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当前共找到 1050 篇文献，本页显示第 261 - 280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2026-04-20 |
AKAP7 is a prognostic biomarker involved in immune infiltration of bladder urothelial carcinoma and correlated with ferroptosis
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04786-8
PMID:41806078
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研究论文 | 本研究探讨了AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达水平、预后意义及其与免疫浸润和铁死亡的相关性 | 首次系统性地将AKAP7与膀胱尿路上皮癌的预后、免疫微环境特征及铁死亡过程联系起来，并验证了其作为生物标志物的潜力 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步的前瞻性临床研究和实验验证来确认其机制 | 探索AKAP7在膀胱尿路上皮癌中的表达模式、预后价值、免疫特征及其与铁死亡的关系 | 膀胱尿路上皮癌组织、细胞系及相关的公共数据库数据 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、基因表达分析、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | 基于TCGA、GEO等多个公共数据库的样本，并包含临床样本和细胞系验证 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2026-04-18 |
Integrated multi-target pharmacology of ginseng in acute myeloid leukemia through single-cell sequencing, molecular docking, network pharmacology, and in vitro experiments
2026-Mar-10, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04747-1
PMID:41806205
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 263 | 2026-04-20 |
Integrated multi-omics analysis identifies and validates endoplasmic reticulum stress and mitophagy-related biomarkers in MASLD
2026-Mar-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43311-3
PMID:41796234
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别并验证了内质网应激和线粒体自噬相关生物标志物在MASLD中的作用 | 首次整合GEO数据挖掘、机器学习、scRNA-seq分析和虚拟筛选，系统性地揭示了NR4A1作为内质网应激和线粒体自噬介导MASLD进展的关键靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和初步实验验证，缺乏深入的体内功能机制研究和临床样本验证 | 阐明内质网应激和线粒体自噬在MASLD进展中的潜在机制，并识别针对这些通路的候选治疗药物 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | GEO数据挖掘、scRNA-seq、分子对接、虚拟筛选 | 机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 涉及FFA处理的肝细胞、MASLD小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2026-03-09 |
ACSL4 mediates ferroptosis to promote immunoglobulin A nephropathy progression: scRNA-seq analysis
2026-Mar-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43023-8
PMID:41794881
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 265 | 2026-04-20 |
ENS lineage potential is not intrinsically regionalized but is modulated by PTPRZ1 signaling
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.05.709942
PMID:41846962
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能扰动，揭示了肠道神经系统（ENS）在发育过程中缺乏内在的区域化，而是通过微环境信号如PTPRZ1信号进行精细调控 | 发现ENS发育不依赖内在的前后轴区域化，而是由局部微环境信号（如PTN/MDK-PTPRZ1信号）调控，挑战了传统区域化模型 | 研究主要聚焦于小鼠胚胎发育阶段（E13.5至E18.5），人类ENS发育的验证仅基于干细胞培养模型，可能未完全反映体内复杂性 | 探究肠道神经系统（ENS）在发育过程中是否经历区域化转录多样化，以及微环境信号如何调控其成熟 | 小鼠胚胎肠道组织（包括ENS、上皮和间充质）以及人多能干细胞衍生的ENS培养物 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 266 | 2026-04-20 |
scGPD: single-cell informed gene panel design for targeted spatial transcriptomics
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag160
PMID:41996577
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研究论文 | 本文提出了一种名为scGPD的深度学习框架，用于利用单细胞RNA-seq数据为靶向空间转录组学设计紧凑、非冗余的基因组合 | 引入了基于深度学习的框架scGPD，通过基因-基因相关性感知的门控机制从数据中提取信息特征，鼓励所选基因的多样性并消除冗余，克服了现有方法忽视基因间相关性的局限 | 未在摘要中明确提及 | 为靶向空间转录组学技术设计信息丰富的基因组合，以捕获组织内细胞和空间异质性的复杂性 | 基因组合设计 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 267 | 2026-04-19 |
Smoothie: efficient inference and integration of spatial co-expression networks from denoised spatial transcriptomics data
2026-Mar-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09898-z
PMID:41888598
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的流程，用于对空间转录组数据进行去噪并构建和整合全基因组共表达网络 | 提出了一个结合高斯平滑去噪与并行化计算的高效流程，能够处理超过1亿个空间分辨点的数据集，并实现快速运行和低内存使用 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深入的生物学见解，包括基因模块检测、功能注释和跨样本比较 | 空间转录组数据中的基因共表达网络 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 268 | 2026-04-19 |
Palmatine ameliorates MASLD in type 2 diabetes by modulating hepatic apoptosis and inflammation
2026-Mar-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-45476-3
PMID:41865191
|
研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析和实验验证，揭示了黄连素通过调控ADRB2、BCL3等五个核心靶点抑制肝细胞凋亡，从而改善2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 首次采用顺序性多组学生物信息学工作流程，结合机器学习预测和单细胞测序验证，系统性地识别了黄连素治疗MASLD的五个核心靶点，并通过动物模型进行了机制验证 | 研究主要在动物模型中进行，尚未进行人体临床试验；多组学预测的靶点网络需要更深入的分子机制研究 | 探究黄连素改善2型糖尿病相关MASLD的作用机制 | 2型糖尿病相关的代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞测序，分子对接，多组学分析 | 机器学习 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 269 | 2026-03-11 |
DGM: deep graph clustering with mincut for analysis of single-cell transcriptomics
2026-Mar-09, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12694-y
PMID:41803718
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 270 | 2026-03-11 |
Single-cell RNA-seq and in vitro study reveal Fusobacterium nucleatum impairs β-cell identity in type 2 diabetes via the NF-κB-CDKN1C axis
2026-Mar-09, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07981-x
PMID:41803883
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 271 | 2026-04-19 |
CD19+Ki67+B cells regulated by NAMPT as key modulators in triple-negative breast cancer with brain metastasis
2026-Mar-09, Breast cancer research : BCR
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s13058-026-02251-6
PMID:41803986
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了CD19+Ki67+ B细胞通过激活NAMPT/ITGA5/ITGB1通路驱动三阴性乳腺癌脑转移的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定出CD19+Ki67+ B细胞作为三阴性乳腺癌脑转移的关键调节细胞，并阐明了其通过NAMPT/ITGA5/ITGB1信号通路促进肿瘤进展的新机制 | 样本量相对较小（15例单细胞测序患者），需要在更大规模的前瞻性队列中进一步验证 | 探究三阴性乳腺癌脑转移的免疫调节机制，寻找潜在治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者（包括有和无脑转移者）、肿瘤类器官、B细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，RNA-seq，多重免疫荧光，细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据，批量RNA-seq数据，免疫荧光图像 | 15例患者（单细胞测序），两个独立RNA-seq队列（TCGA, GSE65194），湘雅真实世界队列，74例患者样本验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 272 | 2026-04-19 |
Single-cell and multi-omics analysis identifies mitophagy-related biomarkers and therapeutic targets in ischemic stroke
2026-Mar-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43377-z
PMID:41792398
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研究论文 | 本研究通过单细胞和多组学分析，识别了缺血性卒中中与线粒体自噬相关的生物标志物和治疗靶点 | 整合了bulk和单细胞RNA测序数据，结合WGCNA和机器学习模型，首次在缺血性卒中中识别出五个核心线粒体自噬相关基因生物标志物，并揭示了小胶质细胞亚群中线粒体自噬活性的动态变化 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分有限，且缺血性卒中的具体病理机制仍需进一步体内外实验探索 | 探究线粒体自噬相关基因在缺血性卒中中的作用，以识别新的生物标志物和治疗靶点 | 缺血性卒中患者或模型中的基因表达数据，特别是线粒体自噬相关基因 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，qPCR | 机器学习模型，加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 273 | 2026-04-19 |
Parvimonas micra exacerbates periodontitis by infiltrating host cells through TmpC and circumventing lysosomal elimination via AppA
2026-Mar, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2026.106187
PMID:41740230
|
研究论文 | 本研究揭示了小单胞菌通过TmpC蛋白侵入宿主细胞，并利用AppA蛋白逃逸溶酶体清除，从而加剧牙周炎的分子机制 | 首次系统阐明了小单胞菌在牙周炎发病中的关键作用，并发现了其通过表面黏附素TmpC结合宿主细胞受体以及利用AppA蛋白逃逸自噬清除的两种新机制 | 研究主要在动物模型和体外实验中进行，人体内的直接验证尚需进一步研究 | 探究小单胞菌在牙周炎发病过程中的具体作用机制 | 小单胞菌、牙周韧带干细胞、大鼠实验模型 | 微生物学与细胞生物学 | 牙周炎 | 16S rRNA测序、单细胞RNA测序、His pull-down assay、LC-MS/MS、micro-CT | NA | 测序数据、质谱数据、影像数据 | 人类龈沟液样本及实验大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 274 | 2026-04-19 |
DuaST: an integrated deep learning framework for spatial transcriptomics with cross-branch interaction
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag174
PMID:41985058
|
研究论文 | 本文提出了DuaST，一个集成的双分支深度学习框架，用于空间转录组学数据分析，通过结合空间和非空间信息来提升生物表征学习 | DuaST设计了空间感知分支和非空间分支来分别建模邻域依赖和拓扑无关特征，并采用局部-全局对比学习、对抗对齐和基于注意力的融合机制来整合这些互补表示，从而强化跨分支交互并学习有生物学意义的表征 | NA | 开发一个通用的计算框架，以整合空间转录组学中的空间和非空间信息，用于空间域识别、空间可变基因检测和多组学分析 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架（双分支架构） | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 275 | 2026-04-19 |
Uncovering causal relationships in single-cell omic studies with causarray
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag175
PMID:41985059
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为causarray的因果推断框架，用于在单细胞组学研究中处理未测量混杂因素并揭示因果关系 | causarray整合了广义混杂调整方法和半参数推断，结合灵活的机器学习技术，能在伪批量及单细胞水平上稳健估计处理效应 | NA | 解决单细胞组学数据中因选择偏差和未测量混杂因素导致的因果推断挑战 | 单细胞组学数据，包括自闭症风险基因的Perturb-seq研究和阿尔茨海默病的病例对照转录组数据集 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序，CRISPR技术 | 机器学习技术 | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2026-04-18 |
NetTracer3D Enables User-Friendly Analysis of Diverse Microscopic and Medical 3D Datasets
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.25.714104
PMID:41929015
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研究论文 | 本文介绍了NetTracer3D工具，用于简化多样3D显微和医学数据集的分析，支持标准化数据格式和交互式探索 | 开发了NetTracer3D集成工具，提供三种网络分析模态（连接性网络、分支邻接与分支点网络、邻近网络），以标准化方式处理3D组织图谱，促进跨数据集整合与共享 | NA | 简化三维图像分析，促进3D空间生物学数据的可访问性和可重复性分析 | 人类和小鼠肾脏、小鼠支气管、人脑血管造影、淋巴结、肿瘤微环境等3D组织图谱 | 数字病理学 | NA | CODEX、无标记拉曼光谱、光片成像 | NA | 3D图像、多维数据、多标量数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 277 | 2026-04-18 |
Pluripotency Factors Modulate Interferon Signaling in Embryonic Stem Cells
2026-Mar-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.03.23.713714
PMID:41929074
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研究论文 | 本文研究了人类胚胎干细胞中多能性因子如何通过调控干扰素信号通路来维持抗病毒抵抗力和多能性 | 揭示了多能性因子（如NANOG、SOX2和OCT4）通过转录控制干扰素信号负调控因子（如SOCS1和SPRY4）来抑制典型干扰素信号，从而在维持抗病毒能力的同时保护多能性状态 | 研究主要基于体外hESC模型和特定流感A病毒突变体感染，可能无法完全反映体内生理条件下的复杂免疫调控网络 | 探究胚胎干细胞中干扰素信号与多能性维持之间的分子机制 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 干细胞生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 278 | 2026-04-18 |
Dnmt1 mediates epigenetic restriction of invasive traits in clonal crayfish
2026-Mar-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71049-z
PMID:41888526
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研究论文 | 本研究探讨了环境变化如何通过下调Dnmt1 DNA甲基转移酶影响克隆小龙虾的入侵性行为特征 | 首次在克隆小龙虾中揭示Dnmt1介导的表观遗传调控如何影响入侵性行为，结合单细胞RNA测序和全基因组亚硫酸氢盐测序分析 | 研究主要基于实验室环境下的表型模拟，可能未完全反映自然条件下的复杂生态交互作用 | 探究表观遗传机制如何调控克隆小龙虾的入侵性特征 | Procambarus virginalis（大理石纹小龙虾）克隆种群 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, dsRNA体内敲低, 图像细胞术 | NA | 基因组甲基化数据, 单细胞转录组数据, 行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组亚硫酸氢盐测序 | NA | NA |
| 279 | 2026-04-18 |
FTO-CHRM3 axis regulates multiple myeloma progression: a machine learning-based identification
2026-Mar-23, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-026-06940-2
PMID:41870649
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了FTO-CHRM3轴在多发性骨髓瘤进展中的作用机制 | 首次结合机器学习和单细胞RNA测序技术，系统性地揭示了FTO-CHRM3轴通过钙信号通路调控多发性骨髓瘤进展的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内动物模型实验进一步证实机制 | 探究FTO基因在多发性骨髓瘤进展中的作用机制及其潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤组织样本及相关基因表达数据 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 机器学习模型 | 基因表达数据,组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2026-04-18 |
Construction of a SEMA3 family-based model to predict prognosis and molecular subtypes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Mar-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04808-5
PMID:41792569
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研究论文 | 本研究构建了一个基于SEMA3基因家族的模型，用于预测胰腺导管腺癌的预后和分子亚型 | 首次整合多组学数据对SEMA3家族在PDAC中的作用进行系统分析，并构建了九基因预后特征模型，同时通过单细胞和空间转录组学揭示了SEMA3C在肿瘤微环境中的关键调控作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床验证，且样本来源可能受限于数据库的异质性 | 探究SEMA3基因家族在胰腺导管腺癌中的预后价值和分子机制，以开发个性化治疗策略 | 胰腺导管腺癌患者及其肿瘤组织 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 多组学数据分析、单细胞RNA-seq、空间转录组学 | Cox回归、LASSO回归 | 基因表达数据、突变数据、临床数据 | 来自TCGA和GEO公共队列的多个数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |