗背景的患者群体 阐明抗PD-1免疫检查点抑制治疗中体液免疫应答(特别是IgG1浆细胞)的作用及其与临床结局的关系 接受新辅助抗PD-1治疗的肝细胞癌患者的肿瘤组织、血清及外周血样本 机器学习 肝细胞癌 单细胞测序、批量RNA测序、空间转录组学、血清学分析 NA 基因组数据、转录组数据、空间转录组数据、蛋白质数据 38例肝细胞癌患者(主要队列),额外7个独立队列共500例单细胞/批量测序数据、7例空间转录组数据及1582例生存分析数据 NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序、空间转录组学 NA NA
282 2026-06-03
Hidden oral-joint-lung axis: Porphyromonas gingivalis Infection promotes the EMyT of RA-ILD by inhibiting the JUN-regulated palmitoylation balance
2026-Mar-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 揭示了牙龈卟啉单胞菌感染通过抑制JUN调控的棕榈酰化平衡促进RA-ILD中上皮-肌成纤维细胞转化的机制 首次提出并验证'口腔-关节-肺轴'假说,揭示牙龈卟啉单胞菌通过JUN调控的棕榈酰化失衡驱动RA-ILD的分子机制 研究对象仅限于RA-ILD患者和小鼠模型,缺乏大规模临床队列验证,且未探讨其他口腔微生物的潜在协同作用 阐明牙龈卟啉单胞菌感染驱动RA-ILD的分子机制,为临床治疗提供新靶点 RA-ILD患者肺泡灌洗液和粪便样本、胶原诱导关节炎小鼠模型、人肺上皮细胞系A549和BEAS-2B 数字病理学 类风湿关节炎相关间质性肺病 宏基因组二代测序、16S rRNA测序、单细胞测序、分子对接 NA 测序数据、免疫病理学图像、qPCR和WB数据 RA-ILD患者肺泡灌洗液和粪便样本(具体数量未明确说明)、CIA小鼠模型(具体数量未明确说明) Illumina 宏基因组二代测序, 16S rRNA测序, 单细胞测序 Illumina NovaSeq NA
283 2026-06-02
Harnessing arginase 2-specific CD8+ T cells to target immunosuppressive cutaneous T-cell lymphoma
2026-03-19, The British journal of dermatology
研究论文 探讨精氨酸酶2特异性CD8+ T细胞靶向免疫抑制性皮肤T细胞淋巴瘤的潜力 首次证明恶性皮肤T细胞淋巴瘤细胞可被ARG2特异性CD8+ T细胞靶向识别,揭示ARG2作为CTCL免疫治疗新靶点的可能性 仅在体外细胞系和公共单细胞数据集中验证,缺乏体内动物模型和临床试验证据 评估恶性CTCL细胞是否高表达ARG2并可作为ARG2特异性CD8+ T细胞的免疫治疗靶点 八种CTCL细胞系及患者病变组织中的恶性T细胞 肿瘤免疫治疗 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序,CRISPR-Cas9基因编辑,酶联免疫斑点检测 NA 基因表达数据,蛋白质表达数据 8种CTCL细胞系,多名供体的CD8+ T细胞 NA 单细胞RNA测序 NA 使用公开的单细胞RNA测序数据集分析患者病变组织
284 2026-06-02
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover glycolytic dysregulation linking skin and systemic inflammation in dermatomyositis
2026-03-19, The British journal of dermatology
研究论文 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示皮肌炎中糖酵解失调连接皮肤与系统性炎症 首次构建皮肌炎皮肤病变的高分辨率单细胞图谱,鉴定出炎症性成纤维细胞亚群,并揭示IFN-I信号通路和CXCL10-糖酵解轴作为核心炎症驱动机制 未明确说明 明确皮肌炎系统性及皮肤病变的炎症景观,并探究其潜在致病机制 成人经典皮肌炎患者的皮肤病变样本及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 数字病理学 皮肌炎 单细胞RNA测序、蛋白质组学、转录组学 NA 图像 成人经典皮肌炎患者样本及实验性自身免疫性肌炎小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium 单细胞3'端测序
285 2026-03-20
Single-cell RNA sequencing: a tool for precision dermatology
2026-Mar-19, The British journal of dermatology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
286 2026-05-30
Splicing variants in MYRF cause partial loss of function in the retinal pigment epithelium leading to nanophthalmos
2026-Mar-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究揭示了MYRF基因的剪接变异体导致视网膜色素上皮细胞部分功能丧失,从而引发纳米眼 首次证明MYRF基因的C末端剪接变异体(如dG-MYRF)是功能减退等位基因,并解释了为何此类变异导致孤立性纳米眼而非综合征性疾病 未提及 探究MYRF基因C末端变异导致孤立性纳米眼与完全功能丧失变异导致综合征疾病的差异机制 MYRF基因C末端剪接变异体(dG-MYRF, p.Gly1126fs30*, c.3376-1G>A)及两个产生非功能性亚型的MYRF剪接变异体 分子生物学 纳米眼 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 人源化MYRF C末端小鼠模型(MyrfhumdG/humdG胚胎致死,MyrfhumWT/humWT存活)及KO RxCre;Myrffl/fl小鼠(E15.5和P0) NA 单细胞RNA测序 NA NA
287 2026-05-30
A single-nucleus and spatial transcriptomic atlas of poplar leaves reveals the regulation of leaf polarity and cuticle deposition
2026-Mar-20, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 通过单核和空间转录组学构建杨树叶片的细胞图谱,揭示叶面极性及角质层沉积的调控机制 首次整合单核和空间转录组学解析杨树叶片近轴-远轴极性,发现MYC2作为角质层生物合成的关键调控因子,结合脂质合成和转运基因启动子并促进角质层增厚 研究主要基于杨树叶片,需验证MYC2在其他植物中的保守性及其在非生物胁迫中的具体功能 探究叶片近轴-远轴极性建立过程中转录组和代谢组的空间调控网络 杨树叶片细胞类群(叶肉细胞、表皮细胞、维管相关细胞)及其近轴-远轴亚型 数字病理学 不适用 单核RNA测序(snRNA-seq)、空间转录组学 不适用 基因表达数据、空间位置数据 杨树叶片样本 10x Genomics 单核RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单核RNA测序平台, 10x Visium空间转录组平台
288 2026-05-29
Pulmonary fibroblast activation during Aspergillus fumigatus infection enhances lung defense via immunomodulation and tissue remodeling
2026-03-31, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 研究烟曲霉感染时肺成纤维细胞的激活及其通过免疫调节和组织重塑增强肺防御的机制 首次通过细胞谱系追踪、靶向细胞消融和单细胞RNA测序揭示成纤维细胞在烟曲霉感染中的保护性免疫调节作用 未提及具体局限性 探究烟曲霉引起的肺损伤中成纤维细胞的功能反应及其在宿主防御中的作用 免疫正常和免疫抑制宿主中的肺成纤维细胞 机器学习 肺曲霉病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 免疫正常和免疫抑制小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
289 2026-05-29
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习和多组学分析解码VDAC2恶性亚型对肿瘤演化的影响 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了VDAC2在泛癌中的恶性功能及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 基于公开数据库的分析,缺乏大规模独立临床样本验证,且实验主要在体外细胞模型中进行 系统挖掘VDAC2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 VDAC2基因在泛癌中的表达、功能及免疫调控机制 机器学习 泛癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-PCR、细胞共培养、CCK-8实验、Transwell侵袭实验、ELISA NA RNA测序数据、空间转录组数据 泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
290 2026-05-29
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用高分辨率空间转录组技术解析猪雌性早期性腺发育过程中细胞类型及其空间动态 首次应用高分辨率空间转录组技术绘制猪早期性腺发育的时空图谱,阐明了支持细胞谱系中两波颗粒细胞的空间定位及其在生殖细胞发育中的调控作用,并发现BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞特化中的关键角色 空间转录组技术无法直接解析单细胞水平的基因表达,可能遗漏部分细胞类型的细微差异 揭示猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞特化和进入减数分裂的时空动态机制 猪(Sus scrofa)雌性早期性腺组织中的原始生殖细胞、体细胞及各种细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 猪早期性腺样本(具体数量未在标题和摘要中明确) NA 空间转录组学 NA 高分辨率空间转录组技术(具体平台未在摘要中说明)
291 2026-05-29
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 提出IN-DEPTH工作流,实现同一玻片上的空间转录组和蛋白质组整合分析,结合SGCC框架揭示肿瘤微环境中的空间重排 开发了IN-DEPTH工作流,可在同一玻片上整合单细胞空间蛋白质组和转录组且无RNA信号丢失;提出SGCC框架用于跨模态整合,解析细胞间功能状态变化 新兴同玻片多组学方法在多重性、空间分辨率、信号保留和整合分析方面仍存在局限 实现空间多组学整合以揭示肿瘤微环境中的临床相关机制,并推动稳健的空间多模态AI模型发展 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC NA 图像、空间转录组数据 EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
292 2026-05-29
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据,实现核分辨率下的配体-受体分析 利用组织学基础模型的深度对比学习,实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析,在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 主要聚焦于Visium平台,可能在其他平台上的泛化能力有限;数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集,以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 空间转录组学, 对比学习 对比学习模型 组织学图像, 空间转录组学数据 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium 10x Visium平台用于空间基因表达分析,VisiumHD用于高分辨率数据,Xenium用于乳腺癌原位验证
293 2026-05-29
The single cell transcriptomic landscape of recurrent giant cell tumor of bone following neoadjuvant denosumab therapy
2026-Mar-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新辅助地诺单抗治疗后复发骨巨细胞瘤的转录组特征 首次通过单细胞RNA测序揭示新辅助DMAb治疗后GCTB复发的潜在机制,包括肿瘤细胞转化及免疫抑制微环境形成 未提及 探索新辅助地诺单抗治疗增加骨巨细胞瘤局部复发风险的潜在机制 未经治疗的原发性GCTB、新辅助DMAb治疗的原发性GCTB以及刮除后停用DMAb的复发性GCTB 单细胞转录组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 33,440个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
294 2026-05-29
BET inhibition blunts antibody production and macrophage-mediated fibrosis to restore lung function in murine cGVHD
2026-03-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 在慢性移植物抗宿主病模型中,BET抑制通过降低抗体产生和巨噬细胞介导的纤维化来恢复肺功能 首次揭示BET蛋白在慢性移植物抗宿主病肺部纤维化中调控抗体产生和巨噬细胞极化的新机制 主要基于小鼠模型,缺乏临床样本验证 研究BET抑制对慢性移植物抗宿主病相关闭塞性细支气管炎综合征的治疗效果和机制 慢性移植物抗宿主病小鼠模型中的免疫细胞(T细胞、B细胞、巨噬细胞)和肺组织 医学研究 移植物抗宿主病,闭塞性细支气管炎综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 慢性移植物抗宿主病小鼠与对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
295 2026-05-29
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 发现TRPV1疼痛感知伤害感受器与化学感应上皮簇细胞协同,驱动2型炎症和肠道免疫的神经-上皮回路 首次揭示TRPV1伤害感受器通过CGRP信号调控上皮簇细胞增殖分化,形成神经-上皮回路整合感觉输入驱动2型免疫 未明确其他感觉神经元类型在该回路中的作用,且机制验证主要在小鼠模型中完成 阐明神经、上皮和免疫细胞如何协调感知输入以启动2型炎症反应 小鼠肠道中的TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞及CGRP神经纤维 机器学习 寄生虫感染相关2型免疫疾病 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活 NA 基因表达数据 小鼠肠道组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间基因表达分析
296 2026-05-29
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens IF:5.5Q1
research paper 通过单细胞RNA测序揭示了HDAC抑制剂诱导的EBV溶解裂解异质性,定义了B淋巴母细胞中的流产和难治状态 首次在单细胞水平上解析HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性,发现NF-κB及CD137信号轴在阻止成功裂解再激活中的作用 研究仅限于四种EBV阳性细胞系,且裂解再激活仅在少数细胞中成功,可能未全面反映体内微环境的影响 探讨HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤的裂解再激活机制及宿主因素的作用 EBV阳性细胞系,包括P3HR1-ZHT Burkitt淋巴瘤、Jijoye Burkitt淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 machine learning Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 4种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
297 2026-05-28
Cell neighborhood topology directs rare cell population identification
2026-Mar-30, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 介绍了一种名为RareQ的快速可扩展框架,通过评估单细胞组学数据中每个细胞的k近邻团度来检测罕见细胞群 提出基于细胞邻域拓扑结构的团度评估方法,能同时识别模态特异性和共享罕见细胞,并在模拟和真实数据集上展现卓越的准确性、灵敏度和效率 NA(摘要未提及局限性) 开发高效方法识别复杂生物系统中关键但低丰度的罕见细胞群 模拟和真实单细胞组学数据,包括空间转录组学数据 单细胞组学 NA(摘要未指定具体疾病) 单细胞组学技术(包括空间转录组学) 图论中的团度分析 单细胞组学数据(包括空间转录组数据) NA(摘要未提及具体样本量) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
298 2026-05-28
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2026-Mar-23, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 利用空间转录组学技术揭示1型糖尿病胰腺和局部引流淋巴结组织中的淋巴毒素β特征 首次通过多细胞分辨率空间转录组学在人类1型糖尿病中识别出淋巴结滤泡和胰岛炎病变中的LTB上调及下游趋化因子特征 未提及,样本量可能有限 探索1型糖尿病自然病程中胰腺和胰腺淋巴结的炎症反应 无糖尿病个体、自身抗体阳性风险个体及1型糖尿病供体的胰腺和胰腺淋巴结组织 空间转录组学 1型糖尿病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 多例供体组织样本(无糖尿病、自身抗体阳性及1型糖尿病供体) NA 空间转录组学 NA 多细胞分辨率空间转录组平台及正交亚细胞分辨率空间转录组平台
299 2026-05-28
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 利用单核多组学测序技术,研究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆的基因调控网络决定因素 通过单核多组学测序同时分析基因表达和染色质可及性,首次重建了CD4 T细胞动态激活过程中的基因调控网络,并识别出五个与记忆相关的转录因子(MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6)可能调控快速回忆过程 转录因子与靶基因的结合预测需要进一步通过ChIP-seq验证,且记忆相关转录因子活性在独立单细胞RNA测序研究中的复制仍需更多验证 阐明记忆CD4+ T细胞快速回忆的基因调控机制,以及这些机制在免疫介导疾病遗传风险中的作用 人类CD4+ T细胞的记忆和初始亚群及其快速回忆反应 机器学习 免疫介导疾病 单核多组学测序(基因表达和染色质可及性)、染色质免疫沉淀测序(ChIP-seq)、全基因组关联研究(GWAS) 基因调控网络 基因表达数据、染色质可及性数据 NA 10x Genomics 单核多组学 10x Chromium 单核多组学测序同时分析基因表达和染色质可及性
300 2026-05-28
Molecular subtypes in pancreatic cancer: from academic promise to clinical reality
2026-Mar-09, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 总结胰腺导管腺癌分子亚型的研究进展,并探讨其从学术概念向临床应用转化的关键障碍与可行路径 整合多组学、单细胞RNA测序和空间转录组学的最新发现,提出以GATA6免疫组化检测为核心的简化临床实施路线图,强调治疗诱导分子可塑性的影响 部分亚型分类标准仍存在争议,治疗过程中分子亚型的动态变化增加了生物标志物的不可靠性,临床验证样本有限 综述胰腺癌分子亚型的研究现状,分析转化障碍,并提出走向临床的实用策略 胰腺导管腺癌及其分子亚型(经典/祖细胞型、基底样/鳞状型) 自然语言处理 胰腺癌 转录组学分析,免疫组化,单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 转录组数据,组织切片图像 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
回到顶部